12. Slægtskab og indavl Flashcards
Kollateralt slægtskab
Kollateralt slægtskab = en eller flere fælles aner.
Direkte slægtskab
Direkte slægtskab = den ene er den andens ane.
Indavl
Indavl: Avl mellem beslægtede individer
Beslægtede individer: Har genetisk materiale (alleler) til fælles
-enten fordi de har en eller flere fælles ane(r) – fx:
Fætter og kusine
Onkel og niece (kolatteralt slægtskab)
-eller fordi den ene er den andens ane – fx:
Mor og søn
Bedstefar og barnebarn (direkte slægtskab)
Definer slægtskabskoefficienten A
(to definitioner)
Slægtskabsgraden/slægtskabskoefficienten (to definitioner): a
andelen af identiske alleler (fra den/de fælles ane(r)) hos de to beslægtede individer
eller
sandsynligheden for at to beslægtede individer arver den samme (identiske) allel fra en fælles ane (bruges kun til kollateralt slægtskab)
a: værdi mellem 0 og 1
Identiske alleler er ikke bare ens alleler men af identisk oprindelse
Enten fordi at de stammer fra en fælles ane (fælles far)
Eller fordi at den ene har arvet dem fra den anden (far og søn)
Definer indavlskoefficienten F
Indavlsgraden/indavlskoefficienten: F
andelen af loci med identisk homozygoti
Eller
sandsynligheden for at de to alleler i et tilfældigt valgt lokus er identiske og stammer fra en fælles ane
F: værdi mellem 0 og 1 → F=½aForældre
Identisk homozygoti - hvad er det og hvordan opstår det
Identisk homozygoti: når man arver samme allel fra en fælles ane og allelerne havner i det indavlede afkom i homozygot form.
Identisk homozygoti opstår når
a. den samme allel fra en fælles ane nedarves til 2 beslægtede individer
b. de 2 beslægtede individer får afkom sammen
c. afkommet arver den samme (identiske) allel både fra mor og far
Sådanne alleler er ”Identical By Descent” (IBD)
Indavl øger frekvensen af _ genotyper
Homozygote
Et pilediagram
Ved beregning af slægtskabet kan et pilediagram anvendes:
Lettere at overskue (især ved komplekse familier)
Kun individer af betydning for indavlen og relaterede til den fælles ane
Individer forbindes med streg/pil til forældre og/eller afkom
Hver streg repræsenterer en generation
Direkte slægtskab
Direkte slægtskab:
Definition: andelen af identiske alleller hos de to beslægtede individer.
aForældre-afkom= ½ (PRÆCIST)
aBedsteforældre-afkom = ½½ (i gennemsnit) fordi at fordelingen af maternelle og paternelle alleler i gameterne er tilfældig.
aoldeforældre-afkom=½½½ (i gennemsnit)
Indavlskoefficient (a) for et kollateralt slægtskab
Kollaterale slægskab
Definition: to individer med fælles ane.
Eks.: slægtskab mellem K og D → Fælles ane: M.
P(K og D arver A3)?
M-K (1 generation = n1): ½
M-L-D (2 generationer = n2): ½ x ½ (½ for hver generation)
Samlet (½)3
Formel: a = (½)^n1+n2
Formlen for indavlskoefficent kan ændres ved:
Indavlskoefficient (F) = ½*a.
A kan være:
Flere fælles aner: A = ½^n
Flere nedarvningsruter: A=(½^na)+(½^nb)
Indavlet fælles ane: A= ((½)^n *(1+FA))
Flere fælles aner
Flere fælles aner:
Eksempel: M og G har to fælles aner: D og P
Afkom kan arve identiske alleler fra både D og P
Veje fra M til G gennem fælles ane:
M-K-D-L-G: 4 generationer
M-K-P-L-G: 4 generationer
a(M-G) = (½)4 + (½)4 = 0.0625 + 0.0625 = 0.125
Justeret formel: a = ∑ (½)^n
Flere nedarvningsruter
Flere nedarvningsruter
G og P har en fælles ane: K - så G kan arve Ks alleler via mor og far
Beregning: Veje fra G til P gennem fælles ane:
G-L-K-F-P: 4 generationer
G-M-K-F-P: 4 generationer
a(G-P) = (½)4 + (½)4 = 0.0625 + 0.0625 = 0.125
Indavlet fælles ane
Indavlet fælles ane
P: identisk homozygoti ~ 18% af loci (FA)
Øget sandsynlighed for M og G arver identisk allel
Endelig formel: a = ∑ ((½)n (1+FA))
Beregning:
Veje fra M til G gennem fælles ane:
M-K-D-L-G: 4 generationer
M-K-P-L-G: 4 generationer
a(M-G) = ((½)4 x 1.0) + ((½)4 x 1.18) = 0.0625 + 0.074 = 0.137
Hvad vil det sige at indavlsgraden er relativ?
Indavlsgraden er relativt ift den grundpopulation som dyret tilhøre. En let indavlet population vs en fuldstændig udavlet population. Fås samme indavlskoefficient for de to dyr vil det ene individ være mere identisk homozygoti til trods for samme indavlskoefficient.
Individet fra den let indavlede population vil være den der har størst identisk homozygoti da der i populationen er færrest alleler i spil i populationen.
