F7 Flashcards
Cellens Informationsflow - DNA og RNA struktur
Hvad er de novo pathway
danne nukleotid
- Nukleotid baser sammensættes fra simple molekyler
- Pyrimidin base samles først, derefter sættes på ribose
- Purine baser er synitiseret først et stykke af gangen direkte på ribose-grundlag molekyle
Aktiveret ribose (PRPP) + aminosyre + ATP + CO2 + etc.
↓
Nukleotid
fra start: de novo
hvad er salvage pathway
- Foruddannet baser er genfundet og genetableret til et ribose molekyle
Aktiveret ribose (PRPP) + base
↓
Nukleotid
En base gen påsættes op en ribose, som er PRPP
salvage: rester
hvad er ribonukleotider
Molekyler som kommer af de novo- og salvage pathway
hvad er deoxyribonukleotider
Syntiseres af fra korresponderende ribonucleotider
Hvad er DNA
cellens information
- Kommer af deoxyribonukleotid
- Er et arveligt i alle bakterielle og eurykariotiske organismer
- RNA og DNA er macromolekyler
- Hver monomer består af: en sukker, phosphat og en base.
- En nucleinsyre består af disse monomerer, hvor phosphaten binder monomerene sammen.
- Hver streng kan agere templet, hvorved man kan danne kopier af DNA og RNA.
- DNA er flexibelt og dynamisk macromolekyle, da den findes som B-, A- og Z-DNA
hvilke baser består DNA af?
Baser
- Adenin (A)
- Guanin (G)
- Thymin (T)
- Cytosin (C )
hvilke strukture har DNA?
Struktur i helix (højre-håndet) (Watson-Crick model/B-DNA)
- 2 strenge, af polynukleotider, der snor sig om hinanden (helix)
- (backbone)Sukker-phosphate fra hver streng sidder yderst i strukturen
- Baserne sidder indad
- Den ene strengs retning/polaritet 5´-3´retning
- Den anden strengs polariet er modsat (3´-5´retning)
struktur
- Strenge holdes sammen via hydrogenbindinger mellem basepar
Adenin – Thymin
Guanin + cytosin
- Dvs. en streng af DNA bestemmer den anden DNA-strengs rækkefølge i forhold til baser. Derved kan en helix deles op i hver sin streng og syntisere nye helix molekyler
- Hver streng indeholder vigtig information
- Strenge kan skilles ad
- DNA kan også rulles om sig selv og danne supercoiled strukturer
- Supercoiling komprimerer DNA, er venstrehåndet og derved er DNA kun delvis udfoldet og mere tilgængelig for processer sås om replikation og transskription.
- Består af nukleotider med 3´ 5´phosphat diesterbindinger
- DNA har polaritet, dvs. har en retning man læser i.
Den ene ender har fri -OH gruppe eller påsat -OH på phosphoryl (5´-enden)
Den anden ende har fri -OH gruppe (3´-enden)
hvilke helix former findes der for DNA?
Der findes forskellige helixformer
- A-DNA (højre håndet)
Dehydreret DNA
Holdes sammen af Watson-Crick base par
- B-DNA (højre håndet) – mest forekommende.
Holdes sammen af Watson-Crick base par
- Z-DNA (venstre håndet)
Phosphorylgrupperne i backbone er zigzag.
- DNA kan bøjes, sat sammen eller udfældes.
- I disse strukture holdes antiparallele strenge sammen af Watson-Crick base par og sammen af stacking kræfter mellem baserne på samme streng
- Sukker-phosphate fra hver streng sidder yderst i strukturen
- Baserne sidder indad
- Strenge holdes sammen via hydrogenbindinger mellem basepar
hvilken DNA helix form er den mest normale?
B-DNA
Stabilitet
- Hydrofobe interaktioner mellem baser i helix (højre håndet)
Derved er hydrofile/polære struktur ud mod vand
- Van der Waal interaktioner mellem base stakke
Disse stakke af baser tiltrækker hinanden via van der Waal interaktioner
Mange af dem: stor stabilitet
(dette gælder også A-DNA, som er en dehydreret udgave)
hvad er nukleosider
Består af
- Purine eller pyrrimidine baser bundet sammen til et saccharid
hvad er en nukleotid?
Nukleotider er opbygget af et nukleosid, hvortil en eller flere fosfatgrupper er bundet.
f.eks. er ATP en nukleotid
Hvad er RNA
ribonukleotid
Enkelt strenget
Lineær polymer med bestemt antal monomere
- Sukker i RNA er ribose og base uracil (U) bruges i stedet for thymin
Baser
- Adenin (A)
- Guanin (G)
- Uracil (U)
- Cytosin (C)
Struktur
- Enkeltstrenget men kan forme forskellige strukture ved at foldes.
- Stemloop: stabiliseres af Watson-Brick base par
- I andre tilfælde kan hydrogenatomer og oxygenatomer, som ikke indgår i Watson-Crick base par, indgå hydrogenbindinger.
- Uforgrenet polymer
- Består af nucleotider med 3´ 5´phosphat diesterbindinger
hvilke baser består RNA af
Adenin
guanin
uracil
cytosin
hvad er forskellen på RNA og DNA?
Sukker:
DNA: Deoxyribonukleinsyre, som indeholder deoxyribose, et sukker uden en hydroxylgruppe (–OH) på 2’ kulstofatomet.
RNA: Ribonukleinsyre, som indeholder ribose, et sukker med en hydroxylgruppe (–OH) på 2’ kulstofatomet.
Struktur:
DNA: Dobbeltstrenget helix, hvor de to strenge er komplementære og holdes sammen af hydrogenbindinger mellem baserne.
RNA: Enkeltstrenget, som kan folde sig i komplekse strukturer, men er ikke dobbeltstrenget.
Basernes sammensætning:
DNA: Indeholder baserne adenin (A), thymin (T), cytosin (C) og guaninn (G).
RNA: Indeholder baserne adenin (A), uracil (U) (i stedet for thymin), cytosin (C) og guaninn (G).
Funktion:
DNA: Opbevarer den genetiske information og fungerer som en “blåprint” for alle cellulære funktioner og arv.
RNA: Overfører den genetiske information fra DNA til ribosomerne for at danne proteiner (mRNA), samt har flere andre funktioner som enzymatiske aktiviteter (f.eks. rRNA, tRNA).
Stabilitet:
DNA: Mere stabilt, hvilket gør det velegnet til langtidsopbevaring af genetisk information.
RNA: Mindre stabilt, hvilket gør det mere egnet til midlertidige funktioner som proteinproduktion.
Sammenfattende er DNA den langtidsholdbare opbevaring af genetisk information, mens RNA er mere aktiv i at oversætte og udføre funktionerne af den genetiske kode.
hvad er nukleinsyre?
er linær polymer og har polaritet
er både RNA og DNA
Består af
- Baser bundet til sukker phosphate backbone
