M4S4 Classification des enzymes Flashcards
• Connaître les grandes classes d’enzymes
Comment est construit le nom des enzymes ?
Le nom de la plupart des enzymes est construit en ajoutant le suffixe -ase au terme qualifiant la réaction et la nature du substrat.
Exemple : pyruvate déshydrogénase.
Cette enzyme catalyse la déshydrogénation du pyruvate.
Certaines enzymes sont désignées par leur nom usuel.
Exemples : pepsine, trypsine.
Qu’est ce que la Enzyme commission numbers / nomenclature EC ?
Cette nomenclature officielle se base sur le type de réaction catalytique.
Chaque enzyme est représentée par un code constitué des lettres E.C. suivies de quatre chiffres (E.C.X.X.X.X).
A quoi correspondent les chiffres de la nomenclature EC ?
Les enzymes sont réparties en six classes principales (premier chiffre) correspondant aux principaux types de réactions.
Les chiffres suivants précisent :
– la nature du groupement donneur d’électrons sur lequel l’enzyme agit ;
– la nature du groupement accepteur d’électrons ;
– le numéro de série dans la catégorie.
Exemple : malate déshydrogénase E.C.1.1.1.37
1 : oxydoréductase
1 : donneur d’électrons = fonction alcool secondaire
1 : accepteur d’électrons = NAD+
37 : 37e enzyme de la catégorie E.C.1.1.1
Qu’est ce qu’une oxydoréductase ? Quel est le code EC? Que nécessitent elles ?
E.C.1
Ces enzymes catalysent des réactions d’oxydoréduction, c’est-à-dire le transfert d’électrons accompagnés ou non de protons.
Leur fonctionnement nécessite la présence d’un coenzyme d’oxydoréduction (NAD, NADP, FAD).
Quelles enzymes sont comprises dans la classe des oxydoréductases ? Exemple
- les déshydrogénases,
- les réductases,
- les oxydases,
- les oxygénases,
- les péroxydases…
Exemple : lactate déshydrogénase (E.C.1.1.1.7)
Lactate + NAD+ ⇄ pyruvate + NADH + H+
Qu’est ce qu’une transférases ? Code E.C.?
E.C.2
Ces enzymes catalysent des transferts d’atome ou de groupements d’atomes d’une molécule à une autre.
Quelles enzymes sont comprises dans la classe des transférases ? Exemple
- les transaminases (E du foie)
- les aminotransférases,
- les méthyltransférases,
- les kinases,
- les transaldolases,
- les transcétolases…
Exemple :
aspartate aminotransférase (ASAT, E.C.2.6.1.1)
Acide aspartique + a-cétoglutarate ⇄ oxaloacétate + acide glutamique
Le groupement transféré est le groupement amine -NH2.
Qu’est ce qu’une hydrolases ? Quel code E.C.?
E.C.3
Les hydrolases catalysent l’hydrolyse de diverses liaisons.
Une hydrolyse est la rupture d’une liaison covalente nécessitant une molécule d’eau.
Quelles enzymes sont comprises dans la classe des hydrolases ? Exemple
- les enzymes digestives (protéases, peptidases, lipases, amylases, glucosidases…),
- les phosphatases,
- les estérases,
- les amidases…
Exemple :
triacylglycérol lipase ou lipase hormonosensible (E.C.3.1.1.3)
Triacylglycérol + H2O → diacylglycérol + acide gras
Quelles enzymes sont comprises dans la classe des Lyases ? Exemple
- les aldolases,
- les décarboxylases,
- les hydratases,
- les déshydratases,
- les synthases.
Exemple :
fumarase (E.C.4.2.1.2)
Fumarate + H2O ⇄ malate
Une molécule d’eau est ajoutée sur une double liaison, la fumarase est une hydratase
Qu’est ce qu’une Lyases ou synthase ? Code E.C. ?
E.C.4
Les lyases catalysent la coupure d’une liaison covalente, sans intervention d’eau, en créant une double liaison.
Dans la réaction inverse, elles catalysent l’addition d’un groupement fonctionnel sur la double liaison d’un substrat, sans apport d’énergie à partir d’ATP.
Quelles enzymes sont comprises dans la classe des isomérases ? Exemple
- épimérases,
- les mutases,
- les tautomérases,
- les racémases.
Exemple :
phosphoglucose isomérase ou glucose-6-phosphate isomérase (E.C.5.3.1.9)
Glucose-6-P ⇄ fructose-6-P
Qu’est ce qu’une isomèrases ? Quel code E.C. ?
E.C.5
Les isomérases catalysent des réactions d’isomérisation, c’est-à-dire des changements de configuration du substrat sans changement de la formule brute.
Qu’est ce qu’une ligase ? Quel code E.C. ?
E.C.6
Elles catalysent des réactions de synthèse ou de condensation, c’est-à-dire la formation de liaisons covalentes nécessitant un apport d’énergie généralement fournie par l’ATP.
