biology of the cell 4 COPY Flashcards
מה היא הולכת אותות?
הולכת אותות היא כל תהליך שבו התא ממיר סוג אחד של אות או דחף לסוג אחר של אות – למשל קישור של אינסולין מחוץ לתא מוביל לפירוק גלוקוז בתוך התא. תהליכים אלו מאופיינים בסדרה רציפה של תגובות תוך תאיות שבסופן, כאמור, שינויים בתפקוד התא. התהליכים הללו יכולים להיות מהירים מאוד או איטיים מאוד – החל ממילישניות ועד מספר ימים. כמו כן, הם יכולים להיות זמניים או קבועים.
quorum sensing
הרבה לפני שיצורים רב-תאיים שוטטו על פני כדור הארץ, אורגניזמים חד-תאיים פיתחו מנגנונים לתגובה לשינויים פיזיים וכימיים בסביבתם. העדויות מגיעות ממחקרים של אורגניזמים חד-תאיים של ימינו כמו חיידקים ושמרים. למרות שתאים אלה מנהלים בעיקר חיים עצמאיים, הם יכולים לתקשר ולהשפיע זה על התנהגותו של זה.
מה
quorom sensing
מאפשר?
הוא מאפשר לחיידקים לתאם את ההתנהגות שלהם כמו למשל תנועתיות, ייצור אנטיביוטיקה, יצירת נבגים וקוניוגציה מינית. באופן דומה, תאי שמרים מתקשרים זה עם זה לקראת ההזדווגות.
איך נקראים השמרים המניצים?
וכיצד הם מזדווגים?
השמרים המניצים
Saccharomyces cerevisiae
מספקים דוגמה שנחקרה היטב: כאשר אינדיבידואל הפלואידי מוכל להזדווג, הוא מפריש
peptide mating factor
שמאותת לתאים מהזוויג השני להפסיק לעבור פרוליפרציה ולהתכונן להזדווגות. ההתמזגות של שני הפלואידים משני זוויגים שונים יוצרת זיגוטה דיפלואידית
תקשורת בין תאית התפתחתה במהלך הזמן
נכון/לא נכון
נכון
כיצד מתווכת התקשורת הבין תאית בין אורגנזימים שונים?
התקשורת הבין תאית באורגניזמים רב תאיים מתווכת בעיקר על ידי מולקולות סיגנאל חוץ תאיות. חלק מהמולקולות הללו פועלות למרחקים ארוכים, ומאותתות לתאים רחוקים בעוד שחלקן פועלות למרחקים קצרים ומאותתות רק לשכנים קרובים.
במי תלוי קבלת האותות ביצורים רב תאיים?
בחלבוני הרצפטור
כיצד נקראים היעדים בסוף מסלולי האיתות?
היעדים הללו נקראים אפקטורים
אילו מספר שלבים יש בהעברת האותות?
- הגעת מולקולת סיגנאל שהיא שליח ראשוני אל הרצפטור וקישורה.
- אקטוב הרצפטור והעברת הסיגנאל אל תוך התא.
- הפעלה של קסקאדה תוך תאית אחת או יותר הכוללת סדרה של חלבוני סיגנאל, עם או בלי שליחים שניוניים
- שינוי פעילות של חלבון אפקטור:
- תגובה מהירה – זרחון או דה זרחון/ביטול פעולה של אנזים או הפעלה של אנזים.
- תגובה איטית/גרעינית כמו נדידת פקטורי שעתוק לגרעין.
כמה גנים מהגנום האנושי מכילים רצפטורים?
1500 גנים המקודדים לרצפטורים, ולא די בכך, מספר הרצפטורים מוגדל עוד יותר על ידי שחבור חליפי של
RNA
ושינויים לאחר התרגום
למה תאים זקוקים לסיגנאלים?
שרידות.
גדילה וחלוקה
התמיינות וייעוד תאי.
אפופטוזיס.
תנועה תאית.
עיכוב התנהגויות תאיות מסויימות.
באילו ארבעה דרכים תאין יכולים לתקשר זה עם זה?
- איתות תלוי מגע
- איתות פאראקריני
- איתות סינאפטי
- איתות אנדוקריני
מה הוא איתות תלוי מגע?
מה הוא שמו השני?
מתי הוא חשוב?
על התאים להיות במגע ישיר אחד עם השני . מכונה גם איתות ג’וקסטאקריני. איתות תלוי מגע זה חשוב במיוחד במהלך ההתפתחות ובתגובות חיסוניות. איתות תלוי מגע במהלך ההתפתחות יכול לפעמים לפעול על פני מרחקים גדולים יחסית אם התאים המתקשרים משתרעים על פני מערכים ארוכים ודקים כדי ליצור קשר זה עם זה.
מה הוא איתות פאראקריני?
על מה הוא פועל?
איזה עוש סוג של איתות נכלל באיתות פאראקריני?
מה תאים סרטניים עושים?
תלוי במתווכים מקומיים שמשתחררים לחלל החוץ תאי ופועלים על תאים סמוכים. ברוב המקרים תאים שמסגנלים מפרישים מולקולות סיגנאל לנוזל החוץ תאי. לעתים קרובות, המולקולות המופרשות הן בבחינת מתווכים מקומיים, הפועלים רק על תאים בסביבה המקומית – איתות פראקריני. בדרך כלל באיתות פראקריני התא המסגנל ותא המטרה משתייכים לשני סוגים שונים של תאים, אך תאים עשויים לייצר סיגנאלים שהם עצמם מגיבים להם. כלומר, שימו לב שאיתות יכול להיות לתאים שכנים או איתות ל”עצמי” – אוטוקריני. תאים סרטניים למשל מפיקים לעתים קרובות אותות חוץ תאיים המעוררים את ההישרדות וההתרבות שלהם.
מה הוא תהליך איתות סינאפטי?
איך התהליך הזה הותאם לאורגנזימים גדולים וכיצד הוא עובד?
מבוצע על ידי נוירונים המעבירים אותות באופן חשמלי לאורך האקסונים שלהם ומשחררים נוירוטרנסמיטרים בסינפסות, הנמצאות לרוב הרחק מגוף תא העצב. אורגניזמים רב-תאיים גדולים כמונו זקוקים למנגנוני איתות ארוכי טווח כדי לתאם את התנהגות התאים באזורים רחוקים ונידחים בגוף. לפיכך, הם פיתחו סוגי תאים המתמחים בתקשורת בין-תאית למרחקים גדולים. המתוחכמים שבהם הם תאי עצב אשר בדרך כלל מכילים כאמור אקסונים המאפשרים להם ליצור קשר עם תאי מטרה הרחק מגוף התא. התהליכים מסתיימים באתרים המיוחדים להעברת האות ומכונים סינפסות כימיות. כאשר נוירון מופעל על ידי גירויים מתאי עצב אחרים, הוא שולח דחפים חשמליים במהירות לאורך האקסון שלו. כאשר הדחף מגיע לסינפסה בסוף האקסון הוא מפעיל הפרשת אות כימי הפועל כנוירוטרנסמיטר. המבנה המאורגן בחוזקה של הסינפסה מבטיח כי העברת הנוירוטרנסמיטרים מתבצעת באופן ספציפי לקולטנים בתא היעד
מה הוא איתות אנדוקריני?
תלוי בתאים אנדוקריניים המפרישים הורמונים לזרם הדם. גם זו אסטרטגיה לשליחת חומרים למרחקים ארוכים – תאים אנדוקריניים משחררים את מולקולות הסיגנאל שלהם, ההורמונים, שכאמור עוברים בזרם הדם, מה שמאפשר להם להגיע לתאי היעד שלהם שיכולים להימצא במקומות שונים בגוף.
איך תאים בבעלי חיים מתקשרים?
תאים בבעלי חיים רב-תאיים מתקשרים באמצעות מאות סוגים של מולקולות סיגנאל תאיות. אלו כוללות חלבונים, פפטידים קטנים, חומצות אמינו, נוקלאוטידים, סטרואידים, רטינואידים, נגזרות של חומצות שומן ואפילו גזים מומסים כמו תחמוצת החנקן ופחמן חד חמצני.
איך מולקולות סיגנאל יוצאות החוצה מהתא?
- מרבית מולקולות הסיגנאל הללו משוחררות לחלל החוץ תאי על ידי אקסוציטוזה
- חלקן נפלטות על ידי דיפוזיה דרך הממברנה הפלסמטית
- אחרות מוצגות על פני השטח החיצוניים של התא, נשארות קשורות אליו, ומספקות איתות לתאים אחרים רק כאשר התאים יוצרים קשר.
האם בדרך כלל ה-
kd
של הרצפטור למולקולת הסיגנאל הוא קטן או גבוה?
קטן
איזה חלבונים הם בדרך כלל רצפטורים?
מה קורה כאשר הם קושרים מולקולה חוץ תאית?
רצפטורים הם חלבונים טראנסממברנאלים המצויים על פני תא המטרה. כאשר חלבונים אלה קושרים מולקולת סיגנאל חוץ תאית (ליגנד) הם מאוקטבים ומייצרים אותות תוך תאיים שונים המשנים את התנהגות התא. במקרים אחרים, חלבוני הרצפטורים נמצאים בתוך תא המטרה עצמו, ומולקולת הסיגנאל צריכה להיכנס לתא כדי לקשור את הרצפטור, מה שכמובן דורש שמולקולת הסיגנאל תהיה קטנה מספיק והידרופובית כדי לעבור דיפוזיה דרך הממברנה של תא המטרה.
כמה מולקולות סיגנאליות יש מסביב לתא?
כיצד תא מגיב אליהן?
תא טיפוסי באורגניזם רב-תאי חשוף למאות מולקולות אות שונות בסביבתו.
התא מגיב ל”סופת השלגים” של הסיגנאלים באופן סלקטיבי, והרבה פעמים מבטא רק את אותם רצפטורים ואת מערכות האיתות התוך-תאית המגיבות לאותות הנדרשים לוויסות התא
מה יקרה אם תא לא יקבל אותות של שרידות ?
יעשה אפופטוזיס
מה נוירוטרנסמיטור אצטיל כולין עושה?
עיתים קרובות למולקולות סיגנאל מסויימות יש מספר השפעות שונות על סוגי תאים שונים, למשל הנוירוטרנסמיטר אצטילכולין :
מוריד את קצב ירי פוטנציאלי הפעולה בתאי הקוצב של הלב. נקשר ל –
GPCR.
מזרז את ההפרשה של רוק בתאי בלוטות רוק. גם כן נקשר ל – GPCR
גורם לכיווץ בתאי שריר מחוספס. נקשר לרצפטור שונה
אילו רצפטורים ישנם?
יש רצפטורים שהם תעלות תלויות ליגנד כמו הרצפטור הניקוטיני של אצטיל כולין המצוי בצומת עצב שריר.
ישנם רצפטורים שמצומדים לפעילות אנזימטית שיכולה לזרחן.
ישנם רצפטורים המצומדים לחלבוני
GPCR
ומפעילים תהליכים דרכם.
רצפטורי אדהזיה הגורמים לתא להתחבר לסביבתו ומאפשרים לתא להרגיש האם הוא קשור למדיום בסביבתו או לא.
רצפטורים סטרואידים המצויים בציטוזול וממתינים שההורמון הסטרואידי יחצה בעצמו את הממברנה, יקשור אותם ויחד יכנסו לגרעין ויבטאו גנים מתאימים.
מה הם השליחים השניוניים ?
תפקידם ודוגמאות
השליחים השניוניים נוצרים בכמויות גדולות בתגובה להפעלת הרצפטור ופועלים כמגבירי האות – הם מתפזרים ממקור היווצרותם ומפיצים את האות לחלקים אחרים של התא.
חלקם, כגון :cAMP , cGMP, Ca2 +
הם מסיסים במים ומפוזרים בציטוזול, בעוד אחרים, כגון
diacylglycerol
הם מסיסים בשומן, והם מפוזרים במישור הממברנה הפלסמטית. בשני המקרים, הם מעבירים את האות על ידי קישור ושינוי התנהגותם של חלבוני סיגנאל או אפקטור. שליח שניוני נוסף שיש להכיר –
ip3
מה קורה כאשר רודופסין נקשרת לרצפטור?
אילו שליחים שניוניים יש לחלבונים מצומדי
G?
cAMP
מדוע משווים את חלבונים במעבר האותות למתגים מולקולאריים?
כאשר הם מקבלים אות, הם עוברים ממצב לא פעיל למצב פעיל, עד לתהליך אחר ש”מנתק” אותם ומחזיר אותם למצב לא פעיל
מה היא המחלקה הגדולה ביותר של המתגים המולקולריים?
במה הם תלויים?
הפעלה והשתקה עי זרחון
בכמות הקינאזות והפוספאטזות
כמה אחוז מהחלבונים האנושיים מכילים פוספאט?
30-50 אחוז
כמה קינאזות וכמה פוספאטזות מקודד הגנום האנושי?
כ-520 קינאזות ו-320 פוספאטזות
לאיזה אזור בחלסון הקינאזות מחברות את הפוספאט שלהן?
ואילו שני סוגים של פרוטאין קינאזות ישנן?
הקינאזות מחברות את הפוספט לקבוצות הידרוקסיל של חומצות אמינו ספציפיות על חלבון המטרה.
ישנם שני סוגים של פרוטאין קינאזות, רובם סרין/תראונין קינאזות (המזרחנים על סרין ותריאונין) ואחרים הם טירוזין קינאזות (המזרחנים על טירוזין). שני הסוגים הם קרובי משפחה במשפחה גדולה ונבדלים זה מזה בעיקר באתרי הקישור לסובסטראט החלבוני שלהם.
איך חלבונים שהם קינאזות לרוב מבוקרים?
עי זרחון
מה היא מחלקת
gtp-binding protein?
המחלקה החשובה הנוספת של מתגים מולקולריים היא מחלקה של
GTP-binding proteins .
חלבונים אלו עוברים בין מצב פעיל בו קשורה מולקולת
GTP
למצב לא פעיל בו קשורה מולקולת
GDP
בדרך כלל יש להם פעילות
GTPase
אינטרינזית והם מכבים את עצמם באמצעות הידרוליזה של ה-
GTP
הקשור אליהם ל-
GDP.
לאילו 2 קבוצות מתחלקים חלבוני
g?
שתי קבוצות של חלבונים קושרי
GTP:
חלבונים קושרי
GTP
טרימרים מכונים גם חלבוני
G
וחלבונים קושרי
GTP
מונומרים קטנים מכונים גם
Small monomeric GTPases.
הקבוצה הראשונה מסייעת בהעברת אותות מרצפטורים המצומדים לחלבון
G
והשניה מסייעת בהעברת אותות מסוגים רבים של רצפטורים על פני התא.
אילו חלבונים רגולוטוריים שולטים בחלבונים
gtp?
חלבונים רגולטוריים ספציפיים שולטים בשתי הקבוצות הללו – חלבוני
GAP
מביאים את החלבונים למצב “כבוי” על ידי הגברת קצב ההידרוליזה של ה-
GTP
הקשור. לעומת זאת, חלבוני
GEF
מאקטבים את החלבונים הקושרים
GTP
על ידי קידום תהליך השחרור של
GDP
הקשור, שמפנה את מקומו וכך נקשר
GTP
חדש. במקרה של חלבוני
G
טרימריים, הרצפטור המופעל משמש כ-
GEF
.
אילו עוד מתגים מולקולאריים יכולים להיות מלבד זרחון
ו-
gtp binding protein?
קשירת חלבון אחר, קשירת שליח שניוני כמו סידן או
cAMP
מודיפיקציה קוולנטית שהיא לא זרחון כמו יוביקוויטינציה
מה יש ברוב מסולול האותות ומדוע זה חשוב?
הרבה פעמים אנחנו מציגים את תהליך העברת האותות כסדרה של צעדים מאקטבים, אולם ברוב מסלולי האיתות ישנם שלבים מעכבים שהם לא פחות חשובים.
כך למשל רצף של שני צעדים מעכבים יכול להשפיע באותה המידה כמו שלב מאקטב אחד במערכת הפשוטה המוצגת ב- איי אפשר לראות רגולטור שעתוק שמוחזק במצב לא פעיל באמצעות קישור לחלבון אינהיביטורי. בתגובה לאות כלשהי במעלה הזרם מופועל קינאז שמזרחן את המעכב, גורם לניתוקו מרגולטור השעתוק וכך מתאפשר ביטוי גנים. בבי אנחנו רואים איך אפשר לתאר את המסלול הזה כרצף של ארבעה שלבים ששניים מהם הם אינהיביטורים.
אילו רעשי רקע יש לתאים במהלך הולכת האותות?
בגלל שמולוקולות סיגנאל תוך תאיות נמצאות כולם ביחד בתא
כיצד האות נשאר חזק, מדוייק וספציפי בכל זאת בתנאים הרעשניים שבו הוא נמצא?
דוגמה לכל מנגנון
ספציפיות גבוהה – קו ההגנה הראשון נובע מהזיקה הגבוהה והספציפיות של האינטראקציות בין מולקולות הסיגנאל לבין הפרטנרים שלהן לעומת הזיקה הנמוכה יחסית בין פרטנרים לא מתאימים. קשירת מולקולת סיגנאל למטרה הנכונה נקבעת על ידי אינטראקציות מדויקות ומורכבות בין משטחים משלימים על שתי המולקולות. כך למשל קינאזות מזהות רצף חומצות אמינו ספציפי סביב אתר הזרחון שלהן ולעיתים קרובות מכילים אתרי עגינה נוספים המקדמים אינטראקציה ספציפית בעלת זיקה גבוהה עם חלבון המטרה. מנגנונים אלה ואחרים עוזרים לספק אינטראקציה חזקה ומתמשכת בין בני הזוג הנכונים, ומפחיתים את הסבירות לאינטראקציות לא נכונות עם חלבונים אחרים.
תגובה תלויית ריכוז – דרך חשובה נוספת בה תאים נמנעים מתגובות לאותות רקע לא רצויים תלויה ביכולתם של חלבוני יעד רבים במורד הזרם להתעלם פשוט מאותות כאלה. חלבונים אלה מגיבים רק כאשר האות במעלה הזרם מגיע לרמת ריכוז או פעילות גבוהה. נניח למשל מסלול בו קינאז מפעיל חלבון מטרה מסויים. אם התגובה מופעלת רק כאשר יותר ממחצית מחלבוני המטרה מזורחנים, הרי שאם מדיי פעם מספר מועט של החלבונים הללו יזורחנו על ידי קינאז תועה לא ייגרם נזק משמעותי. מעבר לכך, פוספטאזות רבות פועלות באופן קונסטיטוטיבי, ובכך מפחיתות את ההשפעה של זרחונים לא נכונים. בדרכים אלו ואחרות מערכות הסיגנאל התאיות מסננות רעשים ומייצרות תגובה מועטה או חוסר תגובה בכלל ברמות נמוכות של גירוי.
כיצד מתגברים על תקלות באיתות?
רוב מערכות האיתות בנויות ליצירת תגובות חזקות ומדויקות להפליא גם כאשר האותות במעלה הזרם משתנים או אפילו כאשר רכיבים מסוימים במערכת מושבתים. במקרים רבים, החוזק הזה של מערכות האיתות התאיות תלוי בנוכחות מנגנוני גיבוי: לדוגמה, סיגנאל עשוי להפעיל שני מסלולים מקבילים להפעלת חלבון יעד משותף אחד במורד הזרם, המאפשר לתגובה להתרחש גם אם נתיב אחד מושבת או לא פועל היטב.
אילו דוגמאות יש לכך שמולקולות סיגנאל תוך תאיות לאזורים ספציפיים על מהת שיוכלו להגיב בצורה נכונה?
-scaffold proteins
חלבוני פיגום
- הרכבה של קומפלקס איתות על רצפטור מאוקטב
- הרכבה של קומפלקס איתות על אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים
דומיינים של אינטראקציה
לרכז את החלבונים יחד
כיצד חלבוני פיגום עוזרים למולקולות הסיגנאל להגיב ללא תקלות?
מביאים מספר חלבוני סיגנל לקומפלקסים מוגדרים, לרוב עוד לפני שהסיגנל התקבל בתא. מאחר וחלבוני פיגומים אלו מחזיקים חלבונים בקרבה רבה, אותם חלבונים יכולים לקיים אינטרקציה בריכוזים מקומיים גבוהים ולהיות מופעלים במהירות, יעילות וסלקטיביות בתגובה לסיגנל החוץ תאי המתאים ובכך להימנע מאינטרקציות בלתי רצויות עם מסלולי סיגנאל אחרים
כיצד הרכב של קומפלקס מאוקטב עוזר למולקולות הסיגנאל להגיב ללא טעויות?
במקרים אחרים, מתחמי איתות כאלה נוצרים באופן חולף רק בתגובה לאות חוץ תאי ומתפרקים במהירות כאשר האות נעלם. כלומר הם מתכנסים סביב הרצפטור לאחר שמולקולה חוץ תאית הפעילה אותו. ברבים מהמקרים הללו, הזנב הציטופלזמטי של רצפטור מופעל מזורחן במהלך תהליך ההפעלה וחומצות האמינו המזורחנות מהוות אתר עגינה לגיוס של חלבוני סיגנאל תוך תאיים. כך למעשה ישנה הרכבה של קומפלקס סיגנליזציה רק כאשר הרצפטור מאוקטב והוא מתפרק לאחר מכן עם היעלמות מולקולת הסיגנל.
איך הרכבה של קומפלקס איתות על אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים
עוזר למולקולות הסיגנאל ?
במקרים אחרים אקטיבציה של רצפטור מובילה לעלייה בזרחון של פוספוליפידים (פוספואינוזיטידים) ספציפיים המהווים אתרי עגינה לחלבוני סיגנל ספציפיים שיודעים לזהות אותם וכך נוצר קומפלקס סיגנליזציה על פוספואינוזיטידים המשמשים אתר עגינה.
מה הם דומייני אינטראקציה?
, קרבה מושרית בה סיגנאל מפעיל הרכבה של קומפלקס איתות משמשת להעברת אותות מחלבון אחד לאחר במסלול. הרכבת מתחמי איתות כאלה תלויה בדומייני אינטראקציה
מוטיב המוכר בחלבון האינטראקציה יכול להיות פפטיד קצר, שינוי קוולנטי (חומצה אמינית מזורחנת למשל) או דומיין חלבוני אחר
למה זה יעיל דומייני אינטראקציה?
כאשר דומיין אינטראקציה מוסף לחלבון הוא יכול לחבר את החלבון הזה למסלולי איתות נוספים.
אילו חלבוני סיגנאל ישנם?
SH2) Src homology 2) –
נקשר לטירוזין מזורחן ברצפי חלבונים ספציפיים על רצפטורים מופעלים/חלבוני סיגנל תוך תאיים.
PTB) phosphotyrosine-binding) –
נקשר לטירוזין מזורחן ברצפי חלבונים ספציפיים על רצפטורים מופעלים/חלבוני סיגנל תוך תאיים.
SH3) Src homology 3) –
נקשר לרצפי חומצות אמינו קצרים עשירים בפרולין.
PH) pleckstrin homology) –
נקשר לקבוצות טעונות על גבי פוספואינוזיטידים ספציפיים המיוצרים בממברנה הפלסמטית בתגובה לאותות חוץ תאיים. הם מאפשרים לחלבון שהם חלק ממנו לעגון על הממברנה ולקיים אינטראקציה עם חלבוני סיגנאל אחרים שגויסו באופן דומה.
לתאר את
interaction domain
של הרצפטור לאינסולין?
הרצפטור לאינסולין הוא רצפטור מצומד אנזים מסוג טירוזין קינאז. הרצפטור המופעל מזרחן את עצמו על טירוזינים ואחת מהפוספוטירוזינים מגייסת חלבון עגינה המכונה
IRS1
דרך דומיין
PTB
של
IRS1.
ל-IRS1
יש גם דומיין
PH,
והוא נקשר לפוספואינוזיטידים ספציפיים על גבי הממברנה מצידה הפנימי. לאחר מכן, הרצפטור המאוקטב מזרחן את
IRS1
על שיירי הטירוזין שלה, ואחת מהפוספוטירוזינים קושרת את Grb2.
Grb2
משתמש באחד מדומייני ה-
SH3
שלו כדי להיקשר לאזור עשיר בפרולין של החלבון
SOs
שמעביר את האות במורד הזרם בזכות תפקודו כ-
GEF.
SOs
נקשר גם לפוספואינוזיטידים דרך דומיין ה-
PH
שלו.
Grb2
משתמש בדומיין ה-
SH3
האחר שלו בכדי לקשור רצף עשיר בפרולין בחלבון פיגום. חלבון הפיגום קושר אליו חלבוני סיגנאל נוספים והטירוזינים המוזרחנים האחרים ב-
IRS1
מגייסים חלבוני סיגנאל נוספים בעלי דומייני
SH2
איפה ניתן למצוא ריכוז של חלבוני סיגנאל שמרוכזים יחדיו?
בסליה ראשונית
מה תפקידה של מערכת האיתות התוך תאית?
תפקידה של מערכת איתות תוך-תאית היא לאתר ולמדוד גירוי ספציפי במקום אחד של התא ואז לייצר תגובה מתוזמנת ומדודה כנדרש במקום אחר. המערכת מבצעת משימה זו על ידי שליחת מידע בצורת “אותות” מולקולריים מה”חיישן” אל היעד, לעיתים קרובות באמצעות סדרת מתווכים שאינם פשוט מעבירים את האות אלא מעבדים אותו בדרכים שונות.
איך הקשר בית אותו לתגובה משתנה בין תאים שונים?
איך תזמון תגובה יכול להשתנות מאות מסוג אחד לאות בסוג אחר?
משתנה באופן דרמטי במערכות איתות שונות בהתאם למהירות הנדרשת לתגובה. במקרים מסויימים כדוגמת איתות סינפטי התגובה יכולה להתרחש תוך אלפיות השניה. מקרים אחרים, כמו בבקרת גורל התאים על ידי מורפוגנים במהלך ההתפתחות, תגובה מלאה יכולה לקחת שעות או ימים.
איך הרגישות יכולה להשתנות מאות של תגובה אחת לאות של תגובה אחרת?
רגישות – הרגישות לאותות חוץ תאיים יכולה להשתנות מאוד. הורמונים נוטים לפעול בריכוזים נמוכים מאוד על תאי היעד הרחוקים שלהם, אשר רגישים מאוד לריכוזי סיגנאל נמוכים. לעומת זאת, נוירוטרנסמיטורים פועלים בריכוזים גבוהים בהרבה בסינפסה ומפחיתים את הצורך ברגישות גבוהה ברצפטורים הפוסט-סינפטיים. לעתים קרובות נשלטת הרגישות על ידי שינויים במספר הרצפטורים או הזיקה שלהם בתא המטרה. מנגנון חשוב במיוחד להגברת הרגישות של מערכת איתות הוא הגברת האותות, לפיו מספר קטן של רצפטורים על פני שטח התא מעורר תגובה תוך-תאית גדולה בין אם על ידי הפקת כמויות גדולות של שליח שניוני או על ידי הפעלת עותקים רבים של חלבון סיגנאל במורד הזרם.
איך טווח דינאמי של מערכת אותות יכול להשתנות במסלולי תגובה שונים?
קשור לרגישות שלו. מערכות מסויימות כמו אלו המעורבות בהחלטות התפתחויות פשוטות מגיבות לאורך לטווח צר של ריכוזים חוץ תאיים. מערכות אחרות כמו אלה השולטות בראייה או בתגובה המטבולית להורמונים מסויימים מגיבות בטווח רחב יותר. נראה כי טווח דינאמי רחב מושג לעיתים קרובות על ידי מנגנוני הסתגלות המתאימים את תגובת המערכת בהתאם לכמות הסיגנאל.
כיצד משך התגובה יכול להשתנות בין מסלולים שונים?
יכול להשתנות מאוד. תגובה חולפת של פחות משניה מתאימה בתגובות סינפטיות למשל, אך תגובה ממושכת ואף קבועה נדרשת בהחלטות לגבי גורל התא במהלך ההתפתחות. ניתן להשתמש במספר מנגנונים כולל משוב חיובי כדי לשנות את משך התגובה והרוורסיביליות שלה.
איך עיבוד סיגנאל יכול להשתנות בין אותו לתגובה במסלולים שונים?
תגובה דיכוטומית (יש-אין) או תגובה תנודתית. עיבוד אותות יכול להמיר אות פשוט לתגובה מורכבת. במערכות רבות, למשל, עלייה הדרגתית של הסיגנאל החוץ תאי מומרת לתגובה פתאומית, מתגית. במקרים אחרים, אינפוט של סיגנאל פשוט מומר לתגובה תנודתית, המיוצרת על ידי סדרה חוזרת של אותות תוך-תאיים חולפים.
כיצד אינטגרציה בין מולקולות שונות משתנה בין מסלולי סיגנאל שונים?
אינטגרציה מאפשרת לשלוט בתגובה על ידי אינפוטים מרובים. כפי שהזכרנו קודם, שילובים ספציפיים של סיגנאלים חוץ תאיים נדרשים בדרך כלל כדי לעורר התנהגויות תאים מורכבות כמו הישרדות תאים ופרוליפרציה שלהם. על כן, התא צריך לשלב מידע המגיע מאותות מרובים, אשר תלוי לעתים ב”גלאים” חלבוניים המופעלים רק אם הם מקבלים מספר אותות המתכנסים אליהם.
איך תיאום בין תגובות שונה בין מסלולים איתות שונים?
ניתן להשיג תיאום של תגובות מרובות בתא אחד על ידי סיגנאל חוץ תאי אחד. למשל יש כמה מולקולות סיגנאל המעוררות תא הן לגדול והן להתחלק. תיאום זה תלוי בדרך כלל במנגנונים להפצת הסיגנאל למספר גורמים על ידי יצירת “ענפים” במסלול האיתות. במקרים מסוימים, הסתעפות מסלולי איתות יכולה לאפשר לאות אחד לשנות את חוזק התגובה לאותות אחרים.
coincidence detectors
כפי שהזכרנו קודם, לעיתים נחוצה אינטגרציה בין שני אותות או יותר כדי להוביל לפעולה מסויימת. כך למשל, כפי שמודגם באיור, גם
A
וגם
B
יודעים לזרחן את
Y –
כל אחד באתר מסויים וכתלות במסלול הולכת אותות מסויים. אולם
Y
מופעל רק כאשר שני האתרים בו מזורחנים. לכן למעשה הוא הופך להיות פעיל רק כאשר שני מסלולי הולכת האותות, זה של A
וזה של
B
נמצאים בו זמנית.
במה תלוי מהירות הסיגנאל של התגובה לתא?
המהירות של כל תגובת איתות תלויה באופי מולקולות הסיגנאל התוך תאיות שמבצעות את התגובה בתא המטרה. כאשר התגובה מחייבת רק חלבונים שכבר נמצאים בתא, היא יכולה להתרחש במהירות רבה: שינוי אלוסטרי בתעלת יון תלויית נוירוטרנסמיטר יכול לשנות את הפוטנציאל החשמלי של הממברנה הפלסמטית תוך אלפיות השניה ותגובות התלויות רק בזרחון חלבונים יכולות להתרחש תוך שניות. לעומת זאת, כאשר התגובה כוללת שינוי בביטוי גנים וסינתזת חלבונים חדשים היא אורכת דקות או שעות רבות ללא קשר למצב העברת האותות.
אילו תגובות נצפה שהן יהיו מהירות ואילו תגובות נצפה שהן יהיו איטיות?
סוגים מסויימים של תגובות תאיות המושרות על ידי סיגנאל יכולות להתרחש לאט או מהר. סוגים מסויימים של תגובות כמו גידול של תאים, כרוכים בשינויים בביטוי גנטי וסינתזה של חלבונים חדשים, לכן הם מתרחשים לאט. לעתים התהליכים הללו מתחילים שעה או יותר לאחר שהאות מתקבל. תגובות אחרות כגון שינויים בתנועת התאים, בהפרשה או בחילוף החומרים, אינן כרוכות בשעתוק גנים ולכן מתרחשות במהירות רבה יותר, לפעמים תוך שניות או דקות. הן עשויות לכלול זרחון מהיר של חלבונים אפקטוריים בציטופלסמה למשל. תגובות סינפטיות מתווכות על ידי שינויים בפוטנציאל הממברנה הן אפילו מהירות עוד יותר ויכולות להתרחש בפרק זמן של אלפיות השניה – כפי שנראה בפיזיולוגיה. אם כן, חלק ממערכות האיתות מייצרות תגובות מהירות ואיטיות ומאפשרות לתא להגיב במהירות לאות ובמקביל ליזום תגובה מתמשכת לטווח הארוך יותר.
מתי ההשפעה של סיגנאל חולפת?
- האות החוץ תאי נעלם
- סיגנאל מפעיל את השפעתו על ידי שינוי הריכוזים של מולקולות תוך תאיות קצרות חיים (מולקולות לא יציבות) העוברות תחלופה מתמדת.
כיצד שיעור התחלופה של מולקולות יכול לקבוע מהירות של תגובה?
שיעור התחלופה של מולקולות תוך תאיות יכול לקבוע את מידת התגובה שהתא ייצור כשיגיע אליו אות חוץ תאי, ותגובה מהירה יכולה להתרחש אם גם הפירוק מהיר
מה הגרף הא מייצג?
נם תהליכים שנעשים בפתאומיות והתגובה מתחלפת בין נמוכה לגבוהה ללא כל תגובת ביניים (קו ירוק), ישנם תהליכים שמגדילים בהדרגה את ריכוז מולקולת הסיגנל החוץ תאית שמגיעה לבסוף לרוויה, מה שיוצר עקומה היפרבולית (קו כחול), ישנם תהליכים שבהם מעכת הסיגנאלים יוצרת עקומה סיגמואידיאלית (קו אדום) משום שהיא מפחיתה את התגובה בריכוזים נמוכים של סיגנאל וכך יוצרת תגובה תלולה יותר באיזשהו ריכוז ביניים.
מה הגרף הבא מייצג?
עקומת שפעול עבור חלבון אלוסטרי כפונקציה של ריכוז המולקולות המפעילות (תמונה ימנית): העקומות בתרשים הימני מראות כיצד החדות של תגובת ההפעלה גדלה עם עלייה במספר המולקולות המשפיעות האלסטריות, שחייבות להיות קשורות בו-זמנית כדי להפעיל את חלבון המטרה. העקומות המוצגות הן אלה הצפויות בתנאים מסוימים – כאשר ההפעלה דורשת חיבור סימולטני של 1, 2, 8, או 16 מולקולות.
האם לרוב החלבונים יש זמן חיים קצר או ארוך
קצר
למה שייכים מרבית הרצפטורים שעל התא?
רצפטורים מצומדים לתעלות יונים
רצפטורים מצומדי חלבוני G
רצפטורים מצומדי אנזים
מה הם רצפטורים שמצומדים לתעלות יונים?
מכונים גם או
transmitter-gated ion channels
או
ionotropic receptors
מעורבים באיתות סינפטי מהיר בין תא עצב לבין תאי יעד אקסיטביליים אחרים כמו תאי עצב ותאי שריר. איתות מסוג זה מתווך על ידי מספר מצומצם של נוירוטרנסמיטרים, הסוגרים או פותחים תעלה יונית באופן זמני. רוב הרצפטורים השייכים למחלקה הזו שייכים למשפחה גדולה של חלבונים הומולוגיים שהם
multipass transmembrane proteins
רצפטורים מצומדי חלבוני G
פועלים על ידי רגולציה בלתי ישירה של חלבון יעד אחר, קושר ממברנה שהוא בדרך כלל אנזים או תעלה יונית.
הפעולה מתבצעת באמצעות חלבון קושר
GTP
טרימרי המתווך את האינטרקציה בין הרצפטור המאוקטב לחלבון היעד. הפעלת חלבון המטרה יכולה לשנות את ריכוזן של מולקולות סיגנאל תוך תאיות קטנות (אם חלבון המטרה הוא אנזים) או לשנות את חדירות היונים
רצפטורים מצומדי אנזים
מתפקדים באנזימים או נקשרים ישירות לאנזימים שהם מפעילים. לרוב מדובר ב-
single-pass transmembrane proteins
שהם בעלי אתר קישור לליגנד בחלק החוץ תאי ואתר קטליטי או אתר קישור לאנזים תוך תאי. רצפטורים מצומדי אנזים הם מגוונים מאוד במבחינת המבנה שלהם לעומת שני הסוגים האחרים עליהם דיברנו. עם זאת, רובם הם פרוטאין קינאזות או קשורים לפרוטאין קינאזות המזרחנים קבוצות חלבונים ספציפיות בתא המטרה כאשר מופעלים. עוד נציין כי ליגנדים מפעילים את מרבית הרצפטורים הללו על ידי קידום דימריזציה שלהם, מה שמביא לאינטראקציה והפעלת הדומיינים הציטופלסמטיים.
על מה מולקולות סיגנאל יכולות להשפיע
- על תהליכים מטאוליים
- על תהליכים בתוך הגרעין
- על הציטוסקלטון
מה הם המשפחה הגדולה ביותר של הרצפטורים?
gpcr
אילו חושים תלויים ברצפטורים ממשפחת
gpcr?
ריח וראייה
מולקותלת סיגנאל אחת יכולה להפעיל
gpcr
אחד
לא נכון מולקולות סינגנאל אחת יכולה להפעיל מולקולות
gpcr
רבות
מה
gpcr
סופר פאמילי כוללות?
כוללת רודופסין, החלבון המופעל על ידי אור בעיניהם של חולייתנים וכן מספר גדול מאוד של קולטני ריח בחולייתנים. בני משפחה אחרים נמצאים באורגניזמים חד-תאיים: הרצפטורים בשמרים המזהים גורמי הזדווגות המופרשים הם דוגמה לכך. סביר להניח שה-
GPCR
המתווך איתות תא-תא באורגניזמים רב-תאיים התפתח מהרצפטורים התחושתיים באבותיהם האאוקריוטים החד-תאיים.
מה המבנה של ה-
gpcr?
למרות המגוון הכימי והתפקודי של מולקולות הסיגנאל שמפעילות אותם, כל רצפטורי ה-
GPCR
הם בעלי מבנה דומה: הם מורכבים משרשרת פוליפפטידית יחידה המתברגת על פני הממברנה הדו שכבתית
7
פעמיםכך שהקצה הקרבוקסילי בתוך התא, והאמיני מחוץ לתא. הם יוצרים מבנה גלילי, ולעיתים קרובות במרכזם אתר עמוק לקישור הליגנד. בנוסף לאוריינטציה האופיינית שלהם בממברנה הפלסמטית, כולם משתמשים בחלבוני
G
בכדי להעביר את האות אל פנים התא.
איזה גודל יהיה לרצפטור
g
כאשא הליגנד הוא קטן ומה יקרה כאשר הליגנד הוא גדול?
ל- GPCR
שקשורים ליגנדים קטנים כמו אדרנלין יש דומיינים חוץ תאיים קטנים והליגנדים בדרך כלל נקשרים עמוק, לאתר שנוצר על ידי חומצות אמינו מכמה מקטעים טראנסממברנאלים. לעומת זאת, ל-
GPCR
שקושרים ליגנדים חלבוניים יש דומיין חוץ תאי גדול
מה התפקיד של הרצפטור הבא?
קושר אדרנלין
איך
gpcr
פועל?
מה קשור אליו?
כיצד זה קשור אליו?
כאשר מולקולת סיגנאל חוץ תאית נקשרת ל-
GPCR
הרצפטור עובר שינוי קונפורמטיבי המאפשר לו להפעיל חלבון קושר
GTP
טרימרי
שמצמד את הרצפטור לאנזימים או לתעלות יוניות בממברנה. בחלק מהמקרים חלבון ה-
G
קשור פיזית לרצפטור עוד לפני הפעלת הרצפטור ובמקרים אחרים הוא נקשר רק לאחר שהרצפטור הופעל. ישנם סוגים שונים של חלבוני
G
שכל אחד מהם ספציפי לקבוצה מסויימת של
GPCR
ולקבוצה מסויימת של חלבוני מטרה בממברנה הפלסמטית.
חלבון ה-
G
עצמו מכיל שלוש תת יחידות: אלפא, בטא וגמא. אלפא וגמא מעוגנות לממברנה הפנימית דרך ליפיד ובטא קשורה לגמא. במצב ללא גירוי, תת היחידה אלפא קשורה ל-
GDP
וחלבון ה-
G אינו פעיל. כאשר ה-
GPCR
מופעל, הוא פועל כ-
GEF
ומשרה על תת יחידה אלפא את השחרור של ה-
GDP.
כך מתאפשר קישור של
GTP
חדש לתת היחידה אלפא. כשזה קורה, תת יחידה אלפא שקושרת את ה-
GTP
עוברת שינוי קונפורמטיבי שמאקטב אותה וכתוצאה מכך מנתקת את חלבון ה-
G
מהרצפטור וכן מפעילה ניתוק שלה מהצמד בטא-גמא (שיוצרים יחידה פונקציונאלית אחת). גם אלפא וגם בטא-גמא נקשרים לחלבוני מטרה שונים כמו אנזימים ותעלות יונים בממברנה הפלסמטית שמעבירים את הסיגנאל הלאה.
מה הזמן שדורש לאלפא להפוך מאלפא
gtp
לאלפא
gdp?
זמן יחסית קצר
עי מי תת יחידה אלפא ב-
g protein
יכולה לעבור הידרוליזה
חלבון המטרה או
RGS – regulator of G protein signaling
אלה ספציפיים לתת יחידה אלפא ומתפקדים כ-
GAP.
ישנם כ- 25
חלבוני
RGS
המקודדים בחלבון האנושי שכל אחד מהם מקיים אינטראקציה עם קבוצת חלבוני
G
מסויימת.
מה מכיל הדומיין של תת יחידה אלפא
- דומיין ה-
Ras
הקשור ל-
GTPases
אחרים ומספק צד אחד של הכיס קשור נוקליאוטיד,
- ואת ה-
alphahelical domain
או “AH” המהדק את הנוקלאוטיד במקום.
מה קורה בתמונה הבאה?
- קישור מולקולת סיגאנל חוץ תאית נקשרת ל-
GPCR
ומשנה את הקונפורמציה שלו.
- שינוי הקונפורמציה מאפשר לרצפטור לקשור חלבון
G
טרימרי ולשנות את הקונפורמציה של חלבון ה
-G
הטרימרי.
- דומיין ה-
HA
של תת היחידה אלפא בחלבון ה-
G
נעה החוצה לפתיחת האתר קושר הנוקלאוטיד וכך מתקדם הליך ההתנתקות של
GDP
ממנה.
- מתרחשת קשירת
GTP
שמקדמת את סגירת האתר קושר נוקלאוטיד וגורמת לשינוי קונפורמציה שמוביל לדיסוציאציה של תת היחידה אלפא מהרצפטור ומקומפלקס בטא-גמא.
- תת היחידה אלפא הקושרת
GTP
וקומפלקס בטא גמא מווסתים כל אחד את הפעילות של מולקולות סיגנאל במורד הזרם (לא מוצג באיור).
- הרצפטור נשאר פעיל בזמן שמולקולת הסיגנאל החוץ תאית קשורה אליו, ולכן היא יכולה לזרז את ההפעלה של מולקולות חלבון
G
רבות נוספות.
על איזה רצפטור מבוססות לפחות 50 אחוז מהתרופות שיוצאות?
רצפטורים מסוג
GPCR
מדוע
camp
חשוב?
כפי שהזכרנו קודם,
cAMP
משמש כשליח שניוני בכמה מסלולי איתות. אות חוץ תאי יכול להגדיל את ריכוז ה-
cAMP
יותר מפי 20 תוך שניות
מה קורה בתמונה הבאה?
הנוירון מגיב לנויורוטרנסמיטר סרוטונין הפועל באמצעות
GPCR
ומוביל לעליה ב-
cAMP.
על מנת לנטר את כמות ה-
cAMP
התא הוטען בחלבון פלאורסנטי שמשנה את הפלורסנציה כשהוא פוגש
ATP –
צבע כחול מציין רמת
cAMP
נמוכה, צהוב – רמה בינונית ואדום – רמה גבוהה. במנוחה, רמות ה-cAMP
האם
camp
יכול להוביל לשינוי ארוך טווח בתא?
כן
כיצד
camp
מסונטזת ?
AMP מסונתזת מ-ATP באמצעות האנזים
adenylyl cyclase
תוך יציאת פירופוספט.
שמפורק עי פירופוסאטז
מה הוא אדנילאט ציקלאז?
מה הוא?
כמה איזופואמים יש לו ביונקים?
adenylyl cyclase
הוא חלבון חוצה ממברנה מספר פעמים עם דומיין קטליטי בצד הציטוזולי של הממברנה הפלסמטית. יש לפחות 8 איזופורמים שלו ביונקים, ורובם מבוקרים הן על ידי חלבוני
G ו
הן על ידי יוני סידן.
עי מי מפורקת
camp?
cyclic AMP phosphodiesterases
מה יקרה ל-camp
כאשר היא תפגוש פוספודיאסתראז?
camp
תהפול
ל-5amp
איך אותות חוץ תאיים שקשרורים ל-
gpcr
פועלים
או עי הגדלת הכמות של
campמ
או עי הורדת הכמות
של
camp
לאיזה רעלן
gs
הוא מטרה
וכיצד הוא מנצל אותו?
לרעלן הכולירה
המיוצר על ידי החיידק הגורם לכולירה הוא אנזים אשר מזרז את העברת
ADP ribose
מ
NAD+
תוך תאי לתת יחידה אלפא של
Gs.
ריבוזילציה זו משנה את תת יחידה אלפא כך שהיא לא יכולה עוד לבצע הידרוליזה של ה-
GTP
הקשור שלה, וכך למעשה גורמת לו להישאר במצב פעיל, מה שגורר יצירת
cAMP
ללא הגבלת זמן. העליה הממושכת בריכוזי
cAMP
בתאי האפיתל של המעי גורמת לזרם גדול של יוני כלור ומים למעי ולכן מובילה לשלשול הקשה המאפיין כולירה.
לאיזה רעלן
gi
הוא מטרה?
רעלן השעלת
(Pertussis toxin),
המיוצר על ידי החיידק הגורם לשעלת, מזרז את הריבוזילציה של
ADP
על גבי תת יחידה אלפא של
Gi
ובכך מונע ממנו לתקשר עם הרצפטור. כתוצאה מכך חלבון ה-
G
נשאר במצב לא פעיל ואינו מסוגל לבקר את חלבוני המטרה של
איך התאים הבאים מתנהגים כאשר יש הרבה
camp?
בלוטת תירואיד
אדרנל
שחלות
עצם
לב
כבד
כליה
שומן
מהו מסלול ה-
gs
1.במסלול הקלאסי בו
Gs
משופעל, למשל על ידי ההורמון גלוקגון או אדרנלין, הוא נודד על גבי הממברנה (הוא כאמור חלבון מעוגן על ידי קישור של חומצת שומן) ומשפעל את האנזים האינטגרלי
adenylyl cyclase.
- כאשר זה משופעל על ידי האינטראקציה עם תת היחידה אלפא המשופעלת, הוא מזרז יצירה של
cAMP.
- cAMP
מצטבר בתא ויכול להוביל לתגובות תאיות תוך שניות כפי שראינו לפני שני שקפים. אולם תגובות אחרות המתווכות על ידי
cAMP
מתרחשות תוך שעות עד שהן מתפתחות באופן מלא כפי שנראה עכשיו.
- cAMP
משפעל את האנזים
PKA cyclic-AMPdependent protein kinase
הדבר נעשה על ידי קישור ליחידות הרגולטריות של האנזים : קישור
cAMP
ליחידות הרגולטוריות
מכונות Aקינאזות
גורם לשינוי קונפורמציה שלהן ולהתנתקותן מהקומפלקס. כעת, תת היחידות הפעילות של
PKA
חופשיות לפעול. יחס הקישור הוא
2
מולקולות
cAMP
לכל יחידה רגולטורית
סך הכל 4
- PKA
המשופעל יכול להמשיך ולזרחן חלבונים אחרים, על גבי חומצה אמינית סרין או תריאונין
איך
camp
משפיע בתאים שמפרישים סומטוסטטין?
בתאים המפרישים את ההורמון הפפטידי סומטוסטטין,
cAMP
מפעיל את הגן המקודד להורמון זה. האזור הרגולטורי בגן מכיל רצף
cis
רגולטורי קצר המכונה CRE
שנמצא בעוד גנים המופעלים באמצעות
cAMP
פקטור שעתוק בשם
CRE-binding (CREB) protein
מכיר את הרצף הזה. כאשר
PKA
מופעל הוא מזרחן את
CREB
על סרין יחידה.
CREB
המזורחן מגייס אקטיבטור שעתוק בשם
CBP
המגרה שעתוק גנים
כך
CREB
יכול להפוך סיגנאל
cAMP
קצר לשינוי ארוך טווח בתא, תהליך שבמוח נחשב לכזה הממלא תפקיד חשוב בכמה צורות של למידה וזיכרון
למה עוזרות תת היחידות הרגולטוריות של
מה קורה בשריר הלב
תת היחידות הרגולטוריות של
PKA
חשובות למיקום נכון של הקינאז הזה בתא.
AKAPs
מיוחדים נקשרים לשתי היחידות הרגולטוריות הללו מצד אחד ולרכיב של השלד התאי או הממברנה מהצד השני, ובכך קושרים את האנזים לאזור מיוחד.
חלק מאותם
AKAPs
קושרים גם חלבוני סיגנאל אחרים ויוצרים קומפלקס איתות. כך למשל
AKAP
הנמצא סביב גרעין שריר הלב קושר גם
PKA
וגם
phosphodiesterase
שמבצע הידרוליזה ל-
cAMP
בתאים שלא עברו גירוי,
ה-phosphodiesterase
שומר על ריכוז מקומי נמוך של
cAMP
כך שה-
PKA
לא פעיל. בתאים שעברו גירוי ריכוז ה-
cAMP
עולה במהירות, מתעלה על פעילותו של
phosphodiesterase
ומפעיל את
PKA.
בין חלבוני המטרה שמזרחן ומפעיל
PKA
מצוי ה- phosphodiesterase
הסמוך, שמוריד במהירות את ריכוז
ה-cAMP
שוב. המשוב השלילי הזה מונע את מה שיכול להיה להיות תגובת
PKA
ממושכת וגורם לכך שהתגובה של
PKA
תהיה קצרה, מקומית ובפולסים קצרים.
אילו שני סוגים של
Pka
יש ביונקים?
סוג 1 נמצא בעיקר בציטוזול, ואילו סוג 2 נקשר באמצעות תת היחידות הרגולטוריות שלו וחלבוני העיגון המיוחדים לממברנה הפלסמטית, לממברנת הגרעין, לממברנה החיצונית של המיטוכונדריה ולמיקרוטובולי. בשני הסוגים, ברגע שהיחידות הקטליטיות משוחררות ופעילות, הן יכולות לנדוד לתוך הגרעין (שם הם יכולים לזרחן חלבונים מבקרי שעתוק), ואילו תת היחידות הרגולטוריות נשארות בציטופלזמה.
עי מי
gpcr
יכול
להפעיל פוספוליפידים מהסוג של אינוזיטול.
רצפטורים שמפעילים מסלול איתות של פוספוליפידים מסוג אינוזיטול עושים זאת בעיקר באמצעות חלבון
G
הנקרא
Gq
שמפעיל את הפוספוליפאז
C-β
באותה צורה שבה
Gs
מפעיל אדניליל ציקלאז.
מה הוא המסלול של
g-q
לתאר את ההשתנות של
pkc
ועי מי הוא מופעל בכל אחד מהפעמים
שוב תת היחידה אלפא משוחלפת, שוב נודדת על הממברנה כיוון שקשורה לחומצת שומן, רק שהפעם היא תשפעל את האנזים פוספוליפאז בטא
plc beta
האנזים פוספוליפאז
beta
יודע לזהות מולקולת
4,5-bisphosphate [PI(4,5)P2]
(שנמצאת בכמויות קטנות בחלק הפנימי של הממברנה הפלסמטית)
ולפרק אותה ל-
DAG diacylglycerol
ול-
3IP
inositol 1,4,5-trisphosphate.
3IP
ההידרופילית נודדת לרשתית האנדופלסמטית שם היא פותחת תעלת סידן
(gated Ca2+-release channels
שגם נקראות
receptors),
ואילו
DAG
נשאר על הממברנה הפלסמטית שם יש לו מספר תפקידי איתות, כשאחד העיקריים הוא היותו משמש כנקודת עיגון ל
PKC (protein kinase C
קרוי כך כי הוא תלוי בסידן.
העלייה הראשונית ביוני הסידן בציטוזול הנגרמת בזכות פעולתו של
IP3
משנה את
PKC
כך שהוא משנה מיקום מהציטוזול לפנים הציטופלסמטיים של הממברנה הפלסמטית, שם הוא מופעל על ידי השילוב של יוני סידן,
DAG
ופוספטידילסרין.
PKC
מזרחן חלבונים רבים, רובם שונים מאלו של
PKA
ומשתנים בהתאם לסוג התא.
DAG יכול להמשיך ולעבור ביקוע ולשחרר חומצה ארכידנואית שהיא כלשצמה בעלת תפקידים רבים כיוון שיכולה לתת איקוזונואידים ופרוסטגלנדינים.
אילו קבוצות של פוספוליפאז c
ישנן?
אלה כוללות את מחלקת ה-
β
שמופעלת על ידי
GPCRs
וכפי שנראה בהמשך, מחלקת
ה-γ
מופעלת על ידי מחלקה של רצפטורים מצומדי אנזים הנקראים רצפטורי טירוזין קינא
מה ניתן לעשות לאחר שביקענו את
dag עי
gpcr
כפי שהזכרנו, ניתן לבקע את
DAG
ליצירת חומצה ארכידונית, שיכולה לשמש סיגנאל בפני עצמה או שניתן להשתמש בה בסינתזת מולקולות סיגנאל ליפידיות קטנות אחרות המכונות איקוזונואידים. מרבית החולייתנים מייצרים איקוזונואידים הכוללים גם פרוסטגלנדינים שהם בעלי פעילויות ביולוגיות רבות – הם משתתפים בתגובות כאב ובתגובות דלקתיות. תרופות אנטי דלקתיות רבות (כדוגמת אספירין, איבופרופן וקורטיזון) פועלות בחלקן על ידי עיכוב הסינתזה שלהם.
מדוע סידן היא מולקולת הפרשה יעילה?
זאת משום שריכוזו בציטוזול נמוך מאוד
(~10–7 M)
ואילו בנוזל החוץ תאי
(~103 M)
ובלומן ה-
ER
הוא גבוה
. כאשר סיגנל פותח באופן זמני תעלות סידן על ממברנת התא או את ממברנת ה-
ER
, ישנו מפל ריכוזים גדול הנוטה להעלות את רמת הסידן בציטוזול: סידן נכנס לציטוזול והעלייה המקומית, שהיא פי 10-20 בריכוז הסידן, מפעילה חלבונים תלויי סידן.
מה הוא מקור הסידן?
גירויים מסויימים כמו דפולריזציה של הממברנה, מתיחת הממברנה או אותות תוך תאיים מסויימים מפעילים תעלות סידן בממברנה הפלסמטית וכתוצאה מכך סידן נכנס מחוץ התא פנימה.
לעומת זאת, אותות אחרים, כולל אלו המתווכים באמצעות
GPCR
כמו זה שתואר קודם פועלים בעיקר באמצעות רצפטורי
IP3
על מנת לעורר שחרור סידן
מה-ER.
ממברנת ה-
ER
כוללת גם סוג שני של תעלות סידן הנקראות
ryanodine receptor
אשר נפתחות בתגובה לעליה ברמות יוני הסידן ובכך מסייעות להגביר את אות הסידן.
מה הוא התפקיד החשוב שיש לרצפטורי
ip3
ולרצפטורי הרייאונדין?
שניהם מעוררים על ידי ריכוז ציטופלסמה נמוך עד בינוני.
מה יש לתאים העושים שימוש נרחב באותות באמצעות סידן?
טרנספורטר נוסף של יוני סידן
(Na+-driven Ca2+ exchanger)
בממברנה הפלסמטית המצמד את שטף הסידן לשטף הנתרן.
מה קורה בתמונה הבאה?
הפריה של ביצית על ידי זרע מעורר גל של סידן בציטוזול: בתמונה השמאלית רואים גל של סידן ציטוזולי המופרש מה-
ER
בכיוון כניסת הזרע. גל הסידן גורם לגל שינויים על פני תא הביצית, מונע כניסת תאי זרע אחרים וגם יוזם התפתחות עוברית.
העלייה הראשונית בריכוז הסידן נגרמת כתוצאה מצורה של
PLC
ספציפי לתאי זרע –
PLCζ
שהזרע מביא לציטופלסמה של הביצית כאשר הוא מתמזג איתה.
הוא שובר
2PIP
ליצירת
3IP
שמוביל לשחרור סידן מה-
ER
של הביצית. השחרור של הסידן מגרה שחרור נוסף מה שמוביל להתפשטות הגל.
אילו אינדיקטורים פלורסנטיים יכולים לנתר את רמות הסידן?
aequorin ו- fura-2
עי מה מעוכבים
Ip3
וראיינאודין ולמה הם גורימים?
על ידי ריכוזי סידן גבוהים, כך שעלייה בסידן בתא מובילה לעיכוב שחרור סידן. מכיוון שמשאבות הסידן מסירות את עודפי הסידן הציטוזולי, ריכוז הסידן נופל, מה שמקל בסופו של דבר על המשוב השלילי הזה ומאפשרת לסידן הציטוזולי לעלות שוב.
התוצאה – תנודתיות בריכוז הסידן. התנודות הללו נמשכות כל עוד הרצפטורים פועלים. תדירות התנודות משקפת את חוזק הגירוי החוץ תאי.
מה התוצאה של התנודתיות בריכוז הסידן?
איך ניתן לשנות את התדירות של התגובה?
דוגמאות
על ידי מנגנוני איתות אחרים כמו זרחון המשפיעים על הרגישות לסידן של תעלות סידן או שמשפיעים על רכיבים אחרים במערכת. אם כן, ראינו שמדובר בתנודתיות בריכוז הסידן. אבל התגובה בסופו של דבר יכולה להיות תנודתיות ויכולה גם שלא. כך למשל בתאי בלוטת יותרת המוח המפרישים הורמונים, תנודתיות הסידן מובילה להתפרצויות של הפרשת הורמון (בכל תנודה יופרש הורמון). לעומת זאת בסוגים מסויימים של תאים תנודה מסויימת של סידן מובילה לתהליך של שעתוק גנים, ויותר מזה, תנודות חזקות יותר מובילות לתהליך של שעתוק גנים אחרים! כיצד זה קורה? ככל הנראה באמצעות חלבונים רגישים לסידן המשנים את פעילותם כפונקציה של תדירות הסידן המגיע אליהם.
מי הוא החלבון החשוב ביותר אליו נקשר הסידן?
איפה הוא נמצא?
ממה הוא מורכב?
כמה אתרים אצלו יכולים לקשור סידן?
סידן יכול להיקשר למספר חלבונים תוך תאיים קושרי סידן והחשוב בהם הוא קלמודולין, שנמצא בכל התאים האאוקריוטים ולעיתים אף מגיע ל-1% ממסת החלבון הכוללת של התא. מולקולת הקלמודולין מתפקדת כרצפטור סידן תוך תאי. היא מורכבת משרשרת פוליפפטיד יחידה ושמורה ביותר בעלת שני אתרים המסוגלים לקשור כל אחד שני יוני סידן
באיזה צורה קלמדולין קושר את הסידן?
בצורה קואפורטיבית כלומר בצורה סיגמואידלית
מה בדרך כלל עושה קומפלקס קלמדולין סידן?
זה מאפשר לו להיקשר לחלבוני מטרה שונים כדי לשנות את פעולותיהם
מה משפעת את המשאבה שדוחפת סידן לתוך ה-
er?
קלמדולין סידן
עי מי השפעות סידן מתווכות?
השפעות רבות של סידן הן עקיפות יותר ומתווכות על ידי זרחון חלבונים המתרחש על ידי משפחת קינאזות הנקראות
Ca2+/calmodulin-dependent kinases (CaM-kinases).
חלק מהם מזרחנים פקטורי שעתוק כמו למשל את
CREB
(\ובדרך זו מפעילים או מעכבים את השעתוק של גנים ספציפיים.
מי הם האנזים הנחקרים ב-
cam?
Cam-kinaseII
איפה
cam kinase 2
נמצא?
במערכת העצבים המרכזית, מרוכז מאוד בסינאפסות
מה המבנה של
cam2
12 עותקים של האנזים מורכבים לזוג טבעות דבוקות כאשר הדומיין שלו נמצא מבחוץ
מה המבנה המיוחד של
cam kinase
מאפשר?
ומה ככל הנראה התפקיד שלו במערכת העצסים?
המבנה המיוחד הזה מאפשר לו לפקד כ”מכשיר זיכרון מולקולרי” – כל תת יחידה עוברת למצב פעיל כאשר נחשפת לקלמודולין פעיל (עם סידן) ונותרת פעילה גם לאחר שהסיגנל של הסידן דעך. כיצד? כאשר קלמודולין מפעיל אותן, תתי היחידות מזורחנות – עוברות אוטופוספורילציה ואז הן נעשות פעילות. כאשר תת יחידה מסוימת מזורחנת היא נותרת פעילה גם בהיעדר סידן ובכך מאריכה את פעילות הקינאז מעבר לסיגנל הסידן ההתחלתי.
נראה שיש לאנזים זה תפקיד בסוגים מסוימים של זיכרון ולמידה במערכת העצבים של חולייתנים. לעכברים מוטנטים שחסרים צורה ספציפית למוח של האנזים הזה יש פגמים ספציפיים ביכולתם לזכור היכן הדברים נמצאים.
כיצד מופעל
cam kinase?
1.לכל חלבון
CaM-kinase II
יש שני דומיינים מרכזיים –
aminoterminal kinase domain
ו- carboxyl-terminal hub domain.
שניהם קשורים על ידי מקטע רגולטורי.
- שישה חלבוני
Cam-kinaseII
מורכבים ליצירת טבעת ענקית בה
ה- hub domains
הדוקים כדי ליצור מבנה מרכזי מורכב בדומייני קינאז.
- האנזים השלם מכיל 2 טבעות ה”דבוקות” זו לזו, וסה”כ 12 חלבוני קינאז, אך באיור מוצגת רק טבעת אחת לשם הפשטות.
- כאשר האנזים אינו פעיל, הטבעת נמצאת בשווי משקל דינאמי בין שני מצבים: הראשון (משמאל למעלה) הוא מצב קומפקטי בו דומייני הקינאז מקיימים אינטארקציה עם דומיין ה-
hub
כך שהמקטע הרגולטורי קבור באתר הקינאז – מה שחוסם את הפעילות הקטליטית של הקינאז. במצב הלא פעיל השני (למעלה, באמצע). דומיין הקינאז מציץ החוצה וקשור לדומיין ה -
hub
על ידי המקטע הרגולטורי שממשיך לכבות את הקינאז, אך כעת הוא נגיש לקלמודולין (עם סידן).
- אם האחרון נמצא בסביבה, הוא ייקשר למקטע הרגולטורי וימנע ממנו לעכב את הקינאז, מה שינעל את הקינאז במצב פעיל (למעלה, מימין).
- אם תת היחידה הסמוכה גם כן “תציץ” גם היא תופעל על ידי קלמודולין (עם סידן) ושני הקינאזות יזרחנו האחד את השני במקטע הרגולציה (למטה, מימין). האוטופוספורילציה הזו תפעיל עוד יותר את האנזים.
איך
הדרך בה ה-
cam kinase 2
נקשר לסידן מאריכה את זמן פעילות האינזים
הדבר מאריך את פעילות האנזים בשתי דרכים:
ראשית, קלמודולין (עם סידן) קשור כך שהוא לא יתנתק מהאנזים עד שרמות הסידן הציטוזוליות יחזרו לערכי הבסיס במשך 10 שניות לפחות שנית, הוא ממיר את האנזים לצורה בלתי תלויה בסידן – כך שהקינאז נשאר פעיל גם לאחר שהקלמודולין (עם סידן) מתנתק ממנו
. פעילות זו נמשכת עד שפעילות הפוספטאז גוברת על זו של האוטופוספורילציה של הקינאז.
איך נשלטת פעילות האינזים
cam 2 kinase?
פונקציה של תדירות הפולסים של סידן
מה יקרה ל-
cam 2
kinase
בריכוזים נמוכים של סידן?
בתדירויות נמוכות של סידן האנזים הופך לא פעיל אחרי כל פולס כיוון שהאוטופוספורילציה הנגרמת על ידי קשירת קלמודולין (עם סידן) אינה שומרת על פעילות האנזים מספיק זמן כדי שהוא יישאר פעיל עד שיגיע פולס הסידן הבא.
מה יקרה לאינזים
cam 2
Kinase
בפולסים רבים של סידן?
בתדירויות גבוהות יותר של פולסים האנזים נכשל בלעבור למצבו הלא פעיל כך שלמעשה פעילותו מתארכת עם כל פולס. אם התדירות תישאר מספיק גבוהה, האוטופוספורילציה תתרחש בכל תתי היחידות ולכן הוא יפעל בצורה מקסימלית.
עי איזה חלק באינזה
cam 2
kinase
נשלטת פעילותו?
עי מקטע רגולטור
האם חלבוני
G
פועלים אך ורק דרך בקרה על פעילותם של חלבונים ממבראנאלים
המשנים את רמות ה-
camp?
דוגמאות
חלבוני G לא פועלים אך ורק דרך בקרה על פעילותם של אנזימים ממברנאליים המשנים את הרמות של
cAMP
וסידן בתא
תת יחידה אלפא של
G12
לדוגמה, מפעילה
GEF
של חלבון
G
מונומרי ממשפחת
Rho
המבקר את שלד התא של סיבי האקטין.
חלבוני
G
מפעילים או מכבים באופן ישיר תעלות יונים בממברנת התא של תאי מטרה ובכך משנים את החדירות של היונים ואת האקסיטביליות של הממברנה. למשל אצטילכולין המשתחרר מעצב הואגוס ומוריד את קצב הלב.
אצטילכולין נקשר ל-
GPCR
שלו והתהליך מתווך על ידי
Gi
כאשר תת יחידה אלפא מעכבת את אדניליל ציקלאז ואילו תת יחידות בטא-גמא נקשרות לתעלות אשלגן ופותחות אותן. הפתיחה של תעלות האשלגן הללו מקשה על הדפולריזציה של התאים ובכך תורמת לאפקט המעכב של אצטילכולין על תאי הלב.
איך קוראים למסלול שאותו עושה מנגנון
rods?’
ואיך הוא נעשה?
Gt
- רודופסין הינו רצפטור מסוג
GPCR
שמופעל בתגובה לאור. כתוצאה מגירוי הרצפטור רודופסין על ידי האור, השייר ה- 11 משנה קונפורמציה מציס לטראנס והדבר גורם לתת יחידה אלפא להיות מופעלת. היא מאקטבת את
cGMP
פוספודיאסטראז שמפרק את
cGMP
. כתוצאה מכך נגרמת סגירת תעלות סידן ונתרן והיפר (רה) פולריזציה.
בחושך לעומת זאת, הרודופסין לא מאוקטב, האנזים שמפרק
cGMP
לא מעוכב ויש לכן כמות רבה של
cGMP .
כמות זו תגרום לתעלות הקטיונים להיות פתוחות והתא עובר דפולריציה.
איל מנגננוני בקרה שליליים יש ל
rods?
1.קיים למערכת קינאז יעודי הקרוי
Rhodopsin Kinase –
אנזים מזרחן את הזנב הציטוזולי של הרצפור רודופסין על מספר שיירי סרין ומונע את היכולת של הרצפטור לשפעל את תת היחידה אלפא.
- חלבון ממשפחת הארסטין
בתמונה מופיעה כ
Recovrin
או
Recov
נקשר לזנב המזורחן ומגביר את חוסר היכולת של הרצפטור להיקשר לתת היחידה אלפא.
- חלבון ממשפחת ה
RGS
נקשר לתת היחידה אלפא
Gt
ומעודד הידרוליזה של
GTP
ולהפסקת פעילותו
4.הירידה החדה בסידן שנגמרה כתגובה לאור המפורטת מעלה, גורמת לשפעול האנזים
Guanylyl Cyclase
וליצירה מחודשת של
cGMP.
פעולה זה נעשית על ידי חלבון ייחודי הרגיש לסידן ולא באופן ישיר. החלבון הייחודי, בניגוד לקלמודולין, מעוכב על ידי סידן ומשופעל רק כאשר הסידן יורד.
מה קורה לבני אדם בעלי מוטציה ב-
RK?
מגלים תגובה מוארכת לחשיפה לאור
Prolonged light Response
כיצד פועלת מערכת הריח?
מהו
NO?
רדיקל חפשי יציב הפועל כמולקולת סיגנל ברקמות רבות בבעלי חיים ובצמחים.
איפה מתקיים מסלול ה-
NO?
מסלול ה-
NO
מתקיים בכל מיני רקמות, כמו למשל אפיתל, נוירונים ואחת הרקמות הייעודיות לפעילותו של
NO
היא רקמת שריר חלק של כלי דם: ביונקים,
NO
אמור לגרום להרפייה של שריר חלק בכלי דם וכך בעצם לגרום להרחבה שלו.
מהו תיאור המסלול של
NO?
- אצטיל כולין נקשר לרצפטור
Gq
כפי שהזכרנו קודם, פעולה הגורמת לעלייה של
3IP
ולכן עלייה של סידן.
- סידן משפעל את האנזים
NO
סינתאז
(NOS)
המנצל ארגינין ליצירת
NO
( נוצר על ידי דה אמינציה של ארגינין).
כל זה קורה באנדותל – התאים המצפים את כלי הדם.
3.ה-
NO
הוא גז הנע בזריזות לתאי שריר חלק הסמוכים, נקשר לאנזים גואנייל-ציקלאז ומשפעל אותו.
4.זה גורם לעלייה ב
cGMP
שגורם להרפיה של שריר חלק
מה ההשפעה של
NO?
ההשפעה של
NO
היא מקומית בלבד כיוון שזמן מחצית החיים שלו הוא בין
5 ל- 10 שניות, לפני שהוא הופך לנירטאטים וניטריטים בנוכחות חמצן ומים.
מה זה אנגינה ולמה משתמשים בניטרוגליצין כדי לרפא אותה?
כאבים הנובעים מזרימת דם לא מספקת לשריר הלב
הניטרוגליצרין מומר ל-
NO
שמרפה את כלי הדם. זה מקטין את עומס העבודה על הלב וכתוצאה מכך מפחית את דרישת החמצן של שריר הלב.
איך נקרא
Nos
בתאי אנדותל?
eNOS
איך נקרא
NOS
בתאי שריר?
nNOS.
האם יש גם במאקרופאגים
NOS?
כן
נקראים
inos
והם מפעילים אותם רק כאשר התאים פועלים
מה יכול לעשות
NO
בתאי מטרה?
NO
נקשר באופן הפיך לברזל באתר הפעיל של גואניליל ציקלאז, ומעודד סינתזה של
NO
כיצד
cyclic gmp
שומר על איזון?
ה-
CGMP
יכול להגדיל את ריכוז ה-
cyclic GMP
תוך שניות, משום ששיעור התחלופה שלה גבוה – היא נוצרת על ידי גואניליל ציקלאז אך מפורקת על ידי פוספודיאסטראז, וכך הייצור שלה מאוזן כל העת.
כיצד ויאגרה פועלת?
ויאגרה וקרובי משפחתה מעכבים את הפוספודיאסטראז, וכך למעשה אין פירוק של מולקולות
cGMP
והן יכולות להמשיך לפעול ולהרפות את השריר החלק – ולכן להרחיב את כלי הדם באזור הפין.
NO
יכול בנוסף לכך להעביר סיגנאלים באופן בלתי תלוי
ב- cGMP
: קישורו לשיירי ציסטאין ספציפיים בחלבונים גורמת לשינוי פעילותם.
מה היא דה סנסיטזציה?
ה סנסיטיזציה הוא תהליך של הפחתת רגישות של רצפטור לסיגנאל מסויים.
מדוע דה סנסיטזציה נחוץ?
זהו תהליך נחוץ משום שאנו רוצים למדוד שינויים – כאשר יש שוני ביחס לסביבה נרצה שהתא יהיה מודע לכך. אולם אם הסביבה השתנתה ויש עכשיו “סטנדרט חדש”, לא נרצה שהתא יסגנל באופן תמידי.
כיצד התא יכול לעבור סינסטריזציה למולקולות סיגנאל חוץ תאיות?
סיקווסטרינג – הרצפטורים עוברים אינטרליזציה ומוכנסים לתוך הציטוזול על מנת שלא יהיו זמינים יותר לקשירת הליגנד.
פירוק רצפטורים בליזוזום – הרצפטורים מוכנסים לתא ונשלחים לפירוק בליזוזום כך שהם לא עובדים יותר.
אינאקטיבציה – פעילות הרצפטורים עוברת שינוי כך שלא יוכלו לקיים אינטראקציה עם חלבוני ה-
G
שלהם.
עי מי תלוי דה סנסטיזציה של
GPCRS?
תלויה בזרחון שלהם על ידי
PKA ,PKC
(grk)
GRKs
אלה מזרחנים עמדות סרין ותראונין רבות על גבי הרצפטור, אך הם עושים זאת רק לאחר שהליגנד נקשר והפעיל את הרצפטור
מרגע שהרצפטור זורחן על ידי
GRK
הוא נקשר באפיניות גבוהה לחבר במשפחת ה-
arrestin
כיצד ה-
arrestin
תורם לדה סנסטיזציה?
ראשית, ארסטין חוסם את אתר הקישור של הרצפטור לתת יחידה אלפא וכך אין הפעלה של יחידות נוספות. שנית, ארסטין משמש כחלבון מתאם לאנדוציטוזה תלויית קלטרין. גורלו של הקומפלקס ארסטין-
GPCR
תלוי בחלבונים אחרים בקומפלקס. יש מקרים בהם הוא מגיע לממברנה הפלסמטית לצורך שימוש חוזר ובמקרים אחרים עובר יוביקוויטילציה, אנדוציטוזה ומפורק בליזוזום
האם כל אנדוציטוזה עי ארסטין בהכרח מונעת קבלת אותו מרצפטור
לא
מה קורה בתמונה הבאה?
רצפטור בטא-אדרנרגי
(מסלול
Gs)
מופעל.
הולכת האותות כפי שראינו מביאה לשפעול
PKA.
PKA
משפעל את האנזים
GRK .
GRK
נקשר לרצפטור הפעיל ומזרחן אזור תוך תאי על סרין/תראונין.
כעת מצוי זנב קרבוקסילי מזורחן בצד הציטוזולי, המאפשר קישור של החלבון ארסטין.
ארסטין נקשר וחוסם את אתר הקישור של הרצפטור לתת יחידה אלפא ומהווה חלבון מתאם לאנדוציטוזה תלויית קלטרין.
מנגנון הראיה
מה הוא מנגנון ההרחה
מה עושים כל אחד מה- g
אלפא
מה קורה כאשר מוציאים
NO
מארגינין
נותר ציטרולין
איפה ניתן לראות רצפטורים מצומדי אינזים
מה קורה בתמונה הבאה?
- בהיעדר ליגנד הרצפטור ל-
EGF
קיים בעיקר כמונומר לא פעיל.
- קשירת
EGF
מובילה לשינוי קונפורמטיבי המקדם דימריזציה של הדומיינים החיצוניים.
- דומיין הקינאז, שלא כמו זה של
RTKs
רבים, אינו מופעל על ידי טראנס-אוטו-פוספורילציה. במקום זאת, הדימריזציה מכוונת את דומייני הקינאז הפנימיים ליצירת דימר לא סימטרי בו דומיין קינאז אחד
(“activator”)
דוחף כנגד השני
(“receiver”)
וכך גורם לשינוי קונפורמטיבי שמפעיל את
ה-receiver.
ה-receiver
הפעיל מזרחן טירוזינים רבים בזנבות
ה-C
טרמינאליים של שני הרצפטורים וכך יוצר אתרי עגינה לחלבוני סיגנאל תוך תאיים.
חלבונים בעלי דומיין
sh2
לאן יכולים להיקשר?
ולמה זה יכול לגרום?
- חלבוני בעלי דומיין
SH2
יכולים להיקשר לפוספוטירוזינים על גבי
RTKs
מופעלים על על חלבוני עגינה. חלק מהחלבונים העוגנים הם אנזימים כמו למשל פוספוליפאז גמא
(PLCγ)
שמתפקד באותו האופן כמו פוספוליפאז
C-β
כך ש-
RTKs
יכולים להעלות את רמות יוני הסידן בציטוזול ולהפעיל את
PKC.
- אנזים אחר המעוגן לרצפטורים הללו הוא הטירוזין קינאז הציטופלסמטי
Src
המזרחן את חלבוני הסיגנאל האחרים בשרשרת על טירוזין.
- אנזים נוסף הוא פוספאינוזיטיד 3-קינאז המזרחן ליפידים
מה עושה הרצפטור
PDGF?
הוא פקטור שמשפעל טסיות
מה ישפעלו חלבונים שיקשרו ל-
pdgf?
החלבונים שייקשרו אליו ישפעלו את מערכת ה-
PI3K
חלקם ישפעלו מערכת חלבוני
G
וחלקם אף ישפעלו את פוספוליפאז ויגרמו לעלייה בסידן תוך תאי במסלול דומה לזה שכבר למדנו. הרצפטור מציג 5 אתרי עגינה – 3 מהם בתחילת החלבון ו-2 בזנב ה-
C
טרמינאלי.
כיצד בנוי
sh2
מבנה התלת מימדי של דומיין
SH2
כיס הקישור לפוספוטירוזין מצוין בכתום וכיס קישור לשרשרת צד של חומצת אמינו
האם כל החלבונים שנקשרים
ל- rtk
עם
sh2
עוזרים להעביר את הסיגנאל?
לתת דוגמה
ומה קורה עם יש מוטציה
לא כל החלבונים שנקשרים ל-
RTKs
עם
SH2
עוזרים להעביר את האות הלאה. חלקם דווקא פועלים להפחתת תהליך האיתות ומתן משוב שלילי. דוגמה אחת היא החלבון
c-Cbl
שיכול להיקשר לרצפטורים פועלים ולזרז את היוביקוויטילציה שלהם, מה שמקדם אנדוציטוזה ופירוק חלבונים בליזוזומים. חלבונים אנדוציטיים המכילים
ubiquitininteraction motifs (UIMs)
מזהים את הרצפטור המסומן ומכוונים אותו לוזיקולות עטופות קלתרין ובסופו של דבר לפירוק בליזוזמים. מוטציות המעכבות את הדאון רגולציה של החלבון
c-Cbl
גורמות לאיתות ממושך מצד רצפטורי
RTK
מה שמקדם התפתחות סרטן.
מה הוא המנגנון אשר מאפשר ל-
NGF
להיקשר ל-RTK הספציפי לו?
כמו במקרה של
GPCR
, אנדוציטוזה הנגרמת על ידי ליגנד של
RTK
לא תמיד מורידה את הסיגנאל, שממשיך ממדורים תוך תאיים כמו האנדוזום. מנגנון זה מאפשר ל-
nerve growth factor (NG
להיקשר ל-
RTK
(trk a(
הספציפי שלו בסוף אקסון ולאותת לגוף התא של אותו התא במרחק רב משם. כאן, וזיקולות אנדוציטיות המכילות
TrkA
עם
NGF
מועברות מהאקסון לגוף התא כאשר
NGF
קשור בצד הלומן וחלבוני הסיגנאל בצד הציטוזולי – מה שמאותת לתא לשרוד.
מה משפחת
ras
כוללת ?
משפחת חלבוני
Ras
הכוללת בתוכה את החלבונים
Ras,Rab,ARF,Ran
ומשפחת
Rho
הם משפחה של חלבוני
G מונומרים, אולם רק
Ras
ו- Rho מקבלים אותות חוץ תאיים.
אילו שלושה חלבוני
ras
עיקריים יש בבני אדם?
ישנם שלושה חלבוני
Ras
עיקריים בבני אדם
H,K ו-N Ras
מה
ras
לרוב גורם?
כאשר
RTKs
מאותתים לגרעין לעורר פרוליפרציה או דיפרנציאציה של תאים, שני תהליכים המצריכים שינויים בביטוי הגנים. 30% מהגידולים האנושיים מבטאים צורות מוטנטיות היפראקטיביות של
Ras
התורמות לפרוליפרציה בלתי מבוקרת של תאי הסרטן.
מוטציה שיש בהן עמידות מוגברת ל-
gap
של
ras
למה הן יגרמו?
לסרטן
כיצד
rtK
מפעילות את
ras?
באופן עקרוני, הם יכולים להפעיל
Ras-GEF
או לעכב
Ras-GAP.
אף על פי שכמה
GAPs
נקשרים ישירות
ל-RTKs
זהו צימוד לא ישיר של רצפטור
ל-Ras-GEF
שמביא את
Ras
למצב הפעיל שלו. לאובדן הפעילות
של
Ras-GEF
השפעה דומה לאובדן הפעילות של
Ras
עצמו.
כיצד מפעילים את ה-
ras super family?
הפעלת חלבוני
Ras superfamily
אחרים כולל אלה ממשפחת
Rho
מתרחשת גם באמצעות הפעלת
GEF.
ה- GEF
הספציפי קובע באיזו ממברנה ה-
GTPase
מופעל, ובאמצעות כך שפועל כפיגום, הוא יכול גם לקבוע אילו חלבונים במורד הזרם מפעיל ה
- GTPase.
היכן התגלה ה-
gef
של ה-
ras?
התגלה במחקרים גנטיים של התפתחות עיניים בדרוזופילה
איך מכונה
GEF
של RTK
איך מכונה מה שמקשר ביניהם?
. GEF
המכונה
Sos.
מחקרים גנטיים חשפו חלבון נוסף, שנקרא כיום
Grb2
שהוא חלבון מתאם המקשר בין רצפטור ה-
Sev לחלבון
Sos
מהו
map-kinase?
בדרך כלל מערכת האותות המופעלת על ידי
RTK ו-Ras
היא קצרת מועד הודות לפעילות
GAP
ופוספטאזות.
אולם כדי לעודד פרוליפרציה או דיפרנציאציה תאית יש להמיר את אירועי הסיגנאל הללו מאירועים קצרים יחסית לאירועים שנמשכים זמן ארוך יותר ומסוגלים להעביר את האות לגרעין כדי לשנות את דפוס הביטוי של הגנים. קסקדת ה-
MAP kinase module
היא אחד ממנגנוני המפתח המשמשים למטרה הזו.
כיצד נקראות שלושת הקינאזות של
Map?
(Raf (= MAPKKK)
Mek (= MAPKK)
ו- (Erk (= MAPK
כיצד פועל רצפטור טירוזין קינאז?
1.קבלת סיגנאל גורמת לדימריזציה ולפוספורילציה של שני מונומרי
RTK .
- grb2
קושר את שיירי הטירוזין המזורחנים בעזרת דומיין
SH2.
3.
Grb2
מצידו השני בעל דומיין
3SH,
וקושר שיירי פרולין של
Sos.
Sos
הוא
ה-GEF
של
Ras
ומבצע שפעול שלו.
- לאחר ש-
RAS
עובר שחלוף, הוא מסייע בגיוס של החלבון
RAF
לממברנה ומשפעל אותו.
- RAF
מזרחן את החלבון
Mek
שמזרחן את החלבון
Erk
– זו קסקדת ה-
MAPK.
מה החלבון
ERK
מזרחן?
Elk1
ואחרים שהם פקטורי שעתוק של “תכנות התא”, הקשורים למסלולים חשובים של התמיינות וחלוקה.
עוד הוא מזרחן מתחמי רגולציה מה שמפעיל קבוצת
immediate early genes
ש”נדלקים” תוך דקות לאחר ש-
RTK
הופעל (והם נדלקו אפילו כשסינתזת החלבון נחסמה בניסויים עם חומרים שונים).
בין הגנים המופעלים על ידי מסלול זה ישנם כמה המגרים את פרוליפרציית התאים, כמו הגנים המקודדים לציקלינים של
G1 .
כיצד אותו חוץ תאייים מפעילים את ה-mapk?
באופן זמני בלבד
האם
ERK
יכול להפסיק
את
raf
כן
כיצד
Map kimase
מפעיל לולאת משוב חיובית?
או שלילית?
מפעיל לולאת משוב חיובית מורכבת כדי לייצר תגובת “הכל או כלום” בלתי הפיכה במסגרתה ביציות של צפרדע ממגורות על ידי חשיפה קצרה להורמון פרוגסטרון החוץ תאי שגורם להן להתבגר. עוד מצוין כי בתאים רבים
MAP
קינאזות מפעילות לולאת משוב שלילי על ידי הגדלת ריכוז הפוספטאז שמסיר את הקינאז מ-
MAP
קינאז. העליה בריכוזו של פוספטאז נובעת הן מעלייה בשעתוק הגן המקודד לו והן מייצוב האנזים כנגד פירוק.
היכן פועלות מערכות של
mapk
בעלות שלושה רכיבים?
פועלות בכל התאים האאוקריוטים, כאשר מערכות שונות מתווכות תגובות שונות באותו התא.
כיצד התאים נמענים מ-
cross talk
בין מסלולי הסיגנאל השונים?
חלבוני פיגום
האם בתאי יונקים יכולים לפעול 5 מערכות
Mapk?
כן
מתי יש שימוש ב-
mapk?
שתיים מהמערכות הללו מופעלות על ידי סוגים שונים של סטרס תאי, כמו קרינה אולטרה סגולה הלם חום, וסטרס אוסמוטי, וכן על ידי ציטוקינים דלקתיים. אחרים בעיקר מתווכים תגובות לאותות מתאים אחרים.
מה החיסרון של
mapk
בפיגומים?
הגבלת ההגברה: למרות שאסטרטגיית הפיגומים מספקת דיוק ונמנעת מ”שיחות חוץ” שיכולות כאמור להתקיים, היא מצמצמת את ההזדמנויות להגברה ולהפצת האות לחלקים שונים בתא, הדורשים שלפחות חלק מהרכיבים יהיו דיפוזיים. לא ברור באיזו מידה הרכיבים הפרטניים של מערכות ה-
MAP
יכולים להתנתק מהפיגום במהלך תהליך ההפעלה כדי לאפשר הגברה.
מה עושה אינסולין?
אינסולין משפעל רצפטור טירוזין קינאז שכאמור, הוא כבר מראש דימר על גבי הממברנה, ולא מונומר שעובר דימריזציה כמו שאר הרצפטורים של המשפחה.
במקרה הזה, הרצפטור לא רק שמזרחן את עצמו ואת בן הזוג לאחר הקישור לאינסולין, הוא גם מזרחן חלבון בשם
1IRS
שבהמשך יגייס את
Grb2
והמסלול ממשיך כרגיל, כפי שלמדנו.
הפקטור
1IRS
הוא פקטור משמעותי העובר זרחון על שיירי טירוזין עם הקישור לאינסולין.
למה
irs
חשוב באינסולין?
הוא משפעל את
PI3K
המזרחן
PIP2
ל- PIP3.
הקישור לקינאז נעשה דרך דומיין
SH2.
PIP3
מגייס לממברנה חלבון בשם
PKB
שאלברטס גם קורא לו
Akt.
עושה כמה דברים:
הוא מזרחן את
GSK3
(ההוא שבהמשך יזרחן את גליקוגן סינתז קינאז, ויהפוך אותו ללא פעיל).
בדרך שאנחנו לא לגמרי מבינים הוא משפעל אקסוציטוזה של וזיקולות
Glut4.
לאיזה משפחה שייכים חלבוני ה-
rho?
שייכים למשפחת ה-
Ras
והם חלבוני
G.
אנחנו רואים סיגנאל ממשפחת ה-
ephirin
שתפקידו לעודד מיגרציה של האקסון לכיוון תא השריר אותו הוא מעצבב.
RhoA
יושב לא פעיל על הממברנה
(קושר GDP)
ועם הקישור של הליגנד לרצפטור, גורם לשחלוף והפעלה שלו שבתורו גורם להפעלה של אפקטורים רבים הקשורים לציטוסקלטון.
עי מי
RHO A
מופעל?
RTK
מה גורם שפעול של חלבוני
RHO.
משפחת
Rho
גורמת לרה-ארגון של הציטוסקלטון בתא, ולכן משפיעה על תנועה, הידבקות, קוטביות וצורת התא. היא גם מבקרת את התקדמות מחזור התא, שעתוק גנים וטרנספורט ממברנות. חלבוני המשפחה ממלאים תפקיד מרכזי בנדידת תאים וצמיחת אקסונים של נוירונים ומתווכים תגובת אקטיבציה להפעלת סוג מיוחד של
guidance receptors
מה שלות החלבונים שמאופיינים היטב עם
ה- cytoskeeton?
Rho בעצמו
Rac
ו-Cdc42
. כל אחד מהם משפיע על חלבוני מטרה רבים במורד הזרם.
מה ההבדל בין
ras
ל-rho?
בשונה מ- Ras
אשר מעוגן לממברנה גם כאשר הוא כבוי, חברי משפחת
Rho
נקשרים במקרים רבים
ל- GDIs
בציטוזול כאשר הם כבויים. קישור זה מונע אינטראקציה של חלבוני ה
-G
עם
Rho-GEFs
בממברנה הפלסמטית.
על מה משפיע
rhoa
משום ש-
RhoA
משפיע על מבנים של אקטין ומיוזין הוא משפיע על סטרס פייברז וגם על הטבעת החונקת בציטוקינזה, כך שאם מנטרלים אותו לא תהיה ציטוקינזה. למשל: בשלבים הראשונים של עובר דרוזופילה אין ציטוקינזה, אך במעבר מחלוקה בין 1000 ל2000 תאים – יש ציטוקינזה בבת אחת. כנראה שיש שם מעורבות של חלבון זה.
כיצד
rtk
מפעיל את
rho gtpase?
אחד מבני משפחת ה-
Eph
נמצא על פני עצבים מוטוריים ועוזר להנחות את הקצה הנודד של האקסון
(המכונה
growth cone)
אל היעד שלו – השריר. הקישור של האפרין מפעיל את הרצפטור שלו וגורם
ל-growth cone
להתמוטט וכך מרחיק אותו מאזורים לא מתאימים ושומר עליו במסלול. התגובה תלויה ב
-Rho-GEF
המכונה
ephexin
, שקשור ביציבות לזנב הציטוזולי של קולטן
ה- Eph.
קשירת ה-
Eph
מפעילה את הרצפטור ל-
Eph
שמפעיל טירוזין קינאז ציטופלסמטי שמזרחן את
ephexin
על טירוזין. כך, יכולתו של
ephexin
להיקשר ל-
RhoA
גבוהה.
לאחר מכן
RhoA
המופעל מבקר חלבוני מטרה שונים במורד הזרם, כולל כמה חלבוני אפקטור השולטים בשלד התאי וגורם ל-
growth cone
להתמוטט.
מה
Pi3k
מזרחן?
הוא בעיקר מזרחן פוספוליפידים של אינוזיטול ולא חלבונים, וגם
RTK ,
וגם
GPCR
יכולים להפעיל אותו. זה ממלא תפקיד מרכזי בקידום הישרדות התאים וגדילתם
Phosphatidylinositol
למה הוא ייחודי?
הוא ייחודי כיוון שהוא יכול לעבור פוספורילציות הפיכות במספר אתרים בקבוצת הראש האינוזיטולים. זאת כדי לייצר מגוון ליפידי
PI
מזורחנים הנקראים פוספואינוזיטידים. כשהוא מופעל,
PI 3-kinase
מזרז זרחון בעמדה 3 של טבעת האינוזיטול ליצירת מספר פוספואינוזיטידים כמתואר באיור. הייצור של
PI(3,4,5)P3
הוא חשוב ביותר מכיוון שהוא יכול לשמש כאתר עגינה לחלבוני סיגנאל תוך תאיים שונים, שמתאספים לדומייני איתות המעבירים את הסיגנאל לצד הציטוזולי של הממברנה הפלסמטית.
מה עושה
Pten phosphatase?
מבצע דה פוספורילציה לכל שלוש העמדות בטבעת האינוזיטול
מה קורה כאשר יש מוטציות
ב-
pten phosphatase?
ניתן למצוא מוטציות ב-
PTEN
בסוג סרטן רבים: על ידי הארכת הסיגנאל מ
PI 3-kinase ‘
מתקדמת גדילה תאית בלתי מבוקרת.
אילו סוגים יש ל-pi3k?
ישנם סוגים שונים של
PI 3-kinases
. אלו המופעלים על ידי
RTKs ו-GPCR
שייכים לקבוצה I.
- אלה הם הטרודימרים המורכבים מתת יחידה קטליטית משותפת ומתת יחידות רגולטוריות שונות.
RTKs
מפעילים מחלקה המכונה
class Ia PI 3-kinases
בה תת היחידה הרגולטורית היא חלבון מתאם הנקשר לשני פוספטירוזינים על
RTKs
(כשהם מופעלים) באמצעות שני דומייני
SH2
שלה.
-GPCRs
מפעילים מחלקה המכונה
class Ib PI 3-kinases
שלהם תת יחידה רגולטורית הנקשרת לקומפלקס הבטא-גמא של trimeric G protein (Gq)
כאשר
GPCRs
מופעלים על ידי הליגנד החוץ תאי שלהם.
מה עושה קישור ישיר של
ras
ל-
class1
בפוספואינוזטידים
קישור ישיר של
Ras
מופעל יכול לאקטב את תת היחידה הקטליטית המשותפת של class I
מהו הזרחון החשוב ביותר מבין שלושת הזרחונים?
בתמונה כאמור ניתן לראות יצירת אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים על ידי
PI 3-kinase.
הזרחון החשוב ביותר הוא של
PI (4,5) P2
ליצירת
PI (3,4,5) P3
שיכול לשמש אתר עגינה לחלבוני סיגנאל בעלי
PI(3,4,5)P3-binding PH domains.
קינאזות אחרות של פוספטידיל אינוזיטול מזרזים את תהליכי הזרחון שמסומנים בירוק.