Eksamen spørgsmål, som jeg havde forkert Flashcards
Hvilken af følgende kan være enheden for kcat?
s-1
Hvilket af følgende udsagn er sandt om Km?
Km kan have enheden mol/l
Fra hvilken del af Golgi-apparatet udsendes vesikler med proteiner til cellens membran?
Trans
Ved endocytose fusionerer de endocytotiske vesikler med vesikler fra hvilket andet organel?
Golgi-apparatet
Den genetiske kode angiver sammenhængen imellem
aminosyrer og codons
Lipopolysakkarider er pyrogene og problematiske ved fremstilling af lægemidler fordi
de er modstandsdygtige overfor autoklavering
nmol/l kan være enheden for
Km
De rør-lignende forbindelser imellem celler kaldes
gap junctions
Hvilken reaktion katalyserer en kinase?
Phosphorylering (påsætte phosphat-gruppe)
Hvilken indflydelse vil en non-kompetitiv hæmmer af et enzym have på Vmax(app)
Vmax(app) er mindre ift. V(max)
Hvilket af følgende G proteiner er involveret i signalering via Ca2+?
G(alpha) q
Hvor mange transmembranelle domæner har G protein-koblede receptorer?
7
Hvor mange tRNA binding sites findes der i ribosomet?
3
Hvilken OH-gruppe på DNA’et bliver der sat nye nukleotider på under DNA-syntesen?
3’
Hvilket af nedestående temperaturinterval ville man normalt sige var nødvendigt for optimal vækst af
en termofil bakterie?
Minimum 40-70 grader C
tRNA molekylet vekselvirker med
ribosomet
Ved bakterievækst observerer man en stationær fase fordi
bakterierne mangler næring
Hvad er et mutagen?
Et kemisk stof som forårsager ændringer i DNA’et
I hvilket organel foregår splicing?
I nucleus
I hvilken cellulær proces er en elongeringsfaktor nødvendig?
Translation
Et enhancer element er involveret i?
Transskription
Hvad er forskellen mellem major og minor groove?
Baserne er mere eksponerede i major groove
Hvilken type kemisk modifikation er nødvendig for at initiere transskription?
Fosforylering
Hvor mange histoner indgår der i et nukleosom?
8
Hvilken type skade forårsager UV-lys på DNA?
Krydsbinding af baser
Hvilket af følgende enzymer indeholder et såkaldt ”Exit site”?
Ribosomet
En ”nuclear hormone receptor” binder til
DNA sekvenser kaldet ”response elements”
Hvilket organel foregår ”RNA processing” i?
Nukleus
Transport af vesikler mellem ER og Golgiapparatet kræver involvering af
motorproteiner
Et apoenzym
er enzymet uden co-faktorer m.m.
Hvilken af følgende kan være enheden for Km?
nM
Et allosterisk enzym adskiller sig fra et Michaelis-Menten enzym ved
at binding af substrat stabiliserer R-state
Et transportsystem der kan transportere det samme molekyle, A, i begge retninger afhængig af
gradienten er
uniport ift. A
Udsagnet “spontan hydrolyse af bundet GTP” handler om hvilken proces?
Inaktivering af et G protein
Ved tilsætning af et ukendt stof, falder den totale cellemængde samt CFU. Hvilken
“drabsmekanisme” kunne der være tale om i dette tilfælde?
Bakteriocidt
Hvilket udsagn er passer bedst mht. væksten af en termofil bakterie?
Den vokser dårligt ved lavere temperaturer (f.eks
37 grader C) og skal have en høj temperatur for
optimal vækst
Hvilken type RNA nedbrydes af enzymet argonaut?
mRNA
Hvorledes repareres et “double strand break” i DNAet?
Rekombination
Et restriktionsenzym genkender en/et
DNA-sekvens
Ved translation af visse proteiner, som indeholder et signalpeptid, fører SRP ribosomet hen til
translocon
Hvilken form har et plot af den initiale reaktionshastighed mod substratkoncentration for en
enzymkatalyseret reaktion, hvis der er tale om et allosterisk enzym?
En S-formet (sigmoidal) kurve
Størrelsen Kcat/Km siger noget om
et enzyms substratpræferance
Hvilket af følgende udsagn er sandt om en enzymkatalyseret reaktion?
V(0) kan måles i enheden mol/sek
En transportproces i cellens plasmamembran er antiport i forhold til Na+ og aminosyren alanin.
Hvilket af følgende udsagn er sandt om denne proces?
Na+ bevæger sig fra det extra- til det intracellulære
rum
Et transportsystem der kan transportere et molekyle, A, i begge retninger afhængig af gradienten er
uniport i forhold til A
En transportmekanisme for glutamin er koblet symport til H(+)-gradienten. Hvad sker der med
transporten af glutamin ind i cellen, hvis pH falder extracellulært?
Den stiger
Hvilken indflydelse vil en non-kompetitiv hæmmer af et enzym have på Km(app)?
Km(app) er lig med Km
Ved tilsætning af et givet stof til en eksponentielt voksende bakteriekultur observeres et fald i
CFU/ml og stagnering af OD450. Ved yderligere tilsætning af samme stof til samme kultur
observerer man nu også et fald af OD450. Hvad kunne begge observationer tyde på?
3) Stoffet er bakteriocidt ved lav og -lytisk ved høj
koncentration
Hvilken enzymatisk aktivitet er karakteristisk for en Argonaut?
Endonuklease aktivitet
Hvilket element er essentielt for initiering af transskription?
Promoter
Hvor mange primere er nødvendige for at køre en PCR?
2
Hvilken type interaktion er essentielt for et Western blot?
Protein:Protein
Et anticodon loop sidder
på et tRNA
Hvorledes indikerer proteinsekvensen typisk hvor det hører til i cellen?
Ved hjælp af signalpeptid
Hvilket af følgende benyttes ikke i en PCR reaktion?
Aminosyrer
En eksponentielt voksende bakteriekultur behandles med et givet stof, først ved en lav og dernæst
ved en høj koncentration. Ved lav koncentration observeres stagnering af CFU/mL og OD450; ved
højere koncentration falder begge. Hvilket er sandt for det givne stof?
Det er bakteriostatisk ved lav og -lytisk ved høj 1
koncentration
Under hvilken af celledelingens faser finder DNA replikationen sted?
S1
cAMP aktiverer
PKA
En 5’ cap
beskytter mRNA’et
Hvad er forskellen på deoxyribose og ribose?
2’ positionen har et H i deoxyribose og en OH- 1
gruppe i ribose
Hvilke baser vekselvirker med hinanden i en DNA dobbelthelix?
Purin:Pyrimidin
Hvor i cellen befinder en intracellulær hormon receptor sig?
I nukleus
I et ribozym består den katalytiske del af
RNA
Ved splicing
Fjernes introns fra mRNA
Den apikale membran i en tarmcelle vender imod
Tarmlumen
Hvilket af nedestående aminosyrepar vil kunne danne en elektrostatisk interaktion via deres
sidekæder?
Glutamat:Lysin
Lineweaver-Burk plots of hhv. enzym+substrat og enzym+susbtrat+inhibitor skærer hinanden ved
X=0. Hvilken type inhibering er der tale om?
Kompetitiv
Adenylate cyclase’s katalytiske domæner befinder sig
Intracellulært
Fosfolipase C hydrolyserer
PIP2
Hvilken af nedenstående processer kræver en start codon?
Translation
Hvilken af nedenstående processer kræver en promoter?
Transkription
Hvilken af nedenstående processer kræver en primer?
Replikation
Proteiner analyseres ofte i foldet eller udfoldet tilstand ved hjælp af gelelektroforese. Hvilket stof
tilsættes for at sikre udfoldning af proteinerne?
SDS
En ekspressionsvektor er et
cirkulært DNA-molekyle
Translocon spiller en central rolle i
transport of polypeptider ind i ER
Et enzym udviser ‘cooperativity’ ved binding af substrat. Dvs der er tale om
et allosterisk enzym
Hvilket af følgende udsagn er sandt om en enzymkatalyseret reaktion?
V(0) kan måles i enheden mol/sek
Den målte Vmax for transport af molekyle A ind i en celle falder efter behandling med stof B. Hvilken
effekt kan stof B have på transportsystemet?
B aktiverer internalisering af transportsystemet
Hvilken indflydelse vil en kompetitiv hæmmer af et enzym have på Km(app)?
Km(app) er større end Km
Man har ladet en E. coli kultur vokse i flydende medie. Netop som kulturen træder ind i den
stationære fase tilsættes et bakteriostatisk stof. Hvilken effekt vil dette have på efterfølgende
målinger af OD600 og vitaltælling (der skal ses bort fra den naturlige dødsfase)?
Ingen effekt
Til samme kultur (og på samme tidspunkt) som i foregående spørgsmål tilsættes i stedet en blanding
af næringsstoffer. Hvilken effekt vil dette have på efterfølgende målinger af OD600 og vitaltælling
(der skal ses bort fra den naturlige dødsfase)?
Begge stiger
Q10-værdien angiver
Hvor meget decimeringstiden ændrer sig, når 1
temperaturen ændrer sig 10C
Ved ionbytter kromatografi separerer man proteiner baseret på deres ladning. Hvilken af
nedestående mutationer kunne tænkes at have størst effekt på denne type kromatografi?
Glutamin til glutamat
Hvilken funktion har ”single-strand binding proteins”?
De holder DNA strenge adskilt
RNA polymerase binder til promoter inden syntese af RNA, men den kan ikke binde af sig selv. Hvad
kræver dette?
Transkriptionsfaktorer
”Signal recognition particle” har en væsentlig rolle i
i “targeting” af protein
Hvilken af nedestående aminosyrer modificeres ved methylering?
Arginin
Hvor mange forskellige temperaturer benyttes i en standard PCR cyklus?
3
Enzymet reverse transcriptase benytter mRNA til at syntetisere
cDNA
For at undersøge om et givet stof er bakterio-statisk -cidt eller -lytisk vil man
måle OD600 (eller OD450) og CFU på en 1
voksende kultur efter tilsætning af stoffet
“Dynamic instability” er et fænomen der vedrører
microtubulus
På hvilken måde vil en positiv allosterisk modulator påvirke et plot af reaktionshastigheden som
funktion af substratkoncentrationen?
Kurven vil venstreforskydes
Transportsystem A har en Vmax på 100 nmol/min og system B en Vmax på 1 mmol/min. Begge har
en Kt på 1 mM. Ved en substratkoncentration på 1 mM, hvilket system transporterer så flest
substratmolekyler per tid?
B
Kcat er et udtryk for
en enzymkatalyseret reaktions maksimale 1
hastighed
En kompetitiv hæmmer
øger Km (app) ift. Km
Hvilken af nedenstående aminosyrer ser man typisk i interaktionen imellem histoners ”haler” og
DNA?
Lys
Visse receptorer er i stand til at påvirke transskriptionen direkte, når de binder deres ligand; et
eksempel på en sådan receptor er østrogen-receptoren. Hvor befinder denne receptor sig?
I cellekernen
mRNA bliver modificeret ved polyadenylering (polyA) og capping. Hvor på mRNA modificeres der?
polyA på 3’ og capping på 5’
Hvad menes der med ”Katalytisk RNA”?
At RNA selv er i stand til at katalysere en reaktion?
”Signal recognition particle”
er indblandet i protein translokation
Vi har kørt en PCR og ser alt for mange biprodukter, altså DNA stykker som ikke svarer til den
forventede længde. Ved hvilket trin bør man ændre temperaturen?
”Hybridisering” af primerne
Allsteriske enzymer udviser
cooperativity ved binding af substrat
System N (membrantransportsystem for visse aminosyre, som du kender fra øvelserne) kobler
antiport til H+ og symport til Na+. Hvilket af følgende udsagn er korrekt?
Et fald i pH på 0.5 enheder påvirker
transporthastigheden af en aminosyre ind i cellen
negativt
G proteinet G(alfa)s binder til
adenylyl cyclase
Km er et udtryk for
den koncentration af substrat der giver den
halvmaksimale reaktionshastighed
Hvilken indflydelse vil en kompetitiv hæmmer af et enzym have på Vmax(app) relativt til Vmax?
Ingen indflydelse
Hvilket af nedenstående er en modifikation af transskriberet RNA?
Splicing
Den genetiske kode angiver sammenhængen i mellem
En sekvens af mRNA og aminosyrer?
En mutation centralt i ribosomets P-site medfører sandsynligvis at:
tRNA kan binde til ribosomet, men der ikke kan 1
dannes peptidbindinger
I forbindelse med molekylærbiologisk forskning benytter man ofte enzymer som kaldes ”restriction
enzymes”. Hvilken aktivitet er typisk associeret med disse enzymer?
De skære i specifikke sekvenser i DNA
Signalpeptidet indikerer hvor et givet protein skal sendes hen i eller uden for cellen. Hvor i proteinet
sidder signalpeptidsekvensen?
N-terminus
Massespektrometri er hyppigt anvendt indenfor proteinforskning. Proteinerne eller deres fragmenter
bliver adskilt baseret på deres
molekylvægt
Hvilket af disse tre filamenter benyttes ved cellebevægelse?
Microtubules
Når nye membranproteiner tilføjes plasmamembranen og proteiner/andre molekyler sekreteres,
foregår begge ved samme proces; hvad kaldes denne?
Exocytosis
Hvilken af disse organismer kræver oxygen for at overleve?
Obligate aerobes
Hvilken metode benyttes til en direkte bestemmelse af det totale antal bakterielle celler?
Microscopic counts
Nævn en gruppe af co-faktorer til enzymer?
organiske molekyler fra vitaminer
Når et enzym hæmmes med en reversible kompetitiv hæmmer?
Så stiger Kmapp
ABC transporteren ”CFTR” transporterer Cl- ved forbrug af
ATP
Alle G-proteiner
har GTPase aktivitet
Aktivering af ’protein kinase receptorer’ kan medføre
krydsphosphorylering og rekruttering af adapter
proteiner
En promoter kan kun binde RNA polymerasen når
Kontakten medieres af transskriptionsfaktorer
Hvilken af nedenstående er ikke en post-translationel modifikation?
Splicing
En mutation i signalpeptidet for en receptor har gjort at peptidet ikke kan genkendes af ”signal
recognition particle”. Hvor vil man da formode at receptoren ender efter translation?
Cytosolen
Hvad benyttes en SDS-PAGE til?
Adskillelse af proteiner baseret på deres
molekylvægt
Hvad er generationstiden (g) for en bakterie, når antallet af celler for denne bakterie øges fra
3,000,000 til 12,000,000 på 2 timer?
1 time
Benzalkoniumklorid er et antimikrobielt stof som kan opløse membraner. Er virkningsmekanismen
da:
Bakteriolytisk
Vælg den korrekte funktion for et proteolytisk enzym (protease)
Proteaser nedbryder peptid-bindinger ved brug af
H20
Hvordan beskrives et enzyms substrat binding bedst matematisk
Den beskrives ved KM
Katalytisk perfektion for enzymer nærmer sig en af følgende
Diffusions hastighed
Na+/K+ ATPasen kan primært beskrives ved følgende
Aktiv transportør og antiporter
Hæmmer man Na+/K+ ATPasen så kan følgende ske
Intracellular Na+ koncentration stiger hvilket kan
øge mængden af intracellular Ca+
Hvordan virker Ca2+ primært som sekundær messenger
Ved binding til Calmodulin
Den hurtigste form for signalering sker ved
Ligand aktiveret åbning af ionkanaler
Hvilken rolle spiller promotorer under RNA-transkriptionen, og hvor ender man dem?
Promotorer er DNA-sekvenser, der markerer 1
begyndelsen af et gen og giver bindingssteder
for RNA-polymerasen
Hvad er det primære formål med capping og polyadenylering i RNA-transkriptionen af
eukaryoter?
At beskyƩe mRNA mod nedbrydning og
forbedre oversæƩelse af mRNA Ɵl protein.
Hvad er forskellen mellem en “signalsekvens” og en “stopkodon”?
Et stopkodon består af 3 nukleoƟder og en 1
signalsekvens består typisk af 55-60
nukleoƟder
Hvad er glykosylering af proteiner, og hvilken effekt har det typisk på proteiners funktion?
Glykosylering er Ɵlføjelsen af sukkermolekyler 1
Ɵl aminosyrer i proteiner, og det kan ændre
proteiners stabilitet og akƟvitet.
Hvilken metode anvendes typisk til at oprense proteiner baseret på deres ladning?
IonbytningskromatograĮ
Hvilken teknik bruges til at separere DNA-fragmenter baseret på deres størrelse?
Gel-elektroforese
Hvilket udsagn om biologiske membraner er korrekt?
Biologiske membraner er i væskefasen
Hvilke dele af cellens cytoskelet afhænger af ATP?
MikroĮlamenter
Hvad er navnet på mikroorganismer, der har en optimal væksketemperatur på over 80
grader?
Termofil
Hvad er generationstiden for bakterier, hvis celletal stiger fra 2.000.000 til 16.000.000 på 3
timer?
1 time
Et antimikrobielt middel dræber bakterier uden at påvirke deres membran. Er det et:
Bakteriedræbende middel
Proteolytiske enzymer kan?
nedbryde peptider
Allosteriske enzymer har en kvaternær-struktur og deres adfærd beskrives ved
enten ’the concerted model’ eller ’the
sequential model’
En nervecelles aktionspotential kan studeres og måles med følgende teknik
patch-clamp elektrofysiologi
Ligand aktivering af G-protein koblede receptorer (GPCR) kan medføre
konformationsændringer, som gør at GTP kan
bytte plads med GDP
Protein kinase receptorer ligand binding kan medføre
receptor dimerisering, krydsphosphorylering,
rekruttering af adapterproteiner
Hvad er transskriptionsfaktorer, og hvordan bidrager de til reguleringen af RNAtranskription?
Transskriptionsfaktorer er proteiner, der
binder til promotorregioner og kan øge eller
hæmme RNA-transkriptionen ved at regulere
RNA-polymerasens aktivitet.
Hvilken type teknik bruges til at bestemme mængden af protein i en prøve under
proteinoprensning?
Spektrometri
Hvilken DNA-teknik anvender enzymatisk ampliĮkation til at generere flere kopier af en
specifik DNA-sekvens og bruges ofte til at identificere og kvantificere gener eller patogener
i en prøve?
PCR (Polymerase Chain Reaction)
Hvor nedbrydes dysfunktionelle molekyler/organeller?
i lysosomer
Hvilket af de tre cytoskeletter er ikke karakteriseret ved dynamisk ustabilitet?
Intermediære filamenter
En drabsproces fører til, at antallet af en given mikroorganisme falder fra 10 000 000 til 10
000 på 1,5 time. Hvad er den decimale reduktionstid
30 min
Hvilket af de følgende kemiske antimikrobielle midler ødelægger alle mikroorganismer,
herunder endosporer?
Steriliseringsmiddel
Proteolytiske enzymer kan lave forskellige specificiteter (substratpræferancer), som kan
bestemme ved at udregne?
Kcat/KM
En unkompetitiv hæmmer har følgende egenskab
den binder kun til enzymet når det har bundet
substrat
Na+/K+ ATPasen skaber
en kemisk gradient, der gør at kalium gerne vil
’løbe’ ud af cellen
Hvis man i en nervecelle hæmmer den ligand-aktiverede Na+ kanal (’ligand-gated’) med
Tetrodotoxin fra en pufferfish, hvad sker der så med de spændingsafhængige Na+ kanaler (’voltage-gated’)?
de vil ikke kunne åbne, da membrane
potentialet er uændret
Monomeriske G-proteiner er anderledes end de trimeriske G-protein, fordi
de bruger ’hjælpe-proteiner’ til omdannelsen
af GTP til GDP og vice versa
Den sekundærer messenger Ca2+, spiller en vigtig rolle for signallering ved at
binde til forskelling Ca2+ -bindende proteiner 1
og derved direkte eller indirekte aktivering af
f.eks kinaser og Ca2+ ATPaser
