MOLECULAR BIOLOGY 1

Question 1

כיצד ראו את הכרומוזומים בפעם הראשונה?

Answer 1

על ידי מיקרוסקופ אור

Question 2

מה חשבו על ה-די אן איי ?

שיש לו תפקיד מבני או תפקיד תורשתי?

Answer 2

תפקיד מבני

Question 3

איזה ניסוי מראה כי ה-

dna

יכול לעבור בצורה תרשתית?

Answer 3

לקחו תאים של זן s

ותאים של זן

r

זן s

גורם לדלקת ריאות

שמו את התאים יחדיו והרגו את התכולה של התאים בזן

r

הם ראו שעבר בדיפוזיה החלק של זן s

Question 4

כיצד קוראים לנוק’

של הדי אן איי?

Answer 4

אדנוזין, סיטידין, גואניזין וטימין.

Question 5

איך כל שרשרת של

dna

נעמדת אחת מול השנייה?

Answer 5

באופן שהוא אנטי פרארללי

Question 6

אילו קשרים מתקיימים בין הנוקליאוטידים

ב-dna?

Answer 6

קשרי מימן

Question 7

ממה מורכב כל נוק’?

Answer 7

סוכר 5 פחמני מסוג ריבוז, הנסגר לרוב למבנה של פוראנוז.

פוספאט אחד לפחות – המתחבר לרוב לפחמן מס’ 5 של הריבוז בקשר פוספואסטרי. היזכרו בתוצר השלב המחמצן של מעגל בפנטוזות – הרי מדובר בריבוז 5 פוספאט. במידה ויש יותר מפוספאט אחד הם יתחברו אחד לשני בקשר פוספואנהידרידי.

בסיס חנקתי – מבנה טבעתי-ארומטי המכיל 6 או 9 מרכיבי טבעת כאשר חלק ממרכיבי הטבעת הם חנקנים.

Question 8

מה הוא הוא הבסיס החנקני של

אדנזין

סיטידין

גואניזין

טימידין

Answer 8

אדנין הוא הבסיס החנקתי של הנוקלאוטיד אדנוזין.

ציטוזין הוא הבסיס החנקתי של הנוקלאוטיד סיטידין.

גואנין הוא הבסיס החנקתי על הנוקלאוטיד גואניזין.

טימין הוא הבסיס החנקתי של הנוקלאוטיד טימידין.

Question 9

למה מתחלקים הבסיסים החנקתיים?

Answer 9

פירימידינים

פורינים

פירמידינים בעל6 מרכיבי טבעת

פורינים בעל 9

Question 10

מה הם הפורינים?

Answer 10

A

G

(Iׁׁ(RNA

Question 11

מה הם הפירימידינים?

Answer 11

c,t,u

Question 12

איך מחברים בין הנוקלואיטידים?

Answer 12

בקשר שהוא פוסופדיאסתרי.

ההידרוקסיל על פחמן מספר 3 שבריבוז מתצה התקפה נוקליאופילית על פוספט אלפא, כך שהקשר הפוספואנהידרידי בין פחמן אלפא לבטא מתנתק .

הפופאט מחבר בין שני פחמנים, בין פחמן מספר 5 ל(הפחמן שממנו היא מגיעה) לבין פחמן מספר 3

Question 13

לאן פונים הבסיסים החנקתיים בהליקס?

ואיך הם נקשרים?

Answer 13

לתוך ההליקס

בקשרי מימן

פורין תמיד יקשר לפורימידין

Question 14

עם מי A

יוצר קשרי מימן?

וכמה?

Answer 14

a

יצור עם T

קשרי מימן 2

Question 15

עם מי C

יצור קשרי מימן וכמה?

Answer 15

c

יצור עם g

קשרי מימן

ו-3

Question 16

כיצד הורשה יכולה להיות מוסברת באמצעים כימיים?

Answer 16

עצם הבנה שהדנ”א מורכב מיחידות – אבני בניין שונות המסודרות באופן שונה לאורכה של המולקולה, מאפשר רישום של קוד בעל 4 אותיות, כאשר קודים שונים נבדלים לא רק באורך הרצף, אלא בסדר הבסיסים בתוך הרצף.

Question 17

כיצד מתבצעת הכפלת המידע הגנטי?

Answer 17

צם ההבנה שהדנ”א מורכב מ-2 שרשראות המתיישבות אחת על השנייה בהתאמה מושלמת – G ל C ו A ל T, מאפשר לכל גדיל לשמש כתבנית לבנייה של הגדיל השני בדיוק גבוה.

Question 18

כמה בסיסים יש בסיבוב סליל אחד ב-

dna?

Answer 18

10.4

Question 19

מה ההבדל בין

dna

ל-

rna

Answer 19

לדי אן איי יש בריבוז בפחמן מספר 2 -

h

ואין ל-rna

יש הידרוקסיל

לכן dna

נקרא

de deoxy

Question 20

עם איזה אנרגיה יש פולימריזציה של dna?

Answer 20

עם האנרגיה שמתחררת מיציאה של פחמן בטא וגאמא

Question 21

איפה יש פחמן 5 חופשי ואיפה יש פחמן 3 חופשי?

Answer 21

פחמן חמש חופשי בנוקליאוטיד הראשון

פחמן 3 חופשי בנוקליאוטיד האחרון

Question 22

למה ה-

dna

הוא לא יציב ומה יכול לייצב אותו?

Answer 22

כי יש לופוספאים

לכן הורדה ב-Ph

תייצב אותו

או מלח שימסך את המטענים

Question 23

איזה חלק הוא הידרופובי ב

די אן איי?

Answer 23

המישור של הבסיסים החנקתיים

Question 24

אילו שתי תעלות יוצר ה-די אן איי ?

ומה תפקידם?

Answer 24

תעלה גדולה - תפקידה: שיקשרו לשם חלבונים שיזהו את הבסיסים

תעלה קטנה : בדרך כלל נקשרים לשם הקסונים

Question 25

איפה ה-די אן איי היוקריוטי ארוז?

Answer 25

במבנה הקרוי כרומוזום

Question 26

מה הקוטר של מולקולת די אן איי?

Answer 26

2 ננו מטר

Question 27

מה יש בתוך הכרומוזום?

Answer 27

dna וחלבונים שמסייעים בקיפול, ססקרת הגנים, ובתיקון

Question 28

איפה נמצאים הכרומוזומים של התא היוקריוטי?

Answer 28

בגרעין

Question 29

איפה נמצאים הכרומוזומים בחיידקים?

Answer 29

אין לחיידקים גרעים ולהם הכרומוזומים שוחים להם חופשי כמו בת הים הקטנה

Question 30

מכמה מולקולות בנוי הכרומוזום החיידקי ובאיזה מבנה?

Answer 30

לרוב זה ממולקולה אחת ובצורה מעגלית

Question 31

כמה עותקים יש לגרעין יוקריוטי מכל כרומוזום? וכיצד עותקים הללו נקראים?

Answer 31

2 כרומוזים הומולגים

Question 32

איזה זוג של כרומוזומים הוא איננו הומולוגים ואיפה הם נמצאים?

Answer 32

איקס ווואי והוא נמצא אצל זכרים חולייתנים

Question 33

כמה זוגות של כרומוזומים הומולוגים יש לבני אדם?

Answer 33

23 זוגות מתוכם 22 זוגות של כרומוזומים הומולגים ועוד זוג אחד שהוא כרומוזומי מין

Question 34

איך נקרא מתאר הכרומוזומים של תא, כאשר הם מאורגנים ומיושרים

Answer 34

קריוטיפ

Question 35

dna hybridization ומתי זה מבוצע? ואיך זה עוד נקרא?

Answer 35

שיטה שבה צובעים את כל הכרומוזים בצבע מסוים עפי רצפים קצרים ב- dna שמחוברים לצבע פורסנטי ומכונים Probes זה מבוצע בשלב המיטוזה spectral karyotype

Question 36

traditinal karyotype מתי זה מבוצע? איך צובעים בה את הכורמוזמים?

Answer 36

שיטה giemsa וזה מבוצע בשלבי המיטוזה המוקדמים בהם הכרומוזומים לא דחוסים עדך הסוף זה חושף דפוס של פסים שנראה במיקרוסקופ אור שמשקף הבדלין בין הכרומטין אך מקור ההבדל לא ברור

Question 37

מה ניתן להבחין בשיטות הצביעה שונות?

Answer 37

בשיטות אלו ניתן להבחין בשינויים כרומוזומאליים מאג'וריים כמו טראנסלוקציות, מחיקות, אנ-אאופלואידיות וכדומה, המורשות לעוברים וגורמים למחלות קשות, כמו גם נגרמות או נוצרות במהלך החיים של אדם ומובילות לסרטן.

Question 38

האם כל גן מקודד לחלבון?

Answer 38

לא

Question 39

כיצד השתנה מבנה הגנום לאורך האבולוציה?

Answer 39

מספר גנים ומרווח בין הגנים

Question 40

איך השתנה מספר הגנים לאורך האבולוציה?

Answer 40

לצורך העניין, לבקטריה ממוצעת יש בערך 500 גנים, לעומת כ- 30,000 בבני אדם (21,000 מקודדים לחלבון ועוד 9000 שאינם מקודדים לחלבון).

Question 41

איך השתנה המרווח בין הגנים לאורך האבולוציה?

Answer 41

אורגניזמים חד תאיים כמו ארכאה ובקטריה, אבל גם שמרים (שהם יוקריוטים פר הגדרה) מכילים צפיפות יחסית גבוהה של גנים, כלומר הגנים יושבים מאד קרוב אחד לשני. לעומת זאת אורגניזמים רב תאיים לרוב מכילים גנים בצפיפות נמוכה, עם הרבה "דנ"א-זבל" בין הגנים, שתפקידו אינו ברור עד היום.

Question 42

למי יש גנום יותר גדול לבני אדם או לדו חיים?

Answer 42

לדו חיים

Question 43

האם לאורגניזם שהוא בעל אותו מספר גנים הוא חייב להיות בעל אותו מספר כרומוזומים?

Answer 43

לא

Question 44

כמה אחוז מהגנום מקודד לחלבונים?

Answer 44

2 אחוזים

Question 45

ממה מורכב מחצית מהגנום האנושי?

Answer 45

מאלמנטים גנטיים ניידים אשר החדירו את עצמם לתוך הגנום במהלך האבולציה והם בעל יכולת ניידות "לקפוץ" החוצה ולשנות מיקום. אלו הם Transposable elements עליהם נרחיב בהמשך.

Question 46

מה הוא אורך ממוצע של גן ? מה הוא אורך ממוצע של חלבון ? מה זה אומר?

Answer 46

ורך ממוצע של גן הוא כ-27,000 בסיסים, וזה מפתיע בעיקר בגלל שאורך ממוצע של חלבון הוא 430 חומצות אמינו, מה שאומר שנזדקק לאורך של כ-1300 בסיסים על מנת לקודד לחלבון כזה.

Question 47

מדוע מרבית ה- dna בתוך הגן עצמו אינו משמש למידע ליצירת חלבון?

Answer 47

1.מרבית הנוקלאוטידים ברצף של גן הם רצפי אינטרונים אשר יחתכו החוצה לאחר שהמולקולה תשועתק לרצף RNA , בעוד שהחלקים שיישארו מכונים אקסונים. 2. לאינטרונים ואקסונים, הגנים מכילים גם רצפי בקרה החיונים להפעלה וכיבוי של הגנים בזמן הנכון. ביוקריוטים האזור הרגולטורי יכול להתפרש על פני עשרות אלפי נוקלאוטידים.

Question 48

כמה גנים מהגנום האנושי מקודדים ל- rna

Answer 48

9000

Question 50

מה הם פסאודוגנים? והאם הם מתבטאים ?

Answer 50

פסאודוגנים הם בעצם דופליקציות של גנים פונקציונאליים אשר הכפילו את עצמם ללא רצפי בקרה ועל כן אינם יכולים להתבטא.

Question 51

כמה זוגות בסיסים יש באדם?

Answer 51

3.2 זוגות בסיסי די אן איי

Question 52

human genome sequence

Answer 52

מתייחס לרצף של כל 23 זוגות הכרומוזומים וגם שרצף של הגנום המיטוכונדריאלי שאורכו כמעט 17,000 בסיסים.

Question 53

מה קורה בשלב האינטרםאזה במחזור התא?

Answer 53

החלק העיקרי והארוך ביותר של מחזור התא עוברת מולקולת הדנ"א רפליקציה. לאחר הרפליקציה, מתקבלות 2 מולקולות זהות הנקראות כרומטידות אחיות, הדבוקות אחת לשניה בחוזקה כדי שכל תא בת יקבל תא אחות

Question 54

מה מולקולות די אן שמתאגנת לכרומוזום חייבת להכיל?

Answer 54

מוצא שכפול – אתר/רצף שממנו מתחילים את מלאכת השכפול. יכול להיות אתר יחיד (למשל בחיידקים) או אתרים רבים (כמו בתאים יוקריוטים). צנטרומר – רצף דנ"א אליו יתחבר במיטוזה קומפלקס חלבוני בשם קינטוכור. תפקידו לדאוג שרק כרומטידות אחות אחת ויחידה תגיע לכל תא בת. כך למעשה הצנטרומר אחראי לביצוע הסגרגציה המדוייקת. בבני אדם הרצף הזה יכול להכיל עד למיליון נוקלאוטידים ולרוב חסר משמעות מבחינת הרצף, אלא בעיקר מכיל קומפלקסים של חומצות גרעין וחלבונים המורשים בעת הפרדת הכרומטידות. 2 טלומרים – שני רצפים חוזרניים המצויים בקצוות הכרומוזומים ואחראים לבקרה על תיקון שברים, זיהוי כרומוזומים ואף קריטיים למניעת התקצרות הכרומוזומים בכל מחזור חלוקה.

Question 55

מה הוא כרומטין?

Answer 55

די אן איי הארוז עם חלבונים

Question 56

האם מבנה הכרומטין והדי אן איי הן קבועים ?

Answer 56

לא

Question 57

איך אפשר לחלק את החלבונים בכרומטין?

Answer 57

היסטונים ולא היסטונים

Question 58

מה היא היחידה הקטנה ביותר שמרכיבה את הכרומטין? וכיצד היא נראית?

Answer 58

נוקליאוזום beads on string

Question 59

ממה מורכב כל נוקליאוזום?

Answer 59

ל נוקלאוזום מורכב מ4 סוגים של חלבונים הקרויים היסטונים (וליתר דיוק, היסטוני הליבה), כך שכל אחד מההיסטונים חוזר פעמיים במבנהו: H2a H2b H3 H4

Question 60

לאיזה מבנה מתארגנים ההיסטונים על הנוקליאוזום?

Answer 60

היסטוני הליבה מתארגנים למבנה של אוקטמר ומלפפים מעל עצמם 147 זוגות בסיסים של דנ"א, שהם 1.7 סיבובים – אלו הם בעצם ה"חרוזים" וזו ליבת הנוקלאוזום.

Question 61

מה יש בין ליבה אחת של נוקליאוזום לליבה אחרת של נוקליאוזום?

Answer 61

dna linker שבנוי מ-50 זוגות בסיסים

Question 62

מה כל נוקליאוזום כולל ?

Answer 62

147 בתוך החרוזים בליבה ו-50 בלינקר

Question 63

לאחר ההתרגנות בנוקליאוזום מהו המבנה של הדי אן איי

Answer 63

שליש מהמבנה המקורי שלי

Question 64

כמה החלבונים מהווים מהכרומוזום

Answer 64

שני שליש

Question 65

מכמה ח"א בנוי היסטון?

Answer 65

102-135

Question 66

איזה מוטיב יש להיסטון?

Answer 66

מוטיב ההיסטונים

Question 67

כיצד מתקפלים ההיסטונים?

Answer 67

H3 AND H4 יוצרים דימר בנפרד H2A AND H2B יוצרים דימר בנפרד לאחר מכן 2X H3 H4 יוצרות טטרמר שיתחיל לסלסל את עצמו על די אן איי ואז יצרף את H2A AND H2B

Question 68

כמה קשרי מימן יש בין הדי אן איי לליבה החלבונית ? בין מה למה יש קשרי מימן?

Answer 68

צורת הדיסק של האוקטמר יוצרת 142 קשרי מימן בין הדנ"א לליבה החלבונית, כמעט מחצית מקשר המימן הללו נעשים על ידי שלד החלבון – amino acid backbone , עם שדרת הפופסאט סוכר של הדנ"א. מעבר לכך אין ספור אינטרקציות הידרופוביות וקשרים אלקטרוסטטים של מטען חשמלי מייצבים את הדנ"א על הליבה החלבונית.

Question 69

מי הן החומצות האמיניות העיקריות על ההיסטונים? ולמה?

Answer 69

ליזין וארגינין כדי לייצב את המטען החשמלי שקיים על הדי אן איי

Question 70

איפה הזנבות האמיניים של ההיסטונים נמצאים? ולמה?

Answer 70

מחוץ לנוקליאוזום הזנבות בקצה האמיני הם אתר מרכזי לביצוע מודיפיקציות קוולנטיות המשפיעות על דגם הביטוי הגנטי

Question 71

אילו אינטראקציות יש בין ה dna לנוקליאוזום?

Answer 71

1. התעלה הקטנה שבהליקס של הדי אן איי יוצרת אינטראקציה עם הנוקליאוזום 2. יש רצפים מסוימים של די נוקליאוטידים שיוצרים קשר טוב יותר עם הנוקליאוזום כמו tt ta aa יעדיפו להיות בחלק הפונה אל הליבה ו- c and g בחלק החיצוני

Question 72

האם רצפי ח"א של ההיסטונים שמורים?

Answer 72

כן

Question 73

איך מסודרים ההיסטונים ואיך זה נקרא

Answer 73

לחיצת יד

Question 74

איך גורמים לשינויים בנוקליאוזום?

Answer 74

על ידי CRC כרומטין רימודנלינג קומפלקס

Question 75

במה ה- crc נעזר?

Answer 75

ATP

Question 76

כיצד קוראים לקומפלקס הבא?

Answer 76

crc

Question 77

מה האינזים crc כולל?

Answer 77

הוא כולל תת יחידה שמבצעת הידרוליזה ל- atp היחידה נקשרת ל-לליבת הנוקלאוזום ולדיאןאיי ובעזרת הידרוליזה אי טי פי היא מנתקת בין הנוקליאוזום לבין הדי אן איי

Question 78

Nucleosome sliding

Answer 78

מחזורים שבהם הקומפלקס CRC מרחיק את ליבת הנוקלאוזום מהדנ"א

Question 79

למה גורמת התזוזה של הנוקליאוזום מה- dna?

Answer 79

שעוד חלבונים יוכלו להיקשר ל- dna

Question 80

Histone Chaperones

Answer 80

מסייעים ל- crc ועוזרים בהרחקת הנוקליאוזום מה dna

Question 81

כל כמה זמן מוחלף נוקליאוזום בגרעים?

Answer 81

כל שעתיים בממוצע

Question 82

האם יש סוג אחד של CRC

Answer 82

לא ישנם כמה וכמה סוגים

Question 83

מה הדבר המשפיע ביותר על התארגנות די אן איי לנוקליאוזומים?

Answer 83

נוכחות של חלבונים מסוימים

Question 84

איך מאורגן מרבית הכרומטין? מה הקוטר שלו? ולמה הוא מאורגן ככה?

Answer 84

מרבית הכרומטין דווקא מאורגן למבנה של סיב בן 30 נ"מ בעל יחידות חוזרניות של טטרה-נוקלאוזום ## Footnote המתארגן בזכות מבנה זיג-זג של הנוקלאוזומים אחד על גבי השני. ההתארגנות של הנוקלאוזומים אחד על גבי השני נגרמת על ידי: זנבות ההיסטונים, בעיקר זה של H4. ההיסטון H1 שהוא חלבון נוסף ממשפחת ההיסטונים המצוי ביחס כמותי של 1:1 לליבת הנוקלאוזום.

Question 86

האם היסטון 1 הוא שמור?

Answer 86

לא היסטון 1 הוא לא שמור

Question 87

מה התפקיד של היסטון 1?

Answer 87

כל היסטון כזה יוצר אינטראקציה עם נוקלאוזום אחד, דרך הליבה החלבונית וגם דרך הדנ"א, כך שהוא משנה את כיוון הליפוף של הדנ"א לאחר שיוצא מהנוקלאוזום – מה שמסייע מאוד לדחיסה וליצירת מבנה הזיג-זג.

Question 88

האם מבני הכרומטין עוברים בתורשה?

Answer 88

נכון

Question 89

אם הורה מסוים עבר איזשהו מקרה שגרם לכרומטין שלו לשנות צורה יכול להיות שגם לצאצא יהיה את אותו הכומטין?

Answer 89

יכול להיות

Question 90

אילו שני סוגי כרומטין ישנם?

Answer 90

הטרוכרומטין – סיב כרומטין דחוס וקומפקטי מאוד. יוכרומטין – סיב כרומטין שאיננו דחוס כל כך, והרבה פחות קומפקטי.

Question 91

איפה ניתן למצוא הטרוכרומטין?

Answer 91

צנטרומרים, טלומרים,

Question 92

האם האזורים שבהם יש הטרוכרומטין משתנים?

Answer 92

כן הם משתנים בהתאים למצב שבו התא נמצא

Question 93

כמה גנים יש לדי אן איי בהטרוכרומטין?

Answer 93

מעט מאוד גנים

Question 94

מה הן התכונות של די אן איי הטרוכרומטרי?

Answer 94

תנגודת לביטוי גנים המצויים באזורים אלו.

Question 95

Position effect

Answer 95

מושג זה מתאר את התופעה בה דנ"א הטרוכרומטי "נדד" לאזור שהוא בהגדרתו יוכרומטי דבר היכול לגרום להשתקה או לכיבוי של אותם האיזורים

Question 96

Position effect varigation ואיזו תפועה ידועה קורית על פי זה?

Answer 96

כאשר תופעת ההטרכורמטין המתפשטת עוברת מתא אם לתא בת x inactivitaion

Question 97

מה זה הגן white בדרוזופילה? מה קורה כאשר יש באלל מוטציה ? מה קורה כאשר מגיע לשם הטרוכרומטין? למה זה נוצר?

Answer 97

גן שכאשר הוא תקין יש צבע אדם ואם יש בעיה באלל יש צבע לבן אם מגיע לשם הטרוכרומטין אז יש אדום עם נקודות לבנות כי ישנם תאים שונים בגוף וכאשר ההטרוכרומטין הגיע אליהם במהלך ההתפחות העוברית קיבלנו צבע לבן

Question 98

איזה מנגנון תומך ב- Positin effect varigation? איפה הם נעשים והאם יש עוד מנגנונים?

Answer 98

הוא מנגנון מודיפיקציות קוולנטיות שלאחר תרגום על גבי היסטוני הליבה: אצטילציה, מונו/בי/טרי-מתילציה על שיירי ליזין. פוספורילציה של שיירי סרין. מודיפיקציות אלו נעשות על פי רוב על גבי זנבותיהם של 8 היסטוני הליבה אשר הם לרוב "חסרי ארגון" מבני ויוצאים כלפי חוץ הנוקלאוזום. עם זאת קיימים לא פחות מ 20 מודיפיקציות שונות הנעשות על גבי הליבה הגלובולארית של הנוקלאוזום.

Question 100

האם המודיפיקציות שנעשות על גבי היסטוני הליבה ב- Position effect varigation הן הפיכות ואם כן מה המגנון שעושה אותן הפיכות?

Answer 100

histon acetyl transfrases הם אחראים על לשים אצטיל ואילו משפחת האנזימים האחראיים על הסרת האצטילציות על ההיסטונים נקראים HDAC – histon DeAcetylase Complex, או למשל מתילציות על ליזין יתבצעו על ידי מתיל-טראנספראזות ואילו דה-מתילציה על ידי דה-מתילאזות.

Question 101

מי אחראי על האינזימים שמבצעים מודיפיקציות על גבי ההיסטונים? ואיך הם עושים זאת? האם המודיפיקציות נשארות?

Answer 101

פאקטורי שיעתוק הם נקשרים הנקשרים לרצפים מסויימים בכרומוזום ובעצם קובעים מתי, באילו מצבים ועל אילו אזורים יהיו אילו מודיפיקציות. עם זאת חשוב לזכור כי המודיפיקציות לרוב נשארות הרבה אחרי שהרמה של אותו פקטור שעתוק בתא כבר ירדה, עובדה המסבירה את ה"זכרון" של התא, ולא רק זאת אלא גם לעבור הלאה לתאי הבת כחלק מתופעת ה Position effect varigatio

Question 102

מה עושה אציטילציה על ליזין בהיסטונים?

Answer 102

בכך מפחיתה את המטען החשמלי החיובי של אותו זנב - דבר שיגרום לירידה באפיניות של אותו זנב לנוקלאוזום הסמוך לו (כיוון שלהזכירכם הדנ"א טעון במטען שלילי). בנוסף, ברגע שעשינו אצטילציה על ליזין שכזו לא ניתן לבצע עליה מתילציה ללא הסרה קודמת של האצטיל.

Question 103

מה עושים מתילציות ספיציפיות על שייר ליזין בהיסטון H3?

Answer 103

מתילציות ספציפיות על שייר ליזין ספציפי על גבי ההיסטון H3 עושה למשל פעולה מעניינת אף יותר – היא גורמת לגיוס של חלבון בשם HP1 אשר תורם להופעה ולהתפשטות של ההטרוכרומטין.

Question 104

אילו תהליכים נוספים יכולים להתרחש על ליזיון בהיסטונים

Answer 104

כמו חיבור ביוטין, יוביקוויטין ומולקולת סומיל.

Question 105

אמה אפשר לחבר לחומצה גלוטמית בהיסטון?

Answer 105

לחומצה גלוטמית ניתן לחבר ADP בתהליך ריבוזילציה.

Question 106

האם ישנם רק ארבעה היסטונים?

Answer 106

ישנם עוד היסטונים אבל הם הרבה פחות שמורים, אבל הם הרבה פחות שמורים באבולוציה

Question 108

לאיזה היסטון אין ואריאנים ?

Answer 108

היסטו מספר 4

Question 109

באיזה שלב ההיסטונים המרכזיים נוצרים? ואיפה

Answer 109

בשלב ה- s ממש מאחורי מזלג השכפול

Question 110

באיזה שלב נוצרים ההיסטונים הוארינטים? ואיך ?

Answer 110

ההיסטונים מיוצרים לאורך האינטרפאזה ולרוב מוכנסים לתוך נוקלאוזומים קיימים בתהליך דורש אי טי פי המזורז על ידי סי אר סי ו היסטו צ'פרון ההכנסה של הוריאנטים נעשית לאזורים ספציפיים באופן מאד סלקטיבי.

Question 112

Histone-Cod

Answer 112

זהו מושג המשתמש בשונות הרבה הקיימת בנוקלאוזומים (הוזכר בפסקה הקודמת) בדנ"א וביכולת התיאורטית שלה "לסמן" אזורים בדנ"א. מודיפיקציות על ההיסטונים-\> גיוס חלבונים-\> סימון קוד

Question 114

האם כל המודיפיקציות על ההיסטונים הן על הזנבות?

Answer 114

לא

Question 116

איך קוראים את הקוד על ההיסטונים?

Answer 116

כיצד קוראים את הקוד וכיצד הקוד "מתפשט" על גבי אזורים בכרומוזום ואף עובר בתורשה? האנזימים האחראיים על הוספה והסרה של המודיפיקציות הם לרוב חלק מקומפלקסים בעלי מספר רב של יחידות, אשר מובאים, ככל הנראה, לאזור מסויים בכרומוזום על ידי חלבונים מזהי רצף (למשל פקטורי שעתוק). לאחר שאנזים אחד או מספר אנזימים "כותבים" את הקוד על גבי ההיסטונים, מתרחשת תגובת שרשרת שבה האנזים ה"כותב" עובד ביחד עם חלבון ה"קורא" את הקוד ומצוי איתו באותו הקומפלקס. החלבון הקורא מזהה מודיפיקציות חדשות שנעשו על גבי הנוקלאוזום. לאחר שה"קורא" נקשר למודיפיקציות הללו הוא משפעל את ה"כותב" על נוקלאוזומים סמוכים. בנוסף ייתכן וקומפלקסים מסויימים מגייסים קומפלקסים אחרים ובעצם מרחיבים את הקוד ההיסטוני.

Question 117

מה מאפשר ואריאבליות בין נוקליאוזום לנורליאוקלום?

Answer 117

1. מודיפיקציות שונות 2. ואריאנטים להיסטונים

Question 118

איזה קומפלקס משתתף בקריאה וכתיבה של histone code?

Answer 118

crc

Question 119

earazer?

Answer 119

עושה דה מתילציה גורם ליוכרומטוין יותר מהטרוכרומטין

Question 120

barrier sequences?

Answer 120

רצף מטרתו להפריד ביון דומיין אחד בכרומוזום (לוקוס) לדומיין אחר בכרומוזום

Question 121

HS4 מה קורה כשמסירים אותו? ואיך זה עוזר לנו בהנדסה גנטית?

Answer 121

רצף המפריד את הלוקוס (=דומיין על הכרומוזום) שמקודד לבטא-גלובין, מלוקוס סמוך שהוא מושתק. כאשר מסירים את הרצף הזה בטכניקות של הנדסה גנטית האזור ההטרוכרומטי הסמוך פולש לשטח של בטא-גלובין ומשתיק אותם ובכך מונע את יצירת החלבון בטא-גלובין. אנשים שיש להם את המחיקה הזו יסבלו מאנמיה קשה. אלא גם משמשת אותנו בטכניקות של הנדסה גנטית. כאשר נרצה להכניס לגנום של יונק גן ולוודא שהוא לא יושתק, ניתן יהיה למקם משני צדיי הגן את רצפי ה HS4

Question 122

כיצד ה- sequence barrier פועלים.?

Answer 122

הם מהווים אתר קישור ל Histone Acetylase-ות. כאשר עושים אצטילציה על שיירי ליזין לא ניתן לבצע את הטרי-מתילציה שכל כך חיונית להתפשטות ההטרוכרומטין.

Question 123

מה התמונה הבאה מלמדת?

Answer 123

על רצפים חוסמים

Question 124

האם הצטנטרומר הוא יוכרומטי או הטרוכרומטי?

Answer 124

הטרוכרומטי

Question 125

מה קורה בצנטרומר במיטוזה?

Answer 125

הפרדה של 2 כרומטידות אחיות בעזרת מיקרוטובולי וכישור החלוקה

Question 126

כיצד קוראים לכרומטין של הצנטרומר?

Answer 126

Centromeric Chromatin

Question 127

איך הכרומטין של הצנטרומר מתקיים ?

Answer 127

עי ואריאנט של היסטון H3 שנקרא cnpa וחלבונים אחרים שדוחסים את הניוקליאוזום למבנה ייחודי שנקרא קינטוכור

Question 130

קינטורוכור

Answer 130

מבנה ייחודי של הנוקלאוזום בצנטרומר

Question 131

כמה בסיסים יש בצנטרומר של שמרים? כמה חלבונים נקשרים לשם? והאם cenpa הוא ביניהם?

Answer 131

125 ויותר מעשרה חלבונים בהחלט

Question 132

האם הצנטרומר של בן אדם מכיל רצף ספציפי? וכמה בסיסים יש בצנטרומר של בן אדם?

Answer 132

לא הוא לא מכיל רצף ספציפי מאות אלפי בסיסים

Question 133

Alpha-Settelite

Answer 133

רצפים קצרים שיש בצנטרומר של בן אדם אבל יכולים גם להופיע סתם בכרומוזום לכן הם לא מה שמגדיר אם ייוצר צנטרומר או לא

Question 135

ממה מורכב הצנטרומרים מחלבונים יותר או מרצף יותר?

Answer 135

חלבונים

Question 136

האם צנטרומרים יכולים להופיע בצורה לא מוגדרת ברצף שלהם? ומה זה מסביר?

Answer 136

כן כנראה בעלת תפקיד משמעותי מבחינה אבולוציונית ומסבירה כיצד אורגניזמים שונים, שיכולים להיות קרובים מאוד אבולוציונית אחד לשני, מכילים מספר כל כך שונה של כרומוזומים

Question 137

כיצד הופעה של צנטרומרים עוברת בתורשה?

Answer 137

כדי שיהיה צנטרומר צריך cenpa שהוא הומולוג של H3 עובר לכרומטירדה אחות במיקום מדויק וקורא לעוד cenpa

Question 138

איזה מנגנון יש להורשה של הטרוכרומטין

Answer 138

קואפרטיבי

Question 139

מה יקרה כאשרר ניקח גרעין של תא אפיתל בוגר ונכניס בתוך ביצית? מה יקרה אם ניקח גרעינים של תאים יותר צעירים? מדוע

Answer 139

1. ניתן לקבל אורגניזם שלם אבל האורגניזם לא התפתח כמו שצריך 2. האורגניזם כן התפתח כמו שצריך הסיבה לכך- ככל שתא עובר יותר חלוקות ככה יש לו יותר אזורי הטרוכרומטין וקשה מאוד להפעיל את הגנים

Question 140

myo d

Answer 140

הגן MyoD מקודד לפקטור שעתוק מרכזי בשלבים הראשוניים של ההתפתחות העוברית.

Question 141

איזה ניסוי עשו עם myo d מה ההסבר והמסקנה?

Answer 141

Question 142

אם יש הטרוכרומטין שחייב להישאר עד סופ חיינו הטרוכרומטין איזה חלבונים יהיו עליו?

Answer 142

HP1

Question 143

איך אזורים ב- dna שפעם הם הטרוכרומטין ופעם הם יוכרומטים יכולים להשתנות ? על ידי מה?

Answer 143

חלבונים ממשפחת polycomb

Question 144

מי הכרומוזום הגדול ביותר שמוכר למדע ומאיזה ביצית הוא מגיע?

Answer 144

הכרומוזום הגדול ביותר המוכר למדע הוא ה- lampbrush chromosome המגיע מביצית של דו-חיים.

Question 145

מה זה בתמונה הזו? באיזה מצב הוא נמצא? מה יקרה בחלק הליניארי שלו? מה יקרה בחלק עם הלולאות?

Answer 145

lampbrush מיוזה שלה ה-pairing ליניארי- לא תהיה ביוסינטזה של rna לולאתי-תהיה ביוסינתזה של rna

Question 146

מה היא שיטת 3c

Answer 146

משמשת להוכחה שהכרומוזום מתארגן בלולאות בזכות חלבונים המקשרים בין שני אזורים מרוחקים. על מנת לבצע את השיטה עלינו להכיר רצפים בשני אזורים (רצף כתום ורצף אדום) שאנחנו חושדים שבעזרת חלבונים קושרי דנ"א המארגנים את הכרומטין למבנה לולאתי מגיעים בסמיכות אחד לשני על אף שהם רצפים מרוחקים.

Question 147

מה הם שלבי הניסוי ב- 3c

Answer 147

Question 148

מי אחראי להיווצרות הלולאות המסודרות במיטוזה?

Answer 148

2 אינזימים: קונדסין וטופואיזומראז

Question 149

תאי פולי-פלואידים

Answer 149

בטבע קיימים לא מעט סוגים של תאים המיצרים המשכפלים את הדנ"א שלהם שוב ושוב אך לא מבצעים חלוקה תאית

Question 150

Giant polytene

Answer 150

במקרה קיצון, כמו בתאי בלוטת הרוק של לארוות הדרוזופילה מיוצרים מאות ואלפי עותקים של הדנ"א ומובילים ליצרית תאי ענק. בנוסף, כל העותקים של הדנ"א מועמדים באופן ישר אחד ליד השני, ממש כמו אוסף של קשים בתוך אריזתם המקורית - תופעה כזו קרויה Giant polytene.

Question 151

האם ניתן לצפות בפוליטן עם מיקרוסקופ אור פשוט?

Answer 151

לא

Question 152

אם מסתכלים על פוליטן עם מיקרוסקופ אור מה ניתן לראות?

Answer 152

חלקים לבנים וחלקים שחורים חלקרים שחורים- מהווים 95 אחוז מהדי אן איי חלקים לבנים-5 אחוזים חלקים שחורים הם החלק היותר דחוס עם יותר חלבונים

Question 153

איך נראה הכומטין באינטרפאזה?

Answer 153

ניתן לסכם שהכרומטין בשלבי האינטרפאזה של מחזור התא (כל שלבי מחזור התא מלבד מהמיטוזה) הוא בעל מבנה mosaic המכיל אזורים שונים בעלי מודיפיקציות שונות על גבי ההיסטונים וסט מסויים של חלבונים לא היסטוניים.

Question 154

אילו חלבונים ניתן למצוא באזורי פוליקומב בהטרוכרומטין בפוליטן אם משתמשים ב chip או בצביעת אימונוביסטוכרומית?

Answer 154

חלבונים ממשפחת Pcg

Question 155

כמה סוגי חלבונים יש בהטרוכרומטין הקלאסי בפוליטן?

Answer 155

6 סוגי

Question 156

האם יש רק 2 סוגי הטרוכרומטין בפוליטן?

Answer 156

לא ,ש כמה

Question 157

Chromosome Puffs

Answer 157

מדובר על חרקים כאשר הם עוברים משלב התפתחותי אחד לאחר והם פותחים או סוגרים אזורים בכרומוזום

Question 159

מאילו שני מצבים עוברים ה- chromosome puffs ומה זה מזכיר?

Answer 159

ורים אלו בעצם עוברים ממצב סיבי ודחוס וקומפקטי למבנה לולאתי חשוף כמו שראינו בכרומוזום של lampbrush

Question 160

איפה נצפה לראות די אן איי הטרוכרומטי בתוך גרעין יורקיוטי?

Answer 160

במחקרים מסוג זה התגלה כי דנ"א הטרוכרומטי בתוך הגרעין היוקירוטי לרוב ממוקם סמוך ללמינה הגרעינית, לא משנה על איזה כרומוזום נעשה הניסוי.

Question 161

Fracale Globule איך גילו זאת? מה זה?

Answer 161

בעזרת 3סי זוהי דרך שבה הכרומוזומין מתרגנים באינטפאזה ר מצד אחד אריזה קומפקטית של גנים שאינם צריכים לעבור ביטוי בזמן זה, ומצד שני מאפשר פריסה נוחה ופתיחה של הלוקוס כאשר נצטרך לבטא את הגנים הללו.

Question 162

האם לוקוסים יכולים לשנות את מיקומום בגרעין ?

Answer 162

כן

Question 163

מה עושות מאקרומולקולות בתוך הגרעין?

Answer 163

יוצרות מדורים- סוג של רשת

Question 164

מה קורה בגרעינון?

Answer 164

בגרעינון, שהוא האתר בו נבנות יחידות הריבוזומים, אנחנו יכולים למצוא חלבונים ו RNA המתארגנים מסביב לגנים המקודדים ל RNA הריבוזומאלי, המצוי ביוקריוטים במספר רב של עותקים על גבי מספר כרומוזומים והם כולם מתקבצים לתוך הגרעינון ותהליכים יוכימיים נוספים

Question 166

גופיי Cajal וגרנולות interchromatin-יות איפה הם נמצאים בתא? ובאילו סוגי תאים? מה התפקיד שלהם?

Answer 166

קימים בגרעין גם בתאים אנימאליים וגם בתאים צמחיים אלו הם לרוב מבנים ספריים המכילים ריכוז גבוה יחסית של רנ"א וחלבון ויוצרים ביחד רשת מאד פרמבילית לרנ"א וחלבונים אחרים. כך בעצם נוצרים אזורים ממודרים יחסית בגרעין בעלי מוביליות יחסית נמוכה ובעלי אופי ביוכימי ספציפי, אך בניגוד לאיברונים עוטפי ממברנה המצויים בציטופלזמה, הם לא יכולים לרכז או למנוע הגעה של מולקולות קטנות מאחר והם חסרי ממברנה.

Question 167

מתי בדרך כלל נוצרים מידורים בגרעין?

Answer 167

כאשר צריך אותם, למשל אם יש נזקי די אן איי כתוצאה מקרינה

Question 168

אם אנו רוצים להגביר מוביליות של מאקרומולקולות לאזורים ממדורים עם אילו חלבונים עלינו להשתמש

Answer 168

tathering

Question 169

מה משמש כשלד לגרעין?

Answer 169

חלבוני מטריקס ו Scaffold בתוך הגרעין המתרכבים עם מולקולות RNA ליצירת מבנים לא מסיסים המשמשים מעין "שלד" לגרעין המכיל מרכיבים סיביים. חלק מן המרכיבים הללו מאפשרים ומייצבים את אותן לולאות של כרומוזומים שהזכרנו כבר.

Question 170

מה מכיל הכרומוזום המיטוטי?

Answer 170

הכרומוזום המיטוטי מכיל בתוכו בעצם 2 מולקולות של דנ"א הזהות מבחינת הרצף אחת לשניה דרך הצנטרומר מאחר והן שכפול מדויק אחת של השניה – מולקולות אלו קרויות כרומטידות אחיות

Question 171

מה היא דרגת הארגון הגבוהה ביותר שהכרומוזון יכול להגיע אליה ?

Answer 171

כרומוזום מיטוטי וזה גם השל הקומפקטי ביותר

Question 172

מה הן שתי הסיבות שבגללן יש דחיסות גבוהה בכרומטידיות האחיות? וכיצד קוראים לשני האינזימים האחראים לכך?

Answer 172

כאשר כל אחת מהכרומטידות דחוסה באופן עצמאי ומלא – קל יחסית להפריד ביניהם (חשבו על כך שיש פחות קשרים ופחות סרבול כאשר המולקולה דחוסה). הדחיסות הגבוהה מגנה על הדנ"א מפני שבירה בשלב מאוד חשוף בו הגרעין לא קיים והכרמטידות נעות חופשי בציטופלזמה. קוהזין וקונדסין

Question 173

מה הם גנים הומולוגיים?

Answer 173

אלו הם גנים בעלי דמיון רב ברצף והם בעלי אב קדמון משותף.

Question 174

אם יש שני גנים הומולגיים הם בהכרח בעלי תפקיד זהה?

Answer 174

לא

Question 175

מה יותר שמור רצפים של גנים או מבנה הגנום כולו?

Answer 175

רצפים של גנים

Question 176

מה הבעיה במחקר הגנומי ואיך ניתן להתמודד איתו?

Answer 176

בעיה במחקר גנומי היא שעלינו לזהות אזורים מקודדים לחלבון (=אקסונים בלבד) בתוך "ים" של דנ"א (שבעבר כאמור קראו לו "דנ"א זבל"). הדרך להתמודד עם זה היא לחפש רצפים דומים עם אורגניזמים איתם אנחנו חולקים אב קדמון משותף.

Question 177

Conserved Regions

Answer 177

אזוריםאשר לחץ הסלקציה האבולוציוני שמר על הרצף המבני שלהם

Question 178

Unconcerned Regions

Answer 178

אזורים שהם לא שמורים מבחינה אבולוציונית

Question 179

multispecies conserved sequence

Answer 179

5 אחוזים מה-די אן איי שלנו שנמצא באורגנזימים אחרים

Question 180

ממה נגרמו שינויים בגנום במהלך האבולוציה?

Answer 180

"תקלות" במערך ההכפלה והאחזקה של הדנ"א (בעיות בשכפול או בעיות בתיקון נזקים) שיכולות להוביל למוטציות נקודתיות, אינברסיות, מחיקות וטראנסלוקציות. טרנספוזונים או אלמנטים מוביליים בדנ"א –– אותן כבר הזכרנו. אלו הן חתיכות דנ"א פרזיטיות אשר מתפשטות בגנום המארח אותן. אלמנטים אלו יכולים בזמן מעברם לפגום ולשנות את תפקודם של גנים ואף ליצור גנים חדשים על ידי איחוי של הטראנספוזון עם גן ישן. טראנספוזיציה כה נפוצה עד כדי שכמעט 50% מהגנום האנושי הוא תולדה של אירועי טראנספוזיציה מהעבר.

Question 181

על פי ניתן לצייר עצים פילוגנטיים?

Answer 181

עי השוואת רצפי חומצות האמינו

Question 182

מלבד ח"א איזה עוד מכנה משותף יש לשימפנזים ולבני אדם.

Answer 182

קודונים הסינונימיים (קודונים המקודדים לאותה חומצה אמינית אבל בעלי שינוי בנוקלאוטיד האחרון בקודון)

Question 183

מה הסיבה שיש שימין בין ח"א שלנו ל-ח"א של תרנגולת

Answer 183

סלקציה מטהרת

Question 184

כיצד אפשר לבדוק איזה רצף של חלבון מסוים היה לאב קדום של אדם ושימפזה?

Answer 184

אם נרצה לשער מה הרצף של חלבון מסויים, למשל החלבון לפטין המבקר את צריכת המזון, שהיה לאב הקדמון של בני אדם ושל שימפנזים, נוכל לבצע השוואת רצפים בין אדם ושימפנזה, ואם יש התאמה, כנראה שגם לאב המשותף היה את אותו הרצף. מה קורה כאשר יש שוני ברצף? נסתכל על הרצף של הגורילה ונשער שלאב המשותף שלנו ושל שימפנזה היה את החומצה האמינית שמתאימה לשניים מתוך שלושת הרצפים המושווים.

Question 185

באיזה אזורים בדי אן איי נצפה לקצב שינויים גבוה?

Answer 185

באזורים שאינם מקודדים לחלבון, למשל אינטרונים (בעיקר באזורים ללא סיגנאל שחבור), גנים שפעילותם נהרסה בגלל מוטציות או מחיקות (פסאודוגנים) ואפילו קודונים סינונימיים

Question 186

איפה קצב המוטציות יותק גבוהה גרעין או במיטוכונדריה?

Answer 186

מיטוכונדריה

Question 187

ממה מושפע קצב השינויים המולקולארי?

Answer 187

1. ברצפים עצמם 2. בקצב המוטציות

Question 188

מה נחשב מדויק יותר שעון מולקולארי או שעון אבולוציוני?

Answer 188

שעון מולקולרי

Question 189

Synteny reigons

Answer 189

ראות שיש מקבצים (בלוקים) של גנים בדנ"א של שני יצורים שונים ששמרו על הסדר שלהם או באותו יצור בכרומוזומים שונים

Question 190

למי יש syntheny regions יותר גדול לנו ולתרנגולות או לנו ולעכברים?

Answer 190

לנו ולעכברים

Question 191

למה כמעט ולא היה שינויים בגודל הגנום אצלנו ואצל עכברים?

Answer 191

בגלל דופליקציות של טראנספוזומים והכפלות אקראיות

Question 192

מה הוא גודל הגנום של כל היונקים ולמה זה מפתיע

Answer 192

עובדה מעניינת שלא נמצא לה הסבר היא שכל היונקים שמרו על גודל של גנום של בערך 3 מיליארד בסיסים, על אף שרצפי הנוקלאוטידים הפונקציונאלים הם 150 מיליון בסיסים בלבד.

Question 193

מדוע לדג פוגו יש רק 0.4 מיליארד בסיסים?

Answer 193

האינטרונים שלו קטנים יותר

Question 195

איך נשמר גודל הגנום?

Answer 195

מירה על גודל הגנום היא בעיקר בזכות שיווי משקל או איזון נכון של מחיקות ותוספות.

Question 196

מה הם הרצפים ALU ן-L1

Answer 196

רצפים טרנספוזומיים שקשורים לבטא גלובין

Question 198

האם אפשר בעזרת מאובנים לגלות די אן איי של יותר ממליון שנה?

Answer 198

עד מיליון שנה

Question 199

מה הם ה- conserved sequences לא מקודדים

Answer 199

רצפים חופפים שלא מקודדים שהם בין 50-200 בסיסים

Question 200

Ultra-Conserved

Answer 200

הם רצפים בני 100 נוקלאוטידים שנמצאו במעל 5000 מינים שונים והם זהים לחלוטין באדם, חולדה ועכבר, ורובם לא עברו שינויים כלל או שעברו מעט מאוד שינויים מאז התפצלו היונקים מהציפורים לפני 300 מיליון שנה

Question 201

incENA

Answer 201

רצפים שהם בדרכ שמורים בין זנים רבים והם משועתקים לאר אן איי ארוך בעל תפקידים רבים

Question 202

אם בני אדם דומים מבחינת הגנום אז איך זה שהם שונים מבחינת המראה?

Answer 202

חוקרים חיפשו רצפים שמורים שהשתנו מאוד והם מצאו Har

Question 203

har

Answer 203

human accelerated Reigons אלו רצפים שמורים בין יונקים אבל הם עברו שינויים מהירים בגנום האנושי ב-6 מיליון השנים שחלפו מאז התפצלנו מהקוף. כרבע מהאתרים האלו נמצאו באזורים בגנום הקשורים להתפתחות נוירונאליות והם עברו יותר שינויים במעבר בין אדם לשימפנזה מאשר בין שימפנזה לתרנגולת.

Question 204

har 1 f?

Answer 204

אחד מהרצפים של ה-har שמשועתק למולקולת בת 118 בסיסים של rna שמתבטאת בקליפת המוח ונקראת har1f

Question 205

האם גם היו מחיקות גנומים במעבר משימפנזה לאדם ואם כן כמה? ואיך הם השפיעו על האדם?

Answer 205

הם מצאו אזורים שעברו ריבוי מחיקות בגנום, מחיקות שממוצען הוא 95 נוקלאוטידים, מתוך 500 רצפים כאלו, רק אחד היה סמוך לגן מקודד לחלבון. רוב הרצפים היו באזורי בקרה בעיקר כאלו הקשורים להשפעה של סטרואידים ולכן מעריכים כי רצפים אלו קשורים למערכת החיסון, להתפתחות נוירונאלית ולרבייה.

Question 207

האם זה שכיח אם משווים בין שני אורגנזימים למצוא אורגניזם ללא הומולוגיה

Answer 207

לא זה נדיר

Question 208

מדוע נגרמת ההומולוגיה בין יצורים מאוד שונים ?

Answer 208

נים מכפילים את עצמם ואז עוברים שינויים. עצם העובדה שגן שוכפל מאפשרת לבצע באחד העותקים שינויים מבלי לפגוע בשרידות של האורגניזם.

Question 209

למה יש הכפלות של הדי אן איי? ואיך זה נקרא?

Answer 209

tandem repeats בם נגרמו בגלל פגמים במנגנון השכפול של הדנ"א ובעיה בתיקון שברים.

Question 210

מה הגורל של גן משוכפל?

Answer 210

ברוב המקרים הגן ששוכפל, מאחר והוא עותק של גן פעיל אחר, איננו עובר סלקציה חזקה ועל כן יעבור שינויים רבים, לפחות בהתחלה ורובם יובילו ל loss of function. עם הזמן הדמיון בין הגן המשוכפל – שכעת נכנה אותו פסאודו-גן עובר כל כך הרבה שינויים עד שכמעט בלתי ניתן למצוא הומולוגיה בינו לבין הגן המקורי. אופציה נוספת היא ששני הגנים נשארים פעילים ועוברים שינויים המשפיעים על עוצמת ודגם הביטוי שלהם בתהליך הנקרא duplication and divergence – זו תופעה המסבירה את הופעת "משפחות הגנים" המוכרות לנו היום , דבר שמגדיל את השונות הביולוגית בין מינים וכמובן את המורכבות של אורגניזמים מסויימים.

Question 211

מה קורה בהכפלה של גנום שלם?

Answer 211

אופציה ראשונה היא המון אירועים של דופליקציה והשתנות כמואר מעלה עד שבסופו של דבר נקבל הכפלה של הגנום באופן לא מאורגן. אופציה נוספת היא הכפלה של הגנום בגמטות (תאי מין) ללא חלוקת תאית לאחר מכן – תופעה זו נפוצה בעיקר בצמחים ובפטריות. עם זאת התופעה קיימת גם בחולייתנים. למשל בדג הזברה שעבר דופליקציה מלאה של הגנום ואף נמצא שכ- 30 עד 50% מהגנום המוכפל עבר השתנות פונקציונאלית לאחר ההכפלה .

Question 212

מה גורמת שונות בין גנים מוכפלים?

Answer 212

1. גורמת להתבטאות ברקמות שונות 2. גורמת להתבטא במתקופות שונות במהלך החיים ושני הגנים יהיו חלק מבסלקציה השמרת

Question 213

האם מקורם של כל הגלובינים הוא באותו הגן?

Answer 213

כל החלבונים ממשפחת הגלובין מקורם באותו גן שעבר דופליקציה והשתנות וכן התפזרות למקומות שונים בגנום היונקי.

Question 214

האם אפשר למצוא חלבונים הומולוגיים של המוגלובין בצמחים ופטריות?

Answer 214

כן

Question 215

מה הקשר בין אלפא לבטא גלובין ולבטא העוברי?

Answer 215

היה לפני המון שנים דופליקטנים של הגלובינים שגרמו ליצירת אלפא גלובין ובטא גלובינים שמתרכבות לטטרמר שיוצר את ההמוגלובין. בשלב מאוחר יותר באבולוציה שרשרת בטא עברה הכפלה בעצמה ויצרה את תת היחידה בטא-עוברית שהיא ייעודית לעובר ומגלה אפיניות גבוהה יותר לחמצן ולכן חיונית להעברת חמצן מהדם האמהי לעובר

Question 216

איפה נמצא בטא גלובין בכרומוזום?

Answer 216

11

Question 217

באיזה כרומוזום נמצא אלפא גלובין?

Answer 217

אלפא גלובין נמצאים על כרומוזום 16

Question 218

האם בדו חיים אלפא בטא גלובין נמצאים על אותו כרומוזום?

Answer 218

כן על כרומוזום 16

Question 219

האם רקומסינציה בין אקסונים יכולה לגרום ליצירת גנים חדשים?

Answer 219

כן

Question 220

מה השכיחות של מוטציה בגנום?

Answer 220

1 חלקי 2n

Question 221

מה יקרה למוטציה אם היא מורידה את השרידות?

Answer 221

היא תעבור אלימנציה בעזרת סלקציה מטהרת

Question 222

מה קורה אם מוטציה נותנת יתרון בשרידות?

Answer 222

היא תתפשט במהירות

Question 223

מרבית המוטציות הן מעילות או מזיקות?

Answer 223

לא מועילות ולא מזיקות, נייטראליות

Question 224

האם מוטציה נייטראלית יכולה להתפשט באוכלוסיה?

Answer 224

ההתפשטות במקרה זה תהיה כתלות בכמות נשאי המוטציה ובכמות הצאצאים שנשאי המוטציות מולידים

Question 225

כמה דורות צריך עוד שמוטציה תתפשט באוכלוסייה?

Answer 225

4N דורות

Question 226

מה יקרה אם נשווה רצף די אן איי של אדם רנדומאלי ךרצף במאגר?

Answer 226

ניתן למצוא כ-100 בלוקים של רצפים שאבדו או נוספו וגם הם מייצגים שינוי באוכלוסייה

Question 227

CNV

Answer 227

לוקים של רצפים שאבדו או נוספו וגם הם מייצגים שינוי באוכלוסייה

Question 228

SNP ומה זה יכול לגרום? כמה נוקליאוטים שונים יש בים שני אנשים שונים בדרך כלל? והאם זה תורם לפיטנס?

Answer 228

שונות של נוקלאוטיד בודד ברצף זה יכול גרום לשונות בתוך האוכלוסייה 2.5 מיליון זה לא תורם לפיטנס

Question 229

אילו רצפים עוברים בדרכ מוטציות ביוקריוט? ולמה משתמשין בזה בדרך כלל?

Answer 229

ca לבדיקות אבהות וזיהוי פלילי

Question 230

האם ל- snp או ל- cnv יש השפעה על הפנוטיפ?

Answer 230

לא