F3 + F4 Flashcards
Cellens organeller 1 og 2
hvordan er en cellemembran formet?
- Form: Optimal form er en sphere for at minimere energiforbrug
Dvs. hvis der ikke blev gjort noget aktivt (proteiner gjord), ville alle cellemembraner være sphere formet i vandigt miljø
hvad er cytosol?
Væsken inden i cellen (uden kerne og organeller).
Hvad er cytoplasma?
Cytosol + organeller
Hvad er Nucleus
cellekerne
- Funktion: Opbevarer DNA og vælger specifikt genetisk materiale.
- Struktur:
* To membraner med porer til transport af mRNA.
* Chromatin: DNA pakket omkring protein. kompleks af DNA foldet tæt om protein scaffold
* Nucleolus: site for RNA transcription og processing og ribosom produktion og samling.
hvad er mitokondrie?
- Funktion: Energiproduktion via forbrænding af kulhydrater/lipider med ilt til ATP, CO₂, og H₂O.
- Struktur:
- To membraner (yder- og indermembran med foldninger for stor overflade).
- Intermembrane rum og matrix.
- Semi-autonomt: har eget DNA men kræver proteiner fra nucleus.
hvad er chloroplast?
- Funktion: Fotosyntese (omdanner sollys til energi).
- Planters udgave af mitokondria
- Funktion: skaber fotosyntese (laver energi fra sollys)
- Struktur:
- Tre membraner (yder-, inder-, og thykaloid).
- Thykaloid arrangeret i grana; stroma indeholder ribosomer og DNA.
Hvad er en vacuole
findes kun i planteceller
- Funktion: Opbevaring af vand, ioner og næringsstoffer; indeholder pigmenter til at tiltrække insekter.
Hvad er ER?
Endoplasmatisk reticulum
- Funktion: Syntese af fosforlipider og proteiner; sorterer proteiner.
- Typer:
* Smooth ER: Bearbejder kemikalier og lipidmetabolisme.
* Rough ER: Dækket af ribosomer; involveret i proteinsyntese, -foldning og -transport til Golgi-apparatet.
Hvad er Golgi app.?
Golgi Apparatus
- Funktion: Modificerer og sorterer proteiner til forskellige destinationer (lysosomer, plasmamembran, sekretion).
- Struktur: Flade membran-dækkede sække (cisternae) med vesikler.
* Cis-, medial-, og trans-Golgi: Håndterer proteinmodifikation og sortering
hvad er den endomembrane system?
Organeller som udveksler materialer
- Består af ER, Golgi, endosomer, og lysosomer.
- Funktioner:
o Endocytose: Import af molekyler.
o Exocytose: Eksport af molekyler.
hvad er endosomer?
- Funktion
Sorterer i materialer, som kommer fra plasma membran
Dannes af fusion fra endocystisk vesicle med TGN vesicle, der indeholder hydrolaser og proton pumper
Proton pumper sænker pH
Hvilke trin og hvordan dannes endosomer til lysosomer?
- Tidlig endosome (pH 6,4-6,8)
frigivelse af cargo
Genbrug af receptor til plasma membran - Sen endosome (pH 5,0-6,0)
Aktivering af hydrolyase
Genrbug af cargo receptor til TGN - Lysosome – pH 5
Nedbryder via hydrolyse proteiner, nuclein syre, carbohydrater og lipider
Danner derved byggesten
Lysosome membran beskyttet af Glycocalyx mod fordøjelse
Kan fordøje komponenter fra cellen og organeller (autophagy)
Hvad er Vesicle mediated transport?
- Trin:
1. Udvælgelse af stoffer til vesicle transport.
2. Dannelse af vesikel fra donor compartment.
3. Transport af vesikel.
4. Fusion med acceptor compartment. - Anterograde transport: Transport mod plamsamembran
- Retrograde transport: Transport væk fra plasmamembran
Hvad er exocytose?
- Pathway: ER → Golgi → sekretorisk vesikel → plasmamembran.
- Funktion: Tilføjer materiale til plasmamembranen og eksporterer molekyler til det ekstracellulære rum.
- Når den sidste vesicle (exocytisk vesicle) fusioneres med plasmamembranen, bliver de en og de transporterede materialer frigives til ekstracellulær rum (kaldet secretion)
- En retning
- Fra endoplasmatisk reticulum (ER)
- Gennem golgi apparat
- Hen til plasmamembran
ER –> Golgi app. –> secretory vesicles –> plasma membran
Når den sidste vesicle (exocytisk vesicle) fusioneres med plasmamembranen, bliver de en og de transporterede materialer frigives til ekstracellulær rum (kaldet secretion)
hvor mange trin er der i exocytose?
9 trin
1. cargo selektion
cargo bliver udvalgt af sorting siganler, som binder til receptor for signal sekvens, som binder til coat proteiner
coat proteiner får signal sekvenser til at samle sig på overfladen ad donor compartment.
Dvs. hver donor compartment har sin egne cargo, cargo receptor og coat proteiner.
- budding
ved samling af cargo, interqagerer coat proteiner med adaptor proteiner (cytosolisk proteiner). Coat proteiner og adaptor proteiner dannet et netværk på ydersiden ad donor compartment. Derved begynder dannelsen af vesicle. - scission
den danne vesicle bliver adskilt fra donor compartment. - uncoating
da vesicle er dannet, bliver coat proteiner frigivet, da de har gjort deres job. Derved kan de bruges igen. - transport
vesicler kan bruge motor proteiner for mere effektiv transport gennem cytosol. Disse motor proteiner interagerer med microtubules og actin filamenter (oftes actin) - tethering
tether proteiner på acceptor compartment med Rab proteiner (GTP bindende proteiner) på vesiclen danner et kompleks. Der skal der findes target protein, hvorved vesicle kan blive fussioneret med acceptor compartment. Hvis ikke frigives vesicle og den finder ny acceptor compartment. - docking
v-SNARE på vesicle binder til komplimentære t-SNARE på acceptor compartment membran. Dette stabiliserer komplekset. - fusion
pga. mange interaktioner mellem v- og t-SNARE proteiner kan fusion finde sted. - disassembly
SNARE proteiner bliver frigivet for at kunne lave processen igen.
Hvad er endocytose?
- Pathway: Plasmamembran → endosomer → lysosomer.
- Funktion: Transport af vigtige biomolekyler og nedbrydning af uønskede stoffer.
- Der subtraheres materialer ved cellens overflade og ekstracellulær rum
- Denne vej er ikke den modsatte af exocytose pathway og der bringes ikke de samme materialer.
hvilke trin er der i endocytose?
- vesicle formation
cargo binder til receptor, som drives af adaptor proteiner. Clathrin sættere sig på overfladen af vesiclen. Derved dannes coated pit - scission
coated pit bliver adskilt fra donor compartment når dynamin adskiller dem - fjerner coating
auxilin sammen med Hsc70 interagerer sammen og derved fjerner adaptor protein og Clathrin fra vesiclens overflade. - transport
vesicle kan transporteres af motor proteiner og dermed micro filamenter eller actin filamenter eller andre kræfter. - fusion
sker på samme med med tethering, cocking og fusion som ved exocytose.
Vesiclen fusionere med tidlig endosomer.
Hvad er et cytoskeleton?
Proteiner, som er med til at forme cellemembranen
En form for cytoskeleton protein er filamenterne
- Bestemmer hvor cellens organeller skal være i cellen
- Stabiliserer formen, ved at skabe beskyttelse mod mekaniske kræfter, som kunne ændre eller ødelægge cellen.
- De interagerer med ekstracellulære strukture
- Alle celler har et cytoskeleton
- Alle filamenter er kun effektive, hvis de danner polymerer.
Hvad er cytoskelton funktion?
- Funktioner:
- Støtter cellens form.
- Bestemmer hvor cellens organeller skal være i cellen
- Stabiliserer formen, ved at skabe beskyttelse mod mekaniske kræfter, som kunne ændre eller ødelægge cellen
- Involveret i cytoplasmatisk streaming.
- Interagerer med ekstracellulære strukturer.
hvilke typer af filamenter findes der?
actin filamenter
intermadiate filamenter
microtubules
hvad er actin filamenter?
- Mest komplekse form for cytoskeleton og stærkest
- Bruges ofte til hurtig filament samling og adskillelse i underregioner/dele af cytosolen
- Er den cytoskeleton, som har flest funktioner. Derved producerer cellen mange forskellige actinbindende proteiner, om kan trække i actinfilamenter eller ændre længde eller ændre stabilitet hos actin filamenter
- Alle disse funktioner er med til at skabe bevægelse og ændring i cellens membran.
- Microfilamenter er dynamisk ustabile, da de hurtigt bliver dannet og adskilt igen
Struktur
- De kan nemt danne linære og forgrenede strukture
- De er mindre end de andre filamenter
- Mindste bestandel: actin monomer
- Actin filament (microfilament): består af actin monomer. 2 monomer, som er viklet om hinanden.
- Har polaritet ligesom microtubules
- Bruger ATP hydrolyse ligesom tubulin dimer til at binde monomer sammen.
hvad er treadmiling?
- Det er en funktion actin filamenter og microfilamenter har
- Det gør dem hele tiden foranderlige, selvom deres form er konstant i forhold til
- Dette styres af actin bindende proteiner, som lige som MAPs proteiner, som binder sig til microtubules.
Hvad er dyneins funktion?
- Er microtubule motorprotein
- De fleste dynein bevæger sig den samme retning, mod minus enden af microtubules
- De bruger ATP hydrolyse for at skabe bevægelse
- Hvis microtubules sidder fast til en centrosome, vil moto proteinerne bevæge sig hen ad microtubules
- Hvis det er motor protein sidder fast, så vil microtubules bevæge sig.
Hvad er kinesins funktion?
- Er microtubule motorprotein
- De fleste kinesin bevæger mod plusenden af microtubules, men nogle den modsatte retning.
- De bruger ATP hydrolyse for at skabe bevægelse
- Hvis microtubules sidder fast til en centrosome, vil moto proteinerne bevæge sig hen ad microtubules
- Hvis det er motor protein sidder fast, så vil microtubules bevæge sig.
- Hvis microtubules sidder fast til en centrosome, vil moto proteinerne bevæge sig hen ad microtubules
- Hvis det er motor protein sidder fast, så vil microtubules bevæge sig.
Hvad er intermediate filament
Giver mekanisk styrke. De er gode til at være modstandsdygtige eller bekæmpe mekaniske kræfter.
De bliver dannet spontant
Stabiliserer formen, ved at skabe beskyttelse mod mekaniske kræfter, som kunne ændre eller ødelægge cellen
Struktur:
- De er krøllede filamenter
- De har maksimalt kontakt med andre proteiner
- Øger mængden af bindinger mellem proteinerne, hvorved de bedre holder sammen
- Coiled coil er den strukturelle basis for styrken hos intermediae filamenter.
(Dannet af 2 intermediate filament proteiner ( 2 alfa-helical polypeptider)
Er strukturel basis for styrken af filamentet)
Hvad er coiled coil?
er den strukturelle basis for styrken hos intermediae filamenter.
(Dannet af 2 intermediate filament proteiner ( 2 alfa-helical polypeptider)
Er strukturel basis for styrken af filamentet)
Hvad er microtubules?
- Største diameter; organiserer indre bevægelse.
- De er dynamisk ustabile
- Bevæger sig hurtigt
- De dannes og adskilles hurtigt
- Specifikke MAPs: proteiner, som styrer, hvor og hvornår disse microtubuler dannes
- Hvis microtubules sidder fast til en centrosome, vil motor proteinerne bevæge sig hen ad microtubules
- Hvis det er motor protein sidder fast, så vil microtubules bevæge sig.
Funktion
- De dirigerer trafikken i en bestemt retning i cellen
- F.eks. transport af vesicler fra golgiapp. Til ER og tilbage.
- Mitokondrier fra en del af cellen til en anden
- Chromosom segretion ved mitose
Struktur
- Bliver dannet fra gamma tubulin ring complex (Er det sted, hvor microtubules dannes fra. De findes mange steder i celle)
- Er hule-tubeformet polymerer
- Polymererne er proteiner kaldet tubulins
- De dannes ud fra et microtubule-organiseringscenter
- Basis for microtubules er en dimer
- En dimer består af 2 tubulin proteiner
Hvad har gamma tubulin ring kompleks at gøre med microtubules?
Er det sted, hvor microtubules dannes fra. De findes mange steder i celle
Hvad bruges GTP/ATP hydrolyse til ved cytoskeleton?
- GTP hydrolyse bruger dimer til at danne microtubules
- GTP binder sig til alfa og beta i dimer og derved dephosphoryleres GTP til GDP og derved kan danne microtubules
- Hvis der ikke er mere GTP, går microtubules fra hinanden.
- ved migration af cellen (aktin filamenter bruger ATP)
Hvad er tubulin proteiner?
- Er en del af Microtubules
- De med til at give Microtubules styrke
- Funktion
De binder sig til GTP og GDP. De bruger forskellen mellem de i struktur til at ændre form og funktion
Hvad er filopodium/filopodia?
En form for actin cluster, som skubber plasmamembran
De er en slags fødder
- Struktur
er tynde og parallel bundet til filamenter, som alle har den samme polaritet
har minus ende mod cytosol
har plus enden mod plasma membran
Hvad er lamellipodium/lamellipodia?
En form for actin cluster, som skubber plasmamembran
De er en slags fødder
- Struktur
Indeholder forgrenet netværk aaf filamenter
Holdes sammen af forskellige crosslinked proteiner (fra filopodia)
hvad er protofilamenter?
Subunits af de store filamenter
Protofilamenter er lange kæder af proteinunderenheder, der samles for at danne større strukturer som mikrotubuli. De består af gentagne enheder (13), der er arrangeret i en lineær sekvens, og flere protofilamenter kan samles for at danne et stabilt, funktionelt filament.
microtubuli
Hvordan foregår cellens migration?
En celle ”kravler” frem ved at (bruger ATP)
1. actin filament bliver elongeret i plus enden
2. myosin motor protein trækker på actin filamenter (filopodium, lamellipodium), hvorved der skabes fremdrift.
actin sidder fast til plasmamembranen
hvad bruges myosin til?
Er motorprotein
Trækker actinfilamenter og ændrer cellens form og bevægelse.
Når actin filamenterne er imobiliseret på cellens overflade, vil det få membranen til at ændre
Dvs. myosin og aktin i teams kan få cellen til at ændre form og bevæge sig.
Hvad bruges en vesicle til?
- Membranbundne rum, som transporterer materialer mellem organeller.
- Kan ikke både donere og acceptere materialer på én gang.
- Funktion: De bærer på materialer til og fra organeller
- Dannelse, transport, targeting og fusion af vesicler: Sker i 9 steps
- En cellemembran er delvis hydrofobisk og derved kan agere ligesom sæbe, hvorved de danner ”klumper” ligesom sæbebobler.
hvad er donor compartment?
- Donor compartment: Det sted, hvor materiale skal flyttes fra
hvad er acceptor compartment?
- Acceptor compartment: Det sted, hvor materialet skal hen
Hvad bruges secretory granules til?
- Også kaldet zymogen granules
- Dannes når vesicle er fyldt med protein, som skal secretion buds af Golgi app.
- De har retning med plasma membran
- De fusionerer med plasma membran
- De frigiver deres indhold (secretory protein) til ekstracellulære rum.
