biochemistry 4 Flashcards
מה אנחנו יצרנו בכל התהליך שהגלוקוז עבר עד כה?
4 ATP
10 NADH
(כל אחד מניב 2.5 ATP כאשר 2 מהם יכולים להיות שווים רק 1.5 איי טיפי (הסבר בהמשך)
2 FADH2
כל אחד מניב 1.5 ATP
בסה”כ מדובר על בין 30-32 מולקולות ATP. מכאן שנשימה הצורכת חמצן שווה פי 15 עד פי 16 יותרATP מאשר גליקוליזה ותסיסה (המניבים רק 2 ATP)/
מדוע המיטוכונדריה והכלורופלסט דומים?
חלק מהתאים היוקריוטים ביצעו תהליך אנדוסימביוזה שני ובלעו חיידק מסוג ציאנובקטריה ששאריותיו היא בעצם הכלורופלסט. שני האיברונים, מיטוכונדריה וכלורופלסט, מכילים מרכיבים מאוד דומים. בשניהם מתרחש תהליך של העברת אלקטרונים על גבי הממברנה עד שהאלקטרונים מגיעים למקבל אלקטרונים סופי.
מה ההבדל בין רקמות שזקוקות ליותר אנרגיה מבחינת המיטוכונדריה לבין רקמות שזקוקות לפחות אנרגיה מבחינת המיטוכונגדריה?
- פיזור המיטוכונדריה הוא יותר גדול וצפוף
- יש יותר קריסטה בתאים הללו
קריסטה זה המקום עליו התאים עושים איי טי פי סינטז
איפה מתרחש התהליך הזרחון החמצוני במיטוכונדריה?
ע”ג הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה
מה הם המקורות של האלקטרונים
ב-nadh?
פעילות האנזים
PDH
פעילות של אנזימי מעגל קרבס
חמצון חומצות שומן
חמצון חומצות אמינו
מה יעשו הקומפלקסים בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ?
הם יעבירו את האלקטרונים מאחד לשני עד שבסופו של דבר האלקרטונים יגיעו למקבל האלקטרונים הסופי שהוא חמצן
מה יקרה כתוצאה מאנרגיית החמצון שקורית בגלל ההעברת האלקטרונים דרך הקומפלקסים?
מהאנרגיה המשתחררת מתהליכי החמצון, אותם קומפלקסים ישאבו פרוטונים מהמטריקס של המיטוכונדריה וידחפו אותם נגד מפל הריכוזים אל התווך הבין ממברנאלי, כך שיוצר מפל כימו-אוסמוטי, או במילים יפות יותר “גרדיאנט אלקטרוכימי”. אותם פרוטונים יוצרים גרדיאנט כימי – ריכוז גבוה של פרוטונים בתווך הבין ממברנאלי ביחס למטריקס, וגרדיאנט חשמלי – מטען חשמלי חיובי ביחס למטריקס השלילי.
מה קורה בכלורופלסט מבחינת הקומפלקסים ?
בכלורופלסט -
נותן האלקטרונים מיםף המים מתחמצנים לחמצן. כדי להוציא את האלקטרונים מהמים יש להשתמש באנרגיית אור (זה לא תהליך ספונטי) . בכלורופלסט מקבל האלקטרונים הסופי
זה nadp
שהופך בסופו של דבר ל-nadh
גם כאן יווצר מפל אלקטרוכימי של פרוטונים
מה הם תהליכי הדימין בין הפוטוסינטזה לנשימה?
שניהם מעבירים אלקטרונים על גבי קומפלקסים ממברנאלים.
האנרגיה בשני המקרים משמשת לפמפום פרוטונים ליצירת מפל ריכוזים.
בשני המקרים תנועה של הפרוטונים בהתאם למפל האלקטרוכימי שלהם נעשית על גבי תעלות המנצלות את האנרגיה הפוטנציאלית המשתחררת לסינתזה של
ATP מ- ADP ופוספאט.
מה הוא קומפלקס 1 בשרשרת העברת האלקטרונים?
nadh דה הידרוגנאז
שמחמצן את
nadh
שני האלקטרונים מגיעים ליובקווינון
שהופך לאחר קבלתם ליוביקווינון
מהו קומפלקס 2 בשרשרת העברת האלקטרונים?
אנזים חשוב במעגל החומצה הציטרית. מחמצן סוקסינאט והאלקטרונים עוברים דרכו
(דרך FADH2 )
ולבסוף מגיעים ליוביקווינון שהופך ליוביקווינול. שימו לב שקומפלקס 1 וקומפלקס 2 הן שתי דרכים אלטרנטיביות להכניס אלקטרונים לשרשרת מעבר האלקטרונים ואינם תלויים אחד בשני.
מה הוא יוביקווינון?
מולקולה קטנה והידרופובית המצויה על גבי הממברנה. כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא מכונה סמי-קווינון (Q.).
ובאלקטרון השני היא מכונה יוביקווינול (QH2).
האלקטרונים של יוביקווינול יימסרו בהמשך לקומפלקס 3.
מה הוא קומפלקס 3?
איך הוא נקרא?
ציטוכרום bc1
יוביקווינון ציטוכרום C
אוקסידורדוקטאז: מחמצן את יוביקווינול ומעביר את האלקטרונים לחלבון המצוי בתווך הבין ממברנאלי הקרוי ציטוכורום C.
ציטוכרום סי?
יעביר את האלקטרונים לקומפלקס 4 (ציטוכרום אוקסידאז) שבתוכו יושב החמצן שהופך למולקולת מים.
מה הם קומפלקסים 1 3 ו-4 ואיך הם נקראים?
קומפלקסים 1,3,4 משמשים כמשאבת פרוטונים, כאשר הכוח המניע את שאיבת הפרוטונים מהמטריקס אל התווך הבין ממברנאלי הוא הפרש ה Redox
בין חמצן לבין NADH
ולכן ניתן להגדירם כ Redox Driven Pumps.
מה משמש הגראדיינט האלקטרוכימי של שרשרת העברת האלקטרונים?
הגרדיאנט האלקטרוכימי של הפרוטונים משמש את הקומפלקס ATP-synthase ליצירת ATP.
הקומפלקס מאפשר חזרה של הפרוטונים מהתווך הבין ממברנאלי אל המטריקס והאנרגיה הפוטנציאלת המשתחררת מאפשרת את הפעלת הקומפלקס האנזימטי וזירוז יצירת מולקולות ATP בתוך המטריקס של המיטוכונדריה.
מה הערך ה-ph במטריקס ומה הערך ה-ph בציטוזול?
שימו לב כי ערך הpH במטריקס הוא בסביבות 7.8
ואילו ערך ה pH בתווך הבין ממברנאלי זהה לזה של הציטוזול ועומד על 7.2
מהי פלאבין?
אילו שתי צורות יש לה?
מה תפקידה?
האם היא שוחה כמו בת הים הקטנה?
איך נקראים חלבונים בעלי קבוצה פלאבינית?
האם פוטנציאל החיזור שלה הוא קבוע?
האם היא נחשבת לחלק מתוצר?
קבוצה שמוכרת לנו בתור נשא אלקטרונים
יש לה שתי צורות:
FAD
FMN
ההבדל ביניהם הוא מספר הנוקליאוטידים .
תפקידה הוא לתווך בין הניאצין לבין היוביקווינון. כי היא אומנם מצליחה לפוס 2 אלקטרונים אבל מוסרת כל אחד בנפרד
היא לא שוחה כמו בת הים הקטנה היא כמעט תמיד חלק מחלבון או קשורה לחלבון
חלונים עם קבוצה פלאבינית נקראים פלאבו פרוטאינים
פוטנציאל החיזור שלה הוא לא קבוע ותלוי באיזה חלבון היא נמצאת
האם בקומפלקס 1 יש פלאבין?
כן בקומפלקס 1
יש פלאבין
fmn
איזה סוג מולקולה זו יוביקווינון?
באיזה מנגנון היא מקבלת אלקטרונים ומוסרת אלקטרונים?
איך הוא נע בממברנה?
כשיוביקוונון במצבו המחוזר האם הוא נושא רק אלקטרונים?
ליפידית קטנה
היא מקבלת אלקטרונים אחד אחד ומוסרת אלקטרונים אחד אחד
כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא הופכת להיות סמיקווינון
וכשהיא מקבלת שניים היא הופכת להיות יוביקווינול
לא הוא נושא גם פרוטונים
ממה נובע שמם של הציטוכרומים?
אילו סוגי ציטוכרומים ישנם?
האם קבוצות ההם שלהם קשורות באופן קוולנטי?
האם לכל הציטוכרומים אותו פוטציאל חיזור?
מי בשרשרת המעבר הוא ציטוכרום?
לפי הצבע שלהם
ABC
רק של C קשורה דרך ציסטאים
לא זה משתנה בהתם לקונטסט
קומפלקס 3 – מכיל את ציטוכרום בי
ציטוכורום C –בתווך הבין ממברנלי
קומפלקס 4– מכיל את ציטוכורום איי ואת איי 3
האם צברי ברזל גופרית מאורגנים?
איך הן נקשרות למולקולה?
איך כל ברזל יודע להעביר אלקטרון?
איפה הם מצויים?
איך הם קרויים?
והאם הפוטנציאל חיזור הוא קבוע?
לא הם לא מאורגנים
עי ציסטאין, או עי מולקולות אורגנית
כל פעם אחד
בקומפלקסים חלבוניים
rieske iron sulfur
פוטנציאל החיזור הוא לא קבוע
אם אני רוצה לחקור את כקומפלקסים במיטוכונדריה מה עליי לעשות?
ומה קורה ל-
atp synthase לאחר ההפרדה?
- דיגיטונין
- osmotic rapture
- ion exxhange
חשוב לציין שלאחר ההפרדה הזו, קומפלקס
ATP-Synthase
שלעיתים מכונה גם קומפלקס 5, הוא חסר פעילות סינתזה של
ATP ודווקא בעל פעילות של הידרוליזה של
ATP . קרי, הוא מפרק
ATP ולא מייצר.
קומפלקס 1
לאן nadh מעביר את האלקטרונים והפרוטונים שלו?
Nadh
מעברין את האלקטרונים
-fmn
(שני אלקטרונים ושני פרוטונים)
2 הפרוטונים הראשונים יוצאים למטריקב
לאחר מכן האלקטרונים מועברים לצברי גופרית ברזל (יש לפחות שישה כאלה) ומשם ליוביקווינין ולאחר קבלת האלקטרונים נזרקים עוד 2 פרוטונים החוצה
ואז כל הפרוטונים נכנס לנוזל הבין ממברנאלי
מה הם החומרים המעכבים של קומפלקס 1?
אמיטאל – חומר ממשפחת הברביטוראטיים.
רוטנון – מדביר חרקים שמופק מצמחים.
פיירצידין A – אנטיביוטיקה .
כל השלושה מעכבים את המעבר של האלקטרונים ממרכזי ברזל גופרית ליוביקווינון
מהו קומפלקס 2?
איך הוא מעברים את האלקטרונים?
האם הוא נחשב לשואב פרוטונים?
קומפלקס 2 זו הדרך בה סוקסינאט נצמד להעברת האלקטרונים
גם פה יש מרכז פלאביני
FAD
שם מועברים האלקטרונים ליוביקווינון
שם אין את הקטע של המשאבת פרוטונים
כל ארבעת הפרוטונים מגיעים למטריקס
כמה שרשרות פוליפפטידיות יש לקומפלקס 2?
4
כמה קבוצות פרוסטטיות יש לקומפלקס 2?
5
אילו יחידות יש בקומפלקס 2?
יחידה A -בתוך המטריקס יש בה אתרי ברזל גופרית
יחידה בי- אתר קישור לאף איי די ולסוקסינאט ואתר קישור ליוביקווינון
יחידה סי ודי הם בעלי 3 הליקסים כל אחת טראנס ממבראנאלים ויש ביניהם קבוצת הם בי
איזה ציטוכרום יש בקומפלקס 2?
ומה תפקידו?
ציטוכרום בי תפקידו הוא למנוע זליגת אלקטרונים כדי שלא יהיה רדיקלים של חמצן
אם יש רדיקלים חופשיים בדם למה זה יכול לגרום?
להופעת גידולים
פרא-גנגיליומה
מוטציה באיזור ההם בי או ליד האתק הקשור לקווינון שגרומת להופעת גידולים שפיריים בקרוטיד באדי- איבר שיכול לחוש את רמת החמצן
כיצד נקרא קומפלקס 3?
ציטוכרום בי סי 1
מה זו היחידה הפונקציונאלית של קומפלקס 3?
היחידה הפונקציונאלית בקומפלקס 3
הינה דימר של ציטוכרום b,
המאפשר תנועה של גם תנועה של יוביקווינון בין שני עלעלי הממברנה הפנימית .
לתאר את המבנה של קומפלקס 3
קומפלקס הוא דימר של ציטוכרום ביץ כל מונומר בנוי מ-11 יחידות.
הליבה של מונומור זה באתירים הפעילים שהם:
Heme bh
heme bl
cytochrome c1
ברזל גופרית
יש לו גם שני אתרים לקשירה של היוביקווינול
qp
qn
מי הם המעכבים של קומפלקס 3?
אנטימיצין
A
חוסמת את מעבר האלקטרונים מ
BH
ליוביקווינון וזה נעשה באתר
QN
מיקסוטיאזול מונע את מעבר האקטרונים מיוביקווינול לצברי הברזל גופרית המצויים על גבי חלבון
Reiske,
עיכוב שמתבצע באתר
QP
מה הוא מחזור היוביקווינול?
היוביקווינול הולך לו לקומפלקס 3 שם אלקוטרונים מתפצלים ל-2:
- אלקטרון אחד הולך דרך צברי ברזל גופרית-> מגיע לסי 1-> עובר לציטורכרום סי מסיס
- אלקטרון שני עובר דרך בי אל ל-בי אייץ’ ואז הולך ליוביקטון אחר.
הופך לסמי קוויטון
כדי שהמעגל יהיה מושלם יש לעשות אותו פעמיים
למה האלקטרונים של יוביקוויטון מתפצלים?
בגלל שציטורכרום סי יודע לקלוט רק אלקטרון אחד
על כל אלקטרון שעבר שני מחזורים כמה פרוטונים יוביקוויטון שואב לתווך בין תאי
2
ממי קומפלקס 4 מקבל אלקטרון? ולאן האלקטרון מועבר?
ציטוכרום סי
האלקטרון מועבר לציטוכרום איי 3
ואז לציטוכרום איי
ואז לחמצן האטמוספרי
כמה אלקטרונים צריך בשביל לחזר ציטוכרום סי ?
ארבעה אלקטרונים
כמה פרוטונים שואב קומפלקס 4 על כל אלקטרון?
4
כמה תתי יחידות יש לקומפלקס 4?
13
כמה יחידות של קומפלקס 4 יש בחיידקים?
3-4
אילו תתי יחידות עיקריות יש בקומפלקס 4? ומה יש בתוך כל אחת מהן?
Mitochondrial Subunint II
מכילה 2 יוני נחושת
CUA
וקבוצת תיול עם שני ציסטאנים
ו-
sub unoit 1
מכיל שתי קבוצות הם
ויון נחושת
CUB
איי ו-איי 3 האלקטורנים עוברים מציטוכרום סי לציטוכרום איי לציטוכרום איי 3 שקשור לחמצן
איפה האלקטרונים מגיעים בסוף שרשרת האלקטרונים ?
לחמצן אטמוספרי
מה קורה עם כל הפרוטונים שנשאבו?
הולכים לכיוון
ה-atp סינטאז
כמה פרוטונים נשאבים כאשר יש
nadh?
10
פרוטונים
כמה פרוטונים נשאבים מה-fadh2?
6
כמה אלקטרונים צריך על מנת לחזר חמצן אטמוספרי ?
4 אלקרטונים
איך ניתן לחזר מולקולה אחת של חמצן?
באילו דרכים?
שהם 2 מולקולות של
NADH
מולקולת NADH
ומולקולת סוקסינאט
כל אופציה אחרת ללא תלות במקור האלקטרונים
רספירזום
כאשר הקומפלקסים בשרשת האלקטרונים נוטים להתאגד לקומפלקסים צמודים יותר שנקראים מגה קומפלקס
איך הרספירזום תורם לשרשרת מעבר האלקטרונים?
- מונע זליגה של האלקטרונים לכיוון המטריקס
- מגביר את ההסתברות למפגשים פוריים בים הסובסטראים השונים מה שמעלה את קצב מעבר שרשת האלקטרונים
אילו שני גורמים יכולים לגרום לרספירזום?
הפקטור HIF -
עליו כבר דיברנו רבות– משתחרר בזמן היפוקסיה ובעצם חיוני ליצירת רספירזום ולהגברת האפקטיביות של שרשרת מעבר האלקטרונים במצבי חוסר חמצן. הוא עושה זאת על ידי שינוי המרכיבים של קומפלקס 4.
קרדיוליפין –
diphosphtydil-glycerol
– ליפיד ייחודי של הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. תפקידו לא לגמרי ברור אך בהוצאתו החוצה או במוטציות המונעות ייצור של קרדי-ליפין, לא ניתן לצפות ברספירזום. בדרך מסויימת הוא מגביר את האפיניות בין מרכיבי הרספירזום.
מה יכול לגרום להצטברות רדיקלים במיטוכונגריה ולמה זה גורם?
הצטברות רדיקלים חופשיים של חמצן היא מצב נפוץ במיטוכונדריה הגורם נזק לדנ”א. הופעת הרדיקלים מוגברת כאשר קצב העברת האלקטרונים אל השרשרת גבוה מקצב העברת האלקטרונים בתוך השרשרת, מצב המתרחש כאשר יש עלייה בריכוז של
NADH
מה עושים כאשר יש רדיקלים במיטוכודנריה?
על מנת להילחם בכך על המיטוכונדריה להשתמש בכוח מחזר ייחודי, NADPH, עליו נדבר עוד בהמשך.
כיצד קוראים לאינזים שמחמצן את
NADH
על מנת למנוע רדיקלים חופשיים ומה הוא עושה?
מה התוצר עושה?
ניקוטין נוקליאוטיד דה הידרוגנאז
והוא מזרז חמצון של
nadh
ל-nad
וחיזור של
nadp
ל-nadh
NADPH
שנוצרת במיטוכונדריה מחזרת את הגלוטטיון שהוא מסלק את רדיקלים חופשיים והאינזים נקרא גלוטטיון רדוקטאז
איך הולך תהליך החיזור של הגלוטטיון
גלוטטיון רדוקטאז זה האינזים שעושה זאת ויש לו איזואינזים בציטוזול
Nadph
מחזרים את הגלוטטין, הגלוטטין קשור לעוד גלוטטיון בקשרי
S-S
כאשר NADPH
מחזר אותם נוצרים שני גלוטטיונים שיכולים ללכת לחזר עוד רדיקאלים של חמצן
מה הגלוטטיון עושה?
הגלוטטיון מחזר פרוקסיד
h2o2
למים
עי אינזים שנקרא גלוטטיון פרוקסידאז
בנוסף גלוטטיון מחוזר מעביר אלקטרונים לחלבונים שקשורים לסטרס חמצוני ומשפעל אותם עי חיזור קשרים די סולפידים
מה קורה כאשר אנחנו לאמצליחים לסלק את הרדיקלים בצורה יעילה?
אי ספיקת לב
סוגים מסוימים ונדירים של סוכרת
מחלות שעוברות בהורשה אמהית (הכוללת פגיעה בתפקוד שריר ונוירונים)
איך קוראים לפרחים של צמחי ארכיאה?
spadix
מה הspadix יודעים לעשות?
- יודע להשרות ריח של בשר כדי שיבואו חרקים
- יודע להתחמם בין 20-40 מעלות כדי שהריח של הבשר יתפזר למרחק יותר גבוהה
איך מצליחים הצמים לחמם את ה-spadix?
וכיצד התהליך ה-זה נקרא?
התהליך נקרה תרמוגנזה והוא נעשה עי שלושה קומפלקסים אלטרנטיבים בשרשרת העברת האלקטרונים:
QH2
אלטרניטיבי שמכיל חמצן- עמיד לציאניד - כמו ציטורכום סי רק שהוא לא מקביל אלקטרונים מקומפלקס 3 אלא מיוביקווינול ולא שואב פרוטונין
Nadh dehydrogenase
אלטרנטיבי
לא רגיש לרוטנון ולא שואב פרוטונים
nadph
דה היגרורגנאז מאפשר את העברת האלקטרונים ליוביקווינול מהציטוזול כי הוא נמצא על החלק החיצוני של הממברנה הפנימית ובכך לייעל את העברת האלקטרונים ליוביקווינון מהציטוזול
לא נוצר ככה איי טי פי
איך קוראים לתהליך שנעזה בזמן האור לצמחים?
פוטורספירציה
מה תוצר הלוואי של פוטורספירציה?
גליצין
מה קורה לתוצר הלוואי של פוטורספירציה בזמן חושך?
הגליצין יומר לסרין בתהליך היוצר
NADH
ואת ה-nadh
יעבירו ליוביקווינון
מה קורה עם ה
nadh
במיטוכונדריה?
אין לו טראנספורטר
אבל יש שאטלים
שאטל זה דרך להעביר אנרגיה של מולקולה בלי להעביר את המולקולה עצמה
שאטל גליצרול 3 פוספאט
מה הוא עושה ?
איפה הוא נמצא?
דה הידרוקסי אצטון פוספאט הופך לגליצראלדהיד 3 פוספאט עי האינזים גליצרול 3 פוספאט דה הידרוגנאז
החיזור נעשה עי nadh
נוצר גליצרול 3 פוספרט
יש את אותו אינזים שמזרז את התגובה
ההבדל הוא שאותו האיניזם נמצא במיטוכונדריה ומשתמש ב-
fad
גליצרול 3 פוספאט מחזר את
fad
וככה fad הופך להיות
fadh2
בקומפלקס 2 נותן את האלקטרונים ליוביקיינון ונוצר לי 1.5
atp
כי זה fad
שאטל זה נמצא במוח ובשלד
מה הוא שאטל מאלאט אספרטט ואיפה הוא נמצא?
- nadh
נותן אלקטרונים לאוקסאלואצטט
- אוקסאלואצטאט הופכת למלאט
- מלאט נכנסת באנטי פורט למיטוכונדריה ככה שיוצא מהמיטוכונדירה אלפא קטוגלוטראט
- מלאט נכנסת למעגל קרבס ומביאה את האלקטרונים שלה
ל-nad
- nad הופך ל-2.5
atp
- זה נמצא בכבדף כליה ושריר לב זה בעיקר מתייחס למעגל האוריאה
מה atp סינטאז מנצל ?
את גראדיינט הפרוטונים
לאיזה משפחה שייך atp סינטאז?
f-type-atp-synthaze
מהו מרכיב F0 במיטוכונדריה?
ממה מורכבבת היחידה?
תעלה הפרוטונים נעוצה בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה
תת יחידה איי אחת
שני תת יחידות בי
מספר משתנה של תת יחידות סי
איך הפרוטונים מתחברים לf0?
עי אספרטט או גלוטאמאט שנמצאות על תת יחידה סי
מה מסובב את
F1
ולמה?
יחידה גאמא שמסתובבבת כתלות במצה בפרוטונים והיא הידרופובית
ממה מורכבת יחידה סי וכמה יחידות יש סדרך כלל?
יחידה סי מורכבת מבין 8-15 יחידות
ויש לה הליקסים טראנס ממבראנאלים
ממה מורכבת תת יחידה איי במפל הפרוטונים ועם מי היא יוצרת קשר?
תת יחידה איי מורכבת מהליקסים הידרופוביים ויוצרת קשר עם תת יחידה סי
איזה תתי יחידות מחזיקות את קומפלקס אף 1 ככה שהוא ישאר סטאטי ביחס לממברנה ?
b2 +delta
כיצד נקרא
f1
איפה הוא נמצא?
ומה קורה כאשר מבודדים אותו?
הוא נמצא במטריקס במיטוכונדריה
הוא האינזים שיוצר את atp
וכשהוא מבודד מהכל הוא עושה הידרוליזה של atp
ולכן שמו:
F1-ATPase
ממה מורכב
f1-atpase?
אלפא-בטא ותת יחידה גמא
איפה נמצאת תת יחידה גאמא?
- מחברת בין אף 0 ל-אף 1
- מחוברת לאחת מיחידות בטא (כל פעם יחידה אחרת)
3.
איזה יון יש ב-f1
איי טי פי אז?
מגנזיום
כמה קונפורמיציות שונות יכולה לקבל תת יחידה בטא?
ולמה ?
3 בגלל סיבוב של תת יחידה גאמא
הודות לסיבוב של תת היחידה גמא. זאת אומרת שבכל קומפלקס בכל רגע נתון כל אחת מתת יחידות בטא אומנם זהה לשנייה אך “לובשת” קונפרמציה אחרת בהתאם לאסוציצייה עם תת יחידה גמא.
לכל קונפורמציה יש אפיניות שונה ל-adp
ו-
atp
אחת קושרת איי די פי שניה איי טי פי
והשלישית כלום
מה עושה תת יחידה אפסילון?
פועלת ביחד עם תת יחידה גמא במנגנון של “רגל וכף רגל” כאשר אפסילון יוצרת אינטרקציה עם יחידות ה c
מה תפקיד תת יחידה דלתא?
תת היחידה דלטא – בעזרת b2 מאפשרת החזקה של
איך נוצר ה-ATP
ומה תפקיד מפל הפרוטונים?
הקומפלקס אף 1 קושר בצורה מאוד חזקה את איי טי פי ןמייצבת אותו יותר מאיי די פי ופספאט בנפרד.
האפיניות הגבוהה יוצרת אנרגיית קישור שמניעה את שיווי המשקל לכיוון יצירת אי טי פי
מה שהפרוטונים עושים הם למעשה גורמים לשינוי קונפורמציה באינזים כדי שיוריד את איי טי פי
כאשר ריכוז האיי טי פי גבוהה מאוד מה עושה הקומפלקס איי טי פי סינטאז?
הקומפלקס משמש כמשאבת פרוטונים:
הקומפלקס פועל כמשאבה בכך שהוא דוחף את הפרוטונים למעלה נגד מפל הריכוזים תוך הידרוליזה של איי טי פי
אם אני מסמנת חמצן באיזוטופ כבד של חמצן,
ו-F1 עושה הידרוליה של ATP
כמה אטומי חמצן מסומנים יהיה לפוספאט האי אורגאני?
3-4
בגלל שזו ריאקציה הפיכה
הפוספאט מתנתק ומתחבר מספר פעמים
לאיי די פי
אילו שינויים תת יחידה בטא עוברת באיי טי פי סינטאז?
בהתחלה תת היחידה קושרת בטא איי די פי ופוספאט
לאחא מכן יש שינוי קונפורמציה ככה שמה שקורה לתת היחידה יהיה יותר זיקה להפוך אותם לאיי טי פי
ויש סוג של ייצוב ואז הריאקציה היא לא הפיכה
לאחר מכן תת היחידה בטא משנה קונפורמציה לבטא אמפטי
כי האפיניות לאיי טי פי יורדת
איך תת יחידה בטא משנה את הקונפורמציה שלה?
c
בקומפלקס אף אפס תופס פרוטונים וגורם לגאמא להסתובב
בכל רוטציה של 120 מעלות גאמא נוגעת עם תת יחידה אחרת של בטא
תת יחידות בטא עושות אינטראקצית אחת עם השניי ככ שאם אחת עם איי טי פי אחת תהיה עם איי די פי ופוספאט ואחת תהיה בלי כלום
בסיבוב של 360 מעלות תת יחידה גאמא מכריחה את תת יחדה בטא להיות בכל שלושת הקונפורמציות
אם אף 1 מסתובב בכיוון ההפוך?
יש הידרוליזה של איי טי פי
איך ה-ph במיטוכונדריה?
יחסית שלילי
הפרוטון מוטיב פורס את מה הוא למעשה מניע?
ומדוע?
את השחרור של איי טי פי לסביבה
אם חושבי על זה האינזים מצליח לייצב את המצב של איי די פי עם פי (המטריקס טעון שלילי לכן הם יעדיפיו את הקומפלקס)
גם את האיי טי פי הוא יחסית מייצב
רק השחרור דורש עוד אינרגיה