MOLECULAR BIOLOGY 2 Flashcards

1
Q

האם מנגנון השכפול בין איאוקריוטים לפרוקריוטים הוא דומה?

A

כן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מה הוא מנגנון השכפול?

A

סמי קונסרבטיבי- נשמר למחיצה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

כיצד נקרא האינזים שמזרז את הפולימריזציה?

A

די אן איי פולימראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

למה מנגנון השכפול של הדי אן איי נקרא סמי קונסרבטיבי?

A

כי כל מולקולת די אן איי חדשה שנוצרת מכילה גדיל חדש וגדין ישן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

למה זה קיבל את השם מזלג השכפול?

A

ולקולה משתכפלת מקבלת צורת,

Y

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה מכיל מזלג השכפול ומי עומד בראשו?

A

קומפלקס מולטי אינזימטי ומי שעומד בראשו הוא די אן פולימרז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה הכיוון של די אן פיי פולימראז ?

A

5 ל-3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה הבעיה במזלג השכפול ובדיאן איי פולימראז?

ואיך נפתרת הבעיה?

A

לדי אן איי פולימראז יש כיווניות אחת.

ויש שני גדילים שיושבים אחד אנטי פאראללית.

אחרי שעשו ניסוי בטימידין שמסומן רדיואקטיבית הבחינו שישנו שלב ביניים לגדיל שעובר סינטזה, בשלב ביניים זה יש רצפים לא מחוברים

לרצפי הללו קוראים מקטעי אוקאזאקי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

כמה בסיסין זה מקטעי אוקאזקי ?

A

1000-2000 בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

אילו שני סוגים עיקריים של גדילים ניתן למצוא במזל השכפול?

A

האחד גדיל מוביל (leading), המסונתז באופן רציף, והשני גדיל מתעכב, המסונתז מקטעים מקטעים – כל מקטע שכזה קרוי מקטע אוקזקי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה הממוצע שמתרחש טעויות בהכפלת הדי אן איי?

A

10 בחזקת 10 נוקליאוטידים מסונטזים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

אילו טעויות יכולות להיות בדי אן איי?

A
  1. הופעה של קשרי מימן בין

G

ל-

T

  1. טאוטמריזציה שיכולה לגרום להופעה של קשרי מימן בין סי לאיי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

אילו מנגנוני הגהה יש בדי אן איי פולימראז?

A
  1. לנוקליאוטיד התקין יש אפיניות גבוהה לפולימראז. בנוסף כאשר ההנוקליאוטיד נכנס לפולי, הפולי עובר שינוי מבני בו הוא מהדק את האתר הפעיל - הדבר הזה יקרה בסיכוי גבוהה כאשר יש נוקליאוטיד מתאים
  2. פעילות האקסונוקלאוז
  3. strand directed mismatch repai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מה היא פעילות האקסונוקלאז?

במה די אן איי פולימראז חייב להשתמש?

A

בפריימר כדי לחוש את המבנה המרחבי שך הדי אן איי.

אם ההפריימר/הפולימראז עושים עבודה לא טובה משמע הבסיס האחרון לא מחובר הצורה טובה לתבנית שלו מה שקורה הוא שיש יחידה אחרת בפולימראז שמאפשרת הסרה של הנוקליאטיד האחרון וכיוונה הוא 3 ל-5 פעילות האקסונוקלאז יכולה להימשך עוד ועוד עד שיהיה זיווג בסיסים מושלם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

האם גם לאר אן איי פולימראז יש אקסונוקלאז?

A

לא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

האם

רק סינתזה בכיוון של 5 ל- 3 יכולה להבטיח דיוק והגהה של סינתזת דנ”א?

A

כן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מה קורה בכל מחזור של סינטזת די אן איי?

A

כיוון הסינתזה הוא תמיד 5 ל- 3, כך שבכל מחזור נכנס לאתר הפעיל נוקלאוטיד 3-פוספאט, מתבצעת שבירה של הקשר האנהידרידי בין פוסאט אלפא לבטא, ומהאנרגיה המשתחררת מחובר הקשר הפוספודיאסטרי לקצה 3 של הגדיל הצומח.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מה היה קורה אילו כיוון הסינטה היה מ3-5?

A

במקרה כזה כאשר נרצה להסיר את הנוקלאוטיד האחרון שהוכנס בטעות בעצם נקבל קצה 5 שיש עליו פוספאט אחד ואין לו קשר אנהידרידי שיכול לספק את הארכת השרשרת ומצב כזה יבצע טרמינציה לסינתזת הדנ”א. לכן, באופן מעניין – רק כיוון סינתזה של 5 ל- 3 מאפשר בסופו של דבר הגהה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

dna primase?

A

אחר ודנ”א פולימראז חייב שיסונתז עבורו פריימר – רצף של נוקלאוטידים המבצעים זיווגי בסיסים עם התבנית לצורך התחלת השכפול, יש צורך באנזים ייחודי

הוא מסנטז פריימר כל גבי תבנית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מה המרחקים בין הפריימרים בגדיל המתעכב?

A

100-200 בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

כמה פריימרים יש בגדיל המוביל?

A

1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מתי מסתיימת הארכתו של הפריימר בגדיל המוביל?

A

הפריימר מסתיימת בהגעתו של הפולימראז לפריימר של מקטע האוקזקי הבא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

איזב סוג נוקליאוטידים זה הפריימרים

A

rna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מה קורה בסוף השכפול של ה-dna

עם הפריימר?

ו

A

יש החלפה של

ה-rna

עם dna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

dna ligase

מי הוא ובמה הוא הוא משתמש?

A
  1. מפרק אר אן איי ומחליף אותו בדי אן איי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

איך נקרא הפרימאז היוקירוטי?

ומה היא התת היחידה שאחראית ליצירת הפריימר?

A

הפרימאז היוקריוטי הוא קומפלקס אנזימטי המשלב את פעילות הפרימאז ופעילות של פולימראז וקרוי Alpha-DNA-polymeras

pri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

כיצד נקרא האינזים שמתיך את הדי אן איי לשני חלקים?

ואיך הוא פועל?

A

הליקאז

משתמש באיי טי פי

מה שהוא עושה הוא נע על חד גדיל כאשר הוא מגיע לדו גדיל הוא פותח אותו לשניים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

במה האינזים הליקאז משתמש?

A

atp

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

איך הליקאזות פועלות ביוקריוטים ובפרוקיוטים?

A

יוקריוטים: משלוש לחמש

פרוקריוטים מחמש לשלוש

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

כיצד נקראים החלבונים שמייצבים את הדי אן איי לאחר פתיתו?

A

ssb

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

כיצד חלבוני ssb

פועלים?

A

בצורה קואפרטיבית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

helix destabilizing proteins

A

שמם השני של

ssb

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

מה היה קורה אילו לא היה את ה-ssb

A

הדי אן איי היה חוזר לדו גדיל שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Hair pins

A

כאשר החד גדיל מתחיל לעשות מבנה של לולאה ומי שמונע את זה זה ה-ssb

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

מה הם ה-

ssb

ביוקריוטים

ומכמה יחידות הם נבנים לעומת הפרוקקריוטים

A

rpa

3

ובפרוקריוטים זו יחידה אחת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

פרוססיביות

A

מדובר במושג המתאר את הנטייה הטבעית של דנ”א פולימראז לפלמר נוקלאוטידים עד שהוא נופל מהתבנית. ככל שהפרוססיביות של פולימראז גדולה יותר, כך גדלה נטייתו להמשיך ולסנתז דנ”א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

כמה הליקאזות יש סך הכל?

A

1 בכל מזלג שכפול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

מרבית הפולימרזות יצליחו לסינטז די אן איי קצרים או ארוכים?

A

קצרים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

למרבית הפולימראזות יש פרוססיביות גבוהה או נמוכה?

A

נמוכה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

מה זה אומר שיש לפולימראזות פרוססיביות נמוכה?

A
  • עובדה זו מאפשרת לפולימראז להתנתק בקלות לאחר שהוא מסיים לסנתז מקטע אוקוזאקי ולהתמחזר על מנת לסנתז את המקטע הבא על הגדיל המתעכב
  • מנגד, עובדה זו מונעת מהפולימראז לפלמר באופן רציף את הגדיל המוביל.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

איך ניתן לטפל בבעיה של הפרוססיבית

A

sliding clamp

שהוא מבנה טבעתי המשמש כמעין תושבת עבור דנ”א פולימראז ומייצב אותו על גדיל התבנית, אך משחרר אותו ברגע שהפולימראז מגיע לאזור דו גדילי

בגדיל המתעכב

גם הפולימראז שנע על גבי הגדיל המתעכב משתמש במצמד המחליק, אך ברגע שהוא מגיע לקצה 5 של אזור דו גדילי (=מקטע האוקוזוקי שסונתז קודם לכן) הפולימראז מתנתק מגדיל התבנית ונטען מחדש על ידי מצמד מחליק נוסף בסמוך לפריימר הבא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

איך ניתן להטעין את המצמד על ה-dna

A

עי קלאמפ לואדר

שפועל עם איי טי פי

לאחר הידרוליזה של איי טי פי יש עזיבה של

loader

וסגירת טבעת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

כמה די אן פולימראזות יש סך הכל ?

A

2 פולימראזות בכל אחד ממזלגות השכפול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

כמה פרימאזות יש סך הכל?

A

1 בכל מזלג שכפול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

מי זז בזמן השכפול של הדי אן איי?

הדי אן איי או הקומפלקס החלבוני?

A

די אן איי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

איך קוראים לפולימראז שמסנטז את הגדיל המוביל ואיך קוראים לפולימראז שמסנטז את הגדיל המתעכב?

A

המוביל - אפסילון

המתעכב- דלתא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

מה הוא אורך מקטעי האוקאזקי בבקטריה?

A

1000-2000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

מה הוא אורך מקטעי האוקאזקי ביוקריוטי?

A

100-200

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

מה נע יותר מהר ?

די אן איי פולימראז בקטריאלי או די אן איי פולימראז אאוקריוטי?

A

בקטריאלי

ככל הנראה בגלל שאין להם נוקליאוזומים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

באיזה מודל מחקר משתמשים בדרך כלל על מנת לחקור מוטנטים?

A

אי קולי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

מה בדרך כלל קורה כאשר יש מוטנט באזור מוטורי באי קולי?

A

יהיו לו הרבה מוטציות אחרות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

Strand Directed Mismatch repair system

איזה עוד שם יש לה ?

ומה היא עושה?

A

MMR

המערכת יודעת לזהות בסיסים שאינם מזווגים כראוי לאחר ביצוע השכפול ולהסיר את הבסיס מהגדיל שזה עתה סונתז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

כיצד מערכת ה-

MMR

מזהה את הגדיל הנבנה

בפרוקריוטים?

A

על ידי רצף פולינדרומי:

GATC

מ5 ל-3

ברצף של הגדיל הישן יש על האדנוזין מתיל, ואילו ברצף של הגדיל החדש עדיין אין מתיל על אותו אדונוזין.

מי שישים את המתיל הוא דם מתילאז עפי זה מערכת ה-

mmr

יכולה לזהות בין גדיל ישן לחדש ולא בטעות להוציא נוקליאוטיד של גדיל ישן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

איך ה

mmr

היוקיוטית מזהה בין הגדילים?

A

המערכת היוקריוטית עובדת בצורה דומה אך מבחינה בין גדיל התבנית והגדיל הנבנה בדרך אחרת – הגדיל המתעכב מיוצר מקטעים מקטעים ולפני שהליגאז מחבר אותם ביחד ניתן לזהות מי הגדיל החדש והגדיל הישן מאחר והגדיל החדש מכיל הרבה מאוד nicks

שהם בעצם שברים חד גדיליים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

HPNCC

A

מחלה שנוצרת בגלל פגמים שנגרמים ב-

mmr

ויכול לגרם לסרטן המעי הגס

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q

אילו חלבונים פועלים ב-mmr?

A

muts l

muts s

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

muts L

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q

muts s

A

סורק את הדנ”א עד שהוא מוצא אזור של

Mismatch

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

muts L

A

האנזים

MutL

מחפש שבר חד גדילי ולאחר שהוא מוצא כזה הוא יוזם דגרדציה המערבת אנזימים נוספים.

ביוקריוטים

MutL

מכיל גם פעילות היוצרת שברים חד גדיליים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q

MutH

A

הוא מזהה אדנוזין לא ממותלים וחותך אותם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q

מה זזה על מה ?

מזלג השכפול שזז על התבננית?

או כררומוזומון שמתקרב למזלג השכפול?

A

מזלכ השכפול זז על התבנית

אמנם אם הכרומוזום היה זז לכיוון מזלג השכפול זה היה מהיר יותר

אבל זה לא מועדף אנרגטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

איך קוראים לאינזים שמסיר את הפיתול בסינטזה?

A

טופואיזומראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

אם מזלג השכפול נע בקצב של 500 נוקליאוטידים לשנייה כמה פתיחות יש לעשות בשנייה?

A

50

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
65
Q

אם הכרומוזום מקובע בקצהו הרחוק מה יקרה?

A

יווצר מתח, אשר יתורגם כמעט תמיד להופעה של פיתולי על. אם פיתולים אלו לא יוסרו, התקדמות מזלג השכפול תיעצר מאחר והאנרגיה שתידרש לפתיחה תהיה גדולה מידי מזה שהליקאז יודע לספק בעזרת הידרוליזה של

ATP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
66
Q

טופואיזומראזות

A

מנטרלות את פיתולי העל שנוצרו במהלך השכפול על ידי יצירת אינטראקציה קוולנטית זמנית עם שלד הסוכר פוספאט של הדנ”א ויצרת שבר זמני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
67
Q

טופואיזומראז 1

במה הוא משתמש כנוקליאופיל?

את מה הוא תוקף?

ומה נשאר?

A

מכיל באתר הפעיל שלו חומצה אמינית טירוזין המשמשת כנוקלאופיל ותוקפת את הפוספאט בקשר הפוספודיאסטרי, כך שנוצר שבר חד גדילי זמני. לאחר היווצרות השבר טופואיזומראז 1 מסובב את את הדנ”א סיבוב אחד ובעצם מבצע התרה של פיתול על. קבוצת

ה- 3 OH

החופשית של הדנ”א תבצע התקפה נוקלאופילית על הפוספאט ויווצר קשר פוספודיאסטרי מחדש. האנזים איננו דורש אנרגיה לצורך פעילותו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
68
Q

טופו איזומראז 2

במה הוא משמש ?

איפה הוא נמצא?

מתי הוא משופעל?

ואיך הוא עובד?

A

משתמש בשתי מטבעות אנרגיה מסוג

ATP

והוא משופעל באזורים בהם 2 הליקסים כפולים (כלומר 2 מולקולות שכל אחת מהן מכילה 2 גדילים)

מתלפפים אחד על השני – בעיקר בחלק הקדמי של מזלג השכפול.

במהלך הריאקציה הוא שובר שבר דו גדילי על גבי אחת ממולקולות הדנ”א

כך שהאנזים משמש כמעין “שער” ונשאר קשור קוולנטית למולקולת הדנ”א השבורה. בשלב הבא הוא מעביר את ההליקס השני דרך אותו השער שנפתח. בשלב השלישי, האנזים משחרר את המולקולה השלמה שהוא העביר דרך השער וסוגר את השער.

בשלב האחרון, הוא מתנתק מהדנ”א ויוצר קשר פוספודיאסטרי מחדש במולקולה שעבר ביקוע. בעצם, בדרך זו, טופואיזומראז 2 מאפשר פרימה של פיתולי על שנוצרים בחלק הקדמי של מזלג השכפול. אם טופואיזומראז 2 לא יעבוד בבקטריה למשל, נקבל בסוף השכפול 2 מולקולות דנ”א דו גדיליות שמלופפות אחת על השניה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
69
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
70
Q

rnaaseh

ומה קורה אחריו

A

מה שמוציא מהפריימר את ה-

rna

די אן איי פולימראז ממשיך את את הדי אן איי ואז לידאז מחבר את הכל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
71
Q

האם פרימאז משתמש באיי טי פי ?

A

כן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
72
Q

למה מתחלקת כל בועת שכפול

A

ל-2 מזלגות שכפול

עי מוצא שכפול

שכל גדיל מתחלק במוצא השכפול למוביל ומעכב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
73
Q

מהו מנגנון הליגאז?

A

יצירת קשר פוספאט - פוספאט עם הפוספאט שנמצא החופשי שנמצא בקמה 5 של שרשרת אחת ועי פירוק איי טי פי.

ואז מגיע ההידוקסיל שתוקף את הקשר פוספאט פוספט

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
74
Q

האם ההליקאז הוא הקסאמר ?

A

כן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
75
Q

עם מה ההליקאז עובד?

A

עם חד גדיל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
76
Q

איפה יש יותר חלבוני

ssb

A

על הגדיל המתעכב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
77
Q

מה הוא מנגנון ה-

clamp loader?

A

נקשר לסליידינג קלאמפ ועי איי טי פי גורם לשינוי צורה כך שהסליידיניג קלאמפ יפתח ואז הדי אן איי נכנס לתוכו ואז האיי טי פי עובר הידרוליזה בקלאמפ לואדר עוזב, סליידינג קלאמפ נסגר סביב הדי אן איי ומגיע פולימראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
78
Q

pcna

A

sliding clamp

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
79
Q

פרימאז פרוקריוטי?

A

די אן איי גי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
80
Q

הליקאז פרוקריוטי ?

A

דנה בי

על התבנית של הגדיל המתעכב פועל מ-חמש

ל-שלוש

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
81
Q

הליקאז איאוקריוטי?

A

על הגדיל המוביל משלוש לחמש

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
82
Q

מה עושה טופואיזומראז שתיים בעזרת שימוש באיי טי פי ?

A

משנה קונפורמוציה עושה שם כל מיני שרשאות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
83
Q

מי מבין כל

muts

הוא אנדונוקלאז?

A

mut h

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
84
Q

מה דורש שכפול די אן איי?

A

שכפול של מולקולת הדנ”א, גם בפרוקריוטים וגם ביוקריוטים, מצריך זיהוי של מוצא שכפול ופרימתו של ההליקס באזור זה או סמוך לאזור זה. על כן, שכפול של מולקולת דנ”א חייב להתחיל בקישור של חלבוני איניציאציה להליקס הכפול ופרימה שלו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
85
Q

עי מה מזוהה מוצא השכפול בחיידקים ושמרים?

A

עי חלבוני איניציאציה עפי רצפים מסוימים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
86
Q

מה נמצא סביב מוצא השכפול?

a

ו-t

או g-c

A

a-t

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
87
Q

איפה הבקרה היחידה שיש לחיידקי ברפליקציה?

A

מזלג השכפול כי קצב הסינטזה הוא אחיד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
88
Q

מה הוא תהליך האיניציאציה בשכפול די אן איי חיידקי?

A
  1. מגיעים חלבוני איניציאציה שמזהים רצפים יש להם איי טי פי והם מתיישבים על הדי אן איי וגורמים לחוסר יציביות של ההליקס הכפול - מה שגורם להגעת הליקאזות לואדרים (מטען של הליקאזה) הם מחזיקים את ההליקאזות ומונעות מהן להתחיל לעבוד לפני הזמן
  2. כשדי אן איי נפרם ההליקאז נותנת לגיטציה לפרימאזה לשים את הפריימר וכך נוצרים שתי מזלגות הפאימאז נע יחד עם ההליקאז
  3. לאחר התחלת השכפול חלבוני האינוציאציה מבצעים הידרוליזה של איי טי פי והופכים להיות מנוטרלים במטרה של למנוע עותקים במחזור השכפול.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
89
Q

תקופה רפקירקטורית?

ומה התנאי שיהיה איניציאציה?

A

התקופה בה מוצאי שכפול חדשים כבר שוכפלו אך לא נפתחו מחדש נקראת תקופה רפרקטורית והיא כוללת עיכובמתילציה על גבי הנוקלאוטידים החדשים שזה עתה סונתזו כחלק מרצפי ה- GATC

איניציאציה של השכפול לא יכולה להתרחש כל עוד האדנוזין לא עובר מתילציה וחלבוני האיניצאיאציה לא נקשרים

ל- ATP

מחדש.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
90
Q

חלבוני האיניציאציה באי קולי.

כיצד נקראים?

A

DNA-A

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
91
Q

איך נקרא המטען של ההליקאז

A

די אן איי סי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
92
Q

מתי שכפול הדי אן איי מתרחש באיאוקריוטים?

A

בשלב

s

במחזור התא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
93
Q

כמה זמן הוא שלב ה-s

במחזור התא באיאוקריטים וכמה בשמרים ומדוע זה מפתיע?

A

באיאוקריוטים זה 8 שעות שעות

בשמרים 40 דקות

לבני אדם יש המון מוצאי שכפול ולוקח לשכפל בין כל אחד ממוצאי השכפול כמעט שעה .

אבל בבני אדם 50 מוצאי שכפול נפתחים יחדיו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
94
Q

מהם שלבי האיניציאציה האיאוקריוטית?

A

חלבון האיניציאציה -

orc

ומורכב ממספר תת יחידות נקשר לדי אן איי באזורים של איי ו-טי

אל חלבון האיניציציב מצטרפות יחידות

Mcm

שהם הליקאזות ויוצרות

prc

ב-g1

ואז מגיע בשלב ה-

s

קינאז בזמן שכולם עובדים, הוא מזרחן את ההליקאזות ואת חלבון האיניציאציה כדי שלא יופיעו עוד בועיות הכפלה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
95
Q

האם זה מספיק לתא לשכפל רק די אן איי בעת ההכפלה?

A

לא הוא חייב לשכפל גם את ההיסטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
96
Q

למה שווה מסת הדי אן איי?

A

למסת ההיסטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
97
Q

מה היא הסיבה שיש הרבה עותקים לגנים של היסטונים ?

A

כדי שיהיה הרבה מהם בזמן השכפול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
98
Q

מתי מסונטזים ההיסטונים?

מתי מסונטזים שאר החלבונים?

A

s

g1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
99
Q

מה קורה לזמן מחצית החיים של

mrna

של היסטון בסיום השיעתוק?

A

זמן מחצית החיים שלו יורד בזכות תכונות של קצה 3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
100
Q

האם ההיסטונים שורדים לכל אורך חייו של התא?

A

כן

101
Q

למה סינטזת ההיסטונים נמצאת בקורלציה ?

A

לכמות הדי אן איי

במנגנון feedback

102
Q

במה משתמש מזלג השכפול על מנת לפרק את הנוקליאוזומים?

A

ב-

crc

103
Q

כיצד מתפרקים הנוקליאוזומים?

A

ל-600 בסיסים חופשיים

טטרמר של אייץ 3 ואייץ 4

ושני דימרים של אייץ 2 אי

ואייץ 2 בי

104
Q

איך מסתדרים הנוקליאוזומים לאחר שהתפרקו עי הסי אר סי במהלך השכפול<

A

הטטרמר אייץ 3 ואייץ ‘ 4 מסתדר באופן רנדומאלי בין שתי מולוקולות הדי אן איי החדשות

הדימרים של אייץ’ 2 משתשחררים מדי אן איי ונקשרים לנוקליאוזומין אייץ 3 ו-4 חדשים בנוסף לעוד אייץ 2 שסונטזו

105
Q

למה משויך קצב הסינטזה של ההיסטונים ?

A

לקצב הפולימארז דלתא במקטעי אוקאזקי

106
Q

איך נעשת הבנייה של הנוקלאוזימים החדשים בזמן הכפלת הדי אן איי ?

ומי עוזר להם ?

A

עי NAP1 ו CAF1

nap1

אחראי על אייץ 2

וקאף 1 אחראי על אייץ3 4

pcna

עוזרת - הטבעת המצמידה

107
Q

מה היא בעיית סיום השכפול באיאוקריוטי?

ולמה אין אותה בפרוקריוטים?

איך פותרים את הבעיה?

A

איאוקריוטים- כאשר מסירים את קצה 5 לקראת סוף הדי אן איי של הפריימר הגדיל המתעכב

אין לנו איך להחליך את זה בדי אן איי או לשים די אן איי חלופי ואז כל פעם הדיאן שלנו היה מתקצר, חיידקים פתרו את הבעיה על ידי כך שהצורה של הדי אן שלהן היא מעגלית.

ניתן לפתור את הבעיה על ידי שימוש ברצף חוזרני בקצוות הכרומוזום שנקרא טלומר

gggtta

108
Q

פרמה הטלומר עושה?

A

יש להם פעילות את ריברס טראנסקריפטאז

והוא מסנטז די אן איי מ5 ל-3 על התבנית של הדי אן איי המתעכב

הוא משתמש בתבנית של אר אן איי לשם כך

ובהמשך יונח שם פריימר נוסף

שבסוף ייצא אך לפחות לא הפסדנו שום דבר

109
Q

איזו בעיה גורמת שימוש בטלומרים?

A

טלומרים גורם לבעיה נוספת. הטלומרים זהים הרי בין כל הכרומוזומים. לכן, כאשר יש שברים דו גדיליים ביותר מכרומוזום אחד, התא ינסה לבצע תיקון על ידי זיהוי באלמנטים הומולוגיים ועשוי בעצם לאחות טלומרים אחד לשני ובעצם לגרום לאיחוי של כרומוזומים שונים.

110
Q

כיצד בעיית הטלומרים נפתרת?

A

נוקלאז מיוחד יוצר חד גדיל באזורחמש של הטלומרים. אזור חד גדילי זה המשולב על הרצף החוזרים של הטלומרים מגייס חלבוני ארכיטקטורה ייחודיים הקרויים

Shelterin

אשר “מחביאים” את הטלומרים ממערכת תיקון נזקי הדנ”א התאית על ידי יצירה של מבנים טבעתיים הקרויים

T-loops

בהם הטלומרים מתקפלים ומזדווגים עם עצמם כפי שמופיע בתמונה.

111
Q

מה קורה לטלומרים של תאים ככל שהם מתבגרים

A

הטלומרים מתקצרים

112
Q

באילו תאים הטלומרים נשמרים באותו האורך כל הזמן?

A

תאי גזה

113
Q

מה קורה כאשר הטלומרים מתקצרים יותר מדי?

A

יש מנגנון תיקון די אן איי שעוצר את מחזוא התא- מנגנון זה הוכח כגורם לזקנה

114
Q

אשר מכילים עותק אחד לא תקין של טלומראז ולכן מכילים טלומרים קצרים יותר – הם סובלים מכשל מוקדם של מח העצם, צלקות בריאה, בכבד ובעיות חמורות באפידרמיס.

A

Dyskeratosis Congenita

115
Q

זרדומה פיגמנטזום

A

מחלה הקשורה ברגישות יתר של קרינת UV

116
Q

HNPCC

A

פגיעה במערכת ה- MMR

117
Q

BRCA \1\2

A

סרטן שד/סרטן מעי גס – פגם בתיקון של רקומבינציה הומולוגית.

118
Q

האם נזקי די אן איי מתרחשים באופן ספונטי?

A

כן

119
Q

מה יכול לגרום לדימריציה של טימידין?

ואיך קוראים לאותו דימר?

A

קרינת

UV

יכולה לגרום להופעת קשרים קוולנטים בין פירמידינים סמוכים וליצור דימרים, למשל דימר של טימידין היוצר טבעת שנקראת ציקלו-בוטאן.

120
Q

מה רואים בתמונה?

A

כל מני נזקים שמתרחשים בדי אן איי באופן ספונטני כגון

דה אמינציה ודה פורינציה

ודימר של פירימידין

121
Q

כיצד המוטציות מתאזרחות בדי אן איי?

A

כיצד נזק דנ”א הופך לדייר של קבע ואפילו מתאזרח בדנ”א? בתמונה המופיעה כאן ניתן לראות 2 דוגמאות:

בדוגמה הראשונה ניתן להבחין כיצד בסיס

C

שעבר דה אמינציה ליצירת

U,

במידה ולא יתוקן, אחת מהתבניות תכיל את הבסיס

U

שיעבור זיווג בסיסים במהלך השכפול עם

A

, כך שבמולקולת הדנ”א הדו גדילית החדשה נקבל זיווג בסיסים A

עם

U

ובמחזור הבא כבר נקבל

A עם

T.

בדוגמה השניה ניתן לראות כיצד אתר א-פוריני (ללא הבסיס שעבר הידרוליזה) יעבור מחיקה במהלך הרפליקציה.

122
Q

כאשר ישנה בעיה בבסיס בודד כמו דה אמינציה של סי ל-u

במה אפשר לשהתמש כדי לתקן זאת?

A

במנגנון בשם

ber

123
Q

מה מערכת

ber

עושה?

A

המערכת מנצלת משפחת של אנזימים הקרויים גליקוזילאז המזהות בסיסים שגויים (כאלו שעברו מודיפיקציה ושאינם אמורים להיות נוכחים בדנ”א בשגרה) ומזרזים הידרוליזה של הבסיס עצמו.

124
Q
A
125
Q

כיצד הגליקוזיאליות מזהות את הבסיסים?

A

מנצלות את הנטייה הטבעית הקיימת בדנ”א לבצע

Base-Flipping.

תכונה זו הכוללת סיבוב של הקשר הפוספודיאסטרי על צירו, מאפשרת לבסיסים לבלוט כלפי חוץ ולהיות מזוהים על ידי אנזימים כדוגמאת הגליקוזילאזות.

126
Q

מה הגליקוזיאד חותך?

A

את הפירימידין של התא הלא טוב

127
Q

מה קורה כאשר הגליקוזיאד חותך את הפירימידין באתר הלא טוב?

A

לאחר שהגליקוזילאז חתך נקבל אתר שהוא א-פרימידיני. אתר זה יעבור זיהוי על ידי אנזים בשם

AP-Endonuclease

( על מנת להזכיר לנו שמדובר באתר הא-פירימידיני) בשילוב עם אנזים בשם פוספודיאזטראז יבקעו את הקשר הפוספודיאסטרי משני הצדדים של אתר זה.

128
Q

איך ה-gap

יושלם במנגנון

ber

A

עי די אן איי פולימראז

ביוקריוטים פולימראז בטא

בפרוקריוטיום פולימראז 1

129
Q

מה הגליקוזיאדות יודעות לזהות?

A

מסוג זה ידועות לנו המזהות בין היתר

C

שעבר דה אמינציה ליצירת

U, ו

A

שעבר דה אמינציה ליצירת

I, א

ליקילציות על חמצן של בסיסים מסויימים, בסיסים בהם הטבעת נשברה, או בסיסים שבהם קשר כפול בין שני פחמנים הומר בטעות לקשר יחיד.

130
Q

איך מתוקן הנזק של דה פורינציה

A

עי האנודקנוקלאז ופוספודיאסתראז

אך לא על ידי גליקוזילאזות

131
Q

מה מנגנון

ner

מזהה?

A

נגנון זה מזהה נגעים חמורים בדנ”א הגורמים לדה פורמציה ואבדן המבנה בצורה מאג’ורית. למשל נגעים שנגרמים למשל מקשרים קוולנטים שהבסיסים עוברים עם קבוצות פחמן-מימן גדולות, כמו למשל עם הקרצינוגן בנזופירן המצוי בטבק ובמוצרי דיזל, או לחלופין דימרים פירמידינים הנגרמים מקרינת המצויה באור השמש.

132
Q

מה עושה קומפלקס נר?

A

במקרה זה קומפלקס אנזימטי ענקי סורק את הדנ”א ומחפש עיוותים עד שהוא מוצא כזה ומתיישב. לאחר שהתיישב על מוקד העיוות, הוא מבקע קשרים פוספודיאסטרים בגדיל הפגום משני צידי הנזק כך שמוסר אוליגו-נוקלאוטיד (בחיידקים 12, בבני אדם כ-30). לאחר הביקוע יגוייסו דנ”א פולימראז ודנ”א ליגאז על מנת לתקן את האזור החד גדילי.

133
Q

הביקוע הוא חד גדילי של נר הוא דו גדילו או חד גדילי.?

A

דו גדילי

134
Q

את מה מצמדים את מנגנון נר?

A

ל-rna

poly

במנגנון השיעתוק

135
Q

איך מנגנון נר פועל פרוקריוטים?

A

מאחר והגנים הם קצרים, רנ”א פולימראז נושר מהגנום לאחר שנעצר באתר הנזק. מתבצע תיקון ולאחר מכן הפולימראז מתיישב מחדש.

136
Q

איך מנגנון פועל באיאוקריוטים?

A

אחר והגנים ארוכים בעשרות מונים מאלו של חיידקים, מדובר במערכת יותר מורכבת אשר מאפשר את עצירת הפולימראז ולאחר מכן את התנעתו מחדש בנקודה בה נעצר.

המטרה העיקרית בהצמדה שכזו היא בעצם להשקיע את מרבית המשאבים בתיקון אזורים מקודדים, גנים, שעוברים שעתוק

137
Q

בסינדרום על שם Cockayne

A

חולים סובלים מפגם בצימוד של מערכת תיקון הדנ”א למערכת השעתוק והיא מתבטא בפגמים נוירונאליים ופיגור שכלי, חסר במערכת שריר-שלד, ורגישות מוגברת לאור. מרבית הפגמים במחלה נגרמים מאחר ורנ”א פולימראז נשאר תקוע באתר הנזק ולא ממשיך בשעתוק

138
Q

אילו דרכים אלטרנטיביות יש למנגנון נר?

A
  1. כך למשל מתילציה שעובר חמצן מס’ 6 בבסיס החנקתי גואנין, יכולה לעבור תיקון באופן ישיר על ידי אנזים יעודי השם

O6-Methyl-Guanisine-Methyl-Transferase

אשר משמש כאנזים “מתאבד” ובעצם לוקח לעצמו את המתיל וקושר אותו על שייר ציסטאין בבטן האנזים. הקישור הקוולנטי של ציסטאין באתר הפעיל של האנזים, בעצם הורסת אותו והוא אינו יכול להתמחזר.

במקרה אחר ניתן לבצע דה מתילציה של

A או של C

על ידי אנזים מסוג דה-מתילאז הנעזר בקבוצת מתכת כקו-פקטור, ובסוף הריאקציה מתקבלת קבוצת

Formaldehyde .

139
Q

למה הדי אן איי היא מולקולה מושלמת לזיהוי נזקים ?

A
  1. אנו יצורים די פלואידים
  2. בסיסים שעברו דה אמינציה קלים לזיהוי. בסיס A

שהפך

I

140
Q

מה ההבדל בין בסיס T

לבסיס U?

A

בסיס T

יש עליו מתיל בפחמן החמישי

ואינו יכול לעבור דה אמינציה

ואילו בבסיס U

אין מתיל והוא יכול לעבור דה אמינציה

141
Q

איפה נוכל לזהות מתילציה בחולייתנים ולמה?

A

ברצפי

gc

142
Q

מה מתילציה על

gc

יכולה לגרום?

A

מביאה את זה למצב של הטרוכרומטין ואם מתרחשת גם דה אמינציה - זה יכול לגרום לבלאגן והופך את סי לטי

143
Q

מה מתקן את המוטציות של ג’י סי

A

מתילאז שיודע להסיר את את הטי

144
Q

למה שייכות שליש מהמוטציות המורשות

A

לג’י וסי

145
Q

transleiton polymerase

A

במצבי חירום, ניתן להשתמש בפולימראזות מיוחדות הנקראות פולימראזות מעקף

פולימראזות אלו נקראות אל הדגל כאשר יש נזקים כבדים והדנ”א פולימראז הדייקן נתקע במקומו. לאחר שפהולימראז נתק במקום, יתבצע “חילוף משמרות” בין פולימראז המשכפל ופולימראז המעקף, שהוא אמנם יעזור לתא לסיים את מחזור השכפול, אך הוא מגלם בתוכו סיכון משמעותי מאחר והוא יסנתז את הדנ”א תוך הכנסת טעויות.

146
Q

כמה פולימראזות מעקף יש בבני אדם?

A

שבעה

147
Q

האם כל הפולימראז מדייקות?

ומדוע?

A

לא חלקן מדייקות יותר חלקן פחות

מדוע פולימראזות אלו פחות דייקניות?

הן חסרות פעילות אקסונוקלאז לביצוע הגהה.

הן לא מצליחות להבדיל באותה איכות כמו הפולימראז המשכפל בין בסיסי הדנ”א והתאמתם לתבנית.

148
Q

איך הפולימראז הרגיל מתנתק מהמצמד בעת הגעה לאזור נזקי?

A

עי יוביקוויטניציה שנעשת על פולימראז מעבר

149
Q

כמה בסיסים מפלמרות פולימראזות המעבר?

A

מעט בסיסים

150
Q

מהו המנגנון של פולי מעבר.

A
151
Q

מה הם נזקי ה-dna?

A
152
Q

ממה יכולים להיגרם בעיות ב-dna?

A
153
Q

איך אפשר לתקן שבר חד גדילי?

A

על ידי ליגאז

154
Q

מה יכול לגרום שבר דו גדילי?

וממה הוא יכול להיגרם?

A

, נגרם בין היתר על ידי רדיקלים חופשיים של חמצן, קרינה מייננת (שגורמת ליצירת רדיקלים חופשיים של חמצן ואז לשבר), חומרים מחמצנים שונים, טעויות בזמן השכפול, מובילים במהרה לשברים כרומוזומליים ולאבדן מידע גנטי בזמן חלוקה תאית.

155
Q

מתי בדרך כלל יש את השברים הדו גדיליים?

A
156
Q
A
157
Q
A
158
Q

NHEJ-non homolog end joining

איפה זה נפוץ?

מה הוא עושה?

באיזה גיל יהיה לאדם הכי הרבה צלקות בדי אן איי?

A

בתאים סומטיים של יונקים

מחבר בין קצוות שבורים בדי אן איי

הוא יכול לגרום לכך שכל קצוות הנוקליאוטידים השבורים יתחברו אחד לשני

הצלקות שהור גורם זה בגיל 70

159
Q

רקומבינציה הומולוגית?

A
160
Q
A
161
Q

מה הוא התיקון השכיח בבני אדם של די אן איי ומתי מתרחשת רקומבינציה הומולוגית?

A

nhej

רק בשלב s

או בשלב g2

לאחר ההכפלה

162
Q

איך נזקי הדי אן איי משפיעים על מחזור התא?

A

דאי לזכור שנזקי דנ”א שנצברים בתא יכולים לעכב את מחזור התא עד לתיקונם.

כך למשל נזק דנ”א מונע את המעבר משלב

G1

ל S

ואם מתרחשים בשלב

S ומזוהים הם מאטים את שלב S

ומונעים את המעבר משלב

G2 ל M

163
Q

ataxia telangictesia

A

למשל ישנו מחסור גנטי באנזימים ATM ו ATR החיוניים להפעלת מנגנוני עצירת מחזור התא. הפנוטיפ של המחלה כולל סיכון מוגבר לסרטן ופגיעה עצבית

164
Q

איך

nhej

פועל?

A

החלבון

Ku

הוא חלבון הטרודימרי התופס את קצוות הכרומוזמים. חלבונים נוספים המגוייסים (ולמזלכם שמותיהם לא מופיעים בספר) נדרשים על מנת להחזיק את הקצוות בזמן שהם עוברים עיבוד הכולל הסרה של נוקלאוטידים ולבסוף חיבור/ליגציה של הקצוות.

165
Q

מה התפקיד של חלבון

ku

A
  1. nhej
  2. רקומבינציה של נוגדנים
  3. רקומבינציה ליצירת רצפטורים

tcr

וזאותי הסיבה ששלושתם מאוד דומים סך הכל

166
Q

איך פועלת רקומבינציה הומולוגית?

A

רקומבינציה הומולוגית היא כאמור מנגנון תיקון שבר דו גדילי המתאפשר הודות לזיהוי והחלפת גדילים בין שני דופלקסים של דנ”א החולקים ביניהם דמיון רב או זהות מוחלטת ברצף הנוקלאוטידים. החלפת הגדילים בין הדופלקסים מאפשרת לגדיל אחד לשמש כתבנית המסייעת להשלמת החסר או הנזק בגדיל השני בצורה מדוייקת יחסית.

167
Q

האם רקומבינציה הומולוגית משמשת רק לתיקון שברים בדי אן איי?

A

לא

168
Q

מי המנגנון הורסטילי והשמור ביותר?

A

רקומובינציה הומולוגית

169
Q

האם משתמשים ברקומבינציה ההומולוגית במיוזה?

A

כן

170
Q

מה הוא הדבר הקריטי ביותר שיש לעשות על מנת שמנגנון הרקומבינציה ההומולוגית יעבוד?

A

זיווג בסיסים

מהלך הרקומבינציה גדיל מכרומוזום אחד “דוגם” גדיל מכרומוזום אחר ו”מחפש” הומולוגיה. המנגנון אמנם אינו מחייב התאמה מוחלטת אבל בהחלט מחייב התאמה מאוד קרובה בין הגדילים.

171
Q

הטרודופקלקס

A

צב בו יש דופלקס חדש המערב גדילים ממולקולות שונות

172
Q

מתי מתבצע מנגנון הרקומבינציה ההומולוגית?

A

מסיבה זו, רקומבינציה הומולוגית מתבצעת מיד לאחר שכפול הדנ”א, כאשר ישנן שתי כרומטידות אחיות, גם מאחר ותהליך השכפול של הדנ”א הוא הגורם המרכזי ליצירת שברים.

173
Q

איך מתרחש המנגנון של רקומבינציה הומולוגית?

A
  1. שבר דו גדילי
  2. יהיה

over hange

בתחילה, קצה מולקולת הדנ”א השבור יעבור עיבוד בקצה 5’ ליצירת אזור שהוא חד גדילי 3’

  1. תהליך הבא נקרא שחלוף גדילים

Strand Exchange

או

Strand Invasion

והוא כולל פלישה של הגדיל המעוכל (=המולקולה עם השבר) אל מולקולה הומולוגית או זהה ו”חיפוש” אחר הומולוגיה. על התהליך הזה נרחיב בהמשך. התוצר של הריאקציה הזו הוא בעצם הטרו-דופלקס.

4.

בשלב הבא דנ”א פולימראז יאריך את הגדיל השבור (בירוק באיור) תוך שימוש בגדיל התקין כתבנית, כך שהרצף שמשוכפל מתאים לדנ”א התקין במלואו.

בשלב האחרון משוחרר הדנ”א הפולש ועובר היברידיזציה עם חצי השבר השני ומתבצעת סינתזת דנ”א נוספת, ובסוף ליגציה ליצירת מולקולת דנ”א תקינה.

174
Q

מה ההבדל בין מנגנוני תיקון אחרים לבין רקומבינציה הומולוגית?

A

אם נחשוב על הבדל משמעותי בין רקומבינציה הומולוגית לבין מנגנוני תיקון אחרים, ניתן לומר שבמנגנוני תיקון אחרים המידע לתיקון נמצא בגדיל המשלים של אותה מולקולת דנ”א ואילו ברקומבינציה הומולוגית המידע לתיקון וסינתזה של הפולימראז מצוי במולקולת דנ”א הומולוגית.

175
Q

עי מי מתרחש שחלוף הגדילים ברקומבינציה הומולוגית?

בפרוקריוטים

ובאאוקריוטים?

A

התהליך מתרחש בפרוקריוטים על ידי האנזים

RecA

וביוקריוטים הודות להומולוג שלו הקרוי

Rad51

176
Q
A
177
Q

איזה סוג חלבון הוא rec a?

A

atpase

178
Q

איך עובד

rec a?

A

החלבון בתחילה קושר

ה-ATP

נקשר באופן קואופרטיבי לדנ”א החד גדילי שנוצר לאחר תהליך העיבוד הראשוני, ויוצר סיב של דנ”א-חלבון.

האינטרקאציה עם הדנ”א גורמת לדנ”א לקבל קונפורמציה מיוחדת בה כל שלושה נוקלאוטידים סמוכים מוחזקים כך שהם “כאילו” מצויים בזיווג בסיסים רק שהשלד סוכר-פוספאט מתוח לחלוטין ואיננו “מסובב” (Untwisted)

בשלב הבא הסיב דנ”א-חלבון שעטוף ב

RecA

נקשר לדולפלקס דנ”א (שאיננו שבור), מותח אותו ומערער את זיווגי הבסיסים בו על מנת שיוכל לדגום את הרצף ולהיעצר כאשר הוא מגיע לאתר זיווגי בסיסים.

זיווגי הביסים נעשים ונסרקים בשלשות , כך שאי התאמה Mismatch

זיווג בסיסים מושלם של 15 בסיסים לפחות יוביל להגברת היציבות ולשחלוף גדילים תקין.

כעת RecA

יבצע הידרוליזה של

ATP ליצירת ADP

ויתנתק מהדנ”א כך שנקבל הטרו-דופלקס בלי חלבון.

בשלב האחרון יגיעו פולימראזות וליגאזות יסיימו את התהליך של התיקון.

תגרור לדיסוציאציה מהירה של הגדיל הפולש מהדופלקס אליו פלשנו. שימו לב שתהליך המתיחה וחיפוש אחר ההומולוגיה אינו דורש הידרוליזה של ATP.

179
Q

מה התפקיד החשוב ביותר של הרוקמבינציה ההומולוגית?

A

כל הנראה, התפקיד החשוב ביותר של רקומבינציה הומולוגית הוא בתיקון מזלג שכפול שבור. מצב כזה של שבר חד גדילי אליו מזלג השכפול מתקדם, יוביל בעת הגעת מזל השכפול לנקודה ליצירת מולקולת דנ”א דו גדילית אחת תקינה ואחת שבורה

180
Q

מה קורה כאשר מזלג השכפול מגיע לנקודת השבר החד גדילי?

A

כאשר מזל השכפול מגיע לנקודת השבר החד גדיל, המזלג נשבר. נוקלאז “יכרסם” את קצה 5’ של השבר ליצירת אזור חד גדילי שימש בהמשך לשחלוף גדילים כפי שמופיע בתמונה. לאחר השחלוף יסונתז דנ”א חדש (כמו בריאקציית הרקומבינציה הרגילה). בשלב הבא יבוצע שבר של הגדיל הפולש וחיבור מחדש ולבסוף יופיע מחדש מזלג השכפול.

181
Q

מה הסכנה במנגנון רקומבינציה הומולוגית?

A

על אף הדייקנות הגבוהה והתרומה הבלתי ניתנת לערעור של מנגנון הרקומבינציה ההומולוגית, קיימת סכנה במנגנון. כך למשל ייתכן כי במקום לבצע רקומבינציה עם כרומטידה אחות, תתבצע הרקומבינציה עם כרומוזום הומולוג, מה שיוביל לאבדן של הטרוזוגיוטיות באזור ששוכפל. במצב כזה עשויה לעבור מוטציה נקודתית מכרומוזום אחד לאחר, ואורגניזם שהיה קודם הטרוזיגוט למוטציה מסויימת יהפוך עכשיו להיות הומוזיגוט לאותה מוטציה בתא שבה התרחשה הרקומבינציה ההומולוגית. על אך נדירותו, מנגנון זה הוא אבן יסוד קריטית בהופעה של גידולים סרטניים רבים.

182
Q

איך ניתן לבקר את הרקומבינציה ההומולוגית?

A
  1. עיבוד הקצוות לאחר השבר מצומד לתהליכים של מחזור התא. הפעלת הנוקלאז הפעיל ביוקריוטים נעשית, לפחות באופן חלקי, על ידי זרחון המתבצע בשלבים

S ו- G2

בלבד. הצמדה זו בעצם מגדילה את הסיכוי שהדופלקס שייבחר יהיה כרומטידה אחות ולא כרומוזום הומולוג, מה גם שהכרומטידות האחיות מאוד קרובות אחת לשניה לאחר השכפול.

  1. הטענת החלבונים

RecA או Rad51

על החד-גדיל המעובד נעשית

Invivo

בסיוע של חלבונים נוספים/ אחד מן החלבונים הללו הוא

Rad52,

קומפלקס חלבוני בעל מבנה טבעתי (דמוי דונאט למען הדיוק של הספר) המורכב בעצמו מ-11 תת יחידות, המבטיח רקומבינציה הומולוגית מדוייקת ואיכותית ביוקריוטים.

לחלבון תפקיד לא רק בהטענת

Rad51

אלא גם בסיום התהליך על מנת לשחזר את הדופלקסים בסוף התהליך.

183
Q

ממה בנוי rad 52?

ומה תפקידו העיקרי?

A

מ-11 יחידות

והתפקיד העיקרי שלו הוא להטעין את rad 51

184
Q

האם אינזימי רקומבינציה בדרך כלל פעילים?

A

לא

185
Q

מתי אינזימי רקומבינציה משופעלים?

A

כאשר יש נזק לדי אן איי

186
Q

מה יוביל לסרטן?

תת פעילות של הרקומבינציה ההומולוגית ?

או יתר פעילות?

A

גם וגם

187
Q

brca 1

A

גן שמעורב ככל הנראה בבקרה של תהליך עיבוד הקצוות. אם לא יעבור עיבוד כמו שצריך,

השבר לא יתוקן או שיעבור תיקון על ידי מנגנון ה

NHEJ

אשר משאיר אחריו פגמים ומוטציות.

188
Q

BRCA2

A

יוצר אינטראקציה עם

Rad51

ושומר עליו במצבו הלא פעיל עד להופעת הצורך. כאשר יש נזק דנ”א

BRCA2

ממקם את

Rad51

בנקודה הנדרש לתיקון ומשחרר אותו לביצוע עבודתו.

189
Q

מה יכול לגרום

brca1

או

brca2?

A

סרטן השד והשחלות

190
Q

חוץ מתיקוני dna

למה עוד משמשת הרקומבינציה ההומולוגית?

A

בשחלוף גדילים במיוזה

191
Q

ממה מתחילה תמיד הרקומבינציה?

ומי מבצע את הרקומבינציה ההומולוגית במיוזה בשמרים?

A

מאחר ורקומבינציה הומולוגית מתחילה תמיד בשבר דו גדילי, חלבון ייעודי אשר בשמרים קרוי

Spo11

אחראי לביצוע השבר. הוא מכיל טירוזין באתר הפעיל אשר מבצע התקפה נוקלאופית על פוספאט בקשר פוספודיאסטרי. יש צורך באנזים אחד על כל גדיל. האנזים נשאר קשור קוולנטית לפוספאט.

192
Q

מי הקומפלקס שאחראי לעיבוד הקצוות בריקומבניציה ההומולוגית ואחראי להשאיר

overhanged

A

mre 11

193
Q

מה קורה לאחר העיבוד של הקצוות ברקומבינציה ההומולוגית?

A

בהמשך חלבונים יוקריוטים הומולוגים ל- RecA

בהם Rad51

וחלבון נוסף שאינו מוזכר בספר אלברטס ושהוא ספציפי למיוזה, מבצעים שחלוף גדילים.

194
Q

אילו אופציות יש לאחר שחלוף הגדילים ברקומבינציה ההומולוגית במיוזה?

A

אופציה 1 – עם שחלוף – תהליך הכולל יצרית צומת הולידיי כפולה, יצירת שברים בצמתי ההולידיי וחיבורם מחדש בליגציה. אנזים מיוחד אחראי על ביצוע החיתוך והשחלוף בצמתי ההולידיי. זהו תהליך שאיננו מאוד נפוץ והוא מבוקר מאוד, כך שהוא מבטיח שכל כרומוזום יעבור שחלוף לפחות פעם אחת ושתהיה כמות שווה יחסית של שחלופים בין הכרומוזומים וכן שכל כרומוזום יעבור באופן גס שני שחלופים – אחת על כל זרוע שלו – כיצד? אנחנו לא ממש יודעים. האנזים שאחראי עם הביקוע והשחלוף נקרא גם רזולבאז (בחיידקים מדובר ב RuvC).

אופציה 2 – ללא שחלוף – מאוד דומה למה שראינו במנגנון הכללי, כמו כל מולקולת דנ”א שעבר תיקון בעזרת רקומבינציה הומולוגית. בבני אדם 90 אחוז מהשברים הנוצרים במהלך המיוזה הם NonCrossover.

195
Q

מה הטרודופלקס מכיל?

A

לא משנה אם היה שחלוף או לא היה שחלוף, בכל מקרה כל הטרודופלקס מכיל בתוכו זיווגי בסיסים בין כרומוזום אמהי לכרומוזום אבהי.

196
Q

בין מה למה מתרחשת רקומבינציה הומולוגית במיוזה?

A

בין כרומוזומים הומולוגים

197
Q

מה היא צומת הולידיי במיוזה?

A

ומת הולידיי היא תוצר ביניים חשוב במיוזה ומכונה גם

Cross-Strand exchange.

הצומת הזו היא בעצם צומת של החלפת גדילים והיא יכולה לעבור איזומריזציה ושינויי קונפרמציה.

198
Q

מה מסמלת כל תמונה?

A

A – הצורה ההתחלתית לאחר שחלוף הגדילים

B – איזומריזציה של הצומת ליצירת מבנה פתוח

C – תופעה הקרויה Branch migration עליה נרחיב מי

199
Q

עי מי נדידת ההסתעפות מזורזת?

A

עי החלבונים שמנצלים ATP

200
Q

מה קורב במהלל נדידת ההסתעפות?

A

ובמהלכה נשברים ונוצרים מחדש זיווגי בסיסים. בדרך זו חלבוני הרקומבינציה מאפשרים את ההרחבה של ההטרו-דופלקס שנוצר תחיל על ידי תהליך שחלוף הגדילים. הנדידה היא לרוב לאורכם של אלפי בסיסים.

201
Q

למה יש

ב-branch migration

שימוש ב-

atp?

A

בשביל למנוע מתגובה ללכת אחורה

202
Q

מה הם שני חלבונים שיש ב-branch migration

בחיידקים?

ואילו סוגים הם?

A

תמונה ניתן לראות את חלבוני ה- Branch Migration

החיידקים RuvA

טטרמר

ורוב בי שהוא הקסמר

הוא בעל פעילות של הליקאז (ואכן הוא הקסמר כמו ההליקאזות אותן פגשנו עד כה). החלבון

RuvA

אחראי על הקואורדינציה של תנועת הגדילים אחד על השני.

203
Q

כמה תוצרים אנחנו אמורים לקבל מכל הומולוג?

A

4

2- מכל הומולוג שהוכפל

204
Q

מה קורה לאחר

branch migration?

A

נוצר הטרודופלקס שיכול להתמשך למשך אלפי בסיסים. ההטרודופלקס הזה יכול “לסבול” אחוז נמוך של בסיסים לא משילימים

205
Q

למה איזורי ההטרודופלקס יכולים לשמש כאתרים ?

A

gene conversion

אתרים בהם מתוך ארבעת תוצרי המיוזה שאמורים להתחלק 2 מהכרומוזום הפרנטאלי ו- 2 מהכרומוזום המטראנלי, נקבל ש 3 יהיו מכרומוזום אחד ורק אחד יהיה מכרומוזום אחר – שזה בעצם סטייה מתוצרי המיוזה הצפויים.

206
Q

למה גורמת נדידת הצומת?

A

נדידת הצומת בעצם מותחת חתיכות גדולות של דנ”א אחת על השניה, לא בהכרח עם הומולוגיה מושלמת על עם אחוז קטן של Mismatch

שהוא הגיוני כיוון שמדובר בכרומוזומים הומולוגים.

207
Q

עי מי יתוקן ה-

mismatch

ב-gene

convasion

A

. אי התאמה תתוקן על ידי מערכת ה-

MMR

ובעצם יבחר גדיל אקראי. שימו לב שהטרודופלקס שכזה יכול להיות מיוצר גם כאשר יש קרוס אובר וגם כאשר אין קרוס אובר.

בדרך כזו נקבל סטייה מתוצרי המיוזה הצפויים כיוון שבחירת הגדיל שישמש כתבנית לתיקון נעשית באופן אקראי וללא יכולת להבחין בין גדיל אמהי לאבהי.

נציין כי זו לא הדרך היחידה להיווצרות

Gene Conversion אבל ללא ספק הדרך העיקרית.

208
Q

איזה סוג חלבון זה ku?

A

הטרודימר

209
Q

כיצד

rec a

נקשר לדי אן איי ?

A

בצורה קופראטיבית

210
Q

gene conversion?

A

סטייה ממה שמנדל הציע

211
Q

למה גורמת קרינת איקס?

A

ליצירת שברים דו גדיליים

212
Q

מה זה טרנספוזיציה ?

ומה הם מכילים?

A

טרנספוזיציה ו- Site Specific Reconbination

הם בעצם דרכי נדידה של אלמנטים גנטיים מובילים. אלמנטים אלו יכולים להיבדל אחד מהשני בגודל (בין מאות לעשרות אלפי בסיסים), לרוב מכילים סטים ייעודיים של גנים המקודדים לאנזימים המזרזים את המעבר ומעודדים את הרקומבינציה.

213
Q

מה יכול לקרות לגנים אשר נמצאים על האלמנטים הגנטים שעוברים טרנספוזיציה?

A

יש מצב להרס הגנים

214
Q

האם כל האלמנטים הגנטים נשארו בגנום שלנו?

A

לא

215
Q

מה זה טראנספוזיציה?

A

טרנספוזיציה היא תנועה של אלמנט גנטי מובילי המזורזת על ידי אנזים המקודד לרוב על ידי הטראנספזון עצמו, ומזהה רצפים בקצוות הטראנספוזון, חותך ומעביר אותו לאתר כלשהו, אליו הוא מגלה מעט אם בכלל סלקטיביות או ספציפיות

216
Q

לאילו שלושה סוגים מחולק הטראנספוזום?

A
217
Q

איזה טרנספוזומים ניתן למצוא בחיידקים?

A

טראנספוזומים של די אן בלבד

218
Q

האם non retro

עדיין נעים אצלנו?

A

כן

219
Q

טראנספוזונים באיזו גרסה הם מצויים?

והאם יש לזה שלב ביניים?

ולמה הם גרמו?

והאם זה עובר בין תאים שונים?

A

בגרסת הדי אן איי בלבד

לא אין לזה שלב ביניים

לעמידות בפני אנטיביוטיקה

כן

220
Q

באיזה מנגנון יעברו הטרנספוזונים?

A

במנגנון

cut and paste

תוך שהם ישאירו צלקות

221
Q

מה קורה כאשר טראנפוזומים חותכים את עצמם מגנום?

A

כאשר טראנזפונים אלו חותכים את עצמם החוצה מהגנום בדרכם לאתר חדש (= Cut) הם משאירים חור בדנ”א שיתוקן על ידי מערכת תיקון שבר דו גדילי -או רקומבינציה הומולוגית או

NHEJ, השיטה האחרונה תשאיר גם פגם או מוטציה באתר היציאה של הטראנספוזון.

222
Q

מה מזכיר את הטראנספוזיציה של

cut and paste

A

מעניין מאוד לחשוב שמנגנון הרקומבינציה

V(D)J

במערכת החיסון של חולייתנים מזכיר מאוד את מנגנון הטראנספוזיציה של

Cut and paste

ואכן חוקרים מאמינים שהוא נגזר ממנו.

223
Q

איך הולך המנגנון של הטראנספוזום?

A

כל טרנספוזון מסוג

DNA-only

יש רצפי -

Inverted repeats

(באדום באיור) המזוהים על ידי האנזים טראנספוזאז (המקודד בתוך הטראנספוזון). רצפים אלו יכולים להיות קצרים מאוד – כ20 בסיסים.

התהליך מתחיל בכך שהטראנספוזאז מתחבר לרצפים הלו ומביא אותם קרוב אחד לשני ליצירת מבנה הקרוי טראנספוזום.

הטראנספוזום מבוקע החוצה על ידי הטראנספוזאז ומתקבלת לולאת דנ”א

כעת הטראנספוזאז יזרז את החדרת הלולאה לאתר אקראי בגנום, בסבירות גבוהה כרומוזום אחר, אך ייתכן שבאותו כרומוזום. את הביקוע של את הכניסה הוא יבקע באופן כזה שישאיר קצוות דביקים

אזור החד גדיל שיווצרו בגלל הקצוות הדביקים יעבור שכפול ולכן נקבל בסוף

Directed repeats

באתר הכניסה. לבסוף כמובן צריך דנ”א ליגאז.

אתר היציאה של הטראנספוזון יעבור איטום על ידי מערכת תיקון נזקי דנ”א.

224
Q

t3

זה

cut and paste or copy and paste?

A

copy and paste

225
Q

למה משמשת טראנזפוזיציה בוירוסים?

A

טראנספוזיציה משמשת וירוסים רבים על מנת להעתיק את המימאדקום שלהם לאחר שעברו אינטגרציה לגנום. כחלק ממחזור החיים של וירוסים רבים שעוברים אינטגרציה לגנום הם שוברים את הדנ”א בנקודה אקראית ונכנסים בדומה למה שמבצע טראנספוזון.

226
Q

איזה וירוס משתמש בטרנזפוזיציה?

A

רטרו וירוסים

227
Q

איך הולך מנגנון הרטרו וירוס?

A

מחוץ לתא הווירוס מתקיים בתוך קפסיד חלבוני שבתוכו יושבת מולקולת

RNA

חד גדילית והאנזים רוורס-טראנסקריפטאז (אשר מזרז כידוע לכם סינתזה של דנ”א על גבי תבנית של רנ”א). עם הכניסה לתא, האנזים משופעל ומולקולת

ה- RNA

הופכת להיבריד

RNA-DNA

ובהמשך ל- dsDNA

אשר נכנס לגרעין התא והאנזים אינטגראז מזהה אזורים בקצוות הדנ”א הדו גדילי, חותך אותם ובמקביל חותך בנקודה אקראית בגנום ומזרז את החדרת הדנ”א אליה במנגנון דומה מאוד למה שראינו ב Cut and Paste.

228
Q

רטרו-טראנספוזונים

ולאילו שתי קבוצות הם מתחלקים?

A

ם טראנספוזונים אשר עוברים דרך שלב ביניים של

RNA

ומקודדים תמיד לאנזים רוורס-טראנסקריפטאז. הרטרו-טראנספוזונים מתחלקים ל2 קבוצות – אלו שדומים לרטרו-וירוסים ואלו שאינם דומים לרטרו-וירוסים.

229
Q

Retroviral Retrotransposons

A

אלו הם רטרוטראנספוזונים הדומים מאוד לרטרו-ווירוסים אך חסרי מעטפת קפסיד חלבונית. הם קיימים החל משמרים דרך זבובים ובני אדם. בניגוד לרטרו-ווריוסים, שלהם יש קפסיד שמגן עליהם ומאפשר להם להניץ מהתא החוץ, לרטרו-טראנספוזונים אין קפסיד ולכן הם מחוייבים להישאר בתוך התא.

230
Q

מה הם השלבים במנגנון פעילות של הרטרוריבל טרנספוזון?

A

השלב הראשון במנגנון הפעילות שלהם הוא שעתוק של הרטרו-טראנספוזון למולקולת

RNA

בעלת כמה אלפי נוקלאוטידים באורך.

האנזים רוורס טראנסקריפטאז המקודד על ידי הטראנספוזון מבצע שעתוק לאחור ליצירת דנ”א דו גדילי ולאחר מכן האנזים אינטגראז שגם הוא מקודד על ידי הטראנספוזון יבצע את האינטגרציה .

231
Q

Non Retroviral Retrotransposons

איפה הם נמצאים?

A

טראנספוזונים אלו מצויים בכמות מאוד גדולה בגנום האנושי, בעיקר בגרסאות שעברו מוטציות או שעברו חיתוך

232
Q

איך טראנזספוזום קשור להמופיליה?

A

אלו מהם ששמרו על הפעילות שלהם, כמו למשל

L1 הידוע גם כ LINE

אחראיים גם למחלות אנושיות, כמו למשל במקרה של המופיליה בה הטראנספוזון

L1

עבר אינסרציה לתוך פקטור הקרישה 8 והרס אותו.

233
Q

מה הוא מנגנון של נון רטרוריבל טרנספוזון?

A

הם משתמשים בקומפלקס אנזימטי אליו הם מקודדים המכיל אנדונוקלאז ורוורס-טראנסקריפטאז.

האנדונוקלאז מזרז יצירת

Nick

בגנום ורוורס טראנסקריפטאז ישתמש בקצה

3 של ה nick

כפריימר ויאריך אותו, תוך שהוא משתמש

ב-RNA כתבנית.

לסיום ישוכפל הגדיל השני ותתבצע ליגציה.

שימו לב שרצף הפולי A עובר כאן שעתוק ואף שעתוק במהופך.

234
Q

למי מהבאים יש רוורסט טראנסקריפטאז ואנדונוקלאז משלו

Line

or sine?

A

line

235
Q

למי שייכים רצפי ה-

alu

Line or sine?

A

sine

236
Q
A
237
Q

כמה line and sine

מהווים מהגנום האנושי?

A

30 אחוז

238
Q

Conservative Site Specific Recombination

A

היא בעצם תופעה בה מתרחשת רקומבינציה שבה דנ”א מוביילי עובר מאתר לאתר אחק כאשר ישנם שני האתרים שהם אתרים יעודיים.

239
Q

אילו תוצאות

Conservative Site Specific Recombination

יכולות להניב?

A

אינטגרציה-אקסיזיה – מולקולה מעגלית יכולה להיכנס לדנ”א לינארי בתוך אתר בו יש עותק זהה לרצף המצוי על גביה כך שהרצף בתוך המולקולה המעגלית יעבור אינטגרציה לדנ”א הלינארי ובקצוות המקטע יהיה רצף חוזרני

Direct Repeat.

לחלופין, רצף המצוי בין 2 רצפי

Direct repeat

יכול להימחק החוצה (תוך כדי שהוא יוצר מולקולה מעגלית). בשיטה זו וירוסים חיידקיים רבים יכולים לעבור אינטגרציה לגנום החיידקי וכאשר יש נזקי דנ”א רבים כמו נזק קרינתי, הוא יכל להפוך את האיטגרציה ולצאת החוצה ובכך לנטוש את הספינה השוקעת.

אינברסיה – רצף שמשני צדדיו

יש Inverted repeat יכול לעבור היפוך.

240
Q

איך סלמונלה משנה את ביטוי הגנים?

A

עי

Conservative Site Specific Recombination

בתהליך שנקרא

Phase variation

בעזרתה היא משנה את הביטוי של הגן פלג’לין

תהליך הרקומבינציה שמסתיים באינברסיה כולל את החלפת המיקום של הפרומוטר. האינברסיה, אשר מזורזת בזכות רצפי Inverted repeats

המצויים משני קצוות הפרומוטר (ראו תמונה), בעצם מונעת את

השעתוק של

H2 ושל הרפרסור

ל- H1. ברגע שהרפרסור של

H1

אינו משועתק אז אין מי שידכא את הביטוי של

H1

ואז התוצר החלבוני של הגן

H1

יעבור ביטוי.

241
Q

האם האינברסיה בסלמונלה היא שכיחה?

A

לא

242
Q

מה היא שיטת

cre?

A

הוא רקומבינאז המזהה את רצפי

LoxP

, ואשר לרוב מוכנס תחת פרומוטר ייעודי לרקמה ושמתבטא בזמנים מסויימים בהתפתחות העוברית.

243
Q

מה זה

directed repeats

ואיפה ניתן למצוא אותן בטראנספוזון די אן איי?

A

לאחר הכנסת הטראנספוזום לאתר המטרה

acg

acg

בשני הצדדים

244
Q

מה זה

invertered repeats

ואיפה ניתן למצוא אותן בטראנספוזון די אן איי?

A

באתר המקור הוא יוצא יחד עם הרצף

acg

gca

245
Q

אילו שלושה תפקידים יש ל

reverse transcriptase?

A
  1. מ-

rna to dna

  1. rnase h
  2. dna-dna
246
Q

מה הפריימר בריברס טראנסקריפטאז?

A

trna- glutamate

247
Q

מה ההבדל בין אינטגרציה ואקסיזציה לאינברסיה

A

באינגרציה ואקסזיציה צריך

directed repeats

משני הצדדים

ואילו באינברסיה

צריך Inverted repears

מה שמתבטא זה מה שבינהים

248
Q

למה לפעמים מתבטא

h2

ולפעמים

H1

של פלאגין בסלמנונה?

A

כדי לברוח מהמערכת החיסונית