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Biomol > Control de expresión génica > Flashcards

Control de expresión génica Flashcards

1
Q

¿Qué es la regulación génica?

A

Es la forma como una célula controla qué genes se expresan

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Q

Tipo de controles (6)

A

Control transcripcional
Control en el procesamiento del RNA
Control del transporte y localización del RNA
Control postraduccional
Control de la degradación del RNAm
Control en la actividad proteica

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Q

Tipos de control a nivel transcripcional

A

Regulación en cis
Regulación en trans
Regulación epigenética

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Q

Tipo de regulación donde hay una secuencia contigua a un gen que tiene un efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen

A

Regulación en cis

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Q

Son reguladores en cis

A

Potenciadores y silenciadores

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6
Q

Tipo de regulación donde la mayoría de secuencias reguladoras no pueden, por sí solas, modificar la velocidad de transcripción, por lo que necesitan de proteínas reguladoras

A

Regulación en trans

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7
Q

Son regulaciones en trans

A

Factores de transcripción
Activadores
Represores
Empaquetamiento

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8
Q

Estructuras que pueden tener los factores de transcripción (4)

A

Motivo hélice-giro-hélice
Motivo dedos de Zn
Motivo zipper de leucina
Hélice-asa-Hélice

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9
Q

Cadena de proteínas que pueden mandar la información del activador a los factores de transcripción

A

Mediadores

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10
Q

Son proteínas que actúan directamente con los factores de transcripción y pueden regular la actividad de la RNA pol II

A

Activadores

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11
Q

¿En qué ayudan los activadores?

A

Desarrollo
Diferenciación
Respuesta de las células a las hormonas y los factores de crecimiento

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12
Q

Son proteínas que se unen a secuencias específicas dentro del DNA para inhibir la transcripción

A

Represores

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13
Q

¿A qué se unen los represores?

A

A los silenciadores

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14
Q

¿A qué se unen los activadores?

A

A los potenciadores

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15
Q

Proteínas que pueden inhibir la unión de otros factores de transcripción al DNA

A

Represores

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16
Q

¿Cómo controlan la expresión de los genes eucariotas los activadores y represores?

A

Interactuando con los factores de transcripción generales y otros componentes de la maquinaria transcripcional
Induciendo cambios en la estructura de la cromatina

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17
Q

¿Qué afecta el enrollamiento del DNA en el nucleosoma?

A

La capacidad de los factores de transcripción para unirse al DNA
La capacidad de la RNA polimerasa para transcribir

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18
Q

¿En qué consiste el empaquetamiento?

A

En regiones de la cromatina poco o muy condensadas

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19
Q

Regiones de la cromatina relativamente dispersas poco condensadas que ocupan la mayor parte del núcleo

A

Eucromatina

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20
Q

¿De qué tiene niveles altos la eucromatina?

A

De acetilación

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21
Q

Es la cromatina que activa transcripcional

A

Eucromatina

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22
Q

Regiones de la cromatina densamente empaquetadas que están inactivas (no se expresan)

A

Heterocromatina

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23
Q

¿Donde es abundante la heterocromatina?

A

En telómeros y centrómeros

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24
Q

¿De qué tiene niveles altos la heterocromatina?

A

De metilación

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25
Son parte del cromosoma que no tiene genes
Telómeros y centrómero
26
Tipos de heterocromatina
Facultativa Constitutiva
27
Tipo de heterocromatina que se expresa durante el desarrollo y / o diferenciación y posteriormente se silencian
Facultativa
28
Tipo de heterocromatina que siempre permanece condensada y se encuentra silenciada
Constitutiva
29
¿Dónde se encuentra la heterocromatina constitutiva?
En telómeros y centrómeros
30
Son procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulación y expresión de los genes y que son heredables de unos organismos a otros
Epigenética
31
Mecanismos de regulación epigenética más comunes en humanos
Metilación de DNA Modificación de histonas (fosforilación, metilación y acetilación)
32
Cambios en la expresión del DNA sin que se modifique la secuencia genética
Mecanismos epigenéticos
33
¿En qué consiste la metilación de DNA?
En la adición de grupos metilo al carbono 5 de la citosina (5mC)
34
¿Qué citocinas se metilan?
Siempre citocinas que van después de una guanina
35
¿Qué porcentaje del DNA es 5mC?
1%
36
¿Qué causa la metilación?
Un cambio conformacional en la doble cadena de DNA y variación espacial y temporal en la cromatina
37
Entre más metilación
Menos expresión génica
38
¿Qué hacen las metiltransferasas?
Reconocen la pareja GC metilada y pone las metilaciones en la hebra hija
39
Dominios de las histonas (2)
- Unirse a otras histonas y unirse al DNA - Aminoterminal que se encuentra fuera del DNA y sufre modificaciones
40
Formas de modificar las histonas (3)
Acetilación Metilación Fosforilación
41
¿Qué hacen la acetilación y fosforilación de histonas?
Añaden cargas negativas a las histonas
42
¿Qué promueve la adición de cargas negativas a las histonas?
La transcripción del gen
43
Son las que acetilan las histonas, añadiendo cargas negativas y promoviendo la transcripción
Acetiltransferasas
44
HAT
Acetiltransferasas
45
Son las que quitan la acetilación a las histonas, incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción
Deacetilasas de histonas
46
HDAC
Deacetilasas de histonas
47
¿Cuántas clases de HDAC hay?
4
48
Clase I de HDAC
Represión de la transcripción, regulación epigenética y regulación del ciclo celular
49
HDAC de la clase 1
HDAC 1 HDAC 2 HDAC 3 HDAC 8
50
Clase II de HDAC
Regulan el tráfico de proteínas, adhesión y movilidad celular
51
HDAC de clase II
HDAC II A 4, 5, 7 y 9 HDAC II B 6 y 10
52
Clase III de HDAC
Formación de memoria, represión de la transcripción y regulación epigenética
53
HDAC en clase III
Sirtuinas
54
Expresión aberrante de HDAC 1
Cáncer de próstata, colon y mama
55
Expresión aberrante de HDAC 2
Carcinoma gástrico y cáncer de cuello uterino.
56
Expresión aberrante de HDAC 8
Neuroblastoma y glioma
57
Inhibidores de HDAC
Vorinostat Romidepsin Belinostat Panobinstat
58
Son las que fosforilan las histonas, agregando cargas negativas y favoreciendo la transcripción
Cinasas
59
Son las que quitan los grupos fosfato de las histonas, incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción
Fosfatasas
60
¿La metilación de histonas qué carga aumenta?
Depende de qué aminoácido se metile
61
Metiltransferasas de lisina
Metilan la lisina Puede activar o reprimir la transcripción de un gen
62
Metiltransferasas de arginina
Metilan arginina Activan la transcripción
63
Son las que quitan los metilos
Demetilasas de histonas
64
Cómo se clasifica la regulación de la expresión génica a nivel transcripcional ?
regulación en cis: secuencias de nucleótidos (potenciadores y silenciadores) regulación en trans: proteínas que leen el DNA (TF)
65
Cómo puede la metilación del DNA regular la expresión de genes?
Solo se metilan las citocinas que van después de una guanina La metilación causa un cambio conformacional –> menos expresión
66
Dónde se modifican las histonas?
en el amino terminal
67
Qué tipo de modificaciones pueden sufrir las histonas
acetilación de lisina (carga -) fosforilación de serina, treonina o tirosina (carga -) metilación de lisina (depende) metilación de arginina (activación transcripcional)

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