Microbiologie 2 Flashcards
les tests de labo qui permettent d’identifier les microbes sont surtout…
phénotypique
Quelle est la terminaison qui désigne une bactérie ?
aceae
Nomme les rangs taxinomique pour la classification du vivant
vie, domaine, règne, embranchement, classe, ordre, famille, genre, espèce, souche
Quels sont les 3 domaines de la vie?
eucaryotes (avec noyau)
procaryote (sans noyau) : bactéries, archéesQ
Lequels ont normalement la plus grande taille: eucaryote ou procaryote ?
eucaryote
Qu’est ce que le terme microorganisme englobe ?
bactérie, virus, mycèts et protozoaire
Quelles sont les caractéristiques commune des microbes?
petite taille
abondance dans la nature
unicellulaire (virus acellulaire)
organisation simple
inclut les procaryote et les eucaryotes
disposent d’un potentiel métabolique, sauf virus
reproduction de manière autonome, sauf virus
Qu’est ce qu’un procaryote
cellule simple sans membrane nucléaire, pas de noyau, généralement un seul chromosome libre dans le cytoplasme = bactéries
Que sont les archées
morphologie cellulaire de type procaryote, composition particulière des ribosomes, lipides membranaires unique (éther lipide), et paroi chimiquement différente, peuvent vivre dans des conditions extrêmes
parfois métabolisme unique comme production de méthane
Quels sont les eucaryotes qui peuvent être pathogènes pour l’humain
mycètes, vers helmintes, protozoaire
Nomme quelques caractéristiques des bactéries
membrane cellulaire dephospholipides, unicellulaire, petite taille, peut former des filaments, abondantes dans l’eau le sol et le système digestif
possèdent de l’ADN et de l’ARN et se réplique de manière autonome
Quels sont les règnes des eucaryotes
protiste, mycète (fungi), plante, animaux
Explique la nomenclature des procaryote
nomenclature binomiale = genre + espèce, le mot qui désigne le genre commence par une majuscule et c’est un nom tandis que le deuxième mot est un adjectif
Vrai ou faux
les procaryotes n’ont pas de règnes définies
vrai
ou se situent les virus et les prions ?
agents infectieux acellualire qui ne sont pas vivants, leur spectre d’hôte est souvent limité à une seule espèce
comment les virus peuvent se répliquer
ce sont des répliquons semi-autonomes, ils ont besoin d’infecter une cellule hote pour se faire répliquer par la machine cellulaire, une fois répliqué ils peuvent migrer hors de la cellule de l’hôtel initiale et aller en infecter une autre
Que sont les prions
ce ne sont pas des réplicons, ce sont des agents pathogènes de nature protéique dépourvus d’acide nucléique, un prions infectieux entraine une cascade de changements de conformations des protéines saines et provoque des dommages aux cellules infectées (accumulation de protéines anormales ce qui fait du dommage au niveau du système nerveux)
lest virus et prions appartiennent a quels domaines et règnes
aucun ils ne sont pas considérés comme vivant
Décrire l’anatomie d’un virus
soit fait avec ARN ou ADN, qui sont entouré d’une capside
Que sont les mycetes (fungi ou champignonsÀ)
plus complexe que les bactéries, ne sont pas nécessairement pathogènes mais peuvent infecter des gens qui on un déficit immunitaire
Quels sont les deux catégories de mycetes
levures : mycètes unicellulaire qui se reproduit pat bourgeonnent, peut causer des infections chez l’humain
moisissures: champignons multicellulaires qui peuvent se présenter sous forme filamenteuse ou dimorphe, certaines peuvent être toxiques
Que sont les protozoaires
eucaryotes unicellulaires (protistes) qui causent des infections, ils viennent dans l’eau, dans les sols humides et dans les organismes
qu’inclût le terme parasite
protozoaire, arthropode, helmintes
Différence entre infestation et infections
externe (ectoparasites) vs interne (endoparasites)
organisme macroscopique non microbien VS microorganisme invisible à l’oeil nu
Quels sont les constituants internes d’une bactérie
cytoplasme, ribosome, matériel génétique constitué d’ADN sous forme libre mais aussi de fragments d’ADN qu’on appelle plasmide
Vrai ou faux
les ribosomes humains sont identiques aux ribosomes bactériens
faux, les ribosomes bactériens possèdent des sous unité 0 s et 30 s qui ont une structure et composition distincte, ce qui est exploitable pour l’antibiothérapie
Que peuvent engendrer les plasmides
peuvent conférer au bactéries des capacités leur permettant de résister au antiobio, porteur de gènes au propriétés pathogènes
Qu’est ce que la paroi cellulaire
structure unique aux bactéries, enveloppe semi-rigide qui donne la forme à la bactérie
Pourquoi le peptidoglycane est une bonne cible pour les antibiotique
car on ne retrouve pas cette protéine au niveau des cellules humaines
Discute de la différence des parois chez les bactéries gram négatif vs positif
+: paroi constitué en partie d’un épais peptidoglycan
-: couche de peptidoglycan très mince mais recouverte d’une seconde couche appelée membrane externe qui contient des lipopolysacharides (endotoxines, antigène O) et des canaux appelés potines, cette membrane supplémentaire limite l’accès à certains antibiotiques
Quelles sont les 3 enveloppes qui entourent les bactéries
membrane cytoplasmique
paroi cellulaire
matériel extracellulaire (capsule, glycocalyx, couches)
De quoi est composée la membrane cytoplasmique et quels sont ses rôles
bicouche de phospholipide, protéines transmembranaires
barrière osmotique : contrôle les taux ioniques
transport: régulation des échanges internes/externes
enzyme: métabolisme énergétique
Qu’est ce que la capsule d’une bactérie ? (antigène K)
enveloppe visqueuse d’Épaisseur variable, pas visuel en microscopie, pas indispensable, empêche la phagocyte par les cellules immunitaires en favorisant l’adhérence des bactéries aux cellules épithéliales de l’hôte, fait de polysaccharides
Qu’est ce que le glycocalyx
feutrage extracellulaire de fibres de polysaccharides, permet l’adhésion aux surfaces et aux bactéries entre elle (c’est dailleurs dans ce cas qu’on appelle par ce nom) sinon on dit capsule
Qu’est ce qu’un biofilm
communauté de plusieurs cellules attachées ensemble et le biofilm les protège en agissant comme une barrière physique, métabolique, active et génétique contre les agents externes comme les antibiotiques
vrai ou faux
le glycocalyx contribue à la formation de biofilm
vrai
Nomme les deux types d’appendice externes commune chez lez bactéries
pili
flagelles
Que permettent les flagelles a une bactérie
mobilité, antigène H
Qu’est ce qu’un pili ? fimbriae
apparence de pilosité au niveau d’une cellul, plus courts que les flagelles et permet aux bactéries de s’attacher aux surface
Nomme les différents type de flagelle et les décrire (diapo 34 pp 1)
monotriche
amphitriche
lophotriche
péritriche
Qu’est ce qu’un pili conjugatif ?
pili spécialisé dans le transfert de plasmide, d’ADN, mécanisme de conjugaison
Que sont les spores (endospore)
spores intracellulaires dans laquelle la cellule préserve son matériel génétique en se débarrassant du reste dans des périodes de survie, d’ou la possibilité de résistance aux antibiose
Quand s’active et se désactive une spore ?
quand les conditions deviennent défavorables, le processus de sporulation s’enclenche et inversement le processus de germination, (une fois la spore fait)
seule la forme germinative est pleinement active et capable de se reproduire et d’avoir une activité pathogène
Souvent, comment sont disséminés les bactéries en dormance dans l’environnement ?
grâce à leur spore
vari ou faux
les spores des mycètes sont semblables aux spores des bactéries
faux
Nomme des maladies qui se dissémine grâce aux spores
gangrène, tétanos, botulisme, anthrax, intoxication alimentaires
Quels sont les composants obligatoires d’une bactérie
paroi cellulaire
membrane plasmique
cytoplame
chromosome
ribosome
Quels sont les composants facultatifs d’une bactérie
capsule
endotoxines
plasmide
flagelle
pili
spore
corps d’inclusion/granule
Nommez les différents types de taille et de forme que peut prendre une bactérie
bâtonnets : bacilles coccobacilles
sphères: cocci-coque
spirale : vibrio (virgule), spirochète (tire-bouchon)
difformes: pléimorphes
Nommez les différents type d’arrangement spatial qu’une bactérie peut prendre
voir diapo 48 pp1 pour image
individuelle
paire (diplo-)
chainettes : strepto-
amas
Nomme les formes, l’élévation et les bord possibles qu’une colonie peut prendre
diapo 51
formes : punctiforme, circulaire, filamenteuse, irrégulière, rhizoide, fusiforme
élévation: plane, élevée, convexe, bombé, bossue
bord: régulier, ondulé, lobé, filamenteux, bouclé
Qu’est ce qu’un colorant simple
solution aqueuse ou alcoolisée d’un seul colorant basique pour faire ressortir la cellule en entier (bleu de méthylène, safranine, violet de cristal, fuchsine)
Explique la coloration de gram
coloration primaire avec cristal violet que tous les cellules absorbent,
lavage avec solution d’éthanol ou d’acétone ce qui décolore seulement certaines bactéries qui étaient au préalable violette
on soumet le frottis à la safranine
visualisation finale : rose = gram - violet = gram +
Quels colorants on utilise pour les mycobactéries
Zhiel-Neilsen : fuchsine et contre colorant de bleu de méthylène
Nommez la coloration pour visualiser ces structures :
capsule
endospore
flagelle
mélanger les bactéries à l’encre de Chine
vert de malachite et safranine comme contre colorant
mordant
Qu’est qu’un mordant
agent chimique qui intensifie la coloration
Quelles sont les 3 types de microscopies
optique (champ clair, fond noir, contraste de phase, fluorescence)
confocale (usa de fluorochromes et laser, meilleure image )
électronique (usage d’électrons, très précis, 2D ou 3 D)
Lors de tests biochimiques quels sont les paramètres évalué dans chaque éprouvette
source de carbone
aérobiose vs anaérobiose
potentiel de fermentation
produit terminaux du métabolisme
tolérance aux inhibiteurs métaboliques et antiobiotiques
Qu’est ce que la méthode d’identification des bactéries par spectrométrie de masse (MALDITOF)
identifie et quantifie les molécules d’intérêt en mesurant leur masse, mélange de la colonie et d’une matrice chimique qui favorise son ionisation, un laser ionise le frottis et identifie le tout
requiert une culture pure des bactéries, suivie de l’obtention d’un spectre de masse, identification complète et précise de la majorité des bactéries d’intérêt médical en à peine plus d’une journée, certaines levures peuvent aussi être identifié
Différence entre test sérologiques et test antigénique
permet de savoir s’il y a eu une infection depuis un certain temps en reconnaissant des anticorps spécifiques VS permet de savoir s’il y a une infection actuellement et le type de microbe en culture en reconnaissant des antigènes microbiens
Qu’est ce que le test d’agglutination sur lame
incorporer les échantillons de colonie bactérienne dans des gouttes de solution saline placés sur différentes lames, on ajoute ensuite un antisérum à chaque lame
Que permet la méthode ELISA
de rechercher un antigène ou des anticorps formé contre cet antigène, usage d’une plaque 96 puits
Sur quoi est basé le test immunochromatographie rapide
sur la mobilité d’un liquide dans une membrane poreuse
Qu’est ce que le TAAN
test d’amplification génétique qui consiste è identifier une séquence signature dans une région et incorporer des oligonucléotides qui permette la détection de la bactérie recherchée directement
il existe des trousse de détection d’un seul microbe et des trousses syndromiques et en détecte plusieurs simultanément
la technologie TAAN la plus répandue dans les hôpitaux est le PCR
Qu’est ce qui distingue les virus des autres organismes
très petit, simple, acellulaire, capside, acide nucléique + emballage, des fois enveloppe lipidique
ARN ou ADN, aps les 2
parasites obligatoires : pas de reproduction autonome
cycle de réplication de l’hôte: culture via cellule hôte seulement, tx par agent antiviral
les noms des virus contiennent ils une majuscule
non
les mycètes ou fungi de type levures peuvent produire des pseudohyphes, c’est à dire
reproduction par bourgeonnement
les mycètes ou fungi de type moisissures se reproduisent le plus souvent comment
spores asexuées volatiles
Quelle est la différence d’une culture sur gélose entre les levures et les moisissures
colonie lisses et muqueuses VS colonies chevelues et poudreuse
Nomme des exemples de maladies causés par des protozoaire
toxoplasmose, giardiase, malaria