Repetidos Comunes Flashcards

1
Q

¿Qué son las regiones repetidas dispersas y dónde se encuentran?

A
  • Son secuencias repetidas que pueden estar en diferentes regiones del genoma.
  • Se encuentran en la heterocromatina y comprenden elementos como transposones, pseudogenes, repeticiones cortas y largas, y repeticiones en tándem.
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2
Q

¿Qué son los transposones?

A
  • Elementos móviles del genoma, conocidos como genes saltarines, que pueden replicarse e insertarse en diferentes localizaciones dentro del ADN.
  • Representan el 45% del genoma humano.
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3
Q

¿Cuáles son las dos clases principales de transposones?

A
  1. Clase I (Retrotransposones):
    - Se transcriben a ARN y luego se retrotranscriben para reintegrarse en el genoma.
    - Incluyen LTRs, LINEs y SINEs.
  2. Clase II (Transposones de ADN):
    - Se desplazan directamente en el ADN sin pasar por un intermediario de ARN.
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4
Q

¿Cómo se dividen los retrotransposones?

A
  1. LTRs (Repeticiones terminales largas):
    - Secuencias largas (100 pb a 5 kb) localizadas en los extremos de los cromosomas.
  2. No LTRs (Repeticiones no terminales largas):
    - LINEs (Elementos intercalados largos): 20% del genoma.
    - SINEs (Elementos intercalados cortos): 13% del geno
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5
Q

¿Qué son los LINEs y cuál es su importancia?

A
  • LINEs (Long Interspersed Nuclear Elements) representan el 20% del genoma y son elementos autónomos, capaces de hacer los productos necesarios para la transposición.
  • Localizados en regiones eucromáticas, en bandas Giemsa + (ricas en AT).
  • Familias de LINEs:LINE-1, LINE-2, LINE-3
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6
Q

¿Qué son los SINEs y cómo funcionan?

A
  • SINEs (Short Interspersed Nuclear Elements) son retrotransposones no autónomos que miden entre 100-400 pb
  • Dependen de la maquinaria de los LINEs para retrotranscribirse.
  • El elemento ALU es el tipo más común de SINEs, con una longitud de 280 pb, compuesto por dos repeticiones en tándem de 120 pb cada una.
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7
Q

¿Qué es el elemento ALU y qué características tiene?

A
  • Es el SINE más común, con una longitud de 280 pb.
  • Está compuesto por dos repeticiones en tándem de 120 pb, seguidas de una secuencia de An/Tn.
    -Se localiza en las bandas R y se cree que tiene una función en la unión celular.
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8
Q

¿Qué son las secuencias repetidas en tándem?

A

Son secuencias repetidas que se agrupan en bloques iguales y se repiten al menos 4 veces.

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9
Q

¿Cuáles son las diferencias entre SINEs y LINEs?

A
  • SINEs son más cortos (100-400 pb) y no autónomos, dependen de los LINEs para la transposición.
  • LINEs son más largos (hasta 6 kb en LINE-1) y autónomos, ya que contienen las enzimas necesarias para su transposición (endonucleasa y transcriptasa reversa).
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10
Q

¿Cuál es la relación entre los LINEs y los SINEs?

A
  • Los SINEs comparten secuencias con los LINEs.
  • La maquinaria de los LINEs, en particular la transcriptasa reversa, es responsable de la retrotranscripción de los SINEs.
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11
Q

¿Qué es LINE-1 y qué proteínas produce?

A
  • LINE-1 es una familia de retrotransposones autónomos de 6 kb que constituye el 17% del genoma.
  • Produce endonucleasa y transcriptasa reversa y tiene una cola de poli A.
  • También produce la proteína P40, que actúa como chaperona de ácidos nucleicos.
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