Inst 1-Genom Flashcards
Vad kallas allt genetiskt material som finns i en cell?
Genom – all DNA i en organism.
Vad heter de repeterande byggstenar som bygger upp nukleinsyran DNA?
Nukleotider – DNA:s basenheter.
En byggsten i DNA består av tre huvudkomponenter. Namnge dessa delar och beskriv kort deras funktion.
Socker (deoxiribos) – struktur, fosfat – ryggrad, kvävebas – kodning.
Vilka är de fyra kvävebaserna i DNA?
Adenin, tymin, guanin, cytosin.
Vilka av dessa är puriner och vilka är pyrimidiner?
Puriner har en dubbelringstruktur, medan pyrimidiner har en enkelringstruktur
Puriner: adenin, guanin. Pyrimidiner: cytosin, tymin.
Vad menas med att DNA-molekylens strängar är antiparallella? Förklara begreppet.
Antiparallella betyder att två strängar löper i motsatta riktningar.
Ena strängen går 5’→3’, den andra 3’→5’.
Hur många kromosomer har en människa i sina somatiska celler?
46 kromosomer (23 par).
Hur många kromosomer har en bakterie vanligtvis?
En cirkulär kromosom.
DNA i varje cell kan vara flera meter långt. I kromosomer är DNA:t packat runt specifika proteiner. Vad kallas dessa proteiner?
Histoner – DNA-packningsproteiner.
Vad innebär det att DNA-replikationen är en semikonservativ process?
En gammal och en ny sträng i varje DNA-molekyl.
Det centrala dogmat inom molekylärbiologin beskriver tre huvudsakliga processer. Vilka är dessa processer, och vad kallas de?
Replikation (DNA→DNA), transkription (DNA→RNA), translation (RNA→protein).
Gen
DNA-sekvens som kodar för ett protein eller RNA.
- Intron
Icke-kodande DNA-sekvens i en gen.
- Exon
Kodande DNA-sekvens i en gen.
- Origins of replication
Startpunkter för DNA-replikation.
- mRNA
Budbärar-RNA, bär genetisk kod till ribosomen.
- tRNA
Transporterar aminosyror till ribosomen.
- rRNA
Bygger upp ribosomer, katalyserar proteinsyntes.
- Promotor
DNA-sekvens där transkription startar.
- Helikas
Enzym som öppnar DNA-spiralen vid replikation.
- Primer
Kort RNA-sekvens som startar DNA-replikation.
- Okazaki-fragment
Korta DNA-bitar på släpsträngen.
- DNA-polymeras III
Enzym som syntetiserar nytt DNA.
- RNA-polymeras II
Enzym som transkriberar mRNA.
Vad innebär att DNA-replikationen är semikonservativ, och varför är detta viktigt för genetisk stabilitet?
Semikonservativ betyder att varje DNA-sträng får en ny och en gammal sträng. Det säkerställer att kopiorna är genetiskt stabila.
Vilken roll spelar enzymet helikas under replikationen?
Helikas öppnar DNA-dubbelhelixen genom att bryta vätebindningarna mellan basparen.
Vad är skillnaden mellan den ledande och den släpande strängen under replikationen, och hur bildas Okazaki-fragment?
Den ledande strängen syntetiseras kontinuerligt, medan den släpande strängen syntetiseras i fragment (Okazaki-fragment) på grund av riktningen.
Vilken funktion har DNA-polymeras I och DNA-polymeras III under DNA-replikationen?
DNA-polymeras III syntetiserar DNA, medan DNA-polymeras I ersätter RNA-primern med DNA.
Hur förhindrar single-strand binding proteins (SSB) att DNA-strängarna återförsluts efter att de separerats?
SSB binder till de enkelsträngade DNA-sekvenserna och förhindrar att de återbildar vätebindningar.
Vad är promotorn, och hur känner RNA-polymeraset igen rätt startpunkt för transkriptionen?
Promotorn är en sekvens som RNA-polymeraset känner igen för att börja transkriptionen.
Vad är skillnaden mellan en intron och en exon, och hur processas mRNA i eukaryoter innan det lämnar cellkärnan?
Introner tas bort, exoner sammanfogas, och 5’-cap samt poly(A)-svans läggs till för att skapa moget mRNA.
Hur regleras transkriptionen med hjälp av transkriptionsfaktorer och enhancers?
Transkriptionsfaktorer binder till promotorn, och enhancers förstärker genuttryck genom att interagera med dessa faktorer.
Vilken roll spelar RNA-polymeras II under transkriptionen, och hur skiljer det sig från RNA-polymeras i prokaryoter?
RNA-polymeras II syntetiserar mRNA i eukaryoter, medan prokaryoter använder ett enda RNA-polymeras.
Vad är polyadenylering, och varför är poly(A)-svansen viktig för mRNA?
Polyadenylering innebär att en poly(A)-svans fästs vid mRNA, vilket skyddar det och hjälper transporten ut ur kärnan.
Hur översätts mRNA-sekvensen till en aminosyrakedja under translationen, och vilken roll spelar ribosomen i denna process?
Ribosomen läser mRNA och kopplar rätt tRNA till kodoner för att bilda en aminosyrakedja.
Vad är kodonet, och hur säkerställs att rätt tRNA binder till rätt kodon?
Kodonet är en sekvens av tre baser i mRNA som kodar för en specifik aminosyra. tRNA binder via antikodonet.
Vilka steg ingår i translationsprocessen (initiering, elongering och terminering), och vad sker i varje steg?
Initiering: ribosomen fäster vid mRNA. Elongering: aminosyror kopplas samman. Termination: ribosomen släpper mRNA när stoppkodon nås.
Vilken funktion har aminosyra-aktiverande enzymer (aminoacyl-tRNA-syntetaser) i translationsprocessen?
Aminoacyl-tRNA-syntetaser kopplar rätt aminosyra till tRNA.
Hur påverkas proteinsyntesen om det uppstår en mutation i en stopkodon?
En mutation i stoppkodon kan förhindra att translationen avslutas, vilket leder till ett onormalt långt protein.
DNA-polymeras I
DNA-polymeras I är ett enzym som ansvarar för att ta bort RNA-primer och ersätta den med DNA under DNA-replikation.
DNA-polymeras II
DNA-polymeras II är inblandat i DNA-reparation och återuppbyggnad av DNA under replikationen vid skador på DNA.
DNA-polymeras III
DNA-polymeras III är det primära enzymet för DNA-syntes under replikation i bakterier. Det syntetiserar den nya DNA-strängen.
RNA-polymeras
RNA-polymeras är det enzym som syntetiserar RNA från en DNA-mall under transkription.
Taq-polymeras
Taq-polymeras är ett värmetåligt enzym som används i PCR (Polymerase Chain Reaction) för att kopiera DNA vid höga temperaturer.
Telomeras
Telomeras förlänger telomererna på kromosomerna genom att lägga till repetitiva DNA-sekvenser, vilket förhindrar förkortning av kromosomer vid celldelning
Antiparallell orientering
De två strängarna i DNA är antiparallella, vilket betyder att en sträng löper i 5’ till 3’-riktning, medan den andra löper i 3’ till 5’-riktning.
Leading strand
Leading strand syntetiseras kontinuerligt i 5’ till 3’-riktning under DNA-replikationen, eftersom den går i samma riktning som replikationsgaflens öppning.
Lagging strand
Lagging strand syntetiseras diskontinuerligt i små bitar kallade Okazaki-fragment, eftersom den går i motsatt riktning mot replikationsgaflens öppning.
Okazaki-fragment
Okazaki-fragment är korta sekvenser av DNA som bildas på lagging strand och sätts samman av DNA-ligas.
DNA-replikation
DNA-replikation är processen där DNA kopieras, vilket sker i riktning 5’ till 3’ på den nya strängen. Det involverar en rad enzymer som DNA-polymeras och helikas.
Helikas
Helikas är ett enzym som öppnar upp DNA-dubbelhelixen genom att bryta vätebindningarna mellan basparen under replikationen.
DNA-ligas
DNA-ligas är ett enzym som sammanfogar Okazaki-fragmenten på lagging strand för att skapa en sammanhängande DNA-sträng.
5’ ände
5’ ände av en DNA-sträng har en fosfatgrupp kopplad till den femte kolatomen på deoxyribosen, och denna ände är där DNA-strängen börjar syntetiseras under replikation.
3’ ände
3’ ände av en DNA-sträng har en hydroxylgrupp (-OH) kopplad till den tredje kolatomen på deoxyribosen och är slutet där nukleotider adderas under DNA-syntes.
Chargaffs regel
Chargaffs regel säger att i DNA är mängden adenin (A) lika med mängden tymin (T), och mängden cytosin (C) lika med mängden guanin (G).
Stora klyftan
Den stora klyftan (major groove) i DNA-dubbelhelixen är den större av de två sektionerna mellan de två strängarna, där proteiner ofta binder för att reglera transkription och andra funktioner.
Lilla klyftan
Den lilla klyftan (minor groove) i DNA-dubbelhelixen är den mindre sektionen mellan de två strängarna, och här sker också bindning av vissa proteiner under DNA-interaktioner.
Promotorregioner
Promotorregioner är DNA-sekvenser nära starten på en gen där RNA-polymeras binder för att initiera transkriptionen.
Reglerande regioner
Reglerande regioner är DNA-sekvenser som påverkar genuttrycket genom att binda till olika transkriptionsfaktorer, ofta belägna utanför själva genen.
Öppen läsram (ORF)
En öppen läsram (ORF) är en sekvens av nukleotider i DNA eller mRNA som kan översättas till ett protein, utan stoppkodon.
Topoisomeraser
Topoisomeraser är enzymer som lindrar spänningar i DNA-strängen under replikation och transkription genom att klippa och återkoppla DNA-strängar för att förhindra överspiraler.
Replikationsorigin
Replikationsorigin är den specifika platsen på DNA där replikationen börjar, där helikas öppnar upp dubbelhelixen.
Nukleosid
En nukleosid består av en kvävebas och en sockermolekyl (deoxyribos eller ribos), men saknar fosfatgruppen som finns i en nukleotid.
Nukleosomer
Nukleosomer är enhetsstrukturer i eukaryotiskt DNA, där DNA är lindat kring histonproteiner och bildar en “pärl”-liknande struktur, vilket hjälper till att packa DNA:t effektivt i cellkärnan.
Vad är skillnaden mellan DNA och genom?
DNA är den kemiska substansen som bär den genetiska informationen, medan genom är den fullständiga uppsättningen av DNA i en organism.
Vad är ett haploid genom?
Ett haploid genom innehåller en enkel uppsättning kromosomer, som hos könsceller (spermier och äggceller).
Vad är ett diploid genom?
Ett diploid genom innehåller två uppsättningar kromosomer, en från varje förälder, vilket finns i de flesta kroppsceller.
