M3S7 - peptides Flashcards
Quelles sont les différentes organisations secondaires ?
une organisation en :
Hélices alpha : Liaison entre le NH d’un AA et le C=O d’un autre AA, avec 3 AA entre les deux
Feuillet bêta : Parallèle si dans le même sens, sinon anti parallèle
Coude gamma : liaison hydrogène avec 1 seul AA entre ceux qui sont reliés
Quelles sont les différentes structures des protéines et qu’incluent-t-elles ?
Primaire : enchainement des AA
Secondaire : Liaisons hydrogènes donnant une organisation en feuillet ou hélice
Tertiaire : Liaisons entre les radicaux
Quaternaire : Association de plusieurs protéines les unes avec les autres
Quel terme défini une protéines nécessitant une structure quaternaire pour être active ?
Oligomérique
Quelles sont les différentes liaisons comprises dans la structure tertiaire ?
Covalente (ex: pont disulfure)
Electrostatique : (ex : les AA hydrophobes vont s’éloigner du solvant pour faire un cœur hydrophobe à la protéine et les AA hydrophiles vont se placer à l’extérieur de la protéine, au contact du solvant)
Associations avec d’autres éléments (ex : fixation d’un noyau hème dans la myoglobine)
Nom de la liaison entre deux AA
Liaison peptidique
Où se produit la liaison entre les AA ? Quelle enzyme est utilisée ? Quel autre élément est utilisé ? Quel terme défini cet action anabolique ?
Ribosomes
Peptidyl-transferases
ATP
Protéogénèse
Qu’est-ce qui peut provoquer l’hydrolyse des AA liés ?
Peptidases ou acide
Quels sont les noms des extrémités d’un peptide ?
Partie N - terminale
Partie C - terminale
Qu’est-ce que la myoglobine ? Fonction
Protéine monomère située dans le cytosol des fibres musculaires et est responsable d’un stock d’O2 intramusculaire pour les situations d’hypoxie. Son affinité pour l’O2 étant beaucoup plus forte que celle de
l’hémoglobine, elle diffuse son O2 au muscle uniquement en situation d’hypoxie.
Qu’est-ce que l’hémoglobine ? Fonction + composition
Assure le transport de l’O2 à l’intérieur des érythrocytes, entre les poumons et les tissus périphériques.
Hétéroprotéine tétramère constituée d’une partie protéique, la globine, et d’un groupement prosthétique (organique non protéique), l’hème. Hème = molécule à noyau tétrapyrrolique centré par un ion fer.
Donner les 2 classifications en fonction de la conformation tertiaire d’une protéine + exemple et fonction
- Protéines fibreuses : de forme allongée, souvent peu solubles dans l’eau, avec un rôle mécanique comme le collagène ou la kératine. Elles sont surtout composées d’hélices alpha.
- Protéines globulaires : de forme sphérique, souvent solubles dans l’eau avec des fonctions très variables comme les enzymes ou de transport comme l’albumine.
Quelles sont les classifications générales des protéines en fonction de leur composition ?
Hétéroprotéine : AA + autre composé
Holoprotéines : exclusivement AA
Dans une hétéroprotéine, comment est appelé la partie protéique ? La partie non protéique ?
Apoprotéine
Groupement prosthétique
Quelles sont les 6 sortes d’hétéroprotéines et quelles sont leurs compositions ? + exemples
Lipoprotéines : P + lipide. Ex : HDL
Nucléoprotéines
Glycoprotéines : P + glucide. Ex: antigènes, certaines hormones.
Métalloprotéines : P + métal. Ex: Enzyme et magnésium
Phosphoprotéines : P+Phosphate (grâce aux protéines kinases). Activation de P
Chromoprotéines : contiennent un pigment. Ex: hème rouge
Quelles sont les 6 classements de protéines en fonction de leur rôle biologique ?
Enzymes, protéines de structures, protéines de défenses, protéines de transport, protéines contractiles