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Biomol > Control de expresión génica > Flashcards

Control de expresión génica Flashcards

1
Q

¿Qué es la regulación génica?

A

Es la forma como una célula controla qué genes se expresan

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Q

Tipo de controles (6)

A

Control transcripcional
Control en el procesamiento del RNA
Control del transporte y localización del RNA
Control postraduccional
Control de la degradación del RNAm
Control en la actividad proteica

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Q

Tipos de control a nivel transcripcional

A

Regulación en cis
Regulación en trans
Regulación epigenética

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4
Q

Tipo de regulación donde hay una secuencia contigua a un gen que tiene un efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen

A

Regulación en cis

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Q

Son reguladores en cis

A

Potenciadores y silenciadores

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6
Q

Tipo de regulación donde la mayoría de secuencias reguladoras no pueden, por sí solas, modificar la velocidad de transcripción, por lo que necesitan de proteínas reguladoras

A

Regulación en trans

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7
Q

Son regulaciones en trans

A

Factores de transcripción
Activadores
Represores
Empaquetamiento

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8
Q

Estructuras que pueden tener los factores de transcripción (4)

A

Motivo hélice-giro-hélice
Motivo dedos de Zn
Motivo zipper de leucina
Hélice-asa-Hélice

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9
Q

Cadena de proteínas que pueden mandar la información del activador a los factores de transcripción

A

Mediadores

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10
Q

Son proteínas que actúan directamente con los factores de transcripción y pueden regular la actividad de la RNA pol II

A

Activadores

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11
Q

¿En qué ayudan los activadores?

A

Desarrollo
Diferenciación
Respuesta de las células a las hormonas y los factores de crecimiento

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12
Q

Son proteínas que se unen a secuencias específicas dentro del DNA para inhibir la transcripción

A

Represores

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13
Q

¿A qué se unen los represores?

A

A los silenciadores

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14
Q

¿A qué se unen los activadores?

A

A los potenciadores

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15
Q

Proteínas que pueden inhibir la unión de otros factores de transcripción al DNA

A

Represores

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16
Q

¿Cómo controlan la expresión de los genes eucariotas los activadores y represores?

A

Interactuando con los factores de transcripción generales y otros componentes de la maquinaria transcripcional
Induciendo cambios en la estructura de la cromatina

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17
Q

¿Qué afecta el enrollamiento del DNA en el nucleosoma?

A

La capacidad de los factores de transcripción para unirse al DNA
La capacidad de la RNA polimerasa para transcribir

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18
Q

¿En qué consiste el empaquetamiento?

A

En regiones de la cromatina poco o muy condensadas

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19
Q

Regiones de la cromatina relativamente dispersas poco condensadas que ocupan la mayor parte del núcleo

A

Eucromatina

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20
Q

¿De qué tiene niveles altos la eucromatina?

A

De acetilación

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21
Q

Es la cromatina que activa transcripcional

A

Eucromatina

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22
Q

Regiones de la cromatina densamente empaquetadas que están inactivas (no se expresan)

A

Heterocromatina

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23
Q

¿Donde es abundante la heterocromatina?

A

En telómeros y centrómeros

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24
Q

¿De qué tiene niveles altos la heterocromatina?

A

De metilación

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25
Q

Son parte del cromosoma que no tiene genes

A

Telómeros y centrómero

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26
Q

Tipos de heterocromatina

A

Facultativa
Constitutiva

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27
Q

Tipo de heterocromatina que se expresa durante el desarrollo y / o diferenciación y posteriormente se silencian

A

Facultativa

28
Q

Tipo de heterocromatina que siempre permanece condensada y se encuentra silenciada

A

Constitutiva

29
Q

¿Dónde se encuentra la heterocromatina constitutiva?

A

En telómeros y centrómeros

30
Q

Son procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulación y expresión de los genes y que son heredables de unos organismos a otros

A

Epigenética

31
Q

Mecanismos de regulación epigenética más comunes en humanos

A

Metilación de DNA
Modificación de histonas (fosforilación, metilación y acetilación)

32
Q

Cambios en la expresión del DNA sin que se modifique la secuencia genética

A

Mecanismos epigenéticos

33
Q

¿En qué consiste la metilación de DNA?

A

En la adición de grupos metilo al carbono 5 de la citosina (5mC)

34
Q

¿Qué citocinas se metilan?

A

Siempre citocinas que van después de una guanina

35
Q

¿Qué porcentaje del DNA es 5mC?

A

1%

36
Q

¿Qué causa la metilación?

A

Un cambio conformacional en la doble cadena de DNA y variación espacial y temporal en la cromatina

37
Q

Entre más metilación

A

Menos expresión génica

38
Q

¿Qué hacen las metiltransferasas?

A

Reconocen la pareja GC metilada y pone las metilaciones en la hebra hija

39
Q

Dominios de las histonas (2)

A
  • Unirse a otras histonas y unirse al DNA
  • Aminoterminal que se encuentra fuera del DNA y sufre modificaciones
40
Q

Formas de modificar las histonas (3)

A

Acetilación
Metilación
Fosforilación

41
Q

¿Qué hacen la acetilación y fosforilación de histonas?

A

Añaden cargas negativas a las histonas

42
Q

¿Qué promueve la adición de cargas negativas a las histonas?

A

La transcripción del gen

43
Q

Son las que acetilan las histonas, añadiendo cargas negativas y promoviendo la transcripción

A

Acetiltransferasas

44
Q

HAT

A

Acetiltransferasas

45
Q

Son las que quitan la acetilación a las histonas, incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción

A

Deacetilasas de histonas

46
Q

HDAC

A

Deacetilasas de histonas

47
Q

¿Cuántas clases de HDAC hay?

A

4

48
Q

Clase I de HDAC

A

Represión de la transcripción, regulación epigenética y regulación del ciclo celular

49
Q

HDAC de la clase 1

A

HDAC 1
HDAC 2
HDAC 3
HDAC 8

50
Q

Clase II de HDAC

A

Regulan el tráfico de proteínas, adhesión y movilidad celular

51
Q

HDAC de clase II

A

HDAC II A 4, 5, 7 y 9

HDAC II B 6 y 10

52
Q

Clase III de HDAC

A

Formación de memoria, represión de la transcripción y regulación epigenética

53
Q

HDAC en clase III

A

Sirtuinas

54
Q

Expresión aberrante de HDAC 1

A

Cáncer de próstata, colon y mama

55
Q

Expresión aberrante de HDAC 2

A

Carcinoma gástrico y cáncer de cuello uterino.

56
Q

Expresión aberrante de HDAC 8

A

Neuroblastoma y glioma

57
Q

Inhibidores de HDAC

A

Vorinostat
Romidepsin
Belinostat
Panobinstat

58
Q

Son las que fosforilan las histonas, agregando cargas negativas y favoreciendo la transcripción

A

Cinasas

59
Q

Son las que quitan los grupos fosfato de las histonas, incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción

A

Fosfatasas

60
Q

¿La metilación de histonas qué carga aumenta?

A

Depende de qué aminoácido se metile

61
Q

Metiltransferasas de lisina

A

Metilan la lisina
Puede activar o reprimir la transcripción de un gen

62
Q

Metiltransferasas de arginina

A

Metilan arginina

Activan la transcripción

63
Q

Son las que quitan los metilos

A

Demetilasas de histonas

64
Q

Cómo se clasifica la regulación de la expresión génica a nivel transcripcional ?

A

regulación en cis: secuencias de nucleótidos (potenciadores y silenciadores)
regulación en trans: proteínas que leen el DNA (TF)

65
Q

Cómo puede la metilación del DNA regular la expresión de genes?

A

Solo se metilan las citocinas que van después de una guanina
La metilación causa un cambio conformacional –> menos expresión

66
Q

Dónde se modifican las histonas?

A

en el amino terminal

67
Q

Qué tipo de modificaciones pueden sufrir las histonas

A

acetilación de lisina (carga -)
fosforilación de serina, treonina o tirosina (carga -)
metilación de lisina (depende)
metilación de arginina (activación transcripcional)

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