VL 8: RNA-Prozessierung - mRNA Export und rRNA

Question 1

Was wird in welche Richtung transportiert? (Kern - Zytoplasma)

Answer 1

Aus Kern raus:

• mRNA
• tRNA
• pre-miRNA
• snRNA

In Kern hinein

• ribosomale Proteine
• snRNP
• Histone
• nuclear proteins

Question 2

Wie sieht ein Kernporekomplex aus

Answer 2

sieht grob wie ein Basketballkorb aus

verdünnt sich nach innen

Cytoplasmafilamente erkennen Proteine die importiert werden sollen

Question 3

Welche Bestandteile von mRNA-Partikeln sind wichtig für den Export?

Answer 3

5‘ cap and cap-Bindeproteine

3‘ poly−A-Schwanz and poly-A Bindeproteine

Spleißfaktoren

Generelle RNA-Bindeproteine (hnRNPs)

Question 4

Die drei Schritte des Exports

Answer 4

1. mRNP Assemblierung: aus dem Gen wird die reife mRNP (Anheftung Mex67, Prozessierung, Spleißen, Transkription)
2. Translokation: Beförderung reifer mRNP aus dem Zellkern ins Zytoplasma
3. 3. mRNP Disassemblierung: reife mRNA wird translatiert (Abspaltung von Mex67)

Question 5

Was macht Mex67?

Answer 5

assoziiert mit Nukleoporinen

ist in 75% aller mRNA-Exporte involviert

Disassemblierung ist wichtig für Direktionalität des Exports (kein Zurücklaufen in der Pore)

Question 6

tRNAs und rRNAs zeigen ausgedehnte Selbstfaltung

Answer 6

?

Question 7

Wie sieht die Sekundärstruktur der tRNA aus?

Answer 7

Kleeblatt-Struktur

Benennug der Arme im Uhrzeigersinn:

1. Akzeptor Arm
2. Phi-U-loop
3. variabler loop (das kleine Ding)
4. Anticodon-loop
5. D-loop

Question 8

Wie sieht die Tertiärstruktur der tRNA aus?

Answer 8

D-loop und Phi-U-loop werden über die Mitte gefaltet

Akzeptor-Arm wird nach rechts gefaltet

–> ergibt L-Form

Question 9

Aminoacylierung

Answer 9

das Befestigen von Aminosäuren an tRNAs

Question 10

Prozess der Aminoacylierung

Answer 10

1. Schritt: Transfer von AMP
   AS + ATP –> adenylierte AS + Pyrophosphat
2. Schritt: tRNA-Beladung durch Aminoacyl-tRNA-Synthetase:
   adenylierte AS + tRNA –> Aminoacyl-tRNA + AMP

Question 11

Nucleolus

Answer 11

Region im Zellkern in der die rRNA liegt

Question 12

Welche Subdomänen findet man im Nucleolus?

Answer 12

FC = Fibrillar Centre
GC = Granular Component
DFC = Dense Fibrillar Component

Question 13

Wie kommt es zur Struktur des Nucleolus?

Answer 13

Keine physikalische Barrieren (z.B. Membranen)

=> Veränderte Aufenthaltsdauer für
Komponenten der Ribosomenbiogenese

=> Der Nukleolus ist eine „kinetische
Struktur

Question 14

Wie erkennen die snoRNAs die zu modifizierenden Basen in tRNAs und rRNAs?

Answer 14

Basen sind komplementär zu ihrer eigenen Sequenz

Question 15

Wann geschieht die Basenmodifikation in tRNAs und rRNAs?

Answer 15

kotranskriptional

Question 16

Wie und warum werden Basen in rRNA und tRNA modifiziert?

Answer 16

Wie: Sequenzspezifische Basenmodifikationen (Umwandlung von U zu Pseudo-U, Methylierung)

Warum: stabilisiert die Faltung

Question 17

rRNAs werden im Nukleolus transkribiert und prozessiert

Answer 17

?

Question 18

Was sind die Eigenschaftenvom genetischen Code?

Answer 18

• Triplettcode
• kommafrei, nicht überlappend
• eindeutig
• degeneriert
• universell

Question 19

NPC - Was ist das?

Answer 19

Nuclear pore complex = kernporenkomplex

Question 20

Wie ist die kernhüllmembran aufgebaut?

Answer 20

Äußere kernmembran
Perinukleärer raum
Innere kernmembran
Kernlamina

Question 21

Was sind Nups?

Answer 21

= Nucleoporine

• Strukturproteine des NPC
• symmetrisch auf cytoplasmatischer und Kernseite verteilt
• kontaktieren die zu transportierenden lasten

Question 22

Womit ist der mRNA-Export gekoppelt und warum?

Answer 22

Unreife mRNAs müssen im Kern bleiben, deswegen ist der Export gekoppelt mit
- transkription
- prozessierung
(- translation)

Question 23

Was ist ein mRNP?

Answer 23

Messenger ribonucleoprotein partikel

Question 24

welche Funktion hat dbp5?

Answer 24

Entfernt den promotor für mRNA-Export –> mex67 fällt ab –> verhindert Rückkehr in die pore
Helikase trennt das Bindeprotein von der mRNA

Question 25

rRNA-Prozessierung

Answer 25

• Nukleasen schneiden prä-rRNA zurecht

- an der Basenmodifizierung sind snoRNA und Proteine beteiligt

Question 26

Wo erfolgt die rRNA expression?

Answer 26

Im Nukleolus

Question 27

Wie ist die struktur der rRNA?

Answer 27

Tannebaumstruktur :)

Question 28

Was beinhaltet die sekundärstruktur der rRNA bei E. coli?

Answer 28

• zentrale domäne
• 3’ haupt- und 3’ nebendomäne
• 5’ domäne

Question 29

Wie wird die tRNA prozessiert?

Answer 29

• verkürzen
• basenmodifikation
• eigtl spleißen
• Anheften des CCA-Endes
• Anbinden der AS

Question 30

Wie viele Bindetaschen haben die Aminoacetyl-tRNA-Synthetasen?

Answer 30

3:

• als erstes binden eine spezifische AS und ATP an die Synthetase
• AS wird nach Bildung von AMP aktiviert und Pyrophosphat wird entlassen
• korrekte tRNA bindet an Synthetase und AS wird angehängt, AMP wird entlassen
• Die beladene tRNA wird entlassen

1 Tasche für AS
1 Tasche für ATP
1 Tasche für tRNA

Question 31

Woran erkennt man eine korrekte tRNA ?

Answer 31

Akzeptorarm

Anticodon