biochemistry 4 Flashcards
מה אנחנו יצרנו בכל התהליך שהגלוקוז עבר עד כה?
4 ATP
10 NADH
(כל אחד מניב 2.5 ATP כאשר 2 מהם יכולים להיות שווים רק 1.5 איי טיפי (הסבר בהמשך)
2 FADH2
כל אחד מניב 1.5 ATP
בסה”כ מדובר על בין 30-32 מולקולות ATP. מכאן שנשימה הצורכת חמצן שווה פי 15 עד פי 16 יותרATP מאשר גליקוליזה ותסיסה (המניבים רק 2 ATP)/
מדוע המיטוכונדריה והכלורופלסט דומים?
חלק מהתאים היוקריוטים ביצעו תהליך אנדוסימביוזה שני ובלעו חיידק מסוג ציאנובקטריה ששאריותיו היא בעצם הכלורופלסט. שני האיברונים, מיטוכונדריה וכלורופלסט, מכילים מרכיבים מאוד דומים. בשניהם מתרחש תהליך של העברת אלקטרונים על גבי הממברנה עד שהאלקטרונים מגיעים למקבל אלקטרונים סופי.
מה ההבדל בין רקמות שזקוקות ליותר אנרגיה מבחינת המיטוכונדריה לבין רקמות שזקוקות לפחות אנרגיה מבחינת המיטוכונגדריה?
- פיזור המיטוכונדריה הוא יותר גדול וצפוף
- יש יותר קריסטה בתאים הללו
קריסטה זה המקום עליו התאים עושים איי טי פי סינטז
איפה מתרחש התהליך הזרחון החמצוני במיטוכונדריה?
ע”ג הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה
מה הם המקורות של האלקטרונים
ב-nadh?
פעילות האנזים
PDH
פעילות של אנזימי מעגל קרבס
חמצון חומצות שומן
חמצון חומצות אמינו
מה יעשו הקומפלקסים בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ?
הם יעבירו את האלקטרונים מאחד לשני עד שבסופו של דבר האלקרטונים יגיעו למקבל האלקטרונים הסופי שהוא חמצן
מה יקרה כתוצאה מאנרגיית החמצון שקורית בגלל ההעברת האלקטרונים דרך הקומפלקסים?
מהאנרגיה המשתחררת מתהליכי החמצון, אותם קומפלקסים ישאבו פרוטונים מהמטריקס של המיטוכונדריה וידחפו אותם נגד מפל הריכוזים אל התווך הבין ממברנאלי, כך שיוצר מפל כימו-אוסמוטי, או במילים יפות יותר “גרדיאנט אלקטרוכימי”. אותם פרוטונים יוצרים גרדיאנט כימי – ריכוז גבוה של פרוטונים בתווך הבין ממברנאלי ביחס למטריקס, וגרדיאנט חשמלי – מטען חשמלי חיובי ביחס למטריקס השלילי.
מה קורה בכלורופלסט מבחינת הקומפלקסים ?
בכלורופלסט -
נותן האלקטרונים מיםף המים מתחמצנים לחמצן. כדי להוציא את האלקטרונים מהמים יש להשתמש באנרגיית אור (זה לא תהליך ספונטי) . בכלורופלסט מקבל האלקטרונים הסופי
זה nadp
שהופך בסופו של דבר ל-nadh
גם כאן יווצר מפל אלקטרוכימי של פרוטונים
מה הם תהליכי הדימין בין הפוטוסינטזה לנשימה?
שניהם מעבירים אלקטרונים על גבי קומפלקסים ממברנאלים.
האנרגיה בשני המקרים משמשת לפמפום פרוטונים ליצירת מפל ריכוזים.
בשני המקרים תנועה של הפרוטונים בהתאם למפל האלקטרוכימי שלהם נעשית על גבי תעלות המנצלות את האנרגיה הפוטנציאלית המשתחררת לסינתזה של
ATP מ- ADP ופוספאט.
מה הוא קומפלקס 1 בשרשרת העברת האלקטרונים?
nadh דה הידרוגנאז
שמחמצן את
nadh
שני האלקטרונים מגיעים ליובקווינון
שהופך לאחר קבלתם ליוביקווינון
מהו קומפלקס 2 בשרשרת העברת האלקטרונים?
אנזים חשוב במעגל החומצה הציטרית. מחמצן סוקסינאט והאלקטרונים עוברים דרכו
(דרך FADH2 )
ולבסוף מגיעים ליוביקווינון שהופך ליוביקווינול. שימו לב שקומפלקס 1 וקומפלקס 2 הן שתי דרכים אלטרנטיביות להכניס אלקטרונים לשרשרת מעבר האלקטרונים ואינם תלויים אחד בשני.
מה הוא יוביקווינון?
מולקולה קטנה והידרופובית המצויה על גבי הממברנה. כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא מכונה סמי-קווינון (Q.).
ובאלקטרון השני היא מכונה יוביקווינול (QH2).
האלקטרונים של יוביקווינול יימסרו בהמשך לקומפלקס 3.
מה הוא קומפלקס 3?
איך הוא נקרא?
ציטוכרום bc1
יוביקווינון ציטוכרום C
אוקסידורדוקטאז: מחמצן את יוביקווינול ומעביר את האלקטרונים לחלבון המצוי בתווך הבין ממברנאלי הקרוי ציטוכורום C.
ציטוכרום סי?
יעביר את האלקטרונים לקומפלקס 4 (ציטוכרום אוקסידאז) שבתוכו יושב החמצן שהופך למולקולת מים.
מה הם קומפלקסים 1 3 ו-4 ואיך הם נקראים?
קומפלקסים 1,3,4 משמשים כמשאבת פרוטונים, כאשר הכוח המניע את שאיבת הפרוטונים מהמטריקס אל התווך הבין ממברנאלי הוא הפרש ה Redox
בין חמצן לבין NADH
ולכן ניתן להגדירם כ Redox Driven Pumps.
מה משמש הגראדיינט האלקטרוכימי של שרשרת העברת האלקטרונים?
הגרדיאנט האלקטרוכימי של הפרוטונים משמש את הקומפלקס ATP-synthase ליצירת ATP.
הקומפלקס מאפשר חזרה של הפרוטונים מהתווך הבין ממברנאלי אל המטריקס והאנרגיה הפוטנציאלת המשתחררת מאפשרת את הפעלת הקומפלקס האנזימטי וזירוז יצירת מולקולות ATP בתוך המטריקס של המיטוכונדריה.
מה הערך ה-ph במטריקס ומה הערך ה-ph בציטוזול?
שימו לב כי ערך הpH במטריקס הוא בסביבות 7.8
ואילו ערך ה pH בתווך הבין ממברנאלי זהה לזה של הציטוזול ועומד על 7.2
מהי פלאבין?
אילו שתי צורות יש לה?
מה תפקידה?
האם היא שוחה כמו בת הים הקטנה?
איך נקראים חלבונים בעלי קבוצה פלאבינית?
האם פוטנציאל החיזור שלה הוא קבוע?
האם היא נחשבת לחלק מתוצר?
קבוצה שמוכרת לנו בתור נשא אלקטרונים
יש לה שתי צורות:
FAD
FMN
ההבדל ביניהם הוא מספר הנוקליאוטידים .
תפקידה הוא לתווך בין הניאצין לבין היוביקווינון. כי היא אומנם מצליחה לפוס 2 אלקטרונים אבל מוסרת כל אחד בנפרד
היא לא שוחה כמו בת הים הקטנה היא כמעט תמיד חלק מחלבון או קשורה לחלבון
חלונים עם קבוצה פלאבינית נקראים פלאבו פרוטאינים
פוטנציאל החיזור שלה הוא לא קבוע ותלוי באיזה חלבון היא נמצאת
האם בקומפלקס 1 יש פלאבין?
כן בקומפלקס 1
יש פלאבין
fmn
איזה סוג מולקולה זו יוביקווינון?
באיזה מנגנון היא מקבלת אלקטרונים ומוסרת אלקטרונים?
איך הוא נע בממברנה?
כשיוביקוונון במצבו המחוזר האם הוא נושא רק אלקטרונים?
ליפידית קטנה
היא מקבלת אלקטרונים אחד אחד ומוסרת אלקטרונים אחד אחד
כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא הופכת להיות סמיקווינון
וכשהיא מקבלת שניים היא הופכת להיות יוביקווינול
לא הוא נושא גם פרוטונים
ממה נובע שמם של הציטוכרומים?
אילו סוגי ציטוכרומים ישנם?
האם קבוצות ההם שלהם קשורות באופן קוולנטי?
האם לכל הציטוכרומים אותו פוטציאל חיזור?
מי בשרשרת המעבר הוא ציטוכרום?
לפי הצבע שלהם
ABC
רק של C קשורה דרך ציסטאים
לא זה משתנה בהתם לקונטסט
קומפלקס 3 – מכיל את ציטוכרום בי
ציטוכורום C –בתווך הבין ממברנלי
קומפלקס 4– מכיל את ציטוכורום איי ואת איי 3
האם צברי ברזל גופרית מאורגנים?
איך הן נקשרות למולקולה?
איך כל ברזל יודע להעביר אלקטרון?
איפה הם מצויים?
איך הם קרויים?
והאם הפוטנציאל חיזור הוא קבוע?
לא הם לא מאורגנים
עי ציסטאין, או עי מולקולות אורגנית
כל פעם אחד
בקומפלקסים חלבוניים
rieske iron sulfur
פוטנציאל החיזור הוא לא קבוע
אם אני רוצה לחקור את כקומפלקסים במיטוכונדריה מה עליי לעשות?
ומה קורה ל-
atp synthase לאחר ההפרדה?
- דיגיטונין
- osmotic rapture
- ion exxhange
חשוב לציין שלאחר ההפרדה הזו, קומפלקס
ATP-Synthase
שלעיתים מכונה גם קומפלקס 5, הוא חסר פעילות סינתזה של
ATP ודווקא בעל פעילות של הידרוליזה של
ATP . קרי, הוא מפרק
ATP ולא מייצר.










