Chapitre 12: virus responsables d'infections respiratoires Flashcards
Influenza
De quelle famille vient le virus?
Orthomyxovirus
Influenza
Que retrouve-t-on comme virus?
- influenza A: hommes, oiseaux, porcs..
- influenza B: hommes, phoques
Influenza
Quelles sont leurs caractéristiques?
- virus enveloppé ARN monocaténaire
- polarité négative
- symétrie hélicoïdale
- 8 segments pour A et B
- réplication dans le noyau avec un haut taux de mutation
Que retrouve-t-on comme virus dans ce chapitre?
- influenza
- paramyxovirus
- rhinovirus
- coronavirus
Influenza A
Sur quoi sont basés les sous-types?
-différences antigéniques au niveau hémagglutinine et neuraminidase
=> 16 sous-types d’hémagglutinine (H1-H16)
=> 9 sous-types de neuraminidase (N1-N9)
Influenza A
Quel est le réservoir?
- canard sauvage et d’autres types d’oiseaux
- porc
Influenza B
Quelles sont ses caractéristiques?
- pas de sous-type d’hemagglutinine et neuraminidase
- épidémies loco-régionales
Influenza
Quelle est la structure de l’enveloppe virale?
2 glycoprotéines
=> HA: rôle dans liaison avec récepteur et fusion
Ag dans lequel les Ac sont produits
Changements de sa structure antigénique qui permet épidémie
Saison hivernale avec prédiction des souches pour le vaccin qui se fait dans l’hémisphère sud
=> N: participe à attachement et évite agrégation de particules virales sur la surface cellulaire à la sortie du virus
Permet au virus de passer à travers des sécrétions muqueuses
Influenza
Quelle est la structure au niveau de la matrice?
- M1 joue un rôle dans l’assemblage viral et le “budding”
- M2: fonction de canal ionique qui joue un rôle dans l’uncoating du génome dans la cellule
Influenza
Comment se transmet le virus?
- par gouttelettes
- contacts rapprochés
- autement infectieux
- individus contagieux à partir de quelques jours avant et pendant 4/5 jours après symptômes
Influenza
Quelles sont les manifestations cliniques?
-incubation de 3/4 jours
-sensation de malaise
-prostration
-forte fièvre
-douleurs musculaires et articulaires
-augmentation GB, enzymes cellulaire et diminution saturation en O2
=> dure 5/7 jours
Influenza
Quelles sont les complications possibles?
- on a toujours une pneumonie associée +/- sévère (peut entraîner DC)
- pneumonie bactérienne à streptococcus pneumoniae
- haemophilus influenze
- straphylococcus aureus
Influenza
Sur quoi se base le diagnostic?
-recherche Ag
-culture cellulaire
-sérologie
=> dans laboratoires de référence pour établir données épidémiologiques
Influenza
Quelle épidémiologie?
- responsable de maladie dans 10% population dans hémisphère nord
- influenza B responsable d’épidémies chaque hiver
Influenza
Qu’est-ce l’antigenic shift?
- remplacement abrupt et majeur d’hemagglutinine
- influenza A
- la plupart des gens ne sont plus immunisés
Influenza
Qu’est-ce que l’antigelif drift?
- petits changements continus dans le temps
- production de nouvelles souches virales
- influenza A et B
- vaccins actualisés chaque année
Quelle sont les 3 causes nécessaires pour qu’un virus crée une pandémie?
- capacité à infecter les humains
- population vulnérable sans immunité
- propagation rapide, efficace, d’individu à individu
Quelles sont les craintes pour de nouvelles pandémies?
- H5N1 devient génétiquement un virus à tropisme humain
- fusion avec un virus pour produire une souche pandémique
Influenza
Quelles mesure en terme de surveillance en période inter-pandémique?
-phase 0.0a:
=>pas de nouveaux sous-types influenza
=> pas d’indication d’activité hautement pathogène aviaires dans espèces prédisposées
-phase 0.0b:
=> pas de nouveaux sous-types d’influenza
=> preuves d’activité hautement pathogènes aviaires dans les espèces prédisposées
Influenza
Quelles sont les phases en période pré-pandémique?
-phase 0.1:
=> nouvelle souche isolée dans un seul cas humain
=> pas de preuve de propagation ou éruption
-phase 0.2:
=> 2 ou plusieurs cas de la nouvelle souche déclarés
=> pas de preuve d’homme à homme
-phase 0.3
=> transmission d’homme à homme confirmée
=> alerte pandémique lancée
Influenza
Quel est le type de vaccin?
- vaccin vivant atténué
- formé de 3 types de virus sélectionnés par OMS
- vaccin recombinant H5N1 en option
Influenza
Quels sont les traitements antiviraux ?
-amantadine
-rimantadine
-inhibiteurs de la neuraminidase: zanamivir et oseltamivir (tamiflu)
=> chimioprophylaxie et prophylaxie post-expoisiont + traitement patients malades
Paramyxovirus
Quelles différences avec les orthomyxovirus?
- ARN non segmenté (moins sujet aux recombinaisons et mutations)
- réplication dans cytoplasme
- protéine de fusion indépendant pH (fusion mb plasmique et endosmose)
Paramyxovirus
Quelle est leur structure?
- virus enveloppés
- bicouche lipidique dérivée de l’hôte
- 2 glycoprotéines spécifiques
- ARN non segmenté
- sens négatif
- simple brin
- noyau nucléocapside contient activité ARN transcriptase
Paramyxovirus
Quelles protéines de structures retrouve-t-on au niveau de l’enveloppe?
- hemagglutinine-neuraminidase (attachement récepteurs)
- hémagglutinine
- protéine G
- protéine de fusion
Paramyxovirus
Quelle protéine de structure retrouve-t-on au niveau de l’enveloppe interne?
-protéine de la matrice (pour assemblage)
Paramyxovirus
Quelles protéines retrouve-t-on au niveau de la nucléocapside?
- nucléoprotéine (complexation avec génome ARN)
- phosphoprotéine (partie complexe ARN polymérase)
- protéine large (partie complexe ARN pol)
Paramyxovirus
Que trouve-t-on comme sous famille?
- paramyxovirus (avec parainfluenza)
- pneumovirus (avec pneumovirus et metapneumovirus)
Parainfluenza
Quelles sont ses caractéristiques?
- sous-types 1 2 ou 3
- surtout enfant 3/5 ans
- infection primaire confère bonne protection contre réinfection voies aériennes supérieures
- diagnostic d’après échantillons sécrétions nasales ou respiratoires soumis à culture cellulaire, recherche AG ou PCR
- traitement symptomatique
Pneumovirus: respiratoire syncitial RSV
Quelles sont ses caractéristiques?
- très contagieux
- homme = unique réservoir
- contamination par grosses gouttes ou objets contaminés
Pneumovirus: RSV
Quelles sont les caractéristiques cliniques?
- durée d’incubation de 4 à 5 jours
- guérison après 10 jours (mais excrétion possible virus pendant plusieurs semaines)
- bronchiolite (et pneumonies interstitielles chez ID)
- récupération clinique = arrêt réplication virale
Pneumovirus: RSV
Quelle épidémiologie?
- saisonnières
- fin de l’automne jusqu’au début printemps
- adultes peuvent être réinfectés dans unité pédiatrique (nosocomiale)
Pneumovirus: RSV
Sur quoi se base le diagnostic?
- comme parainfluenza
- virus pousse mal en culture cellulaire
Pneumovirus: RSV
Sur quoi repose le traitement?
- AB si surinfection bactérienne, anti-inflammatoires et bronchodilatateurs
- ribavirin aux ID formes sévères (très cher)
Métapneumonies
Quelles sont les caractéristiques?
- humain = seul réservoir
- à l’âge de 5 ans, majorité enfant séro+
- similaire à RSV
Rhinovirus
Quelles sont leurs caractéristiques?
- symptômes rhume
- virus stables sans mutation
- picronavirus
- forte incidence pendant l’hiver
Rhinovirus
Quelle est sa structure?
- virus à ARN monocaténaire à polarité positive
- +100 sérotypes capables d’infecter l’homme
- sensible à l’acide et se multiplie à 33°
- se sert récepteur à ICAM-1
- pas de co-récepteur
- transcription dans cytoplasme
Rhinovirus
Comment se transmet le virus?
- via sécrétions nasales
- on le retrouve sur les mains mais transmission par objet peu probable
- régions tempérées dans les mois les plus froids
Rhinovirus
Quels sont les signes cliniques?
- incubation de 1/4 jours
- obstruction ou écoulement nasal
- gorge sensible
- symptômes généraux spécifiques
- fièvre rare
Rhinovirus
Quelles sont les complications possibles et éventuels traitement?
- surinfection bactérienne
- traitement symptomatique
- pas d’antiviraux
- pas de vaccin
Coronavirus
Quelles sont ses caractéristiques?
- grands virus enveloppés à ARN monocaténaire
- polarité positive
- font partis des nidovirus
Coronavirus
Quels sont les 2 types de nidovirus? Sérotypes?
- torovirus
- coronavirus => pathologie humaine
-3 sérotypes I, II, III
Coronavirus
Quel est le cycle de réplication?
- glycoprotéine via une protéine d’enveloppe
- fusion pour libérer matériel génétique dans cytoplasme
- assemblages protéines virales au niveau du RE puis Golgi
- virus relargué par exocytose
- réplication dans voies respiratoires ou tractus digestif
Coronavirus
Comment se présente cliniquement l’infection?
-lésions pulmonaires graves (atteintes alvéoles)
-4/6 jours d’incubation
-malaise
-fièvre
-myalgies
-mais pas signe d’affection des voies respiratoires supérieures
=> récupération totale pour survivants (parfois altération)
=> peut être mortel
Coronavirus
Quel est le diagnostic?
- clinique
- PCR
Coronavirus
Quel est le traitement?
- pas de vaccin
- pas d’antiviraux
- épidémie SARS: isolation parfaite patient et hygiène stricte contiennent virus
