10. Kromosomfejl Flashcards
Kunne definere følgende kromosomfejl (rearrangementer): deletioner, duplikationer, inversioner og translokationer
Kromosom arrangementer:
Deletion: Et stykke af kromosomet fjernes (mange gener).
Duplikation: Når et kromosomstykke duplikeres 2 eller flere gange.
Insertion: Når et kromosomstykke roteres 180 grader og indsættes på det samme kromosom.
Translokation: Når et stykke kromosom bryder af og hæfter sig fast på et andet kromosom.
Arrangementer sker, når kromosomerne går i stykker.
Eksempel på en deletion
Hvis der opstår brud på kromosomet på to steder, og det mellemliggende stykke fjernes, inden ligase limere dem sammen, opstår der en deletion.
Eksempel på translokation
Hvis der opstår brud på kromosomet på to steder, og det mellemliggende stykke fjernes, inden ligase limere dem sammen, opstår der en deletion.
Hvis et afbrækket stykke kan sættes ind i et andet stykke opstår translokation.
Eksempel på reciprok translokation
Brud på to ikke-homologe kromosomer + translokation = reciprok translokation.
Forklar hvordan kromosomale rearrangementer kan opstå
SKÆV OVERKRYDSNING
Eks to mikrosatellitter med samme repeat-sekvens
Tandem duplikation
Skæv overkrydsning = deletion i ene DNA streng (12-45) og duplikation i anden DNA streng (123345)
Non tandem duplikation
Duplikation kan også opstå ved at to homologe kromsomer går i stykker og fragmentet af det ene kromosom bindes i midten af det andet kromosom = deletion i det ene og duplikation i den anden. Når de to kromosomers fragmenter ikke længere sidder side om side kaldes det non-tandem duplikation
Konsekvenser af deletions-rearrangementer
Deletions rearrangementer:
Deletions homozygoter vil ofte dø da de mangler essentielle gener i kromosomet.
Deletions heterozygoter overlever typisk men kan have påvirket fænotyper da de kun har en kopi af genet i genomet vil evt. recessive skadelige alleler komme til udtryk.
OBS: i sjældne tilfælde opstår haploinsufficiens hvor en kopi gen ikke producerer nok til at opretholde en normal fænotype.
Konsekvenser af duplikations-rearrangementer
Dublikations rearrangementer:
Dublikations homozygot vil danne en tandem duplikation da den vil have to af et gen eks 12334
Dublikations heterozygoter vil danne non-tandem duplikation og have et af samme gen indsat flere steder i genomet. Eksempelvis 152345
HUSK: I sjældne tilfælde kan duplikation give AFVIGENDE fænotype.
De ekstra kopierer kan nemlig give øget produktmængde. Generne i duplikeret fragment kan adskilles fra naturlige enheder eller havne i nærheden af nye regulatorer og ekspressionen af generne ændres ift timing og produktmængde.
Forklar hvordan inversioner og translokationer kan påvirke meiosen
Inversioner og translokationer:
1) Inversioner påvirker som regel ikke fænotypen men hvis kromosom-bruddet sker midt i genet kan inversionen ødelægge genets funktion.
2) Samme er tilfældet for kromosomer hvor brud ødelægger genet og deraf og påvirker fænotypen.
3) Et andet problem kan være at generne flyttes til områder med regulatorer der ændre genekspressionen.
Forklar hvilke mekanismer meiosen benytter i tilfælde af homozygote eller heterozygote rearrangementer
Ved homozygoti for et rearrangement er de to homologe kromosomer ens.
Ved heterozygoti opstår problemer når de homologe skal synapse før overkrydsning fordi at de ikke er ens.
Specifikke mekanismer kromosomet benytter sig at for at få meiosen til at forløbe bedst muligt:
Deletions heterozygote
Duplikations heterozygote
Pericentrisk inversions heterozygote
Paracentrisk inversions heterozygote
Reciprok translokations synapse
Deletions heterozygot (kromsomal rearrangement)
Deletions heterozygote:
Opstår når to homologe kromosomer skal synapse men den ene har fået en deletion og er derfor ikke genetisk identisk til anden kromosom. Den længste kromosom uden deletion danner derfor et loop af den sekvens der er deleteret. På den måde kan kromosomerne nu synapse og overkrydse udenfor deletionsområdet. Deletions sekvens loopet vil dog stadig nedarves til halvdelen af gameterne.
Duplikations heterozygote (kromsomal rearrangement)
Duplikations heterozygote:
Opstår når et homologt kromosompar skal synapse men den ene har fået en duplikation. Duplikations heterozygoten danner igen et loop og overkrydsnignen sker udenfor duplikationen men den nedarves stadig til halvdelen af gameterne.
Pericentrisk inversions heterozygot (kromsomal rearrangement)
Pericentriske inversions heterozygoter opstår når det ene kromsom har fået en inversion af genet og derfor lavet et drejet loop for at kunne synapse med det komplementære homologe kromsom.
Sker overkrydsningen i den inverterede region dannes der nu både kromosomer med deletioner og duplikationer.
På det ene kromosom vil der ske en duplikation af et område samt en deletion af et andet område så der opstår non-tandem duplikation. Omvendt vil det selvfølgelig være på det andet kromsom.
Gameter med sådanne kromosomer kaldes ubalancerede gameter der mangler eller har for meget genom. Disse medfører af embryoner ikke kan overleve.
Paracentrisk inversions heterozygote: (kromsomal rearrangement)
Kromosompar hvor det ene kromosom har inversion der ikke omfatter centromeren kaldes paracentrisk. Denne skal igen lave et inversionsloop for at kunne synapse.
Sker overkrydsning i inverteret region vil det igen resulterer i kromosomer med både duplikation og deletioner.
Begge kromosomer får både deletioner og duplikationer men det ene kromosom får begge centromerer og bliver dicentrisk og vil under 2 meiotiske deling trækkes i 2 tilfældige stykker. Det andet kromosom bliver acentrisk og går tabt under meiosen.
Samlet set giver synapse i inverterede regioner ubalancerede gameter.
Derfor har også paracentrisk inversions heterozygoter have nedsat fertilitet.