biochemistry Flashcards
יסודות קורט
יסודות שזניחים ביחס למשקלם אך חיוניים לחיים כמו ברזל
אילו קשרים בין מולקולאריים ישנם ומה משפיע על כל אחד מהקשרים?
דיפול רגעים- קשרי לונדון, מה שמשפיע עליהם זה מסה ומספר אטומים במולוקולה דיפול-דיפול- קשרים בין אטומים פולאריים וקשרי מימן
למה מתחלקות הביו- מולקולות
מטאבוליטים ומאקרו מולקולות
מה ההבדל בין מטאבוליטים משניים לראשוניים?
מטאבוליטים שניוניים- ספציפים לאותו האורגניזם
מטאבוליטיםראשוניים - מטאבוליטים אוניברסאלים כמו גלוקוז
מהו מטאבולום?
מגוון של מטאבוליטים תחת תנאים בסיסיים כמו למשל שנותנים אינסולין לחולי סכרת
מה הן מאקרו מולקולות
מורכבים ממשקל מולקאלרי של 500 דלתון ומעלה, ומעלה, פולימרים
סופר מולקולה קומפלקס
כשפולימרים שונים יוצרים קומפלקס לדוגמא ריבוזום שמורכבמחלבונים וחומצות גרעים
cell’s proteome
מתאר את תפקוד החלבונים בתא
למי אין את היכולת ליצור את הסופר מולקולה קומפלקס
ל-dna
מהם התפקידים של ה glycome?
מאגר דלק עתיר אנ מבנה קשיח בדופן התא מרכיב זיהוי והכרה חוץ תאיים הנקשרים לחלבונים על תאים אחרים
מהם תפקידי ה lipiosome?
- מרכיב עיקרי בממברנות 2. משמש כפיגמנטים 3. משמש כויטמינים
מהי ביולוגיה מערכתית
גישה המנסה לעשות אינטגרציה של המידע הנאסף מה glycomic lipodrmic ganomic proteomic
Informatial macromulcolus
חלבונים וחומצות גרעין ולפעמים אוליגוסוריכים- מה שנותן מידע
איזומרים עם מבנה שונה לחלוטין הם…
איזומרים מבניים
איזומרים עם מבנה מרחבי שונה הם…
סטריאואיזומרים
סטריאואיזומים
מולקולות בעלות אותה נוסחה כימית ואותם קשרים כימיים בין היסודות המרכיבים את המולקולה עם הבדל בקונפיגורציה
מהי האינטראקציה בין ביו מולקולות
סטריוספציפיות
מה היא סטריאוספציפיות
אינטראקציה שדורשת שמולוקולה תהיה בעלת מבנה מאוד ספציפי על מנת לקיים את ההתאמה המרחבית בין שתי המולקולות
אילו שלושה דרכים ישנם כדי להציג מולוקולות?
- קווים ויתדות 2. ball and stick 3. spacr filling
מודל קווים ויתדות
מודל שמציג מולקולה קו ישר- מציג קשר קוולנטי שאין בו הבדלים בקונ קו מלא- קשר קוולנטי שיוצר זווי ממישור הנייר קו מקווה מייצג קשר קוולנטי אל תוך הניר
ball and stick
מודל שמאפשר לצפות בזוויות הקשרים ואורך הקשרים
spacr filling
מודל שבו כל אטום מוצג ככדור בעל קוטר שונה המתאם פרוציואנלית לרדיס ו.ד.ו חיוני מאוד כאשר עושים אנליזה בין מולקולות ביולוגיות
מה משפיע על הקונפיגקציה ?
קשר כפול ומרכזים קיראליים
מדוע קשר כפול משפיע על הקונפיגרציה?
כי מסביב לקשר כפול לא יכולה להתקיים רוטציה והאטמים תקועים
מדוע מרכז קיראלי משפיע על הקונפיגרציה?
כי הם מרכזים סביבים קבוצות כימיות הקשורות בקשר יחיד, והם מצויים באוריינטציה מסוימת
האם ניתן לעבור מקונפיגורציה אחת לאחרת בסטריאואיזומרים
כן כי שבירת קשרים בלבד
אילו שני איזומרים מרחביים קיימים?
- איזומרים גיאומטריים 2. איזומרים בעלי מרכז קיראלי
מה הם איזומרים גיאומטרים ודוגמאות?
איזומרים של ציס וטרנס ציס- באותו בצד טרנס- בצדדים שונים
מה הם איזומרים בעלי מרכז קיראלי
פחמן היוצר קונפיגורציה של טטרהדר שקשור ל-4 קבוצות כימיות שונות ועי הזזה של כל אחת מהן ניתן לקבל מולקולות שונות . לכל מולקולה יש שני מצבים שנקראים אננטיומרים. אם יש לי שני מרכזים קיראלים נקבל 4 סטריאואיזמורים כל פעם זה עולה בחזקה 2
אילו קונפיגרציות קיימות לפחמנים בעלי פחמן קיראלי?
d and l r and s
איזה קונפגרציה יש לגלוקוז ולמה?
D כי המימן נמצא בצד בשמאלי של הפחמן הקיראלי
איזה קונפיגורציה יש לח.א
L
מה זה אומר קונפורמציה?
כאשר אטומים נעים במרחב בלי שיישבר הקשר הקוולנטי ביניהם
אילו קונפורמציות ישנן? ואילו מביניהן היציבה ביותר?
staggared and eclipse staggared-יציבה
מה הוא קבוע שווי המשקל
כל ריאקציה מגיעה לאיזשהו ש.מ עבור ריאקציה מסוימת וטמפרטורה מסוימת
מהו Q מה קןרה עם Q גדול מקבוע שווי המשקל? קאן ממנו?
קיו- יחס התוצרים למגיבים כאשר קיו קטן- התגובה תלך קדימיה כאשר קיו גדול- התגובה תלך אחורה
כלל לה-שטליה
התגובה תמיד תרצה לחזור לשיווי משקל כימי
אננטיומרים
סטריאואיזומרים שהם תמונת ראי של אחת ושניה
דיאסטריאואיזומרים
כאשר הסטיראואיזומרים אינם תמונת ראי של אחת ושנייה
redox
טבלה של פוטציאל חמצון חיזור,
redox
כמה חומר מחמצן טוב יותר כך ה redox שלו גבוה יותר redox = פוטנציאל החמצון
מה גורם למים להיות נוזליים בטמפ החדר? ובצורת crystalline?
קשרי מימן
מה הגיאומטריה של המים? ומה היא הזווית בין המימן לחמצן?
sp3 104.5
מה הם היסודות הנפוצים ביותר לפי הסדר
H C O N
אילו שני סוגים של קשרים קוולנטים ישנם?
- פולארי 2. לא פולארי
כשיש קשר משולש איזה סוגי קשרי ישנם
ישנם שני קשרי פאי שנמצאים מעל המישור וקשר סיגמא שנמצא במישור
מה זה אומר דיפול שלילי
שרוב הזמן האלקטרונים יהיו אצל האטום בעל האלקטרושליליות הגבוהה יותר
- מה קורה כאשר ישנם שתי מולקולות בעלות אטומים לא פולארים? מה קורה כאשר ישנם שתי מולוקולות בעלי אטומים פולארים ?
יווצר בין שתי מולקולות בעלות אטומים לא פולארים קשרי לונדון יווצר בין שתי מולקולות בעלות אטומים פולארים או קשרי דיפול - דיפול או קשרי מימן
מה הם התנאים לקשרי מימן?
- האם יש אטומי nof בשתי המולוקלות ? 2. האם לפחות באחת המולקולות אטום ה nof קשור למימן ?
משיכה אלקטרוסטטית
כאשר מולקולה בעל דיפול קבוע מושכת אליה אטום אחר
מה יותר חזק קשר פאי או קשר סיגמא?
קשר סיגמא
מה היא הקבוצה הבאה
אנול
מה היא הקבוצה הבאה
אתר
מה היא הקבוצה הבאה
אתיל
מה היא הקבוצה הבאה
אימין
מה היא הקבוצה הבאה
אלדהיד
מה היא הקבוצה הבאה
אמינו
מה היא הקבוצה הבאה
אנהידריד
מה היא הקבוצה הבאה
אצטיל
מה היא הקבוצה הבאה?
בסיס שיף
מה היא הקבוצה הבאה?
גוואנידיניום
מה היא הקבוצה הבאה?
די סולפיד
מה היא הקבוצה הבאה?
הידרוקסיל
מה היא הקבוצה הבאה?
מתיל
מה היא הקבוצה הבאה?
סולפאידריל
מה היא הקבוצה הבאה?
פוספואנהידריד
מה היא הקבוצה הבאה
פוספוריל
מה היא הקבוצה הבאה?
פניל
מה היא הקבוצה הבאה?
קארבוקסיל
מה היא הקבוצה הבאה
קטון
מה היא הקבוצה הבאה?
תיואסתר
כמה קשרי מימן יכולה ליצור מולקולת מים?
עד ארבעה קשרי מימן
מה קורה כאשר מתיכים קרח או מאדים מים?
יש עלייה באנטלפיה ועלייה באנתרופיה מאחר והרשת המסודרת הופכת לאדי מים
flickering clusters
מושג האומר שבגלל שמולקולות המים מתקבצים לצברים זמניים, בעלי זמן חיים קצר המקושרים ביניהם עי קשרי מימן שנוצרים ומתפקים
למה בטמפרטורת החדר ההפיכה של המים לגז היא ספונטנית?
בגלל שיש נטייה טבעית לעלייה באנתרופיה
כמה קשרי מימן יש למולקולת מים בטמפרטורת החדר?
3.4
למה שווה אנרגית החום של התמיסה המימית (=אנרגיה קינטית של תנועת המולקולות)?
היא שווה לאנרגיה הנדרשת כדי לשבור את הקשרים
למה גזים לא מסיסים לא יכולים להתמוסס במים?
בגלל שיש עליה באנטרופיה
carbonic unhydrase
מזרז את התגובה בין מים לפדח ליצירת חומצה קרבונולית
למה חומרים לא פולארים לא יכולים להתמוסס במים?
מהו מבנה clathrate
מבנה שנוצר כאשר יש מולקולות לא פולאריות בתוך מים