biochemistry Flashcards
יסודות קורט
יסודות שזניחים ביחס למשקלם אך חיוניים לחיים כמו ברזל
אילו קשרים בין מולקולאריים ישנם ומה משפיע על כל אחד מהקשרים?
דיפול רגעים- קשרי לונדון, מה שמשפיע עליהם זה מסה ומספר אטומים במולוקולה דיפול-דיפול- קשרים בין אטומים פולאריים וקשרי מימן
למה מתחלקות הביו- מולקולות
מטאבוליטים ומאקרו מולקולות
מה ההבדל בין מטאבוליטים משניים לראשוניים?
מטאבוליטים שניוניים- ספציפים לאותו האורגניזם
מטאבוליטיםראשוניים - מטאבוליטים אוניברסאלים כמו גלוקוז
מהו מטאבולום?
מגוון של מטאבוליטים תחת תנאים בסיסיים כמו למשל שנותנים אינסולין לחולי סכרת
מה הן מאקרו מולקולות
מורכבים ממשקל מולקאלרי של 500 דלתון ומעלה, ומעלה, פולימרים
סופר מולקולה קומפלקס
כשפולימרים שונים יוצרים קומפלקס לדוגמא ריבוזום שמורכבמחלבונים וחומצות גרעים
cell’s proteome
מתאר את תפקוד החלבונים בתא
למי אין את היכולת ליצור את הסופר מולקולה קומפלקס
ל-dna
מהם התפקידים של ה glycome?
מאגר דלק עתיר אנ מבנה קשיח בדופן התא מרכיב זיהוי והכרה חוץ תאיים הנקשרים לחלבונים על תאים אחרים
מהם תפקידי ה lipiosome?
- מרכיב עיקרי בממברנות 2. משמש כפיגמנטים 3. משמש כויטמינים
מהי ביולוגיה מערכתית
גישה המנסה לעשות אינטגרציה של המידע הנאסף מה glycomic lipodrmic ganomic proteomic
Informatial macromulcolus
חלבונים וחומצות גרעין ולפעמים אוליגוסוריכים- מה שנותן מידע
איזומרים עם מבנה שונה לחלוטין הם…
איזומרים מבניים
איזומרים עם מבנה מרחבי שונה הם…
סטריאואיזומרים
סטריאואיזומים
מולקולות בעלות אותה נוסחה כימית ואותם קשרים כימיים בין היסודות המרכיבים את המולקולה עם הבדל בקונפיגורציה
מהי האינטראקציה בין ביו מולקולות
סטריוספציפיות
מה היא סטריאוספציפיות
אינטראקציה שדורשת שמולוקולה תהיה בעלת מבנה מאוד ספציפי על מנת לקיים את ההתאמה המרחבית בין שתי המולקולות
אילו שלושה דרכים ישנם כדי להציג מולוקולות?
- קווים ויתדות 2. ball and stick 3. spacr filling
מודל קווים ויתדות
מודל שמציג מולקולה קו ישר- מציג קשר קוולנטי שאין בו הבדלים בקונ קו מלא- קשר קוולנטי שיוצר זווי ממישור הנייר קו מקווה מייצג קשר קוולנטי אל תוך הניר
ball and stick
מודל שמאפשר לצפות בזוויות הקשרים ואורך הקשרים
spacr filling
מודל שבו כל אטום מוצג ככדור בעל קוטר שונה המתאם פרוציואנלית לרדיס ו.ד.ו חיוני מאוד כאשר עושים אנליזה בין מולקולות ביולוגיות
מה משפיע על הקונפיגקציה ?
קשר כפול ומרכזים קיראליים
מדוע קשר כפול משפיע על הקונפיגרציה?
כי מסביב לקשר כפול לא יכולה להתקיים רוטציה והאטמים תקועים
מדוע מרכז קיראלי משפיע על הקונפיגרציה?
כי הם מרכזים סביבים קבוצות כימיות הקשורות בקשר יחיד, והם מצויים באוריינטציה מסוימת
האם ניתן לעבור מקונפיגורציה אחת לאחרת בסטריאואיזומרים
כן כי שבירת קשרים בלבד
אילו שני איזומרים מרחביים קיימים?
- איזומרים גיאומטריים 2. איזומרים בעלי מרכז קיראלי
מה הם איזומרים גיאומטרים ודוגמאות?
איזומרים של ציס וטרנס ציס- באותו בצד טרנס- בצדדים שונים
מה הם איזומרים בעלי מרכז קיראלי
פחמן היוצר קונפיגורציה של טטרהדר שקשור ל-4 קבוצות כימיות שונות ועי הזזה של כל אחת מהן ניתן לקבל מולקולות שונות . לכל מולקולה יש שני מצבים שנקראים אננטיומרים. אם יש לי שני מרכזים קיראלים נקבל 4 סטריאואיזמורים כל פעם זה עולה בחזקה 2
אילו קונפיגרציות קיימות לפחמנים בעלי פחמן קיראלי?
d and l r and s
איזה קונפגרציה יש לגלוקוז ולמה?
D כי המימן נמצא בצד בשמאלי של הפחמן הקיראלי
איזה קונפיגורציה יש לח.א
L
מה זה אומר קונפורמציה?
כאשר אטומים נעים במרחב בלי שיישבר הקשר הקוולנטי ביניהם
אילו קונפורמציות ישנן? ואילו מביניהן היציבה ביותר?
staggared and eclipse staggared-יציבה
מה הוא קבוע שווי המשקל
כל ריאקציה מגיעה לאיזשהו ש.מ עבור ריאקציה מסוימת וטמפרטורה מסוימת
מהו Q מה קןרה עם Q גדול מקבוע שווי המשקל? קאן ממנו?
קיו- יחס התוצרים למגיבים כאשר קיו קטן- התגובה תלך קדימיה כאשר קיו גדול- התגובה תלך אחורה
כלל לה-שטליה
התגובה תמיד תרצה לחזור לשיווי משקל כימי
אננטיומרים
סטריאואיזומרים שהם תמונת ראי של אחת ושניה
דיאסטריאואיזומרים
כאשר הסטיראואיזומרים אינם תמונת ראי של אחת ושנייה
redox
טבלה של פוטציאל חמצון חיזור,
redox
כמה חומר מחמצן טוב יותר כך ה redox שלו גבוה יותר redox = פוטנציאל החמצון
מה גורם למים להיות נוזליים בטמפ החדר? ובצורת crystalline?
קשרי מימן
מה הגיאומטריה של המים? ומה היא הזווית בין המימן לחמצן?
sp3 104.5
מה הם היסודות הנפוצים ביותר לפי הסדר
H C O N
אילו שני סוגים של קשרים קוולנטים ישנם?
- פולארי 2. לא פולארי
כשיש קשר משולש איזה סוגי קשרי ישנם
ישנם שני קשרי פאי שנמצאים מעל המישור וקשר סיגמא שנמצא במישור
מה זה אומר דיפול שלילי
שרוב הזמן האלקטרונים יהיו אצל האטום בעל האלקטרושליליות הגבוהה יותר
- מה קורה כאשר ישנם שתי מולקולות בעלות אטומים לא פולארים? מה קורה כאשר ישנם שתי מולוקולות בעלי אטומים פולארים ?
יווצר בין שתי מולקולות בעלות אטומים לא פולארים קשרי לונדון יווצר בין שתי מולקולות בעלות אטומים פולארים או קשרי דיפול - דיפול או קשרי מימן
מה הם התנאים לקשרי מימן?
- האם יש אטומי nof בשתי המולוקלות ? 2. האם לפחות באחת המולקולות אטום ה nof קשור למימן ?
משיכה אלקטרוסטטית
כאשר מולקולה בעל דיפול קבוע מושכת אליה אטום אחר
מה יותר חזק קשר פאי או קשר סיגמא?
קשר סיגמא
מה היא הקבוצה הבאה

אנול
מה היא הקבוצה הבאה

אתר
מה היא הקבוצה הבאה

אתיל
מה היא הקבוצה הבאה

אימין
מה היא הקבוצה הבאה

אלדהיד
מה היא הקבוצה הבאה

אמינו
מה היא הקבוצה הבאה

אנהידריד
מה היא הקבוצה הבאה

אצטיל
מה היא הקבוצה הבאה?

בסיס שיף
מה היא הקבוצה הבאה?

גוואנידיניום
מה היא הקבוצה הבאה?

די סולפיד
מה היא הקבוצה הבאה?

הידרוקסיל
מה היא הקבוצה הבאה?

מתיל
מה היא הקבוצה הבאה?

סולפאידריל
מה היא הקבוצה הבאה?

פוספואנהידריד
מה היא הקבוצה הבאה

פוספוריל
מה היא הקבוצה הבאה?

פניל
מה היא הקבוצה הבאה?

קארבוקסיל
מה היא הקבוצה הבאה

קטון
מה היא הקבוצה הבאה?

תיואסתר
כמה קשרי מימן יכולה ליצור מולקולת מים?
עד ארבעה קשרי מימן
מה קורה כאשר מתיכים קרח או מאדים מים?
יש עלייה באנטלפיה ועלייה באנתרופיה מאחר והרשת המסודרת הופכת לאדי מים
flickering clusters
מושג האומר שבגלל שמולקולות המים מתקבצים לצברים זמניים, בעלי זמן חיים קצר המקושרים ביניהם עי קשרי מימן שנוצרים ומתפקים
למה בטמפרטורת החדר ההפיכה של המים לגז היא ספונטנית?
בגלל שיש נטייה טבעית לעלייה באנתרופיה
כמה קשרי מימן יש למולקולת מים בטמפרטורת החדר?
3.4
למה שווה אנרגית החום של התמיסה המימית (=אנרגיה קינטית של תנועת המולקולות)?
היא שווה לאנרגיה הנדרשת כדי לשבור את הקשרים
למה גזים לא מסיסים לא יכולים להתמוסס במים?
בגלל שיש עליה באנטרופיה
carbonic unhydrase
מזרז את התגובה בין מים לפדח ליצירת חומצה קרבונולית
למה חומרים לא פולארים לא יכולים להתמוסס במים?
מהו מבנה clathrate
מבנה שנוצר כאשר יש מולקולות לא פולאריות בתוך מים
מה הן מולקולות אמפיפיליות/ אמפיפטיות
מולקולות בעלות איזורים הידורופיליים והידרופובים
מה קורה כאשר מולקולות אמפיפיליות נכנסות למים?
האזור הלא פולארי מתקבץ יחדיו כדי למנוע גישה למים בעוד שהאזור ההידרופילי מתקבץ כדי למקסם את הגישה שלו למים
ובכך האנטרופיה של המים עולה
איך קוראים לכוחות ששומרים על המולקולות ההידרופוביות ביחד?
ומדוע הכוחות קיימים?
קשרים הידרופוביים
כוחות תירומודינימים- עליה באינתרופיה
מתי המשיכה בין שני אטומים היא מקסימאלית
ברדיוס ואן דר ואלס, רדיוס שמתאר את המשיכה המקסימאלית. שני אטמים יכולים להתקרב עי כך ששניהם יוצרים דיפולים חשמליים רגעיים, ברגע שהם מתקרבים יותר מדי נוצרת דחיה למעשה בין שני האטומים
מתי אינטראקציות הידרופוביות מתחזקות?
כאשר הממס שלהם הוא מאוד פולארי, כמו במיצלה.
אפקט קומולוטיבי
ומשמעותו
אפקט של כמה קשרים בין מולקולאריים
כל פעם קשרים נשברים ונוצרים, הופעה של כל אחד מהקשרים הללו תורמת לירידה באנרגיית החופשית
האם מולקולות מים יכולות להיות חלק ממבנה של חלבון?
נכון
איך חלבונים, די אן איי ואר אן איי מייצבים את המולקולות של עצמן ?
עי התקפלות המולקולות עי כוחות בין מולקולריים
כיצד מים עוברים יינון?
מים עוברים יינון באופן ספונטני
ל-OH
ו-H
איך ניתן לחשב יינון של מים?
עי מוליכות כי המים מתייננים ליון הידרוקסיל ויון הידרונים ככה שאחד הולך לאנודה ואילו השני הולך לקטודה
כיצד יון ההידרוניום וההידרוקסיל מגיעים לקשרי לאנודה ולקטודה?
עי Proton hopping
מה הריכוז של היוני הידרוניום ויוני הידרוקסיל במים בטמפ 25 מעלות ?
10-7 מולאר
איך ניתן לקבוע את ערכי החומציות ?
עי נייר לטמוס או אלקטרודת זכוכית שרגישה ליוני מימן
מה הערך ה-Ph בדם?
ומה קורה אם הוא גבוה או נמוך יותר?
7.4
זה יכול לגרום לבססת או לחמצת
מה זה חומצה ומה זה בסיס?
חומצה מוסרת פרוטון ועוברת דפרוטונוציה
בסיס מקבל פרוטון ועובר פרוטונוציה
Conjugate acid-base pair
כאשר חומצה מוסרת פרוטון ואז היא הופכת לבסיס או ההפך
(חומצה אצטית הופכת ליון אצטט)
איך מוגדרת הנטייה של חומצה להפוך לבסיס המצומד שלה?
keq
ionization constant
acid dissociation constant
ka
מה הן חומצות מונופרוטיות?
חומצות המוסרות פרוטון אחד
מה היא טיטרציה?
טיטרציה היא ניסוי בו מוסיפים חומר אחד בעדינות ובזיהרות לחומר אחר ובודקים את השינויים או ההתמרות שמתרחשות. שימוש בטיטרציה היא דרך נפוצה על מנת להעריך את כמות החומצה שיש בתמיסה נתונה. בניסוי שכזה נפח ידוע של חומצה עובר טיטרציה על ידי בסיס חזק כדוגמאת NaOH בריכוזים ידועים. הבסיס החזק מוסף במשורה ובכמויות קטנות בכל פעם עד שכל החומצה עוברת עוברת סתירה (=ניטרול) על ידי אינדיקטור (צבע או pH-meter). החישוב של כמה חומצה הייתה בתמיסה המקורית שנפחה ידוע היא על ידי שימוש בריכוז הבסיס שידוע ובסך הנפח שהשתמשנו בו עד שהגדענו לניטרול מלא של החומצה (pH=7).
אקווילנט
כמות החומר המספקת או הצורכת 1 מול פרוטונים
מתי ph= Pka ?
מתי שחצי מהחומצות מצומדות בסיס בכלי נתנו את המימן שלהם
בופר
מערכת המצויה בתמיסה מימית שיש לה נטיה להתנגד לשינוי PH
BUFFERIN REGION
1+-pka
של חומצה מצומדת בסיס
מדוע כשהPh=pka זוהי נקודת הבופר
בגלל שריכוז החומצה שווה לריכוז הבסיס המצומד לה, כלומר לא משנה אם נשים יוני הירדונים או הידרוקסיל מה שיקה בסוף זה סתירה
משוואה אנדסרסון האסלבך

אילו שני בופרים למדנו?
- פוספאט בשני מצבים
- ביקרבונאט בשני מצבים
איפה ניתן למצוא את הפוספאט כבופר?
ומה הם שתי הצורות שלו?
h2po4 to hpo4
בפלסמה ובנוזל הבין תאי
מה הPka של h2po4
6.86
אילו שתי צורות יש לקרבונאט?
h2co3
to
hco3
עם מי החומצה הקרבונילית נמצאת בש.מ?
עם הצורה הלא מסיסה שלו, פחמן דו חמצני בנאדית הריאה
איך הבופר של החומצה הקרבונילית מתנהג?

איך ה-Ph בדם משפיע קצב הנשימה?
כאשר ה-PH בדם גבוה משמע הדם בסיסי, נרצה שיותר פחמן דו חמצני יכנס לדם ויהפול לחומצה קרבונולית ובהמשך ליון הידרוניום וביקאקרבונאא
כאשר ה-PH בדם נמוך משמע הדם חומצי, נרצה להוריד את כמות הפרוטונים, כלומר להוריד את ריכוז הפדח בדם, עי הכנסתם לנאדית הריאה
איך זה הגיוני של-H2CO3 יש PKA-3.57 ואילו בדם יש PH=7.4 כלומר איך זה הגיוני שזה משמש כבופר?
- יש רזרבואר שמגיע מהריאות כלומר הוא משמש בופר טוב כי אם מגיעה למשל יון הידרוניום התגובה חוזרת אחורה לכדי פחמן והפחמן יוצא החוצה
- הוא משמש כבופר טוב בגלל שיש רזרבואר בדם

מהי השפעת סכרת על ערכי PH?
כאשר יש סוכרת יש מטאבוליזם של לרוב של שומן כי סוכר לא נכנס לתאים וכתוצאה מכך נוצרים גופיפי קטו וחומצות קרבוקסיליות שמורידות את ה-PH בדם ונוצר אצידוזיס.
מה הן התופעות הלוואי של אצידוזיס?
- כאבי ראש
- ערפול הכרה
- stupor שלשולים
איפה ניתן לזהות חמצת ומדוע?
- רעב וצום - בגלל חומצות
- אימון מאומץ מאוד - חומצה לקטית
- אי ספיקת כליות-אין ייצור של בי קארבונט
- מחלות ריאה - emphysema נפחת ו-pneomonia כל זה מוריד את הוצאתו של הפדח
מה עושים במקרי חמצת?
אינסולין לחולי סכרת
סטרואידים ואנטיביוטיקה- לחולי דלקת ריאות
ריאקציה אנדרוגנית
ריאקציה לא ספונטנית
ריאקציה אקסרוגנית
ריאקציה שהיא כן ספונטית
ריאקציות של פלמור הן אינן ספונטיות, כיצד ניתן להפוך אותן לספונטינות?
עי הצמדה לתגובות אקסורגניות
תארי את תגובת הפיכת adp to atp ?

מה תפקידי המים ?
- ממס
- מגיבים ותוצרים בתהליכי הידרוליזה שונים
- בתגובת ההמסה של פדח עי carbonic anhydrase מים משמשים כמגיב וכproton hopping
- מים תורמי אלקטרונים בפוטוסינטזה
ממה נבדלים סוכרים?
מספר הפחמנים המרכיבים את חד הסוכר.
מיקום קבוצת הקרבוניל – אלדהידים מול קטונים.
סידור מרחבי – סטראואיזומרים שונים לאותו מבנה יתנו סוכר שונה.
איזה תכונות של המים יצורים מימיים מנצלים?
- חום סגולי גבוהה של המים
- חום אידוי גבוהה
- הידבקות פנימית כך שנוטריינטים יכולים להגיע למעלה
- צפיפות הקרח גבוהה מצפיפות המים ולכן אגמים קופאים מלמעלה למטה ולא הפוך כך למעשה יצורים מימיים לא קופאים
מה ההבדל בין סוכר D לסוכר L?
ב-D הפחמן הרחוק מהקרבוקסיל יש לו מימן בצד שמאל ואילו ב-L לאותו פחמן יש בצד ימין
סוכרים אפימרים הם:
שני סוכרים שיש להם הבדל בפחמן כיראלי אחד שאינו הפחמן הרחוק מהקרבוקסיל
פיראנוז
טבעת שמכילה 6 פחמנים שאחד מהם הוא חמצן
פוראנוז
טבעת המכילה 5 מרכיבים, אחד מהן המרכיבים הוא חמצן
איך שרשרת הופכת לטבעת?
עי תגובה של הכוהל עם האלדהיד/קטון. ההיידרוקסיל הוא נוקלאופיל שתוקף את הקרבוניל
איך קוראים למבנה שנוצר לאחר ההתקפה הנוקלאופילית של כוהל את האלדהיד?
ואיך קוראים למבנה שנוצר לאחר ההתקפה הנוקלאופילית של כוהל את הקטון?
המי אצטל
המי קטאל
מה קורה ששפחמן בעל הידרוקסיל תוקף המי קטאל או המי אצטל?
- המי קטאל הופך לקטאל
2 המי אצטל הופך לאצטאל
מתי נפלטת מולקולת מים:
בחיבור בין שתי מולקולות סוכר או הפיכת שרשרת סוכר לטבעת?
בחיבור בין שתי מולוקולת סוכר
תארי את התגובות שמתרחשות כדי ששרשת סוכר תהפוך לטבעת:
- עבור אלדהיד
- עבור קטון

פחמן אנומרי
פחמן מספר 1 בטבעת של הסוכר
אנומר אלפא
כשקבוצת ההידרוקסיל בפחמן האנומרי קרובה לפחמן 2
אנומר בטא
כשקבוצת ההידרוסיל בצד הרחוק מפחמן השניים
מה יודע לעשות כל אננטיומר?
כל אננטיומר יודע לסובב אור בצורה מסוימת
מה קורה לריכוזים במערכת במצב ש”מ?
הריכוזים אינם משתנים
איך נקראת תערובה שבה יש שני אננטיומרים באותה הכמות?
תערובת רצמית
האם תערובת רצמית גורמת לקיטוב של אור?
לא
מה הם התנאים שבו keq נשאר קבוע בהם?
- טמפ קבועה
- לחץ קבוע
כדי שתיווצר ריאקציה שתי מולקולות שנפגשות איך הן צריכות להיות?
באוריינטציה נכונה עם אנרגיה מספקת
מהי ההגדרה של האנרגיה החופשית של גיבס ?
האנרגיה החופשית של מולקולות שאנו יכולים לנצל כדי לעשות עבודה
למה יש אנרגיה יותר נמוכה בתגובה ספונטנית למגיבים או לתוצרים?
תוצרים
מה גורם לריאקציה להיות איטית?
כדי להוציא מולקולה ממצב יציב כדי להגיע למצב עוד יותר יציב יש לעבור במצב המעבר
מהו המצב הכי אנרגטי בזמן תגובה?
ומה זה אומר מצב אנרגטי?
מצב המעבר
מצב אנרגטי זה אומר מצב לא יציב
אנרגית שפעול
הפרש ב-G של מצב המעבר לעומת אנרגית המגיבים
מה עושה אינזים/זרז?
מייצב את מצה המעבר/מוריד אנרגית שפעול
אנרגית האקטיבציה נמצא ביחס הפוך ל…
קבוע הגזים, ולקבוע הקצב
ככל שאנרגית האקטיבציה גבוהה יותר משמע…
הקצב הוא נמוך יותר
למה ריכוזי המגיבים משפיעים על קצבי ריאקציה?
כי ככל שיש יותר מגיבים אז יש יותר סיכוי שיהיו מפגשים בין מולקולות שונות
מהי ריאקציה רב שלבית?
ומהו שלב קובע מהירות של התגובה?
ריאקציה שיש בה יותר משלושה מגיבים
שלב קובע המהירות הוא השלב שבו קצב התגובה הוא הנמוך ביותר כלומר השלב בו אנרגית האקטיבציה היא הגבוהה ביותר
ממה מושפע dG?
- אנתפליה - חוזק הקשרים בתוצרים פחות חוזק הקשרים במגיבים
- אנתרופיה המדד לאי סדר
מה קורה ל-dG במהלך התגובה?
dG עולה עד מצב שהוא מגיע בו ל-0, זה המצב של ש.מ. כלומר dG משתנה בכל רגע נתון
מה ההבדל בין dG טאג ל-dG רגיל?
dG טאג זהdG שנמדד בתנאי טמפ של 25 מעלות וכאשר ריכוז המגיבים והתוצרים שווה למולאר אחד
איך אפשר לחשב dG ברגע נתון
dG=dG(tag)+ln q
מה הם המושגים של התרמודינמיקה ומה הם המושגים של הקינטיקה שאסור לנו להתבלבל ביניהם לעולם או שרשף שורף אותנו ?
קינטיקה -rate
Ea זרזים V0 VMAX KM
תרמודינמיקה-
dG,dH,dS
ספונטני
כיוון תגובה
DE
מה ההבדל בין:
משקל מולקולארי
מסה מולקולארי
מסה מולארית
משקל מולקולארי- חסר יחידות, סוכמים את המולקולסה ומחלקים אותה ב-מסה של 1/12 אטום פמן
מסה מולקולארית - מחושבת בדלתון כאשר מחלקים את הגרם למול במספר אבוגדו
מסה מולארית - גרם למול
מהי ריאקציית חמצון חיזור?
ריאקציה שבה מעבירים אלקטרונים ופרוטונים או רק אלקטורנים נקראת ריאקציית חמצון חיזור
מה הם כללי האצבע של ריאקציות חמצון חיזור?
אטום במצב היסוד- הוא יקבל 0
מימן +1
חמצן 2-
כל מספרי החמצון מתחברים למצב של המטען על המולקולה
איך נזהה ריאקציית חמצון חיזור?
נבדוק אם מספרי החמצון משתנים
מה טבלת ה-redox מייצגת?
מי מחמצן יותר טוב ממימן ומי מחמצן פחות טוב ממימן
אם פוטנציאל החיזור בטבלת ה-redox הוא שלילי משמע…
ואם הוא חיובי משמע….
שלילי- מחמצן פחות טוב ממימן
חיובי מחמצן יותר טוב ממימםן
איך מחשבים
dE?
ומתי תגובה היא ספונטנית?
dE= E(REDUCTION)-E(OXIDATION)
מחמצן- מחזר
התגובה היא ספונטנית כזה חיובי
מהו הנוסחא שמקשרת בין
dE ל- dG
ככל ש-dE יותר גבוהה כך ?
dG=-nFEcell
כך מתקבלת יותר אנרגיה כתוצאה מהתגובה
לאילו שתי ריאקציות ניתן לחלק חימצון חיזור
חצי ריאקצית חמצון וחצי ריאקצית חיזור
איפה כל האטומים יושבים על אותו משטח בקשר יחיד או בקשר כפול?
בקשר כפול
זרזים הם ממהרים את התגובה קדימה או אחורה?
זרזים ממהרים את שניהם
מה ההבדל בין מצב יציב לבין מצב של ש”מ
מצב יציב - יש כל הזמן השקעת אנרגיה
dG TAG!=0
מצב ש”מ אין השקעת אנרגיה
dg tag=0
ממה נובעת האנומליה של המים?
חומרים רגילים מתכווצים בטמפרטורות נמוכות ואילו מים מתרחבים בגלל הניצול של כל קשרי המימן שלהם מ3.4 קשרי מימן ל-4 קשרי מימן
למה קארבוניל יוצר קשרים פחות מוצלחים עם מים מאשר עוד מולקולת מים ?
כי קארבוניל הוא רק hidrogen acceptor בעוד שמולקולת מים אחרת היא גם hidrogen accptor וגם hidrogen donor
מדוע נעדיף להשתמש בקשרים הידרופובים בתא?
מכיוון שבתוך התא יש מים המים נמצאים בתחרות מתמדת עם המולקולות שיוצרות קשרי מימן
מה זה אומר הקבוע הדיאלקטרי? ובאיזה נוסחה משתמשי בו ?
ככל שהקבוע הדיאלקטרי גבוהה יותר כך הממס והמומס מתחברים והתמיסה יותר מוליכה חשמלית
F=q1q2/Er2
דטרגנטים
ממיסים ממברנות, מולקולות אמפיטטיות
קשר קואורדינציה הוא
קשר שרק אחד מהאטומים הוא תורם אלקטרונים
פיתוח הנוסחה של kw
מה זה kw
פי כמה kw גדול מ-keq?
ומה זה נטרליות?
kw גדול פי 55.4 מ-keq
נטרליות :
[OH]=[Hּ[

מה היא הנוסחה של אנרגיית האקטיבציה ?
Ea=-RTlnk/A
אם יש PH מה זה אומר לנו לגבי התמיסה
שמדובר בתמיסה מימית
מה זה KA
מה אומר אם pka נמוך? והאם זה אומר משהו לגבי Ph?
ככל ש-Pka יותר נמוך ככה החומצה יותר חזקה אך זה לא אומר שום דבר על ה-Ph

מתי זה נכון לגבי מים:
PH+POH=14
רק כאשר המים בטמפ של 25 מעלות ו-1 אטמ
ככל שהחומצה יותר חלשה הבסיס המצומד שלה הוא יותר….
חזק
תאר את תהליך הטיטרציה
מולקולת ה- Carvone, סטראואיזומר R נמצא בספירמינט ונותן את הריח שלה, ואילו קונפיגרוציית S נמצאת בצמח הכרוויה ומקנה לה את ריחה האופייני.
מה זה הנוסחה שקובעת את ה-ph בתמיסה עם בופר
Ph=pka+log conjugatedbase/acid
מולקולת ה-carvone אילו שני צורות יש לה ומה מקנה לה כל צורה ?
מה ההבדל באספרטיים בין שני הצורות שלהם?
מה הוא הצורה הרפואית של ציטרופלם?
מולקולת ה- Carvone, סטראואיזומר R נמצא בספירמינט ונותן את הריח שלה, ואילו קונפיגרוציית S נמצאת בצמח הכרוויה ומקנה לה את ריחה האופייני.
אספרטיים שהוא ממתיק מלאכותי, קונפיגורציות נבדלות בטעם – מריר לעומת מתוק.
ציטלופרם (מאד קרוב לציפרלקס ובן לאותה משפחה) – נוגדן דכאון ממשפחת ה SSRI, רק קונפיגורצית S פעילה מבחינה רפואית
מה הם התכונות של המים?
למים יש טמפרטורת התכה וחום אידוי (Heat of vaporization) מאשר למרבית הממסים האחרים.
- כל אטום מימן חולק זוג אלקטרונים עם החמצן המרכזי של המולקולה.
- הגיאומטריה של המולקולה כולה מוכתבת על ידי האלקטרונים המצויים באורביטלות החיצוניות של המולקולה אשר מאוד דומות לקשר מסוג sp3 אשר שהפחמן יודע לעשות ובעצם אמורה לייצר מבנה טטרהדראלי עם אטומי המימן בשתי הפינות ושני זוגות של אלקטרונים לא קושרים בשתי פינות נוספות.
- זווית הקשר בתוך המבנה הטטרהדראלי הוא 104.5℃, קצת פחות מ ℃ 109.5 של טטראהדר מושלם – למה לא בדיוק כמו טטראהדר מושלם? מאחר וזוגות האלקרטרונים הלא קושרים מצטופפים סמוך לאטום החמצן ומפעילים כוחות דחייה על הקשרים שקיימים עם המימנים.
- מאחר והחמצן הינו אטום אלקטרושלילי ביותר, הוא מושך באופן חזק יותר את אלקטרוני הקשר אשר יהיו יותר בקרבת החמצן מאשר המימן. תכונה זו יוצרת דיפול חשמלי בשני הקשרים הקוולנטיים בין החמצן והמימן בתוך המולקולה.
- כתוצאה מכך המימן נטען במטען חיובי חלקי (דלתא פלוס) ואילו על החמצן מטען חלקי שלילי (דלתא מינוס) מה שמאפשר יצירת קשרי מימן על ידי משיכה אלקטרוסטטית בין 2 מולקולות מים שכנות.
- קשרי מימן הם קשרים יחסית חלשים כפי שלמדנו, לפחות חלשים יותר מקשר קוולנטי. במים נוזליים יש לקשרי המימן אנרגיית דיסוציאציה (האנרגיה הנדרשת לשבור קשר Bond dissociation energy) של כ- 23 גילו-ג׳אול למול, בהשוואה ל- 470 קילוג׳אול למול של הקשר הקוולנטי בין חמצן ומימן בתוך מולקולת המים, או 348 קילוג׳אול למול בתוך הקשר הקוולנטי פחמן-פחמן.
- קשר המימן הוא בערך 10% קוולנטי הודות לחפיפה באורביטלות הקשר, ובערך 90% אלקטרוסטטי.
- בטמפרטורת החדר, אנרגיית החום (Thermal energy) של התמיסה המימית (=האנרגיה הקינטית של תנועת אטומים ומולקולות בודדות) הינה באותו סדר גודל של האנרגיה הנדרשת לשבור את הקשר. כאשר מחממים את המים מתגברת תנועת מולקולות המים הבודדות.
- בכל רגע נתון, במים במצב צבירה נוזלי, מרבית המולקולות מצויות בקשר מימן. אך זמן החיים של הקשר הינו בין 1-20 פיקו-שניה (10-12 שנייה), כך שבכל רגע ורגע נשבר קשר ומיד נוצר עוד אחד, עם אותה מולקולה שכנה או עם אחת אחרת תוך 0.1 פיקו-שניה.
- מאחר ומולקולות המים במצב נוזלי מתקבצים למעין צברים זמניים בעלי זמן חיים קצר המקושרים ביניהם על ידי קשרי מימן שנוצרים ומתפרקים, הם קיבלו את השם Flickering Clusters
- סכום כל קשרי המימן של המים מתבטא כהידבקות פנימית די חזקה של מולקולות המים.
- בנוסף, רשת קשרי המימן הענפה יוצרת גשרים בין מומסים כמו חומצות גרעין וחלבונים המאפשרים למולקולות גדולות לעשות אינטראקציה אחת עם השניה במרחקים של מספר ננומטרים ללא מגע פיזי ביניהם.
- המבנה הכמעט טטראהדראלי מאפשר לכל מולקולת מים ליצור עד 4 קשרי מימן.
- מים נוזליים בטמפרטורת החדר ובלחץ של אטמוספרה אחת – גל מולקולת מים יוצר בממוצע 3.4 קשרי מימן.
- בקרח מולקולות המים מקובעות במרחב ולכן כל מולקולת מים יוצרת 4 קשרי מימן עם שכנותיה מה שיוצר מבנה של רשת רגילה.
- קשרי המימן תורמים לנקודת התכה גבוהה יחסית מאחר והאנרגיה התרמית (thermal energy) הנדרשת לשבירת קשר המימן במבנה הרשתי המסודר של קרח קריסטאלי היא גבוהה יחסית.
- כאשר מתיכים קרח או מאדים מים, חום נלקח על ידי המערכת (עלייה באנתלפיה) אך גם ישנה עלייה באנטרופיה של המערכת מאחר והרשת המסודרת של המים מתפרקת והופכת להיות פחות מסודרת הן במעבר מקרח למים נוזליים והן במעבר ממים נוזליים לאדי מים.
- בטמפרטורת החדר, גם התכה וגם אידוי של מים מתרחשים באופן ספונטני מאחר והנטייה לאקראיות (בהקשר של אנטרופיה) עולה הנטייה האנרגטית של מולקולות המים ליצר קשרי מימן. במילים פשוטות, אידוי והתכה מונעים אנרגטית על ידי עלייה באנטרופיה.
מה הכוח התרמודינאמי להמסת המלח?
עלייה באנטרופיה
מה ההבדל בין לשים משהו הידרופובי בתוך מים לבין לשים משהו שהוא הידרופילי בתוך מים?
משהו הידרופובי- עלייה קטנה באנטלפיה אך אין עלייה באנטרופיה, ההפך האנטרופיה יורדת
משהו הידרופילי- עלייה קטנה באנטרופיה אך עלייה גם באנטרופיה
מי זו הביומולוקלה הנפוצה ביותר שיש?
סוכרים
glycoconjugate
רב סוכרים שמחוברים לליפידים וחלבונים
mutarotation
זהו מצב בו לזמן קצרצר נפתח המבנה הטבעתי ונסגר מחדש תוך מעבר מאוריינטציה אלפא לבטא או להיפך. כך למשל תמיסות המכילות רק בטא או רק אלפא אנומרים של גלוקוז, יגיעו לשיווי משקל כימי לאחר זמן מסוים ליצירת תערובת המכילה שליש מצב אלפא ושני שליש במצב בטא (כן, גם התמיסה שהתחילה במצב אלפא תסיים בשיווי משקל כאשר שני שליש במצב בטא). בנוסף לשני המצבים הדומיננטיים ניתן יהיה למצוא בתמיסה רמה זניחה במיוחד של שרשראות לינארית ואף גלוקו-פורנאזוים, קרי גלוקוז הנסגר לטבעת מחומשת.
מה הם התכונות הקולגטיביות של המים?
- לחץ אידוי
- נקודת רתיחה
- נקודת התכה (=נקודת קיפאון)
- לחץ אוסמוטי
ממה נובעות התכונות הקולגטיביות של המים?
מה שמשותף לכל ארבעת התכונות הללו הוא שהן נובעות מכך שריכוז המים בתמיסה הינו ירוד בהשוואה למים טהורים. התכונות הללו כלל לא קשורות לתכונות של המומסים עצמם, אלא רק לריכוז של המומסים, או יותר נכון – לכמות החלקיקים של המומסים בתוך כמות מסויימת של מים. כך למשל תרכובת של NaCl המתפרקת ל- 2 חלקיקים, נתרן וכלור, כלומר פי 2 חלקיקים יותר מאשר מולקולת גלוקוז, כך שהמסה של 1 מול של NaCl במים נותנת לחץ אוסמוטי שהוא כפול מזה של 1 מול גלוקוז. זו לא התכונה של החומר, אלא כמות החלקיקים במומס שנותנת את התכונות הקוליגטיביות.
מה הכוח המניע את האוסמוזה?
אנתרופיה
מה היא אוסמוזה?.
איך מסמנים אותה?
כאשר מים עוברים ממקום בו יש להם ריכוז גבוהה למקום בו יש להם ריכוז נמוך
באות π
מה משפיע על האוסמוזה מספר החלקיקים במים או המסה שלהם?
מספר החלקיקים במים
מה ימנע עלייה עצומה בלחץ האוסמוטי, סוכרים פשוטים או סוכרים מורכבים?
סוכרים מורכבים- עמילן וגליקולגן
איך צמחים ובני אדם משתמשים בלחץ האוסמוטי ?
צמחים- כוח טורגור (דופן התא מונע מהתא לנתנפח וכוח הטורגור רק עושה אותו יותר קשיח)
בני אדם - נלמד בפיסיולוגיה