biology of the cell 4 Flashcards
מה היא הולכת אותות?
הולכת אותות היא כל תהליך שבו התא ממיר סוג אחד של אות או דחף לסוג אחר של אות – למשל קישור של אינסולין מחוץ לתא מוביל לפירוק גלוקוז בתוך התא. תהליכים אלו מאופיינים בסדרה רציפה של תגובות תוך תאיות שבסופן, כאמור, שינויים בתפקוד התא. התהליכים הללו יכולים להיות מהירים מאוד או איטיים מאוד – החל ממילישניות ועד מספר ימים. כמו כן, הם יכולים להיות זמניים או קבועים.
quorum sensing
הרבה לפני שיצורים רב-תאיים שוטטו על פני כדור הארץ, אורגניזמים חד-תאיים פיתחו מנגנונים לתגובה לשינויים פיזיים וכימיים בסביבתם. העדויות מגיעות ממחקרים של אורגניזמים חד-תאיים של ימינו כמו חיידקים ושמרים. למרות שתאים אלה מנהלים בעיקר חיים עצמאיים, הם יכולים לתקשר ולהשפיע זה על התנהגותו של זה.
מה
quorom sensing
מאפשר?
הוא מאפשר לחיידקים לתאם את ההתנהגות שלהם כמו למשל תנועתיות, ייצור אנטיביוטיקה, יצירת נבגים וקוניוגציה מינית. באופן דומה, תאי שמרים מתקשרים זה עם זה לקראת ההזדווגות.
איך נקראים השמרים המניצים?
וכיצד הם מזדווגים?
השמרים המניצים
Saccharomyces cerevisiae
מספקים דוגמה שנחקרה היטב: כאשר אינדיבידואל הפלואידי מוכל להזדווג, הוא מפריש
peptide mating factor
שמאותת לתאים מהזוויג השני להפסיק לעבור פרוליפרציה ולהתכונן להזדווגות. ההתמזגות של שני הפלואידים משני זוויגים שונים יוצרת זיגוטה דיפלואידית
תקשורת בין תאית התפתחתה במהלך הזמן
נכון/לא נכון
נכון
כיצד מתווכת התקשורת הבין תאית בין אורגנזימים שונים?
התקשורת הבין תאית באורגניזמים רב תאיים מתווכת בעיקר על ידי מולקולות סיגנאל חוץ תאיות. חלק מהמולקולות הללו פועלות למרחקים ארוכים, ומאותתות לתאים רחוקים בעוד שחלקן פועלות למרחקים קצרים ומאותתות רק לשכנים קרובים.
במי תלוי קבלת האותות ביצורים רב תאיים?
בחלבוני הרצפטור
כיצד נקראים היעדים בסוף מסלולי האיתות?
היעדים הללו נקראים אפקטורים
אילו מספר שלבים יש בהעברת האותות?
- הגעת מולקולת סיגנאל שהיא שליח ראשוני אל הרצפטור וקישורה.
- אקטוב הרצפטור והעברת הסיגנאל אל תוך התא.
- הפעלה של קסקאדה תוך תאית אחת או יותר הכוללת סדרה של חלבוני סיגנאל, עם או בלי שליחים שניוניים
- שינוי פעילות של חלבון אפקטור:
- תגובה מהירה – זרחון או דה זרחון/ביטול פעולה של אנזים או הפעלה של אנזים.
- תגובה איטית/גרעינית כמו נדידת פקטורי שעתוק לגרעין.
כמה גנים מהגנום האנושי מכילים רצפטורים?
1500 גנים המקודדים לרצפטורים, ולא די בכך, מספר הרצפטורים מוגדל עוד יותר על ידי שחבור חליפי של
RNA
ושינויים לאחר התרגום
למה תאים זקוקים לסיגנאלים?
שרידות.
גדילה וחלוקה
התמיינות וייעוד תאי.
אפופטוזיס.
תנועה תאית.
עיכוב התנהגויות תאיות מסויימות.
באילו ארבעה דרכים תאין יכולים לתקשר זה עם זה?
- איתות תלוי מגע
- איתות פאראקריני
- איתות סינאפטי
- איתות אנדוקריני
מה הוא איתות תלוי מגע?
מה הוא שמו השני?
מתי הוא חשוב?
על התאים להיות במגע ישיר אחד עם השני . מכונה גם איתות ג’וקסטאקריני. איתות תלוי מגע זה חשוב במיוחד במהלך ההתפתחות ובתגובות חיסוניות. איתות תלוי מגע במהלך ההתפתחות יכול לפעמים לפעול על פני מרחקים גדולים יחסית אם התאים המתקשרים משתרעים על פני מערכים ארוכים ודקים כדי ליצור קשר זה עם זה.

מה הוא איתות פאראקריני?
על מה הוא פועל?
איזה עוש סוג של איתות נכלל באיתות פאראקריני?
מה תאים סרטניים עושים?
תלוי במתווכים מקומיים שמשתחררים לחלל החוץ תאי ופועלים על תאים סמוכים. ברוב המקרים תאים שמסגנלים מפרישים מולקולות סיגנאל לנוזל החוץ תאי. לעתים קרובות, המולקולות המופרשות הן בבחינת מתווכים מקומיים, הפועלים רק על תאים בסביבה המקומית – איתות פראקריני. בדרך כלל באיתות פראקריני התא המסגנל ותא המטרה משתייכים לשני סוגים שונים של תאים, אך תאים עשויים לייצר סיגנאלים שהם עצמם מגיבים להם. כלומר, שימו לב שאיתות יכול להיות לתאים שכנים או איתות ל”עצמי” – אוטוקריני. תאים סרטניים למשל מפיקים לעתים קרובות אותות חוץ תאיים המעוררים את ההישרדות וההתרבות שלהם.

מה הוא תהליך איתות סינאפטי?
איך התהליך הזה הותאם לאורגנזימים גדולים וכיצד הוא עובד?
מבוצע על ידי נוירונים המעבירים אותות באופן חשמלי לאורך האקסונים שלהם ומשחררים נוירוטרנסמיטרים בסינפסות, הנמצאות לרוב הרחק מגוף תא העצב. אורגניזמים רב-תאיים גדולים כמונו זקוקים למנגנוני איתות ארוכי טווח כדי לתאם את התנהגות התאים באזורים רחוקים ונידחים בגוף. לפיכך, הם פיתחו סוגי תאים המתמחים בתקשורת בין-תאית למרחקים גדולים. המתוחכמים שבהם הם תאי עצב אשר בדרך כלל מכילים כאמור אקסונים המאפשרים להם ליצור קשר עם תאי מטרה הרחק מגוף התא. התהליכים מסתיימים באתרים המיוחדים להעברת האות ומכונים סינפסות כימיות. כאשר נוירון מופעל על ידי גירויים מתאי עצב אחרים, הוא שולח דחפים חשמליים במהירות לאורך האקסון שלו. כאשר הדחף מגיע לסינפסה בסוף האקסון הוא מפעיל הפרשת אות כימי הפועל כנוירוטרנסמיטר. המבנה המאורגן בחוזקה של הסינפסה מבטיח כי העברת הנוירוטרנסמיטרים מתבצעת באופן ספציפי לקולטנים בתא היעד

מה הוא איתות אנדוקריני?
תלוי בתאים אנדוקריניים המפרישים הורמונים לזרם הדם. גם זו אסטרטגיה לשליחת חומרים למרחקים ארוכים – תאים אנדוקריניים משחררים את מולקולות הסיגנאל שלהם, ההורמונים, שכאמור עוברים בזרם הדם, מה שמאפשר להם להגיע לתאי היעד שלהם שיכולים להימצא במקומות שונים בגוף.

איך תאים בבעלי חיים מתקשרים?
תאים בבעלי חיים רב-תאיים מתקשרים באמצעות מאות סוגים של מולקולות סיגנאל תאיות. אלו כוללות חלבונים, פפטידים קטנים, חומצות אמינו, נוקלאוטידים, סטרואידים, רטינואידים, נגזרות של חומצות שומן ואפילו גזים מומסים כמו תחמוצת החנקן ופחמן חד חמצני.
איך מולקולות סיגנאל יוצאות החוצה מהתא?
- מרבית מולקולות הסיגנאל הללו משוחררות לחלל החוץ תאי על ידי אקסוציטוזה
- חלקן נפלטות על ידי דיפוזיה דרך הממברנה הפלסמטית
- אחרות מוצגות על פני השטח החיצוניים של התא, נשארות קשורות אליו, ומספקות איתות לתאים אחרים רק כאשר התאים יוצרים קשר.
האם בדרך כלל ה-
kd
של הרצפטור למולקולת הסיגנאל הוא קטן או גבוה?
קטן
איזה חלבונים הם בדרך כלל רצפטורים?
מה קורה כאשר הם קושרים מולקולה חוץ תאית?
רצפטורים הם חלבונים טראנסממברנאלים המצויים על פני תא המטרה. כאשר חלבונים אלה קושרים מולקולת סיגנאל חוץ תאית (ליגנד) הם מאוקטבים ומייצרים אותות תוך תאיים שונים המשנים את התנהגות התא. במקרים אחרים, חלבוני הרצפטורים נמצאים בתוך תא המטרה עצמו, ומולקולת הסיגנאל צריכה להיכנס לתא כדי לקשור את הרצפטור, מה שכמובן דורש שמולקולת הסיגנאל תהיה קטנה מספיק והידרופובית כדי לעבור דיפוזיה דרך הממברנה של תא המטרה.

כמה מולקולות סיגנאליות יש מסביב לתא?
כיצד תא מגיב אליהן?
תא טיפוסי באורגניזם רב-תאי חשוף למאות מולקולות אות שונות בסביבתו.
התא מגיב ל”סופת השלגים” של הסיגנאלים באופן סלקטיבי, והרבה פעמים מבטא רק את אותם רצפטורים ואת מערכות האיתות התוך-תאית המגיבות לאותות הנדרשים לוויסות התא
מה יקרה אם תא לא יקבל אותות של שרידות ?
יעשה אפופטוזיס
מה נוירוטרנסמיטור אצטיל כולין עושה?
עיתים קרובות למולקולות סיגנאל מסויימות יש מספר השפעות שונות על סוגי תאים שונים, למשל הנוירוטרנסמיטר אצטילכולין :
מוריד את קצב ירי פוטנציאלי הפעולה בתאי הקוצב של הלב. נקשר ל –
GPCR.
מזרז את ההפרשה של רוק בתאי בלוטות רוק. גם כן נקשר ל – GPCR
גורם לכיווץ בתאי שריר מחוספס. נקשר לרצפטור שונה

אילו רצפטורים ישנם?
יש רצפטורים שהם תעלות תלויות ליגנד כמו הרצפטור הניקוטיני של אצטיל כולין המצוי בצומת עצב שריר.
ישנם רצפטורים שמצומדים לפעילות אנזימטית שיכולה לזרחן.
ישנם רצפטורים המצומדים לחלבוני
GPCR
ומפעילים תהליכים דרכם.
רצפטורי אדהזיה הגורמים לתא להתחבר לסביבתו ומאפשרים לתא להרגיש האם הוא קשור למדיום בסביבתו או לא.
רצפטורים סטרואידים המצויים בציטוזול וממתינים שההורמון הסטרואידי יחצה בעצמו את הממברנה, יקשור אותם ויחד יכנסו לגרעין ויבטאו גנים מתאימים.

מה הם השליחים השניוניים ?
תפקידם ודוגמאות
השליחים השניוניים נוצרים בכמויות גדולות בתגובה להפעלת הרצפטור ופועלים כמגבירי האות – הם מתפזרים ממקור היווצרותם ומפיצים את האות לחלקים אחרים של התא.
חלקם, כגון :cAMP , cGMP, Ca2 +
הם מסיסים במים ומפוזרים בציטוזול, בעוד אחרים, כגון
diacylglycerol
הם מסיסים בשומן, והם מפוזרים במישור הממברנה הפלסמטית. בשני המקרים, הם מעבירים את האות על ידי קישור ושינוי התנהגותם של חלבוני סיגנאל או אפקטור. שליח שניוני נוסף שיש להכיר –
ip3
מה קורה כאשר רודופסין נקשרת לרצפטור?

אילו שליחים שניוניים יש לחלבונים מצומדי
G?
cAMP
מדוע משווים את חלבונים במעבר האותות למתגים מולקולאריים?
כאשר הם מקבלים אות, הם עוברים ממצב לא פעיל למצב פעיל, עד לתהליך אחר ש”מנתק” אותם ומחזיר אותם למצב לא פעיל
מה היא המחלקה הגדולה ביותר של המתגים המולקולריים?
במה הם תלויים?
הפעלה והשתקה עי זרחון
בכמות הקינאזות והפוספאטזות
כמה אחוז מהחלבונים האנושיים מכילים פוספאט?
30-50 אחוז
כמה קינאזות וכמה פוספאטזות מקודד הגנום האנושי?
כ-520 קינאזות ו-320 פוספאטזות
לאיזה אזור בחלסון הקינאזות מחברות את הפוספאט שלהן?
ואילו שני סוגים של פרוטאין קינאזות ישנן?
הקינאזות מחברות את הפוספט לקבוצות הידרוקסיל של חומצות אמינו ספציפיות על חלבון המטרה.
ישנם שני סוגים של פרוטאין קינאזות, רובם סרין/תראונין קינאזות (המזרחנים על סרין ותריאונין) ואחרים הם טירוזין קינאזות (המזרחנים על טירוזין). שני הסוגים הם קרובי משפחה במשפחה גדולה ונבדלים זה מזה בעיקר באתרי הקישור לסובסטראט החלבוני שלהם.
איך חלבונים שהם קינאזות לרוב מבוקרים?
עי זרחון
מה היא מחלקת
gtp-binding protein?
המחלקה החשובה הנוספת של מתגים מולקולריים היא מחלקה של
GTP-binding proteins .
חלבונים אלו עוברים בין מצב פעיל בו קשורה מולקולת
GTP
למצב לא פעיל בו קשורה מולקולת
GDP
בדרך כלל יש להם פעילות
GTPase
אינטרינזית והם מכבים את עצמם באמצעות הידרוליזה של ה-
GTP
הקשור אליהם ל-
GDP.
לאילו 2 קבוצות מתחלקים חלבוני
g?
שתי קבוצות של חלבונים קושרי
GTP:
חלבונים קושרי
GTP
טרימרים מכונים גם חלבוני
G
וחלבונים קושרי
GTP
מונומרים קטנים מכונים גם
Small monomeric GTPases.
הקבוצה הראשונה מסייעת בהעברת אותות מרצפטורים המצומדים לחלבון
G
והשניה מסייעת בהעברת אותות מסוגים רבים של רצפטורים על פני התא.
אילו חלבונים רגולוטוריים שולטים בחלבונים
gtp?
חלבונים רגולטוריים ספציפיים שולטים בשתי הקבוצות הללו – חלבוני
GAP
מביאים את החלבונים למצב “כבוי” על ידי הגברת קצב ההידרוליזה של ה-
GTP
הקשור. לעומת זאת, חלבוני
GEF
מאקטבים את החלבונים הקושרים
GTP
על ידי קידום תהליך השחרור של
GDP
הקשור, שמפנה את מקומו וכך נקשר
GTP
חדש. במקרה של חלבוני
G
טרימריים, הרצפטור המופעל משמש כ-
GEF
.
אילו עוד מתגים מולקולאריים יכולים להיות מלבד זרחון
ו-
gtp binding protein?
קשירת חלבון אחר, קשירת שליח שניוני כמו סידן או
cAMP
מודיפיקציה קוולנטית שהיא לא זרחון כמו יוביקוויטינציה
מה יש ברוב מסולול האותות ומדוע זה חשוב?
הרבה פעמים אנחנו מציגים את תהליך העברת האותות כסדרה של צעדים מאקטבים, אולם ברוב מסלולי האיתות ישנם שלבים מעכבים שהם לא פחות חשובים.
כך למשל רצף של שני צעדים מעכבים יכול להשפיע באותה המידה כמו שלב מאקטב אחד במערכת הפשוטה המוצגת ב- איי אפשר לראות רגולטור שעתוק שמוחזק במצב לא פעיל באמצעות קישור לחלבון אינהיביטורי. בתגובה לאות כלשהי במעלה הזרם מופועל קינאז שמזרחן את המעכב, גורם לניתוקו מרגולטור השעתוק וכך מתאפשר ביטוי גנים. בבי אנחנו רואים איך אפשר לתאר את המסלול הזה כרצף של ארבעה שלבים ששניים מהם הם אינהיביטורים.

אילו רעשי רקע יש לתאים במהלך הולכת האותות?
בגלל שמולוקולות סיגנאל תוך תאיות נמצאות כולם ביחד בתא
כיצד האות נשאר חזק, מדוייק וספציפי בכל זאת בתנאים הרעשניים שבו הוא נמצא?
דוגמה לכל מנגנון
ספציפיות גבוהה – קו ההגנה הראשון נובע מהזיקה הגבוהה והספציפיות של האינטראקציות בין מולקולות הסיגנאל לבין הפרטנרים שלהן לעומת הזיקה הנמוכה יחסית בין פרטנרים לא מתאימים. קשירת מולקולת סיגנאל למטרה הנכונה נקבעת על ידי אינטראקציות מדויקות ומורכבות בין משטחים משלימים על שתי המולקולות. כך למשל קינאזות מזהות רצף חומצות אמינו ספציפי סביב אתר הזרחון שלהן ולעיתים קרובות מכילים אתרי עגינה נוספים המקדמים אינטראקציה ספציפית בעלת זיקה גבוהה עם חלבון המטרה. מנגנונים אלה ואחרים עוזרים לספק אינטראקציה חזקה ומתמשכת בין בני הזוג הנכונים, ומפחיתים את הסבירות לאינטראקציות לא נכונות עם חלבונים אחרים.
תגובה תלויית ריכוז – דרך חשובה נוספת בה תאים נמנעים מתגובות לאותות רקע לא רצויים תלויה ביכולתם של חלבוני יעד רבים במורד הזרם להתעלם פשוט מאותות כאלה. חלבונים אלה מגיבים רק כאשר האות במעלה הזרם מגיע לרמת ריכוז או פעילות גבוהה. נניח למשל מסלול בו קינאז מפעיל חלבון מטרה מסויים. אם התגובה מופעלת רק כאשר יותר ממחצית מחלבוני המטרה מזורחנים, הרי שאם מדיי פעם מספר מועט של החלבונים הללו יזורחנו על ידי קינאז תועה לא ייגרם נזק משמעותי. מעבר לכך, פוספטאזות רבות פועלות באופן קונסטיטוטיבי, ובכך מפחיתות את ההשפעה של זרחונים לא נכונים. בדרכים אלו ואחרות מערכות הסיגנאל התאיות מסננות רעשים ומייצרות תגובה מועטה או חוסר תגובה בכלל ברמות נמוכות של גירוי.
כיצד מתגברים על תקלות באיתות?
רוב מערכות האיתות בנויות ליצירת תגובות חזקות ומדויקות להפליא גם כאשר האותות במעלה הזרם משתנים או אפילו כאשר רכיבים מסוימים במערכת מושבתים. במקרים רבים, החוזק הזה של מערכות האיתות התאיות תלוי בנוכחות מנגנוני גיבוי: לדוגמה, סיגנאל עשוי להפעיל שני מסלולים מקבילים להפעלת חלבון יעד משותף אחד במורד הזרם, המאפשר לתגובה להתרחש גם אם נתיב אחד מושבת או לא פועל היטב.
אילו דוגמאות יש לכך שמולקולות סיגנאל תוך תאיות לאזורים ספציפיים על מהת שיוכלו להגיב בצורה נכונה?
-scaffold proteins
חלבוני פיגום
- הרכבה של קומפלקס איתות על רצפטור מאוקטב
- הרכבה של קומפלקס איתות על אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים
דומיינים של אינטראקציה
לרכז את החלבונים יחד
כיצד חלבוני פיגום עוזרים למולקולות הסיגנאל להגיב ללא תקלות?
מביאים מספר חלבוני סיגנל לקומפלקסים מוגדרים, לרוב עוד לפני שהסיגנל התקבל בתא. מאחר וחלבוני פיגומים אלו מחזיקים חלבונים בקרבה רבה, אותם חלבונים יכולים לקיים אינטרקציה בריכוזים מקומיים גבוהים ולהיות מופעלים במהירות, יעילות וסלקטיביות בתגובה לסיגנל החוץ תאי המתאים ובכך להימנע מאינטרקציות בלתי רצויות עם מסלולי סיגנאל אחרים

כיצד הרכב של קומפלקס מאוקטב עוזר למולקולות הסיגנאל להגיב ללא טעויות?
במקרים אחרים, מתחמי איתות כאלה נוצרים באופן חולף רק בתגובה לאות חוץ תאי ומתפרקים במהירות כאשר האות נעלם. כלומר הם מתכנסים סביב הרצפטור לאחר שמולקולה חוץ תאית הפעילה אותו. ברבים מהמקרים הללו, הזנב הציטופלזמטי של רצפטור מופעל מזורחן במהלך תהליך ההפעלה וחומצות האמינו המזורחנות מהוות אתר עגינה לגיוס של חלבוני סיגנאל תוך תאיים. כך למעשה ישנה הרכבה של קומפלקס סיגנליזציה רק כאשר הרצפטור מאוקטב והוא מתפרק לאחר מכן עם היעלמות מולקולת הסיגנל.

איך הרכבה של קומפלקס איתות על אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים
עוזר למולקולות הסיגנאל ?
במקרים אחרים אקטיבציה של רצפטור מובילה לעלייה בזרחון של פוספוליפידים (פוספואינוזיטידים) ספציפיים המהווים אתרי עגינה לחלבוני סיגנל ספציפיים שיודעים לזהות אותם וכך נוצר קומפלקס סיגנליזציה על פוספואינוזיטידים המשמשים אתר עגינה.

מה הם דומייני אינטראקציה?
, קרבה מושרית בה סיגנאל מפעיל הרכבה של קומפלקס איתות משמשת להעברת אותות מחלבון אחד לאחר במסלול. הרכבת מתחמי איתות כאלה תלויה בדומייני אינטראקציה
מוטיב המוכר בחלבון האינטראקציה יכול להיות פפטיד קצר, שינוי קוולנטי (חומצה אמינית מזורחנת למשל) או דומיין חלבוני אחר
למה זה יעיל דומייני אינטראקציה?
כאשר דומיין אינטראקציה מוסף לחלבון הוא יכול לחבר את החלבון הזה למסלולי איתות נוספים.
אילו חלבוני סיגנאל ישנם?
SH2) Src homology 2) –
נקשר לטירוזין מזורחן ברצפי חלבונים ספציפיים על רצפטורים מופעלים/חלבוני סיגנל תוך תאיים.
PTB) phosphotyrosine-binding) –
נקשר לטירוזין מזורחן ברצפי חלבונים ספציפיים על רצפטורים מופעלים/חלבוני סיגנל תוך תאיים.
SH3) Src homology 3) –
נקשר לרצפי חומצות אמינו קצרים עשירים בפרולין.
PH) pleckstrin homology) –
נקשר לקבוצות טעונות על גבי פוספואינוזיטידים ספציפיים המיוצרים בממברנה הפלסמטית בתגובה לאותות חוץ תאיים. הם מאפשרים לחלבון שהם חלק ממנו לעגון על הממברנה ולקיים אינטראקציה עם חלבוני סיגנאל אחרים שגויסו באופן דומה.
לתאר את
interaction domain
של הרצפטור לאינסולין?
הרצפטור לאינסולין הוא רצפטור מצומד אנזים מסוג טירוזין קינאז. הרצפטור המופעל מזרחן את עצמו על טירוזינים ואחת מהפוספוטירוזינים מגייסת חלבון עגינה המכונה
IRS1
דרך דומיין
PTB
של
IRS1.
ל-IRS1
יש גם דומיין
PH,
והוא נקשר לפוספואינוזיטידים ספציפיים על גבי הממברנה מצידה הפנימי. לאחר מכן, הרצפטור המאוקטב מזרחן את
IRS1
על שיירי הטירוזין שלה, ואחת מהפוספוטירוזינים קושרת את Grb2.
Grb2
משתמש באחד מדומייני ה-
SH3
שלו כדי להיקשר לאזור עשיר בפרולין של החלבון
SOs
שמעביר את האות במורד הזרם בזכות תפקודו כ-
GEF.
SOs
נקשר גם לפוספואינוזיטידים דרך דומיין ה-
PH
שלו.
Grb2
משתמש בדומיין ה-
SH3
האחר שלו בכדי לקשור רצף עשיר בפרולין בחלבון פיגום. חלבון הפיגום קושר אליו חלבוני סיגנאל נוספים והטירוזינים המוזרחנים האחרים ב-
IRS1
מגייסים חלבוני סיגנאל נוספים בעלי דומייני
SH2

איפה ניתן למצוא ריכוז של חלבוני סיגנאל שמרוכזים יחדיו?
בסליה ראשונית
מה תפקידה של מערכת האיתות התוך תאית?
תפקידה של מערכת איתות תוך-תאית היא לאתר ולמדוד גירוי ספציפי במקום אחד של התא ואז לייצר תגובה מתוזמנת ומדודה כנדרש במקום אחר. המערכת מבצעת משימה זו על ידי שליחת מידע בצורת “אותות” מולקולריים מה”חיישן” אל היעד, לעיתים קרובות באמצעות סדרת מתווכים שאינם פשוט מעבירים את האות אלא מעבדים אותו בדרכים שונות.
איך הקשר בית אותו לתגובה משתנה בין תאים שונים?

איך תזמון תגובה יכול להשתנות מאות מסוג אחד לאות בסוג אחר?
משתנה באופן דרמטי במערכות איתות שונות בהתאם למהירות הנדרשת לתגובה. במקרים מסויימים כדוגמת איתות סינפטי התגובה יכולה להתרחש תוך אלפיות השניה. מקרים אחרים, כמו בבקרת גורל התאים על ידי מורפוגנים במהלך ההתפתחות, תגובה מלאה יכולה לקחת שעות או ימים.
איך הרגישות יכולה להשתנות מאות של תגובה אחת לאות של תגובה אחרת?
רגישות – הרגישות לאותות חוץ תאיים יכולה להשתנות מאוד. הורמונים נוטים לפעול בריכוזים נמוכים מאוד על תאי היעד הרחוקים שלהם, אשר רגישים מאוד לריכוזי סיגנאל נמוכים. לעומת זאת, נוירוטרנסמיטורים פועלים בריכוזים גבוהים בהרבה בסינפסה ומפחיתים את הצורך ברגישות גבוהה ברצפטורים הפוסט-סינפטיים. לעתים קרובות נשלטת הרגישות על ידי שינויים במספר הרצפטורים או הזיקה שלהם בתא המטרה. מנגנון חשוב במיוחד להגברת הרגישות של מערכת איתות הוא הגברת האותות, לפיו מספר קטן של רצפטורים על פני שטח התא מעורר תגובה תוך-תאית גדולה בין אם על ידי הפקת כמויות גדולות של שליח שניוני או על ידי הפעלת עותקים רבים של חלבון סיגנאל במורד הזרם.
איך טווח דינאמי של מערכת אותות יכול להשתנות במסלולי תגובה שונים?
קשור לרגישות שלו. מערכות מסויימות כמו אלו המעורבות בהחלטות התפתחויות פשוטות מגיבות לאורך לטווח צר של ריכוזים חוץ תאיים. מערכות אחרות כמו אלה השולטות בראייה או בתגובה המטבולית להורמונים מסויימים מגיבות בטווח רחב יותר. נראה כי טווח דינאמי רחב מושג לעיתים קרובות על ידי מנגנוני הסתגלות המתאימים את תגובת המערכת בהתאם לכמות הסיגנאל.
כיצד משך התגובה יכול להשתנות בין מסלולים שונים?
יכול להשתנות מאוד. תגובה חולפת של פחות משניה מתאימה בתגובות סינפטיות למשל, אך תגובה ממושכת ואף קבועה נדרשת בהחלטות לגבי גורל התא במהלך ההתפתחות. ניתן להשתמש במספר מנגנונים כולל משוב חיובי כדי לשנות את משך התגובה והרוורסיביליות שלה.
איך עיבוד סיגנאל יכול להשתנות בין אותו לתגובה במסלולים שונים?
תגובה דיכוטומית (יש-אין) או תגובה תנודתית. עיבוד אותות יכול להמיר אות פשוט לתגובה מורכבת. במערכות רבות, למשל, עלייה הדרגתית של הסיגנאל החוץ תאי מומרת לתגובה פתאומית, מתגית. במקרים אחרים, אינפוט של סיגנאל פשוט מומר לתגובה תנודתית, המיוצרת על ידי סדרה חוזרת של אותות תוך-תאיים חולפים.
כיצד אינטגרציה בין מולקולות שונות משתנה בין מסלולי סיגנאל שונים?
אינטגרציה מאפשרת לשלוט בתגובה על ידי אינפוטים מרובים. כפי שהזכרנו קודם, שילובים ספציפיים של סיגנאלים חוץ תאיים נדרשים בדרך כלל כדי לעורר התנהגויות תאים מורכבות כמו הישרדות תאים ופרוליפרציה שלהם. על כן, התא צריך לשלב מידע המגיע מאותות מרובים, אשר תלוי לעתים ב”גלאים” חלבוניים המופעלים רק אם הם מקבלים מספר אותות המתכנסים אליהם.
איך תיאום בין תגובות שונה בין מסלולים איתות שונים?
ניתן להשיג תיאום של תגובות מרובות בתא אחד על ידי סיגנאל חוץ תאי אחד. למשל יש כמה מולקולות סיגנאל המעוררות תא הן לגדול והן להתחלק. תיאום זה תלוי בדרך כלל במנגנונים להפצת הסיגנאל למספר גורמים על ידי יצירת “ענפים” במסלול האיתות. במקרים מסוימים, הסתעפות מסלולי איתות יכולה לאפשר לאות אחד לשנות את חוזק התגובה לאותות אחרים.
coincidence detectors
כפי שהזכרנו קודם, לעיתים נחוצה אינטגרציה בין שני אותות או יותר כדי להוביל לפעולה מסויימת. כך למשל, כפי שמודגם באיור, גם
A
וגם
B
יודעים לזרחן את
Y –
כל אחד באתר מסויים וכתלות במסלול הולכת אותות מסויים. אולם
Y
מופעל רק כאשר שני האתרים בו מזורחנים. לכן למעשה הוא הופך להיות פעיל רק כאשר שני מסלולי הולכת האותות, זה של A
וזה של
B
נמצאים בו זמנית.

במה תלוי מהירות הסיגנאל של התגובה לתא?
המהירות של כל תגובת איתות תלויה באופי מולקולות הסיגנאל התוך תאיות שמבצעות את התגובה בתא המטרה. כאשר התגובה מחייבת רק חלבונים שכבר נמצאים בתא, היא יכולה להתרחש במהירות רבה: שינוי אלוסטרי בתעלת יון תלויית נוירוטרנסמיטר יכול לשנות את הפוטנציאל החשמלי של הממברנה הפלסמטית תוך אלפיות השניה ותגובות התלויות רק בזרחון חלבונים יכולות להתרחש תוך שניות. לעומת זאת, כאשר התגובה כוללת שינוי בביטוי גנים וסינתזת חלבונים חדשים היא אורכת דקות או שעות רבות ללא קשר למצב העברת האותות.

אילו תגובות נצפה שהן יהיו מהירות ואילו תגובות נצפה שהן יהיו איטיות?
סוגים מסויימים של תגובות תאיות המושרות על ידי סיגנאל יכולות להתרחש לאט או מהר. סוגים מסויימים של תגובות כמו גידול של תאים, כרוכים בשינויים בביטוי גנטי וסינתזה של חלבונים חדשים, לכן הם מתרחשים לאט. לעתים התהליכים הללו מתחילים שעה או יותר לאחר שהאות מתקבל. תגובות אחרות כגון שינויים בתנועת התאים, בהפרשה או בחילוף החומרים, אינן כרוכות בשעתוק גנים ולכן מתרחשות במהירות רבה יותר, לפעמים תוך שניות או דקות. הן עשויות לכלול זרחון מהיר של חלבונים אפקטוריים בציטופלסמה למשל. תגובות סינפטיות מתווכות על ידי שינויים בפוטנציאל הממברנה הן אפילו מהירות עוד יותר ויכולות להתרחש בפרק זמן של אלפיות השניה – כפי שנראה בפיזיולוגיה. אם כן, חלק ממערכות האיתות מייצרות תגובות מהירות ואיטיות ומאפשרות לתא להגיב במהירות לאות ובמקביל ליזום תגובה מתמשכת לטווח הארוך יותר.
מתי ההשפעה של סיגנאל חולפת?
- האות החוץ תאי נעלם
- סיגנאל מפעיל את השפעתו על ידי שינוי הריכוזים של מולקולות תוך תאיות קצרות חיים (מולקולות לא יציבות) העוברות תחלופה מתמדת.
כיצד שיעור התחלופה של מולקולות יכול לקבוע מהירות של תגובה?
שיעור התחלופה של מולקולות תוך תאיות יכול לקבוע את מידת התגובה שהתא ייצור כשיגיע אליו אות חוץ תאי, ותגובה מהירה יכולה להתרחש אם גם הפירוק מהיר
מה הגרף הא מייצג?

נם תהליכים שנעשים בפתאומיות והתגובה מתחלפת בין נמוכה לגבוהה ללא כל תגובת ביניים (קו ירוק), ישנם תהליכים שמגדילים בהדרגה את ריכוז מולקולת הסיגנל החוץ תאית שמגיעה לבסוף לרוויה, מה שיוצר עקומה היפרבולית (קו כחול), ישנם תהליכים שבהם מעכת הסיגנאלים יוצרת עקומה סיגמואידיאלית (קו אדום) משום שהיא מפחיתה את התגובה בריכוזים נמוכים של סיגנאל וכך יוצרת תגובה תלולה יותר באיזשהו ריכוז ביניים.
מה הגרף הבא מייצג?

עקומת שפעול עבור חלבון אלוסטרי כפונקציה של ריכוז המולקולות המפעילות (תמונה ימנית): העקומות בתרשים הימני מראות כיצד החדות של תגובת ההפעלה גדלה עם עלייה במספר המולקולות המשפיעות האלסטריות, שחייבות להיות קשורות בו-זמנית כדי להפעיל את חלבון המטרה. העקומות המוצגות הן אלה הצפויות בתנאים מסוימים – כאשר ההפעלה דורשת חיבור סימולטני של 1, 2, 8, או 16 מולקולות.
האם לרוב החלבונים יש זמן חיים קצר או ארוך
קצר
למה שייכים מרבית הרצפטורים שעל התא?
רצפטורים מצומדים לתעלות יונים
רצפטורים מצומדי חלבוני G
רצפטורים מצומדי אנזים
מה הם רצפטורים שמצומדים לתעלות יונים?
מכונים גם או
transmitter-gated ion channels
או
ionotropic receptors
מעורבים באיתות סינפטי מהיר בין תא עצב לבין תאי יעד אקסיטביליים אחרים כמו תאי עצב ותאי שריר. איתות מסוג זה מתווך על ידי מספר מצומצם של נוירוטרנסמיטרים, הסוגרים או פותחים תעלה יונית באופן זמני. רוב הרצפטורים השייכים למחלקה הזו שייכים למשפחה גדולה של חלבונים הומולוגיים שהם
multipass transmembrane proteins

רצפטורים מצומדי חלבוני G
פועלים על ידי רגולציה בלתי ישירה של חלבון יעד אחר, קושר ממברנה שהוא בדרך כלל אנזים או תעלה יונית.
הפעולה מתבצעת באמצעות חלבון קושר
GTP
טרימרי המתווך את האינטרקציה בין הרצפטור המאוקטב לחלבון היעד. הפעלת חלבון המטרה יכולה לשנות את ריכוזן של מולקולות סיגנאל תוך תאיות קטנות (אם חלבון המטרה הוא אנזים) או לשנות את חדירות היונים

רצפטורים מצומדי אנזים
מתפקדים באנזימים או נקשרים ישירות לאנזימים שהם מפעילים. לרוב מדובר ב-
single-pass transmembrane proteins
שהם בעלי אתר קישור לליגנד בחלק החוץ תאי ואתר קטליטי או אתר קישור לאנזים תוך תאי. רצפטורים מצומדי אנזים הם מגוונים מאוד במבחינת המבנה שלהם לעומת שני הסוגים האחרים עליהם דיברנו. עם זאת, רובם הם פרוטאין קינאזות או קשורים לפרוטאין קינאזות המזרחנים קבוצות חלבונים ספציפיות בתא המטרה כאשר מופעלים. עוד נציין כי ליגנדים מפעילים את מרבית הרצפטורים הללו על ידי קידום דימריזציה שלהם, מה שמביא לאינטראקציה והפעלת הדומיינים הציטופלסמטיים.

על מה מולקולות סיגנאל יכולות להשפיע
- על תהליכים מטאוליים
- על תהליכים בתוך הגרעין
- על הציטוסקלטון
מה הם המשפחה הגדולה ביותר של הרצפטורים?
gpcr
אילו חושים תלויים ברצפטורים ממשפחת
gpcr?
ריח וראייה
מולקותלת סיגנאל אחת יכולה להפעיל
gpcr
אחד
לא נכון מולקולות סינגנאל אחת יכולה להפעיל מולקולות
gpcr
רבות
מה
gpcr
סופר פאמילי כוללות?
כוללת רודופסין, החלבון המופעל על ידי אור בעיניהם של חולייתנים וכן מספר גדול מאוד של קולטני ריח בחולייתנים. בני משפחה אחרים נמצאים באורגניזמים חד-תאיים: הרצפטורים בשמרים המזהים גורמי הזדווגות המופרשים הם דוגמה לכך. סביר להניח שה-
GPCR
המתווך איתות תא-תא באורגניזמים רב-תאיים התפתח מהרצפטורים התחושתיים באבותיהם האאוקריוטים החד-תאיים.
מה המבנה של ה-
gpcr?
למרות המגוון הכימי והתפקודי של מולקולות הסיגנאל שמפעילות אותם, כל רצפטורי ה-
GPCR
הם בעלי מבנה דומה: הם מורכבים משרשרת פוליפפטידית יחידה המתברגת על פני הממברנה הדו שכבתית
7
פעמיםכך שהקצה הקרבוקסילי בתוך התא, והאמיני מחוץ לתא. הם יוצרים מבנה גלילי, ולעיתים קרובות במרכזם אתר עמוק לקישור הליגנד. בנוסף לאוריינטציה האופיינית שלהם בממברנה הפלסמטית, כולם משתמשים בחלבוני
G
בכדי להעביר את האות אל פנים התא.
איזה גודל יהיה לרצפטור
g
כאשא הליגנד הוא קטן ומה יקרה כאשר הליגנד הוא גדול?
ל- GPCR
שקשורים ליגנדים קטנים כמו אדרנלין יש דומיינים חוץ תאיים קטנים והליגנדים בדרך כלל נקשרים עמוק, לאתר שנוצר על ידי חומצות אמינו מכמה מקטעים טראנסממברנאלים. לעומת זאת, ל-
GPCR
שקושרים ליגנדים חלבוניים יש דומיין חוץ תאי גדול

מה התפקיד של הרצפטור הבא?

קושר אדרנלין
איך
gpcr
פועל?
מה קשור אליו?
כיצד זה קשור אליו?
כאשר מולקולת סיגנאל חוץ תאית נקשרת ל-
GPCR
הרצפטור עובר שינוי קונפורמטיבי המאפשר לו להפעיל חלבון קושר
GTP
טרימרי
שמצמד את הרצפטור לאנזימים או לתעלות יוניות בממברנה. בחלק מהמקרים חלבון ה-
G
קשור פיזית לרצפטור עוד לפני הפעלת הרצפטור ובמקרים אחרים הוא נקשר רק לאחר שהרצפטור הופעל. ישנם סוגים שונים של חלבוני
G
שכל אחד מהם ספציפי לקבוצה מסויימת של
GPCR
ולקבוצה מסויימת של חלבוני מטרה בממברנה הפלסמטית.
חלבון ה-
G
עצמו מכיל שלוש תת יחידות: אלפא, בטא וגמא. אלפא וגמא מעוגנות לממברנה הפנימית דרך ליפיד ובטא קשורה לגמא. במצב ללא גירוי, תת היחידה אלפא קשורה ל-
GDP
וחלבון ה-
G אינו פעיל. כאשר ה-
GPCR
מופעל, הוא פועל כ-
GEF
ומשרה על תת יחידה אלפא את השחרור של ה-
GDP.
כך מתאפשר קישור של
GTP
חדש לתת היחידה אלפא. כשזה קורה, תת יחידה אלפא שקושרת את ה-
GTP
עוברת שינוי קונפורמטיבי שמאקטב אותה וכתוצאה מכך מנתקת את חלבון ה-
G
מהרצפטור וכן מפעילה ניתוק שלה מהצמד בטא-גמא (שיוצרים יחידה פונקציונאלית אחת). גם אלפא וגם בטא-גמא נקשרים לחלבוני מטרה שונים כמו אנזימים ותעלות יונים בממברנה הפלסמטית שמעבירים את הסיגנאל הלאה.
מה הזמן שדורש לאלפא להפוך מאלפא
gtp
לאלפא
gdp?
זמן יחסית קצר
עי מי תת יחידה אלפא ב-
g protein
יכולה לעבור הידרוליזה
חלבון המטרה או
RGS – regulator of G protein signaling
אלה ספציפיים לתת יחידה אלפא ומתפקדים כ-
GAP.
ישנם כ- 25
חלבוני
RGS
המקודדים בחלבון האנושי שכל אחד מהם מקיים אינטראקציה עם קבוצת חלבוני
G
מסויימת.
מה מכיל הדומיין של תת יחידה אלפא
- דומיין ה-
Ras
הקשור ל-
GTPases
אחרים ומספק צד אחד של הכיס קשור נוקליאוטיד,
- ואת ה-
alphahelical domain
או “AH” המהדק את הנוקלאוטיד במקום.
מה קורה בתמונה הבאה?

- קישור מולקולת סיגאנל חוץ תאית נקשרת ל-
GPCR
ומשנה את הקונפורמציה שלו.
- שינוי הקונפורמציה מאפשר לרצפטור לקשור חלבון
G
טרימרי ולשנות את הקונפורמציה של חלבון ה
-G
הטרימרי.
- דומיין ה-
HA
של תת היחידה אלפא בחלבון ה-
G
נעה החוצה לפתיחת האתר קושר הנוקלאוטיד וכך מתקדם הליך ההתנתקות של
GDP
ממנה.
- מתרחשת קשירת
GTP
שמקדמת את סגירת האתר קושר נוקלאוטיד וגורמת לשינוי קונפורמציה שמוביל לדיסוציאציה של תת היחידה אלפא מהרצפטור ומקומפלקס בטא-גמא.
- תת היחידה אלפא הקושרת
GTP
וקומפלקס בטא גמא מווסתים כל אחד את הפעילות של מולקולות סיגנאל במורד הזרם (לא מוצג באיור).
- הרצפטור נשאר פעיל בזמן שמולקולת הסיגנאל החוץ תאית קשורה אליו, ולכן היא יכולה לזרז את ההפעלה של מולקולות חלבון
G
רבות נוספות.
על איזה רצפטור מבוססות לפחות 50 אחוז מהתרופות שיוצאות?
רצפטורים מסוג
GPCR
מדוע
camp
חשוב?
כפי שהזכרנו קודם,
cAMP
משמש כשליח שניוני בכמה מסלולי איתות. אות חוץ תאי יכול להגדיל את ריכוז ה-
cAMP
יותר מפי 20 תוך שניות
מה קורה בתמונה הבאה?

הנוירון מגיב לנויורוטרנסמיטר סרוטונין הפועל באמצעות
GPCR
ומוביל לעליה ב-
cAMP.
על מנת לנטר את כמות ה-
cAMP
התא הוטען בחלבון פלאורסנטי שמשנה את הפלורסנציה כשהוא פוגש
ATP –
צבע כחול מציין רמת
cAMP
נמוכה, צהוב – רמה בינונית ואדום – רמה גבוהה. במנוחה, רמות ה-cAMP
האם
camp
יכול להוביל לשינוי ארוך טווח בתא?
כן
כיצד
camp
מסונטזת ?
AMP מסונתזת מ-ATP באמצעות האנזים
adenylyl cyclase
תוך יציאת פירופוספט.
שמפורק עי פירופוסאטז

מה הוא אדנילאט ציקלאז?
מה הוא?
כמה איזופואמים יש לו ביונקים?
adenylyl cyclase
הוא חלבון חוצה ממברנה מספר פעמים עם דומיין קטליטי בצד הציטוזולי של הממברנה הפלסמטית. יש לפחות 8 איזופורמים שלו ביונקים, ורובם מבוקרים הן על ידי חלבוני
G ו
הן על ידי יוני סידן.
עי מי מפורקת
camp?
cyclic AMP phosphodiesterases
מה יקרה ל-camp
כאשר היא תפגוש פוספודיאסתראז?
camp
תהפול
ל-5amp
איך אותות חוץ תאיים שקשרורים ל-
gpcr
פועלים
או עי הגדלת הכמות של
campמ
או עי הורדת הכמות
של
camp
לאיזה רעלן
gs
הוא מטרה
וכיצד הוא מנצל אותו?
לרעלן הכולירה
המיוצר על ידי החיידק הגורם לכולירה הוא אנזים אשר מזרז את העברת
ADP ribose
מ
NAD+
תוך תאי לתת יחידה אלפא של
Gs.
ריבוזילציה זו משנה את תת יחידה אלפא כך שהיא לא יכולה עוד לבצע הידרוליזה של ה-
GTP
הקשור שלה, וכך למעשה גורמת לו להישאר במצב פעיל, מה שגורר יצירת
cAMP
ללא הגבלת זמן. העליה הממושכת בריכוזי
cAMP
בתאי האפיתל של המעי גורמת לזרם גדול של יוני כלור ומים למעי ולכן מובילה לשלשול הקשה המאפיין כולירה.
לאיזה רעלן
gi
הוא מטרה?
רעלן השעלת
(Pertussis toxin),
המיוצר על ידי החיידק הגורם לשעלת, מזרז את הריבוזילציה של
ADP
על גבי תת יחידה אלפא של
Gi
ובכך מונע ממנו לתקשר עם הרצפטור. כתוצאה מכך חלבון ה-
G
נשאר במצב לא פעיל ואינו מסוגל לבקר את חלבוני המטרה של
איך התאים הבאים מתנהגים כאשר יש הרבה
camp?
בלוטת תירואיד
אדרנל
שחלות
עצם
לב
כבד
כליה
שומן

מהו מסלול ה-
gs
1.במסלול הקלאסי בו
Gs
משופעל, למשל על ידי ההורמון גלוקגון או אדרנלין, הוא נודד על גבי הממברנה (הוא כאמור חלבון מעוגן על ידי קישור של חומצת שומן) ומשפעל את האנזים האינטגרלי
adenylyl cyclase.
- כאשר זה משופעל על ידי האינטראקציה עם תת היחידה אלפא המשופעלת, הוא מזרז יצירה של
cAMP.
- cAMP
מצטבר בתא ויכול להוביל לתגובות תאיות תוך שניות כפי שראינו לפני שני שקפים. אולם תגובות אחרות המתווכות על ידי
cAMP
מתרחשות תוך שעות עד שהן מתפתחות באופן מלא כפי שנראה עכשיו.
- cAMP
משפעל את האנזים
PKA cyclic-AMPdependent protein kinase
הדבר נעשה על ידי קישור ליחידות הרגולטריות של האנזים : קישור
cAMP
ליחידות הרגולטוריות
מכונות Aקינאזות
גורם לשינוי קונפורמציה שלהן ולהתנתקותן מהקומפלקס. כעת, תת היחידות הפעילות של
PKA
חופשיות לפעול. יחס הקישור הוא
2
מולקולות
cAMP
לכל יחידה רגולטורית
סך הכל 4
- PKA
המשופעל יכול להמשיך ולזרחן חלבונים אחרים, על גבי חומצה אמינית סרין או תריאונין

איך
camp
משפיע בתאים שמפרישים סומטוסטטין?
בתאים המפרישים את ההורמון הפפטידי סומטוסטטין,
cAMP
מפעיל את הגן המקודד להורמון זה. האזור הרגולטורי בגן מכיל רצף
cis
רגולטורי קצר המכונה CRE
שנמצא בעוד גנים המופעלים באמצעות
cAMP
פקטור שעתוק בשם
CRE-binding (CREB) protein
מכיר את הרצף הזה. כאשר
PKA
מופעל הוא מזרחן את
CREB
על סרין יחידה.
CREB
המזורחן מגייס אקטיבטור שעתוק בשם
CBP
המגרה שעתוק גנים
כך
CREB
יכול להפוך סיגנאל
cAMP
קצר לשינוי ארוך טווח בתא, תהליך שבמוח נחשב לכזה הממלא תפקיד חשוב בכמה צורות של למידה וזיכרון

למה עוזרות תת היחידות הרגולטוריות של
מה קורה בשריר הלב
תת היחידות הרגולטוריות של
PKA
חשובות למיקום נכון של הקינאז הזה בתא.
AKAPs
מיוחדים נקשרים לשתי היחידות הרגולטוריות הללו מצד אחד ולרכיב של השלד התאי או הממברנה מהצד השני, ובכך קושרים את האנזים לאזור מיוחד.
חלק מאותם
AKAPs
קושרים גם חלבוני סיגנאל אחרים ויוצרים קומפלקס איתות. כך למשל
AKAP
הנמצא סביב גרעין שריר הלב קושר גם
PKA
וגם
phosphodiesterase
שמבצע הידרוליזה ל-
cAMP
בתאים שלא עברו גירוי,
ה-phosphodiesterase
שומר על ריכוז מקומי נמוך של
cAMP
כך שה-
PKA
לא פעיל. בתאים שעברו גירוי ריכוז ה-
cAMP
עולה במהירות, מתעלה על פעילותו של
phosphodiesterase
ומפעיל את
PKA.
בין חלבוני המטרה שמזרחן ומפעיל
PKA
מצוי ה- phosphodiesterase
הסמוך, שמוריד במהירות את ריכוז
ה-cAMP
שוב. המשוב השלילי הזה מונע את מה שיכול להיה להיות תגובת
PKA
ממושכת וגורם לכך שהתגובה של
PKA
תהיה קצרה, מקומית ובפולסים קצרים.
אילו שני סוגים של
Pka
יש ביונקים?
סוג 1 נמצא בעיקר בציטוזול, ואילו סוג 2 נקשר באמצעות תת היחידות הרגולטוריות שלו וחלבוני העיגון המיוחדים לממברנה הפלסמטית, לממברנת הגרעין, לממברנה החיצונית של המיטוכונדריה ולמיקרוטובולי. בשני הסוגים, ברגע שהיחידות הקטליטיות משוחררות ופעילות, הן יכולות לנדוד לתוך הגרעין (שם הם יכולים לזרחן חלבונים מבקרי שעתוק), ואילו תת היחידות הרגולטוריות נשארות בציטופלזמה.
עי מי
gpcr
יכול
להפעיל פוספוליפידים מהסוג של אינוזיטול.
רצפטורים שמפעילים מסלול איתות של פוספוליפידים מסוג אינוזיטול עושים זאת בעיקר באמצעות חלבון
G
הנקרא
Gq
שמפעיל את הפוספוליפאז
C-β
באותה צורה שבה
Gs
מפעיל אדניליל ציקלאז.
מה הוא המסלול של
g-q
לתאר את ההשתנות של
pkc
ועי מי הוא מופעל בכל אחד מהפעמים
שוב תת היחידה אלפא משוחלפת, שוב נודדת על הממברנה כיוון שקשורה לחומצת שומן, רק שהפעם היא תשפעל את האנזים פוספוליפאז בטא
plc beta
האנזים פוספוליפאז
beta
יודע לזהות מולקולת
4,5-bisphosphate [PI(4,5)P2]
(שנמצאת בכמויות קטנות בחלק הפנימי של הממברנה הפלסמטית)
ולפרק אותה ל-
DAG diacylglycerol
ול-
3IP
inositol 1,4,5-trisphosphate.
3IP
ההידרופילית נודדת לרשתית האנדופלסמטית שם היא פותחת תעלת סידן
(gated Ca2+-release channels
שגם נקראות
receptors),
ואילו
DAG
נשאר על הממברנה הפלסמטית שם יש לו מספר תפקידי איתות, כשאחד העיקריים הוא היותו משמש כנקודת עיגון ל
PKC (protein kinase C
קרוי כך כי הוא תלוי בסידן.
העלייה הראשונית ביוני הסידן בציטוזול הנגרמת בזכות פעולתו של
IP3
משנה את
PKC
כך שהוא משנה מיקום מהציטוזול לפנים הציטופלסמטיים של הממברנה הפלסמטית, שם הוא מופעל על ידי השילוב של יוני סידן,
DAG
ופוספטידילסרין.
PKC
מזרחן חלבונים רבים, רובם שונים מאלו של
PKA
ומשתנים בהתאם לסוג התא.
DAG יכול להמשיך ולעבור ביקוע ולשחרר חומצה ארכידנואית שהיא כלשצמה בעלת תפקידים רבים כיוון שיכולה לתת איקוזונואידים ופרוסטגלנדינים.

אילו קבוצות של פוספוליפאז c
ישנן?
אלה כוללות את מחלקת ה-
β
שמופעלת על ידי
GPCRs
וכפי שנראה בהמשך, מחלקת
ה-γ
מופעלת על ידי מחלקה של רצפטורים מצומדי אנזים הנקראים רצפטורי טירוזין קינא
מה ניתן לעשות לאחר שביקענו את
dag עי
gpcr
כפי שהזכרנו, ניתן לבקע את
DAG
ליצירת חומצה ארכידונית, שיכולה לשמש סיגנאל בפני עצמה או שניתן להשתמש בה בסינתזת מולקולות סיגנאל ליפידיות קטנות אחרות המכונות איקוזונואידים. מרבית החולייתנים מייצרים איקוזונואידים הכוללים גם פרוסטגלנדינים שהם בעלי פעילויות ביולוגיות רבות – הם משתתפים בתגובות כאב ובתגובות דלקתיות. תרופות אנטי דלקתיות רבות (כדוגמת אספירין, איבופרופן וקורטיזון) פועלות בחלקן על ידי עיכוב הסינתזה שלהם.
מדוע סידן היא מולקולת הפרשה יעילה?
זאת משום שריכוזו בציטוזול נמוך מאוד
(~10–7 M)
ואילו בנוזל החוץ תאי
(~103 M)
ובלומן ה-
ER
הוא גבוה
. כאשר סיגנל פותח באופן זמני תעלות סידן על ממברנת התא או את ממברנת ה-
ER
, ישנו מפל ריכוזים גדול הנוטה להעלות את רמת הסידן בציטוזול: סידן נכנס לציטוזול והעלייה המקומית, שהיא פי 10-20 בריכוז הסידן, מפעילה חלבונים תלויי סידן.
מה הוא מקור הסידן?
גירויים מסויימים כמו דפולריזציה של הממברנה, מתיחת הממברנה או אותות תוך תאיים מסויימים מפעילים תעלות סידן בממברנה הפלסמטית וכתוצאה מכך סידן נכנס מחוץ התא פנימה.
לעומת זאת, אותות אחרים, כולל אלו המתווכים באמצעות
GPCR
כמו זה שתואר קודם פועלים בעיקר באמצעות רצפטורי
IP3
על מנת לעורר שחרור סידן
מה-ER.
ממברנת ה-
ER
כוללת גם סוג שני של תעלות סידן הנקראות
ryanodine receptor
אשר נפתחות בתגובה לעליה ברמות יוני הסידן ובכך מסייעות להגביר את אות הסידן.
מה הוא התפקיד החשוב שיש לרצפטורי
ip3
ולרצפטורי הרייאונדין?
שניהם מעוררים על ידי ריכוז ציטופלסמה נמוך עד בינוני.
מה יש לתאים העושים שימוש נרחב באותות באמצעות סידן?
טרנספורטר נוסף של יוני סידן
(Na+-driven Ca2+ exchanger)
בממברנה הפלסמטית המצמד את שטף הסידן לשטף הנתרן.
מה קורה בתמונה הבאה?

הפריה של ביצית על ידי זרע מעורר גל של סידן בציטוזול: בתמונה השמאלית רואים גל של סידן ציטוזולי המופרש מה-
ER
בכיוון כניסת הזרע. גל הסידן גורם לגל שינויים על פני תא הביצית, מונע כניסת תאי זרע אחרים וגם יוזם התפתחות עוברית.
העלייה הראשונית בריכוז הסידן נגרמת כתוצאה מצורה של
PLC
ספציפי לתאי זרע –
PLCζ
שהזרע מביא לציטופלסמה של הביצית כאשר הוא מתמזג איתה.
הוא שובר
2PIP
ליצירת
3IP
שמוביל לשחרור סידן מה-
ER
של הביצית. השחרור של הסידן מגרה שחרור נוסף מה שמוביל להתפשטות הגל.
אילו אינדיקטורים פלורסנטיים יכולים לנתר את רמות הסידן?
aequorin ו- fura-2
עי מה מעוכבים
Ip3
וראיינאודין ולמה הם גורימים?
על ידי ריכוזי סידן גבוהים, כך שעלייה בסידן בתא מובילה לעיכוב שחרור סידן. מכיוון שמשאבות הסידן מסירות את עודפי הסידן הציטוזולי, ריכוז הסידן נופל, מה שמקל בסופו של דבר על המשוב השלילי הזה ומאפשרת לסידן הציטוזולי לעלות שוב.
התוצאה – תנודתיות בריכוז הסידן. התנודות הללו נמשכות כל עוד הרצפטורים פועלים. תדירות התנודות משקפת את חוזק הגירוי החוץ תאי.
מה התוצאה של התנודתיות בריכוז הסידן?
איך ניתן לשנות את התדירות של התגובה?
דוגמאות
על ידי מנגנוני איתות אחרים כמו זרחון המשפיעים על הרגישות לסידן של תעלות סידן או שמשפיעים על רכיבים אחרים במערכת. אם כן, ראינו שמדובר בתנודתיות בריכוז הסידן. אבל התגובה בסופו של דבר יכולה להיות תנודתיות ויכולה גם שלא. כך למשל בתאי בלוטת יותרת המוח המפרישים הורמונים, תנודתיות הסידן מובילה להתפרצויות של הפרשת הורמון (בכל תנודה יופרש הורמון). לעומת זאת בסוגים מסויימים של תאים תנודה מסויימת של סידן מובילה לתהליך של שעתוק גנים, ויותר מזה, תנודות חזקות יותר מובילות לתהליך של שעתוק גנים אחרים! כיצד זה קורה? ככל הנראה באמצעות חלבונים רגישים לסידן המשנים את פעילותם כפונקציה של תדירות הסידן המגיע אליהם.
מי הוא החלבון החשוב ביותר אליו נקשר הסידן?
איפה הוא נמצא?
ממה הוא מורכב?
כמה אתרים אצלו יכולים לקשור סידן?
סידן יכול להיקשר למספר חלבונים תוך תאיים קושרי סידן והחשוב בהם הוא קלמודולין, שנמצא בכל התאים האאוקריוטים ולעיתים אף מגיע ל-1% ממסת החלבון הכוללת של התא. מולקולת הקלמודולין מתפקדת כרצפטור סידן תוך תאי. היא מורכבת משרשרת פוליפפטיד יחידה ושמורה ביותר בעלת שני אתרים המסוגלים לקשור כל אחד שני יוני סידן

באיזה צורה קלמדולין קושר את הסידן?
בצורה קואפורטיבית כלומר בצורה סיגמואידלית
מה בדרך כלל עושה קומפלקס קלמדולין סידן?
זה מאפשר לו להיקשר לחלבוני מטרה שונים כדי לשנות את פעולותיהם
מה משפעת את המשאבה שדוחפת סידן לתוך ה-
er?
קלמדולין סידן
עי מי השפעות סידן מתווכות?
השפעות רבות של סידן הן עקיפות יותר ומתווכות על ידי זרחון חלבונים המתרחש על ידי משפחת קינאזות הנקראות
Ca2+/calmodulin-dependent kinases (CaM-kinases).
חלק מהם מזרחנים פקטורי שעתוק כמו למשל את
CREB
(\ובדרך זו מפעילים או מעכבים את השעתוק של גנים ספציפיים.
מי הם האנזים הנחקרים ב-
cam?
Cam-kinaseII
איפה
cam kinase 2
נמצא?
במערכת העצבים המרכזית, מרוכז מאוד בסינאפסות
מה המבנה של
cam2
12 עותקים של האנזים מורכבים לזוג טבעות דבוקות כאשר הדומיין שלו נמצא מבחוץ
מה המבנה המיוחד של
cam kinase
מאפשר?
ומה ככל הנראה התפקיד שלו במערכת העצסים?
המבנה המיוחד הזה מאפשר לו לפקד כ”מכשיר זיכרון מולקולרי” – כל תת יחידה עוברת למצב פעיל כאשר נחשפת לקלמודולין פעיל (עם סידן) ונותרת פעילה גם לאחר שהסיגנל של הסידן דעך. כיצד? כאשר קלמודולין מפעיל אותן, תתי היחידות מזורחנות – עוברות אוטופוספורילציה ואז הן נעשות פעילות. כאשר תת יחידה מסוימת מזורחנת היא נותרת פעילה גם בהיעדר סידן ובכך מאריכה את פעילות הקינאז מעבר לסיגנל הסידן ההתחלתי.
נראה שיש לאנזים זה תפקיד בסוגים מסוימים של זיכרון ולמידה במערכת העצבים של חולייתנים. לעכברים מוטנטים שחסרים צורה ספציפית למוח של האנזים הזה יש פגמים ספציפיים ביכולתם לזכור היכן הדברים נמצאים.
כיצד מופעל
cam kinase?
1.לכל חלבון
CaM-kinase II
יש שני דומיינים מרכזיים –
aminoterminal kinase domain
ו- carboxyl-terminal hub domain.
שניהם קשורים על ידי מקטע רגולטורי.
- שישה חלבוני
Cam-kinaseII
מורכבים ליצירת טבעת ענקית בה
ה- hub domains
הדוקים כדי ליצור מבנה מרכזי מורכב בדומייני קינאז.
- האנזים השלם מכיל 2 טבעות ה”דבוקות” זו לזו, וסה”כ 12 חלבוני קינאז, אך באיור מוצגת רק טבעת אחת לשם הפשטות.
- כאשר האנזים אינו פעיל, הטבעת נמצאת בשווי משקל דינאמי בין שני מצבים: הראשון (משמאל למעלה) הוא מצב קומפקטי בו דומייני הקינאז מקיימים אינטארקציה עם דומיין ה-
hub
כך שהמקטע הרגולטורי קבור באתר הקינאז – מה שחוסם את הפעילות הקטליטית של הקינאז. במצב הלא פעיל השני (למעלה, באמצע). דומיין הקינאז מציץ החוצה וקשור לדומיין ה -
hub
על ידי המקטע הרגולטורי שממשיך לכבות את הקינאז, אך כעת הוא נגיש לקלמודולין (עם סידן).
- אם האחרון נמצא בסביבה, הוא ייקשר למקטע הרגולטורי וימנע ממנו לעכב את הקינאז, מה שינעל את הקינאז במצב פעיל (למעלה, מימין).
- אם תת היחידה הסמוכה גם כן “תציץ” גם היא תופעל על ידי קלמודולין (עם סידן) ושני הקינאזות יזרחנו האחד את השני במקטע הרגולציה (למטה, מימין). האוטופוספורילציה הזו תפעיל עוד יותר את האנזים.

איך
הדרך בה ה-
cam kinase 2
נקשר לסידן מאריכה את זמן פעילות האינזים
הדבר מאריך את פעילות האנזים בשתי דרכים:
ראשית, קלמודולין (עם סידן) קשור כך שהוא לא יתנתק מהאנזים עד שרמות הסידן הציטוזוליות יחזרו לערכי הבסיס במשך 10 שניות לפחות שנית, הוא ממיר את האנזים לצורה בלתי תלויה בסידן – כך שהקינאז נשאר פעיל גם לאחר שהקלמודולין (עם סידן) מתנתק ממנו
. פעילות זו נמשכת עד שפעילות הפוספטאז גוברת על זו של האוטופוספורילציה של הקינאז.
איך נשלטת פעילות האינזים
cam 2 kinase?
פונקציה של תדירות הפולסים של סידן
מה יקרה ל-
cam 2
kinase
בריכוזים נמוכים של סידן?
בתדירויות נמוכות של סידן האנזים הופך לא פעיל אחרי כל פולס כיוון שהאוטופוספורילציה הנגרמת על ידי קשירת קלמודולין (עם סידן) אינה שומרת על פעילות האנזים מספיק זמן כדי שהוא יישאר פעיל עד שיגיע פולס הסידן הבא.
מה יקרה לאינזים
cam 2
Kinase
בפולסים רבים של סידן?
בתדירויות גבוהות יותר של פולסים האנזים נכשל בלעבור למצבו הלא פעיל כך שלמעשה פעילותו מתארכת עם כל פולס. אם התדירות תישאר מספיק גבוהה, האוטופוספורילציה תתרחש בכל תתי היחידות ולכן הוא יפעל בצורה מקסימלית.
עי איזה חלק באינזה
cam 2
kinase
נשלטת פעילותו?
עי מקטע רגולטור
האם חלבוני
G
פועלים אך ורק דרך בקרה על פעילותם של חלבונים ממבראנאלים
המשנים את רמות ה-
camp?
דוגמאות
חלבוני G לא פועלים אך ורק דרך בקרה על פעילותם של אנזימים ממברנאליים המשנים את הרמות של
cAMP
וסידן בתא
תת יחידה אלפא של
G12
לדוגמה, מפעילה
GEF
של חלבון
G
מונומרי ממשפחת
Rho
המבקר את שלד התא של סיבי האקטין.
חלבוני
G
מפעילים או מכבים באופן ישיר תעלות יונים בממברנת התא של תאי מטרה ובכך משנים את החדירות של היונים ואת האקסיטביליות של הממברנה. למשל אצטילכולין המשתחרר מעצב הואגוס ומוריד את קצב הלב.
אצטילכולין נקשר ל-
GPCR
שלו והתהליך מתווך על ידי
Gi
כאשר תת יחידה אלפא מעכבת את אדניליל ציקלאז ואילו תת יחידות בטא-גמא נקשרות לתעלות אשלגן ופותחות אותן. הפתיחה של תעלות האשלגן הללו מקשה על הדפולריזציה של התאים ובכך תורמת לאפקט המעכב של אצטילכולין על תאי הלב.
איך קוראים למסלול שאותו עושה מנגנון
rods?’
ואיך הוא נעשה?
Gt
- רודופסין הינו רצפטור מסוג
GPCR
שמופעל בתגובה לאור. כתוצאה מגירוי הרצפטור רודופסין על ידי האור, השייר ה- 11 משנה קונפורמציה מציס לטראנס והדבר גורם לתת יחידה אלפא להיות מופעלת. היא מאקטבת את
cGMP
פוספודיאסטראז שמפרק את
cGMP
. כתוצאה מכך נגרמת סגירת תעלות סידן ונתרן והיפר (רה) פולריזציה.
בחושך לעומת זאת, הרודופסין לא מאוקטב, האנזים שמפרק
cGMP
לא מעוכב ויש לכן כמות רבה של
cGMP .
כמות זו תגרום לתעלות הקטיונים להיות פתוחות והתא עובר דפולריציה.
איל מנגננוני בקרה שליליים יש ל
rods?
1.קיים למערכת קינאז יעודי הקרוי
Rhodopsin Kinase –
אנזים מזרחן את הזנב הציטוזולי של הרצפור רודופסין על מספר שיירי סרין ומונע את היכולת של הרצפטור לשפעל את תת היחידה אלפא.
- חלבון ממשפחת הארסטין
בתמונה מופיעה כ
Recovrin
או
Recov
נקשר לזנב המזורחן ומגביר את חוסר היכולת של הרצפטור להיקשר לתת היחידה אלפא.
- חלבון ממשפחת ה
RGS
נקשר לתת היחידה אלפא
Gt
ומעודד הידרוליזה של
GTP
ולהפסקת פעילותו
4.הירידה החדה בסידן שנגמרה כתגובה לאור המפורטת מעלה, גורמת לשפעול האנזים
Guanylyl Cyclase
וליצירה מחודשת של
cGMP.
פעולה זה נעשית על ידי חלבון ייחודי הרגיש לסידן ולא באופן ישיר. החלבון הייחודי, בניגוד לקלמודולין, מעוכב על ידי סידן ומשופעל רק כאשר הסידן יורד.
מה קורה לבני אדם בעלי מוטציה ב-
RK?
מגלים תגובה מוארכת לחשיפה לאור
Prolonged light Response
כיצד פועלת מערכת הריח?
מהו
NO?
רדיקל חפשי יציב הפועל כמולקולת סיגנל ברקמות רבות בבעלי חיים ובצמחים.
איפה מתקיים מסלול ה-
NO?
מסלול ה-
NO
מתקיים בכל מיני רקמות, כמו למשל אפיתל, נוירונים ואחת הרקמות הייעודיות לפעילותו של
NO
היא רקמת שריר חלק של כלי דם: ביונקים,
NO
אמור לגרום להרפייה של שריר חלק בכלי דם וכך בעצם לגרום להרחבה שלו.
מהו תיאור המסלול של
NO?
- אצטיל כולין נקשר לרצפטור
Gq
כפי שהזכרנו קודם, פעולה הגורמת לעלייה של
3IP
ולכן עלייה של סידן.
- סידן משפעל את האנזים
NO
סינתאז
(NOS)
המנצל ארגינין ליצירת
NO
( נוצר על ידי דה אמינציה של ארגינין).
כל זה קורה באנדותל – התאים המצפים את כלי הדם.
3.ה-
NO
הוא גז הנע בזריזות לתאי שריר חלק הסמוכים, נקשר לאנזים גואנייל-ציקלאז ומשפעל אותו.
4.זה גורם לעלייה ב
cGMP
שגורם להרפיה של שריר חלק

מה ההשפעה של
NO?
ההשפעה של
NO
היא מקומית בלבד כיוון שזמן מחצית החיים שלו הוא בין
5 ל- 10 שניות, לפני שהוא הופך לנירטאטים וניטריטים בנוכחות חמצן ומים.
מה זה אנגינה ולמה משתמשים בניטרוגליצין כדי לרפא אותה?
כאבים הנובעים מזרימת דם לא מספקת לשריר הלב
הניטרוגליצרין מומר ל-
NO
שמרפה את כלי הדם. זה מקטין את עומס העבודה על הלב וכתוצאה מכך מפחית את דרישת החמצן של שריר הלב.
איך נקרא
Nos
בתאי אנדותל?
eNOS
איך נקרא
NOS
בתאי שריר?
nNOS.
האם יש גם במאקרופאגים
NOS?
כן
נקראים
inos
והם מפעילים אותם רק כאשר התאים פועלים
מה יכול לעשות
NO
בתאי מטרה?
NO
נקשר באופן הפיך לברזל באתר הפעיל של גואניליל ציקלאז, ומעודד סינתזה של
NO
כיצד
cyclic gmp
שומר על איזון?
ה-
CGMP
יכול להגדיל את ריכוז ה-
cyclic GMP
תוך שניות, משום ששיעור התחלופה שלה גבוה – היא נוצרת על ידי גואניליל ציקלאז אך מפורקת על ידי פוספודיאסטראז, וכך הייצור שלה מאוזן כל העת.
כיצד ויאגרה פועלת?
ויאגרה וקרובי משפחתה מעכבים את הפוספודיאסטראז, וכך למעשה אין פירוק של מולקולות
cGMP
והן יכולות להמשיך לפעול ולהרפות את השריר החלק – ולכן להרחיב את כלי הדם באזור הפין.
NO
יכול בנוסף לכך להעביר סיגנאלים באופן בלתי תלוי
ב- cGMP
: קישורו לשיירי ציסטאין ספציפיים בחלבונים גורמת לשינוי פעילותם.
מה היא דה סנסיטזציה?
ה סנסיטיזציה הוא תהליך של הפחתת רגישות של רצפטור לסיגנאל מסויים.
מדוע דה סנסיטזציה נחוץ?
זהו תהליך נחוץ משום שאנו רוצים למדוד שינויים – כאשר יש שוני ביחס לסביבה נרצה שהתא יהיה מודע לכך. אולם אם הסביבה השתנתה ויש עכשיו “סטנדרט חדש”, לא נרצה שהתא יסגנל באופן תמידי.
כיצד התא יכול לעבור סינסטריזציה למולקולות סיגנאל חוץ תאיות?
סיקווסטרינג – הרצפטורים עוברים אינטרליזציה ומוכנסים לתוך הציטוזול על מנת שלא יהיו זמינים יותר לקשירת הליגנד.
פירוק רצפטורים בליזוזום – הרצפטורים מוכנסים לתא ונשלחים לפירוק בליזוזום כך שהם לא עובדים יותר.
אינאקטיבציה – פעילות הרצפטורים עוברת שינוי כך שלא יוכלו לקיים אינטראקציה עם חלבוני ה-
G
שלהם.

עי מי תלוי דה סנסטיזציה של
GPCRS?
תלויה בזרחון שלהם על ידי
PKA ,PKC
(grk)
GRKs
אלה מזרחנים עמדות סרין ותראונין רבות על גבי הרצפטור, אך הם עושים זאת רק לאחר שהליגנד נקשר והפעיל את הרצפטור
מרגע שהרצפטור זורחן על ידי
GRK
הוא נקשר באפיניות גבוהה לחבר במשפחת ה-
arrestin
כיצד ה-
arrestin
תורם לדה סנסטיזציה?
ראשית, ארסטין חוסם את אתר הקישור של הרצפטור לתת יחידה אלפא וכך אין הפעלה של יחידות נוספות. שנית, ארסטין משמש כחלבון מתאם לאנדוציטוזה תלויית קלטרין. גורלו של הקומפלקס ארסטין-
GPCR
תלוי בחלבונים אחרים בקומפלקס. יש מקרים בהם הוא מגיע לממברנה הפלסמטית לצורך שימוש חוזר ובמקרים אחרים עובר יוביקוויטילציה, אנדוציטוזה ומפורק בליזוזום
האם כל אנדוציטוזה עי ארסטין בהכרח מונעת קבלת אותו מרצפטור
לא
מה קורה בתמונה הבאה?

רצפטור בטא-אדרנרגי
(מסלול
Gs)
מופעל.
הולכת האותות כפי שראינו מביאה לשפעול
PKA.
PKA
משפעל את האנזים
GRK .
GRK
נקשר לרצפטור הפעיל ומזרחן אזור תוך תאי על סרין/תראונין.
כעת מצוי זנב קרבוקסילי מזורחן בצד הציטוזולי, המאפשר קישור של החלבון ארסטין.
ארסטין נקשר וחוסם את אתר הקישור של הרצפטור לתת יחידה אלפא ומהווה חלבון מתאם לאנדוציטוזה תלויית קלטרין.
מנגנון הראיה

מה הוא מנגנון ההרחה

מה עושים כל אחד מה- g
אלפא

מה קורה כאשר מוציאים
NO
מארגינין
נותר ציטרולין
איפה ניתן לראות רצפטורים מצומדי אינזים

מה קורה בתמונה הבאה?

- בהיעדר ליגנד הרצפטור ל-
EGF
קיים בעיקר כמונומר לא פעיל.
- קשירת
EGF
מובילה לשינוי קונפורמטיבי המקדם דימריזציה של הדומיינים החיצוניים.
- דומיין הקינאז, שלא כמו זה של
RTKs
רבים, אינו מופעל על ידי טראנס-אוטו-פוספורילציה. במקום זאת, הדימריזציה מכוונת את דומייני הקינאז הפנימיים ליצירת דימר לא סימטרי בו דומיין קינאז אחד
(“activator”)
דוחף כנגד השני
(“receiver”)
וכך גורם לשינוי קונפורמטיבי שמפעיל את
ה-receiver.
ה-receiver
הפעיל מזרחן טירוזינים רבים בזנבות
ה-C
טרמינאליים של שני הרצפטורים וכך יוצר אתרי עגינה לחלבוני סיגנאל תוך תאיים.
חלבונים בעלי דומיין
sh2
לאן יכולים להיקשר?
ולמה זה יכול לגרום?
- חלבוני בעלי דומיין
SH2
יכולים להיקשר לפוספוטירוזינים על גבי
RTKs
מופעלים על על חלבוני עגינה. חלק מהחלבונים העוגנים הם אנזימים כמו למשל פוספוליפאז גמא
(PLCγ)
שמתפקד באותו האופן כמו פוספוליפאז
C-β
כך ש-
RTKs
יכולים להעלות את רמות יוני הסידן בציטוזול ולהפעיל את
PKC.
- אנזים אחר המעוגן לרצפטורים הללו הוא הטירוזין קינאז הציטופלסמטי
Src
המזרחן את חלבוני הסיגנאל האחרים בשרשרת על טירוזין.
- אנזים נוסף הוא פוספאינוזיטיד 3-קינאז המזרחן ליפידים
מה עושה הרצפטור
PDGF?
הוא פקטור שמשפעל טסיות
מה ישפעלו חלבונים שיקשרו ל-
pdgf?
החלבונים שייקשרו אליו ישפעלו את מערכת ה-
PI3K
חלקם ישפעלו מערכת חלבוני
G
וחלקם אף ישפעלו את פוספוליפאז ויגרמו לעלייה בסידן תוך תאי במסלול דומה לזה שכבר למדנו. הרצפטור מציג 5 אתרי עגינה – 3 מהם בתחילת החלבון ו-2 בזנב ה-
C
טרמינאלי.

כיצד בנוי
sh2
מבנה התלת מימדי של דומיין
SH2
כיס הקישור לפוספוטירוזין מצוין בכתום וכיס קישור לשרשרת צד של חומצת אמינו

האם כל החלבונים שנקשרים
ל- rtk
עם
sh2
עוזרים להעביר את הסיגנאל?
לתת דוגמה
ומה קורה עם יש מוטציה
לא כל החלבונים שנקשרים ל-
RTKs
עם
SH2
עוזרים להעביר את האות הלאה. חלקם דווקא פועלים להפחתת תהליך האיתות ומתן משוב שלילי. דוגמה אחת היא החלבון
c-Cbl
שיכול להיקשר לרצפטורים פועלים ולזרז את היוביקוויטילציה שלהם, מה שמקדם אנדוציטוזה ופירוק חלבונים בליזוזומים. חלבונים אנדוציטיים המכילים
ubiquitininteraction motifs (UIMs)
מזהים את הרצפטור המסומן ומכוונים אותו לוזיקולות עטופות קלתרין ובסופו של דבר לפירוק בליזוזמים. מוטציות המעכבות את הדאון רגולציה של החלבון
c-Cbl
גורמות לאיתות ממושך מצד רצפטורי
RTK
מה שמקדם התפתחות סרטן.
מה הוא המנגנון אשר מאפשר ל-
NGF
להיקשר ל-RTK הספציפי לו?
כמו במקרה של
GPCR
, אנדוציטוזה הנגרמת על ידי ליגנד של
RTK
לא תמיד מורידה את הסיגנאל, שממשיך ממדורים תוך תאיים כמו האנדוזום. מנגנון זה מאפשר ל-
nerve growth factor (NG
להיקשר ל-
RTK
(trk a(
הספציפי שלו בסוף אקסון ולאותת לגוף התא של אותו התא במרחק רב משם. כאן, וזיקולות אנדוציטיות המכילות
TrkA
עם
NGF
מועברות מהאקסון לגוף התא כאשר
NGF
קשור בצד הלומן וחלבוני הסיגנאל בצד הציטוזולי – מה שמאותת לתא לשרוד.
מה משפחת
ras
כוללת ?
משפחת חלבוני
Ras
הכוללת בתוכה את החלבונים
Ras,Rab,ARF,Ran
ומשפחת
Rho
הם משפחה של חלבוני
G מונומרים, אולם רק
Ras
ו- Rho מקבלים אותות חוץ תאיים.

אילו שלושה חלבוני
ras
עיקריים יש בבני אדם?
ישנם שלושה חלבוני
Ras
עיקריים בבני אדם
H,K ו-N Ras
מה
ras
לרוב גורם?
כאשר
RTKs
מאותתים לגרעין לעורר פרוליפרציה או דיפרנציאציה של תאים, שני תהליכים המצריכים שינויים בביטוי הגנים. 30% מהגידולים האנושיים מבטאים צורות מוטנטיות היפראקטיביות של
Ras
התורמות לפרוליפרציה בלתי מבוקרת של תאי הסרטן.
מוטציה שיש בהן עמידות מוגברת ל-
gap
של
ras
למה הן יגרמו?
לסרטן
כיצד
rtK
מפעילות את
ras?
באופן עקרוני, הם יכולים להפעיל
Ras-GEF
או לעכב
Ras-GAP.
אף על פי שכמה
GAPs
נקשרים ישירות
ל-RTKs
זהו צימוד לא ישיר של רצפטור
ל-Ras-GEF
שמביא את
Ras
למצב הפעיל שלו. לאובדן הפעילות
של
Ras-GEF
השפעה דומה לאובדן הפעילות של
Ras
עצמו.
כיצד מפעילים את ה-
ras super family?
הפעלת חלבוני
Ras superfamily
אחרים כולל אלה ממשפחת
Rho
מתרחשת גם באמצעות הפעלת
GEF.
ה- GEF
הספציפי קובע באיזו ממברנה ה-
GTPase
מופעל, ובאמצעות כך שפועל כפיגום, הוא יכול גם לקבוע אילו חלבונים במורד הזרם מפעיל ה
- GTPase.
היכן התגלה ה-
gef
של ה-
ras?
התגלה במחקרים גנטיים של התפתחות עיניים בדרוזופילה
איך מכונה
GEF
של RTK
איך מכונה מה שמקשר ביניהם?
. GEF
המכונה
Sos.
מחקרים גנטיים חשפו חלבון נוסף, שנקרא כיום
Grb2
שהוא חלבון מתאם המקשר בין רצפטור ה-
Sev לחלבון
Sos

מהו
map-kinase?
בדרך כלל מערכת האותות המופעלת על ידי
RTK ו-Ras
היא קצרת מועד הודות לפעילות
GAP
ופוספטאזות.
אולם כדי לעודד פרוליפרציה או דיפרנציאציה תאית יש להמיר את אירועי הסיגנאל הללו מאירועים קצרים יחסית לאירועים שנמשכים זמן ארוך יותר ומסוגלים להעביר את האות לגרעין כדי לשנות את דפוס הביטוי של הגנים. קסקדת ה-
MAP kinase module
היא אחד ממנגנוני המפתח המשמשים למטרה הזו.
כיצד נקראות שלושת הקינאזות של
Map?
(Raf (= MAPKKK)
Mek (= MAPKK)
ו- (Erk (= MAPK
כיצד פועל רצפטור טירוזין קינאז?
1.קבלת סיגנאל גורמת לדימריזציה ולפוספורילציה של שני מונומרי
RTK .
- grb2
קושר את שיירי הטירוזין המזורחנים בעזרת דומיין
SH2.
3.
Grb2
מצידו השני בעל דומיין
3SH,
וקושר שיירי פרולין של
Sos.
Sos
הוא
ה-GEF
של
Ras
ומבצע שפעול שלו.
- לאחר ש-
RAS
עובר שחלוף, הוא מסייע בגיוס של החלבון
RAF
לממברנה ומשפעל אותו.
- RAF
מזרחן את החלבון
Mek
שמזרחן את החלבון
Erk
– זו קסקדת ה-
MAPK.

מה החלבון
ERK
מזרחן?
Elk1
ואחרים שהם פקטורי שעתוק של “תכנות התא”, הקשורים למסלולים חשובים של התמיינות וחלוקה.
עוד הוא מזרחן מתחמי רגולציה מה שמפעיל קבוצת
immediate early genes
ש”נדלקים” תוך דקות לאחר ש-
RTK
הופעל (והם נדלקו אפילו כשסינתזת החלבון נחסמה בניסויים עם חומרים שונים).
בין הגנים המופעלים על ידי מסלול זה ישנם כמה המגרים את פרוליפרציית התאים, כמו הגנים המקודדים לציקלינים של
G1 .
כיצד אותו חוץ תאייים מפעילים את ה-mapk?
באופן זמני בלבד
האם
ERK
יכול להפסיק
את
raf
כן
כיצד
Map kimase
מפעיל לולאת משוב חיובית?
או שלילית?
מפעיל לולאת משוב חיובית מורכבת כדי לייצר תגובת “הכל או כלום” בלתי הפיכה במסגרתה ביציות של צפרדע ממגורות על ידי חשיפה קצרה להורמון פרוגסטרון החוץ תאי שגורם להן להתבגר. עוד מצוין כי בתאים רבים
MAP
קינאזות מפעילות לולאת משוב שלילי על ידי הגדלת ריכוז הפוספטאז שמסיר את הקינאז מ-
MAP
קינאז. העליה בריכוזו של פוספטאז נובעת הן מעלייה בשעתוק הגן המקודד לו והן מייצוב האנזים כנגד פירוק.
היכן פועלות מערכות של
mapk
בעלות שלושה רכיבים?
פועלות בכל התאים האאוקריוטים, כאשר מערכות שונות מתווכות תגובות שונות באותו התא.
כיצד התאים נמענים מ-
cross talk
בין מסלולי הסיגנאל השונים?
חלבוני פיגום

האם בתאי יונקים יכולים לפעול 5 מערכות
Mapk?
כן
מתי יש שימוש ב-
mapk?
שתיים מהמערכות הללו מופעלות על ידי סוגים שונים של סטרס תאי, כמו קרינה אולטרה סגולה הלם חום, וסטרס אוסמוטי, וכן על ידי ציטוקינים דלקתיים. אחרים בעיקר מתווכים תגובות לאותות מתאים אחרים.
מה החיסרון של
mapk
בפיגומים?
הגבלת ההגברה: למרות שאסטרטגיית הפיגומים מספקת דיוק ונמנעת מ”שיחות חוץ” שיכולות כאמור להתקיים, היא מצמצמת את ההזדמנויות להגברה ולהפצת האות לחלקים שונים בתא, הדורשים שלפחות חלק מהרכיבים יהיו דיפוזיים. לא ברור באיזו מידה הרכיבים הפרטניים של מערכות ה-
MAP
יכולים להתנתק מהפיגום במהלך תהליך ההפעלה כדי לאפשר הגברה.
מה עושה אינסולין?
אינסולין משפעל רצפטור טירוזין קינאז שכאמור, הוא כבר מראש דימר על גבי הממברנה, ולא מונומר שעובר דימריזציה כמו שאר הרצפטורים של המשפחה.
במקרה הזה, הרצפטור לא רק שמזרחן את עצמו ואת בן הזוג לאחר הקישור לאינסולין, הוא גם מזרחן חלבון בשם
1IRS
שבהמשך יגייס את
Grb2
והמסלול ממשיך כרגיל, כפי שלמדנו.
הפקטור
1IRS
הוא פקטור משמעותי העובר זרחון על שיירי טירוזין עם הקישור לאינסולין.

למה
irs
חשוב באינסולין?
הוא משפעל את
PI3K
המזרחן
PIP2
ל- PIP3.
הקישור לקינאז נעשה דרך דומיין
SH2.
PIP3
מגייס לממברנה חלבון בשם
PKB
שאלברטס גם קורא לו
Akt.
עושה כמה דברים:
הוא מזרחן את
GSK3
(ההוא שבהמשך יזרחן את גליקוגן סינתז קינאז, ויהפוך אותו ללא פעיל).
בדרך שאנחנו לא לגמרי מבינים הוא משפעל אקסוציטוזה של וזיקולות
Glut4.

לאיזה משפחה שייכים חלבוני ה-
rho?
שייכים למשפחת ה-
Ras
והם חלבוני
G.
אנחנו רואים סיגנאל ממשפחת ה-
ephirin
שתפקידו לעודד מיגרציה של האקסון לכיוון תא השריר אותו הוא מעצבב.
RhoA
יושב לא פעיל על הממברנה
(קושר GDP)
ועם הקישור של הליגנד לרצפטור, גורם לשחלוף והפעלה שלו שבתורו גורם להפעלה של אפקטורים רבים הקשורים לציטוסקלטון.

עי מי
RHO A
מופעל?
RTK
מה גורם שפעול של חלבוני
RHO.
משפחת
Rho
גורמת לרה-ארגון של הציטוסקלטון בתא, ולכן משפיעה על תנועה, הידבקות, קוטביות וצורת התא. היא גם מבקרת את התקדמות מחזור התא, שעתוק גנים וטרנספורט ממברנות. חלבוני המשפחה ממלאים תפקיד מרכזי בנדידת תאים וצמיחת אקסונים של נוירונים ומתווכים תגובת אקטיבציה להפעלת סוג מיוחד של
guidance receptors
מה שלות החלבונים שמאופיינים היטב עם
ה- cytoskeeton?
Rho בעצמו
Rac
ו-Cdc42
. כל אחד מהם משפיע על חלבוני מטרה רבים במורד הזרם.
מה ההבדל בין
ras
ל-rho?
בשונה מ- Ras
אשר מעוגן לממברנה גם כאשר הוא כבוי, חברי משפחת
Rho
נקשרים במקרים רבים
ל- GDIs
בציטוזול כאשר הם כבויים. קישור זה מונע אינטראקציה של חלבוני ה
-G
עם
Rho-GEFs
בממברנה הפלסמטית.
על מה משפיע
rhoa
משום ש-
RhoA
משפיע על מבנים של אקטין ומיוזין הוא משפיע על סטרס פייברז וגם על הטבעת החונקת בציטוקינזה, כך שאם מנטרלים אותו לא תהיה ציטוקינזה. למשל: בשלבים הראשונים של עובר דרוזופילה אין ציטוקינזה, אך במעבר מחלוקה בין 1000 ל2000 תאים – יש ציטוקינזה בבת אחת. כנראה שיש שם מעורבות של חלבון זה.
כיצד
rtk
מפעיל את
rho gtpase?
אחד מבני משפחת ה-
Eph
נמצא על פני עצבים מוטוריים ועוזר להנחות את הקצה הנודד של האקסון
(המכונה
growth cone)
אל היעד שלו – השריר. הקישור של האפרין מפעיל את הרצפטור שלו וגורם
ל-growth cone
להתמוטט וכך מרחיק אותו מאזורים לא מתאימים ושומר עליו במסלול. התגובה תלויה ב
-Rho-GEF
המכונה
ephexin
, שקשור ביציבות לזנב הציטוזולי של קולטן
ה- Eph.
קשירת ה-
Eph
מפעילה את הרצפטור ל-
Eph
שמפעיל טירוזין קינאז ציטופלסמטי שמזרחן את
ephexin
על טירוזין. כך, יכולתו של
ephexin
להיקשר ל-
RhoA
גבוהה.
לאחר מכן
RhoA
המופעל מבקר חלבוני מטרה שונים במורד הזרם, כולל כמה חלבוני אפקטור השולטים בשלד התאי וגורם ל-
growth cone
להתמוטט.
מה
Pi3k
מזרחן?
הוא בעיקר מזרחן פוספוליפידים של אינוזיטול ולא חלבונים, וגם
RTK ,
וגם
GPCR
יכולים להפעיל אותו. זה ממלא תפקיד מרכזי בקידום הישרדות התאים וגדילתם
Phosphatidylinositol
למה הוא ייחודי?
הוא ייחודי כיוון שהוא יכול לעבור פוספורילציות הפיכות במספר אתרים בקבוצת הראש האינוזיטולים. זאת כדי לייצר מגוון ליפידי
PI
מזורחנים הנקראים פוספואינוזיטידים. כשהוא מופעל,
PI 3-kinase
מזרז זרחון בעמדה 3 של טבעת האינוזיטול ליצירת מספר פוספואינוזיטידים כמתואר באיור. הייצור של
PI(3,4,5)P3
הוא חשוב ביותר מכיוון שהוא יכול לשמש כאתר עגינה לחלבוני סיגנאל תוך תאיים שונים, שמתאספים לדומייני איתות המעבירים את הסיגנאל לצד הציטוזולי של הממברנה הפלסמטית.
מה עושה
Pten phosphatase?
מבצע דה פוספורילציה לכל שלוש העמדות בטבעת האינוזיטול
מה קורה כאשר יש מוטציות
ב-
pten phosphatase?
ניתן למצוא מוטציות ב-
PTEN
בסוג סרטן רבים: על ידי הארכת הסיגנאל מ
PI 3-kinase ‘
מתקדמת גדילה תאית בלתי מבוקרת.
אילו סוגים יש ל-pi3k?
ישנם סוגים שונים של
PI 3-kinases
. אלו המופעלים על ידי
RTKs ו-GPCR
שייכים לקבוצה I.
- אלה הם הטרודימרים המורכבים מתת יחידה קטליטית משותפת ומתת יחידות רגולטוריות שונות.
RTKs
מפעילים מחלקה המכונה
class Ia PI 3-kinases
בה תת היחידה הרגולטורית היא חלבון מתאם הנקשר לשני פוספטירוזינים על
RTKs
(כשהם מופעלים) באמצעות שני דומייני
SH2
שלה.
-GPCRs
מפעילים מחלקה המכונה
class Ib PI 3-kinases
שלהם תת יחידה רגולטורית הנקשרת לקומפלקס הבטא-גמא של trimeric G protein (Gq)
כאשר
GPCRs
מופעלים על ידי הליגנד החוץ תאי שלהם.
מה עושה קישור ישיר של
ras
ל-
class1
בפוספואינוזטידים
קישור ישיר של
Ras
מופעל יכול לאקטב את תת היחידה הקטליטית המשותפת של class I
מהו הזרחון החשוב ביותר מבין שלושת הזרחונים?

בתמונה כאמור ניתן לראות יצירת אתרי עגינה פוספואינוזיטידיים על ידי
PI 3-kinase.
הזרחון החשוב ביותר הוא של
PI (4,5) P2
ליצירת
PI (3,4,5) P3
שיכול לשמש אתר עגינה לחלבוני סיגנאל בעלי
PI(3,4,5)P3-binding PH domains.
קינאזות אחרות של פוספטידיל אינוזיטול מזרזים את תהליכי הזרחון שמסומנים בירוק.
דרך מה חלבוני סיגנאל נקשרים ל-
PI(3,4,5)P3?
חלבוני סיגנאל נקשרים ל-
PI(3,4,5)P3
דרך דומיין אינטאקציה ספציפי כמו למשל
pleckstrin homology (PH),
אשר זוהה לראשונה בחלבון הטסיות
pleckstrin.
מה הם דומייני
PH?
דומייני
PH
מתפקדים בעיקר כדומייני אינטראקציה בין חלבונים ורק קבוצה קטנה שלהם נקשרת ל-
PI(3,4,5)P3.
לפחות חלקם מכירים גם חלבון קושר ממברנה ספציפי, כמו גם את
PI (3,4,5) P3
מה שמגדיל מאוד את הספציפיות של הקישור ומסייע להסביר מדוע חלבונים בעלי
PI(3,4,5) P3-binding PH domains
לא מעוגנים כולם לאתרי
PI(3,4,5)P3
ל-
sos
ול-
akt
יש PH?
נכון
מה הוא המסלול העיקרי שמופעל עי אינסולין?
PI-3-kinase–Akt signaling pathwa
היא המסלול העיקרי שמופעל על ידי אינסולין, והוא גם משחק תפקיד מרכזי בקידום הישרדות וגדילה של סוגי תאים רבים הן בחסרי חוליות והן בחולייתנים.
מה הוא החלבון
mtor
חלבון
mTOR
הוא חלבון סופר חשוב המבקר את שרידות התא מבקר את גדילת התא, התמיינות והחלקות וגם אוטופאגיה . הפעילות הישירה של
mTOR
היא “קינאז”. אנחנו אוהבים לקרוא לו “אב הבית של התא”, זאת מאחר והוא אחראי על כל התחזוקה השותפת והיומיומית של התא.
איך
IGF
מצליחים לעורר גדילה?
הם נקשרים ל-
RTK
ספציפי שמפעיל
PI 3-kinase
שבתורו מייצר
PI(3,4,5)P3.
ה-PI(3,4,5)P3
מגייס שני קינאזות לממברנה דרך דומייני
PH:
האחד,
Akt
(המכונה גם פי קיי בי)
והשני
PDK1
הדבר מוביל לאקטיבציה של
Akt.
כאשר הוא מאוקטב,
Akt
מזרחן חלבונים רבים על הממברנה הפלסמטית, בציטוזול ובגרעין. ההשפעה על רוב החלבונים הידועים הללו היא הפעלתם והפעילות של
Akt
נועדה לשפר את שרידות התאים וצמיחתם כפי שמופיע באיור.

למה
MTOR
נקרא
MTOR?
הבקרה על גדילה תאית במסלול ה-
PI-3-kinase–Akt
תלויה בחלקה ב-
mTOR: הוא קרוי
mTOR
מאחר והוא יעד של
Rapamycin.
רפמיצין הוא טוקסין חיידקי המעכב את פעילות הקינאז של
mTOR
ולכן משמש כתרופה אימונוסופרסיבית (מדכאת מערכת החיסון) וככימותרפיה לסוגים מסויימים של סרטן.
אילו שני קומפלקסים יש ל-
Mtor?
1.
קומפלקס 1 של
mTOR
כולל את החלבון
Raptor
המקנה לקומפלקס רגישות לרפמיצין. קומפלקס זה אחראי לגדילה תאית על ידי יצירה של ריבוזומים וסינתזת חלבונים ועל ידי עיכוב פירוק חלבונים. קומפלקס זה מקדם גם שרידות תאית על ידי עידוד אפטייק של נוטריינטים ומטבוליזם.
- קומפלקס 2 של
mTOR
כולל את החלבון
Rictor
והוא אינו רגיש לרפמיצין. הוא מסייע להפעלת
Akt
(במסלול זה
mTOR
מזרחן את
Akt
ומסייע לו להתנתק מהממברנה, כך שהוא יכול לזרחן בעצמו את החלבון
Bad
שמעכב את
BCL2). בנוסף, קומפלקס זה חיוני לבקרה על שלד האקטין באמצעות חלבוני
Rho.
מה
MTOR
יודע לעשות דרך קומפלקס 1?
mTOR
בעיקר דרך קומפלקס 1 יודע לבקר גדילה תאית, זאת על ידי אקטיבציה שהוא עובר בזכות נוטריינטים כמו חומצות אמינו (על פי לנינג’ר גם חומצות שומן מסועפות) וחלבוני סיגנאל חיצוניים המכונים
growth factors.
למעשה הוא משלב אינפוטים ממקומות שונים ואלה מסייעים להפעיל את
mTOR
ולקדם כאמור גדילה תאית.
דרך איזה מסלול גורמי גדילה מפעילים
MTOR?
PI3K-AKT
מאקטב את
mTOR
בקומפלקס 1 באופן לא ישיר על ידי זרחון שמעכב
GAP
בשם
Tsc2
. Tsc2
כעת פועל על
Ras-related GTPase
מונומרי בשם
Rheb.
בצורתו הפעילה,
Rheb-GTP
מאקטב את
mTOR
בקומפלקס 1. בסופו של דבר התוצאה היא ש-
Akt
מפעיל את
mTOR
ובכך מקדם גדילה תאית.
האם
GPCR
ו-
RTK
יכולים להפעיל את אותם המסלולים?
כן

האם יש רצפטורים שפועלין במנגנון של טירוזין קינאז אך אין להם טירוזין קינאז?
כן
רצפטורים רבים על פני התא תלויים בזרחון של טירוזין לפעילותם אך חסרים דומיין טירוזין קינאז. רצפטורים אלה פועלים באמצעות טירוזין קינאזות ציטופלסמטיים הקשורים לרפטורים ומזרחנים חלבוני מטרה שונים, לרוב את הרצפטורים עצמם.
רצפטורים אלה פועלים באותו אופן דומה ל-
RTKs
למעט העובדה שדומיין הקינאז שלהם מקודד על ידי גן נפרד והוא קשור באופן לא קוולנטי לשרשרת הפוליפפטיד של הרצפטור.
במה תלויים רצפטורים שאין להם דומיין טירוזין קינאז?
חלק מאותם רצפטורים תלויים בבני המשפחה הגדולה ביותר של טירוזין קינאזות בציטופלסמה של יונקים, משפחת ה-
Src.
מבין חבריה ניתן למנות את החלבונים הבאים:
Src, Yes, Fgr,
Fyn, Lck, Lyn, Hck, Blk.
הקינאזות הללו כוללות כולן דומייני
SH2 ו-SH3
ונמצאות בצד הציטופלסמטי של הממברנה הפלסמטית, מוחזקות שם בחלקן על ידי האינטראקציה עם הרצפטורים הטראנסממברנאליים ובחלקן על ידי קישור קוולנטי לשרשרת ליפידית.
האם חלבוני
GPCR
יכולים להפעיל
SRC
כן
מה הם צמתים בין תא לתא ?
התאים יכולים להיות קשורים זה לזה וקשורים למטריקס החוץ תאי (רשת מורכבת של חלבונים ושרשראות פוליסכרידים שהתאים מפרישים) –צמתים. כך או כך הם יוצרים מבנה רב תאי מאורגן שיכול לעמוד ולהגיב לכוחות החיצוניים השונים המופעלים עליו.
מה הם צמתים בין תא לתא?
אינטראקציות שאוחזות את התאים ביחד, קשורים זה לזה ולמטריקס החוץ תאי
על מה מנגנוני ההיצמדות שולטים?
מנגנוני ההיצמדות שולטים בארכיטקטורת הגוף – צורתו, חוזקו וסידור סוגי התאים השונים שלו. יצירה ושבירה של הקשרים בין התאים כמו גם המטריקס החוץ תאי קובעים את הדרך בה ינועו התאים באורגניזם.
על מה חיבורים באמצעות צמתים שולטים?
על הכיוון וההתנהגות של שלד התא, ובכך מאפשרים לו לחוש ולהגיב לשינויים בתכונות המכאניות של סביבתו. לכן מנגנוני הצמתים קריטיים לכל היבט של ארגון, פונקציה ודינאמיקה של מבנים רב תאיים, וליקויים במנגנון זה גורמים למגוון עצום של מחלות.
על ידי אילו שני רקמות ניתן לתאר את מאפייני הצמתים?
רקמת חיבור
רקמת אפיתל
מי יוצר את הרקמת חיבור?
המטריקס החוץ תאי
איזה צמתים יוצרים התאין והמטריקס?
התאים והמטריקס יוצרים צמתים חשובים המקשרים בין שלד התא למטריצה ומאפשרים לתאים לנוע דרכה ולעקוב אחר שינויים בתכונות המכאניות שלה.
אילו דוגמאות יש לרקמת אפיתל?
ומי יוצר אותה?
הרקמה השניה היא רקמת אפיתל כמו אפיתל המעי או שכבת האפידרמיס של העור. ברקמת האפיתל התאים נקשרים לזה לזה תוך שהם יוצרים “יריעות” הנקראות
epithelia.
ממה מורכבת המטריצה החוץ תאית בתאי אפיתל
מהלמינה הבאזאלית
איך התאים נקשרים זה לזה ברקמת אפיתל?
ברקמת האפיתל התאים נקשרים לזה לזה תוך שהם יוצרים “יריעות” הנקראות
epithelia
מה הם הצמתים שיש בין לתא לתא ובין תא למטריקס?
- דזמוזומים
(desmosomes) –
מהווים נקודת עגינה לסיבי ביניים ויוצרים מבנה המקשר בין התאיים.
- צמתי הדבקה
(adherens junctions)
– מהווים נקודת עגינה לסיבי אקטין וגם הם מקשרים בין התאים.
actin-linked cell-matrix junction – אחראים ליצירת אינטראקציות בין סיבי אקטין ללמינה הבזאלית.
- המידזמוזומים
(hemidesmosomes) –
אחראים ליצירת אינטראקציות בין סיבי ביניים ללמינה הבזאלית.
4.צמתי אטימה
(Tight junctions)
– מחזיקים את התאים קרוב זה לזה, אוטמים את המרווח ביניהם וכך ומונעים זליגה של חומרים בין התאים.
5.צמתי תקשורת
(Gap junction) – יוצרים תעלות ותפקידם לתאם העברת מולקולות קטנות המסיסות במים מתא אחד לאחר באותה שכבת תאים. יש להם מרכיב חשוב בתקשורת.

המיקומים היחסיים של הצמתים זהים כמעט בכל תאי האפיתל של החולייתנים
נכון
כיצד מקושרים השלד התאי ומבנים אחרים מחוץ לתא?
באמצעות חלבונים טראנסממברנאליים
אילו שני
superfamilies
יש בחלבוני שלד התא החוץ תאי?
חלבונים ממשפחת הקדהרינים
(cadherin superfamily)
מתווכים בעיקר את ההיקשרות של תא לתא.
חלבונים ממשפחת האינטגרינים
(integrin superfamily)
מתווכים בעיקר את ההיקשרות של תא למטריקס החוץ תאי.
מה קדהירינים יכולים לקשור?
ומה אינטגרינים קושרים?
- מובן שיש התמחות בכל משפחה כזו: כך למשל קדהרינים מסויימים קושרים אקטין ויוצרים
adherens junctions
ואילו אחרים נקשרים לסיבי ביניים ויוצרים דזמוזומים.
- במשפחת האינטגרינים ישנם חברים הקושרים אקטין ויוצרים
actinlinked cell–matrix junctions
ואילו אחרים נקשרים לסיבי ביניים ויוצרים המידזמוזומים.
האם אינטגרינים יכולים גם לתווך בין תא לתא?
כן
אילו צמתים ואיזה חלבון מתאים לכל צומת?

ממה בנויה כל צומת?
כל צומת בנוי מחלבון צומת חוצה ממברנה, ליגנד חוץ תאי איתו נוצר קשר, סיב תוך אליו הצומת מקשרת וחלבון מתאם בין הצומת לשלד התא.
מה הם קדהירנים?
ואיפה הם נמצאים?
קדהרינים הם חלבונים שנמצאים בכל התאים האנימליים שהגנום שלהם נותח. הם נמצאים גם ב-
choanoflagellates
שיכולים להתקיים הן כאורגניזם חד תאי והן כרב תאי, ונחשבים כנציגים של קבוצת הפרוטיסטים ממנה התפתחו בעלי החיים
האם קדהירנים נמצאים גם בצמחים ובפטריות?
לא
מה מכיל הדומיין החוץ תאי של חלבוני קדהירנים?
מה מכיל הדומיין של קדהירין קלאסי ומה מכיל הדומיין של קדהירנים הלא קלאסיים?
מספר רב של חזרות של הדומיין המשותף לקדהרינים. הקדהרינים הקלאסיים (מיד נסביר) מכילים 5 יחידות של הדומיין ודזמוגלין ודזמוכולין (לא קלאסיים) מכילים 4 או 5. קדהרינים לא קלאסיים מסויימים מכילים אפילו מעל 30 חזרות.
איזה חלק הוא ואריאבלי בקדהרינים?
החוץ ממברנאלי או התוך ממברנאלי?
התוך ממבראנלי
האם יש קדרהין שהוא חסר דומיין טראנס ממבאנלי?
ואם כן מי הוא?
האזור התוך תאי של הקדהרינים הוא וריאבילי, דבר המשקף את האינטראקציה שמשפחה זו יוצרת עם מגוון רחב מאוד של חלבונים תוך תאיים, חלקם חלבוני סיגנאל וחלקם קשורים לשלד התא. במקרים מסויימים למשל במקרה של קדהרין טי חסר דומיין טראנס ממברנאלי, ויש לו רק דומיין חוץ תאי. לפיכך טי קדהרין מעוגנים לממברנה מהצד החוץ תאי על ידי
GPI.
איך נקראו שלושת הקדהירינים הראשונים שהתגלו?
E-cadherin
מצוי על סוגי אפיתל רבים,
N-cadherin
בעצב, בשריר ובעדשות,
P-cadherin
בשליה (פלצנטה) ובאפידרמיס. כל אלה נמצאים גם ברקמות אחרות, ונקראים קדהרינים קלאסיים.
איזה קשר יש בין כל הקדהרינים הקלאסיים?
ומה הם יוצרים?
קדהרינים קלאסיים קשורים יותר מבחינת הרצף שלהם, והם יוצרי צמתי אדהזיה עם אקטין
מה הם קדהירינים לא קלאסיים?
דהרינים לא קלאסיים הם כאלה בעלי רצף מרוחק יותר, והם למשל דזמוכולין ודזמוגלין.
מה קדהירינים לא קלאסיים יוצרים?
קדהרינים לא קלאסיים יוצרים דזמוזום עם סיביי ביניים. הקדהרינים הלא קלאסיים ידועים בפונקציית ה”הדבקה” שלהם, כמו למשל
protocadherins
מגוונים המבוטאים במוח ויש עוד סוגים רבים. [
כמה קדהירינים יש בבני אדם?
180
מה הם קדהירינין מתווכים?
צמתי עיגון בין תאים הם בדרך כלל סימטריים: אם בצד אחד של הצומת הקישור הוא לאקטין כך יהיה גם בצד השני. למעשה, הקישור בין קדהרינים שונים הוא הומופילי – כאשר קדהרין מתא אחד יוצר אינטראקציה עם קדהרין מתא אחר ובשניהם מדובר באותו סוג של קדהרינים

במה קדהירינים תלויים?
ואיך?
קדהרינים תלויים ביוני סידן, משם גם נגזר שמם סידן: הסידן יושב באתר המצוי סמוך ל”ברך” שהיא חלק מהמבנה של החלבון, וגורם לה להיות קשה – מה שמייצב את המבנה של הקדהרין (מעין משפעל אותו). כאשר מסירים את הסידן, ה”ברך” מתרפה וכל המבנה שלה נהיה גמיש יותר, כך שהצומת יכול להיפרד. במקביל, נראה כי הקונפורמציה בקצה ה-
N
משתנה מעט, ומחלישה את הזיקה למולקולת הקדהרין התואמת על התא הנגדי.

אילו אינטראקציות יש בין שני קדהירינים?
המון אינטראקציות חלשות
האם ישנה זיקה גבוהה בין שני קדהירינים?
לא
אפקט וולקרו
לאחר שיצרו אינטראקציה עם קדהרינים מהתא השני, יש להם נטייה להתקבץ יחד עם עוד מולקולות של קדהרין ולייצר אזור ממברנאלי שכולו קדהרינים. הקשר הכולל המתקבל בצומת שכזו חזק בהרבה מהקשרים הבודדים המרכיבים אותו אך מאפשר בו זמנית למנגנוני בקרה לפרק את הצומת על ידי הפרדת המולקולות אלו מאלו

האם קדהירינים מתחברים כדבק? ולמה?
קדהרינים לא מתחברים פשוט כדבק, אלא מתווכים היכרות סלקטיבית ומאפשרים לתאים מסוגים דומים להתחבר אלו לאלו ולהיפרד מסוגי תאים אחרים.
איפה הקדהירין ממלאים תפקיד מכריע?
בהליך מיון בהתפתחות העוברית
איפה ניתן לראות את הקדהירין בהתפתחות?
ביצירת צינור העצבים בחולייתנים – מתרחש מעבר מביטוי
E-cadherin
שהולך ונעלם אט אט לביטוי קדהרינים אחרים כמו
N-cadherin
בתאים האקטודרמליים שייצרו את צינור העצבים. לאחר מכן, כאשר תאי ה-
neural crest
נודדים הרחק מצינור העצבים, הקדהרינים הללו הופכים להיות מעטים מאוד ובהמשך מתחיל ביטוי של קדהרין חדש,
cadherin 7,
העוזר בעגינת התאים המהגרים יחד כקבוצת תאים הקשורה באופן רופף. לבסוף, כאשר התאים עוברים אגרגציה ליצירת גנגליונים הם מחזירים את הביטוי של ה-
N-cadherin .
אם
N-cadherin
מתבטא באופן מלאכותי, בניסוי, בתאי ה-
neural crest
המתהווים, התאים לא מצליחים לברוח צינור העצבים ולנדוד.

מה שולט בתהליכים של הפרדת רקמות בקדהרין?
קישור ההומופילי של קדהרינים
מה ההבדל בין שתי התמונות הללו?

בתמונה הראשונה שמו שני סוגים של קדהירינים שונים
ובתמונה השנייה זה אותו סוג של קדהרין
האם יצירה של שכפת אפיתל היא תהליך הפיך?
כן
איך ניתן לשלוט על תאי אפיתל ?
עי מולקולות עגינה
מה הם הפאקטורי השיעתוק שקשורים למולוקלות העגינה?
Slug, Snail, Twist
מה עושה פאקטור שיעתוק
twist?
פקטור השעתוק
Twist
למשל מדכא יצירה של קדהרינים וביניהם
E
קדהרין ובכך מגביר את המעבר של תא האפיתל לתא מזנכימאלי על ידי ניתוק של תא האפיתל מהסביבה האפיתליאלית שלו.
לפי התיאוריה של מולוקולות עיגון
מה הסיבה שתנאים ממאירים?
הידע על השינוי האפיתליאלי מזנכימאלי יכול לשפוך אור על הדרך בה תאים ממאירים משנים את התכונות שלהם, מתנתקים מהסביבה ונודדים בהתפתחות סרטן גרורתי באדם בוגר: שינויים אפיתליאליים מזכנימאליים מתרחשים גם כאירועים פתולוגיים במהלך חיי בוגר, בסרטן. רוב סוגי הסרטן מקורם באפיתל אך הם נוטים להפוך לממאירים – להתפשט, להימלט מרקמת האפיתל המקורית ולפלוש לרקמות אחרות
מה יכול לגרום לתא סרטן לקבל אופי לא ממאיר
ניסויים עם תאי סרטן שד מתורבתים מראים כי חסימה של
Twist
יכולה להפוך את התאים חזרה לבעלי אופי לא ממאיר.
מה זה
ADHERENT JUNCTION?
הוא סוג של צומת עיגון בין תא לתא. מעורבים בו סיבי אקטין, חלבונים מתאמים וכמובן – קדהרינים.
מה
adherent junction
מכיל?
צומת אדהזיה זה מכיל אינטראקציות עם חלבונים מתאמים ציטופלזמטיים בשם קטנינים. בטא קטנין, ו-
120-P
קטנין יוצרים אינטרקציה עם הקדהרינים מהצד הציטוזולי ואליהם נקשר קרוב משפחה נוסף שנקרא אלפא קטנין אשר יכול לעשות בעצמו אינטרקציה עם אקטין, אך גם יכול לגייס חלבונים מתאמים נוספים (כמו וינקולין שיוצר אינטרקציה עם האקטין) כדי לספק קישור דינאמי לסיבי האקטין
איך מחוברים צמתי ההדבקה לשרשראות האקטין?
מתי ההדבקה מחוברים מהצד הציטוזולי לסיבי אקטין כפי שציפינו, אך לא אקטין לבדו. מרביתם מחוברים ל
contractile bundles
– כלומר לא רק לסיבי אקטין לבדם אלא גם מיוזין 2 מעורב.
מה קורה כאשר מופעל מתח על תא אחד מבחינת הרקמה?
התאים האחרים ברקמה יודעים להתכווץ גם כן.
כיצד מתאזנים כוחות התכווצות בתא אחד?
כוחות ההתכווצות הפועלים על צומת בתא אחד מאוזנים על ידי כוחות התכווצות בצומת התא הנגדי, כך שאף תא לא מושך אחרים לעברו ובכך משבש את ההתפלגות האחידה של התאים ברקמה.

כיצד חלבונים בקומפלקס הקדהרין משנים את צורתם במתיחה?
חלבון אלפא אקטנין למשל, נמתח ממצב מקופל לקונפורמציה מורחבת כאשר פעילות התכווצות עולה בצומת, מה שמאפשר חיבור של חלבוני עזר נוספים כמו וינקולין, הנקשר לאזור החדש והחשוף של אלפא קטנין ומגייס עוד צברי אקטין כך שהאינטראקציה בין שלד התא לצומת מתחזקת. באמצעות מגנונים כמו זה משיכה של צומת מחזקת אותה. בחלק מהתאים, לעומת זאת, התכווצות האקטינים דווקא מפחיתה את הידבקות התאים במיוחד כשמדובר בכוחות גדולים. כוחות התכווצות מבוססי אקטין גדולים עשויים, ברקמות מסוימות, למשוך חזק מספיק בשולי הצמתים כדי לקלף אותם זה מזה, במיוחד אם ההתכווצות משולבת יחד עם מנגנוני ויסות נוספים המחלישים את ההדבקה. מנגנון זה עשוי להיות חשוב בצורות מסויימות של “שיפוץ” רקמות במהלך ההתפתחות.
איך צמתי אדהזיה יכולים ליצור שונות?
- ברקמות לא אפיתליאליות רבות הם מופיעים כמקבצים קטנים המחברים בין סיבי אקטין קורטיקלי, ממש מתחת לממברנה הפלסמטית, של שני תאים שעושים אינטראקציה זה עם זה.
- בשריר הלב הצמתים מעגנים את צרורות האקטין של האזור המתכווץ ופועלים במקביל לדזמוזומים כדי לחבר בין התאים המתכווצים מקצה לקצה.
- דוגמה הידועה לצמתי האקטין מתרחשת בתאי אפיתל, שם הם יוצרים
adhesion belt
ארוכה
ממש מתחת לפני השטח האפיקליים של האפיתל ואופפים את כל התאים בגליון האפיתל הזה. בתוך כל תא
contractile bundle
של צרורות אקטין ומיוזין 2 שוכנים בצמוד ל-
adhesion belt
מכוונים במקביל לממברנה הפלסמטית וקשורים אליה על ידי קדהרינים וחלבונים מתאמים. צרורות האקטין והמיוזין קשורים דרך הקדהרינים ליצירת רשת “טראנס-סלולארית” רחבה. התכווצות מתואמת של רשת זו מספקת את הכוח לתהליך בסיסי במורפוגנזה של בעלי חיים – קיפול גליונות האפיתל לצינורות, וזיקולות ומבנים קשורים אחרים
כיצד ההתכווצות של האקטין משפיעה על התפתחות הדוזפופילה?
זמן קצר לאחר הגסטרולציה, האפיתל החיצוני של העובר מוארך בתהליך המכונה
germ-band extension
בו התאים מתכנסים פנימה לכיוון ציר דורסלי-ונטראלי ונמשכים לאורך הציר האנטריורי-פוסטריורי. הסידור מחדש תלוי ברגולציה המרחבית של ה-
contractile bundles (אדום).
ההתכווצות של הצרורות האלה מלווה בהסרה של
E קדהרין
וכתוצאה מכך הצטמקות המבנה ואובדן ההדבקה . נוצרות אדהזיות מבוססות קדהרין חדשות וכתוצאה מכך התרחבות התאים בציר הקדמי אחורי.

מה הם דזמוזומים?
הם סוג נוסף של צמתי עגינה. מבחינה מבנית הם דומים לצמתי האדהזיה, אך הם מחברים בין התאים דרך סיבי ביניים וחלבונים מתאמים. סיב הביניים נקשר דרך חלבון מתאם אל קדהרין לא קלאסי. שני קדהרינים לא קלאסים מתחברים ליצירת צומת.
איפה נמצאין דזמוזומים?
דזמוזומים נמצאים אצל חולייתנים אך לא נמצאים למשל בדרוזופילה. הם קיימים ברוב האפיתליה של חולייתנים בוגרים ונמצאים בשפע ברקמות הנתונות ללחץ מכאני כמו שריר לב והאפידרמיס המהווה את השכבה החיצונית של העור
מה הדזמוזומים מכילים?
הדזמוזומים מכילים קדהרינים מתמחים שאינם קלאסיים ומתחברים מהצד הציטוזולי אל סיבי ביניים, אשר משתנים בהתאם לסוג הרקמה: למשל קראטינים בתאי אפיתל, דזמין בתאי שריר הלב.
אילו שני קדהרינים לא קלאסיים ישנם?
ומה הזנבות הציטופלסמטיים שלהם קושרים?
הקדהינים הם:
דזמוגלאין
דזמוקולין
הזנבות הציטופלסמטיים שלהם קושרים
plakoglobin
ו- plakophilin
אשר בתורם נקשרים לדסמופלאקין

מה הדזמוזומים עושים?
הדזדמוזומים מופיעים בדרך כלל כ”כתמי הדבקה” דמויי כפתור ומרתקים את התאים זה לזה. בתוך התא, צרורות של סיבי ביניים מעוגנים לדזמוזומים יוצרים מסגרת מבנית בעלת חוזק מתיחה רב. עם קישור לצרורות דומים בתאים סמוכים נוצרת רשת המשתרעת לאורך הרקמה

מחלת פמפיגוס (pemphigus)
בה מיוצרים נוגדנים כנגד אחד הקדהרינים של הדזמוזום. נוגדנים אלה נקשרים ומשבשים את הדזמוזומים המחזיקים את תאי האפידרמיס של החולים (קרטינוציטים) יחד. התוצאה היא שלפוחיות קשות בעור, עם דליפת נוזלי גוף לאפיתליום המשוחרר.
מה הם צמתי אטימה?
צמתים האוטמים את המרווח בין שני תאים וכך מונעים זליגה של חומרים ביניהם
מה הוא תפקיד של תאי אפיתל?
ומה יש לעשות על מנת שתפקיד זה יישמר?
הם משמשים כמחסומי חדירות סלקטיביים, ומפרידים בין הנוזל המחלחל לרקמות בצד הבזאלי שלהם לבין נוזל עם הרכב כימי שונה בצד האפיקאלי
פונקציית המחסום הזו מחייבת אטימה של התאים הסמוכים זה לזה באמצעות צמתים הדוקים בכדי שמולקולות לא יוכלו לדלוף בחופשיות מבעד לשורת התאים – צמתי אטימה. אפיתל המעי הדק מספק דוגמה טובה למבנה ותפקוד של צמתי אטימה,
מה מאפשרים צמתי האטימה לתאי האפיתל?
צמתים האטימה מאפשרים לתאי האפיתל לשמש כמחסום למעבר של מומסים ונוזלים. הם אוטמים את המרווח בין התאים ומונעים זליגה של חומרים ביניהם. היות וכאמור כל תאי האפיתל משמשים כמחסום סלקטיבי עם חדירות חלקית למעבר של חומרים דרכם, צומת האטימה מצמד חזק את הממברנות של התאים הסמוכים ומונע מעבר של חומרים בין התאים.
האם צמתי האטימה יכולים להיות חדירים למולקולות קטנות?
כן
הובלה פרא-סלולרית
התנועה של יונים ומולקולות אחרות בין תאי אפיתל
מה קורה בתמונה הבאה?

לאפיתל זה מבנה עמודי פשוט, כלומר הוא מורכב משכבה אחת של תאים גבוהים (עמודיים). אלה הם מכמה סוגים שונים אבל רובם הם תאים סופגים, כאלה המתמחים בספיגת נוטריינטים מהחלל הפנימי (או – לומן) של המעי. על התאים הסופגים להעביר נוטריינטים נבחרים על פני האפיתל מהלומן אל הנוזל החוץ תאי שבצד השני. משם, הנוטריינטים הללו עוברים דיפוזיה ומגיעים לכלי דם קטנים בכדי לספק הזנה לאורגניזם.
במה תלויה הובלה טראנס סלולארית?
היא תלויה בשתי קבוצות של חלבוני טרנספורט בממברנה הפלסמטית של התאים הסופגים – סט חלבונים אחד מוגבל למשטח האפיקאלי – כלומר פונה לצד של הלומן, ומעביר באופן אקטיבי מולקולות נבחרות לתוך האפיתל מהלומן של המעי. הסט השני מוגבל למשטחים הבזולטראליים (בצד הבזאלי והלטראלי) של התא והוא מאפשר לאותן מולקולות שנספגו באמצעות הסט הראשון לצאת בצורת הובלה פאסיבית אל הנוזל החוץ תאי בצד השני של האפיתל.
מלבד למנוע דליפה של מולקולות בין תאי האפיתל למה עוד משמשים
“גדרות” המסייעות במניעת הדיפוזיה של חלבונים אפיקאליים ובאזולטראליים בממברנה לאזור הלא נכון.
אילו חלבונים יוצרים את צמתי האטימה?
- סוג אחד של חלבונים הטראנסממברנאלים העיקריים היוצרים את הצמתים הם הקלאודינים החיוניים ליצירת הצומת ולתפקודו (עכברים חסרי קלאודין בשכבת האפידרמיס של העור יאבדו נוזלים במהירות וימותו יום לאחר היוולדם. לעומת זאת, אם תאים כמו פיברובלסטים מבטאים קלאודין באופן מלאכותי באמצעות ניסוי הם נצמדים זה לזה).
- צמתי אטימה נורמליים מכילים גם חלבון טראנסממברנאלי נוסף – אוקלודין שאינו חיוני להרכבה או למבנה של הצומת אך חשוב להגבלת החדירות של הצומת.
- חלבון טראנסממברנאלי נוסף הוא טריצלולין שדרוש לאטימת ממברנות יחד לשם מניעה של דליפה טרנס-אפיתליאלית בנקודות בהן שלושה תאים נפגשים.

מה מיוחד בקצה של קלואודים ואוקלודין?
שהקצה האמיני והקרבוקסילי של שניהם נמצא בצד הציטוזולי
מה התפקיד של הקצוות קלאודין ואוקלודין?
. לא נראה בתמונה אך מצויין בספר כי הקצוות הלו נקשרים לחלבוני פיגום גדולים המחברים את צומד האטימה לשלד האקטין. עוד ניתן לראות כי החלבונים יוצרים אינטראקציות הומופיליות.
כמה קלאודינים יש בבני אדם?
באדם יש 24 סוגי קלאודין שמתבטאים בקומבינציות שונות ברקמות שונות כדי להקנות חדירות שונה לאפיתל של אותה הרקמה.
מה זה
paracellular pores?
קלאודינים יוצרים אותו
תעלות סלקטיביות המאפשרות ליונים ספציפיים לחצות את המחסום של צומת האטימה מחלל חוץ תאי אחד למשנהו, כלומר, חלק מהחלבונים הללו הם חדירים לחומרים מסויימים. כך למשל בכליה מתבטא קלאודין שמאפשר מעבר של יוני מגנזיום דרכו, כדי לאפשר למגנזיום לעבור מהשתן לדם. כאשר ישנה מוטציה בגן המקודד לקלאודין הזה, רואים שיש הפרשה מוגברת של מגנזיום בשתן
איך חלבוני הפיגום עוזרים בצמתי אטימה?
ולאיזה משפחה הם שייכים?
קושרים את הצד הציטופלסמטי של חלבוני הצומת, ומקנים תמיכה מכאנית לצומת שלמעשה נבנה עליהם.
– חלבונים חשובים השייכים למשפחת ה
ZO = zonula ocledens.
שלוש העיקריים במשפחה הם
zo1
zo2
zo3
כיצד חלבוני הפידום מתחברים קלאודין?
וכיצד הם נקשרים לאוקלודין?
וכיצד הם נקשרים לחלבונים של הולכת אותות?
לאיזה סיב בתא צמתי האטימה יכולים להיקשר?
לחלבוני הקלאודין דרך דומיין הקרוי
PDZ
(סגמנטים של 80 ח. אמינו היכולים לזהות ולהיקשר לזנב
ה- C
טרמינלי של חלבונים ספציפיים) ,
לחלבוני אוקלודין דרך אתר
GK
ולחלבונים של הולכת אותות דרך דומיינים כמו
3SH.
אקטין

כמה דומיינים יש לחלבוני פיגום שיכול להיקשר לקלאודין?
. לחלבוני הפיגום דומיין אחד שיכול להיקשר לקלאודין בעוד שאחרים יכולים להיקשר לאוקלודין או לאקטין. בנוסף, חלבוני הפיגום הללו יכולים להיקשר זה לזה.
איפה נמצאת הרשת של צמתי האטימה?
הרשת של צמתי האטימה לרוב נמצאת אפיקלית לדזמוזומים או צמתי אדהזיה, אך כל המכלול נקרא
junctional complex
והחלקים שלו תלויים אחד בשני לצורך היווצרותם.
מה הם צמתי תקשורת?
הם צמתים המצמדים תאים מבחינה מטבולית וחשמלית.
אילו שני תעלות של צמתי תקשורת ישנם?
קונקסינים
(connexins)
ואינקסינים
(innexins).
איפה קיימים קונקסינים ואיפה קיימים אינקסינים?
קונקסינים הם חלבוני צמתי התקשורת השולטים בבעלי חוליות עם 21 איזופורמים בבני אדם. אינקסינים נמצאים בצמתי תקשורת של חסרי חוליות.
מה הגודל של צמתי התקשורת ומה הן מאפשרות להעביר?
לצמתי התקשורת
pore size
של 1.4 ננומטר המאפשר חילופי יונים אנאורגניים ומולקולות מסיסות אחרות, אך לא מאקרומולקולות כמו חלבונים או חומצות גרעין
מה התאים המצומדים חולקים עי צמתי תקשורת?
פיכך, התאים המצומדים חולקים את המולקולות הקטנות שלהם אך לא את המאקרומולקולות
מה קורה לזרם חשמלי שמוזרק לתוך תא בעזרת ה-
gap junction?
זרם חשמלי המוזרק לתוך תא אחד דרך מיקרואלקטרודה גורם להפרעה חשמלית בתא השכן עקב מעבר של יונים הנושאים מטען חשמלי דרך
ה - gap junctions.
צימוד חשמלי זה דרך ה
gap junctions
משרת מטרה ברורה ברקמות המכילות תאים אקסיטביליים: פוטנציאל הפעולה יכול להתפשט במהירות מתא לתא ללא העיכוב המתרחש בסינפסות כימיות / כך למשל בבעלי חוליות צימוד חשמלי דרך הצמתים האלה מסנכרן את הכיווציות של תאי שריר הלב כמו גם של תאי שריר חלק האחראיים על התנועה הפריסטלטית של המעי.
מאיזה חלבון מורכב צומת תקשורת?
קונקסין
מה הוא קונקסין?
קונקסין הוא חלבון חוצה ממברנה ארבע פעמים. כל תעלה המצויה על ממברנה של תא אחד מורכבת מ – 6 תתי יחידות של קונקסין. 6 היחידות יחד קרויות קונקסון. שני קונקסונים על תאים נפרדים העוברים יישור אחד מול השני יוצרים תעלה רציפה. הספר מציין כי צומת תקשורת עצמו מורכב מהרבה זוגות קונקסונים כאלו במקביל, ויוצרים מעין מסננת מולקולרית.

האם יש לצמתי התקשורת עוד תפקיד מלבד תיאום מטאבולי?
מעניין לדעת כי צמתי התקשורת לא רק אחראים לתיאום מטבולי אלא צמתים אלו מספקים גם פונקציית הצמדה בין התאים.
כיצד ניתן להרכיב את התעלה של הקונקסינים?
יש אפשרות להרכיב את התעלה באופן הומוטיפי או הטרוטיפי במגוון וריאציות. כלומר
Gap junctions
ברקמות שונות יכולים להיות בעלי מאפיינים שונים מאחר והם נוצרו על ידי קומבינציות שונות של קונקסינים ולכן יוצרים תעלות השונות בחדירות ובבקרה שלהן (כמו כן מרבית סוגי התאים מבטאים יותר מסוג אחד של קונקסין). .
האם התעלות של
gap junctions
פתוחות כל הזמן?
לא
זמן החיים של קלנוקסין הוא ארוך לכן אין צורך ש
gap-junctional plaque
יעבור פירוק והרכבה
לא נכון
זמן החיים של קלנוקסין הוא ארוך
מה הוא המסלול להוספה של קונוקסונים חדשים?
הם מוכנסים לממברנה על ידי אקסוציטוזה כמו חלבונים טרנסממברנלים אחרים, ולאחר מכן עוברים דיפוזיה במישור הממברנה עד שהם מתנגשים עם ההיקף של פלאק קונקסון קיים ונתפסים בו. יש לכך השלכות – הממברנה הפלסמטית הרחוק מצמתי התקשורת אמורה להכיל קונקסונים שהם חצי תעלות, כאלו שלא הותאמו עדיין עם המקבילים שלהם בתא אחר
מה ההשלכות של בניית קונקסונים?
הממברנה הפלסמטית הרחוק מצמתי התקשורת אמורה להכיל קונקסונים שהם חצי תעלות, כאלו שלא הותאמו עדיין עם המקבילים שלהם בתא אחר. נהוג לחשוב שאותן חצי תעלות מוחזקות בדרך כלל במבנה סגור שמונע מהתא לאבד את המולקולות הקטנות שלו על ידי דליפה דרכם, אולם יש גם עדויות לכך שבנסיבות מסויימות הן יכולות להיפתח ולשמש כתעלות לשחרור מולקולות סיגנאל קטנות.
מה היא פלסמודזמטה?
צומת שעושה עבודה מאוד דומה לצמתי התקשורת
זוהי בעצם רציפות ציטופלסמטית בין תאי צמח המצויים באותה הרקמה, ובחלקה המרכזי גם רציפות של ה-אי אר החלק נקרא דזמוטיובול.
למה רקמות צמחיות לא צריכות צמתי עגינה?
רקמות צמחיות מאורגנות על פי עקרונות שונים מאלו של בעלי חיים. הסיבה לכך היא שתאי הצמח “כלואים” בדפנות קשיחות המורכבות ממטריצה חוץ תאית העשירה בתאית (צלולוז) ובפוליסכרידים. דפנות התאים של תאים שכנים דבוקות היטב מה שמבטל את הצורך בצמתי עגינה,
מה הוא עובי של דופן התא בין תאים סמוכים?
בין זוג תאים סמוכים הוא בעובי של 0.1 מיקרומטר לפחות
מהי צורת הפלסמוזלה?
עי תעלה גלילית
מה הוא ה-
desmotubule?
החלק המרכזי של התעלה גלילית
הוא רציף עם אלמטים של ה
ER
החלק של כל אחד מהתאים השכנים. בין החלק החיצוני של הדזמוטיובול לבין החלק הפנימי של התעלה הגלילית הנוצרת מהממברנה הפלסמטית, נמצא נוזל ציטוזולי דרכו מולקולות קטנות יכולות לעבור מתא לתא.

מתי נוצרת הפלסדוזמטה?
ממה הן נוצרות?
במהלך הציטוקינזה של חלוקת התא
. הן נוצרות סביב אלמנטים של ה-
ER
החלק שנלכדים על פני התא המתפתח. ניתן להכניסן דה נובו דרך דפנות תאים קיימים שם הם נמצאים בדרך כלל במקבצים צפופים הנקראים
pit fields.
כאשר אין צורך, ניתן להסיר את הפלזמודזמטה.
האם הפלסמודמטה מבוקרת?
ועד איזה משקל מולקולארי ניתן להעביר פלסמודמטה?
ניסויים בהזרקת צבע למשל מראים שיכולים להיות מחסומים לתנועה של מולקולות אפילו כאלה בעלות משקל מולקולרי נמוך בין תאים מסויימים או קבוצות תאים המחוברים באמצעות פלזמודזמטה רגילה לכאורה. המנגנונים המבקרים את התקשורת במקרים אלה עוד לא מובנים.
אילו שלושה מרכיבים חשובים יש בהדבקה תאית?
אינטגרינים – איטרקציה בין התא למטריקס החוץ תאי, למרות שחלק מהם יכולים לתווך הדבקה בין תאים. תלויי סידן.
סלקטינים – יוצרים אינטרקציה זמנית בין תאים, תלויים בסידן, קושרי סוכר (לקטינים).
ig-superfamiliy –
אינם תלויים בסידן.
מה תפקידם העיקרי של האינטגרינים?
תפקידם העיקרי בהדבקה של תא-מטריקס, אך כמה מהם מתווכים הדבקה של תא-תא
במה האינטגרינים תלויים?
תלויים בסידן.
מה הסלקטינים דורשים?
ולמה?
דורשים סידן לצורך פעילות ההדבקה שלהם
מה הם סלקטינים?
ומה תפקידם?
סלקטינים הם חלבונים הקשורים לפני שטח התא וקושרים פחמימות (לקטינים) המתווכים מגוון אינטראקציות הדבקה זמניות בין תאים בזרם הדם. התפקיד העיקרי של הסלקטינים, לפחות בבעלי חוליות, הוא בבקרת התנועה של תאי דם לבנים מזרם הדם לאיברי לימפה נורמליים ולרקמות מודלקות. תאי הדם לבנים מנהלים “חיי נוודים” הנודדים בין זרם הדם לרקמות וזה מצריך התנהגות דביקה מיוחדת. הסלקינים שולטים על קשירת תאי הדם הלבנים לתאי האנדותל המצפים את כלי הדם, ובכך מאפשרים לתאי הדם לנדוד מזרם הדם לרקמה.
איזה סוג הם סלקטינים?
כל סלקטין הוא חלבון טראנסממברנאלי בעל דומיין לקטין שמור אשר נקשר לאוליגוסכריד ספציפי בתא אחר.
אילו שלושה סלקטינים ישנם?
סלקטינים מסוג
L –
מצויים על תאי דם לבנים (לימפוציטים). התפקוד: תאי אנדותל ברקמה לימפטית (למשל טחול, בלוטת לימפה) מבטאים אוליגוסאכרידים המזוהים על ידי הסלקטינים מסוג
L
בלימפוציטים, דבר הגורם ללימפוציטים להילכד/להיתפס ולהגיע אל הרקמה הלימפטית.
סלקטינים מסוג
E –
על אנדותל שמשופעל בגלל דלקת. התפקוד: הפוך מזה שתיארנו קודם. באתר דלקתי תאי האנדותל מבטאים סלקטינים, ואלו נקשרים לאוליגוסאכריד המצוי על גבי הלימפוציטים והטסיות, ומכריחים אותם להגיע אל הרקמה כדי לעזור במצב החירות המקומי.
סלקטינים מסוג
P –
מצויים על טסיות הדם ועל תאי האנדותל.
במה נעזרים סלקטינים כדי להשלים את פעולותיהם?
סלקטינים לא עובדים לבד, הם נעזרים באינטגרינים על מנת להשלים את הפעילות שלהם. אלה מחזקים את הקשר בין כדוריות הדם לאנדותל.
ההיצמדות בין התאים המתווכת עי אינטגרינים וסלקטינין הינה הטרופילת או הומופילית?
ההיצמדות בין התאים המתווכת על ידי אינטגרינים וסלקטינים הינה הטרופילית – סלקטינים נקשרים לאוליגוסכרידים ספציפיים על גליקופרוטאינים וגליקוליפידים ואינטגרינים נקשרים לחברים ספציפי במשפחת ה- Ig.
מה הסלקטינים מתווכים?
סלקטינים מתווכים היצמדות חלשה – הקישור בין הלקטין לבין הליגנד הסוכרי הוא בעל אפיניות נמוכה. זה מאפשר לתאי הדם הלבנים להיצמד באופן חלש והפיך לתאי האנדותל בתנועת גלגול המערבת קישור ושחרור המושפע מזרם הדם.
איך האינטגרינים גורמים לתאי דם הלבנים להגיע לאזור הדלקתי?
האינטגרינים עוברים לקונפורמציית היצמדות המאפשרת להם להיצמד למאקרומולקולות ספציפיות מחוץ לתא. במקרה זה, חלבונים על פני שטח תאי האנדותל. מרגע שהתא חובר באופן זה הוא עוזב את זרם הדם אל הרקמה על ידי זחילה בין תאי האנדותל המרפדים את כלי הדם.
מה קורה בתמונה הבאה?

כפי שהסברנו קודם, סלקינים בתאי האנדותל נקשרים לאוליגוסכרידים בתא הדם הלבן, כך שהוא מתחבר באופן רופף ומתגלגל לאורך דופן הכלי.
לאחר מכן, תאי הדם הלבנים מפעילים אינטגרין בשם
LFa1
הנקשר לחלבון
ICaM1
על ממברנת תא האנדותל. תאי הדם הלבנים דבוקים לדופן הכלי, ואז זוחלים דרכו באמצעות תהליך הדורש
pECaM1 (או CD3),
חלבון השייך למשפחת
Ig superfamily.
חלבוני
ig
superfamily?
חלבונים השייכים למשפחה זו הם חלבונים גדולים חוצי ממברנה המכילים ריבוי שיירי ציסטאין הנוטים ליצר קשרי
SS
ברים במשפחת על זו מכילים דומיין דמוי נוגדנים חוץ תאי אחד או יותר. יש להם תפקידים רבים מחוץ למערכת החיסון ושלא קשורים להגנה חיסונית. הם יכולים לגרום להדבקה וגם לדיכוי הדבקה, והתפקידים השונים שלהם נגזרים משחבור חליפי.
אילו חלבונים הם אנדתיאליים ומוכרים עי תאי דם לבנים?
icam / vcam
vcam
אלה מתווכים קישור הטרופילי לאינטגרינים, אך חברים רבים אחרים במשפחת ה-
Ig
ncam
icam
שמבוטא על סוגי תאים שונים כולל מרבית תאי העצב, ויכולה ללבוש צורות שונות, שנוצרות על ידי שחבור חלופי של טרנסקריפט
RNA
בודד. מעניין לדעת כי כמה צורות של
NCAM
נושאות כמות גדולה במיוחד של חומצה סיאלית (עם שרשראות המכילות מאות יחידות חוזרניות של חומצה סיאלית). מתוקף המטען השלילי שלהן, שרשרות חומצות הפוליסיאליות הארוכות יכולות להפריע להידבקות התאים (כי מטענים דומים דוחים זה את זה). לפיכך, צורות אלה של
NCAM
יכולות לעכב הדבקה, ולא לגרום לה.
מה התפקיד הקדהרין ומה התפקיד של
ig-superfamily?
קדהרינים הן לרוב חזקות בהרבה ואחראיות על ההחזקה של התאים יחד, הפרדה של תערובת תאים לרקמות נפרדות ושמירה על השלמות של הרקמה.
לעומת זאת
ig-superfammiliy
כמו
NCAM
חשובים כנראה לסוג של
fine tuninig (עידון)
של אינטרקציות היצמדות אלו במהלך ההתפתחות והרגנרציה של רקמות. בניגוד לקדהרינים, שמוטציה בהם בעכברים היא מוטציה לטאלית שגורמת למוות בשלב התפתחותי מוקדם, מוטציה ב-
NCAM
היא ויאבילית לחלוטין ומאפשרת התפתחות בצורה יחסית תקינה (נציין כי המוטנטים מראים כמה חריגות קלות בהתפתחות רקמות ספציפיות, כולל חלקים ממערכת העצבים).
ממה מורכבות רקמות?
מתאים הן גם מכילות רשת מורכבת של מאקרומולקולות המהוות את המטריצה החוץ תאית. מטריצה זו מורכבת מחלבונים רבים ומפוליסכרידים שונים שהופרשו באופן מקומי והתכנסו לרשת מאורגנת והדוקה עם משטחי התאים המייצרים אותם.
מי אחראי על ייצור המטריקס?
הפיברובלסטים
האם הציטוסקלטון של תא יכול להשפיע על אוריינטציית המטריקס?
כן
מי מפריש את רקמת החיבור סחוס ועצם?
כונדרובלסטים ואוסטאובלסטים בהתאמה
מאילו שלוש מחלקות של מאקרומולקולות בנוי המטריקס החוץ תאי?
GAGs (glycosaminoglycan)
חלבונים סיביים
גליקופרוטאינים שאינם קולגן
מה הוא ה-
gag?
פוליסכרידים גדולים וטעונים, לרוב קשורים לחלבונים קוולנטית לחלבון בצורת פרוטאוגליקאנים. מולקולות הפרוטאוגליקאן ברקמות חיבור מהוות בדרך כלל מבנה דמוי ג’ל בו מוטמעים קולגן וגליקופלרוטאינים. הג’ל הפוליסכרידי מתנגד לכוחות דחיסה על המטריצה תוך כך שהוא מאפשר דיפוזיה מהירה של חומרים מזינים, מטבוליטים והורמונים בין הדם לתאי הרקמות.
מה הם חלבונים סיביים כמו קולאגן?
סיבי הקולגן מחזקים ומסייעים בארגון המטריצה, בעוד חלבונים סיביים אחרים, כמו האלסטין הדומים לגומי, מעניקים לה חוסן.
במה תורמים גליקופרוטאינים שאינם קולאגן?
כמו למינין, פיברונקטין – מקנים תכונות נוספות כמו למשל עזרה לתאים נודדים להתיישב במקום הנכון.
כמה חלבוני מטריקס יש ביונקים?
, ביונקים יש כמעט 300 חלבוני מטריקס: מעל 200 גליקופרוטאינים (שכוללים בדרך כלל תתי דומיינים רבים ויוצרים מולטימרים), כ- 40 קולגנים וכ-36 פרוטאוגליקנים.
האם מטריצה חוץ תאית משתנה מרקמה אחת לרקמה אחרת?
כל רקמה מכילה תערובת ייחודית משלה של רכיבי המטריקס, וכתוצאה מכך מטריצה חוץ תאית המתמחה לצרכי אותה רקמה.
מה הם ה-
gags?
GAGים
הם פוליסכרידים לא מסועפים המורכבים מיחידות חוזרניות של די סכריד: סוכר אחד הוא סוכר אמינו
(NAG)
שבדרך כלל עובר סולפטציה והשני הוא
uronic acid
(חומצה גלוקורונית או אידורונית).
באיזה מטען טעונים ה-
gags
ולמה?
ה-גאגים טעונים שלילית משום שיש על הדי סכרידים המרכיבים אותם סולפט או קרבוקסיל. מדובר במולקולות האניוניות ביותר המיוצרות על ידי תאים אנימאליים.
מה הן ארבעת הקבוצות של
gags?
הילורונאן
(hyaluronan)
כוינדרוטין סולפאט ודרמטאן סולפאט
(chondroitin sulfate ו-dermatan sulfate)
הפראן סולפאט
(heparan sulfate)
קרטאן סולפאט
(keratan sulfate)
מה תופס את רוב הנפח החוץ תאי?
שרשראות הפוליסכריד הן נוקשות מכדי להתקפל למבנה גלובולארי והן הידרופיליות מאוד כך שלמעשה תופסות נפח עצום ביחס למסתן, הודות לקונפורמציה המורחבת שהם נמצאים בה. משקלם פחות מ-10% ממשקל החלבונים ברקמת החיבור אבל הם תופסים את רוב הנפח החוץ תאי
מתי הפוליסכרידים במטריקס ייצרו מבנה ג’לי?
בריכוזים נמוכים
מה גורמים המטענין החשמליים של ה-
GAGS?
פיפות הגבוהה של המטענים השליליים מושכת ענן של קטיונים, במיוחד יוני נתרן הפועלים באופן אוסמוטי, דבר הגורם לכמויות גדולות של מים להישאב לתוך המטריצה. זה מאפשר למטריצה להתנגד לכוחות דחיסה (בניגוד לקולגן שמאפשר התנגדות לכוחות מתיחה). מטריצת הסחוס שמקשרת את מפרק הברך, למשל, יכולה לתמוך בלחצים של מאות אטמוספרות בדרך
פגיעה בסינטזה
disaccharide dermatan sulfate
מה גורמת?
פגיעה בסינטזה של
gags
האנשים הלוקים בה הם בעלי קומה נמוכה, נוטים להזקנות בגיל מוקדם, ובעלי פגמים כלליים בעור, במפרקים, בשרירים ובעצמות.
מה הוא ה-
gag
הפשוט ביותר?
הילורונאן המכונה גם hyaluronic acid ו- hyaluronate
כמה די סאכרים מכילה הילרואן? ואילו קשרים יש לה שם?
הילורונאן מכיל עד 25,000 דיסאכרידים חוזרניים שלNAG וחומצה גלוקורונית בקשר בטא 1,3 וגם בטא 1,4
באילו רקמות נמצא ההילוארן?
נמצא בכמויות משתנות בכל הרקמות במבוגרים ונפוץ במיוחד בעוברים מוקדמים.
האם יש להילוראן סולפאט בסוכרים שלו?
לא
האם האילוראן מחור לחלבון?
לא
מי גורם ללהילוראן להיות מופרש מהתא?
קומפלקס אינזימתי
איזה תפקיד חשוב יש להילוראן?
תפקיד חשוב של הילורונאן הוא התנגדות למתח וכוחות דחיסה ברקמות ובמפרקים, אך גם כנראה כ”ממלא חלל” במהלך ההתפתחות העוברית, שם ניתן להשתמש בו בכדי לכפות שינוי בצורת המבנה, שכן כמות קטנה שלו מתרחבת עם מים לתפיסת נפח גדול.
מאיפה מסונטז הילוראן?
הילורונאן המסונתז באופן מקומי מהצד הבזאלי של תאי האפיתל יכול לעוות את האפיתל על ידי יצירת חלל נטול תאים מתחתיו, כך שתאים יוכלו לנדוד לשם לאחר מכן. בלב המתפתח, למשל, סינתזת הילורונאן מסייעת בדרך זו להניע את היווצרות השסתומים והמחיצה המפרידה בין חדרי הלב. תהליכים דומים מתרחשים במספר איברים אחרים. כאשר נדידת התאים מסתיימת, עודף ההילורונאן מפורק לרוב על ידי האנזים היאלורונידאז
מה הילורונאן יודע לעשות?
הילורונאן מיוצר בכמויות גדולות גם בתהליכי ריפוי פצעים, ומצוי גם במפרקים שם מהווה מרכיב חשוב בנוזל המפרקין ומשמש כחומר סיכוך.
למה קשורים כל ה-gag?
מלבד הילורונאן, כל ה-
גאגים האחרים קשורים קוולנטית לחלבונים כפרוטאוגליקאנים (מבנה סוכרי שעליו חלבונים), המיוצרים על ידי רוב תאי בעלי החיים.
כיצד חלבוני הליבה של הפרוטיאוגלאנים מסונטזים?
חלבוני הליבה מתורגמים בתהליך של
cotranslational
בעזרת ה-
ER .
שרשראות הפוליסכריד יורכבו בעיקר על חלבון הליבה הזה. המרכיב הסוכרי עובר הרכבה על חלבון הליבה בגולג’י, לפני המסירה לחוץ התא באקסוציטוזה. התהליך מתחיל בהרכבה של פריימר של טטרה-סאכריד לשייר ה-
R
של חומצה האמינית סרין בחלבון הליבה של הפרוטאוגליקאן
למה משמש הטטרה סכריד בסינטזת חלבוני הליבה של
gag?
הטטראסכריד משמש כפריימר לגדילת הפוליסכריד. לאחר מכן מוספים סוכר אחד בכל פעם על ידי גליקוזיל טראנספראז ספציפי.
על איזה ח”א מסונטז הטטרסכריד בחלבוני הליבה של פרוטאוגליקנים?
סרין
איזה די סכריד יהיה מורכב כאשר מדובר בהרכבה של
כרונודיריטין סולפט?
D-glucuronic acid ו-N-acetyl-D-galactosamine,
ממה יהיה מורכב די סכרידהפראן סולפאט?
D-glucuronic acid או L-iduronic acid
ו-N-acetyl-Dglucosamine
איזה די סכריד כאשר מדובר בקרטאן סולפאט?
D-galactose ו- N-acetyl-D-glucosamine.
מה מכיל הטטרסכריד?
הטטראסכריד מכיל קסילוז, גלקטוז וחומצה גלוקורונית (על פי הנראה בתמונה, לא מצויין בטקסט) והוא כאמור מחובר ב –
O linked.
עוד בגולג’י הוא עובר המון תוספות ושינויים על ידי סדרת תגובות רציפה ומתואמת. חלק מהשינויים כוללים אפימריזציה (שינוי סביב פחמן יחיד) וסולפיזציה (שמגדילה את המטען השלילי).
איך נבדלים הפרוטאוגליקאנים מהגליקופרואטינים?
הפרוטאוגליקאנים נבדלים בבירור מגליקופרוטאינים אחרים בתכונותיהם וכן בכמות והסידור של שרשראות הסוכר הצדדיות שלהם. פר הגדרה, לפחות אחת משרשראות הסוכר בפרוטאוגליקאן חייבת להיות
GAG.
כמו כן, בעוד שהגליקופרוטאינים בדרך כלל מכילים שרשראות של אוליגוסכרידים קצרות יחסית ומסועפות התורמות רק חלק קטן ממשקלם, משקלם של פרוטאוגליקאנים יכול להיות מורכב מכ-
95%
סוכר שרובו שרשראות ארוכות ללא הסתעפויות כמעט, כשכל שרשרת מכילה בדרך כלל כ-80 סוכרים.
האם פרוטאיוגליקראנים הם וריאביליים ?
כן
כמה שרשראות של
gag
יש לדכורין וכמה יש לאגרכאן?
אגרקאן שמהווה מרכיב עיקרי בסחוס, מכיל מעל 100 שרשראות
GAG
בעל משקל מולקולרי של
3 × 106
דלטון, ואילו דכורין, המופרש מהפיברובלפסטים, מכיל רק שרשרת אחת.
ממה מורכב האגראקן
עוד מצויין כי אגרקאן מורכב בדרך כלל מכ- 100 שרשראות של
chondroitin sulfate
וכ-30 שרשראות של
keratan sulfate
המחוברות לחלבון ליבה עשיר בסרין המכיל כ-3000 חומצות אמינו.
מה התפקיד של דוכרין?
דכורין “מקשט”
(=decorates)
את סיבי הקולגן ומכאן שמו. הוא מבקר את הרכבת הסיב וקוטר הפיבריל. עכברים שאינם יכולים ליצור דכורין הם בעלי עור שביר שמופחת בכוחות מתיחה.
למה ה-gags
ואפרוטיאוגליקאנים יכולים להתחבר?
קומפלקסים פולימריים גדולים יותר במטריקס החוץ תאי
האם כל הפרוטיאוגליקאנים מופרשים למטריקס?
חלקם הם רכיבים אינטגרליים של הממברנה הפלסמטית ויש להם חלבוני ליבה משלהם המוכנסים לרוחב הדו-שכבה או מעוגנים על ידי GPI (glycosylphosphatidylinositol).
מה הוא הסינדקאנס?
פרוטאוגליקאן שלא מופרש למטריקס והוא חלבון ליבה חוצה ממברנה
עם מה הדומיין התוך תאי של הסינדקנס יוצר אינטראקציה?
איפה הם ממוקמים?
עם מה הסינדקנס פועלים?
והדומיין התוך תאי שלו יוצר אינטראקציה עם שלד האקטין ועם מולקולות סיגנאל בקליפת התא.
ה-Syndecans
ממוקמים על פני סוגי תאים רבים כולל פיברובלסטים ותאי אפיתל.
בפיברובלסטים ניתן למצוא אותם בצמתי תא-מטריקס, שם הם מווסתים את תפקוד האינטגרינים על ידי אינטראקציה עם פיברונקטין על פני התא וכן עם חלבוני שלד תאי וחלבוני סיגנאל בתוך התא.
Syndecan ופרוטאוגליקאנים אחרים פועלים עם
growth factors
פפטידיים ומסיסים ומשפיעים על גדילה ופרוליפרציה.
מה הם הקולגנים?
עי מי הם מופרשים?
כמה קולגן מהווה ממסת החלבון אצל יונקים
הקולגנים הם משפחה של חלבונים סיביים הנמצאים בכל בעלי החיים הרב-תאיים. הם מופרשים בכמויות גדולות על ידי תאי רקמת חיבור, ובכמויות קטנות יותר על ידי סוגי תאים רבים אחרים. כמרכיב עיקרי של עור ועצם, קולגנים הם החלבונים השופעים ביותר ביונקים, שם הם מהווים 25% מכלל מסת החלבון.
האם אפלא קולגן הוא אלפא הליקס?
לא
מה היא הזווית סיבוב בסיב קולאגן?
120 מעלות
ממה מורכבת כל שרשרת קולגן ?
gly-x-y
x- פרולין
y- הידרוקסיפרולין
מכמה ח”א מורכבת כל שרשרת קולאגן?
1000 ח”א
כמה גנים מקודדים לקולאגן?
42 גנים
כמה סוגים שונים של קולאגן ידועים לנו?
40
מה הוא קולאג סוג 1?
מה הוא מקנה ?
איפה הוא נמצא?
מה קורה לו לאחר שהוא מופרש החוצה?
הנפוץ ביותר, מצוי בעיקר בעור ובעצם ומקנה חוזק מכאני. הוא שייך לקולגנים הפיברילאריים (קולגנים סיביים) או
fibril-forming collagens:
לאחר שהופרשו לחלל החוץ תאי הם מורכבים לפולימרים מסדר גבוה יותר הנקראים
collagen fibrils.
אלו הם מבנים דקים (קוטרם 10–300 נ”מ) באורך של מאות מיקרומטרים ברקמות בוגרות. ה-
collagen fibrils
מצטברים לכדי צרורות גדולים יותר דמויי תאים בקוטר של כמה מיקרומטרים, המכונים
collagen fibers.
קולגן מסוג
II ?
איפה הוא נמצא?
מצא בסחוס, פחות קשיח מקולגן 1.
מה הוא קולאגן מספר 4?
רשת היוצרת חלק נרחב מהלמינה הבזאלית.
מה הוא קולאגן מסוג 9 ו-12
מקשטים את פני השטח של סיבי קולגן. מקשרים את סיביהם לרכיבים שונים במטריקס החוץ תאי.
fibril-associated collagens
מה הוא קולאגן מסוג 7?
וצרים דימרים המורכבים למבנה מיוחד הקרוי
anchoring fibrils.
מבנה זה מסייע לצרף את הלמינה הבזאלית של תאי האפיתל הרב שכבתי לרקמת החיבור ולכן הם שופעים מאוד בעור.
אילו חלבונים דמויי קולאגן ישנם?
אלו כוללים את קולגן סוג 17 המכיל דומיין טרנסממברנלי וקיים בהמידזמוזום, וסוג 18 חלבון הליבה של הפרוטאוגליקנים בממברנת הבסיס
לאילו כוחות גאגים מתנגדים ולאילו כוחות קולאגן מתנגד?
קולגן מתנגד למתיחה
gag
לדחיסה
מה בקולגן יכול להעיד שחלבונים רבים התפתחו על ידי דופליקציות חוזרניות של רצף דנ”א מקורי, והולידו דפוס חוזר של חומצות אמינו.
גנים שמקודדים לשרשראות אלפא של מרבית הקולגנים הסיביים גדולים מאוד (מעל 44 ק”ב באורך) ומכילים כ-50 אקסונים. רוב האקסונים מורכבים מ-54 נוקלאוטידים או כפולות של 54 נוקלאוטידים, מה שמרמז כי הקולגנים הללו מקורם בדופליקציות מרובות של גן קדמון המכיל 54 נוקלאוטידים ומקודד לבדיוק שש חזרות של
Gly-X-Y .
איך הקולאגן מתארגן בעור?
הם ארוגים בדפוס כזה בו הם מתנגדים ללחץ מתיחה בכיוונים מרובים מה שמסייע לעור להישמר כראוי.
מה קובע את גודל סיבי הקולגן?
תאי רקמת החיבור תאים יכולים לבטא אחד או יותר גנים לסוגים השונים של מולקולות קולגן סיבי.
מדוע פיבריליות שמורכבות מאותה תערובת של קולגן יש סידורים שונים ברקמות שונות?
חלק מהתשובה היא שתאים יכולים לווסת את המערך של מולקולות הקולגן לאחר ההפרשה על ידי הנחיית היווצרות פיברילות קולגן קרוב לממברנה הפלסמטית. בנוסף, תאים יכולים להשפיע על הארגון הזה על ידי כך שהם מפרישים מולקולות נוספות למטריקס כמו פיברונקטין מה שמקדם את יצירת פיברילות הקולגן ועוזר בארגון שלהן.
Fibril-associated collagens
איך נבדלים מהקולגן?
הם נבדלים מהקולגן הרגיל הפיברילי בכך שההליקס שלהם הוא לא רציף (יש להם חלק לא הליקסי) מה שהופך אותם למעט יותר גמישים. שנית, הם לא עוברים אגרגציה אחד עם השני מחוץ לתא, אלא נקשרות לפיברילים.
מה תפקיד ה-
Fibril-associated collagens
הם נחשבים לסוג של קולגן המתווך את האינטרקציה והארגון של סיבי קולגן אחד עם השני ועם מאקרומולקולות אחרות במטריקס כדי לסייע לקבוע את ארגון הסיבים במטריצה. כך סוג 9 נקשר לאגד קולגן 2 של סחוס, קרנית וזגוגית העין וקולגן 12 נקשר לסוג 1 בגידים וברקמות אחרות.
איזה סוגי אינטרקאציות יש בין התאים למטריקס חוץ תאי?
כימית ומכאנית
אילו תאים משפיעים על רקמת הקולאגן?
פיברובלאסטים
איך הפיברובלרטים אחראים על ארגון המטריצה בתאי הגוף?
הפיברובלסטים מסנתזים את סיבי הקולגן ומסדרים אותם באורינטציה הנכונה. לאחר מכן הם נעים על גבי המטריקס שהם הפרישו, זוחלים ומושכים אותו ליצירה של גידים, רצועות ושכבות קשות וצפופות של רקמות חיבור המקיפות וחברות יחד את את מרבית איברי הגוף.
האם הקולגן הוא גליקופרוטאין?
כן
איזה ויטמין גורם למחסור בקולאגן?
ויטמין סי
מחלת הפרכת
גרמת כתוצאה מפגם בקולגן 1 – זוהי מחלת רקמת חיבור תורשתית. המחלה גורמת לפריכות בעצמות ולכן ניתן לצפות בשברים מרובים. בנוסף, החולים הללו עשויים לסבול מחירשות, הפרעה בהתפתחות השיניים, גמישות יתר של המפרקים ולובן העין עשוי להיות בצבע כחול זאת משום שקולגן 1 מצוי בעין והצבע שלה גם נגזר מכמה הסיבים קשיחים וישרים.
איזה חלבון ניתן למצוא במטריצה החוץ תאית מחבד קולאגן?
אלסטין
אילו תכונות האלסטים מקנה לרקמות?
את הגמישות שלהן: רקמות רבות של חולייתנים, דוגמת העור, כלי דם והריאות, צריכות להיות גם חזקות אך גם אלסטיות על מנת לתפקד. רשת של סיבים אלסטיים במטריקס החוץ תאי של רקמות אלו מקנה להן את היכולת להתאושש ולחזור לצורתם המקורית לאחר מתיחה זמנית. סיבים אלו ניתנים להרחבה פי חמש יותר מרצועת גומי באותו חתך. עם זאת, סיבי קולגן ארוכים ולא גמישים שזורים בתוך הסיבים האלסטיים על מנת להגביל את המידה בה הם יכולים להתמתח ועל מנת למנוע את קריעת הרקמה.
מה דומה ומה שונה בין קולגן לאלסטין?
חלבון הידרופובי מאוד בעל 750 חומצות אמינו. בדומה לקולגן, האלסטין עשיר בשיירי פרולין וגליצין ובשונה מקולגן לא עובר גליקוזילציה.
טרופואלסטין?
הפרקורסור הביוסינטטי של אלסטין, מופרש לחלל החוץ תאי ועובר הרכבה לסיבים אלסטיים הקרובים לממברנת התא. כשהחלבון מופרש החוצה מהתא הוא מורכב לסיבים אלסטיים הקרובים לממברנה הפלסמטית. לאחר ההפרשה, מולקולות הפרקורסור הופכות קשורות מאוד זו לזו ויוצרות רשת נרחבת של סיבי אלסטין.
איזה סוגים של סגמנטים מורכב האלסטין?
סגמנטים הידרופוביים החשובים למאפיינים האלסטיים של המולקולה.
אלפא הליקס עשירים באלאנין וליזין האחראיים על יצירת קשרי הצילוב עם מולקולות שכנות על ידי קשרים קוולנטים בין שיירי ליזין קרובים.
איפה מצוי האלסטין?
אלסטין שופע במטריקס החוץ תאי של עורקים, ולמעשה הוא החלבון החוץ תאי הדומיננטי בהם
מה קורה כאשר יש אלסטין מוטנטי בעברים או בבני אדם ?
מעניין לדעת שכשאלסטין מוטנטי בעכברים או בבני אדם, לא רק שהעורק עובר היצרות, אלא גם שתאי השריר החלק בדפנותיו עוברים פרוליפרציה, כך שמסתבר שהאלסטיות התקינה של עורק נדרשת כדי להאט את קצב הפרוליפרציה של תאים אלו.
האם האלסטין הוא המרכיב היחידי בסיבים אלסטיים?
לא
במה עטוף האלסטין?
האלסטין עטוף במיקרופיברילים שלכל אחד קוטר של כ- 10 ננומטר.
ה- microfibrils
מופיעים לפני אלסטין ברקמות מתפתחות ולכן מאמינים כי הם מהווים פיגומים להנחייה ולארגון של האלסטין עצמו.
האם ניתן למצוא מיקרופיסרילים ללא אלסטין?
כן לדוגמה בעין
ממה מורכבים המיקרופיברילים?
ומה היא תסמונת מרפן ?
המיקרופיברילים מורכבים ממספר גליקופרוטאינים שונים, האחד מהם הוא הגליקופרוטאין הגדול פיברילין הנקשר לאלסטין וחיוני לשלמותם של הסיבים האלסטים. מוטציה בו גורמת לתסמונת מרפן . במרבית החולים, אבי העורקים נמצא בסיכון גבוה לקריעה
תופעות שכיחות אחרות כוללות מיקום לא נכון של עדשות העין ומופיעות אבנורמליות שונות בשלד ובמפרקים
מה הם גליקופרוטינים?
כיצד הם ערוכים?
מה תפקידם?
גליקופרוטאינים רבים הם חלבוני פיגום גדולים המכילים עותקים רבים של דומייני אינטראקציה ספציפיים לחלבון. כל דומיין מקופל למבנה גלובולארי נפרד ודומיינים רבים כאלה ערוכים לאורך החלבון כמו חרוזים על חוט. חלבונים אלה תורמים אפוא הן לארגון המטריצה והן מסייעים לתאים להיקשר למטריצה. בדומה לפרוטאוגליקנים, הם גם מנחים את תנועות התאים ברקמות מתפתחות, באמצעות כך שהם משמשים מסלולים שלאורכם תאים יכולים לנדוד או ככאלה המרחיקים את התאים מאזורים אסורים. הם יכולים גם לקשור ובכך להשפיע על תפקודם של
eptide growth factors
ומולקולות קטנות אחרות המיוצרות על ידי תאים סמוכים.
כמה גליקופרוטאינים נמצאין במטריצה חוץ תאית של יונקים?
200
מה פיברונקטין מכיל ?
ומה מכילים גליקופרוטאינים שונים?
פיברונקטין מכיל עותקים רבים של שלושה
fibronectin repeats
שלוש חזרות
FN3
בסמוך לקצה ה-
C
טרמינלי יוצרות אתר קישור חשובים לאינטגרינים ואילו אחרות מעורבות בקשירת פיברין, קולגן והפרין כמתואר. חלבוני מטריצה אחרים מכילים רצפים חוזרים הדומים לאלו של
EGF
הרגולטור העיקרי לצמיחת תאים ושגשוגם. חזרות אלה עשויות לשרת פונקציית סיגנאל דומה בחלבוני מטריקס.
חלבונים אחרים מכילים דומינים כמו חזרות של
insulin-like growth factor-binding protein (IGFBp)
הקושרים ומווסתים את תפקודם של גורמי גדילה מסיסים.
ממה נוצרים הגליקופרוטאינים?
רבים מחלבונים אלה מקודדים על ידי רנ”א שעובר שחבור בדרכים שונות כמו הוספה והסרת אקסונים כמו אלה שבפיברונקטין. ואם זה לא מספיק, פונקציות הפיגום והרגולציה של חלבוני מטריקס רבים מורחבות עוד יותר על ידי הרכבה לצורות מולטימריות.
מה הוא פיברינוקטין?
גליקופרוטאין גדול המצוי בכל בעלי החוליות וחשוב לאינטראקציות רבות בין תאים למטריקס.
מה קורה לעכבים שלא מצליחים לייצר פיברינוקטין?
עכברים מוטנטים שלא מצליחים לייצר פיברונקטין תקין מתים מוקדם בהתפתחות העוברית מאחר ותאי האנדותל שלהם לא מצליחים ליצור כלי דם תקינים. פגם זה כנראה נוצר בשל אבנורמליות באינטראקציות בין תאים אלו עם המטריקס החוץ תאי שסביבם שלרוב מכיל את החלבון פיברונקטין.
ממה פיברונקטין מורכב?
פיברונקטין הוא דימר המורכב משתי תתי יחידות גדולות מאוד שאליהן מצטרפים קשרי די סולפיד בקצוות ה-
C
טרמינאליים שלהם. כל תת יחידה כוללת סדרה של דומיינים קטנים וחוזרניים (או מודולים) המופרדים על ידי שרשרת פוליפפטיד גמישה.
עי מה מקודד כל דומיין של פירבונקטין?
כל דומיין מקודד בדרך כלל על ידי אקסון נפרד, מה שמרמז כי הגן של פיברונקטין כמו הגנים המקודדים לחלבוני מטריקס רבים, התפתח באמצעות דופליקציות מרובות של אקסונים.
מה הוא הדומיין העיקרי של פיברונקטין?
הדומיין החוזר העיקרי נקרא
type III fibronectin
ואורכו כ-90 חומצות אמינו, והוא חוזר לפחות 15 פעמים בכל תת יחידה. חזרה זו היא מבין הנפוצות מכל דומיני החלבון בחולייתנים
כמה גנים של פיברונקטין יש בגנום האנושי?
ישנו גן אחד של פיברונקטין והוא בעל 50 אקסונים
איזה רצפים בפיברונקטין חשובים לשם קשירת אינטריגינים
Arg-Gly-Asp
איזו דרך יש על מנת לנתח את חלבון פיברונטקין?
לסנתז אזורים בודדים של החלבון ולבדוק את יכולתם לקשור חלבונים אחרים. בשיטות אלה ואחרות ניתן היה להראות שאזור אחד של פיברונקטין נקשר לקולגן, אזור אחר לפרוטאוגלקנים ואחר לאינטגרינים ספציפיים על פני השטח של סוגים שונים של תאים. לאחר מכן השתמשו בפפטידים סינתטיים המתאימים למקטעים שונים של הדומיין הקושר אינטגרין והראו כי הקישור של פיברונקטין לאינטגרינים על פני שטח תאים תלוי ברצף בן שלוש חומצות אמינו-
RGD:
ארגינין-גליצין ואספרטט
(Arg-Gly-Asp)
האם רק לפיברונקטינים יש
rgd?
לא גם לפפטידים קצרים אחרים דבר המאפשר את היקשרות התאים למטריקס החוץ תאי
באילו תרופות ניתן למצוא פפטידים בעלי
RGD?
תרופות נוגדות קרישה
במה נחשים משתמשים על מנת לגרום לקורבנותיהם לדמם?
ם מפרישים חלבונים אנטי קרישתיים המכילים
RGD
ומכונים
disintegrins
לארס שלהם.
האם זה מספיק
rgd
בלבד על מנת שאינטגרין יקשר?
לא יש צורך בגורמיםנוספים
היכן פיברונקטין יכול להסתובב?
פיברונקטין יכול להסתובב בגרסה המסיסה שלו בדם ובמטריקס החוץ תאי, והוא יכול להתארגן גם לפיברילים לא מסיסים על ידי יצירת קשרי
SS
נוספים עם דימרים נוספים שיוצרים חלק מהמטריקס החוץ תאי.
מתי מולקולות הפיסברינוקטין מתארגנות לסיב?
בשונה ממולקולות קולגן סיבי, שיכולות להיות מורכבות לסיב גם במבחנה, מולקולות פיברונקטין מתאספות לפיברילים רק בתאים ורק במקומות בהם אותם תאים מחזיקים בחלבונים מתאמים הקשורים לפיברונקטין בעיקר אינטגרינים.
מדוע פיברינוקטין יכול להתאסף לסיב רק כאשר יש אינטיגרינים?
אינטגרינים מספקים קישור בין הפיברונקטין החוץ תאי לשלד האקטין התוך תאי. הקשר הזה גורם למתיחה למולקולות הפיברונקטין ולחשיפת דומיין “סודי” .חשיפת האתרים הנסתרים מאפשרת למולקולות הפיברונקטין להיקשר ישירות אלו לאלו ולגייס מולקולות פיברונקטין נוספות ליצירת סיב. תלות זו במתח ובהיקשרות לפני שטח התא מבטיחה שפיברילות של פיברונקטין יווצרו היכן שיש צורך מכני בהם ולא באתרים לא מתאימים כמו זרם הדם.
איזה חלבון הוא מכנוסנסר של במטריצה החוץ תאית?
פיברונקטין
מה זה הלאמינה הבאזאלית?
היא צורה מיוחדת של מטריקס חוץ תאי. היריעה הדקה, הקשיחה והגמישה הזאת מהווה בסיס חיוני לשכבת תאי אפיתל. על אף שהיא קטנה בנפחה, יש לה תפקיד קריטי בארכיטקטורה של הגוף.
האם לכל בע”ח יש לאמינה באזאלית?
בדומה לקדהרינים נראה כי היא מהווה אחת מהתכונות המגדירות שמשותפות לכל בעלי החיים הרב-תאיים, ונראה שהיא הופיעה כבר בשלב מוקדם מאוד בהתפתחותם – המרכיבים המולקולריים העיקריים של הלמינה הבזאלית הם מהמאקרומולקולות חוץ תאיות של המטריקס מהקדומות ביותר.
מה העובי של הלאמינה הבאזאלית?
ומה היא?
מה היא מקיפה?
היא לרוב בעובי של 40-120 ננומטר והיא בעצם אוסף של סיבי מטריקס המתארגנים במבנה מיוחד. יריעה זו של הלמינה הבזאלית לא רק מהווה את הבסיס לתאי אפיתל אלא גם מקיפה תאי שריר, שומן ותאי שוואן (התאים המקיפים את האקסונים של הנוירונים הפריפריאליים ליצירת מעטפת המיאלין שלהם).
אילו שלוש דרכים מרכזיות הלאמינה הבאזאלית יכולה להתארגן?
הלמינה הבזאלית יכולה להקיף תאים מסויימים כמו תאי שריר שלד.
הלמינה הבזאלית עומדת בבסיס האפיתליה
הלמינה הבזאלית מונחת בין שתי יריעות תאים ומהווה חוצץ (כמו בגלומרולוס בכליה, שבמקרה זה היא חוצצת בין תאי אנדותל ואפיתל בכליה, ובעלת פונקציה של סינון ותמיכה).
מה התפקיד של הלאמינה הבאזאלית?
הפרדה ובסינון ממברנת הבסיס מסייעת בקביעת הפולריות של התאים, משפיעה על מטבוליזם של התא, על ארגון החלבונים בממברנות הפלסמטיות השכנות, מקדמת הישרדות או התמיינות של תאים ומשמשת כמסלול להגירת תאים.
כיצד התפקיד המכאני של הלאמינה הבאזאלית מתבטא?
התפקיד המכני של ממברנת הבסיס הינו חיוני. בעור למשל, שכבת האפיתל החיצונית (האפידרמיס), תלויה בחוזק של ממברנת הבסיס על מנת להישאר מחוברת לרקמת החיבור מתחת (הדרמיס). לאנשים שלהם פגמים גנטיים במרכיבי ממברנת הבסיס או בקולגנים ספציפים המעגנים את ממברנת הבסיס, רקמת החיבור האפידרמיס נוטה להתנתק מהדרמיס.
זה יוצר מחלת שלפוחיות הנקראת
junctional epidermolysis bullosa ,
מחלה קשה מאוד היכולה להיות לטאלית.
מה הוא למינין?
ממה הוא מורכב?
למינין הוא המארגן העיקרי של מבנה היריעה, ומוקדם בהתפתחות הלמינה הבזאלית הכילה בעיקר מולקולות למינין. למינינים מהווים משפחה גדולה של חלבונים, כל אחד מהם מורכב משלוש שרשראות פפטידיות ארוכות (מעל 1500 חומצות אמינו) – אלפא, בטא וגמא, המוחזקות זו לזו על ידי קשרים דיסולפידים ואשר מסודרים בצורת זר א-סימטרי (כמו זר משלושה פרחים שהגבעולים שלהם מסובבים אחד כלפי השני אך ראשיהם נשארים נפרדים). הוא מתארגן למבנה הצלב בעזרת
coiled coil
שנוצר באזור.
האם ההטרוטרימר של הלמינין יכול להיות מורכב באופן עצמאי במבחנה?
הטרוטרימרים אלה יכולים להיות מורכבים באופן עצמי במבחנה, בעיקר באמצעות אינטראקציות בין ראשם, אם כי יש צורך באינטראקציה עם תאים כדי לארגן את הרשת לגיליון/ יריעה מסודר/ת.
כמה סוגים של כל אחתשרשאות למינין ישנם?
מאחר וישנם איזופורמים רבים מכל סוג שרשרת, אשר יכולים לעבור הרכבה בקומבינציות שונות. ידועים חמישה סוגים של שרשראות אלפא, ארבעה סוגים של שרשראות בטא ושלושה סוגים של שרשראות גמא, מהם ניתן לייצר למינינים רבים ושונים, כשכל למינין ספציפי מקנה ללמינה הבזאלית את התכונות הייחודיות שלה (כך למשל למינין111 מורכב משרשרת אלפא1, שרשרת בטא1 ושרשרת גמא1).
האם לאיזופורמים של למינין יש התפלגות מסוימת ברקמות?
למינין332 נמצא בעור, למינין211 בשרירים ולמינין411 בתאי אנדותל של כלי דם.
עם זאת, שרשרת גמא 1 של למינין היא מרכיב של רוב ההטרוטרימרים של למינין. עכברים עם מוטציה בגן לשרשרת גמא 1 מתים במהלך ההתפתחות העוברית מאחר והם לא יכולים לייצר את הלמינה הבזאלית.
האם יש ללמינין דומיינים רבים?
כן
מה הוא התפקיד המרכזי של הלמינין?
בזכות אתרי הקישור לחלבונים אחרים, מולקולות הלמינין ממלאות תפקיד מרכזי בארגון הלמינות הבזאליות ועיגונן לתאים.
מה הוא קולגן 4?
הוא המרכיב החיוני השני של הלמינה הבזאלית וגם הוא קיים במספר איזופורמים.
ממה מורכב קולגן 4?
קולגן 4 מורכב משלוש שרשראות ארוכות נפרדות המסתובבות זו על זו ליצירת סופרהליקס דמוי חבל.
למי קולגן 4 דומה?
fibrillary collagens
איך קולגן 4 שונה מפיברילי קולאגן?
בכך שמבנה הטריפל הליקס מופרע ביותר מ- 20 אזורים ובכך,מאפשר יצירה של כיפופים רבים במולקולה זה לא מבנה של סליל רציף
עם מי למינין וקולאגן מסוג 4 מקיימים אינטראקציה?
עם מרכיבי הלמינה אחרים, כמו הגליקופרוטאין נידוגן והפרוטאוגליקאן פרלקאן. כתוצאה מכך נוצרת רשת צולבת של חלבונים ופרוטאוגליקנים
עי מי מסונטזת הלמינה הבאזאלית? ומה היא מכילה?
למינה הבזאלית מסונתזת על ידי תאים מכל אחד מצדדיה – תאי האפיתל תורמים סט אחד של מרכיבים בזמן שתאים מתחת ללמינה הבזאלית, חלק מרקמת החיבור (מכונה “סטרומה” – ביוונית – “מצעי מיטה”), תורמים את החלק השני. על אף שההרכב המדוייק של הלמינה הבזאלית משתנה בין רקמות ואף בין אזור לאזור של אותה הלמינה, היא לרוב מכילה:
קולגן סוג 4
למינין
Nidogen
הפרוטאוגליקן
perlecan
איפה פיברונקטין וקולאגן 18 נמצאים?
בלמינה הבזאלית הם פיברונקטין וקולגן
XVIII(18)
– חלבון קולגן מיוחד אשר מהווה את חלבון הליבה של פרוטאוגליקן.
עי מי נוצר הלאמינה הבאזאלית?
מבנה המולקולרי של הלמינה הבזאלית: הלמינה הבזאלית נוצרת על ידי אינטראקציות ספציפיות בין החלבונים למינין, קולגן, 4 ונידוגן.
מה הם תפקידי הלאמינה הבאזאלית?
פילטר מולקולרי בגלומרולי בכליה –
מחסום בררני לתנועה של תאים ולסינון של מולקולות –
חשיבות ברגנרציה של הרקמה לאחר פציעה –
מה התפקיד של הלאמינה הבאזאלית בכליה?
למינה בזאלית עבה במיוחד מתפקדת כאחת מהשכבות של פילטר מולקולרי ומסייעת במניעת המעבר של מקרומולקולות מהדם אל השתן בעת היווצרות שתן.
למה פרוטיאוגלירן חשוב בתהליך הסינום בגלומורל בכליה?
פרוטאוגליקן בלמינה ההבזאלית חשוב לתפקיד זה – כאשר שרשראות ה
GAG-
שלו מוסרות על ידי אנזימים ספציפיים יכולות הסינון של הלמינה הבזאלית נהרסות .
למה לקולאגן יש חשיבות בלאמינה הבאזלית בכליה?
. לקולגן IV גם כן יש תפקיד חשוב: בתסמונת כליות תורשתית בשם
Alport syndrome
מוטציות בקולג
ן IV
גורמות לקבלת מסנן גלומרולי מעובה ובלתי פונקציונאלי. מוטציות בלמינין גם מפריעות לתפקוד של מסנני הכליה אך באופן אחר – על ידי הפרעה להתמיינות של תאים המקיימים עם מסנני הכליות אינטראקציות ותומכים בהם.
איך ללמינה הבאזאלית יש תפקיד במחסום בררני של תנועה ושל סינון מול?
כך ממברנת בסיס מתחת לשכבת תאי אפיתל למשל מונעת מפיברובלסטים ברקמת החיבור בבסיס מלקיים מגע עם תאי האפיתל אך אינה חוסמת את התנועה של מאקרופאגים, לימפוציטים או סיבי נוירונים אל רקמת האפיתל. תאים אלו חוצים את ממברנת הבסיס על ידי הפרשה של פרוטאזות מיוחדות אשר יוצרות בה חורק לשם מעבר התאים.
איזה חשיבות יש יש ללמינה הבאזאלית ברגרנציה של רקמה?
כאשר תאים ברקמות כמו שריר, עצבים ואפיתל נפגעים או מתים, ממברנת הבסיס לרוב שורדת ומשמשת כפיגום על גביו תאים חדשים יכולים להגר לשם תיקון הפגיעה ברקמה וכך הארכיטקטורה המקורית של הרקמה משוחזר בקלות. דוגמה בולטת במיוחד מגיעה ממחקרים בנושא צומת עצב שריר. בבעלי חוליות, הלמינה הבזאלית מקיפה את תאי השריר ותאי העצב, ולאזור הסינפטי של הלמינה יש אופי כימי מיוחד, עם איזופורמים מיוחדים של קולגן 4, למינין ופרוטאוגליקן בשם אגרין. לאחר פגיעה עצבית או שרירית, ללמינה הבזאלית באזור הסינפסה תפקיד מרכזי בשחזור הסינפסה במיקום הנכון. פגמים במרכיבי הלמינה הבזאלית בסינפסה אחראים על צורות מסוימות של ניוון שרירים, בהן השרירים מתפתחים כרגיל אך מתדרדרים בהמשך החיים.
מה היא החשיבות לפירוק המטריקס?
כולתם של תאים לפרק את המטריקס החוץ תאי הינה חשובה בדיוק כמו יכולתם לבנות אותו. פירוק מהיר של המטריקס דרוש במקרים כמו תיקון רקמות מפציעות ונזקים. מעבר לזה, ישנו שחלוף מתמיד של מרכיבי המטריקס וסינתזה מחדש שלהם. תהליך זה מאפשר לעצמות למשל לעבור עיצוב מחדש על מנת להיות מותאמות לשינויים בעומסים המופעלים עליהן.
באיזה דרכים היכולת לחתוך מעבר גרך המטריקס היא קריטית?
- היא מאפשרת להם להתחלק בזמן שהם “תקועים” בתוך המטריקס – תאים ברקמות חיבור לרוב צריכים להיות מסוגלים להתמתח על מנת להתחלק. אם תא חסר את האנזימים הנחוצים לפירוק המטריקס שמסביבו, יש עיכוב חזק לחלוקתו בנוסף לעיכוב על יכולתו להגר ברקמה.
- היא מאפשרת להם לנוע דרך המטריקס – פירוק מקומי של מרכיבי המטריקס נדרש גם בכל פעם בה תאים הכלואים בתוך ממברנת הבסיס צריכים לברוח ממנה למשל במהלך גדילה נורמלית של מבנים אפיתליאליים כמו בלוטות על מנת לאפשר לאוכלוסיית תאי האפיתל לגדול וגם כאשר תאי דם לבנים מהגרים דרך ממברנת הבסיס של כלי דם לרקמות בתגובה לזיהום או פציעה. עם זאת, נזכיר כי פירוק המטריקס מאפשר התפשטות תאי סרטן בגוף ולפלוש לרקמות.
אילו שני סוגי פרוטאזות יכולות לחתוך את המטריקס החוץ תאי?
מטריקס מטלופרוטאזות – המשפחה הגדולה ביותר המונה כ-50 חברים בחולייתנים. תלויות בסידן או אבץ לפעילותן.
סרין פרוטאזות – בעלות סרין ריאקטיבי מאוד באתר הפעיל. יחד, שתי מחלקות אלו משתפות פעולה בפירוק חלבוני המטריקס כמו קולגן, למינין ופיברונקטין. פעילות הפרוטאזות מוגבלת באופן כללי לקרבת פני שטח התא שייצר אותם על ידי חלבוני עגינה ספציפיים , על ידי אקטיבטורים המעוגנים לממברנה, ועל ידי הייצור של מעכבי פרוטאזות במקום בו אין צורך בפעילות פרוטאז.
קולגנזים?
מטאלופרוטאזות במטריקס החוץ צאי
לאיפה מוגבלת פעילות הפרוטאז?
פעילות הפרוטאזות מוגבלת באופן כללי לקרבת פני שטח התא על ידי חלבוני עגינה ספציפיים , אקטיבטורים המעוגנים לממברנה והן על ידי הייצור של מעכבי פרוטאזות במקום בו אין צורך בפעילות פרוטאז
איך המטריקס חשוב לתהליך איתות תאי?
. תאים מתקשרים זה עם זה על ידי הפרשת מולקולות סיגנל הנעות בדיפוזיה דרך הנוזל החוץ תאי על מנת להשפיע על תאים שכנים, ובדרכן הן נתקלות במטריקס. מרכיבים במטריקס דוגמת מטענים שליליים ודומיינים לאינטרקציות חלבון-חלבון, יכולים לקיים אינטראקציה עם מולקולות הסיגנל ובכך לשנות את פעילותן במגוון דרכים.
איך שרשראות ה-
heparin sulfate
משפיעות על הולכת סיגנאלים?
-הן עשירות במטענים על גבי פרוטאוגליקנים למשל מקיימים אינטרקציה עם מספר מולקולות סיגנל מופרשות דוגמת
FGFs) ו- VEGF
אשר בין השאר מעודדים מגוון סוגי תאים להתחלק. הם נשארים באינטראקציה עם המטריקס החוץ תאי, מה שמגביל את הדיפוזיה שלהם ומשאיר אותם בסביבה. למעשה, על ידי אספקה של מערך צפוף של אתרי קשירה לפקטורי גדילה, פרוטאוגליקנים יוצרים מאגר גדול של פקטורים אלו, ובכך כאמור מגבילים את הדיפוזיה שלהם וממקדים את השפעותיהם לתאים הקרובים. באופן דומה, פרוטאוגליקאנים עשויים לסייע ביצירת גרדיאנטים של פקטורי גדילה בעובר, מה שיכול להיות חשוב בעיצוב הרקמות במהלך ההתפתחות. ניתן אף לשפר את פעילות ה-
FGF
גם על ידי פרוטאוגליקאנים, שמאפשרים אוליגומריזציה של מולקולות
FGF
ומאפשרים להן להתחבר ולהפעיל את הרצפטורים שמזהים אותם על פני התא בצורה יעילה יותר.
עי אילו פרוטיאוגליקנאים נשלטות מולקולות סיגנאל?
וכיצד?
Dally ו-Dally-like.
נראה שחברים במשפחה זו מרכזים חלבוני סיגנאל במקומות ספציפיים ומשמשים כקו-רצפטורים משותפים המשתפים פעולה עם הרצפטורים הרגילים על פני התא. כתוצאה מכך הם מקדמים איתות ומונעים איתות במקומות לא נכונים. בשחלה של דרוזופילה
Dally
אחראי בחלקו על הלוקליזציה והתפקוד של
Dpp
החוסם את ההתמיינות של
germline stem cells.
כאשר הגן המקודד
ל-Dally מוטנט,
פעילות
Dpp
מופחתת מאוד והתפתחות הביציות לא תקינה.
אילו חלבוני צטריקס יוצרים אינטראקציה עם חלבוני סיגנאל?
קולגן מסוג 4 בלמינה הבזאלית יוצר קשר עם
Dpp
בדרוזופילה.
פיברונקטין מכיל
type III fibronectin repeat
אשר מקיים אינטרקציה עם
VEGF
ודומיין אחר המקיים אינטרקציה עם פקטור גדילה אחר בשם
HGF
ובכך מקדם את הפעילות של פקטורים אלו.
האם גליקופרוטאינים קושרים חלבונים טראנס ממברנאלים
וכיצד זה משפיע על התא?
גליקופרוטאינים במטריקס יכולים גם כן להכיל דומיינים הקושרים באופן ישיר רצפטורים ממברנליים ועל ידי קישור בין הנ”ל יכול להיות מועבר סיגנל שישפיע על התנהגותם של תאים.
כיצד המטריקס החוץ תאי משפיע על התאים?
עיקר דרך חלבוני אדהזיה טראנסממברנאליים מיוחדים המשמשים כ-
“matrix receptors”.
חלבונים אלה קושרים את המטריקס מבחוץ יחד עם חלבוני שלד התא מבפנים, אך תפקידם הוא הרבה מעבר להחזקה מכאנית פשוטה. דרכם, רכיבי המטריקס יכולים להשפיע כמעט על כל היבט בהתפתחות התא. לאותם
matrix receptors
תפקיד מכריע בתאי האפיתל, והם מתווכים את האינטראקציות שלהם עם הלמינה הבזאלית שמתחתיהם. הם חשובים לא פחות בתאי רקמת חיבור ומתווכים את האינטראקציות של התאים עם המטריצה הסובבת אותם.
מה הם הרצפטורים העיקריים לקשירת חלבוני מטריקס חוץ תאיים?
אולם, הרצפטורים העיקריים בתאי בעלי חיים לקשירת חלבוני המטריקס החוץ תאיים הם האינטגרינים. כמו הקדהרינים ומרכיבי המפתח של הלמינה הבזאלית, אינטגרינים הם חלק ממערך הכלים האדריכלי הבסיסי האופייני לבעלי חיים רב תאיים. לבני משפחה גדולה זו יש יכולת מדהימה להעביר אותות לשני הכיוונים על פני הממברנה הפלסמטית. קישור של רכיב מטריצה לאינטגרין יכול לשלוח מסר לפנים התא והתאים יכולים לשלוח מסרים משלהם ולשלוט בקישור האינטגרין למטריצה. מתח המופעל על אינטגרין יכול לגרום לו להדק את אחיזתו במבנים התאים והתאיים, ואובדן המתח יכול לשחרר את אחיזתו, כך ש-
molecular signaling complexes
יתפרקו משני צידי הממברנה. באופן זה, אינטגרנים יכולים לשמש לא רק להעברת אותות מכניים ומולקולריים, אלא גם להמרת סוג אחד של אות לסוג שני.
ממה מורכבת כל מולקולת אינטגרין?
כל מולקולת אינטגרין מורכבת משתי תתי יחידות גליקופרוטאיניות – אלפא ובטא המחוברות בקשרים לא קוולנטים. זנב ה-
C
טרמינלי קצר ונמצא בתוך התא, והזנב ה-
N
טרמינלי ארוך ונמצא מחוצה לו.
מה הוא האתר הקישור המובן ביותר לאינטגרין?
ואיזה אתר קישור הוגדר אחריו?
rgd
Ldv
כמה סוגי אינטגרינים יש בבני אדם?
בבני אדם 24 סוגי אינטגרינים שהם תוצאה של 8 גנים שונים לשרשרת בטא ו-18 גנים שונים לשרשרת אלפא, שמורכבים בצורה שונה ליצירת דימר.
האם יש מולקולות שיכולות להשפיע עח יכולות הקשירה של אינטגרין?
כן
ממה מושפעת קשירת האינטגרינים לליגנדים שלהם?
קשירת האינטגרינים לליגנדים שלהם שנמצאים במטריקס מושפעת גם מריכוז הסידן והמגנזים במדיום החוץ תאי ומשקפת את נוכחותם של דומיינים קושרי קטיונים דו ערכיים בתת יחידות אלפא ובטא. הקטיונים הדו-ערכיים יכולים להשפיע הן על הזיקה והן על הספציפיות של קשירת האינטגרין לליגנדים החוץ תאיים שלו.
החלק התוך תאי של דימר אינטגרין נקשר לקומפלקס של כמה חלבונים שונים שיחד יוצרים קישור לשלד התא.
מה הם
actin cell matrix?
אלו הם צמתים הנוצרים בין התא לבין המטריקס החוץ תאי. בהם אינטגרין נקשר לחלבון חוץ תאי מצד אחד, ולחלבונים מתאמים מצד שני, כאשר חלבונים אלה נקשרים לאקטין.
מה עושה החלבון המתאם הגדול המעורב בצמתים בין המטריקס לאקטין?
אלו הם צמתים הנוצרים בין התא לבין המטריקס החוץ תאי. בהם אינטגרין נקשר לחלבון חוץ תאי מצד אחד, ולחלבונים מתאמים מצד שני, כאשר חלבונים אלה נקשרים לאקטין.
איזו דוגמה יש לצמתים גדולים בולטים ועמידים בין המטריקס לאקטין?
גמה לצמתים גדולים, בולטים ועמידים הם ה-
focal adhesions
הנוצרים כאשר לפיברובלסטים יש מספיק זמן כדי ליצור חיבורים חזקים למצע, או
myotendinous junctions
המחברים תאי שריר לגידים שלהם.
מה קורה בתמונה הבאה?

הראשים ה-
N
טרמינאליים של שרשראות האינטגרין נקשרים ישירות לחלבון חוץ-תאי כמו פיברונקטין. הזנב ה-
C
טרמינלי התוך תאי של תת היחידה בטא נקשר לחלבונים מתאמים שנקשרים לסיבי האקטין. קצה אחד של טאלין נקשר לאתר ספציפי בזנב הציטופלסמטי של שרשרת בטא של האינטגרין. חלבונים רגולטוריים אחרים, כגון קינדלין, נקשרים לאתר אחר בזנב. כפי שניתן לראות, וינקולין יוצר קשר בין טאלין ליחידות אקטין בנוסף לאלו שטאלין קושר בעצמו.
המידזמוזום?
הוא למעשה צומת בין סיבי ביניים בתוך התא לבין המטריקס החוץ תאי. הצומת בנויה כך שסוג מסויים של אינטגרין מעגן את התאים ללמינין בלאמינה הבזאלית בצד אחד ולתוך התא מהצד השני. כאן, ההיקשרות התוך תאית היא לסיב הביניים קרטין דרך חלבונים מתאמים בשם פלקטין
וBP230 .
עוד חבר בצומת הוא קולגן 17, קולגן ייחודי. מעניין לדעת כי באפיתליה, אתרי החיבור הנראים בולטים (מבחינת מראה) למטריצה הם המידזמוזומים.
מה קורה בתמונה הבאה?

בתמונה אפשר לראות איור של המידזמוזום – ב-איי רואים כי תאי האפיתל מתחברים באמצעות המידזמוזומים ללמינה הבזאלית. ב-בי ניתן לראות את הרכיבים המולקולריים של המידזמוזום בדומה למה שכבר תיארנו: אינטגרין ייעודי בשם
α6β4 integrin
לאורך הממברנה מתחבר לסיבי קרטין דרך חלבונים מתאמים הנקראים פלקטין
ו-BP230 .
מהצד החוץ תאי, האינטגרין הזה מתחבר ללמינין. במקביל לאינטגרין, מצוי בצומת גם קולגן יוצא דופן (חבר במשפחת הקולגנים אך מיוחד) בשם קולגן 17 שהוא בעל דומיין חוצה ממברנה. עוד ניתן לראות כי הלמינין הוא החלבון החוץ תאי הקושר מצד אחד אינטגרין ומצד שני קולגן 4. שימו לב שהלמינין הולך במקביל לכיוון האינטגרינים ולא מאונך להם.
bullous pemphigoid
מחלה באחד מהמרכיבים של ההמידזמוזום
, היא מחלה אוטואימונית בה מערכת החיסון מפתחת נוגדנים נגד קולגן 17 או נגד
BP230.
עם כמה תתי יחדה אלפא יכולה ליצור דימרים תת יחידה בטא 1 של אינטגרין ?
עם לפחות 12
איזה רצפטור הוא
a5b1
באינטגרין?
ו-
a6b1
α5β1
הוא רצפטור לפיברונקטין
ו-α6β1
הוא רצפטור ללמינים בסוגי תאים רבים.
מה יקרה לעכברים שלא יכולים לייצר
beta 1
של אינטגרין?
ו-
alpha 7
עכברים מוטנטים שאינם יכולים לייצר
β1
מתים בשלב מוקדם בהתפתחות העוברית. עכברים שרק אינם מסוגלים לייצר את תת היחידה
α7
(בת הזוג של בטא 1 בשריר) שורדים, אך מפתחים ניוון שרירים. כך גם עכברים שאינם מסוגלים לייצר את ליגנד הלמינין עבור אינטגרין
α7β1.
עם כמה סוגים של תת יחידה אלפא יכולה ליצור דימר תת יחידה בטא 2?
ואיפה בטא 2 מבטאת אינטגרין?
תת היחידה
β2
יוצרת דימרים עם לפחות 4 סוגים תת יחידה אלפא והיא מתבטאת באופן בלעדי על פני כדוריות הדם הלבנות, שם יש לה תפקיד חיוני ביכולתם של התאים ההלו להילחם בזיהום.
בין מה למה מתווכים אינטגרים של בטא 2?
מי הם הליגנדים שלהם?
האינטגרינים של
β2
מתווכים בעיקר אינטראקציות בין תא לתא במקום אינטראקציות בין תא למטריקס, קושרים ליגנדים ספציפים על תא אחר כמו אנדותל.
הליגנדים הם חלק ממשפחת ה-
Ig
מה עושה אינטגרין מסוג
alb2?
מאפשר לתאי דם לבנים להיצמד היטב לחלבון
Ig
בשם
ICAM1
על תאי האנדותל באתרי זיהום
leukocyte adhesion deficiency
ינם מצליחים לסנתז תת יחידות
β2
תפקודיות. כתוצאה מכך, תאי הדם הלבנים שלהם חסרים את כל משפחת רצפטורי
β2
והם סובלים מזיהומים חיידקיים חוזרים ונשנים.
איפה נמצאים האינטגרינים המורכבים מבטא 3?
טסיות הדם
מה קושרים אינטגרינים
B3?
הם קושרים כמה חלבוני מטריקס כולל פקטור הקרישה פיברינוגן. טסיות הדם צריכות לקיים אינטראקציה עם הפיברינוגן בכדי לתווך קרישת דם תקינה
מחלת גלנזמן?
לוקים בחסר גנטי של האינטגרינים של
β3
סובלים מקרישת דם לקויה ומדממים יתר על המידה.
מי מתווך את ההרכב ופירוק המטריקס בעת נדידה של הלאמינה הבאזאלית?
מולקולת האינטגרין
האם לאינטגרינים יש מצבי פעילות שונים?
כן
מה קורה במצב לא פעיל של האינטגרין?
ובמצב פעיל?
במצב לא פעיל, הקטעים החיצוניים של דימר האינטגרין מקופלים זה על זה למבנה קומפקטי שאינו יכול לקשור חלבוני מטריקס. במצב זה, הזנבות הציטופלסמטיים של הדימר תפוסים יחד מה שמונע את האינטראקציה עם חלבונים מתאמים לשלד התא. במצב הפעיל, שתי היחידות של האינטגרין אינן תפוסות זו בזו וחושפות את אתרי הקישור לחלבונים מתאמים ציטופלסמטיים, והדומיינים החיצוניים נפרשים כמו זוג רגליים על מנת לחשוף אתר קושר מטריקס בעל זיקה גבוהה

עי אילו שני מנגנונים יכול להיות הפעלה לאינטגרין?
outside in
inside out
מנגנון Outside in?
הקישור של חלבון מטריקס חוץ תאי כמו פיברונקטין הנושא רצף
RGD
יכול לגרום לאינטגרין לעבור ממצב לא פעיל בעל אפיניות נמוכה למצב פעיל בעל אפיניות גבוהה. כתוצאה משינוי זה אתרי הקישור התוך תאיים נעשים חשופים על שרשרת בטא וזמינים להיקשרות חלבונים מתאמים כמו טאלין. קישור חלבונים אלה מוביל לקישור של סיבי אקטין. באופן זה, כאשר האינטגרין תופס את הליגנד שלו מחוץ לתא, התא מגיב על ידי קשירת מולקולת האינטגרין לשלד התאי, כך שניתן להפעיל כוח בנקודת הקישור.
מנגנון
Inside out?
הפעלת האינטגרין תלויה בחלבון רגולטורי תוך תאי המעודד את יכולתו של טאלין וחלבונים נוספים לקיים אינטרקציה עם שרשרת בטא של האינטגרין. טאלין מתחרה עם שרשרת אלפא על קישורה לשרשרת בטא. כאשר טאלין נקשר לשרשרת בטא הוא חוסם את הקישור התוך תאי בין שרשראות אלפא ובטא ומאפשר לחלקים התוך תאיים באינטגרין להיות מופרדים אלו מאלו ובכך למעשה להפעיל את האינטגרינים.
איפה ניתן לראות בקרה של
Inside out
על האינטגרין?
הבקרה של הפעלת אינטגרינים במנגנון
“inside-out”
מובנת היטב בטסיות הדם, כאשר חלבון סיגנאל בשם טרומבין נקשר לרצפטור שהוא
GPCR
על פני התא, ובכך מפעיל מסלול איתות תוך-תאי המוביל להפעלה. סביר להניח כי מסלולי איתות דומים שולטים בהפעלת אינטגרנים בתאים רבים אחרים.
מה הוא התהליך של ה-
insise out
בטסיות הדם?
טרומבין מגיע מחוץ לתא כתגובה לנזק רקמתי.
טרומבין נקשר ל
GPCR -
וגורם לשרשרת פעולות שתוביל לשחלוף של
GDP
ל- GTP
על גבי
rap 1
שהוא חלבון החבר במשפחת חלבוני ה-
G
המונומרים.
כאשר
rap1
משופעל הוא מגייס את החלבון
RIAM
שמגייס את טאלין לממברנה הפלסמטית.
יחד עם קינדלין, טאלין מקיים אינטראקציה עם שרשרת הבטא של אינטגרין במטרה להפכו לפעיל.
לאחר מכן טאלין נקשר לחלבון מתאם כמו וינקולין וכתוצאה מכך נקשר אקטין.
רגולציה על הטאלין תלויה בחלקה באינטראקציה עם הדומיין ה-C
טרמינלי הגמיש בצורת מתג שלו לבין הקצה ה
-N
טרמינלי שלו המכיל את אתר הקישור לאינטגרין. אינטראקציה זו שומרת על טאלין במצב לא פעיל כשהוא חופשי בציטופלזמה (ראו את צורתו העגולה כשהוא מקופל על עצמו). כאשר טאלין מגוייס על ידי RIAM לממברנה, ראשו נקשר ל-
pI(4,5)p2
(לא מוצג באיור) וכך הדומיין שבצורת מתג משתחרר.

כיצד אינטגרינים נבדלים מרצפטורים להורמונים?
בכך שהם בדרך כלל קושרים את הלינגד שלהם בזיקה נמוכה ונמצאים בריכוז גבוה פי 10 עד 100 על פני התא.
איזה עיקרון דומה יש בין האינטגרין לקדהרין?
יקרון הוולקרו שראינו בהידבקות קדהרין פועל גם כאן. לאחר הפעלתם, האינטגרינים מתקבצים יחדיו ליצירת משטח צפוף בו מולקולות אינטגרין רבות מעוגנות לסיבי ציטוסקלטון. המבנה החלבוני המתקבל יכול להיות גדול ומורכב להפליא.
במה תלויה הרכבת הקומפלקס של צמתי תא מטריקס?
הרכבת קומפלקסים של צמתי תא-מטריקס תלויה בגיוס של עשרות חלבוני פיגום וחלבוני סיגנאל. טאלין הוא מרכיב עיקרי בקומפלקסי תא-מטריקס רבים, אך גם אחרים תורמים רבות. כך למשל
integrin-linked kinase
ושותפיו
pinch ו-parvin
המהווים יחד קומפלקס טרימרי המשמש כמרכז ארגון בצמתים רבים.
צמתי תא מטריקס גם משתמשים בכמה חלבונים קושרי אקטין כדוגמת
vinculin, zyxin, VASP, α-actinin
כדי לקדם את ההרכבה והארגון של סיבי האקטין. מרכיב קריטי נוסף בצמתים רבים בין תא למטריקס הוא
FAK- focal
adhesion kinase,
שאחראי על אינטראקציה עם מספר רכיבים בצומת ובעל פונקציה חשובה בהולכת אותות כפי שנראה מי
אינטגרינים מסוגלים להפעיל מסלולי איתות?
נכון
anchorage dependence
תלות של תא להיקשר למצע
עי מי
anchorage dependence
מתווכת?
היא מתווכת בעיקר על ידי אינטגרינים והאותות התוך תאיים שהם מחוללים. מוטציות המשבשות או מבטלות את ה-
anchorage dependence
מאפשרות לתאים לברוח ממנה ומתרחשות בתאים סרטניים. כך הן למעשה ממלאות חלק מרכזי בהתנהגותם הפולשנית.
איך מסלול
ras map kinase
יכול להיות מופעל?
הן על ידי הרצפטורים הקונבנציונאליים של המסלול והן על ידי אינטגרינים
איך
focal adhesion kinase
מופעל?
במחקרים על תאים בצלחת תרבית,
focal adhesions
נמצאים כאתרים העשירים בזרחון על גבי שיירי טירוזין ו-
FAK
הוא אחד מהטירוזין קינאזות העיקריים באתרים אלו. כאשר אינטגרינים מתקבצים בצמתי תא-מטריקס,
FAK
מגוייס לתת יחידה בטא על ידי חלבונים מתאמים כמו טאלין או פקסילין . מולקולות ה-
FAK
המגוייסות מזרחנות זו את זו על שיירי טירוזין ספציפיים ויוצרים באופן זה אתרי עגינה מזורחנים לחברים במשפחת ה-
Src
של טירוזין קינאזות אשר מגבירים את הסיגנאל. באופן זה, סיגנאלי
outside-in
מאינטרגינים, דרך הקינאזות FAK
וחברי משפחת
Src
מועברים לתוך התא באופן דומה להעברת סיגנל על ידי
RTK
איך צמתי תא מטריקס יכולים לחוש ולהגיב לכוחות המכאניים שפועלים עליהם
משל רוב הצמתים ההלו מחוברים לרשת אקטין הנוטה למשוך את הצמתים פנימה, הרחק מהמטריצה. כאשר תאים מחוברים למטריצה נוקשה המתנגדת בחוזקה לכוח משיכה שכזה, הצומת מסוגל לחוש במתח הגבוה שנוצר ולהפעיל תגובה במהלכה הוא מגייס אינטגרינים וחלבונים נוספים על מנת להגדיל את יכולת הצומת לעמוד במתח כזה. חיבור תא למטריצה רכה יותר מייצר פחות מתח ולכן תגובה פחות חזקה. מנגנונים אלה מאפשרים לתאים לחוש ולהגיב להבדלים בקשיחות של מטריצות חוץ תאיות ברקמות שונות.
מה קורה בדומיין הזנב סי טרמינאלי של טאלין וכיצד זה משפיע על מתיחת התא?
דומיין הזנב הסי טרמינאלי של טאלין למשל כולל מספר רב של אתרי קישור לחלבון מבקר האקטין וינקולין. רבים מהאתרים הלו מוסתרים בדומיינים מקופלים אך נחשפים כאשר הדומיינים הללו נפרשים באמצעות מתיחת החלבון. הקצה ה-אן טרמינאלי של טאלין קושר אינטגרין וה-סי טרמינאלי אקטין. לפיכך, כאשר סיבי אקטין נמשכים על ידי מיוזין בתוך התא, המתח המתקבל מותח את הטאלין ובכך חושף אתרים הקושרים וינקולין. מולקולות הוינקולין מגייסות ומארגנות סיבי אקטין נוספים. המתח מגדיל בכך את חוזק הצומת.