מיקרוביולוגיה: אבחון מולקולרי ועקרונות מעבדה Flashcards
מהי המוגבלות העיקרית של השיטה האבחונית המיקרוביולוגית הקלאסית ?
תיתכן עד ימים שלמים של גידול האורגניזמים ואבחון מלא לפי צביעה או תרביות
מה היתרון של הבדיקה המולקולרית לאבחנה על פני השיטה הקלאסית?
אין צורך לגדל את החיידק או נגיף - מהירות ודיוק גבוהים יותר
עד 4 שעות
מהן החסרונות הברורים של שיטות מולקולריות לאבחון מיקרוביולוגי?
מחיר פי 10 עד 100 ממחיר תרבית
מאמץ רב לפיתוח השיטה
אין בדיקות עוקבות אפשריות כמו בתרביות
איך נראה גרף הגילוי של גורמי זיהום חדשים על ידי דגימות מולקולריות?
אקפוננציאלי
מהן השיטות המולקולריות?
DNA-EXTRACTION PCR
איזה סוג פולימראז משומש - PCR ?
למה?
TAQ-POLYMERASE
HEAT RESISTANT
איזה חיידקים מתאימים מאוד לשימוש באבחנה מולקולרית?
תחת טיפול אניביוטי פסטידיים כשל גידול בתרבית מצב מסכן חיים מיידי בירור גנטי לתנגודת חיידקית
איזה שימוש נרחב יש לאבחנה ביולוגית באופן המביט על האוכולסיה?
חקירות אפידימיולוגיות
NESTED PCR
במה תורם לנו סבב נוסף
באבחון מולקולרי?
באיזה אורגניזם נהוג לעשות זאת? למה?
מגביר ספציפיות
לוקח זמן רב יותר - אספרגילוס
כמה ביקורות נהוג לעשות בתהליך ה PCR ?
שלושה
שתיים שליליות
ואחת חיובית
איזה שיטה תעזור לנו לברור בין זנים בתוך משפחה של בקטריות?
PCR-RFLP
PCR-RFLP
מה יהיה ההבדל בין זן לזן במשפחה?
אורך שונה של גנים שירוצו לפי המסה למרחק שונה על גבי הגל אלקטרופורזיס
איזה שיטה היא הרחבה ביותר בזיהוי מולקולרי?
PAN-PCR
PAN-PCR
איזה אתר מטרה הוא מבין המקובלים ביותר לבדיקה של חיידקים באופן רחב? מה ההיתרונות בו?
גנים ריבוזומליים - 16 אס אר-דנא
חלקים רבים משותפים לכמעט כל החיידקים וגם חלקים ייחודיים וספציפים בגנים לזנים מסוימים.
איזה קבוצות חשובות בזיהוי בעזרת PCR
לגבי סוג הטיפול
MDR - CRE, MRSA, VRE
מה היתרון של הגישה הסינדרומית לעומת הגישה הגן-אקס במכשור של הפיסיאר?
מאפשר באותו זמן (2 שעות) פענוח של מספר מזהמים ולא אחד בודד!
איזה שיטות מולקולריות עתידות לתפוס מקום יותר גדול באבחון?
NGS, WGS
איזו שיטה מאפשרת זיהוי מולקולרי של וירוסי RNA ?
RT-PCR
באיזה שלבים יש את מספר הטעויות הכי גדול במעבדה המיקרוביולוגית?
PRE-ANALYTICAL
לקיחת הדגימה והעברת הדגימה למעבדה
הצוות הרפואי והסיעודי יהיה מעודכן בנוגע ל____
העבודה של המעבדה )רגישות, ספציפיות, דרך לקיחה
ומשלוח של דגימות).
הצוות הרפואי והסיעודי יהיה מעודכן בנוגע לשיטות
העבודה של המעבדה )רגישות, ספציפיות, דרך לקיחה
ומשלוח של דגימות).
צוות המעבדה יקבל מהצוות הרפואי והסיעודי __________ (מחלות רקע, טיפול תרופתי קבוע,
היסטוריה רפואית ).
צוות המעבדה יקבל מהצוות הרפואי והסיעודי מידע
לגביי המטופל (מחלות רקע, טיפול תרופתי קבוע,
היסטוריה רפואית ).
שתן לתרבית יש לקחת מהמטופל לאחר חיטוי אזור מתן השתן,
איסוף שתן אמצעי ורצוי שתן ראשון של הבוקר. במידה והשתן
לא נאסף בצורה זו מתקבלות _____ _______ וקשה לקבוע
האם מדובר בזיהום אמיתי ומיהו הפתוגן.
שתן לתרבית יש לקחת מהמטופל לאחר חיטוי אזור מתן השתן,
איסוף שתן אמצעי ורצוי שתן ראשון של הבוקר. במידה והשתן
לא נאסף בצורה זו מתקבלות צמיחות מעורבות וקשה לקבוע
האם מדובר בזיהום אמיתי ומיהו הפתוגן.
כמו כן לאחר נטילת הדגימה יש לשמור את השתן בקירור
לשלוח למעבדה בהקדם מאחר ותרבית שתן היא ברוב המקרים-
כמו כן לאחר נטילת הדגימה יש לשמור את השתן בקירור
לשלוח למעבדה בהקדם מאחר ותרבית שתן היא ברוב המקרים
כמותית
כרבע מהבקבוקים שמגיעים למעבדה מגיעים ללא מספיק __ ואז יש סיכון של תשובה שלילית שגויה .
כרבע מהבקבוקים שמגיעים למעבדה מגיעים ללא מספיק דם ואז יש סיכון של תשובה שלילית שגויה .
תרבית דם צריכה להילקח לאחר ____ של אזור הדקירה
למרות זאת עדיין תרביות דם מזוהמות ע”י חיידקים המהווים את
הפלורה של העור
תרבית דם צריכה להילקח לאחר חיטוי של אזור הדקירה
למרות זאת עדיין תרביות דם מזוהמות ע”י חיידקים המהווים את
הפלורה של העור
שוב לזכור שלמידע שזורם מהמחלקה למעבדה
השפעה רבה על תהליך העבודה במעבדה למשל -
התאמת מצעי הגידול
הארכת פרוטוקול האינקובציה של התרבית
מהן שתי הגישות הקלאסיות לזיהוי פתוגנים ?
משטח ישיר הכולל צביעה
זריעת הדגימה ע”ג מצעי גידול - בדיקת רגישויות ומטבוליזם
מהן ההנחיות לגבי משך ההעברה של הדגימה אל המעבדה?
להעביר דגימות בהקדם האפשרי אם זמן העברה מעל
שעתיים, להשתמש בהתקן עם מצע העברה (או לשמור
(בקירור.
עד 24 שעות בכל מקרה.
אילו דגימות אין לאכסן בקירור?
תרביות-דם, נוזל שדרה, דגימות מדרכי-
המין, עין, או אוזן תיכונה.
מהן ההנחיות לסימון בדגימות למעבדה?
בטיחות וסימון – לגבי חומרים עם רמת סיכון גבוהה.
סימון נכון ומלא (שם, מס’ זיהוי, מקור, מען, תאריך) במדבקה
דוגמאות לאיסוף תקין של דגימות מדרכי נשימה תחתונות?
כיח, ריר טרי המכיל תאי דלקת
דוגמאות לאיסוף תקין של דגימות מדרכי השתן?
זרם אמצעי
SPA
דוגמאות לאיסוף תקין של דגימות מדרכי עיכול?
צואה טרייה
חומר שנאסף באנדוסקופיה
דוגמאות לאיסוף תקין של דגימות מדם ורידי?
דגימות מ2/3 איסופים שונים ביממה, לפני מתן אנטיביוטיקה
נפח: 20 מ”ל
מהן יתרונות צביעת גרם:
שיטה מהירה -~ 5 דקות
יכולה לתמוך בבחירת אנטיביוטיקה
בקביעת סוגי תרביות לדגימה מסוימת
ובהשוואת ממצאים מדגימה לתוצאות בתרבית.
מהי השיטה באפייון מטבולי של חיידק? מה נעשה במהלך חלק זה?
נזהה תבניות של תגובות חיוביות ושליליות לשם זיהוי ואבחון האורגניזם.
תבניות כאלה יצרו פרופיל מטבולי שהוא כלי אבחוני!
דוגמאות לפרופילים מטבוליים בקטריות?
- חיידקים מהירי גידול ממשפחת חיידקי המעיים
- חיידקים גרם שליליים הגדלים לאט ואינם מהמשפחה
הנ”ל. - אנאירובים
מה ההבדל בין האפיון המטבולי שמבוצע על ידי ערכה אוטומטית לעומת ערכה ידנית?
המערכות הידניות מתבססות על הכישורים האנאליטיים
של איש המעבדה לקריאה ולפרשנות של בעוד שמערכות
אוטומטיות מציעות גישה ללא-מגע יד אדם (מלבד שלבי
ההכנה) ומאפשרת זמן פנוי לפעילויות אחרות
על איזה סוג של ערכה מדובר לפי היתרונות המוצגים? אוטומטי/ידני
-מערכת ניהול בסיס נתונים רחב
-רמת איכות ודיוק גבוהים
-הפנלים ]כרטיסי בדיקה[ כוללים 43 – 48 מבחנים ביוכימיים.
-תוצאות לאחר: 4 , 10 , 48 שעות בהתאם לסוג הכרטיס.
-אפשרות למתן תשובות בזמן אמת למחשב השולח.
דווח על ממצאים חריגים.
אוטומטי
מדובר בשיטה פיזיקאלית בה יורים קרן לייזר לעבר חיידקים ההופכים ליונים עם תצריף יוני סגולי לכל חיידק וחיידק. כך נוצר מעין “כרטיס ביקור” יוני של החיידקים בצורת גרף, כשציר ה- x הוא זמן הטיסה\גודל המולקולה וציר ה- y הוא כמות המולקולות מאותו הגודל.
על איזה בדיקת מעבדה מיקרוביולגית מדובר?
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI-TOF)
Mass Spectrometry
Antibiotic Susceptibility Testing
איזה שיטות משפיעות על כך?
מה הנתון אליו נכוון בבדיקה זו?
שיטת הדיפוזיה באגר
שיטת המהילה
מכוון למציאת - MIC!
MIC Minimum Inhibitory concentration
הגדרה ?
הריכוז הקטן ביותר של אנטיביוטיקה נתונה, המעכב
צמיחת חיידק נבדק בתנאי ניסוי מוגדרים ומבוקרים.
התוצאות מבוטאות ב – m g/ ml .
MBC Minimal Bactericidal Concentration
הגדרה ?
הריכוז הקטן ביותר של אנטיביוטיקה נתונה, המשמיד
חיידק נבדק בתנאים מוגדרים ומבוקרים.
התוצאות מבוטאות ב – m g/ ml .
מהו עיקרון הבדיקה של - E-TEST ?
מבוסס על שילוב של 2 השיטות הנ”ל: מהילה ודיפוזיה.
- יקבע בהתאם ל MIC
.אורך הסולם, במקום שהאליפסה מתאחדת עם הרצועה
QUANTITATIVE TEST
אתה בודק את הריכוז המינימלי הדרוש (MIC) של אמפיצילין לטיפול ב-E.coli באמצעות disc diffusion method. מה נכון בנוגע לבדיקה?
- שטח האינהיביציה (inhibition zone) גדל ככל שהחיידק עמיד יותר לאנטיביוטיקה.
- שטח האינהיביציה (inhibition zone) בהתחלה גדל, וכעבור מספר ימים עם העלאת ריכוז האנטיביוטיקה בדיסק, קטן.
- שטח האינהיביציה (inhibition zone) גדל ככל שהחיידק רגיש יותר לאנטיביוטיקה.
- אמפיצילין אינו יעיל לטיפול ב-E.coli ולכן בדיקה זו אינה מתאימה לצורך קביעת ה-MIC.
- שטח האינהיביציה (inhibition zone) גדל ככל שהחיידק רגיש יותר לאנטיביוטיקה.