Begrepp 2-DNA Fingeravtryck och gelelektrofores & PCR Flashcards
DNA-fingeravtryck
Unik DNA-profil skapad genom analys av repetitiva sekvenser.
PCR (Polymerase Chain Reaction)
Teknik för att amplifiera DNA genom upprepade cykler.
Gelelektrofores
Metod för att separera DNA-fragment baserat på storlek.
Restriktionsenzym
Enzym som klipper DNA vid specifika sekvenser.
Agarosgel
Porös gel som används för att separera DNA vid elektrofores
DNA-laddningsfärg
Färgämne som används för att visualisera DNA i gel.
Elektroforesbuffert
Vätska som leder ström och stabiliserar pH vid elektrofores.
Termocykler
Upprepade temperaturväxlingar under PCR-amplifiering.
Primer
Korta DNA-sekvenser som binder specifika målsekvenser i PCR.
VNTR (Variable Number Tandem Repeats)
DNA-segment med upprepade sekvenser som varierar mellan individer.
STR (Short Tandem Repeats)
Korta sekvenser av DNA som består av 2-5 baspar som upprepas flera gånger i rad. Dessa upprepningar varierar mellan individer och används ofta i genetiska analyser och identifiering.
DNA-stege (Molekylviktmarkör)
Standard-DNA-fragment med kända storlekar för jämförelse.
Denaturering (PCR)
Uppvärmning som bryter vätebindningar och separerar DNA-strängar.
Annealing (PCR)
Nedkylning så att primers kan binda till enkelsträngat DNA.
Vektor
En vektor är ett DNA-molekyl som används för att introducera genetiskt material i en cell, ofta använt i genetisk modifiering eller kloning.
Realtids PCR
Realtids PCR (qPCR) är en teknik som möjliggör mätning av mängden DNA eller RNA i realtid under amplifikationen, vilket gör det möjligt att kvantifiera genetiskt material.
6500 bp
Ett DNA-fragment på 6500 baspar (bp) är vanligt vid amplifikation av en gen i homozygota individer, där båda allelerna ger samma fragmentstorlek.
2500 bp + 4000 bp
Vid heterozygot genotyp (Dd) kan två olika fragment, ett på 2500 bp och ett på 4000 bp, bildas som resultat av DNA-digestion.
6500 bp + 4000 bp + 2500 bp
En heterozygot individ (Dd) kan ha tre olika fragmentstorlekar (6500 bp, 4000 bp och 2500 bp) när båda allelerna amplificeras, vilket ger olika resultat för varje allel.
Termostabilt polymeras
DNA-polymeras som kan stå emot höga temperaturer, t.ex. Taq-polymeras.
Cykel
En upprepning av denaturering, annealing och elongering i PCR-processen för att amplificera DNA.
Amplifikation
Den process där DNA mängden ökar exponentiellt genom upprepade cykler av PCR.
Mål-DNA
Den specifika DNA-sekvens som man vill amplificera under PCR.
Elektroforesbuffert
En lösning som används för att upprätthålla rätt pH och jonstyrka under elektroforesen och för att leda strömmen.
Laddningsbuffert
En lösning som blandas med DNA-prover innan de laddas i gelen för att ge proverna rätt densitet och färg för visualisering.
Små fragment
DNA- eller RNA-sekvenser som rör sig snabbare genom gelen under elektrofores, då de är mindre i storlek.
Stora fragment
DNA- eller RNA-sekvenser som rör sig långsammare genom gelen eftersom de är större i storlek.
UV-visualisering
En teknik som använder UV-ljus för att visualisera fluorescerande DNA-färger efter elektrofores.
Protein-elektrofores
typ av elektrofores som separerar proteiner istället för nukleinsyror baserat på storlek och laddning.
RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)
En metod för att analysera variationer i DNA-längd genom att använda restriktionsenzymer, en viktig teknik i DNA-fingeravtryck.
DNA-profil
En unik uppsättning av DNA-mönster som identifierar en individ, ofta skapad genom RFLP eller STR.
Släktskapsbestämning
Processen att fastställa genetiska relationer mellan individer, där DNA-fingeravtryck används för att jämföra familjemedlemmar.
Magnesiumjoner (Mg²⁺)
Kofaktor i PCR som stabiliserar DNA-strängarna och underlättar enzymaktiviteten.
PCR-reaktion
Magnesiumjoner är nödvändiga för DNA-polymeras att syntetisera nya DNA-strängar under cyklerna av PCR.
Magnesiumkoncentration
En optimal koncentration av magnesiumjoner krävs för att kontrollera PCR-effektiviteten och specificiteten.
Stabilisering av primerbindning:
Magnesiumjoner bidrar till att primrar binder korrekt till mål-DNA under uppvärmning i PCR.
Probe
En kort, märkta DNA- eller RNA-sekvens som används för att specifikt binda till ett mål-DNA i PCR för detektion eller kvantifiering.
94°C
Den temperatur vid vilken DNA denatureras under PCR, vilket innebär att dubbelsträngat DNA separeras till enkla strängar.
53°C
Annealingtemperaturen i PCR, där primrar binder till den komplementära DNA-sekvensen.
72°C
Temperaturen där DNA-polymeras, som Taq-polymeras, syntetiserar nya DNA-strängar under förlängningsfasen i PCR.
Taq-polymeras
Ett värmestabilt DNA-polymeras som hämtas från bakterien Thermus aquaticus och används i PCR för att syntetisera DNA vid höga temperaturer.
32P
En radioaktiv isotop av fosfor som används för att märka probes för att möjliggöra detektion av DNA eller RNA i experiment.
Fluorescensprobe
En probe märkt med en fluorescerande molekyl som används för att detektera specifika DNA- eller RNA-sekvenser genom fluorescens vid excitation.
Hybridisering
Processen där en probe binder till en komplementär sekvens på mål-DNA eller RNA för detektion.
Märkning
Att binda en detektionssignal, som radioaktivitet eller fluorescens, till en probe för att göra den spårbar i experiment.
FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer)
En teknik som används för att mäta när två fluorescerande molekyler är nära varandra, vanligt i realtids-PCR för att detektera DNA-amplifiering.
Molekylär sond
Ett annat namn för probe, ofta använd för att referera till korta sekvenser som binder till mål-DNA/RNA för analys.
TaqMan-probe
En specifik typ av fluorescerande probe som används i realtids-PCR för att kvantifiera DNA genom att mäta ljusutsläpp vid varje cykel.
