biochemistry 4 Flashcards

1
Q

מה אנחנו יצרנו בכל התהליך שהגלוקוז עבר עד כה?

A

4 ATP

10 NADH

(כל אחד מניב 2.5 ATP כאשר 2 מהם יכולים להיות שווים רק 1.5 איי טיפי (הסבר בהמשך)

2 FADH2

כל אחד מניב 1.5 ATP

בסה”כ מדובר על בין 30-32 מולקולות ATP. מכאן שנשימה הצורכת חמצן שווה פי 15 עד פי 16 יותרATP מאשר גליקוליזה ותסיסה (המניבים רק 2 ATP)/

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מדוע המיטוכונדריה והכלורופלסט דומים?

A

חלק מהתאים היוקריוטים ביצעו תהליך אנדוסימביוזה שני ובלעו חיידק מסוג ציאנובקטריה ששאריותיו היא בעצם הכלורופלסט. שני האיברונים, מיטוכונדריה וכלורופלסט, מכילים מרכיבים מאוד דומים. בשניהם מתרחש תהליך של העברת אלקטרונים על גבי הממברנה עד שהאלקטרונים מגיעים למקבל אלקטרונים סופי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה ההבדל בין רקמות שזקוקות ליותר אנרגיה מבחינת המיטוכונדריה לבין רקמות שזקוקות לפחות אנרגיה מבחינת המיטוכונגדריה?

A
  1. פיזור המיטוכונדריה הוא יותר גדול וצפוף
  2. יש יותר קריסטה בתאים הללו

קריסטה זה המקום עליו התאים עושים איי טי פי סינטז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

איפה מתרחש התהליך הזרחון החמצוני במיטוכונדריה?

A

ע”ג הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מה הם המקורות של האלקטרונים

ב-nadh?

A

פעילות האנזים

PDH

פעילות של אנזימי מעגל קרבס

חמצון חומצות שומן

חמצון חומצות אמינו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה יעשו הקומפלקסים בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ?

A

הם יעבירו את האלקטרונים מאחד לשני עד שבסופו של דבר האלקרטונים יגיעו למקבל האלקטרונים הסופי שהוא חמצן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה יקרה כתוצאה מאנרגיית החמצון שקורית בגלל ההעברת האלקטרונים דרך הקומפלקסים?

A

מהאנרגיה המשתחררת מתהליכי החמצון, אותם קומפלקסים ישאבו פרוטונים מהמטריקס של המיטוכונדריה וידחפו אותם נגד מפל הריכוזים אל התווך הבין ממברנאלי, כך שיוצר מפל כימו-אוסמוטי, או במילים יפות יותר “גרדיאנט אלקטרוכימי”. אותם פרוטונים יוצרים גרדיאנט כימי – ריכוז גבוה של פרוטונים בתווך הבין ממברנאלי ביחס למטריקס, וגרדיאנט חשמלי – מטען חשמלי חיובי ביחס למטריקס השלילי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה קורה בכלורופלסט מבחינת הקומפלקסים ?

A

בכלורופלסט -

נותן האלקטרונים מיםף המים מתחמצנים לחמצן. כדי להוציא את האלקטרונים מהמים יש להשתמש באנרגיית אור (זה לא תהליך ספונטי) . בכלורופלסט מקבל האלקטרונים הסופי

זה nadp

שהופך בסופו של דבר ל-nadh

גם כאן יווצר מפל אלקטרוכימי של פרוטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה הם תהליכי הדימין בין הפוטוסינטזה לנשימה?

A

שניהם מעבירים אלקטרונים על גבי קומפלקסים ממברנאלים.

האנרגיה בשני המקרים משמשת לפמפום פרוטונים ליצירת מפל ריכוזים.

בשני המקרים תנועה של הפרוטונים בהתאם למפל האלקטרוכימי שלהם נעשית על גבי תעלות המנצלות את האנרגיה הפוטנציאלית המשתחררת לסינתזה של

ATP מ- ADP ופוספאט.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה הוא קומפלקס 1 בשרשרת העברת האלקטרונים?

A

nadh דה הידרוגנאז

שמחמצן את

nadh

שני האלקטרונים מגיעים ליובקווינון

שהופך לאחר קבלתם ליוביקווינון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מהו קומפלקס 2 בשרשרת העברת האלקטרונים?

A

אנזים חשוב במעגל החומצה הציטרית. מחמצן סוקסינאט והאלקטרונים עוברים דרכו

(דרך FADH2 )

ולבסוף מגיעים ליוביקווינון שהופך ליוביקווינול. שימו לב שקומפלקס 1 וקומפלקס 2 הן שתי דרכים אלטרנטיביות להכניס אלקטרונים לשרשרת מעבר האלקטרונים ואינם תלויים אחד בשני.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מה הוא יוביקווינון?

A

מולקולה קטנה והידרופובית המצויה על גבי הממברנה. כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא מכונה סמי-קווינון (Q.).

ובאלקטרון השני היא מכונה יוביקווינול (QH2).

האלקטרונים של יוביקווינול יימסרו בהמשך לקומפלקס 3.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה הוא קומפלקס 3?

איך הוא נקרא?

A

ציטוכרום bc1

יוביקווינון ציטוכרום C

אוקסידורדוקטאז: מחמצן את יוביקווינול ומעביר את האלקטרונים לחלבון המצוי בתווך הבין ממברנאלי הקרוי ציטוכורום C.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

ציטוכרום סי?

A

יעביר את האלקטרונים לקומפלקס 4 (ציטוכרום אוקסידאז) שבתוכו יושב החמצן שהופך למולקולת מים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה הם קומפלקסים 1 3 ו-4 ואיך הם נקראים?

A

קומפלקסים 1,3,4 משמשים כמשאבת פרוטונים, כאשר הכוח המניע את שאיבת הפרוטונים מהמטריקס אל התווך הבין ממברנאלי הוא הפרש ה Redox

בין חמצן לבין NADH

ולכן ניתן להגדירם כ Redox Driven Pumps.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מה משמש הגראדיינט האלקטרוכימי של שרשרת העברת האלקטרונים?

A

הגרדיאנט האלקטרוכימי של הפרוטונים משמש את הקומפלקס ATP-synthase ליצירת ATP.

הקומפלקס מאפשר חזרה של הפרוטונים מהתווך הבין ממברנאלי אל המטריקס והאנרגיה הפוטנציאלת המשתחררת מאפשרת את הפעלת הקומפלקס האנזימטי וזירוז יצירת מולקולות ATP בתוך המטריקס של המיטוכונדריה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מה הערך ה-ph במטריקס ומה הערך ה-ph בציטוזול?

A

שימו לב כי ערך הpH במטריקס הוא בסביבות 7.8

ואילו ערך ה pH בתווך הבין ממברנאלי זהה לזה של הציטוזול ועומד על 7.2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מהי פלאבין?

אילו שתי צורות יש לה?

מה תפקידה?

האם היא שוחה כמו בת הים הקטנה?

איך נקראים חלבונים בעלי קבוצה פלאבינית?

האם פוטנציאל החיזור שלה הוא קבוע?

האם היא נחשבת לחלק מתוצר?

A

קבוצה שמוכרת לנו בתור נשא אלקטרונים

יש לה שתי צורות:

FAD

FMN

ההבדל ביניהם הוא מספר הנוקליאוטידים .

תפקידה הוא לתווך בין הניאצין לבין היוביקווינון. כי היא אומנם מצליחה לפוס 2 אלקטרונים אבל מוסרת כל אחד בנפרד

היא לא שוחה כמו בת הים הקטנה היא כמעט תמיד חלק מחלבון או קשורה לחלבון

חלונים עם קבוצה פלאבינית נקראים פלאבו פרוטאינים

פוטנציאל החיזור שלה הוא לא קבוע ותלוי באיזה חלבון היא נמצאת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

האם בקומפלקס 1 יש פלאבין?

A

כן בקומפלקס 1

יש פלאבין

fmn

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

איזה סוג מולקולה זו יוביקווינון?

באיזה מנגנון היא מקבלת אלקטרונים ומוסרת אלקטרונים?

איך הוא נע בממברנה?

כשיוביקוונון במצבו המחוזר האם הוא נושא רק אלקטרונים?

A

ליפידית קטנה

היא מקבלת אלקטרונים אחד אחד ומוסרת אלקטרונים אחד אחד

כאשר היא מקבלת אלקטרון אחד היא הופכת להיות סמיקווינון

וכשהיא מקבלת שניים היא הופכת להיות יוביקווינול

לא הוא נושא גם פרוטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

ממה נובע שמם של הציטוכרומים?

אילו סוגי ציטוכרומים ישנם?

האם קבוצות ההם שלהם קשורות באופן קוולנטי?

האם לכל הציטוכרומים אותו פוטציאל חיזור?

מי בשרשרת המעבר הוא ציטוכרום?

A

לפי הצבע שלהם

ABC

רק של C קשורה דרך ציסטאים

לא זה משתנה בהתם לקונטסט

קומפלקס 3 – מכיל את ציטוכרום בי

ציטוכורום C –בתווך הבין ממברנלי

קומפלקס 4– מכיל את ציטוכורום איי ואת איי 3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

האם צברי ברזל גופרית מאורגנים?

איך הן נקשרות למולקולה?

איך כל ברזל יודע להעביר אלקטרון?

איפה הם מצויים?

איך הם קרויים?

והאם הפוטנציאל חיזור הוא קבוע?

A

לא הם לא מאורגנים

עי ציסטאין, או עי מולקולות אורגנית

כל פעם אחד

בקומפלקסים חלבוניים

rieske iron sulfur

פוטנציאל החיזור הוא לא קבוע

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

אם אני רוצה לחקור את כקומפלקסים במיטוכונדריה מה עליי לעשות?

ומה קורה ל-

atp synthase לאחר ההפרדה?

A
  1. דיגיטונין
  2. osmotic rapture
  3. ion exxhange

חשוב לציין שלאחר ההפרדה הזו, קומפלקס

ATP-Synthase

שלעיתים מכונה גם קומפלקס 5, הוא חסר פעילות סינתזה של

ATP ודווקא בעל פעילות של הידרוליזה של

ATP . קרי, הוא מפרק

ATP ולא מייצר.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
קומפלקס 1 לאן nadh מעביר את האלקטרונים והפרוטונים שלו?
Nadh מעברין את האלקטרונים -fmn (שני אלקטרונים ושני פרוטונים) 2 הפרוטונים הראשונים יוצאים למטריקב לאחר מכן האלקטרונים מועברים לצברי גופרית ברזל (יש לפחות שישה כאלה) ומשם ליוביקווינין ולאחר קבלת האלקטרונים נזרקים עוד 2 פרוטונים החוצה ואז כל הפרוטונים נכנס לנוזל הבין ממברנאלי
26
מה הם החומרים המעכבים של קומפלקס 1?
אמיטאל – חומר ממשפחת הברביטוראטיים. רוטנון – מדביר חרקים שמופק מצמחים. פיירצידין A – אנטיביוטיקה . כל השלושה מעכבים את המעבר של האלקטרונים ממרכזי ברזל גופרית ליוביקווינון
27
מהו קומפלקס 2? איך הוא מעברים את האלקטרונים? האם הוא נחשב לשואב פרוטונים?
קומפלקס 2 זו הדרך בה סוקסינאט נצמד להעברת האלקטרונים גם פה יש מרכז פלאביני FAD שם מועברים האלקטרונים ליוביקווינון שם אין את הקטע של המשאבת פרוטונים כל ארבעת הפרוטונים מגיעים למטריקס
28
29
כמה שרשרות פוליפפטידיות יש לקומפלקס 2?
4
30
כמה קבוצות פרוסטטיות יש לקומפלקס 2?
5
31
אילו יחידות יש בקומפלקס 2?
יחידה A -בתוך המטריקס יש בה אתרי ברזל גופרית יחידה בי- אתר קישור לאף איי די ולסוקסינאט ואתר קישור ליוביקווינון יחידה סי ודי הם בעלי 3 הליקסים כל אחת טראנס ממבראנאלים ויש ביניהם קבוצת הם בי
32
איזה ציטוכרום יש בקומפלקס 2? ומה תפקידו?
ציטוכרום בי תפקידו הוא למנוע זליגת אלקטרונים כדי שלא יהיה רדיקלים של חמצן
33
אם יש רדיקלים חופשיים בדם למה זה יכול לגרום?
להופעת גידולים
34
פרא-גנגיליומה
מוטציה באיזור ההם בי או ליד האתק הקשור לקווינון שגרומת להופעת גידולים שפיריים בקרוטיד באדי- איבר שיכול לחוש את רמת החמצן
35
כיצד נקרא קומפלקס 3?
ציטוכרום בי סי 1
36
מה זו היחידה הפונקציונאלית של קומפלקס 3?
היחידה הפונקציונאלית בקומפלקס 3 הינה דימר של ציטוכרום b, המאפשר תנועה של גם תנועה של יוביקווינון בין שני עלעלי הממברנה הפנימית .
37
לתאר את המבנה של קומפלקס 3
קומפלקס הוא דימר של ציטוכרום ביץ כל מונומר בנוי מ-11 יחידות. הליבה של מונומור זה באתירים הפעילים שהם: Heme bh heme bl cytochrome c1 ברזל גופרית יש לו גם שני אתרים לקשירה של היוביקווינול qp qn
38
מי הם המעכבים של קומפלקס 3?
אנטימיצין A חוסמת את מעבר האלקטרונים מ BH ליוביקווינון וזה נעשה באתר QN מיקסוטיאזול מונע את מעבר האקטרונים מיוביקווינול לצברי הברזל גופרית המצויים על גבי חלבון Reiske, עיכוב שמתבצע באתר QP
39
מה הוא מחזור היוביקווינול?
היוביקווינול הולך לו לקומפלקס 3 שם אלקוטרונים מתפצלים ל-2: 1. אלקטרון אחד הולך דרך צברי ברזל גופרית-\> מגיע לסי 1-\> עובר לציטורכרום סי מסיס 2. אלקטרון שני עובר דרך בי אל ל-בי אייץ' ואז הולך ליוביקטון אחר. הופך לסמי קוויטון כדי שהמעגל יהיה מושלם יש לעשות אותו פעמיים
40
למה האלקטרונים של יוביקוויטון מתפצלים?
בגלל שציטורכרום סי יודע לקלוט רק אלקטרון אחד
41
על כל אלקטרון שעבר שני מחזורים כמה פרוטונים יוביקוויטון שואב לתווך בין תאי
2
42
ממי קומפלקס 4 מקבל אלקטרון? ולאן האלקטרון מועבר?
ציטוכרום סי האלקטרון מועבר לציטוכרום איי 3 ואז לציטוכרום איי ואז לחמצן האטמוספרי
43
כמה אלקטרונים צריך בשביל לחזר ציטוכרום סי ?
ארבעה אלקטרונים
44
כמה פרוטונים שואב קומפלקס 4 על כל אלקטרון?
4
45
כמה תתי יחידות יש לקומפלקס 4?
13
46
כמה יחידות של קומפלקס 4 יש בחיידקים?
3-4
47
אילו תתי יחידות עיקריות יש בקומפלקס 4? ומה יש בתוך כל אחת מהן?
Mitochondrial Subunint II מכילה 2 יוני נחושת CUA וקבוצת תיול עם שני ציסטאנים ו- sub unoit 1 מכיל שתי קבוצות הם ויון נחושת CUB איי ו-איי 3 האלקטורנים עוברים מציטוכרום סי לציטוכרום איי לציטוכרום איי 3 שקשור לחמצן
48
איפה האלקטרונים מגיעים בסוף שרשרת האלקטרונים ?
לחמצן אטמוספרי
49
מה קורה עם כל הפרוטונים שנשאבו?
הולכים לכיוון ה-atp סינטאז
50
כמה פרוטונים נשאבים כאשר יש nadh?
10 פרוטונים
51
כמה פרוטונים נשאבים מה-fadh2?
6
52
53
כמה אלקטרונים צריך על מנת לחזר חמצן אטמוספרי ?
4 אלקרטונים
54
איך ניתן לחזר מולקולה אחת של חמצן? באילו דרכים?
שהם 2 מולקולות של NADH מולקולת NADH ומולקולת סוקסינאט כל אופציה אחרת ללא תלות במקור האלקטרונים
55
רספירזום
כאשר הקומפלקסים בשרשת האלקטרונים נוטים להתאגד לקומפלקסים צמודים יותר שנקראים מגה קומפלקס
56
איך הרספירזום תורם לשרשרת מעבר האלקטרונים?
1. מונע זליגה של האלקטרונים לכיוון המטריקס 2. מגביר את ההסתברות למפגשים פוריים בים הסובסטראים השונים מה שמעלה את קצב מעבר שרשת האלקטרונים
57
אילו שני גורמים יכולים לגרום לרספירזום?
הפקטור HIF - עליו כבר דיברנו רבות– משתחרר בזמן היפוקסיה ובעצם חיוני ליצירת רספירזום ולהגברת האפקטיביות של שרשרת מעבר האלקטרונים במצבי חוסר חמצן. הוא עושה זאת על ידי שינוי המרכיבים של קומפלקס 4. קרדיוליפין – diphosphtydil-glycerol – ליפיד ייחודי של הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. תפקידו לא לגמרי ברור אך בהוצאתו החוצה או במוטציות המונעות ייצור של קרדי-ליפין, לא ניתן לצפות ברספירזום. בדרך מסויימת הוא מגביר את האפיניות בין מרכיבי הרספירזום.
58
מה יכול לגרום להצטברות רדיקלים במיטוכונגריה ולמה זה גורם?
הצטברות רדיקלים חופשיים של חמצן היא מצב נפוץ במיטוכונדריה הגורם נזק לדנ"א. הופעת הרדיקלים מוגברת כאשר קצב העברת האלקטרונים אל השרשרת גבוה מקצב העברת האלקטרונים בתוך השרשרת, מצב המתרחש כאשר יש עלייה בריכוז של NADH
59
מה עושים כאשר יש רדיקלים במיטוכודנריה?
על מנת להילחם בכך על המיטוכונדריה להשתמש בכוח מחזר ייחודי, NADPH, עליו נדבר עוד בהמשך.
60
כיצד קוראים לאינזים שמחמצן את NADH על מנת למנוע רדיקלים חופשיים ומה הוא עושה? מה התוצר עושה?
ניקוטין נוקליאוטיד דה הידרוגנאז והוא מזרז חמצון של nadh ל-nad וחיזור של nadp ל-nadh NADPH שנוצרת במיטוכונדריה מחזרת את הגלוטטיון שהוא מסלק את רדיקלים חופשיים והאינזים נקרא גלוטטיון רדוקטאז
61
איך הולך תהליך החיזור של הגלוטטיון
גלוטטיון רדוקטאז זה האינזים שעושה זאת ויש לו איזואינזים בציטוזול Nadph מחזרים את הגלוטטין, הגלוטטין קשור לעוד גלוטטיון בקשרי S-S כאשר NADPH מחזר אותם נוצרים שני גלוטטיונים שיכולים ללכת לחזר עוד רדיקאלים של חמצן
62
מה הגלוטטיון עושה?
הגלוטטיון מחזר פרוקסיד h2o2 למים עי אינזים שנקרא גלוטטיון פרוקסידאז בנוסף גלוטטיון מחוזר מעביר אלקטרונים לחלבונים שקשורים לסטרס חמצוני ומשפעל אותם עי חיזור קשרים די סולפידים
63
מה קורה כאשר אנחנו לאמצליחים לסלק את הרדיקלים בצורה יעילה?
אי ספיקת לב סוגים מסוימים ונדירים של סוכרת מחלות שעוברות בהורשה אמהית (הכוללת פגיעה בתפקוד שריר ונוירונים)
64
איך קוראים לפרחים של צמחי ארכיאה?
spadix
65
מה הspadix יודעים לעשות?
1. יודע להשרות ריח של בשר כדי שיבואו חרקים 2. יודע להתחמם בין 20-40 מעלות כדי שהריח של הבשר יתפזר למרחק יותר גבוהה
66
איך מצליחים הצמים לחמם את ה-spadix? וכיצד התהליך ה-זה נקרא?
התהליך נקרה תרמוגנזה והוא נעשה עי שלושה קומפלקסים אלטרנטיבים בשרשרת העברת האלקטרונים: QH2 אלטרניטיבי שמכיל חמצן- עמיד לציאניד - כמו ציטורכום סי רק שהוא לא מקביל אלקטרונים מקומפלקס 3 אלא מיוביקווינול ולא שואב פרוטונין Nadh dehydrogenase אלטרנטיבי לא רגיש לרוטנון ולא שואב פרוטונים nadph דה היגרורגנאז מאפשר את העברת האלקטרונים ליוביקווינול מהציטוזול כי הוא נמצא על החלק החיצוני של הממברנה הפנימית ובכך לייעל את העברת האלקטרונים ליוביקווינון מהציטוזול לא נוצר ככה איי טי פי
67
איך קוראים לתהליך שנעזה בזמן האור לצמחים?
פוטורספירציה
68
מה תוצר הלוואי של פוטורספירציה?
גליצין
69
מה קורה לתוצר הלוואי של פוטורספירציה בזמן חושך?
הגליצין יומר לסרין בתהליך היוצר NADH ואת ה-nadh יעבירו ליוביקווינון
70
מה קורה עם ה nadh במיטוכונדריה?
אין לו טראנספורטר אבל יש שאטלים שאטל זה דרך להעביר אנרגיה של מולקולה בלי להעביר את המולקולה עצמה
71
שאטל גליצרול 3 פוספאט מה הוא עושה ? איפה הוא נמצא?
דה הידרוקסי אצטון פוספאט הופך לגליצראלדהיד 3 פוספאט עי האינזים גליצרול 3 פוספאט דה הידרוגנאז החיזור נעשה עי nadh נוצר גליצרול 3 פוספרט יש את אותו אינזים שמזרז את התגובה ההבדל הוא שאותו האיניזם נמצא במיטוכונדריה ומשתמש ב- fad גליצרול 3 פוספאט מחזר את fad וככה fad הופך להיות fadh2 בקומפלקס 2 נותן את האלקטרונים ליוביקיינון ונוצר לי 1.5 atp כי זה fad שאטל זה נמצא במוח ובשלד
72
מה הוא שאטל מאלאט אספרטט ואיפה הוא נמצא?
1. nadh נותן אלקטרונים לאוקסאלואצטט 2. אוקסאלואצטאט הופכת למלאט 3. מלאט נכנסת באנטי פורט למיטוכונדריה ככה שיוצא מהמיטוכונדירה אלפא קטוגלוטראט 4. מלאט נכנסת למעגל קרבס ומביאה את האלקטרונים שלה ל-nad 5. nad הופך ל-2.5 atp 5. זה נמצא בכבדף כליה ושריר לב זה בעיקר מתייחס למעגל האוריאה
73
מה atp סינטאז מנצל ?
את גראדיינט הפרוטונים
74
לאיזה משפחה שייך atp סינטאז?
f-type-atp-synthaze
75
מהו מרכיב F0 במיטוכונדריה? ממה מורכבבת היחידה?
תעלה הפרוטונים נעוצה בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה תת יחידה איי אחת שני תת יחידות בי מספר משתנה של תת יחידות סי
76
איך הפרוטונים מתחברים לf0?
עי אספרטט או גלוטאמאט שנמצאות על תת יחידה סי
77
מה מסובב את F1 ולמה?
יחידה גאמא שמסתובבבת כתלות במצה בפרוטונים והיא הידרופובית
78
ממה מורכבת יחידה סי וכמה יחידות יש סדרך כלל?
יחידה סי מורכבת מבין 8-15 יחידות ויש לה הליקסים טראנס ממבראנאלים
79
80
ממה מורכבת תת יחידה איי במפל הפרוטונים ועם מי היא יוצרת קשר?
תת יחידה איי מורכבת מהליקסים הידרופוביים ויוצרת קשר עם תת יחידה סי
81
איזה תתי יחידות מחזיקות את קומפלקס אף 1 ככה שהוא ישאר סטאטי ביחס לממברנה ?
b2 +delta
82
כיצד נקרא f1 איפה הוא נמצא? ומה קורה כאשר מבודדים אותו?
הוא נמצא במטריקס במיטוכונדריה הוא האינזים שיוצר את atp וכשהוא מבודד מהכל הוא עושה הידרוליזה של atp ולכן שמו: F1-ATPase
83
ממה מורכב f1-atpase?
אלפא-בטא ותת יחידה גמא
84
איפה נמצאת תת יחידה גאמא?
1. מחברת בין אף 0 ל-אף 1 2. מחוברת לאחת מיחידות בטא (כל פעם יחידה אחרת) 3.
85
איזה יון יש ב-f1 איי טי פי אז?
מגנזיום
86
כמה קונפורמיציות שונות יכולה לקבל תת יחידה בטא? ולמה ?
3 בגלל סיבוב של תת יחידה גאמא הודות לסיבוב של תת היחידה גמא. זאת אומרת שבכל קומפלקס בכל רגע נתון כל אחת מתת יחידות בטא אומנם זהה לשנייה אך "לובשת" קונפרמציה אחרת בהתאם לאסוציצייה עם תת יחידה גמא. לכל קונפורמציה יש אפיניות שונה ל-adp ו- atp אחת קושרת איי די פי שניה איי טי פי והשלישית כלום
87
88
מה עושה תת יחידה אפסילון?
פועלת ביחד עם תת יחידה גמא במנגנון של "רגל וכף רגל" כאשר אפסילון יוצרת אינטרקציה עם יחידות ה c
89
מה תפקיד תת יחידה דלתא?
תת היחידה דלטא – בעזרת b2 מאפשרת החזקה של
90
איך נוצר ה-ATP ומה תפקיד מפל הפרוטונים?
הקומפלקס אף 1 קושר בצורה מאוד חזקה את איי טי פי ןמייצבת אותו יותר מאיי די פי ופספאט בנפרד. האפיניות הגבוהה יוצרת אנרגיית קישור שמניעה את שיווי המשקל לכיוון יצירת אי טי פי מה שהפרוטונים עושים הם למעשה גורמים לשינוי קונפורמציה באינזים כדי שיוריד את איי טי פי
91
כאשר ריכוז האיי טי פי גבוהה מאוד מה עושה הקומפלקס איי טי פי סינטאז?
הקומפלקס משמש כמשאבת פרוטונים: הקומפלקס פועל כמשאבה בכך שהוא דוחף את הפרוטונים למעלה נגד מפל הריכוזים תוך הידרוליזה של איי טי פי
92
אם אני מסמנת חמצן באיזוטופ כבד של חמצן, ו-F1 עושה הידרוליה של ATP כמה אטומי חמצן מסומנים יהיה לפוספאט האי אורגאני?
3-4 בגלל שזו ריאקציה הפיכה הפוספאט מתנתק ומתחבר מספר פעמים לאיי די פי
93
אילו שינויים תת יחידה בטא עוברת באיי טי פי סינטאז?
בהתחלה תת היחידה קושרת בטא איי די פי ופוספאט לאחא מכן יש שינוי קונפורמציה ככה שמה שקורה לתת היחידה יהיה יותר זיקה להפוך אותם לאיי טי פי ויש סוג של ייצוב ואז הריאקציה היא לא הפיכה לאחר מכן תת היחידה בטא משנה קונפורמציה לבטא אמפטי כי האפיניות לאיי טי פי יורדת
94
איך תת יחידה בטא משנה את הקונפורמציה שלה?
c בקומפלקס אף אפס תופס פרוטונים וגורם לגאמא להסתובב בכל רוטציה של 120 מעלות גאמא נוגעת עם תת יחידה אחרת של בטא תת יחידות בטא עושות אינטראקצית אחת עם השניי ככ שאם אחת עם איי טי פי אחת תהיה עם איי די פי ופוספאט ואחת תהיה בלי כלום בסיבוב של 360 מעלות תת יחידה גאמא מכריחה את תת יחדה בטא להיות בכל שלושת הקונפורמציות
95
אם אף 1 מסתובב בכיוון ההפוך?
יש הידרוליזה של איי טי פי
96
איך ה-ph במיטוכונדריה?
יחסית שלילי
97
הפרוטון מוטיב פורס את מה הוא למעשה מניע? ומדוע?
את השחרור של איי טי פי לסביבה אם חושבי על זה האינזים מצליח לייצב את המצב של איי די פי עם פי (המטריקס טעון שלילי לכן הם יעדיפיו את הקומפלקס) גם את האיי טי פי הוא יחסית מייצב רק השחרור דורש עוד אינרגיה
98
מה יש במרכז טבעת סי ?
ממברנה ליפידית וחומצה אמינית אספרטט וגלוטאמאט
99
דרך איפה הפרוטונוים עוברים ?(דרך אילו תתי יחידה וכמה כל תת יחידה כזאת מעבירה אותם)?
חלק בסי וחלק באיי תחילה הם נמצאים בתת יחידה איי שמעבירה אותם חצי ממרנה דרך דיפוזיה
100
איך גאריינט הפרוטונים גורם לדיפוזיה דרך תתי יחידות סי ואיי
אספרטט בתת יחידה סי קשור לארגינין בתת יחידה איי-\> בא פרוטון אספרטט נקשר לפרוטון והארגינין הולך-\> ארגינין נקשר לתת יחידה בי אחרת עם פרוטן כלומר לארגינין אחר עם פרוטון-\> הפרוטון יוצא לתת מחצי הממבארנה השנייה לכיוון המטריקס
101
כמה פרוטונים נדרשים כדי שיהיה סיבוב?
ביונקים -8 בשמרים -10 בציאנו בקטריה של 15
102
מה הם קצב הסיבובים במיטוכודנריה שלמה?
6000 סל"ד
103
מדוע nadh יוצר רק 2.5 איי טי פי ולא 3 ?
אן איי די אייץ אמור ליצור 3 בגלל שכל סיבוב הוא 120 מעלות ככה שהיה אמור להיווצר 3 איי טי פי הסיבה שהוא לא יוצר 3 היא בכלל הסיבה היא שחלק מן הפרוטונים חיוניים על מנת להכניס בסימפורט את הפוספאט אינאורגני. הסימפורט קרוי פוספאט-טראנסלוקאז. הכוח המניע – גרדיאנט הפרוטונים.
104
יצד ADP נכנס למטריקס ו ATP יוצא החוצה?
כאן יש לנו אנטיפורטר המוציא ATP על התווך הבין ממברנאלי ומכניס ADP אל תוך המטריקס. הכוח המניע – הוצאה של 4 מטענים שליליים מהמטריקס והכנסה של 3 מטענים שליליים למטריקס - מכאן שיש אבדן של מטען חשמלי שלילי במטריקס – וזה מצב יציב יותר תרמודינמית כיוון שהמטריקס עצמו טעון שלילית.
105
מי מהבאים צריך אותו לתהליכים אנאבולים? nadh nadph
nadph
106
האם fad שנמצאת על קומפלקס 2 היא קבוצה פרוסטטית?
נכון
107
אילו מקורות ל-nadph יש במיטוכונדריה?
1. איזוציטראט דה הידרוגנאז 2. מעגל אוריאה- גלוטאמט דה הידרוגנאז 3. טראנס ניקוטין דה הידרוגנאז
108
מה הוא גלוטטיון?
טרי פפטיד
109
כמה אלקטרונים ציטורכופ סי יודע לקחת ? ומה עוזר לו?
יודע לקחת אחד (כמו צבר ברזל גופרית) 1. עצם זה שיוביקווינול לוקח כל פעם אחד 2. עצם זה שמופרדים לו בקומפלקס 3
110
איפה מסתובב החמצן במיטוכונדריה?
עג הממברנה הפנימית כי הוא הידרופובי
111
האם סוקסיל דה הידרוגנאז הוא חלק משאטל גליצרול ?
לא
112
עם מי מאלאט דה הידרוגנאז באנטי פורט?
עם אלפא קטוגלוטראט
113
עם מי פוסאט טראנסלוקז בסימפורט?
עם מולקולת H+ כי גם ככה פוספרט הוא שלילי אז על כל מולקולה שלילית שנכנסת צריכה להיכנס מולקולה אחת חיובית
114
מה עושה הנוקלאוטיד טראנסלוקאז?
מוציא איי טי פי ומכמיס adp בגלל המטע החשמלי
115
מה הם המעכבים שיש במיטוכונדריה?
116
מה קורה כאשר מוסיפים ציאניד לגוף ?
הציאניד תופס את מקומו של החמצן, ומעכב את קומפלקס 4
117
למה אין צריכה של חמצן כאשר מוסיפים רק סוקסינאט וצריך את הסובסטארטים atp synthaze?
גראדיינט הפרוטונים שנוצר כתוצאה משרשרת העברת האלקטרונים, אין חמצן שנצרך, ואין איי טי פי
118
מה שרשרת של אוליגו מיצין עושה?
פוגעת בהעברה של הסובטראטים של איי טי פי סינטאז ובאופן עקיך פוגעת גם בשררת העברת האלקטרונים
119
מה הוסיפו בכל שלב
120
מה הוסיפו בכל אחד מהשלבים ?
121
מה עושים מפרי צימוד?
הורסים את גראדיינט הפרוטונים
122
מה עושה dnp?
הוא תפוס פרוטון מהתווך הבין ממברנאלי ומעביר אותו אל המטריקס כשהוא חודר את הממברנה כמולקולה הידרופובית. אותו פרוטון חוזר למטריקס אך לא דרך ATP-synthase ולכן לא נוצר ATP.
123
מה עושה ואלינומיצין?
פותח תעלת אשלגן ובעצם גורם לאשלגן שריכוזו גבוה בתווך הבין ממברנאלי לנוע אל המטריקס, טוען אותו במטען חשמלי חיובי ובעצם מונע את מעבר הפרוטונים בחזרה אל המטריקס..
124
באילו רמות מבוקר הזרחון החמצוני בתא?
Acceptor Control Mass-action החלבון המעכב IF1
125
accrptor control
בקרה ברמת המקבל כאשר יש מספר רב של adp ופרוטונים אז יש יותר חמצן
126
Mass-action
כאשר צריכת האנרגיה התאית עולה לדוגמא בזמן סינטזה חלבון היחס atp/adp\*p יורד וכאשר היחס יורד ישנה הצטברות של איי די פי מה שמגביר את מעבר האלקטרונים
127
מה קורה כאשר התא במצב היפוקסי? איך אפשר לתקן זאת?
התא במצב היפוקסי-\> קצב העברת האלקטרונים הוא איטי-\> אין גראדיינט-\> יכול להיווצר מצב שהוא הפוך כלומר פירוק איי טי פי במצב כזה חלבון איי אף 1 נקשר לשני קומפלקלקסים של טיי פי סינטאז ומעכב את פעילות האיי טי פי אז שלהם
128
מתי חלבון איי אף 1 פעיל?
1. כאשר הוא במצב דימרי כאשר PH מתחת ל-6.5 דבר הקורה כאשר יש הרבה גליקוליזה והרבה לקטט
129
איזה סוג חלבון הוא איי אף 1?
חסר ארגון פנימי
130
איזה עוג מערכות ישנם להסרת רדיקלים? ואיך הן פועלות?
הגברה של HIF 1 גורמת: בקרה על הקומפלקס PDH - תחת תנאים היפוקסיים האנזים PDH-kinase משופעל ומזרחן את היחידה E1 ובכך מנטרל את פעילותה ובכך מעכב את קצב העברת הסובסטראטים אל מעגל החומצה הציטרית ומשם אל שרשרת מעבר האלקטרונים. החלפת תת יחידה בקומפלקס 4 –בתנאים היפוקסיים תת היחידה COX4-1 מוחלפת ביחידה אחרת COX4-2, אשר פועלת באופן אופטימאלי בריכוז חמצן נמוכים ובכך מבצעים אופטימיזציה לקומפלקס 4. ההחלפה מתבצעת על ידי שעתוק ותרגום של היחידה החדש והפעלת פרוטאז המפרק את Cox4-1.
131
תרמוגנזה מי עושה אותה ומה תפקידה?
מיטוכונריה שמירה על חום גוף תקין
132
מה הוא מפר צימוד ביולוגי? איפה הוא נמצא? למי יש אותו?
טרמוגין יו סי פי 1 על מיטוכונדריה בתאי שומן בתאי שומן חום לתינוקות, בגלל שהיכולת לייצר חום היא מעטה לכן יש יש שימוש בטרמוגין. החלבון משמש כתעלת פרוטונים, שמאפשרת לפרוטונים להיכנס ללא אי טי פי סינטז למטריקס ולכן משתחרר חום מהגוף
133
מדוע אם אין adp+p זה משפיע על צריכת חמצן?
אמנם צריכת החמצן קשורה לשרשרת מעבר האלקרטרונים אבל ברגע שמצטבר גראדיינט פרוטונים אי אפשר יותר להעביר פרוטונים לתווך הבין ממבראנלי ומעבר האלקטרונים נתקע
134
מה קורה לצריכת החמצן כאשר מוסיפים cn ומה קורה לאיי טי פי פרודאקשן?
נתקע
135
מה קורה כאשר שמים מפר צימוד לאיי טי פי? ומה קורה לצריכת החמצן?
צריכת החמצן לא משתנה איי טי פי נתקע
136
האם שרשרת מעבר האלטרונים וייצור איי טי פי הם סיבה ותוצאה?
לא
137
מה זה יוני פור?
מולקולה קטנה שקושרת יון ועוברת איתו את הממברנה
138
איפה יש לנו אשלגן בגוף ?
בציטוזול
139
מה הוא גליקוגן?
חומר תשמורת סוכרי- פולימר שח יחידות חוזרניות של גלוקוז
140
מה היתרון שלאגור גליקוגן ולא מונומרים של סוכר?
המונומרים של הגלוקוז גורמים ללחץ אוסומוטי גבוהה לעומת גליקוגן
141
באילו איברים יש גליקוגן ? ובאיזה איבר הוא תופס הכי הרבה מקום?
שריר וכבד כליה ומוח בכבד
142
איפה נמצא הגליקגן כשהוא בתוך איבר מסוים?
הוא נמצא בתוך גרנולות ויש שם גם את האינזימים שבונים ומפרקים את הגליקוגן
143
מה הוא האלמנט הבסיסי שמרכיב את הגליקוגן?
חלקיק בטא הוא 21 נ"מ ו-55 אלף יחידות של גלוקוז
144
מה זה אלפא רוזטה?
20-40 חלקיקי בטא של הגליקוגן וניתן לראות אותה במיקרוסקופ- נראית כמו פרח
145
למה משמש הגליקוגן?
1. למקור זמין באנרגיה בתנאים אירוביים ואן אירוביים 2. הגליקוגן של השריר משמש את השריר לצורך פעילות המיידית במקרה של פעילות אקסטנסיהבית מלאי הגליקוגן בשריר יכול להיעלם תוך שעה אחת 3. הגליקוגן של הכבד יכול לספק גם את הרקמות האחרות בעיקר את המוח והמלאי שלו יכול להיגמר בין 12-24 שעות
146
מה הוא מבנה הגליקוגן?
הגליקוגן בנוי מיחידות חוזרניות של גלוקוז בקשר של אלפא 1-4 שרשראות באורך של 12-14 סוכרים אחת לכמה יחידות יש קשרים של אלפא 1-6
147
למה מחוברת שרשרת הסוכרים הראשונה בגליקוגן?
לחלבון מרכזי בליבת הגליקוגן שנקרא גליקוגנין- בקשר קוולנטי
148
מה יש בפריפריה של הגליקוגן?
קצוות לא מחזרים
149
מי הוא האיניזים הראשון שמשתתף בקטאבוליזם של הגליקוגן? ומה הוא עושה?
גליקוגן פוספורילאז תפקידו הוא לשים זרחן אי-אורגני על פחמן מספר 1 של הסוכר הראשון בשרשרת, כל שהקשר הגליקוזידי אלפא 1-4 נשבר, ויש הידרוקסיל על הסוכר אחריו. הוא עושה זאת עד שנותרו 4 סוכרים להסתעפות התוצר הוא גלוקוז 6 פוספאט
150
מדוע כאשר מפרקים גליקוגן אין פשוט הידרוליזה? מדוע יש פוספוריליזה?
המטרה בפוספורוליזה היא לשמר את האנרגיה הנעוצה בקשר הפוספו אסתרי
151
איך קוראים לקו אינזים שמשתמש גליקוז פוספורילאז?
plp בי 6 בריאקציה שנקראת שיף בייס
152
מה הוא האינזים השני באקאטבוליזם של הגליקוגן ומה תפקידו? ואיזה עוד שם ניתן לתת לו?
de branching enzyme 1. הוא שובר קשר אלפא 1 4 ומעביר שלושה פחמנים לשרשרת הסמוכה עי יצירת קשר אלפא 1 4 2. אלפא 1 6 גליקוזיאז- שובר קשר אלפא 1 6 עי הידרוליזה ומשאיר גלוקוז אחד חופשי
153
מה יקרה לגלוקוז 1 פוספאט לאחר פירוק הגליקוגן בכבד?
1. יפגוש אינזים שנקרא פוספוגלוקומוטאז שיעביר את הפוספאט לפחמן מספר 6 2. יכנס לאי אר יפגוש את האינזים 6 פוספאטז שימיר אותו לגלוקוז חופשי 3. גלוקוז חופשי ייצא מהכבד ישירות לזרם הדם דרך טראנספורטר גלוט 2
154
מה יקרה לגלוקוז 1 פוספאט לאחר קטאטאבוליזם של גליקוגן בשריר?
לאחר שיש כבר את הזרחון- הגליקוליזה מניבה 3 איי טי פי, לעומת 2 בגליקוליזה רגילה
155
מה עושה גליקוג'נין? ומה שמו של האינזים? ומי הסובסטראט שלו?
מחסבר לעצמו שרשרת גליקוגן ראשונית כפריימר ומייצר קשרי אלפא 1-4 udp-גלוקוז גליקוזיל טראנספראז
156
מה הוא תהליך תחילת סינטזת של הגליקוגן?
1. גלוקוז עובר זרחון על פחמן מספר 6 בתוך התא (הקסוקינאז) 2. האינזים פוספוגלוקומוטאז מעביר את הזרחון על פחמן פספר 1 3. ואז מתבצע זרחון לנוקליאוטיד וכך מקבל הסובסטראט יו די פי גלוקוז
157
מה עושה הגליקוג'נין?
לגליקוגנין יש שייר של טירוזין, ההידרוקסיל לש הטירוזין נקשר לגלוקוז, וזה נקרא גליקוזיל טראנספראז, האנרגיה ליצירת הקשר זה מפירוק הנוקלאוטיד. הריאקציה מתבצעת שוב ושוב, עד שיש 8 יחידות של גלוקוז
158
מה עושה גליקוגן סינטאז? איזה סוג אינזים הוא? איזה סוג קשרים הוא יודע לייצר?
גליקוגן סינטאז הוא אינזים מסוג טראנספראז, הוא מעביר את הגלוקוז מיו די פי גלוקוז אל פחמן מספר 4 של השרשרת הקיימת האנרגיה לקשר היא עי שבירת הקשר עם יו די פי סוג הקשר הוא אלפא 1-4
159
מה שמו השני של הבראנשינג אינזים? ומה הוא עושה בתהליך בניית הגליקוגן?
1. שובר קשר אלפא 1-4 שעשה גליקוגן סינטאז 2. בונה קשר של אלפא 1-6
160
איזה סוג של סוכר זה יו די פי גלוקוז?
סוכר-נוקלואידס
161
למה משמשים סוכרים נוקליאוטידים?
1. לגליקוגן 2. אוליגוסכרידים 3. פוליסכרידים 4. אמינוסכרידים 5. ויטמינים
162
מדוע סוכרים נוקלואוטידים תורמים לביוסינטזה של מולקולה מסוימת?
1. יצירתם היא בלתי הפיכה מאחר וביצירה משתחרר פירו=פוספאט, שמתפרק בהידרוליזה עי פירופוספאטז, בעל דלתא גי נמוך מה גורם לתגובה הראשונה ללכת לכיוון התוצרים 2. הנוקליאוטיד גדול וגורם לאנרגיית קישור של האינזים 3. קבוצות נוקליאטידיות משמשות כקבוצה עוזבת טובה מה שמאפשר התקפה נוקליאופיית 4. סימום הסוכרים עי נוקליאוטיד מסוים גורם להפרדה יותר יעילה בין תהליכים שונים שסוכרים משתתפים בהם
163
איך מתרחש תהליך הסימון של גלוקוז? ואיך קוראים לאינזים שעושה זאו?
אחר שנכנס לתא, גלוקוז עובר זרחון על פחמן 6 בתיווך האנזים הקסוקינאז. האנזים פוספו-גלוקו-מוטאז מעביר את הפוספאט לפחמן 1. כעת מתבצע צימוד לנוקלאוטיד, על ידי האנזים יו די פי גלוקוז פוספורילאז אשר מזרז התקפה נוקלאופילית של ההידרוקסיל על הפוספאט שמחובר לפחמן מס' 1 בסוכר על פוספאט אלפא של הנוקלאוטידיו טי פי. התוצר הוא גלוקוז הקשור דרך פחמן מס' 1 לפוספאט (שהגיע מהזרחון של הקסוקינאז) שמחובר לפוספאט אלפא של הנוקלאוטיד – מכאן שיש 2 פוספאטים, האחד מקורו בסוכר והשני מקורו בנוקלאוטיד. את הפירו-פוספאט המורכב מפוספאטים בטא וגמא נפרק בתיווך האנזים פירו-פוספטאז.
164
איזה סוג של אינזים זה גליקוגן פוספורילאז? אילו שני איזו אינזימים יש לו? ובאילו שני מצבים הוא יכול להיות?
הוא דימר אחד בכבד ואחד בשריר A- פעיל B- לא פעיל
165
166
מה היא הבקרה ההורמונאלית של הפוספורילאז בשריר?
מאמץ-\>אפינפרין מבלוטת יותרת הכליה-\> מתחבר לג'י פי סי ארים-\> מפעיל את פי קיי איי-\> מזרחן את פוספורילאז קינאז בי-\> מזרחן את פוספרילאז בי-\> הופך אותו למצב פעיל איי כל הזרחונים מתבצעים על שייר סרין כאשר נגמר המאמץ, אינזים בשם פוספורילאז איי פוספאטאז-\> מזרחן את פוספורילאז איי
167
מה מבקר את הפוספורליאז קינאז בי בשריר בצורה אלוסטרית?
סידן - נקשר בצורה אלוסטרית לתת יחידה דלתא של פוספורליאז קינאז בי שמסמן סוג של סמן לכיווץ שרירים גם איי אם פי משפעל אותו בצורה אלוסטרית כאשא יש הרבה איי טי פי הוא חוסם את המקום לאיי אם פי וככה אין מי שישפעל אותו
168
מה היא הבקרה ההורמונאלית של הפוספורילאז בכבד?
גלוקגון -\> גי פי סי ארים-\> ציקליק איי אמ פי-\> פי קיי איי-\> זרחון על שייר סרין של פוספורילאז בי קינאז-\> זרחון על שייר סרין של פוספורילאז הפיכה ל-איי אינסולין-\> פי פי איי -\> הוצאת סרחון של פוספורילאז הפיכה ל-בי
169
מה היא הבקרה האלוסטרית של הפוספורילאז בכבד?
הבקרה האלוסטרית גלוקוז נקשר לפוספורילאז איי-\> מראה את שייר הסרין לפי פי 1-\> יש הוצא זרחן כך גם האינזים משמש כסנסור לגלוקוז
170
האם פוספורילאז הוא טראנספראז?
לא הוא לא טראנספראז כי הוא לא משתמש באיי טי פי, הוא משתמש בפוספאט אי אורגני
171
מה קורה כאשר מזרחנים את שייר הסרין בפוספורילאז?
סרין נמצא בסביבה שהיא טעונה שלילית ויש כם כמה חומצות אמינו בעלות מטען חשמלי חיובי, כאשר מזרחנים את הסרין המטען החשמלי השלילי גדל ולכן החומצות האמינו צריכות מקום אחר ללכת אליו והם ילכו לאתר אחר שמכיל שיירי ארגינים וזה מה שמוביל לפעילות של פוספורילאז
172
אילו שני מצבים יש לגליקוגן סינטאז?
גליקוגן סינטאז איי- מצב פעיל שאיננו מזורחן גליקוגן סינטאז בי- מצב איננו פעיל ומזורחן או עם גלוקוז 6 פוספאט באתר האלוסטרי שלו
173
למה צריך הסתעפויות בגליקוגן?
כי ברגע שיש הסתעפויות אז אפשר לנצל יותר גלוקוז
174
מכמה יחידות בנוי גליקוגן סינטאז?
2
175
איפה גליקוגן סינטאז יכול להיות מזורחן? וכמה קינאזות יכולות לעשות את זה?
גם בשיירי סרין כמו גליקוגן פוספאטאז 11 קינאזות שונות
176
מה השם של הקינאזה הכי חשובה שמזרחנת את גליקוגן סינטז?
גליקוגן סינטזאז קינאז 3
177
איפה גליקוגן סינטאז קינאז 3 מזרחן את גליקוגן סינטאז?
שיירי סרין- סמוך לקצה הקרבוקסילי
178
מה צריך לקרות כדי שגליקוגן סינטאז קינאז יזרחן את גליקוגן סינטאז?
קאזאין קינאז 2 צריך לזרחן אותו קודם
179
מה גורם לדיכוי גליקוגן סינטאז קינאז?
רמות גבוהות של אינסולין
180
למה רמות גבוהות של אינסולין גורמות לדיכוי של GSK 3?
האנזים GSK3 מדוכא על ידי זרחון הנגרם על ידי האנזים PKB. האנזים PKB כשלעצמו משופעל על ידי קסקדת PI3K המושרית על ידי ההורמון אינסולין.
181
בכבד מי מוציא את הזרחון שלעל גליקוגן סינטאז?
pp1 שמשופעל על אינסולין
182
מה קורה לגליקוגן סינטאז כאש מצטבא בתא גלוקוז 6 פוספאט
גלוקוז 6 פוספאט נקשר לאתר אלוסטרי של גליקוגן סינטאז ומשרה שינוי מרחבי על הסרת הזרחן עי ה pp1 ולכן האינזים הוא גם סנסור לגלוקוז
183
לאילו שלושה אינזימים pp1 מוציא זרחון?
פוספורילאז קינאז פוספורילאז גליקוגן סינתאז
184
לאן pp1 מחובר? למה ? עי מה הוא משופעל אלוסטרית ועי מה הוא משופעל קוולנטית
glycogen-targeting proteins, משפחה זו מומחית בהכוונה של חלבונים ואנזימים לגליקוגן על ידי כך שהם קושרים את הגליקוגן מצד אחד ואת האנזימים מהצד השני. משפחה זו גם קושרת את כל שלושת האנזימים הנ"ל מהם PP1 מסיר זרחן. האנזים PP1 בעצמו מבוקר אלוסטרית (משופעל ידי קישור גלוקוז) וקוולנטית (זרחון של PKA מדכא את פעילותו).
185
איך האינסולים גורם לזרחון של גלוקוז סינטאז קינאז?
אינסולין כאמור גורם להפעלת קסקדת PI3K שמשפעלת את PKB ובהמשך מזורחן GSK3 – מה שמונע ממנו לזרחן את גליקוגן סינתאז.
186
מתי גליקוגן סינטאז קינאז 3 עובד ?
כאשר איננו מזורחן וכאשר גליקוגן סינטאז יש לו פוספאט על סרין +4 בגלל שבאתר קישושר של גליקוגן סינטאז קינאז 3 יש ח"א חיוביות ולכן רק במצב זה הוא יכול לזרחן את סרין 0, -4,-8 של גליקוגן סינטאז
187
מה קורה כאשר pkb מזרחן את גת גליקוגן סינטאז קינאז 3 ?
מצב שנקרא פסואודו סובסטראט שבוגליקוגן סינטאז קינאז3 מזהה את הזרחון של עצמו ולא של הסובסטראט של עצמו
188
מה עושה האינזים GSK3 חוץ מפעילות בקרת הגליקוגן?
1. תווך סיגנאלים של אינסולין 2. מתווך ספציאציה והתמיינות
189
האם יש לגליקוגן סינטאז קינאזות שמעכבות יותר מאחרים?
יש לגליקוגן סינטאז קינאזות שמעכבות יותר,
190
מה יותר עושהאינאקטיביציה קזאין קינאז 1 או 2 לגליקוגן סינטאז
קינאז 2
191
מחלות לאגירת גליקוגן type 0 type 1a type 1b type 1c
192
מחלות לאגירת גליקוגן type 2 type 3 a type 3 b type 4
193
מחלות לאגירת גליקוגן type 5 6 7 6B 8 9
194
מחלות אגירת גליקוגן type 11
195
איפה נוצר הגלוקוז?
ב-er
196
מי הכי צריך להשתמש בגלוקוניאוגנזה?
המוח
197
למה הצמחים משתמשים בגלוקוניאוגנזה?
די סכרידים גלוקופרוטאינים
198
אילו תאים צריכים את הגלוקוז בגלוקוניאוגנזה?
המוח ומערכת העצבים אריתרוציטים אשכים מדולת האדרנל רקמות העוברית
199
איפה מתרחש תהליך הגלוקוניאוגנזה?
בעיקר בכבד קורטקס הכליה תאי אפיתל של מערכת העיכול (זניח)
200
אילו מולקולות קלאסיות של שלושה פחמנים יכולות להיות פרוקורסורים לגלוקוז?
פירובאט לקטאט (המגיע לכבד לאחר פעילות מואמצת) – כחלק ממעגל קורי עליו נרחיב בהמשך גליצרול אלנין
201
אילו מולקולות של ארבעה פחממנים יכולות להיות פרוקורסרים טובים לגלוקוז?
אוקסלו-אצטאט אספרטאט
202
מה הבעיה בגלוקוניאוגנזה?
שיש שלוש ריאקציות שהן אינן הפיכות ; הקסוקינאז Pfk1 pyruvate kinase
203
מה הוא המעקף הראשון בגלוקוניאוגנזה ? מה הוא המעקף השני בגלוקוניאוגנזה? מה הוא המעקף השלישי בגלוקוניאוגנזה?
מעקף ראשון – יעסוק בהמרת פירובאט ל PEP מעקף שני – יעסוק בהמרת F1,6BP ל F6P מעקף שלישי – יעסוק בהמרת G6P לגלוקוז חופשי
204
לתאר את מעקף של ריאקציה מספר 10 אם הפרוקורסור שלי הוא פירוואט?
1. פירוואט נכנס למטריקס בטרנספורטר 2. פירוואט קרבוקסילאז צריך ביוטין- בי 7, ואיי טי פי על מנת להפוך לאוקסלואצטט 3. אוקסאלו אצטט עי מאלאט דה הידרוגנאז הופך למאלט 4. מאלאט יוצא עם טרנספורטר מהתא 5. מאלאט הופך לאוקסאלואצטט עי מאלאט דה הידרוגנאז 6. אוקסלו אצטט הופך עי פפסי קיי ו-ג'י טי פי לפוספואנול פירוואט (ומגנזיום)
205
לתאר את מעקף מספר 10 כאשר מדובר בלקטט
הלקטט שמגיע מהשרירים מגיע לציטוזול של הכבד דרך מעגל קורי הופך לפירוואט דרך לקטט דה הידרוגנאז ועל הדרך זורק nadh לאחר מכן נכנס הפירוואט נכנס למיטוכונדריה הופך אוקסלואצטט עי פירוואט קרבוקסילאז (יחד עם ביוטין ואיי טי פי הופך לאיי די פי) אוקסאלו אצטט הופל עי פפסי קיי מיטוכונדריאלי וג'י טי פי לפוספואונול פירוואט שיוצא מהמיטוכונדריה והולך לציטוזול
206
מה משפעל מבחינה אלוטרית את פירוואט קרבוקסילאז?
אצטיל קו איי
207
למה זה חשוב שבמעקף מספר 10 ישתחרר Nadh
כדי להפחית את הריאקציה של גליראלדהיד דה הירוגנאז
208
למה ה- delta g של מעקף מספר 10 מאוד קרוב ל-0?
בגלל שהפכנו פירוואט לטאוטומר מאוד לא יציב אבל התנאים פיסיולוגיים התגובה היא פחות מ-0
209
פירוואט קרבוקסילאט למה הוא קשור? במה הוא משתמש כמקור פחמן? ובמה הוא משתמש כמקור אנרגיה? ואיך מתרשת התגובה?
ליזין קשור לפירוואט קרבוקסילאז HCO3 ATP קישור של ביוטין לקרבוקסיל. הקישור הוא תמיד דרך חנקן בביוטין ודורש ATP טראנס-קרבוקסילציה – העברת הקרבוקסיל מהביוטין אל מולקולת המטרה
210
מה הוא מעקף מספר 2 בגלוניאוגנזה? במה האינזים הנ"ל משתמש? והאם זו ריאקציה הפוכה? אם לא אז למה?
לצורך המרה של F1,6BP ל F6P עלינו להשתמש באנזים F1,6BPase-1 אשר מזרז הידרוליזה בלתי הפיכה של F1,6BP ל פרוקטוז 6 פוספאט ופוסאט אינאורגני. אנזים זה משתמש ביון מגנזיום כקופטור עבור פעילותו/ שימו לב שזו לא הריאקציה ההפוכה לריאקציה אותה מזרז PFK1 מאחר והפוספאט איננו מוחזר ל ADP, אלא פשוט עובר הידורליזה והופך להיות פוספאט אינאורגני חופשי בתמיסה.
211
מה הוא מעקף מספר 3 בגלוקוניאוגנזה? מי מבצע את המעקף? איפה ? ומה הוא דורש להפעלתו? מה הוא המסלול שעוש הגלוקוז?
g6p צריך להוריד את הפוספאט באי אר החלק איפה לכיוון האברון יש גלוקוז 6 פוספאטז מגנזיון גלוקוז 6 פוספאט-\> טי 1 מכניס אותו לאי אר-\> גלוקוז 6 פוספטטז עושה עליו פעילות-\> טי 2 מוציא אותו מהאי אר-\> הגלוקוז יוצא דרך גלוט 2-\>הפוספאט האי אורגאני יוצא דרך טרנספורוספרטר 3
212
כמה אנרגיה יש להשקיע אם רוצים לקבל מולקולת גלוקוז מלאה?
בשביל לקבל 2 פוספואנול פירוואט: 2 איי טי פי ו-2 גי טי פי בשביל לקבל 2: 1,3 פוספוגליצראט יש להשקיע עוד 2 איי טי פי בפוספוגליצראט קינאז בשביל לקבל 2 גליצראלדהיד יש להשקיע 2 nadh מכאן שסך הכל יש לשהשקיע: 6 atp 2 Nadh
213
באיזה מעגל ניתן להמיר אצטאט לגלוקוז?
גליקוסילאט
214
מה מדכא פירוואט קרבוקסילאז?
adp
215
מה מדכא Pepck?
adp
216
מה משפעל את f16 pase? ומה מדכא?
1. ציטראט amp f2,6 bp
217
מה הבקרה ההורמונאלית על הגלוקוניאוגנזה?
אינסולין אינסולין-\> מפעיל pkb שמזרחן את פוקסו. כאשר פוקסו מזורחן הוא במצב בלא פעיל כאשר הוא במצב הפעיל הוא קשור להפעל גנים שקשורים לגלוקוניאוגנזה
218
מה משבית את Pdh בזמן הגלוקוניאוגנזה
pka
219
האם תאי כבד יכולים ליצור ולפרק גלוקוז בו"ז?
כן
220
איזה מולקולה יחיה בעלת דני פחממנים יכולה ליצור גלוקוז?
גליצין
221
מה הוא מסלול הפנטוזות?
הדרך שבה מייצרים אצלנו בתאים מסוג פנטוזות כמו ריבוז
222
אילו תאים צריכים את מעגל הפנטוזות?
- תאים המתחלקים במהירות כמו תאי מח עצם - תאי עור - תאי רירית המעי - תאי סרטניים
223
איך מסלול הפוספופנתוזות קשור לרדיקלים חופשיים?
הוא יוצר את ה-nadph שיודע להתמודד עם רדיקלים חופשיים
224
אילו רקמות יצטרכו אספקה גבוהה של nadph?
1. מי שעוסק בביוסינתזה חומצת שומן 2. או מי שמתעסק בכולסטרול 3. אריתרוציטים
225
למה מסלול הפוספופסנתוזות מתחלק?
למסלול המחמצן ולמסלול הבלתי מחמצן
226
לתאר את הפוספופנתואוזות השלב המחמצן?
1. גלוקוז 6 פוספאט על ידי g6pd הופך לפוספוגלוטולקטון 2. פוספוגלוטולקטון הופך על ידי לקטונאז ומים ל-6 פסופוגלוקונולאט 3. 6 פוספוגלוקונאט הופך עי 6 פוספוגולונאט הידורגנאז לריבולוז 5 פוספאט 4. ריבולוז 5 פוספאט הופך עי ריבולוז 5 פוספאט איזומט לריבוז 5 פוספא6 כולם נעזרים במגנזיןם מלבד איזומראז
227
עי מי האינזים g6pd מעוכב?
nadph-תוצר
228
האם השלב המחמצן בפוספופנתוזות הוא שלב הפיך?
לא
229
איפה הגן של האינזים g6pd נמצא?
על כרומוזום איקס
230
מה יקרה לאנשים שיש להם מחסור ב- g6pd?
תהיה להם בעיה עם רדיקלים חופשיים בתאי דם האדומים תהיה פירוקסידציה של ליפידים ופירוק ממברנות . זה יכול להוביל לעמידות נגד מלריה ויש את זה ל-25 אחוז מהאוכלוסיה באפריקה
231
מה יכול להכניס תאים לסטרס חמצני ?
תרופות נגד מלריה (המנגנון שלהן הוא ביצירת סטרס חמצני בכדוריות הדם ולכן בשילוב עם G6PD פגום, מדובר בתגובה חזקה מידי שפוגעת בתאים) פול – מזון המכיל חומרים מעוררי נזק חמצני מוצרי סולפה (אנטיביוטיקות מסויימות) מתילן-בלו.
232
למה קוראים למעגל הפוספופנתוזות מעגל?
אם נכניס לשלב זה 6 סוכרים בעלי 5 פחמנים, בעזרת 2 משפחות של אנזימים טראנס-קטולאז וטראנס-אלדולאז נוכל ליצר 5 סוכרים של 6 פחמנים – ובעצם לייצר גלוקוז. השלב הלא מחמצן יכול לייצר גם סוכרים בעליי ארבעה או 7 פחממנים
233
האם השלב הלא מחמצן יכול ליצור Nadph?
לא
234
האם הריאקציות בשלב הלא מחמצן הן ריאקציות הפיכות?
הן הפיכות
235
מה התפקיד של טראנס קאטולאז+ 2 דוגמאות ומה הוא צריך
זהו אנזים המזרז מספר ריאקציות בשלב הלא מחמצן של מעגל הפנטוזות המזרז העברה של קבוצה דו פחמנית מקטוז לאלדוז. האנזים מנצל את קו האנזים TPP לצורך פעילותו.
236
תסמונת Wernicke-Korsako ומתי היא חמורה
זהו סינדרום הנגרם בשל מחסור חריף בתיאמין, מרכיב חשוב ביצירת טי פי פי . הסינדרום נפוץ מאוד בקרב אלכוהוליסטים מאחר וצריכת אלכוהול מפחית את הספיגה של תיאמין (ושל שאר ויטמיני בי). מאחר ואין לבני אדם מאגרי תיאין ארוכי טווח (בניגוד לויטמיניבי אחרים). הסינדרום כולל סימפטומים, המצויים בהחרפה, וכוללים אובדן זכרון חמור, בלבול חריף ושיתוק חלקי (מאד דומה לדימנציה). הסינדרום מחריף כאשר קיימת מוטציה גנטית בטראנסקטולאז, מוטציה המפחיתה את האפיניות של האנזים ל-טי פי פפי פי 10 פחות. במצב כזה אפילו מחסור קל בתיאמין יוביל לסימפטומים חריפים של המחלה.
237
טראנס אלדולאז תפקיד?
הו אנזים המזרז את הריאקציה הדומה לריאקציית אלדולאז של הגליקוליזה ובה מועברת קבוצה תלת פחמנית (המזכירה די-הידרוקסי-אצטון) מהסוכר סדו-הפטולוז אל גליצר אלדהיד 3 פוספאט. מתקבל סוכר 4 פחמני ארטירוז וסוכר 6 פחמני -פרוקטוז 6 פוספאט.
238
איזה סוג של אינטראקציה עושה טראנס אלדולאז?
שיף בייס
239
מה הם היחסים בין קסילוז לריבולוז?
הם אפימרים
240
מה התקפיד הבקרתי של קסילוז?
הוא משפעל אינזים שנקרא pp2a הוא מסיר את הזרחון מאינזים טאנדם ככה ש- pfk2 יוכל לעבוד ויהיה עדיפות לגליקוליזה ולא לגלוקוניאוגנזה
241
מתי מעגל הפנטוזות פעיל?
מעגל הפנטוזות פעיל בנוכחות אינסולין
242
מה משמש לביוסינטזה של חומצות שומן?
אצטיל קו A
243
מה מכיל האתר הקטליטי של האינזים pp2a?
שני יוני מנגן
244
כמה יח רגולטריות יש לאינזים pp2a? ומה הן עושות
2 והן מאפשרות לו לזהות חומרים שונים שיש עליהם פוספאט