Microbiologie 5 Flashcards
Cmb il y a de décès lié aux infections chaque année et cela représente quel pourcentage des décès
9 millions, 16%
Est ce qu’il y a une diminution ou une augmentation de la mortalité causé par les infections
diminution, car émergence de la tri-thérapie
vrai ou faux
la mort de 1,27 millions de personnes est directement attribuables à la résistance aux antimicrobiens
vrai
Différence entre réplication, transcription et traduction
on réplique ADN
on refait l’ADN à partir du simple brin pour en faire un double
on traduit l’ADN avec un ribosome pour faire une prot
Nomme les mécanismes que les bactéries utilisent pour développer une résistance aux antibiotiques
- Altération de la perméabilité de la membrane donc les antibiose n’ont pas accès à la cible
- Modification ou destruction des antibio
- modification ou remplacement de la cible
Nomme les principales cibles des antibios
paroi et synthèse des protéines en touchant la sous unités 30S et 50S des ribosomes
à quoi s’attaquent les beta-lactamine
peptidoglycan des parois bactériennes
Les bactéries ne possède pas de noyau donc ou se retrouve leur matériel génétique
nucléoide qui est un empaquetage qui se promène librement dans la cellule
Que sont les plasmides et ils codent pour quoi
éléments extra chromosomiques capable de se répliquer de manière autonome et normalement ils ne codent pas pour des fonctions essentielles à la cellule, mais peuvent contenir des infos qui permettent la résistance aux antibios à la cellule, une capacité métabolique supplémentaire, des facteurs qui favorisent l’infection, etc q
Comment se divisent les bactéries
fission binaire
Quels sont les principales composants anatomiques entre les eucaryotes et les procaryotes qui peuvent être exploités par les antibio
ribosome
nucléoide
paroi
vrai ou faux
tous les bactéries peuvent se faire éradiquer par le même antibio
faux, chaque bactéries réagi de manière différentes aux antibios, car elles n’ont pas toutes les meme propriétés
Que se passe il a partir des années 1990 au niveau de la découverte des antibios
vide
Explique l’importance de la longueur du génome pour les bactéries
une bactérie qui a un génome court, encode moins de gènes, donc capacité limitées qui obligent ces bactéries à être plus dépendantes de l’hôte pour leur survie
Nomme les 3 types de gènes présentes sur les chromosomes d,ubne bactérie
virulence
essentiel
résistance
Cmb de chromosome on la plupart des bactéries
1 et circulaire
Quels sont les types de gènes présents au niveau du plasmide
virulence et résistance (taille entre 1 et 1000 kilo paire de base)
Est ce que E. Coli a un gros génome
oui, ce qui explique ses bonnes propriétés bactériennes
Définition pangénome
ensemble des gènes qui peuvent se trouver dans au moins une source d’une espèce bactérienne
génome de base + génome accessoire
Définition génome de base
gènes commun à toutes les souches d’une meme espèce
Définition génome accessoire
gènes retrouvés dans certaines souches mais absents Chez d”autres souches, souvent plus de génome accessoire que de génome de base
le pangénome est un réservoir potentiel de quoi
résistance, virulence, antigènes de surface, métabolisme divers
Cmb de temps dure une génération par fission binaire
environ 20 min
Que se passe il lors de la fission binaire
il y a répartition égale des copies des chromosomes entre les cellules filles mais pas tjrs équitable pour les plasmides
vrai ou faux
afin de minimiser ses dépenses énergétiques, la bactérie n’active un système que si elle en a besoin
vrai, tjrs perte a produire ce qu’il faut pour répondre rapidement
Quel est le coeur de la régulation bactérienne
régulation trasncriptionelle par le biais d’activateurs et de represseurs (changement dans le nb de transcrits) important mécanisme pour la résistance.
Définition promoteur VS opérateur
séquence en amont qui permet la transcription du gène en ARNm, requise pour amorcer la transcription
VS
séquence adjacente à un groupe de gène, reconnue par une protéine régulatrice, contrôle la transcription de ce gène ou groupe de gène
Définir répresseur VS activateur
protéines qui inhibe la transcription d’un gène en se liant à une séquence spécifique de nucléotides de l’ADN
VS
protéine qui stimule a transcription d’un gène, souvent reconnaissance de séquence situé à proximité du promoteur
Que nécessite la régulation bactérienne de l’expression des gènes
processus actif qui exige que la cellule soit dans un état métabolique ment actif, la régulation est un processus comprenant des boucles de contrôle comme dans le cas de l’autorégulation
Nomme les types de contrôles de la régulation trasncriptionnelle
négatif (répresseur, inducteur ou répressible)
positif (activateur, inducteur ou répressible)
Nomme les 4 type de régulation
simple : un promoteur contrôle un gène
dans un opéron : un seul promoteur pour contrôler plusieurs gènes adjacents
par un régulon : une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits dans le génome
par un stimulon : controle de plusieurs gènes non contigus par un mec stimulus
Mutation spontanée VS induite
causé par actions des radiations naturelles ou erreurs survenues lors de la réplication, rare
VS
causé ;par agents physiques, chimiques et biologiques (agents mutagènes), + fréquent
Nomme les types de mutations
substitution (silencieuse, non sens, faux sens )v, délétion, insertion, réarrangement,
vrai ou faux
la pression sélective me crée pas la mutation, la mutation survient avant et au hasard puis la pression sélective s’exerce
vrai, dou la résistance aux antibiotiques
Quels sont les types de réparation d’ADN utilisé par la cellule
réparation directe ADN
réparation excision
réparation recombinaison
réponse SOS ( stimule le transfert de gene)
réparation sujette à erreur (induit des mutations parfois)D
Définition phénotype
effet observable d’une mutation
Que donne phénotype + sélectionnable
effet sur une population
vrai ou faux
certaines bactéries nécessite une concentration plus grande de rx pour être éradiqué
comment on nomme cet mesure
vrai, c’est la fenêtre de sélection par antibiotiques
y a til bcp d’étude pour conclure sur la réduction de la durée de l’antibiothérapie
non
Qu’arrivera il si on utilise de manière excessive les antibio
danger de résistance des microbes accrue, d’ou l’Émergence due projet balance qui veut être une source d’info pour maximiser les effets de ces rx et diminuer les effets néfastes au minimum
Vrai ou faux
certains antbio peuvent activer les systèmes de réparation d’ADN des bactéries
vrai
Quels sont les 3 mécanismes qui permettent aux cellules d’échanger de l’information génétique de manière horizontale entre elle
conjugaison ( rapprochement physique de 2 bactérie une donatrice et une réceptrice qui s’échange une partie de gène), + fréquent , transfert unidirectionnel
transformation (résidus d’ADN d’autres bactéries qui entre dans la bactéries en vie)
transduction (bactériophages qui empaquete accidentellement du matériel génétique appartenant à la cellule hôte et ainsi transférer certaines gènes bactériens de manière horizontale)
Définition de compétence
capacité d’une bactérie à être transformé par de l’ADN externe, permet la résistance aux antibio
Nomme une espèce ou la compétence est naturelle
s, pneumoniae
vrai ou faux
la transformation est plus efficace dans les bactéries venant dune meme espece ou qui sont cousines
vrai
Comment les antibio contribuent à la transformation
impose une pression sélective aux bactéries transformé par des gènes de résistance
stimulus externe qui induit la compétence
favorise la lyse des cellules, libérant ainsi de l’ADN servant à la transformation
définir mobilisation
lorsque pendant le processus de conjugaison, on transfert des plasmide non conjugatif
Définition bactériophage ou phage
virus qui parasite uniquement les bactéries
Nomme les cycles de vie possible des bactériophages
lytique (virulent, strictement lytique) : entraine la mort des cellules bactériennes
lysogénique (tempéré) : entre dans la cellule sans la détruire et intègre leur matériel génétique ou il sera répliqué comme une partie intégrante du génome
chronique : sortir de la cellule bactérienne sans la lysr=er, infecte la bactérie demanière chronique, peuvent se faire reproduire sans tuer la bactéRie
Définition prophage
lorsque le génome du bactériophage est rendu dans la cellule bactérienne
Comment se nomme l’enveloppe protéique du bactériophage qui renferme son matériel génétique
capside
Quels sont les 2 types de génome du phage
spécialisée: rare mais peut se propager par la suite, génome hybride phage-bactérie est créé quand le génome du propage est improprement excisé du génome de l’hôte
généralisée : + fréquent mais ne peut se propager, résultat de l’empaquetage accidentel uniquement de fragments de l’ADN de l’hôte à l’intérieur d’une capside de phage
Définition transposition
mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une meme cellule, requiert un certaine proximité physique avec les diff.rents nucléotide concerné
nomme les 3 classes de transposons
séquence insertion
transposons complexe : importance médicale pour résistance
phages transposable
Que sont les intégrons
éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègre les uns à la suite des âtres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément
vrai ou faux
il y a 10 fois plus de bactéries dans le corps que de cellules nuclées
vrai, 500 à 1000 espèces bactériennes différentes, nb total de gène du microbiome > 150x le nb de gènes humains
pharmacomicrobiomique VS pharmacoécologie
effets des microbiomes sur rx VS effets de srx sur la composition et la fonction du microbiome
est ce que les infections à c diff demeurent stables
oui
Quel est le système le mieux connu qui protège les bactéries contre l’invasion d’ADN étrangers
système de restriction-modification de classe 2
Quels sont les 2 composantes du système restriction-modification de classe 2
enzyme méthylase : modifie ADN de l’hôte à certaines séquence spécifique pour le protéger d’une digestion éventuelle par la seconde composante du système
nucléase de restriction : détruit ADN étrangé non méthylé ce qui restreint l’entrée de matériel génétique nouveau
Quel est le second système plus spécifique de la restriction des échanges au niveau bactérien
CRIPR/cas
Qu’est ce que le CRISPR/Cas
quand un nouveau otage infecte une bactérie, le système incorpore une courte séquence dérivée du génome du phage, pour conserver une mémoire spécifique des infections passées, ces séquences peuvent générer des courtes molécules d’ARN CRISPR qui patrouillent l,intérieur de la bactérie à la recherche de séquence de phase complémentaire, s’il y a reconnaissance l’ARN CRISPR guide la protéine Cas qui coupera ADN étranger pour prévenir infection de la bactérie
Comment se faut il qu’il existe des barrière à l’échange de gènes de résistance
car dans le sol par exemple, il y a moins de mobilité que dans l’humain et moins de sélection
Nomme quelques produits sur le marché qui sont synthétisés par les bactéries et d’autres types de cellules
GH
insuline humaine
alpha 1 anti-tripsyne
EPO
…
Quelques infos à propos du PCR
il y a des milliards de copies qui deviennent détectables, haut niveau d’amplification spécifique des acides nucléique, donc pas besoin de multiplier une culture pure
en effet, on chauffe pour dénaturer , par la suite on fera l’appariement des amorces et de l’élongation pour obtenir de plus en plus de copies puis on recommence ces étapes
Que peuvent faire les professionnels de la santé pour prévenir et combattre la propagation de la résistance aux antibio
prévention (hygiène, epi, etc)
ne prescrire et délivrer des rx seulement si nécessaire
signaler les infections résistantes aux antibios
parler aux patients de la bonne prise des antibios et des dangers d’un usage abusifs
parler aux pt de la prévention des infections
OMS: optimiser l’usage des anti-microbiens
