13. Sygdomsgenetik og segregationsanalyse Flashcards
Beskrive hvornår mistanken om arvelig ætiologi for en sygdom opstår
Alt tyder på en ny arvelig sygdom:
fx. stigende forekomst hos en race
eller høj incidens i en familie
miljøfaktorer er udelukket
Fejlkilder i genealogiske undersøgelser
(FULGHI)
Fejlkilder i genealogiske undersøgelser
Usikker diagnostik (skal laves specifikke undersøgelser)
Fæno kopier (afvigende fænotype pga. miljøfaktorer)
Heterogenitet (mutationer i forskellige loci = samme sygdom)
Late onset sygdomme Sygdommen først kommer fænotypisk til udtryk i dyrets liv når den eks er 8 år
Inkomplet penetrans = udviser ikke sygdommen lige meget
og
Genetisk heterogenitet = Samme fænotype/kliniske symptomer - Forskellig genetisk baggrund
Lokus heterogenitet
Mutationer i forskellige gener giver samme sygdom
Allel heterogenitet
Forskellige mutationer i samme gen (alleler) giver samme sygdom
Genetisk heterogenitet to typer
Genetisk heterogenitet = Samme fænotype/kliniske symptomer - Forskellig genetisk baggrund
Lokus heterogenitet
Mutationer i forskellige gener giver samme sygdom
Allel heterogenitet
Forskellige mutationer i samme gen (alleler) giver samme sygdom
Hvad bruger man en segregationsanalyse til
Til at undersøge hypotesen om en sygdoms arvegang statistisk
Singles metode - segregationsanalyse
Singles metode:
▪ Kun ved recessiv arvegang
▪ Familier med mindst 1 sygt afkom
▪ Bias: bærer x bærer kan give kuld uden syge afkom
* Disse kuld er ikke med i beregningen
▪ Man benytter sig derfor af hele familier hvor sygdommen fremtræder i kuld!
Singles:
Recessivt nedarvede sygdomme, hvor familier med rask afkom efter bærereforældre systematisk udelukkes. (Materialet indsamles ud fra kendskab til syge afkom i kuldene).
X2 test - segregationsanalyse
bruges når man har viden omkring forældrene, og derfor bruger man kuld af kendte anlægsbærere og tester dette med om hypotesen om den enkelte nedarvningstype er korrekt
Dominant nedarvede sygdomme
Recessivt nedarvede sygdomme, hvor familier med rask afkom efter bærerforældre potentielt kan være med.
Forklar hvad der indgår i singles metode formel
SINGLES:
P-hat = sande sygdomsfrekvens
Est.var.P.Hat = Variansestimat af sygdomsfrekvens,
z^2 = forskel ml. observeret og forventet sygdomsfrekvens
T = totalt afkom
A = totalt sygt afkom
A1 = antal familer med 1 sygt barn
A2 = antal familer med 2 syge børn
haplotype
haplotype er en kombination af alleler i forskellige loci på et kromosom