Manejo y conservación de muestras biológicas/aplicaciones de los microarreglos Flashcards
¿Para qué son esenciales las muestras biológicas como sangre, orina o tejido?
Son esenciales para el diagnóstico y monitoreo de enfermedades, investigación y creación de bancos genéticos.
¿Qué se puede evaluar mediante el análisis de fluidos corporales?
Inflamación, presencia o ausencia de infecciones, y la naturaleza de un tumor (maligno o benigno).
Menciona tipos de fluidos corporales analizados en estudios clínicos.
Líquido sinovial, líquido cefalorraquídeo, liquido de membranas serosas, líquido amniótico, orina, heces, semen, secreciones vaginales
¿Cuáles son algunas fuentes comunes para la extracción de ADN?
Sangre periférica, células epiteliales, raíces del cabello, biopsia de tejido, y líquido amniótico.
¿Qué técnica permite la identificación de ADN o ARN mediante hibridación en una estructura de vidrio o silicona?
Los microarreglos.
¿Cuáles son los tipos de microarreglos y qué detecta cada uno?
• SNPs: Detectan variantes genéticas específicas. ADN
• Expresión génica: Analizan cDNA para ver si un gen está activo.
• Metilación: Comparan sitios de metilación (CpG).
• Proteínas: Analizan proteínas usando anticuerpos específicos.
¿Cuál es la relación entre fluorescencia y expresión en microarreglos?
A mayor fluorescencia, mayor expresión de ese producto en la muestra.
¿Qué es una librería en el contexto de microarreglos?
Una colección de clonas de ADN, generada a partir de células del organismo en estudio, utilizando enzimas de restricción y clonación en bacterias o levaduras.
Describe el proceso general de un microarreglo de ADN.
Oligonucleótidos se distribuyen en una estructura de sílice o silicona. Fragmentos de ADN derivados de librerías se hibridan, y las variantes se detectan mediante fluorescencia.
¿Qué identifica un microarreglo de ADN (SNPs CHIP)?
Identifica un polimorfismo específico (SNP) en cada celda, utilizando un oligonucleótido con un fluoróforo diferente para cada variante.
¿Cuántos chips se utilizan actualmente en los microarreglos de ADN?
Se utilizan aproximadamente 50,000 chips.
¿Qué son los TagSNPs en microarreglos de ADN?
Son SNPs representativos de un haplotipo y se usan para reducir la cantidad de variantes analizadas sin perder información.
Menciona dos aplicaciones de los microarreglos de ADN (SNPs CHIP).
En ciencia forense para identificación y en salud para análisis de polimorfismos en enfermedades metabólicas y cáncer.
¿Cuál es el proceso básico de un microarreglo de ARN?
Incluye extracción de ARN, amplificación a cDNA, adherencia del cDNA al microarreglo y detección mediante hibridación.
¿Qué mide la intensidad de la fluorescencia en microarreglos de ARN?
La intensidad de fluorescencia es directamente proporcional al nivel de expresión de un gen. Se mide la cantidad de gen (si se ve mucho cDNA quiere decir que el gen se esta expresando).
¿Cuáles son los dos tipos de arreglos de metilación y cómo se diferencian?
- Infinium 1: Tiene pozos separados para regiones metiladas y no metiladas.
- Infinium 2: Marca con fluorescencia roja las regiones no metiladas y verde las metiladas.
