MIcrobiote Flashcards
Nombre cell humaine, bacteriennes (total, GI humain, mammifere
10^13 cellules humaines
5 x10^30 cellules bactériennes
10^14 bactéries GI/humain Poids: 1 à 2 kg
10^12/g Intestin mammifère
Definition de microbiote
Microbiote intestinal: ensemble des micro organismes (bacterie, levure) résidant dans le tube digestif
Definition de microbiome
Microbiome: ensemble du matériel génétique contenu dans les micro-organismes (et dans leur environnement, metabolites), susceptible d’avoir un impact sur l’hôte = 10 millions de gènes par hôte.
Definition de etude metagenomiques,
Étudier le microbiome à grande échelle nécessite des études métagénomiques
Definition de etude metabolomiques,
Étudier les produits du microbiote à grande échelle: études métabolomiques
Definition de prebiotiques
Prébiotiques : Substrats nutritionnels favorisant la
croissance de microbes bénéfiques pour la santé de l’hôte. (forme de fibre)
Definition de Probiotiques
Micro-organismes vivants qui confèrent des bénéfices pour la santé lorsqu’ils sont administrés en quantité adéquate à l’hôte.
Définition OMS (2012): Micro-organismes vivants qui confèrent un bénéfice à l’hôte, lorsque donnés en quantité appropriée.
bénéfice important dans la definition
fonction du microbiote
metabolisme acid biliaire (primaire a secondaire)
fermentation (carbohydrates, amino acid, phytate, mucus en acide gras a chaine courte (SCFA/BSCFA)
- Extraction des nutriments et production énergétiques des aliments via des activité enzymatiques et biochimiques
-Biosynthèse des molécules bioactives tels que les vitamines, acides aminés, lipides dépendent du microbiote intestinal
degradation acide aminee
niveau immunitaire
-Production de substances anti-microbienne
- Développement de la muqueuse intestinale et du système immunitaire
- Stimulation reponse immunitaire
Microbiotes les plus importants
1 - intestinale
2- Oro-pharynge
3 - cutanee/ vaginale
Phylum du microbiote intestinale
Firmicutes 26 066
Bacteriodetes 12 203
Proteobacteria 657
Verrucomicrobia 607
Actinobacteria 554
Autres 55
aussi fungi ( candida, saccharomyces, malassezia, cladosporidium)
Principales Firmicutes (presente sur slide)
CLostridium et lactobacillus
Principales Bacteriodetes (presente sur slide)
Bacteroides
Principales Actinobacteria (presente sur slide)
Bifidobacterium
Composition aérobies et anaérobes du microbiotes intestinales
organismes aérobies = proximale ( estomac)
anaérobes = distale (colon)
ex: proteobacterie (enterobacteries) dans grele mais pas colon (bacteroides)
Characteristique d’un microbiote en sante
En bonne conditions, le microbiote est résilient, stable et a des interactions symbiotiques avec l’hôte
Un microbiote en santé est riche , diversifié et stable
Le microbiote intestinal varie selon l’âge et les facteurs environnementaux
Vers l’âge de 3 ans, le microbiote de l’enfant est comparable à celui d’un adulte avec les 3 principaux phylum:
– Firmicutes, Bacteroidetes et Actinobactérie en dominance
Changement microbiotes chez personnes plus agees
diminution des Bifidobactérium et une augmentation des Clostridium et Proteobactériées.
– Cette diminution des Bifidobactérium vient réduire le système immunitaire.
Est ce que la methode d’accouchement change le microbiotes
oui, vaginal contact bacterie probiotiques
cesarienne microbiote cutane/oral qui amene plus de risque maaldies infectueuse/atopiques/immunes
Est-ce que le microbiote est varie par personne
oui
Facteurs influençant composition (2019):
– Génétique de l’hôte
– Géographie
– Diète (végétaux surtout)
– Sommeil
– Activité physique
– États pathologiques autres, antécédents
– Histoire personnelle et sociale: stress important, voyage/migration, interactions sociales
– Médicaments
Que veux dire dysbiose
microbiote abnormal (pas riche/ diversifie ou stable/equilibre), potentiel pro-inflammatoire
Comment le microbiote peu influence l’activite de l’hote
– Régulant l’expression de gènes humains
– Produisant des composés actifs
(neurotransmetteurs, métabolites, hormones,
composés pro- ou anti-inflammatoires)
– Éliminant des substances de l’hôte
– Autres effets non élucidés
effets de L’absence de microbiote
– Métabolisme altéré: perte de poids
– Susceptibilité diminuée à l’anxiété et dépression
– Diminution de l’immunité
– Motilité GI altérée
Mécanismes d’action Probiotiques
– Effet immunomodulatoire: production de cytokines antiinflammatoires (TGF-beta et IL-10) et inhibition de cytokines pro-inflammatoires (TNF) et lymphocytes
– Modulation de la barrière épithéliale (perméabilité)
– Suppression de la croissance ou invasion par pathogènes
– Modulation de la perception de douleur (expression des récepteurs opioïdes et cannabinoïdes)
Probiotiques: contre-indications
Toutes sont relatives
■ Intolérance au lactose: souches de Lactobacilles
■ Allergie aux levures: S. Boulardii
■ Attention à la contamination par gluten pour les patients atteints de la maladie cœliaque
■ Immunosuppression sévère, patients critiques et prématurés en période néo-natale: case reports de fungémie à S. cerevisiae et septicémie à Lactobacillus
– Plusieurs succès de probiotiques et transplantation fécale chez transplantés rénaux et hépatiques
Différentes techniques d’administration Transplantation de selles
Lavement
Tube nasojéjuna (nasoduodénal Gastrostomie / colonoscopie
Stomie
