6. Kobling og kortlægning

Question 1

Chiasmata

Answer 1

I genetik er en chiasma kontaktpunktet, den fysiske forbindelse, mellem to kromatider, der tilhører homologe kromosomer.
Tydelig tegn på overkrydsning

Question 2

Kobling, generelt + forskel ml. kobling af nogenlunde tætte eller meget tætte gener

Answer 2

To alleler fra to gener som er fysisk forbundet (koblet) nedarves oftere sammen end hver for sig.
Kobling: loci sidder tæt forbundet. Kobling = ALTID overskud af parentale gameter. IKke overskud af parentale gameter = IKKE KOBLEDE
Nogenlunde tæt = flest parentale gameter
Meget tætte = ingen rekombination ml. gener!

Question 3

Overkrydsning mellem koblede gener af to hetetozygote betyder rekombinante gameter:

DEDE x dede
Skriv de mulige gameter

Answer 3

DEDE x dede → DE og de (parentale gameter) De og dE (rekombinante gameter)

Question 4

Nulhypotesen

Answer 4

Nul hypotesen:
Observerede værdier er lig forventede værdier ved uafhængig nedarvning.
I koblede studier skal udafhængiv nedarvningshypotensen afvises.

Ved dobbelt heterozygote forventes en 1:1:1:1 ratio af gameterne (25% af hver).
Eks: bC/Bc x bc/bc (dobbelt homozyg):
Parentale = 77% (bC og Bc)
rekombinante 23% (bc, BC)

Question 5

Rekombinations frekvensen reflekterer den fysiske afstand
1 % rekombination = 1 RF = 1 map unit (m.u.)
= 1 centiMorgan (cM)

Question 6

Hvis afstanden fra gen A til B er 32 Map units (M.u) - hver er sandsynligheden for rekombination?

Answer 6

32%

Question 7

Opgave: REKOMBINATION
(regn med at den kommer til eksamen 🙂)
Generne Q og P er koblede med en afstand på 20 map units.
Hvad vil fraktionen af QP/qp blive efter en parring mellem Qp/qP og qp/qp?

Answer 7

Fremgangsmåde: ved OVERKRYDSNING ml. Q og P.
20 m.u = 20% rekombinante gameter (QP og qp)
Opstil punnet square for rekombinatne gamter og udregn procent for specifikke QqPp.
Der er 50% chance ud af de iforvejen 20% for rekombinatne gameter for at få kombinationen: QqPp = 10%

Question 8

Begrænsninger ved dihybrid kryds (3)

Answer 8

Begrænsninger ved dihybrid kryds
Svært at bestemme genrækkefølge når generne er tæt koblede
Afstanden mellem generne summerer ikke altid rigtig op
Parvise kryds er tidskrævende

Question 9

Trihybridkryds (tre loci) Overkrydsningmuligheder

Answer 9

Trihybridkryds (tre loci) Overkrydsningmuligheder
Enkelt rekombination
Mellem lokus 1 og 2
Mellem lokus 2 og 3
Dobbelt rekombination
Både mellem lokus 1 og 2 og lokus 2 og 3
Dvs 2 parentale grupper og 6 rekombinante
Laveste sandsynlighed

Question 10

Kromosomal interferens:

Answer 10

Overkrydsning kræver at kromosomerne ‘bøjes’ og et rekombination kompleks af proteiner rekrutteres.
Derfor betyder rekombination i én region at overkrydsning hæmmes i naboregionerne.

Question 11

Rekombination i et område reducerer typisk ____ i naboområderne.

Answer 11

rekombination

Question 12

Interferens rolle i overkrydsninger

Answer 12

Interferens angiver om der er flere (I<0) eller færre (I>0) dobbelt overkryds end forventet
Interferensen er ikke uniform mellem eller indenfor kromosomer
I = 1 – C (C = %observerede overkrydsninger /%forventede overkrydsninger)
i=0,6 = vi ser kun 60% af de forventede dobbeltovekryrdsninger, 40% mangler pga interferens

Question 13

Koblingskort og koblingsgruppe

Answer 13

Koblingskort = placering af flere koblede loci/gener.
koblingsgruppe = Geners tendens til at nedarves sammen på samme kromosom.

Dette skyldes, at den fysiske nærhed af gener på et kromosom begrænser mulighederne for genetisk rekombination, som er udveksling af genetisk materiale mellem homologe kromosomer under meiosen. Hyppigheden af rekombination mellem to gener kan bruges til at bestemme deres relative position på kromosomet, som kaldes genkortlægning.

Question 14

Begrænsninger ved dihybrid kryds

Answer 14

Begrænsninger ved dihybrid kryds
* Svært at bestemme genrækkefølge når generne er tæt
koblede
* Afstanden mellem generne summerer ikke altid rigtig
op
* Parvise kryds er tidskrævende

Question 15

Hvordan udregnes genetisk afstand mellem to gener?

Answer 15

Den genetiske afstand måles i centimorgans (cM).

Genetisk afstand mellem to loci kan beregnes ved hjælp af følgende formel:

Genetisk afstand = (antal afkom, der har gennemgået rekombination mellem de to loci/ det totale antal afkom) x 100

Denne formel bruger antallet af afkom, der har gennemgået rekombination mellem de to loci, og dividerer med det totale antal afkom for at finde frekvensen af rekombination mellem disse to loci. Multiplikation med 100 konverterer frekvensen til procent, som er den enhed, der normalt bruges til at rapportere genetisk afstand.

Hvis der er mere end to gener involveret, kan den genetiske afstand mellem hvert par af gener beregnes, og den samlede afstand mellem alle gener kan opsummeres.

Question 16

Forklar detaljieret genetisk kortlægning ml. tre loci (gener) og udregn afstand mellem dem :)

Answer 16

For at udføre genetisk kortlægning af tre loci/ gener, skal vi først krydse to homozygote forældre med forskellige alleler i de tre loci og derefter observere afkommet for at bestemme deres genotyper

Question 17

For at bestemme om gener er linket på basis af genotypisk eller fenotypisk information fra gameter eller afkom, kan man udføre en såkaldt krydsningstest.

Answer 17

krydsningstest: tjek om gener er linket via geno/fænotypisk information

to homozygote forældre med forskellige alleler i de to gener af interesse, og observerer derefter afkommet for at bestemme deres genotyper.

Kobling = flere parentale. sammenligne den observerede fordeling af genotyper i afkommet med den forventede Mendelske fordeling
Ikke koblet = 50/50

Question 18

Hvor mange rekombinante klasser er der i et trihybrid kryds og hvilke rekombinationer ligger til grund for dem?

Answer 18

2 parentale og 6 rekombiante klasser

Question 19

Kromosomal interferens

Answer 19

Kromosomal interferens er et fænomen, hvor crossover-hændelser i én del af et kromosom kan påvirke sandsynligheden for, at der sker en anden crossover-hændelse i en anden del af det samme kromosom.

Når en crossover-hændelse sker i et bestemt område på et kromosom, kan det medføre, at sandsynligheden for, at der sker en anden crossover-hændelse i et nærliggende område, bliver reduceret. Dette skyldes, at der dannes kryds- og tværbindinger mellem kromosomerne under meiosen, og at de kromosomale regioner, der allerede har gennemgået en crossover-hændelse, bliver “blokeret” for yderligere crossovers.

Dette fænomen medfører, at crossover-hændelser på et kromosom ikke sker uafhængigt af hinanden, og det kan påvirke sandsynligheden for, at bestemte allelkombinationer opstår i afkommet efter en krydsning. Kromosomal interferens kan derfor have indflydelse på resultatet af genetiske kortlægninger, hvor man forsøger at kortlægge placeringen af gener på kromosomerne ved at analysere rekombinationsfrekvenser.

Question 20

% rekombination er lig A/B

Answer 20

A = Antal rekombinante gameter*100
B = Totale antal gameter

Question 21

Genetisk afstand

Answer 21

antal syge afkom*100/total antal syge afkom

Kan også ses hvis eks