F1 + F2 Flashcards
omkring det basale en celle består af (elementer etc.) Cellens membran og Cellen som den grundlæggende enhed
En celle helt kort
- Er basis for liv
- Kan vokse, replikere og interagerer med deres miljø
- De beskyttes af cellemembran for deres omgivelser
- Der skal være en hel membran for at kunne sige en organisme er i live.
- Består af millioner af molekyler
- 70% er vand
- Vigtigste atomer: carbon, hydrogen, nitrogen, svovl, oxygen og fosfor
Muskelcelles funktion
Skaber bevægelser hos skelet, hjerte etc.
Hjerneceller/neuroner
Skaber elektriske signaler til kroppen, Kontrollerer bevægelser, 5 sanser
Fibroblast
Skaber ekstracellulær materiel, som holder celler sammen i væv
Hvad består en celle af?
- Carbon
- Hydrogen
- Oxygen
- Nitrogen
- Fosfor
- Svovl
- Disse atomer er ca. 98% af vores krop
- Vand: 70% af vores krop
Hvad er en membran?
- En hinde til at beskytte eller indeholde en væske eller lignende
- Molekylerne i membranen er mere hydrofobe end det de omgiver, som er mere hydrofil.
- Membranen er dynamisk og bevægelig
- Det er nemmere at lave om på en membran end at bygge en hel ny.
- Membraner i cellen er varierende i forhold til indhold af proteiner, lipider etc.
Hvad består en membran af?
- Lipider
- Cholesterol
- Proteiner
Hvad er integral membran proteiner?
- Sidde i membranen, de er integrerede i membranen
- Kan kun tages væk ved at ødelægge membranen
Hvad er Periphetale membran protein
- Sidder i overfladen af membranen
- Sidder på hovederne af lipiderne
hvad er Lipid-anchored membran proteiner
- Har et lipid eller prenyl anker i membranen og derved sidder i membranen.
Hvilke membranprotein struktur er den mest hyppige?
Alfa-ehlix
- H-binding stabiliserer alfahelixer (indeni)
- Viser hydrofobiske sidekæder til lipidernes hydrofobe kæder
Hvad er beta strand?
er sekundær struktur som alfa-helix
- Bundet via hydrogenbindinger
- Ikkepolær overflade interagerer med hydrocarbon kerne
- Hydrofile kerne er fyldt med vand
Findes triglycerider i cellemembranen?
nej
hvad er opbygningen af cellemembranen?
- Består af hydrofile hoveder og lipofile haler (lipider)
- Har van der waals interaktioner mellem de hydrofile haler i membranen
- De ligger i 2 lag, hvor halerne (lipofile ender) vender mod hinanden
- Mens hovederne (hydrofile ender) vender ud af, enten mod cytoplasma eller ud mod omgivelserne.
- Er vandafvisende
- Cellemembranen er asymmetrisk – de er ikke ens, de to lager af lipider
- De forskellige membraner i en celler er forskellige fra hinanden. Mitokondriemembran er anderledes for cellemembranen pga. funktion og dermed deres indhold.
hvad er et flip?
Flip af lipider sker kun ved hjælp af proteiner i membranen
Dette er når cellen, vil have membranen til at omstrukturere.
Hvad har fluidity af betydning for membranen?
Temperatur har indflydelse på fluidity af membranen. Jo højere temp. Jo mere fluidity
- Antallet af dobbeltbindinger mindsker smelte temp. Dobbeltbindinger skaber mere plads mellem lipiderne, da de fylder mere ved dobbeltbindinger
Jo flere carbonatomer, øger smelte temp.
hvilke factor er der for membran fluidity?
Faktorer for membrans fluidity
- Mængden af dobbeltbindinger
- Længden af lipiderne
- Mængden af cholesterol
hvad er cellemembranens funktion?
- En hinde, som indeholder cytoplasma
- beskytter cellens vigtige organeller.
- Indeholder molekyler og ioner
- Beskytter mod udefrakommende legemer
- Kun specifikke molekyler kan komme igennem membranen (permabilitet)
Hvilke stoffer kan komme igennem en cellemembran via simpel diffusion?
hydrofobe molekyler
små neutrale molekyler så som ilt og CO2
vand kan til dels lave simpel diffusion, men det går langsomt.
Hvilke stoffer kræver hjælp for at komme over membranen?
polære organiske molekyler
sukre
ioner og ladede molekyler
proteiner
andre store molekyler
Vand
- Polær molekyle
- Danner hydrogenbindinger
- Har både partial negativ og positiv ladet ender på hhv. Oxygenatomet og hydrogenatomet.
Elektronerne er mest ved oxygenatom pga. EN, hvorved O er partiel negativ ladet, mens hydrogen er partiel positiv ladet. - Dårlig opløsningsvæske for upolære stoffer
- Kan optage store mængde af varme
- Vand er godt isolationsmateriale, da det kan absorbere meget varme.
hvilke bindinger kan vand danne?
hydrogen bindinger
Hvad er lipider?
- Fedt
- Er hydrofobe og hydrofile: amfiliatiske molekyler
- Oxygen i lipider gør dem lidt hydrofile
- De er oftest uopløselige i polære opløsningsvæsker
- Er små molekyler i forhold til proteiner og nucleotider
- Har lille molekylærvægt
- Er amphipathic molecule, da den har både polær og upolær ender
hvilke funktioner har lipider?
- Fuel and energy lager
- Hormones
- Messengers in signal-transduction pathways
- Components of membranes
- De klumper sig sammen i cytosol.
- Ofte er lipider sat sammen med hydrofile funktionelle grupper, som gør dem lidt hydrofile (lipiderne)
hvad er phosphorlipider?
- Mest forekommende
- Sidder i cellemembran
- Er forgrenede molekyler
- Lipider er ikke opløselige i vand
- De klumper sig sammen til enten mono- eller bi-layer
- Er amphipathic molecule, da den har både polær og upolær ender
hvad er phosphorlipiders funktioner?
- Deres funktion er at danne lipid bilayer i membran
- De er delvis permable for bestemte stoffer.
- Phosphorlipider er neutralt ladet (summen af alle ladninger)
hvilke typer af phosphorlipider findes der?
- Fosforglycerider er det oftest forekommende. (en del af cellemembran)
- Sphingolipider (en del af cellemembran)
- Steroler (en del af cellemembran)
- Triglycerider (danner dråber)
hvad består en phosphorlipid af?
- hydrofob hale (fedtsyre): Er vandafvisende, Har van der waals interaktioner
- Phosphatgruppe – den polære og hydrofile del
- Glycerol backbone
- hydrofil hoved: Er vandtiltrækkende, Er elektrostatiske, Har hydrogenbindger med hinanden
Hvad er monolayer
- Kun ét lag af lipider
- Enderne vender den samme vej
Hvad er bilayer
- 2 lag af lipider
- De hydrofobe ender vender ind mod hinanden
- De hydrofile ender vender ud ad mod den vandige opløsning.
Hvad er micelle
- Danner en kugler/cirkel, hvor alle hydrofobe ender vend ind mod centrum, mens hydrofile ender vender ud ad.
hvad er liposomer
- Der er bilayer, men er formet som en kugle.
Hvad er Sphingolipider?
- Bruges som bindingssite for fedtsyre og phosphatgrupper
- Fedtsyre
- Sphingosine backbone
- Hovedgruppe: forskellige grupper/egenskaber
- Har en lang ”hale”, der minder om fedtsyre
Hvad er fedtsyre
- Kan være mættede, udmættede (dobbeltbindinger) polymetættede (mange dobbeltbindinger) etc.
- Saturated fatty acid: mættet fedtsyre
- Mono saturated fatty acid: monomættet fedtsyre
- Unsaturated fatty acid: umættet fedtsyre
- Hovedgruppen kan have forskellige egenskaber, polære, negativt ladet etc.
hvad er fedtsyres funktioner?
Fedtsyrer har flere vigtige funktioner i kroppen:
Energikilde: Fedtsyrer giver koncentreret energi ved at blive nedbrudt til ATP.
Cellemembraner: De er byggesten i cellemembraner, som beskytter og regulerer cellernes funktioner.
Isolering og beskyttelse: Fedtvæv isolerer kroppen og beskytter organer mod stød.
Hormonproduktion: De er nødvendige for at producere hormoner som østrogen og testosteron.
Hvad består en fedtsyre af?
En fedtsyre består af en lang kæde af kulstofatomer (C), bundet til hydrogenatomer (H), og har en carboxylgruppe (-COOH) i den ene ende.
- 16, 18 eller 20 lang carbonkæde hos fedtsyre
- Fleste har en eller 2 dobbeltbindinger (18:1) eller (18:2)
- Glycerolgruppen (glycerol backbone) er hvor fedtsyrene er bundet til
- Phosphatgruppen er ledet mellem glycerol og hovedgruppen
Sphingosine backbone - Backbone hos Sphingolipiders
- Den gruppe hvorpå fedtsyren er bundet.
hvad er steroler?
- Inkluderer kolesterol
- Vigtigt molekyle for cellemembran
- Sidder oftest i rummet med hydrofobe ender (kolesterol er hydrofobt)
- Linær struktur
- Lille hydrofil del
hvad er triglyceroler?
- Olier og fedt
- Er energilager for dyr
- Er uopløselige i vand
- Sidder i dråber
- Transporteres af lipoproteiner for at få dem rundt i kroppen.
- 3 forskellige fedtsyre
- Glycerol backbone
- Hver fedtsyre er bundet til et o hos glycerol backbone
- En måde at lagre fedtsyre på i kroppen
Hvad er lipoproteiner
Lipoprotein: består af både protein og lipider. Mange enzymer, transportere, strukturelle proteiner, antigener og toxiner er lipoproteiner. Eksempler på lipoproteiner er HDL og LDL i blodet.
Hvad er carbon?
et grundstof
Vigtigste atom for liv
kan danne 4 enkelbindinger, for at opnå oktetregel.
bliver dermed mest stabil.
Hvad er carbohydrater?
- er carboydrater
- består af monosaccharider (glucose etc.)
- er rygrad/backbone for nucleidsyre i RNA
- d- sukre er de mest naturlig forekommende
hvad er strukturen for carbohydrater?
- Enten rind eller lineær kæde
- oxygen og hydrogen er i de funktionelle grupper (hydroxyler, carbonyler, aldehyder, alkaner etc.)
- indeholder mindst 3 carbon
- D-ribose: backbone for nucleid syre RNA
- D-glucose: monosacchraid, sucker
- Disaccharider: 2 cycliske ringe
- Oligosaccharider: få sukre bundet sammen med glycosidic bindinger
Har mange funktioner, kan være bundet på proteiner, lipide molekyler, - Polysaccharider: mange sukre bundet sammen med glycosidic binding. (stivelse)
Hvilke bindinger er der mellem disaccharider?
O-glycosidic binding
Hvad er glycogen?
- energilager hos dyr
- består af lange kæder af glucosemolekyler med forgreninger.
Stivelse:
- energilager hos planter
aldehyd + alkohol = hemiacetal
Hvad er proteiner?
- Består af aminosyre
- Signalstoffer
- receptor
- Bygges af op til 20 forskellige aminosyre
Hvad er primær struktur?
- Rækkefølge af aminosyre
- Peptidbindinger
- Sidder som polymere
Hvad er sekundær struktur?
- Hvordan kæderne af aminosyre sidder sammen, hvilke bindinger binder dem sammen?
- Hvordan folder kæderne i 2D
Hvad er tertiær struktur?
- Hvordan de rummeligt sidder
- Deres foldning i 3D
Hvad er kvartnær struktur?
- Hvis et protein består af flere monomere
Hvad er nukleinsyre?
- DNA
- RNA
- Består af nukleotider
- Lagre og overføre/transfer information
Hvordan er nukleinsyre bygget op?
nukleotider + phosphatgruppe
DNA og RNA består af nukleinsyre
Hvad er aminosyre?
Aminosyrer er de byggesten, der udgør proteiner. De består af en aminogruppe (-NH2), en carboxylgruppe (-COOH) og en variabel sidekæde, der bestemmer den enkelte aminosyres egenskaber. Der findes 20 forskellige aminosyrer, som sammen kan danne utallige proteiner, der er nødvendige for kroppens funktioner. Nogle aminosyrer er essentielle, hvilket betyder, at kroppen ikke kan producere dem og de skal derfor indtages gennem kosten.
hvad er et α-amino syre?
- har et centralt carbon-atom (α-carbon)
- α-carbon har en amingruppe på en ende
- carboxylgruppe på den anden ende
- hydrogen-atom på en anden ende
- sidste R er sidekæden (som er forskellig for hver aminosyre)
Er alle aminosyre chirale?
- nej, glycin er ikke chiralt
- Alle aminosyre er chirale (pga. 4 forskellige grupper på central-carbon)
- de kan findes som L eller D isomere (ikke alle aminosyre) – deraf spejlbillede af aminosyre
- Kun L isomer bruges til at bygge proteiner
hvilke former findes aminosyre i?
- protoneret
- zwitterion
- deprotoneret
hvordan er en aminosyre protoneret?
begge grupper er protonerede
dette sker ved lav pH
hvordan kan en aminosyre være en zwitterion?
carboxylgruppen har en pKa på ca. 2, hvilken gør, at den først afgiver sin proton.
Men den anden gruppe (amin) bliver først deprotoneret ved højere pH-værdier (omkring 9-11).
dvs. C-terminalen er deprooneret (minus ladning) mens N-terminalen er protoneret (plus ladning).
dette sker oftest ved fysiologisk pH
det er en dipolar ion
hvordan kan en aminosyre være deprotoneret?
amin-gruppen afgiver sin proton (bliver deprotoneret) og derved bliver neutralt ladet.
derved er begge terminaler deprotoneret.
amin-gruppen afgiver først sin proton ved pH 9.
Amino syre sidekæder?
Der findes 20 forskellige aminosyre, som er forskellige pga. deres sidekæder
- størrelse
- ladning
- hydogenbindings kapacitet
- hydrofobisk egenskab
- kemisk egenskab
alle disse forskelligheder gives af funktionelle grupper
- alkoholer
- thioler
- thioethere
- carboxylsyre
- carboxamider
- andre basiske grupper
Hvordan er aminosyre delt op?
De er opdelt i 4 grupper
1. hydrofobe aminosyre med ikkepolær R
2. polære aminosyre med neutral R
ladningen er ikke fordelt ligeligt over molekylet
3. positiv ladet aminosyre med R, der er positivt lade ved fysiologisk pH (pH=7,4)
4. negativ ladet aminosyre med R, der er negativt ladet ved fysiologisk pH
hvilke aminosyre er hydrofobe med ikke-polær sidekæde?
- Glycin – Gly, G
- Alanin – ala, A
- Valine – Val, V
- Leucin - Leu, L
- Isoleucin – Ile, I
- Prolin- Pro, P
- Phenylalanin – Phe, F
- Trytophan – Trp, W
- Methionin – Met, M
Hvilke aminosyre er polære
Hydroxyl (-OH) gruppe
Mest tilbøjelige til at danne binding med andre polære
- Serin – Ser, S
- Threonin – Thr, T
- Tyrosin – Tyrm Y
Carboxylamine gruppe
- Asparagine – Asn, N
- Glutamin – Gin, Q
Thiol (-SH) gruppe
- Cystein – Cys, C
hvilke aminosyre er positivt ladet
Positiv ladet aminosyre med R, der er positivt lade ved fysiologisk pH
Lysin – Lys, K
Arginin – Arg, R
HIstidin – His, H
hvilke aminosyre er negtaiv ladet
Negtaivt ladet aminosyre med R, der er negativt ladet ved fysiologisk pH
Aspartatsyre – Asp, D
Glutaminsyre – Glu, E
hvad er DNA
Deoxyribonucleotid syre
Dobbelt strenget helix i ”højere organismer”
Er byggeplanen for organismen
Er sekvenser af nucleutider
hvordan er DNA opbygget?
- 4 deoxyribonucleotid
- Er kun forskellig i hvilke baser der bruges
G(guanin), C (cytosin), A (adenin) og T (tymin) - Baserne interagerer med hinanden i dobbelt helixer A og T, G og C.
- Fosfordiester bindinger
Hvad er RNA
Ribonucleutid syre
Enkeltstrenget helix
Nedbrydes ofte.
mRNA er kopiser af strenge af DNA, er den information som skal laves om til protein
hvordan er RNA bygget op?
- 4 deoxyribonucleotider
- Er kun forskellig i hvilke baser der bruges
G (guanin), C (cytosin), A (adenin) og U (uracil). T er er byttet ud med U - Sukkermolekylerne i ribonucleotiderne har en ekstra -OH gruppe (hydroxyl)
Hvad er forskellen på RNA og DNA?
DNA (deoxyribonukleinsyre) og RNA (ribonukleinsyre) er begge nukleinsyrer, men de adskiller sig på flere måder:
Struktur: DNA er dobbeltstrenget, mens RNA er enkeltstrenget.
Sukker: DNA indeholder deoxyribose, mens RNA indeholder ribose.
Basetyper: DNA har baserne adenin (A), thymin (T), cytosin (C) og guanin (G), mens RNA har uracil (U) i stedet for thymin.
Funktion: DNA opbevarer og overfører genetisk information, mens RNA hjælper med at oversætte denne information til proteiner (særligt mRNA).
Samlet set fungerer DNA som den langsigtede opbevaring af genetisk information, mens RNA er involveret i proteinproduktionen.
hvad er en nukleotid?
Består af sukre
- 5 carbon-atom i ring
- Enten deoxyribose
- Eller ribose
- De sidder fast til en heterocylisk ring=base
- Der sidder mindst én fosforylgruppe
Hvad er en leaflet?
I en biologisk membran refererer leaflet til et af de to lag i en lipidbilayer. Hvert lag består af fosfolipider, hvor det ene lag vender mod cellens yderside (ekstracellulær leaflet) og det andet mod cellens indre (cytoplasmisk leaflet). De to leaflets har forskellig lipid-sammensætning og er vigtige for membranens funktioner som signalering og transport.
The fluid-mosaic model
Er en model for membran organisering
- Membranen repræsenterer et mosaik mønster
- Phosphorlipider bilayer agerer som plan væske
- Membranproteinerne flyder rundt i dette mønster
- Hydrofbiske interaktioner er mellem phosphorlipid haler og hydrofobiske aminosyre, som derved holder mønstret sammen.
- Inde i mosaiken flyder ”flåder” (lipid rafts) rundt.
- De er kemisk og fysisk forskellig fra dens omgivelser
- De indeholder proteiner, phosphorlipider og andre lipider (herunder cholesterol)
- Dens bestanddele er bundet tæt sammen.
glycolipid hvad er det?
Er lipider, som er bundet til carbohydrater
Er vigtig for membran constituents
Glycolipider er altid orienteret asymmetrisk i membranen, så sukre residues altid er på den ekstracellulære side.
- Cerebroside: er den simpleste glycolipid, har et sukker residue (enten glucose eller galactose)
- Ganglioside: mere kompleks glycolipid, indeholder forgrenet kæde med mange sukre residues.
hvad er cell-cell junction?
Cell-cell junctions er strukturer, der forbinder celler med hinanden, og de muliggør kommunikation og mekanisk sammenhold i væv. De hjælper med at opretholde vævets struktur og funktion. Eksempler inkluderer tight junctions, desmosomer og gap junctions.
hvad er adherens junction?
Adherens junctions er celleforbindelser, der hjælper med at holde naboceller sammen i væv. De er især vigtige for væv, der kræver mekanisk stabilitet, som f.eks. epitelvæv. Adherens junctions dannes primært af cadheriner, som er proteiner, der binder cellerne sammen, og de er forbundet til aktinfilamenter inde i cellen. Denne type junction spiller en central rolle i vævsstruktur, signalering og cellebevægelser.
hvad er desmosomer
desmosomes: binder naboceller sammen, så væv forbliver sammen, selvom der sker stræk og andet stress.
hvad er gap junctions?
- gap junction: de er kanaler mellem naboceller, tillader transprot af ioner, vand og andre subtrater.
hvad er tight junction?
- tight junction: funktion er at holde væske adskilt mellem celler.
