Rearreglos Genomicos Flashcards
¿Qué son los rearreglos genómicos?
Son cambios en el DNA que pueden abarcar desde miles de bases hasta regiones completas de cromosomas, como duplicaciones, inversiones, inserciones y deleciones.
¿Qué nombre reciben las enfermedades causadas por rearreglos genómicos?
Desórdenes genéticos.
¿Cuáles son los tres mecanismos propuestos por los cuales ocurren los rearreglos genómicos?
NAHR (Recombinación homóloga no alélica), NHEJ (Non-homologous end-joining) y FoSTeS (Fork Stalling and Template Switching).
¿Qué es NAHR y cómo ocurre?
NAHR es la Recombinación homóloga no alélica, mediada por LCRs (low copy repeats). Ocurre cuando las regiones repetidas de los LCRs inducen un entrecruzamiento erróneo debido a la gran similitud de las secuencias.
¿Dónde ocurren comúnmente los eventos de NAHR?
En regiones conocidas como “hot spots” de los LCRs, tanto en mitosis como en meiosis.
¿Qué diferencia hay entre un rearreglo recurrente y uno no recurrente?
Los rearreglos recurrentes están delimitados por LCRs, mientras que los no recurrentes tienen regiones cortas de sobrelapamiento (SRO) y empiezan y terminan en lugares diferentes.
¿Qué tipos de rearreglos genómicos pueden surgir de NAHR según la orientación y ubicación de los LCRs?
• Misma orientación en el mismo cromosoma: Duplicaciones o deleciones.
• Orientación opuesta en el mismo cromosoma: Inversiones.
• LCRs en diferentes cromosomas: Traslocaciones.
¿Cómo puede afectar la eficiencia de NAHR?
La eficiencia de NAHR puede estar influida por la longitud de los LCRs, la cercanía entre ellos y el porcentaje de identidad, siendo común en LCRs de 100 a 400 kb con >96% de similitud.
¿Qué es NHEJ y cuál es su función principal?
NHEJ (Non-homologous end-joining) es un mecanismo de reparación de rupturas de doble cadena (DSB) del DNA, como las causadas por radiación o especies reactivas de oxígeno.
¿Cuáles son los pasos principales del mecanismo de NHEJ?
- Detección de la DSB. 2. Puenteo de los extremos dañados. 3. Modificación de los extremos para compatibilidad. 4. Ligación de los extremos.
¿En qué tipo de eventos es más común el mecanismo de NHEJ?
Es el mecanismo más común en las translocaciones cromosómicas observadas en cáncer.
¿Qué es FoSTeS y cuándo ocurre?ii
FoSTeS (Fork Stalling and Template Switching) es un mecanismo derivado de la replicación del DNA, que ocurre cuando hay estructuras de DNA palindrómicas, stem-loop, o cruciformes.
¿Cómo se describe el proceso de FoSTeS durante la replicación?
Durante la replicación, si una hebra rezagada se desvía, puede adherirse y copiar fragmentos erróneos, generando un loop que resulta en una duplicación del material genético.
¿Qué son los LCRs y cuál es su relevancia en los rearreglos genómicos?
Los LCRs (Low Copy Repeats) son fragmentos de DNA de 10-300 kb con una similitud del 95-97%, localizados en regiones pericentroméricas, subteloméricas e intersticiales. Su presencia facilita el NAHR y los rearreglos genómicos.
¿En qué cromosomas se encuentran la mayor cantidad de duplicaciones mediadas por LCRs?
En el cromosoma 22 y el cromosoma Y.
NAHR en mitosis
Resultando en mosaicos de poblaciones de celulas que portan el rearreglo genomico -> CANCER
En la meiosis NAHR puede llevarse a cabo en:
- En la misma cromática (intracromatida)
- En cromátidas hermanas (intercromatida)
- En cromosomas homólogos (intercromosomal)
