Genes Codificantes De Proteinas Flashcards
Proceso en el que la hebra antisentido de DNA sirve de molde para sintetizar RNA. Copia exacta de la hebra sentido de DNA, excepto por el uracilo que reemplaza a la timina.
Transcripción
¿Qué es un gen?
Es una secuencia de ácidos nucleicos necesaria para la síntesis de un producto génico funcional, que puede ser una proteína o RNA. Incluye secuencias codificantes y no codificantes.
¿Qué indica la posición +1 y las posiciones negativas en la transcripción?
La posición +1 indica el comienzo de la región que se va a transcribir. Las posiciones antes de +1, como la región promotora, son negativas (-1).
¿En qué dirección se polimeriza el RNA mensajero (mRNA)?
La polimerización del RNA mensajero ocurre en la dirección 5’-3’.
¿Qué significan los términos “upstream” y “downstream”?
• Downstream (río abajo): Dirección del templado en la cual es transcrito el DNA o el RNA mensajero (+).
• Upstream (río arriba): Dirección contraria al templado (-).
¿Qué es la caja TATA y cuál es su función?
Secuencia de TA repetidas 25-35 pb río arriba del sitio de inicio de la transcripción. Estudios de mutagénesis han demostrado que el cambio de una base en esta secuencia puede disminuir la tasa de transcripción de la RNA polimerasa II (POL II)
¿Qué es la caja GC y dónde se encuentra?
Es un elemento regulador con la secuencia GGGCGG. Se encuentra en genes que no tienen la caja TATA, como los genes constitutivos, que realizan las mismas funciones en todas las células. Puede estar orientada en dirección 5’-3’ o viceversa y se une a factores de transcripción como SP1, SP3, y SP4
¿Qué son las islas CpG y cuál es su función?
Las islas CpG son secuencias ricas en CG, de 20-50 nucleótidos de longitud, que se encuentran alrededor de 100 pb río arriba del sitio de inicio de la transcripción. Estas secuencias indican el comienzo de la transcripción cuando no están metiladas.
¿Dónde se encuentra la caja CAAT y qué características tiene?
La caja CAAT se localiza en la posición -80 relativa al sitio de inicio de la transcripción. Puede orientarse en cualquier dirección, ya sea 5’-3’ o 3’-5’
¿Qué son los potenciadores distantes (Enhancers) y dónde se localizan?
Sitios de control que se encuentran lejos del sitio de transcripción, a diferencia de otros elementos reguladores que están río arriba. Reguladores tipos CIS. Pueden ser específicos según el tipo celular. POTENCIADORES
• A unos 50 kb río arriba del promotor. • Río abajo: En algún intrón o en el último exón.
¿Qué es la 5’ cap y cuál es su función?
La 5’ cap es una modificación postranscripcional donde se añade una 7-metilguanosina en el extremo 5’ del RNA.
1. Proteger el RNA de la degradación enzimática. 2. Ayudar en el transporte del RNA al citoplasma. 3. Actuar como sitio de unión para factores proteicos necesarios para la traducción en el citoplasma.
¿Qué es la cola de poli A y cuál es su función?
La cola de poli A es una modificación postranscripcional donde se agregan entre 100 y 250 adeninas en el extremo 3’ del RNA. Sus funciones incluyen:
1. Proteger el RNA de la degradación. 2. Facilitar la eficiente traducción en los ribosomas
¿Qué son las UTR y cuál es su relevancia?
UnTranslated Regions son regiones del RNA que no se traducen en proteínas. Estas regiones son importantes para la regulación de la estabilidad y traducción del RNA.
¿Qué es el transcrito primario?
El transcrito primario es el primer RNA sintetizado a partir de un gen. También se conoce como RNA heterogéneo nuclear (hnRNA) o RNA precursor.
¿Qué componentes incluye el transcrito primario?
• UTR (Regiones no traducidas)
• M7Gppp Cap o 5’ cap
• Intrones
• Exones
• Cola de poli A
¿Qué componentes forman la unidad de transcripción en el proceso de splicing?
La unidad de transcripción está formada por intrones (regiones no codificantes) y exones (regiones codificantes).
¿Qué son las splice junctions y cuál es su relevancia en el splicing?
Las splice junctions son secuencias nucleotídicas específicas en las uniones de exones e intrones que son identificadas para llevar a cabo el splicing
¿Cuáles son las secuencias consenso en las uniones de intrones y exones?
Las secuencias consenso clave en las uniones de intrones y exones son:
1. Sitio donador (en el extremo 5’ del intrón) 2. Sitio aceptor (en el extremo 3’ del intrón) 3. Sitio ramificado (ubicado cerca del extremo 3’ del intrón)
¿Cómo se inicia el proceso de splicing?
Comienza con un ataque nucleofílico de la adenina en el sitio ramificado contra la guanina en el extremo 5’ del intrón (GU), formando un lazo y rompiendo la unión entre el intrón y el exón
¿Cómo es transportado el RNA mensajero (RNAm) al citoplasma?
El RNAm se mantiene asociado a proteínas heterogéneas nucleares (hnRNP), formando el complejo proteico mensajero nuclear (mRNP). El transporte al citoplasma se realiza a través de los poros nucleares, los cuales están formados por complejos de poro nuclear (NPC) compuestos de proteínas llamadas nucleoporinas.
¿Dónde se lleva a cabo la transcripción y el procesamiento del rRNA en eucariotas?
Tanto la transcripción como el procesamiento del rRNA se llevan a cabo en el nucleolo.
¿Qué tipos de rRNA se generan a partir de un mismo transcrito en eucariotas?
- 18S: Asociado a la subunidad ribosomal menor (40S) - sintetizado por POL I.
- 28S: Asociado a la subunidad ribosomal mayor (60S) - sintetizado por POL I.
- 5.8S: Asociado a la subunidad ribosomal mayor (60S) - sintetizado por POL I.
- 5S: Asociado a la subunidad ribosomal mayor (60S) - sintetizado por POL III.
¿Qué se requiere para la iniciación de la transcripción de rRNA por la RNA polimerasa I (POL I)?
- Elemento río arriba: de -155 a -60.
- Sitio de inicio: de -40 a +5.
- La transcripción se inicia con la unión de factores de activación como UAF al elemento río arriba, seguido de la interacción con un factor trimerico y TBP en el elemento central. El complejo POL I se asocia con Rrn3p para iniciar la transcripción.
¿Cómo se madura el pre-rRNA?
Después de la síntesis en el nucleolo, el rRNA naciente se une a proteínas formando el pre-rRNP. Este contiene el 45S pre-rRNA, que es cortado para formar el rRNA maduro. Las posiciones de corte son reconocidas por el snoRNA (small nucleolar RNA). El ensamblaje de las unidades ribosomales se completa en el núcleo y luego son transportadas al citoplasma a través de los poros nucleares.
¿Cómo se componen las subunidades del ribosoma en términos de rRNA?
• Subunidad mayor (60S): Compuesta por 28S, 5.8S y 5S rRNA.
• Subunidad menor (40S): Compuesta por 18S rRNA.
¿Qué factores de transcripción están involucrados en la transcripción del tRNA y el 5S rRNA?
• TFIIIA: Actúa sobre 5S rRNA.
• TFIIIB: Actúa sobre tRNA y 5S rRNA.
• TFIIIC: Actúa sobre tRNA y 5S rRNA.
La RNA polimerasa III (POL III) se une a las cajas promotoras (A y B para tRNA, C para 5S rRNA) que se encuentran dentro de la región de transcrito.
¿Cuáles son los pasos clave en la maduración del pre-tRNA?
- Eliminación de un intrón de 14 nucleótidos mediante splicing.
- Eliminación de la secuencia 5’ de 16 nucleótidos por la ribonucleasa P (RNase P).
- Reemplazo del residuo UU en el extremo 3’ por ACC, necesario para la síntesis de proteínas.
- Modificación de diferentes bases durante el proceso de maduración.
Degradación de ARN independiente y dependiente
- Independiente: 5’cap -> decaping exonucleasa
- Dependiente: 3’ cola poli a -> exonucleasa
Y endonucleasa
