Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

CMB > F11 + F12 > Flashcards

F11 + F12 Flashcards

Transcription

1
Q

er RNA eller DNA mere reaktivt?

A

RNA er mere reaktivt og mere ustabilt. (dobbeltstrenget)
DNA er mindre reaktivt og mere stabilt. (enkeltstrenget)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

hvad består genom af

A

DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

hvad består transcriptom af

A

RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

hvad består proteom af

A

protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

hvad er transskription?

A
  • Syntese af RNA fra DNA template
  • Katalyseres af stort proteinkompleks(enzym) kaldet RNA-polymerase
  • Består af
    Initiation
    Elongering
    termination
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

hvor henne i cellen foregår transskription?

A

i cellens nucleus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

hvilket enzym katalyserer transkription?

A

RNA-polymerase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

hvad kan RNA polymerase?

A

Er et enzym som katalyserer initation og elongering af RNA

RNA behøver ikke en primer som DNA polymerase skal.

(RNA)n reridues+ribonucleoside triphosphate ↔ (RNA)n+1 reridues + PPi

Retning: 5’  3’
Elongering af RNA er meget lige dette
-OH enden angriber den inderste phosphoryl gruppe på ribonukleoside triphosphate
Reaktionen drives af hydrolysen af pyrophosphate.

Kræver
1. template
en dobbeltstrenget DNA, hvor kun den ene streng bliver transkripteret.
Dvs. den DNA-streng som bruges som template er komplimentær til den transkripterede RNA streng

  1. aktiverede precursers
    andre subtrater som bruges til RNA transkription
    ribonukleoside triphosphat ATP, GTP, UTP og CTP- af RNA produkt.
  2. et divalent metalion
    RNA polyemerase bruger en divalent cation som co-factor.
    Enten Mg^2+ eller Mn^2+
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

hvad er et gen?

A

DNA segmenter som koder for RNA
- nogle er express hele tiden
- andre kun under bestemte situationer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

hvilke typer RNA findes der og hvad bruges de til?

A

rRNA: ribosomalt RNA
- Med i katalysen
- Selve RNA er en del af ribosomet

mRNA: messenger RNA  Protein

tRNA: transfor RNA
- Er vigtig komponent sammen med rRNA i processen for translaterer mRNA til protein.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

hvilken betydning af sigma subunit for initiation (transskription)?

A

Hjælper med at finde stedet, hvor transskriptionen skal starte
Den deltager i initationen af RNA syntese
Til sidst dissocidere den sig fra resten af enzymet. Derved sker elongering af den dannede RNA-sekvens.

RNA-polymerase uden sigma unit kaldes core enzym. (core enzym indeholder det aktive site)

Dvs. sigma subunits rolle er som katalysator. Altså med til at starte initation og dissocierer fra derefter.

  • Sigma subunit hjælper polymerase med at finde korrekt startsted for initiation
    (mindkser polymerasens affinitet for specifikke regioner af DNA template, mindsker styrken af bindinger til DNA)
    (sigma subunit får plymerasen til at genkende promotor site)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

hvad skal en promotor?

A

En DNA sekvens på templates, som viser, hvor RNA-polymerasen skal starte med at transkiptere

Kan have betydning for regulering af transkription, da styrken eller effektivet af promotor sekvens styrer regulering.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

i hvilket stadie af transskription bruges sigma subunit og promotor?

A

ved initiation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

hvad er initiation?

A

Først del af RNA transkription

  • Promotor angiver RNA polymerasens started for transskription.
  • Sigma subunit hjælper polymerase med at finde korrekt startsted for initiation
    (mindkser polymerasens affinitet for specifikke regioner af DNA template, mindsker styrken af bindinger til DNA)
    (sigma subunit får plymerasen til at genkende promotor site)
  • RNA polymerasen unwind helix for at kunne starte transskriptionen.
    Den behøver ingen promotor for at starte elongering
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

hvad betyder consensus sekvens?

A

En consensussekvens er en sekvens af DNA, RNA eller protein, der repræsenterer den mest almindelige eller typiske sekvens, der findes på tværs af en række beslægtede sekvenser. Den bruges ofte til at identificere og beskrive specifikke bindingssteder for proteiner, regulatoriske elementer eller motiver i genomiske sekvenser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

hvilke betydning har transkriptionsfaktor?

A

Er regulatory proteiner
Som binder til bestemte sekvenser tæt på promotor site
Interagerer med RNA-polymerase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

hvad er transkriptions bobbel?

A

Er en region hvor RNA-polymerase sidder med DNA og begyndende RNA (elongering af RNA).

Her er DNA-dobbelthelixen adskilt i de to strenge i den foreste del af RNA-polymerasen og ”rulles sammen” igen ved slutningen af RNA-polymerase.

Inde i denne bobbel sker der unwinding ad helix, elongering af RNA og rewinding ad helix

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

i hvilkent kompleks eller bobbel finder transkription sted?

A

transkriptions bobbel

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

hvad sker der efter initiation?

A

elongering finder derefter sted

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

hvordan foregår elongering

A
  • Sigma subunit dissocierer fra RNA polymerase komplekset efter start af initiation
  • Derved kan enzymet binde stærkt til template
  • Derefter forsætter elongering indtil enzymkompleks møder termination signal.
  • Derefter, når RNA polymerase har transkriberet DNA signalet for termination, stopper transkriptionen

Denne termination sker ikke altid, nogle steder bruges proteinkomplekset rho ved termination.

Det dannede mRNA bliver transporteret ud fra nucleus og ud i cytoplasm i segmenter. I cytoplasm foregår translation (protein syntese)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

hvornår kommer RNA ud af nucleus?

A

efter transkription af DNA til mRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

hvilken betydning har rho for termination af transkription?

A

Proteinkompleks.
hvor der sker termination.
Ved denne termination kræves ekstra protein med ATPase kaldet rho (p)

Kaldes også protein-dependent termination.

Rho binder til RNA, så RNA kommer igennem centret for proteinet.
Derefter ATPase aktivitet gør, at RNA trækkes gennem p.
Når p kolliderer med RNA-polymerase ved transkription boblen, brydes den RNA-DNA helixen inde i RNA-polymerasen og derved stoppes transkription.

23
Q

hvad sker der i elongering?

A

Starter ved at transkriptionsboblen flytter hen over DNA-templaten ved en hastighed på 50 nukleotider pr- sekund.

Elongering stopper ved stopsignal. F.eks. ved RNA hairpin hvorefter flere U residues kommer efter

24
Q

hvor mange RNA-polymeraser har bakterier?

A

kun én

25
Q

hvor mange RNA-polymeraser har eukaryoter?

A

de har 3

RNA-polymerase I : syntiserer rRNA

RNA-polymerase II : syntiserer mRNA

RNA-polymerase III : syntiserer tRNA og andre

26
Q

hvad betyder CTD?

A

Carboxyl-terminal domæne (CTD)

27
Q

hvad bruges CTD til?

A

Carboxylterminal domæne CTD på RNA polymerase II.

Ved phosphorylering af CTD øger (enhancer) transkription og rekruterer andre faktorer, som kræves til at RNA-polymerase kan syntisere.

28
Q

Hvad er betydning af TATA-box?

A

En sekvens transkripteret af RNA-polymerase
Er cis-acting element for gener
Ligner meget dets bakteriele modstykke men længere væk fra startsted af RNA-polymerase.

Ved mutation på en base i TATA box forringes promotor aktivitet.
Dvs. den rigtige sekvens er essentiel for RNA-polyemerase. Derved forringes transkription.

29
Q

hvad er transkriptions factor?

A

Binder sig til DNA-template.
Er regulatory proteiner
Som binder til bestemte sekvenser tæt på promotor site
Interagerer med RNA-polymerase

30
Q

hvad gør en enhancer?

A

Enhancer øger aktiviteten af promotor
De kan være upstream, downstream og i midten.
De er effektive selv vis de kun er på den ene streng (ikke template)

De er bundet af proteiner kaldet transkriptions aktivatorer, som deltager i reguleringen af transkription.

31
Q

hvad er en mediator?

A

Store proteinkomplekser på 25-30 subunits.
Kommer til transkriptionsmaskineriet inden initation finder sted.
De agerer ”broer” mellem enhancerbundet aktivatorer, andre transkriptorer og promotor bundet RNA-polymerase II.

32
Q

hvilket fænomen er combinatorial control?

A

Et fænomen
Combinatorial control refererer til den måde, hvorpå forskellige regulatoriske proteiner interagerer for at styre genudtryk i celler. I stedet for at et enkelt protein styrer et gen, involverer combinatorial control flere transkriptionsfaktorer, der arbejder sammen i komplekse mønstre for at aktivere eller repressere genudtryk.

33
Q

hvad gør en nuclear hormon receptor?

A

Binder til signal molekyle (ligand)
Ligand-receptor kompleks modificerer udseendet af specifik gen ved binding til kontrol elementer i DNA

Binder til specifikke DNA sites

34
Q

Hvad er ERE

A

Form for nuklear hormon receptor
Estrogen response element (ERE) er en specifik DNA-sekvens, der fungerer som bindingssted for estrogenreceptorer. Disse receptorer er proteiner, der binder sig til østrogen, et vigtigt hormon i mange fysiologiske processer, herunder regulering af reproduktion, vækst og udvikling.

35
Q

hvad er HAT?

A

Histon acetyltransferase

Enzym
Påsætter acetyl på lysine i histone tails.

Histone tails bliver forlænget så de kan være i HAT´s aktive site. Og derved blive acetyleret.

Denne proces løsner DNA fra histonkomplekset.

36
Q

hvad danner chromatin-remodeling engine?

A

Danner fri energi fra ATP hydrolyse.
Så kan nukleosomer skifte position på DNA og starte andre konformationelle ændringer i chromatin (måske derved udsætte bindingssite for andre faktorer)

37
Q

hvad er et nucleosome?

A

Nukleosomer er de grundlæggende enheder af kromatin, som er den struktur, der pakker DNA i celler. Hver nukleosom består af en segment af DNA, der er viklet omkring et kerne af histonproteiner.

38
Q

hvad gør histon deacetylase

A

Histon deacetylaser (HDACs) er en gruppe af enzymer, der spiller en vigtig rolle i reguleringen af genudtryk ved at fjerne acetylgrupper fra histonproteiner på lysine. Denne proces er en del af epigenetisk regulering, som påvirker, hvordan DNA er pakket og tilgængeligt for transkription.

39
Q

hvad er exon?

A

regioner i DNA som koder for noget. de bliver en del af det modne RNA

40
Q

hvad er introns?

A

regioner i DNA som ikke koder for noget

(i hvert fald noget som vi ikke ved noget om)
Oftest den største del af DNA.

de bliver ikke en del af det modne RNA, da de fjernes inden i mRNA, mens det er præ-mRNA

41
Q

hvad er snoRNP?

A

small nukeolear ribonukleoprotein (snoRNP)

Første step i cleavage i pre-rRNA
Disse små proteiner laver modifikationer på ribose og baser på pre-rRNA.

snoRNPs består af smp nucleolar RNA (snoRNA) og andre proteiner.

42
Q

hvad er pre-mRNA?

A

Produkt af RNA-polymerase II.
Kaldes også primær transkript.
Både 3´- og 5´- enden er modificeret.
De fleste pre-mRNA molekyler er splicet til at kunne fjerne introns.

43
Q

hvad er 5’ cap?

A

5´enden på triphosphat enden i det begyndende RNA modificeret kort efter initation af RNA syntese.

  1. phosphorylgruppen fjernes via hydrolyse af RNA triophosphatase
  2. enden på diphosphate 5´af RNA angriber GTP til at former en ualmindelig 5´-5´triphosphate binding. Denne specifikke terminus kaldes 5´cap
  3. N-7 nitrogen atom på terminus guanin er methyleret så dannes cap 0.

Caps bidrager til stabiliteten af mRNA ved at beskytte deres 5´-ender fra phosphorylering og nucleaser.

Også 3´-enden modificeres hos pre-mRNA

44
Q

hvad er Poly(A) tail?

A

Også 3´-enden modificeres hos pre-mRNA

Mest eukaryotisk mRNA indeholder polyadenylate eller poly(A) tail i den dene (3´-enden)

Dette tilføres efter transkription sluttes.

Dvs. DNA koder ikke for poly(A) tail.

Dog kendes Poly(A) tails fulde rolle ikke.
Måske enhancer det translation effektivitet og stabilitet af mRNA.

Oftest er mRNA med en Poly(A) tail mere effektiv template for protein syntese end mRNA uden tail.

45
Q

hvad gør splicing?

A

Proces, som klipper i mRNA for at fjerne introns inden det er det færdige mRNA

Introns starter med: GU
Introns ender med: AG
Dvs.
upstream
exon, GU – exon – AG- exon
downstream

46
Q

hvad er et splicosome?

A

Proteinkompleks.
Kan lave processen splicing.

Består af
- Små RNA molekyler og deres tilhørende proteiner er nøgleelementer for splicosomet.
snRNP´s er RNA proteinkomplekset.

47
Q

hvad er snRNA?

A

Er essentiel for plicing mRNA precursors

48
Q

hvad er Små nuklear ribunikleoprotein (snRNP) partikler

A

snRNP´s er RNA proteinkomplekset.

  1. RNA molekyler er vigtige i forhold til directing af splicing site og udførelsen af catalysen.
    ATP afhængig helicase udruller RNA duplex intermediater, som faciliterer catalysis og induce frigørelsen af snRNP fra mRNA.
49
Q

hvad sker der ved transesterifikation?

A

5´-enden af exon er klippet og det resterende pre-mRNA molekyle fanner en lariat intermediat, hvor first nucleotid fra intron (G) bindes til A i side regionen i en usædvanlig 5´-2´phosphordieste binding.

50
Q

hvad er alternativ splicing?

A
  1. Er en alternativ splicing, som giver en stærk mekanisme for udvide alsidighed for genomiske sekvenser gennem combimatorial control.
51
Q

hvad er RNA editing?

A

Begreb for ændring i nukleotid sekvens af RNA efter transkription. Dette sker ved andre processer end RNA splicing.

52
Q

hvad er catalytisk RNA?

A

Kaldes også riboenzymer
RNA alene kan være katalytisk inder bestemte forhold. Og kan derved agere enzym.

53
Q

hvad gør selv-splicing?

A

En reaktion i gruppe I introns
Kræver tilførsel af guanosin eller guanin nukleotid (dette er energikilde)

-OH gruppen på Guanosine factor angriber 5´-enden af intron.
Guanosin sætter sig på enden, mens -OH sætter sig på den nu frie 3´-ende og binder upstream- og downstream exon sammen (linear RNA)

CMB (19 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions