F5 + F6 Flashcards

Chemistry of the cell 1 og 2

1
Q

Hvad er energi

A

energi bruges til reaktioner som ikke er spontane
energi kan ikke fjernes eller tilføres. Dog kan det konverteres til andre energi former.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

hvordan lagres energi?

A

det lagres som potentiel energi i form af bindinger i strukture, som brydes for at kunne bruge energien

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

hvad er potentiel energi

A

energi, som er lagret

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

I hvilken form bruges energi

A

som kinetisk energi. dette bruges til at udføre arbejde
dvs. man rykker rundt på elektroner.
man går altid mod en lavere energiform

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvad sker der med den brugte energi?

A

den kinetiske energi bliver omdannet til varme energi og lagret i ny struktur.
varmenergi er et restprodukt fra reaktioner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

hvad er kinetisk energi

A

energi, som bruges til at lave arbejde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

hvad er varmeenergi

A

biprodukt fra reaktioner

kan ses ved indre temp. øges.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

hvad er entropy?

A

det er uorden/kaos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad sker der, når entropy øges?

A

dvs. kaos øges, eller det bliver uorden

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvordan kan entropy mindskes?

A

celler bruger energi for at mindske entropy.
Når en reaktion bruger energi, er reaktionen ikke spontan.
Når en reaktion ikke er spontan mindsker man entropy.
Entropy øges ved spontane reaktioner (kræver ikke energi, da går mod lavere energiniveua)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvordan kan man stimulere ufavorable reaktioner?

A

ved at koble dem med favorable reaktioner.
dvs. den energi, som kommer fra den favorable reaktioner bruges til den ufavorable reaktionen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvordan kan gradienter bruges til reaktioner?

A

ion-gradienter og andre kan skabe energi direkte.
ved at transportere f.eks. en ion med den gradient (favorabel) kan den favorable reaktion kobles med transport af en anden ion eller molekyle, hvor den transport går mod den gradient (ufavorabel reaktion)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvad er ATP

A

Adenosine triphosphat (ATP)
er universal energi

ved hydrolyse af ATP, fjernes en phosphat gruppe (brydes en phospho-anhydride binding) hvilket frigiver meget energi.

endergonisk reaktioner bruger energi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

hvad er en endergonisk reaktion?

A

en reaktion som kræver energi

energi kan komme fra
- aktiv transport
- celle movement
- anabolism

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad er anabolism?

A

man bygger noget op
bruger energi
det modsatte af catabolism

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

hvad er exergonisk reaktion

A

en reaktion som frigiver energi

energi kan frigives ved
- celle respiration
- catabolisme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

hvad er catabolism?

A

nedbrydning af struktur til mindre dele
derved frigives energi
det modsatte af anabolism

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

hvad er en phototroph?

A

en organisme som bruger lys som energikilde

19
Q

hvad er en chemotroph?

A

en organisme som oxiderer carbon fuel til at danne energi.

20
Q

hvad er en elektrokemisk gradient?

A

Både elektrisk og kemisk gradient tilstede hos et molekyle eller ion.

21
Q

hvad er orthophosphat?

A
  • Orthophosphat (ofte skrevet som PO₄³⁻) er en form for fosfat, der består af et fosforatom (P) omgivet af fire oxygenatomer (O) i et tetraedrisk arrangement. I denne struktur er fosforatomet kovalent bundet til de fire oxygenatomer, og der er en samlet negativ ladning på -3 (denne ladning er fordelt over de fire oxygenatomer).
  • Orthophosphat er den enkleste og mest almindelige form for fosfat og er en vigtig ion i både biologi og kemi. Det er den primære form af fosfat, der findes i vandige opløsninger og er en central bestanddel af mange biologiske processer. For eksempel:
  • I biologiske systemer er orthophosphat en vigtig komponent i ATP (adenosintrifosfat), der er den primære energimolekyle i celler.
  • I plante- og dyreceller er orthophosphat afgørende for energimetabolisme, da det er involveret i fosforylering og dephosphorylering af molekyler.
  • Orthophosphat kan også kombineres med andre elementer for at danne forskellige fosfatforbindelser
22
Q

hvad er en kovalent binding?

A

Kovlente bindinger
- Stærk binding mellem 2 atomer, hvor de deler et (lonepair)
- Meget stabilt konformation

EN for kovalente bindinger
- 0<x<0,4 EN : ikke-polær kovalent binding
- 0,4<x<2,0 EN: polær kovalent binding

  • Deler elektronpar (eller flere)
    Enten ligelig deling: O=O eller H-H etc.
    Eller ulige deling: som vand, hvor hydrogen-atomerne er positivt partiel ladet, mens oxygen er negativ partiel ladet.
  • Bindingsenergi: 50-110 KJ/mol
23
Q

hvad er ion binding?

A

Ionbindinger er de stærkeste af de intermolekylære bindinger og dannes mellem ladede atomer eller molekyler – bedre kendt som ioner. Ionerne skabes ved, at et atom eller molekyle enten afgiver eller optager en elektron fra et andet atom eller molekyle. Dette danner to ioner med modsat ladning, som nu tiltrækkes af hinanden og danner en binding.

Positivt ladede ioner som Na+ (natriumion) og NH4+ (ammoniumion) kaldes kationer, og negativt ladede ioner som Cl– (chlorid) og COO– (carboxylat) kaldes anioner.

EN for ion bindinger
- 2,0<x EN : ion binding

  • Tiltrækning af modsatte ladninger
  • Bindingsenergi: 3-7 KJ/mol
  • Ioner kan interagerer med vand
24
Q

hydrogen binding hvad er det?

A
  • Elektrisk tiltrækning mellem kovalent bundet H-atom og et elektronegativt atom.
  • Bindingsenergi: 3-7 KJ/mol
  • Bindinger kommer af svag elektrisk tiltrækning mellem kovalent bundet H-atom og et elektronegativt atom.
  • De er med til at stabiliserer 3D struktur for proteiner og DNA.
    Sidder og bindinger nukleinsyre sammen.
25
Q

hvad er hydrofobe interaktioner?

A
  • Ikke-polær substans interagerer i polær molekyler (særlig vand)
  • Upolære substanser i polære substanser vil gerne gå sammen
  • 2 lov i thermodynamik:
    Den totale entropy for et system og dets omgivelser vil altid øge i spontane processer.
    Med til at stabilisere 3D struktur hos proteiner og membraner
26
Q

Hvad har homeostase at gøre med celle?

A

Hallmark of all living organisms: maintenance of internal constancy homeostasis – e.g. pH
Alle levende organismer opretholder et indre konstant homeostase (pH)

Homøostase er opretholdelse af indre ligevægt; i biologien det forhold, at systemer og organer i legemet virker ind på hinandens funktioner, fx ved feedback-mekanismer, således at det indre miljø holdes inden for snævre grænser.

27
Q

Hvad betyder polær?

A
  • delokalisering af elektroner (ulige fordelt)
  • der er en partial positiv og partial negaiv ladning
  • kan lave hydrogen bindinger

vand er polært

28
Q

hvad betyder upolær?

A
  • kan lave hydrofobiske interaktioner
  • har ingen ulige fordeling af elektroner
  • kan laver van der Waal interaktioner

alkaner og lipid haler er upolære

29
Q

Hvad er van der Waal interkationer

A
  • Interaktioner med elektroner hos ikke-polære molekyler

Med til at stabilisere 3D struktur hos proteiner og membraner (særlig membraner i deres hydrofobiske haler)

30
Q

hvad er disulfid bindinger?

A

Kovalent binding

er binding melle 2 svovl på hver sin cystein aminosyre

  • Stabiliserer 3D struktur af proteiner
    Sidder og binder aminosyre-kæde sammen (foldning)
  • Mellem aminosyre, som er langt væk fra hinanden i primær struktur men binder samen (foldning) ved sekundær og teritær strukutr?
31
Q

hvad er elektrostatiske interaktioner?

A

Ion binding
- Stabiliserer 3D struktur af proteiner
Sidder og binder aminosyre-kæde sammen (foldning)

32
Q

Hvad er phosphoryl-transfer potentiale?

A

En fosfatgruppes evne for at flytte en phosphorylgruppen fra et molekyle, gerne i form at ATP, til et andet

Et mål for den energi, som frigives, ved flytning af en phosphorylgruppe fra et energirigt molekyle til et andet.

ATP har et højt phosphoryl-transfer potentiale pga. 4 ting
1. ladnings afstødning i ATP molekylet
2. resonans stabilisering af Pi
3. stigning i entropy (1 til 2 molekyler)
4. stabilisering ved hydrering af ADP og Pi

33
Q

hvad er en phospho-anhydride binding?

A

Denne binding er ustabil
Findes i GTP og ATP og brydes, når de bliver hydrolyseret. Dvs. danner GDP og ADP.
Afgiver stor mængde energi

34
Q

hvad er termodynamik?

A

Termodynamik, varmelære, læren om varme og dens omsætning, idet gasser, væsker og faste stoffer behandles som makroskopiske objekter. I modsætning hertil beskæftiger statistisk fysik sig med stoffernes mikroskopiske opbygning af atomer eller molekyler. Termodynamikkens vigtigste emner er overførsel af varme fra et system til et andet og omsætninger mellem varme og andre energiformer.

35
Q

hvad siger 1. lov termodynamik?

A

”Energi kan ikke blive ødelagt eller skabt, det kan kun blive transformeret”
- Dvs. der er en vis mængde energi, som kan laves om til f.eks. kinetisk eller mekanisk energi
- Der kan aldrig skabes eller fjernes energi.

36
Q

Hvordan bruges 1. lov af termodynamik i biologi?

A

energi bliver konverteret til forskellige former.

potentiel energi lagres i strukture

kinetisk energi bruges ved arbejde (rykker rundt på elektroner)

varme energi som biprodukt ved brug af energi (varme)

37
Q

hvad siger 2. lov termodynamik?

A

”Den totale entropy for et system og dets omgivelser øges altid ved spontan proces”
- Entropy: et mål for uorden/kaos
- Dvs. orden vil altid gå mod uorden/kaos

38
Q

hvad har 2. lov af termodynamik med biologi at gøre?

A

da alt går mod entropy, vil cellen modvirke dette.
dette modvirkes ved at bruge energi til at mindske entropy.

39
Q

hvad er katabolistiske reaktioner

A
  • Nedbryde store komplekse molekyler til mindre molekyler
  • Frigiver energi (exergoniske reaktioner)

f.eks. ved nedbrydning af sucrose til glucose og fructose. derved brydes bindinger (rykker på elektroner) og energi frigives.

dvs. man går fra et høj energi niveau til et mindre energiniveau (spontan reaktion)

derved er gibbs energi mindre en nul

40
Q

Hvad er anabolistiske reaktioner?

A
  • Binder små molekyler sammen for at danne større og mere komplekser molekyler
  • Kræver energi (endergonisk reaktion)

dvs. man går fra et energi niveau til et højere energiniveau.

derved er gibbs energi større en nul.

41
Q

hvad bruges gibbs fri energi til?

A

til at kunne bestemme om en reaktioner er spontan eller ej.

ved værdi mindre end nul:
- spontan reaktion
- exergonisk reaktion (frigiver energi)
- katabolistisk reaktion
- kan være hydrolyse

ved værdi større end nul:
- ikke-spontan reaktioner
- endergonisk reaktion (bruger energi)
- anabolistisk reaktion
- kan være dannelse af bindinger

gibbs fri energi er afhængig af
- naturen af reaktanterne
- reaktanterne og produkternes koncentrationer

42
Q

hvornår er en reaktion spontan?

A

ved gibbs fri energi mindre end nul

43
Q

hvornår er en reaktion ikke spontan?

A

ved gibbs fir energi større end nul