biology of the cell 3 Flashcards
מה התפקידים של שלד התא?
שלד התא על כל רכיביו משתתף בחלוקת התא, הוא אחראי ליציבות, לפולריות, למבנה, לחוזק המכאני של התא. הוא מאפשר העברה של חומרים כמו טרנספורט של וזיקולות, מאפשר חיבור עם הצד החוץ תאי ותנועה תאית.
אילו רכיבים מרכזיים יש בשלד התא?
אקטין (או: מיקרופילמנטים) – הסיבים הדקים ביותר. קובעים את צורת פני התא, הכרחיים לתנועה תאית, כיווץ שריר, ציטוקינזה.
מיקרוטובולי – הסיבים העבים ביותר. קובעים את מיקומם של איברונים סגורים בממברנה בתא, מתווכים הובלה תוך תאית (הנעת וזיקולות), אחראים על יצירת כישור החלוקה המפריד את הכרומוזומים במהלך חלוקת התא.
סיבי ביניים (או בקיצור: IF)
–מעניקים חוזק מכאני לתא, מייצבים ממברנות.
עם מה נמצא שלד התא באינטראקציה
כל משפחה כזו מקיימת אינטראקציה עם מאות חלבונים נוספים –חלבונים אקססוריים – המווסתים חיבור ופירוק של הסיבים בינם לבין עצמם ובינם לבין רכיבים אחרים. החלבונים האקססוריים אם כן חיוניים להרכבה מבוקרת של סיבי שלד התא. ביניהם ניתן למצוא גם חלבונים מוטוריים, הממירים את האנרגיה שבהידרוליזת
ATP
לכוח מכאני שיכול להזיז איברונים לאורך סיבי השלד או להזיז את סיבי השלד עצמם.
מה הקוטר של סיב אקטין?
ובמה הוא מאפיין
קוטר הסיב הוא 8 ננומטר והוא מתאפיין בגמישות ויכולת ארגון מהירה
מה מספק חוזק וצורה לממברנה פלסמתית?
אקטין
מה מייצב מבנים דינאמיים בפריפריה?
סיבי אקטין
מה הוא חלבון מנוע של אקטין?
מיוזין
contractile ring
נעשת עי?
אקטין
מה הם מיקרוטובולי?
מיקרוטובולי אלו הם סיבים ארוכים הבנויים כצילינדר (גליל) ארוך וחלול, בעל קוטר של 25 ננומטר. הם קשיחים בהרבה מסיבי האקטין ומתארגנים בצורת כוכב כך שכל הסיבים יוצאים ממרכז ארגון המצוי במרכז התא ומכונה
MTOC
הצנטרוזום.
המיקרוטובולי נמצאים לעיתים קרובות במערך הציטופלסמטי המשתרע לפריפריה של התא.
מה התפקיד של מיקרוטובולי<
- בניית כישור החלוקה במהלך חלוקת התא.
- יצירת פלאג’לה וסיליה המתפקדות כ”משוטים” תנועתיים או כאמצעי חישה על פני התא.
- יצירת צרורות המשמשים כאוטוסטרדה מרכזית להנעת חלבונים ווזיקולות בתוך התא, למשל במורד אקסונים.
- בצמחים, מערכים מאורנים של מיקרוטובולי עוזרים לכוון את תבנית סינתזת דופן התא.
- בפרוטאוזונים רבים מיקרוטובולי מהווים את המסגרת עליה בנוי התא כולו.
מה הם סיבי הביניים?
לו הם סיבים חזקים הבנויים כמו חבל. הדוגמה הקלאסית היא אלפא-קראטין עליו למדנו מעט בביוכימיה.
סיבי הביניים הם ציטופלסמטיים או תוך גרעיניים. בגרעין מדובר בלמינה הגרעינית שתפקידה לייצר מעין כלוב מגן על הדנ”א. בציטופלזמה הם מאפשרים למשל לנוירונים לשלוח אקסונים ארוכים ויציבים ובתאי האפיתל של העור לייצר את השיער, הקרניים והציפורניים. בנוסף, בציטופלסמה הם מאפשרים להחזיק קטעים ארוכים של תאים אפיתליאליים.
שלד התא יכול להשתנות
נכון / לא נכון
נכון
איזה דוגמא יש לפיברובלסט בארגון מחדש עי שלד התא?
לאחר שכפול הכרומוזומים, המיקרוטובולי מתפשט בכל הציטופלסמה ובונה את כישור החלוקה אשר אחראי להפריד בין שני העותקים של כל כרומוזום. באותו הזמן, סיביאקטין יוצרים מבנים המאפשרים לפיברובלסט לזחול על פני המשטח כך שהוא יפסיק לנוע ויקבל צורה כדורית יותר. כמו כן, אקטין וחלבון המנוע שלו, מיוזין, יוצרים חגורה סביב אמצע התא הנקראת
contractile ring
שבעזרתה מתבצעת החלוקה. לאחר השלמת החלקה, שני תאי הבת מארגנים מחדש הן את המיקרוטובולי והן את האקטין כך שיאפשרו להם לזחול שוב.
איזה תא משתמש בדינאמיות של שלד התא על מנת לתפוס חיידקים?
ובמה הוא משתמש?
ניוטרופיל, סוג של תא דם לבן רודף ובולע תאים חיידקיים ותאי פטריה שחודרים לגוף, למשל דרך העור. ניוטרופילים מתקדמים על ידי הרחבת מבנה בולט ומלא בחוטי אקטין מפולימרים חדשים . כאשר הטרף החיידקי החמקמק נע בכיוון אחר, הנויטרופיל מוכן לארגן מחדש את מבני הבליטה הקוטביים שלו תוך שניות.
מי אחרי להפרדה בין הממבברננ האפיקאלית לבאזולאטראלט?
אקטין
סיב יכול להשתרע מקצה אחד בתא לקצה השני
נכון
האם אפשר להעביר סיב בדפיפוזיה למקום אחר בתא?
לא
אבל אפשר להעביראת החלבונים עצמם שמרכיבים אותו עי דיפוזיה
איזה אינטרקציות יש בין המונומרים שבונים את הסיבי השלד?
אינטרקציות חלשות
מי מבין הסיבים הוא פולארי ומי סימטרי:
אקטין
מיקרוטובולי
קרטין
אקטין ומיקרוטובולי הם קוטיים
קרטין הוא סימטרי
מה הקוטביות של אקטין ומיקרוטובולי מעניקה להם?
במקרה של אקטין ומיקרוטובולי קוטביות תת היחידות מעניקה לסיבים קוטביות מבנית לאורכם, וגורמת לשני הקצוות של כל פולימר להתנהג אחרת.
מה הנוקלטיד טרי פוספט לו אקטין עושה הידרוליזה?
ATP
למה מיקרוטובולי עושים הידרוליזה?
GTP
למה אקטין ומיקרוטובולי עושים הידרוליזה?
האנרגיה משמשת ל
remodeling
ובכך לסיבים להתחדש במהירות
למה התא רותם את הקוטביות של המיקוטובולי<
להפריד כרומוזומים
להזיז קצה מוביל של תא נודד קדימה
ממה נבנה מיקרוטובולי?
ואיזה תכונו זה נותן לו?
מיקרוטובולי כפי שנראה בהמשך נבנים מ-13 פרוטופילמנטים – מיתרים ליניאריים של תת יחידות המחוברות מקצה לקצה. אלה מתחברים זה לזה לרוחב ליצירת צילינדר חלול. הארגון הזה גורם להם לחזק מכאני ולעמידות לטמפרטורה: תוספת או אובדן של יחידת משנה בסוף פרוטופילמנט אחד מייצרת או שוברת מספר קטן של קשרים. לעומת זאת, אובדן יחידת משנה מהאמצע מחייבת שבירת קשרים רבים נוספים, ואילו שבירה לשניים מחייבת שבירת קשרים בפרוטופילמנטים מרובים כולם בו זמנית (כפי שלשבור לבנה באמצע מצריך שבירה של הרבה קשרים) העמידות לטמפרטורה גבוהה נגרמת מריבוי קשרים של
end to end
ושל
side by side
ביצירת הצילינדר.
מה דורש יותר אנרגיה לשבירה, סיב אקטין או סיב מיקרוטובולי?
סיב מיקרוטובולי
איך סיבי הביניים מסתדרים
כאלפא קויל קויל
מי מבין שלושת הסיבים יכול להתנגד למתיחה?
סיבי ביניים
למי הומולוג
ftsz
מרכיב חשוב בתהליך הנצה (חלוקה תאית) של חיידקים. הוא סוגר ספטום והוא הומולוגי למיקורטובולי (לא להתבלבל עם אקטין שאצלנו הוא זה שצובט).
איך מעבירים פלסמידים באקטין?
ולמי הוא הומולגי?
העברת פלסמידים מצד מצד אחד לצד שני (לרבות חלוקה סימטרית של פלסמידים בעת חלוקה תאית) בחיידקים על ידי –
ParM
חלבון חיידקי הומולוג לאקטין.
Mbl ו- merB
הומולוגים לאקטין ונמצאים במבני ספירלה ומתג.
מה הגודל של תאים של חיידקים?
גודלם של חיידקים הוא בדרך כלל כמה מיקרומטרים בודדים
האם יש לתאים של חיידקים שלד תא?
כן
אילו חלבונים יותר מגוונים חלבונים של שלד התא האיאוקריוטי או של חיידקי?
חיידקי
למה הומולגי החלבון
ftsz?
לטובולין
מה עושה חלבון
ftsz?
Z-ring
בחיידקים ובארכאות במהלך חלוקת התא
משך מחצית החיים של סיב
fts z
ממוצע הוא?
30 שניות
מה הם החלבונים ההומולוגיים לארטין הקיימים בחיידקים ?
באיזה סוגי חיידרים הם נמצאים?
ומה זמן מחצית החיים שלהם?
חלבונים הומולוגיים לאקטין כמו
MreB
ו- Mbl
המצויים בעיקר בחיידקים בעלי צורת מתג או או ספירלה, אשר מגייסים חלבונים הקשורים לסינתזת הפפטידוגליקאן בדרך המזכירה את פעולתם של חלבוני הטובולין בצמחים אשר מכווינים את סינתזת הצלולוז בדופן התא. חלבונים אלו בדומה לחלבון
FtsZ
הם בעלי זמן מחצית חיים קצר (של מספר דקות) ובעלי דינאמיות גבוהה. נציין כי את תהליך הפלמור שלהם מלווה הידרוליזת נוקלאוטידים. מוטציות בחלבונים אלו גורמות לדפקטים משמעותיים בצורה של החיידקים ואף בהפרדת הכרומוזומים בזמן הנצה.
למי
parm
הומולוגי?
אקטין
איפה
Parm
מקודד?
ומה תפקידו?
חלבון זה מקודד על גבי פלסמידים שמכילים כמעט תמיד גם גן המקודד לעמידות לאנטיביוטיקה וגורמים להתפשטות של עמידות לתרופות.
החלבון
Par-M
שהוא הומולוג לחלבוני האקטין משמש לסגרגציה של הפלסמיד בזמן הנצה על ידי אינטראקציה עם חלבונים המגוייסים למוצא השכפול של הפלסמיד ובכך בעצם מאפשר לדחוף את הפלסמידים המשוכפלים לשני קצוות שונים.
למי
tub z
הומולוכי?
אקטין
crescentin
איפה יש את החלבון הזה ולמי הוא הומולגי?
החיידק קלובקטר קרסנטוס מכיל חלבון זה והוא הומולוגי לסיבי ביניים.
מה הוא הקוטר של סיבי אקטין?
8 נ”מ
ממה מורכבים סיבי אקטין?
הם מורכבים כפולימר הליקאלי של החלבון אקטין. כשהוא מצוי בצורתו הגלובולרית הוא מכונה
G-actin
ובצורה הסיבית –
F-actin
מסודר בסליל ימני.
כמה ח”א מכיל
g-actin?
375
האם
g-actin
הוא שמור?
כן
מה
g-actin
קושר?
atp or adp
כמה איזופורמים של אקטין יש בחולייתנים?
שלושה
אלפא אקטין – מבוטא רק בתאי שריר.
בטא וגמא אקטין – נמצאים יחד כמעט בכל התאים שאינם תאי שריר.
כיצד היחידות של אקטין מתאספות?
ראש לזנב
איזה קצה של אקטין צומח מהר
ואיזה קצה של אקטין צומח לאט?
וכיצד הם נקראים?
תת היחידות של אקטין מתאספות ראש לזנב ויוצרות סליל הדוק. סיבים אלו הם קוטביים ויש להם קצוות שונים מבחינה מבנית – קצה המינוס צומח לאט יותר ואילו קצה הפלוס מהר יותר.
קצה המינוס מכונה גם
“pointed end”
וקצה הפלוס
“barbed end”.
כיצד חלבונים ישפיעו על האקטין?
ככל שיהיו יותא חלבונים ככה המבנה של הקטין יהיה פחות גמיד ויותר נוקשה
איפה מצויים פילמנטים של אקטין?
מתחת לממברנה הפלסמטית
אילו מבנים דינאמיים יוצרים האקטין?
פילמטים של אקטין מצויים ממש מתחת לממברנה הפלסמטית ומספקים חוזק וצורה. בנוסף הם אחראים על תנועה ויוצרים מבנים דינמיים כמו למלופודיה ופילופודיה, אך גם מאפשרים כיווץ שריר.
אילו דוגמאות יש לכך שזמן החיים של סיבי אקטין הוא שונה?
צברי האקטין של הסטראוסיליה באוזן ישרדו לאורך כל חייו של האדם, לעומת צברי אקטין שלמראית עין מאוד דומים לאלו שבאוזן אך מצויים באפיתל המעי ומכונים מיקרווילי חיים ימים ספורים וגם בתוך אותם הימים סיבי הקטין יתחלפו במלואם כל
48
שעות. כמו כן, מבנים כמו
Contractile ring
מתקיימים לדקות בודדות.
איך ניתן ליצור אקטין ולמה?
אוליגומרים קטנים של תת יחידות של אקטין יכולים להתחבר זה לזה באופן ספונטני, אולם הם לא יציבים ומתפרקים בקלות. זאת כיוון שבמצב זה כל מונומר נקשר רק למונומר אחד או שניים. על מנת ליצור סיב חדש של אקטין, תת היחידות חייבות ליצור צבר ראשוני או “גרעין” המיוצב על ידי קשרי תת יחידה-תת יחידה רבים. לאחר מכן יכול הסיב להתארך במהירות על ידי תוספת שלל יחידות נוספות.
איך נראה התהליך של יצירת האקטין?
נוקלאציה או
filament nucleation
ובמסגרתו נוצר
nucleated filament
שלב
lag
ההתפלמרות הראשוניץ של אקטין היא איננה יציבה וזה מה שגורם למחסום אנרגנטי
elongation phase
כאשר חלק מהמונומרים של האקטין עבור את המחסום האנרגטי את שלב ה-
lag
ואז יש התפלמרות מהירה
במהלך שלב זה מתווספות תת יחידות במהירות לקצוות ה-
nucleated filament.
מתי יש מצב יציב של אקטין?
לבסוף, ככל שהתפלמרות הסיב מתקדמת, ריכוז המונומרים של האקטין יורד ואנו מגיעים למצב יציב בו מספר היחידות המצטרפות אל הסיב שווה למספר היחידות המתנתקות ממנו.
איך נקרא הריכוז של היחידות החופשיות של האקטין?
הריכוז של תת יחידות שנשארו חפשיות מכונה הריכוז קריטי. בריכוז זה בסיב לא צומח ולא מתפרק. למעשה, הריכוז הקריטי שווה ל-
Kd
קבוע הדיסוציאציה והופכי
ל- K
קבוע שווי המשקל.
מה מתואר בתמונה הבאה?
תמונה מימין ניתן לראות כי כאשר אנחנו עושים נוקלאציה של סיבי האקטין, כלומר בדרך כלשהי מחזיקים את המונומרים הראשונים יחדיואנחנו בעצם מדלגים על ה-
lag phase
ועל המחסום הקינטי.
מה הריכוזה הקריטי של אקטין במבחנה?
2 ננו מטר
האם הריכוז הקריטי של אקטין בתא חי הוא גדול או קטן מבממבחנה?
גדול
למה ה-
kd
שיש לאקטין בתא גבוהה מה-
kd
שיש ללאקטין ממבחנה?
והתא פיתח מנגנונים כדי למנוע ממונומרי האקטין להתפלמר – הדרכים הללו כוללות שלל חלבונים תאיים הנקשרים למונומרים או לסיבי האקטין ומווסתים את נטייתם להתפלמר או לחילופין מעודדים אותם להישאר בסיב – אלו הם חלבוני העזר (חלבונים אקססוריים) של האקטין עליהם נלמד בהמשך.
איפה יש זמן חיים לאקטים גבוהה יותר?
במבחנה או בתא?
מבחנה
מה יוביל ריכוז גבוה יותר מריכוז קריטי של מונומרים של אקטין?
וריכוז נמוך מריכוז קריטי?
להתפלמרות
האפיניות של איזה קצה היא גדולה יותר ליחידות אקטין
קצה מינוס או פלוס?
האפיניות של שני הקצוות היא זהה לקבלת מונומרים של אקטין, בפרט אם הם היו קשורים לאותו נוקלאוטיד – ,
ATP או ADP.
מכאן הסיקו החוקרים שהסיבה להבדלים בקצב ההתפלמרות קשורה, ככל הנראה, לקצב ההידרוליזה של
ATP
אשר שונה בין 2 הקצוות.
מתי נעשית הידרוליזת
atp?
הידרוליזת
ATP
נעשית זמן קצר לאחר החבירה לסיב. כאשר הסיב המונומר קשור עדיין ל-
ATP
זוהי תצורה
T
ואילו כאשר הוא קשור
ל- ADP
זוהי תצורה
D.
תצורה
T,
כך מסתבר, נוטה יותר להתפלמר ולקבל מונומרים חדשים ואילו התוצרה
D
נוטה יותר להתקצר ולאבד מונומרים. המבנה של סיב האקטין הוא כזה שקצה מינוס עובר הידרוליזה מהירה יותר של
ATP
ל- ADP.
ממה
מורכה
Kd
של האקטין ?
הקבוע
Koff
הוא הקבוע הקינטי של ניתוק המונומרים מסיב האקטין, והקבוע
Kon
הוא הקבוע הקינטי של חיבור מונומרים לסיב האקטין. היחס ביניהם שווה לקבוע הדיסוציאציה (וזה הגיוני כי קבוע דיסוציאציה כפי שכבר למדנו הוא היחס בין קבועי הקצב של ההתפרקות להיווצרות).
באיזה מצב ה-
koff>kon
ובאיזה מצב
kon>koff
כאשר הצורה היא
d
כאשר הצורה היא
T
מה מתפרק מהר יותר באקטין קצה מינוס או קצה פלוס?
וואיזה סוג של יח מבנה ניתן למצוא בקצותיו.
קצה מינוס
d
במינוס
t
בפלוס
מתי טרימידילינג מתרחש?
ואיך זה מוגדר?
מתרחש כאשר ריכוז המונומרים הוא כזה המאפשר התארכות מקצה פלוס המצוי במצב
T
מחדוהתקצרות מקצה מינוס המצוי במצב
D
מאידך.
מכיוון שבטרידמילינג אנו שומרים על קצה פלוס במצב
T
אבל דואגים שקצה מינוס יהיה במצב
D
המצב היציב הזה מחייב צריכה קבועה של אנרגיה בצורת הידרוליזה של
ATP
. נציין שאורך הסיב לא משתנה, כי הוא מתארך ומתקצר בקצב יחסית דומה. טרידמילינג מאפשר לנו תנועה תאית ויצירת מבנה חשוב הקרוי פילופודיה, שלוחה תאית דקה וארוכה בה סיבי האקטין מסתדרים באופן מאורגן וחד כיווני, כך שהם מקבילים אחד לשני . על מבנה זה נרחיב בהמשך.
איך אפשר לעכב אקטין באמצעים כימיים?
ציטוכלסין מעכב התפלמרות של סיבי אקטין על ידי קישור לקצה פלוס.
הכימיקל לאטרונקולין מעכב התפלמרות אקטין על ידי קישור למונומרים.
פלויידין המיוצר על ידי פטריה ממשפחת האמניטינה – נקשר לצדדים של סיבי האקטין ומונע מהם מלעבור דה-פלמור
אילו חלבונים משפיעים על התנהגותו של אקטין?
כמה מונומרים של אקטין מסיסים יש בתא?
ומדוע נוצרת התפלמרות?
ב תאי החולייתנים שאינם שרירים, כ-50% מהאקטין נמצא בצורת סיב וכ-50% בצורתו המסיסה. ובכל זאת, ריכוז המונומרים המסיסים הוא 50–200 מיקרומול הרבה מעל הריכוז הקריטי.
הסיבה להתפלמרות נעוצה בחלבונים הנקשרים למונומרים של אקטין שהופכים את הפלמור להרבה פחות נוח. הדוגמה הבולטת לכך היא טימוזין, החלבון השופע ביותר מהסוג הזה.
מה עושה הטימוזין?
הטימוזין מונע הידרוליזה או שחלוף על גבי המונומר ובעצם מחזיק את המונומר במצב כלוא ונעול, כך שאין היכולתו להיקשר לאחד מן הקצוות.
אם יש בתא טימוזין איך ניתן לעשות פלמור?
עי פרופילין
הוא מגביר את היכולת של המונומרים להיקשר לסיב ולמעשה, הוא מתחרה בטימוזין.
מה עושה הפרופילין?
חלבון פרופילין נקשר על פני האקטין בצד ההפוך לצד שאליו נקשר ה-
ATP
וחוסם את הצד במונומר שעובר אינטרקציה עם קצה מינוס, ובעצם משאיר חשוף רק את הצד שנקשר לקצה פלוס – מכאן שהוא מקדם הארכה של קצה פלוס בלבד. עם הקישור לקצה פלוס, האפיניות של אקטין לפרופילין יורדת בעקבות שינוי קונפורמטיבי באקטין, והפרופילין מתנתק מהאקטין.
האם טימוזים ופרופילין יכולים להיקשר בו זמנית ביחד לאותו מונומר?
לא
איך ניתן לבצע בקרב של פרופילין ובקרה של אקטין תוך כדי?
בקרה זו יכולה להתבצע על ידי זרחון של פרופילין או אינטרקציה שלו עם פוספואינוזיטידים. מנגנונים אלה יכולים להגדיר את האתרים שבהם פרופילין פועל. כך למשל פרופילין נדרש להרכבת סיב סמוך לממברנה הפלסמטית, שם הוא מגוייס על ידי פוספוליפידים חומציים. במיקום זה, אותות חוץ תאיים יכולים להפעיל פרופילין כדי לייצר פילמור אקטין מקומי וכך להביא להרחבה של מבנים תנועתיים עשירים באקטין כמו פילופודיה ולמלופודיה.
מה עושה
arp2/3
איפה הוא נפוץ?
ומה הזווית בין הבתעפות אחת לשניה?
Arp2/3
מתיישב על הצד של סיבי אקטין כך שהוא יוצר נוקלאציה לסיב חדש בצורה המסעפת את סיבי האקטין למצב דמוי עץ. למעשה, הקומפלקס יכול להתחבר לסיב אחר של אקטין תוך כדי שהוא נשאר כבול לקצה מינוס של הסיב שעובר נוקלאציה.
הסתעפויות בשיטה זו נפוצות סביב קליפת התא
הסתעפות של 70 מעלות
מה הם התנאים על מנת שיווצר סיב של אקטין?
- נוקלאציה
- יחיטות אקטיביות של אקרטין
מה זה פורמין?
איפה אתר הקושר שלה?
הפורמינים אלו הם חלבונים דימרים הנקשרים לקצה פלוס של סיבים ישרים שאינם מסתעפים. הם מקדמים נוקלאציה של קצה פלוס על ידי תפיסה בחוזקה של שני המונומרים האחרונים שהצטרפו לסיב ובכך מקצרים את הזמן שלוקח למונומרים נוספים להצטרף לקצה פלוס.
לכל יחידת פורמין יש אתר קושר מונומר אקטין, ונראה כי דימר של פורמין יוצר נוקלאציה של קצה האקטין על ידי לכידת שני מונומרים.
מי מבין הקווצות עובר נוקלאציה בכל אחד מהחלבונים:
furmin
arp2/3
פורמין קצה +
arp קצה מינוס
מה מגיא את הקשר של האקטין לפורמין?
אקטין עם פרופילין
איפה נמצא
arp 2/3
ופורמין
ומה תפקידו?
ליד קליפת התא
בעודו עושה זאת הוא מאריך את זמן מחצית החיים של הסיב ומונע ממנו לעבור אינטארקציה עם חלבונים נוספים.
מה עושה טרופומיוזין?
הוא חלבון סיבי הנקשר לצד סיב האקטין ובעצם מיצב אותו כשהוא קשור ל-6 עד 7 יחידות של אקטין בסיב
מה הוא קאפ זי?
סיב אקטין המפסיק להתפלמר ואינו מיוצב באופן ספציפי יתפרק במהירות, בעיקר בקצהו הפלוס כאשר מולקולת האקטין תבצע הידרוליזה ל-,
ATP.
הקישור של חלבון לקצה + מייצבת את הסיב בקצה הזה על ידי הפיכתו לבלתי פעיל, וכך מפחיתה כן את צמיחת הסיב והן את התפרקותו.
מה יוצר בסרקומר את ה-
z line?
cap z
מה עושה טרופומודולין?
מייצב את סיב אקטין על ידי קישור לקצה מינוס ומונע פירוק או הרכבה
מה תפקיד הטקופומודלין בשריר?
כמו כן, הוא הוא ידוע בעיקר בזכות תפקודו בכיסוי של סיבי האקטין בעלי אורך חיים יוצא דופן בשריר.
מי מבין הבאים יכול להשפיע בכמויות קטנות על סיבי האקטין:
טרופו מודולין
טרופומיוזין
טרופומודולין
מה עושים הגלזולינים?
מתי הם פועלים?
איך הם פועלין?
משפחה אחת של חלבוני ביקוע היא משפחת הגלזולינים . חלבונים אלה משופעלים בריכוז גבוה של סידן בציטוזול. גלזולין מבצע אינטרקציה עם צידו של סיב האקטין וכולל דומיינים שנקשרים לשני אתרים שונים – אחד שחשוף לסיב האקטין ואחד נסתר בין תת היחידה הבאה. לפי אחד המודלים, גלזולין קושר את צידי סיב האקטין עד שתנודה תרמית יוצרת מרווח קטן בין שתי תתי יחידות, ובשלב זה גלזולין כמו דוחף עצמו פנימה כדי להגדיל את המרווח הזה ליצירת חריץ גדול יותר, עד שהסיב נשבר לשני סיבים קטנים יותר. בסופו של דבר הגלזולין נשאר קשור לקצה פלוס של הסיב החדש.
מה הוא קופלין?
מה הוא עושה
ולאיפה הוא נקשר?
קופילין הוא חלבון חשוב נוסף המערער את יציבותו של סיב האקטין. הוא מכונה גם
“actin depolymerizing factor”.
עקב היותו פקטור מרכזי המעודד דה-פלמור של אקטין. הוא מצוי בכל האאוקריוטים.
הוא נקשר אל סיב האקטין ו”מכריח” אותו להסתובב (טוויסט) בצורה יותר הדוקה כך שנוצר לחץ מכאני חזק המפריע לאינטראקציה בין היחידות הבונות את הסיב (הלחץ המכאני מחליש את נקודות המגע בין תתי היחידות של אקטין), מה שגורם לסיב האקטין להיות פגיע יותר לשינויי טמפרטורה ולכך שקצוות הסיב הופכים להיות מועדפים לדה-פילמור.
כתוצאה מכך, מרבית חוטי האקטין שבתאים הם בעלי אורך חיים קצר יותר מאשר חוטים הנוצרים מאקטין טהור במבחנה.
קופילין נקשר באופן מועדף לאזורי סיב הקושרים
ADP
על פני אזורים אחרים הקושרים
ATP.
מכאן שהוא נוטה יותר להיקשר לסיבים ישנים יחסית, שכבר עברו הידרוליזה של
ATP.
הנטייה הזו להיצמד לסיבים ישנים הופכת אותו לפקטור חשוב מאד בהפחתת היציבות של סיבים ישנים בזמן זחילה תאית
איך ניתן להגן על האקטין מפני קופילין?
להגן על חוטי אקטין מפני קופילין באמצעות קשירה של טרופומיוזין.
מה מתואר בציור הנ”ל
Stress fibers –
מתכווצים ומפעילים מתח. נוצרים על ידי אקטין ומיוזין 2.
actin cortex –
ממש מתחת לממברנה הפלסמטית אקטין מסודר כרשת דמויית ג’ל. בקליפת התא סיבי האקטין מצויים בזווית גדולה אחד לשני. כדי לייצב את המבנה הזה נעשה שימוש בחלבון הדימרי ספקטרין.
lamellopodia –
רשתות אקטין דנדריטיות המאפשרות בליטת הממברנה. מבנה הלמלופודיה מיוצב על ידי החלבון פילאמין.
Filopodia –
מבנה דמוי מסמר של הממברנה הפלסמטית המאפשר לתא לחקור את סביבתו. בפילופודיה יש צרורות המתוחזקים במקביל ובאותה כיווניות על ידי פורמין.
bundling proteins
מחברים אקטין במערכים מקבילים.
gel-forming proteins
האוחזת שני סיבי אקטין יחד בזווית יחסית גדולה המאפשרת יצירת רשת משוחררת יותר.
כמה דומיינים יש
ל-bulding proteins ול-gel forming proteins?
לשתי הקבוצות הללו יש בד”כ שני דומיינים דומים הנקשרים לסיבי האקטין שיכולים להיות חלק משרשרת פוליפפטיד יחידה או שתי שרשראות שהורכבו ליצירת דימר.
איזה מן החלבונים מחבר את סיבי האקטין בצורה מקבילה ואיזה מהחלבונים מחבר את סיבי האקטין בצורה לא מקבילה, ובאיזה מקרים מיוזין 2 יכול לנוע:
פימברין
אלפא אקטינין
פימברין -מקביל ומיוזין לא יכול לנוע עליו
אלפא אקטינין - אנטי מקביל ומיוזין יכול לנוע עליו
כאשר ישנו חלבון פימברין על האקטין האם סיבי האקטינים יפנו לכיוונים שונים?
איזה סוכ זה חלבון פימברין
לא
פימברין הוא מונומר
מה המרחש שמחזיק הפימרין את סיבי האקטין זה מזה ?
14 ננו מטר
איפה ניתן למצוא אריזה רופפת ולא הדוקה של אקטין
עם פימרין או עם אלפא אקנטין?
אלפא אקניטין
איזה סוג חלבון זה אלפא אקניטין?
הומודימר
באיזה מרחק אלפא אקניטין מחזיק את סיבי אלפא אקטין?
30 ננט מטר זה מזב
מה הוא פילאמין?
מקדם היווצרות של ג’ל אקטין רופף וצמיגי על ידי הידוק שני סיבי אקטין בזווית ישרה זה לזה
כמה אתרים קושרים יש לפילאמין לאקטין
שניים
למה תאים צריכים את הפילאמין?
תאים צריכים את ג’לי האקטין הנוצר על ידי פילאמין בכדי לאריך את מבני הלמלופודיה המסייעים להם לזחול על פני משטחים מוצקים.
מה גורמת מוטציה בפילאמין איי לבני אדם?
אצל בני אדם, מוטציות בגן הפילמין איי גורמות למומים בהגירה של תאי עצב במהלך התפתחות עוברית מוקדמת. הדבר מוביל לכך שתאים מאזור חדרי המוח לא נודדים ליצירת הקורטקס, ובמקום זאת יוצרים גושים, וגורמים לתסמונת הנקראת heterotopia periventricular
ב-MRI
של אנשים בריאים נראה משטח חלק על פני שטח החדרים ואילו אצל הלוקים בתסמונת ניתן לראות משטח מחוספס בקירות החדרים הלטראליים, משטח המייצג נוירוני קורטקס שלא הצליחו לנדוד במהלך התפתחות המוח. ראוי לציין, כי על אף שנוירונים רבים אינם מצויים במקום הנכון, האינטליגנציה של אנשים הלוקים בתסמונת היא לעיתים קרובות תקינה או רק פגועה קלות, והביטוי הקליני העיקרי הוא אפילפסיה המתחילה לעתים קרובות בעשור השני לחיים.
חלבוני פילאמין מקיימים אינראקמיות עם מספר רב של חלבונים תאיים
נכון
למה יכולים להוביל מוטציות של פילאמין?
מוטציות של פילאמין יכולות להוביל גם לפגמים בהתפתחות העצם, מערכת הלב, כלי דם ואיברים אחרים.
מה הוא אוכו של הומודימר פילאמין?
160 נ”מ
מה יוצר ספקטרין?
מה מאפיין אותו?
איזה חלבון הוא?
רשת
ארוך וגמיש
טטראמר בעל שתי יחידות אלפא ושתי יחידות בטא. יש לו שני אתרים קושרי אקטין המרוחקים כ-200 ננומטר זה מזה.
איפה ספקטרין זוהה לראשונה?
מה הוא עושה שם?
ספקטרין זוהה לראשונה בתאי דם אדומים, שם הוא יוצר מעין רשת דו מיימדית המוחזקת יחד על ידי סיבי אקטין קצרים שאורכם המדויק מבוקר היטב על ידי חלבוני
capping
בכל קצה. ספקטרין מחבר את הרשת הזו לממברנה הפלסמטית היות והוא בעל אתרי קישור נפרדים לחלבונים פריפריאליים הרשת המתקבלת יוצרת
cell cortex
המספק תמיכה מכאנית של הממברנה הפלסמטית המונחת עליו, מה שמאפשר לתא הדם האדום לחזור לצורתו המקורית לאחר דחיסתו לאורך הנימים.
.
על שם מי נקרא חלבון
erm?
חלבוני
ERM
נקראים על שם שלושת החברים הראשונים במשפחה –
ezrin, radixin, moesin.
מה תפקיד חלבוני
erm?
מה התפקיד של המואזין?
חלבונים אלו מסייעים בארגון מתחמים בממברנה באמצעות יכולתם לקיים אינטראקציה עם חלבונים טראנסממברנאליים. בכך הם לא מספקים רק קישורים מבניים לחיזוק קליפת התא, אלא גם מבקרים את הפעילות של מסלולי הולכת אותות.
Moesin
גם מגביר את הנוקשות הקורטיקלית כדי לקדם את עיגול התאים בזמן המיטוזה. בניסויים שנערכו מתברר כי כאשר ריכוזו בזמן מיטוזה דליל יותר, ה-
cell cortex
נשארת רכה.
חלבוני
ERM
נחשבים למארגנים את האקטין הקורטיקלי במגוון הקשרים, ובכך משפיעים על צורתו והקשיחות של הממברנה כמו גם על לוקליזציה ופעילות של מולקולות סיגנאל.
כיצד חיידרקים או וירוסים מתגברים על כך שהצטיזול הוא צמיג וקשה לעשות בו דיפוזיה?
אמצעות גיוס והפעלת קומפלקס
Arp 2/3
על פני השטח שלה.
Arp 2/3
, כמו שכבר למדנו, מבצע נוקלאציה לאקטין, הדבר מייצר כוח משמעותי ובכך החיידק נדחף דרך הציטופלסמה בשיעורים של 1 מיקרומטר לשניה
מה קורה בתמונה הבאה?
על גבי המעטפת של החיידק מצוי החלבון
Act-A
אשר משפעל את הקומפלקס
Arp2\3
המבצע נוקלאציה של סיבי אקטין. כך נוצר מעין קומפלקס המחובר לדופן של החיידק. כעת הסיבים מתארכים מקצה פלוס עד אשר יעברו
Capping.
בנוסף, החיידק מגייס את החלבון קופילין אשר גורם לחוסר יציבות בקצה מינוס (למעשה קופילין ממחזר את האקטין ומשפר את הדפולימריזציה בקצה מינוס). כך, בסופו של דבר, מתקבלת צמיחה נטו של הסיב סביב פני השטח האחוריים של החיידק שמניעה אותו קדימה, למשל לכיוון הממברנה של המונוציט וכך הוא יכול להניץ החוצה.
אילו שני סוגים של מיוזים ישנם?
מיוזין 1 – מונומר.
מיוזין 2 – מתארגן כפולימר, סיב עם הרבה יחידות מוטוריות.
איזה מיוזין מייצר את הכוח להתכווצות השריר?
מיוזין 2
מה מכיל מיוזין 2?
מכילה שתי שרשראות כבדות וארבע שרשרות קלות. ה”זנב” של כל שרשרת כבדה נכרך בזנבות אחרים, מה שיוצר כאמור סיבים עבים, דו קוטביים ובעלי כמה מאות ראשי מיוזין בכיוונים מנוגדים בשתי קצוות הסיב העבה.
מה מכיל כל שרשרת כבדה של מיוזין 2?
ומה מכילה כל שרשרת קלה?
כל שרשרת כבדה מכילה “ראש כדורי” בקצה
N
המכיל את המנגנון שמייצר כוח ולאחריו זנב
coiled-coil
ארוך המתווך את הדימריזציה.
שתי השרשראות הקלות נקשרות קרוב לקצה ה-
N
של השרשרת הכבדה. השרשראות הקלות הן משני סוגים שונים, ועל כל ראש מיוזין קיים עותק אחד מכל סוג.
מתי מתרחשת דימריזציה של סלילי
alpha?
הדימריזציה מתרחשת כאשר שני סלילי האלפא נכרכים זה סביב זה ליצירת
coiled-coil
, והדבר מונע על ידי חומצות אמינו הידרופוביות שנמצאות במרווחים קבועים.
לאיזה קצה באקטין המיוזין מתהלך לו?
כיצד הוא עושה זאת?
לקצה פלוס
כל ראש מיוזין נקשר ומבצע הידרוליזת
ATP.
שימוש באנרגיה המשתחררת מההידרוליזה מאפשר למיוזין “ללכת” לכיוון קצה פלוס של סיב האקטין. האוריינטציה המנוגדת של הראשים בסיב העבה הופכת את הסיב ליעיל בעת ההחלקה כאשר מתרחשת הזזת סיבי אקטין מנוגדים, וכך מתאפשר כיווץ שריר.
האם בשרירים החלקים ובשריר הלב יש את אותו מיוזינים?
כן מיוזין מסוג 2
אבל הם מקודדים מגנים שונים
האם אפשר לבצע את הידרוליזת המיוזין גם במעבדה?
כן
מה הוא תהליך הידרוליזת המיוזין?
מיוזין קשור לאקטין כאשר אין אף נוקלאוטיד בתוך הראש הגלובולארי.
כניסה של
ATP
מובילה לשחרור המיוזין מהאקטין.
הידרוליזה מובילה לשינוי קונפורמציה המסובב את הראש של המיוזין.
כאשר הפוספאט יוצא החוצה – נוצרת האינטרקציה מחדש – זהו בעצם ה-
power stroke.
יצאת ה-
ADP
מחזקת את האינטראקציה בין המיוזין לאקטין והופכת אותה להיות קשה
במחזור מיוזין 2 המתואר, הראש נשאר קשור לסיב האקטין רק כ המינוס.
איזה מיוזין נע מפלוס למינוס?
מיוזין 6
האם כמה מיוזינים ביחד יכולים להזיז סיב?
כן
מי מבין שלושת השרירים נחשב להתפתחות מאוחרת אבולוציונית?
שריר לב
שריר חלק
שריר שלד
שריר שלד
מה הם סיבי שריר?
סיבי השריר הארוכים והדקים של שריר השלד הם למעשה תאים בודדים וענקיים הנוצרים במהלך ההתפתחות על ידי מיזוג של תאים נפרדים רבים המכונים מיובלאסטים.
בתא שריר יש רק גרעין אחד מתחת לממברנה הפלסמטית
לא נכון בתא שריר יש גרעינים רבים מתחת לממברנה הפלסמטית
מה הגודל של תא שריר באדם בוגר?
אצל אדם בוגר קוטרו של תא שריר עומד על כ-50 מיקרומטר ויכול להיות באורך של כמה סנטימטרים.
הציטופלסמה מורכבת בעיקרה ממיופיברילים, האלמנטים הכיווציים הבסיסיים של תא השרירי.
מה מורכבת הציטופלסמה של תא שריר?
ממיופיברילים, האלמנטים הכיווציים הבסיסיים של תא השרירי
מה הוא מיופיבריל?
הוא מבנה גלילי בקוטר 1-2 מיקרומטר שלרוב הוא ארוך כמו תא השריר עצמו. הוא מורכב משרשרת ארוכה וחוזרת של יחידות זעירות המכונות סרקומרים, שכל אחת מהן אורכה כ -2.2 מיקרומטר , המעניקות למיופיבריל של החולייתנים את מראהו המפוספס.
מה הסרקומר מכיל?
מיוזין 2 ואקטין – סיבים עבים, שהם סיבים של מיוזין 2, וסיבים הדקים שהם סיבים של אקטין.
טרופומודולין ו-
CapZ –
שימו לב שסיב האקטין מוקף משני הכיוונים שלו. מקצה מינוס על ידי טרופומודולין, ומקצה פלוס על ידי
CapZ.
Z דיסק –
מורכב כמובן
מ- CapZ
אבל גם מהחלבון אלפא-אקטינין. הדיסק מונע דפולימריזיצה של אקטין תוך שהוא מחזיק אותם יחד בצרור במרווחים קבועים.
טרופומיוזין – על גבי סיבי האקטין מצוי טרופומיוזין המייצב את מבנה הסיב.
טרופונין – חוסם את אתר הקישור של מיוזין לאקטין. בפיזיולוגיה נדון עליו בהרחבה ונראה כיצד הוא מבטיח שהמיופיבריל יגיב במהירות לעלייה בריכוז הסידן.
נבולין – חלבון נוסף שניתן למצוא בסרקומר הוא
Nebulin
הנמתח מה-
Z disc
עד לקצה מינוס של האקטין, והוא שומר על האורך המדוייק של סיב האקטין. גם נבולין הוא חלבון עצום בגודלו, והוא מורכב ממוטיב חוזר קושר אקטין, מוטיב של של 35 חומצות אמינו.
טיטין – החלבון הגדול ביותר בטבע. הוא משתרע מה
Z דיסק לקו האמצע , מרחק של יותר מ- 1 מיקרומטר. החלבון הסופר חשוב הזה, מכיל דומיינים של
immunoglobulin-like
ומשמש כקפיץ מולקולרי כך שהדומיינים הללו שלו יכולים לעבור
unfolding
בזה אחר זה בזמן ההתכווצות, מה ששומר על הסיב העבה של הסרקומר ומאפשר לסיבי השריר להתאושש לאחר שנמתחו יתר על המידה. .
מתי מיוזין 2 יקשור
ATP
ומתי
ADP
בתאי שריר?
במצב רפוי, סיב המיוזין קושר
ATP
ואילן בזמן הכיווץ, כאשר הוא יוצר אינטראקציה עם האקטין הוא קושר
ADP