La structure des acides aminées Flashcards

1
Q

Quel fonction compose les acides aminées?

A

amine (NH2), acide (COOH), H et R

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2
Q

Comment retrouve-t-on les acides aminées à PH physiologique? Dès lors, comment apelle-t-on ce type de molécule?

A

amine (NH3+) et acide (COO-)
Ce sont des molécules amphotérique (base+acide) ce qui permet de moduler leur fonction.

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3
Q

Les acides aminées sont chirale. Qu’est-ce qu’une moécule chirale? Et, sous quel forme retrouve-t-on les acides aminées?

A

C’est une molécule dont le Calpha possède 4 chaines différentes et que l’image miroir n’est pas superposable.
On retrouve les acides aminées sont la forme L uniquement.

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4
Q

Comment distinguer la forme L vs D?

A

On utilise CORN
1)COO
2)R
3)NH3+
Si dans le sens aiguille d’une montre=ok

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5
Q

Nommez les acides aminés non polaire.

A

Gycine, Alanine, Valine, Leucine, Isoleucine, Phenylalanine, Méthionine,Tryptophane, Proline

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6
Q

Nommez les acides aminés polaire non chargé.

A

Aspargine, Glutamine, Tyrosine, Threonine, Cysteine, Serine

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7
Q

Nommez les acides aminés polaire basique (+).

A

Lysine, Histidine, Arginine

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8
Q

Nommez les acides aminés polaire acide (-).

A

Acide aspartique, acide glutamique

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9
Q

Quels sont les particularités de la glycine?

A

non hydrophobe, non chargé, non chiral et pas de chaine latéral

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10
Q

Quels sont les particularités de la proline?

A

La chaine latéral forme un cycle avec l’amine.
Pas de pont H possible, cis/trans= même énergie, N-Calpha fixe

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11
Q

Quel est la particularité de la cystéine?

A

Groupement SH qui peut formé des pont disulfure.

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12
Q

Quels sont les caractéristiques des acides aminées non polaires?

A

Hydrophobe ou interaction faible avec l’eau, fréquement retrouvé à l’intérieur de la molécule de protéine, ne partcipe pas directement aux réactions chimiques.

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13
Q

Quels sont les caractéristiques des acides aminées polaires non-chargés?

A

Interactions des groupements fonctionnelles avec l’eau, en contact avec l’eau dans la protéine, peut aussi se retrouver à l’intérieur pour faire des pont H

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14
Q

Quels sont les caractéristiques des acides aminées polaires chargés?

A

Chaine latérale chargée à PH physiologique
Contact avec l’eau ou à l’interieur pour pont H

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15
Q

Dans une solution où l’on retrouve des acides aminées, le PH est calculé en fonction de quoi?

A

Proportion de la forme acide de l’acide aminée et de la forme basique

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16
Q

Qu’est-ce que le point isoélectrique?

A

PH auquel une moécule est électriquement neutre.

17
Q

Qu’est-ce que le zwitterion?

A

Espèce moléculaire qui a des charges qui s’annulent.

18
Q

Comment calcule-t-on le PI si il y a
a) 2 fonctions ionisables;
b) 2 acides;
c) 2 bases?

A

a) PI=(PKa1+PKa2)/2
b)PI=(PKa1+PKa2)/2
c)PI=(PKa2+PKa3)/2

19
Q

Comment les chaines latérales influenent-elles le PI et le comportement le liens avec le PH?

A

Certains acides aminées possèdent un groupement ionisable, donc perdent un proton à un PH donnée.

20
Q

Quel est la valeur du PKa des groupes ou acides aminées suivant:
a) COOH terminal
b)NH3+ du Caplpha
c)Cystéine
d)Tyrosine
e)Acide aspartique
f)Acide glutamique
g)Lysine
h)Arginine
i)Histidine

A

a)2
b)9
c)8,4
d)10,5
e)3,9
f)4,1
g)10,5
h)12
i)6,0

21
Q

Comment les acides aminés peuvent-ils former des chaines?

A

Condensation de 2A.A (perte H2O)==> formation d’un lien covanlent (lien peptidique) entre le carboxyle1 et l’amine2

22
Q

Qu’est-ce que la structure primaire?

A

L’arrangement linéaire de A.A

23
Q

Qu’est-ce que la structure secondaire?

A

Formation locales de structure 3D à plusieurs A.A (hélice alpha et feuillet plissé beta)

24
Q

Qu’est-ce que la structure tertiaire?

A

Assemblage de structure secondaires en motifs protéiques formant la configuration native de la protéine

25
Q

Qu’est-ce que la structure quaternaire?

A

Assemblage de plusieurs polypetides entre eux pour former une protéine fonctionelle (sous-unités)

26
Q

Lequel n’est pas un acide aminé?

Alanine
Histidine
Adénine
Tryptophane

A

Adénine

27
Q

Lequel n’est pas un acide aminé?

Cytosine
Leucine
Glutamine
Cystéine

A

Cytosine

28
Q

Vrai ou Faux, à pH physiologique (pH~7), la chaîne latérale de l’acide glutamique est chargée?

A

Vrai

29
Q

Quels acides aminés parmi les suivants sont dans la catégorie polaire chargé?

Lysine
Arginine
Sérine
Leucine

A

Lysine
Arginine

30
Q

Quels acides aminés parmi les suivants sont dans la catégorie hydrophobe?

Tryptophane
Leucine
Méthionine
Cystéine

A

Tryptophane
Leucine
Méthionine

31
Q

Quelle est la charge nette de ce tripeptide à pH physiologique (pH~7) (Trp-Val-Arg)

1-
Il n’est pas chargé.
2+
1+

A

1+