Chapitre 1: introduction Flashcards
Qu’est-ce qu’un virus?
- entité nucléoprotéique possédant un type d’acide nucléique
- se reproduisent par la cellule hôte à partir de leur propre matériel génétique
- incapable de division sans infecter cellule hôte
Vrai/Faux
Certains virus à ARN semble accidentellement contenir des ribosomes qui ne jouent aucun rôle dans la synthèse de protéines virales.
Vrai
Quelle est la taille d’un virus?
0.02 à 0.3 um
visible en ME
De quoi est composé le virus?
- acide nucléique (ADN ou ARN)
- capside formant le manteau de protéine protectrice
Qu’est-ce que la nucléocapside?
- ensemble acide nucléique et capside
- peut être hélicoïdale, icosaédrique ou complexe
Qu’est-ce que l’ARN monocaténaire?
Majorité des virus à ARN
-polarité + ou -, taille de 2/30 kb
Quels sont les autres types d’ARN?
- bicaténaire (cas exceptionnel) => rétrovirus, rotavirus
- segmenté (virus de la grippe)
Quels sont les types d’ADN?
- bicanténaire (majorité ADN, 6/250 kb)
- monocaténaire (cas exceptionnel) => parvovirus
Quel est le rôle de la capside?
- renferme et protège l’acide nucléique
- permet l’attachement du virus de la cellule hôte
Quelles sont les 3 catégories de capsides?
- tubulaire à symétrie hélicoïdale
- capside isoédrique à symétrie brique
- capside à symétrie complexe
Comment se constitue l’enveloppe virale?
-dérive par bourgeonnement
=> soit à partir membrane cytoplasmique (VIH, virus de la grippe)
=> soit à partir de la membrane nucléaire (herpès)
=> également à partir des membranes intra cytoplasmique (RE, golgi, vacuoles) : rubéole
Quelle est la caractéristique principale de l’enveloppe virale?
-détermine pathogénicité virus
-rend virus plus sensible
-enveloppe composé de lipides et protéines
=> bicouche avec glycoprotéine virales (spicules)
Comment sont classés virus?
- type d’acide nucléique
- symétrie capside
- présence ou absence enveloppe
- nombre de capsomères
Quels sont les virus à ARN monocaténaire avec capside icosaédrique à symétrie cubique nus ?
-picornaviridae
=> entérovirus
=> rhinovirus
=> hépatovirus (HPA)
-astrovirus
-calciviridae
=> norovirus
-hépatite E
Quels sont les virus à ARN monocaténaire avec capside icosaédrique à symétrie cubique enveloppés?
-togoviridae
=>alphavirus (Chikungunya)
=> rubivirus (rubéole)
-falviviridae
=> flavivirus (dengue, fièvre jaune)
=>hepacivirus (HPC)
Quels sont les virus à ARN monocaténaire avec capside tubulaire à symétrie hélicoïdale nus ?
-coronavirus
-filoviridae (ebolavirus)
-rhabdoviridae (lyssavirus)
-paramyxoviridae
=> respirovirus (parainfluenza)
=> rubulavirus (oreillon/parainfluenza)
=> morbillivirus (rougeole)
Quels sont les virus à ARN monocaténaire segmenté avec capside tubulaire, à symétrie hélicoïdale enveloppés?
-orthomyxoviridae
=> Influenza A,B, C
Quels point importants pour l’interaction cellule/virus?
- conditions préalables à toutes infections
- virus et cellule joue un rôle essentiel dans la détermination du résultat de l’interaction
Qu’est-ce qu’une cellule sensible?
- a un récepteur fonctionnel
- capable ou non de supporter la réplication virale
Qu’est-ce qu’une cellule résistante?
- pas de récepteur
- compétant ou non pour soutenir la réplication virale
Qu’est-ce qu’une cellule perméable?
- capacité de répliquer le virus
- peut être ou ne pas être sensible
Vrai/Faux
Une cellule sensible et permissive est la seule cellule qui peut prendre jusqu’à une particule de virus et de le reproduire.
Vrai
Quels sont les types de cellules sensibles?
-productive avec production de descendance infectieuse (cellules perméantes)
-abortive sans production de virus infectieux
=> infections cellules sensibles qui ne sont pas permissive
=> infection de cellules avec des virus défectueux (absence de génome complet)
Quelles sont les différents types d’infections virales?
- productive
- abortive
- latente ou persistante
Qu’est-ce qu’une infection productive?
- expression de tous les gènes viraux
- lyse
- production de virions
Qu’est-ce qu’une infection abortive?
-expression interrompue
(virus défectueux ou cellule non permissive)
-retour à la normal
-absence de production de virion
Qu’est-ce qu’une infection latente ou persistante?
- persistance du génome dans la cellule avec expression de quelques gènes viraux
- survie avec modification
- absence de production de virions
Quelles sont les étapes du cycle viral?
- précoces: attachement, pénétration et décapsidation
- synthèse de macromolécules: fabrication des ARNm, synthèse de protéines et réplication de génomes
- tardives: assemblage et relargage (construction nucléocapside et libération virions infectieux)
Comment se fait l’attachement?
-interaction vrius/cellule hôte
-permet fixation virus
=> à la surface virus : protéines capsides ou glycoprotéines
=> à la surface de la cellule cible: récepteurs cellulaires
Comment pénètre le virus?
- nécessite l’énergie
- dépend de la température et du pH
Comment se passe la décapsidation?
-aboutit destruction capside pour libération matériel génétique virus
=> immédiatement après attachement (picornavirus)
=> endosmose (influenza)
=> cytoplasme (rétrovirus)
Vrai/faux
La décapitation se fait avant l’entrée dans le cytoplasme.
Faux, dans le cytoplasme
Qu’est-ce que la classification de Baltimore?
- guide sur mécanismes de réplication des génomes viraux
- basée sur principe que tous les virus doivent générer des ARNm à partir de leur génome pour synthétiser des protéines et se répliquer
Quelles sont les conventions de la classification de Baltimore?
- ARNm de polarité +
- ADN écrit dans 5’-3’ aussi de polarité +
Comment se réplique le génome viral?
- mécanisme par lequel le virus exprime son ARNm
- certains doivent aller dans le noyau
- ARNm viraux coiffés et polyadénylés
- expression protéines virale utilise machinerie cellulaire
Comment se fait l’assemblage et le relargage?
- manière aléatoire
- assembler molécule génome viral avec sous-unités protéiques de la capside => nucléocapside
Quelle est la particularité dans l’assemblage des virus nus?
- procapside => maturation
- molécule génome viral empaquetée
- plusieurs clivages => nucléocapside définitive
- virions dans cytoplasme ou noyau
- lyse cellulaire pour libération
Vrai/faux
Le virion n’est pas infectieux tant qu’il n’est pas entouré d’une enveloppe.
Vrai
Comment se fait la transmission d’un virus?
-contact direct
-intermédiaire milieu extérieur
=> virus fragiles, contact étroits
=> virus résistant, transmission par contact étroit ou à distance
Quelles sont les voies d’infection possible?
- sécrétion biologique (respiratoire, intestinal, peau, urogénital, salive)
- transmission mère/enfant
- transmission iatrogène
- comportement sociaux
Notion de tropisme
=> neurotropes, mucotropes, entérotrope, adénotropes, récepteurs cellulaires..
Quelles sont les 3 phases de progression de l’infection virale?
- période de latence (acide nucléique viral incorporé dans cellule sans lésions morphologique visible)
- période de stimulation : augmentation métabolisme, propagation..
- effet cytopathogène (lésions)
Qu’est-ce que la pathogénèse virale?
Processus par lequel un virus cause la maladie
Qu’est-ce que la virulence?
Capacité d’un virus à causer une maladie
Qu’est-ce que la maladie virale?
Sommet des effets
=> réplication virale et dommages directs au cellules (cytopathogénèse)
=> réponse immunitaire de l’hôte (immunopathogénèse)
Que comprend la pathogénèse?
- mécanisme de transmission
- entrée virale
- propagation virale
- déterminants de l’invasion tissulaire
- virulence
- blessures causées par des infections virales
Comment se fait la transmission virale?
-hôte sensible à un autre selon 2 modèles
=> virus maintenus à une seule espèce
=> virus infectent alternativement des insectes et des hôtes vertébrés
Qu’est-ce qu’un vecteur?
- insecte ou petit animal
- transport et sert le processus de transmission de la maladie
Qu’est-ce qu’une zoonose?
Maladie virale partagée par les humains et les animaux ou les insectes
Qu’est-ce qu’un porteur?
-contient
-propage
-porte
un agent infectieux
Comment se transmettent en générale les virus à enveloppe?
- fragiles
- sensibles au pH faible
- souvent transmis par aérosols ou sécrétions, injections voir transplantation d’organes
Comment se transmettent les virus non enveloppé?
- survivent dans endroits secs
- moins sensibles aux détergents, à pH faibles ou t plus élevée
- plus souvent transmis par voies respiratoires
- voies oraux-fécales
- vecteurs passifs (objets contaminés)
Quelles voies de transmission pour les virus causant des infections aigues ou de courte durée?
- efficacement transmis à de nouveaux hôtes
- généralement transmis par voie orale ou oral-fécal
- excrétion de grands nombres de particules virales
Quels sont les virus causant des infections “persistante”?
- n’ont pas besoin d’être efficacement transmise
- virions excrétés pour quelques années
Quels sont les facteurs qui promeuvent la transmission virale?
- stabilité virale
- présence virus dans les aérosols et dans les sécrétions
- division asymptomatique
- inefficacité réponse immune
Qu’est-ce que la transmission horizontale?
- transmission d’hôtes à hôtes
- haut taux d’infection pour maintenir la population de virus
Qu’est-ce que la transmission verticale?
Génération d’hôte à la suivant
Vrai/faux
Dans le cas des infections pathogènes, le site d’entrée peut influencer les symptômes que la maladie produit.
Vrai
Quelles sont les particularités du la barrière cutanée?
- très efficace contre les virus
- couche externe constitué de cellules mortes (ne peut supporter la réplication virale)
- requière brèche pour entrée virus dans l’organisme
Quelles sont les particularités du tractus respiratoire?
- entrée virale la plus commune
- mécanismes sophistiqués de défense immunitaire (mécanisme d’inhibition non spécifique)
Quelles sont les particularités du tractus gastro-intestinal?
- environnement hostile
- détruit la plupart des virus enveloppés
- virus adaptés avec stratégies de résistances (protéases)
- entre par transcytose et déposé au niveau membranes basales sous-jacentes
Comment se fait la propagation virale?
- reste localisé où le virus se propage à l’intérieur de l’épithélium (infection localisée)
- propagation au-délà du site primaire : infection disséminée, nécessite de léser barrières physiques
Comment se fait la propagation aux cellules adjacentes ?
- EC ave distribution virus dans liquide EC
- IC par fusion cellules infectées avec cellules adjacentes via berges cytoplasmiques entre cellules
Vrai/Faux
La plupart des virus se propagent par voie extracellulaire.
Vrai, certains se propagent par IC et EC (herpès et paramyxovirus)
Qu’est-ce que la réplication primaire?
- où le virus se réplique après avoir gagné l’entrée initial de l’hôte
- détermine si le virus va être localisée au site d’entrée ou va se propager
- secondaire: prend place aux organes/tissus susceptibles de suivre la propagation généralisée
Qu’est-ce que la dissémination ?
- lorsque l’infection se propage au-délà du site primaire
- libéré à la surface apicale ou surfaces baso-latéral
Comment dissémine le virus?
- torrent circulatoire
- système nerveux
Qu’est-ce que la propagation hématogène?
- présence du virus infectieux dans le sang
- virions peuvent être libres dans le sang ou contenu dans cellules infectées
- mesure de la virémie
Qu’est-ce que la virémie primaire?
- réplication au site d’entrée
- virions libérés dans sang
- faible concentration
Qu’est-ce que la virémie secondaire?
- apparence retardée de haute concentration de virus
- infecte sang
- apparaissent comme extension virale par réplication pendant dissémination infection
Comment est produite la virémie active?
Par réplication virale
Comment est produite la virémie passive?
Particules virales introduites dans le sang sans réplication virale au niveau site d’entrée
Quels sont les virus neural?
- vius poliomyélite
- fièvre jaune
- encéphalite vénézuélienne
- réovirus
- herpes simplex 1 et 2
Quels sont les virus olfactifs?
- poliomyélite
- herpes simplex
- coronavirus
Quels sont les virus hématogène?
- poliomyélite
- coxsackies
- oreillons
- rougeole
- herpes simplex
- CMV
Qu’est-ce que les virus neurotropes?
- peuvent infecter cellules neurales
- peut arriver par propagation neurale ou hématogène
Que sont les virus neuro-invasifs?
- entrer dans le CNS
- après infection d’un site périphérique
Que sont les virus neuro-viralents?
- peuvent causer des maladies du tissu nerveux
- HSV: faiblement neuro-invasif mais très neuro-virulent
- oreillons: très neuro-invasif mais faible neuro-virulence
- rage: très neuro-invasif et très neuro-virulent
Quels sont les étapes de l’invasion tissulaire?
- invasion de l’organe
- dépend balance virus/défense de l’hôte
Quand le rash se produit?
Lorsque virions quittent les vaisseaux sanguins
Que sont les macules et les papules?
Quand inflammation arrive au derme où l’infection est confinée dans ou près lit vasculaire
Que sont les vésicules et pustules?
Quand virus se propage des capillaires à la couche superficielle de la peau
=> destruction des cellules par réplication virale = première cause de lésion
Quelles sont les lésions mucor-cutanées à propagation non systémique?
- papilloma virus
- molluscum contagiosum
- ORF
Qu’est-ce que le tropisme viral?
Spectre de tissu infecté par un virus
Quels sont les déterminants du tropisme tissulaire?
-récepteurs cellulaires (HIV-1, EBV)
-protéines cellulaires qui régulent la transcription virale
=> virus JC se réplique dans oligodendrocytes car activateur viral actif seulement dans ce type cellulaire
-protéases cellulaires qui doit être clivée pour une série protéase pour être infectant
Qu’est-ce que la Clara tryptase?
- tractus respiratoire
- sérine protéase
Par quoi est déterminé l’affinité virale?
- récepteurs cellulaires pour virus
- FT cellulaire qui reconnaissent séquences virales
- habilité cellules à supporter réplication virale
- barrière physiques
- température locale, pH
- enzymes digestives et bile
Quelles sont les différentes classes de gènes viraux qui effectuent la virulence?
Genes qui
- affectent l’habilité du virus à se répliquer
- gènes qui modifie les mécanismes de défense des l’hôte
- permettent au virus de se propager dans l’hôte
- ont des effets intrinsèques tuant la cellule
Vrai/Faux
La désactivation des gènes de virulence réduit la fitness du virus mais l’habitabilité à se répliquer dans une culture tissulaire n’est pas affectée.
Vrai
Quels sont les gènes qui modifient les mécanismes de défense de l’hôte?
-gènes qui peuvent mimer les molécules cellulaires normales critiques pour la défense de l’hôte
=> sabotage défenses intrinsèques corps
=> initiation système adaptative
- virokines sécrètent protéines qui miment cytokines, facteur de croissance ou régulateurs immunitaires
- virorecepteurs: homologues récepteurs de l’hôte ou molécules immunitaires cellules de surface
D’où viennent les symptômes cliniques de l’infection virale de l’hôte?
Réponse de l’hôte à l’infection
De quoi résultent les dommages cellulaires?
- effet de la réplication virale dans la cellule
- réponses immunitaires innées et adaptatives
Que provoque l’inhibition de la synthèse des protéines et de l’ARN par le virus?
- perte intégrité membranaire
- fuite enzymes et lysosomes
- dégradation cytoplasmique
- formation syncytium pour virus enveloppés
- apoptose
- perméabilité membranes cellulaires
- génome peut-être endommagé
- production des toxines
De quoi résulte la diarrhée induite par le rotavirus?
- malabsorption due à des dommages des entérocytes
- activation du système nerveux entérique
- action protéine virale NSP4 qui altère la perméabilité cellulaire de l’épithélium et la sécrétion de Cl-
- effet sur BBM
Vrai/faux
Pour les virus non cytolytique, il est probable que la réponse immunitaire est la seule cause de la maladie donnant une immunopathologie.
Vrai
Sur quoi est basé la classification des interactions entre l’hôte et le virus?
- prodution descendance infectieuse
- virus tue les cellules de l’hôte
- observation de signes ou de symptômes cliniques
- durée de l’infection
Vrai/Faux
La plupart des infections virales sont sub-cliniques.
Vrai
De quoi dépend la sévérité de la maladie?
- virus
- SI
- encore des facteurs de l’hôte
Que sont les infections “hit and run”?
- principalement cytolytiques (détruisent cellules de l’hôte)
- très infectante
- facilement transmissible à un nouvel hôte sensible
Que sont les infections “hit and stay” ?
Fréquentes ou rarement transmissibles aux hôtes successifs
Infections aigues
Que sont les infections aigues?
- analogues aux infections aigues cytopathgéniques in vitro
- différente (in vivo, plus faible)
- échelle de temps différentes
Infections aigues
Comment est obtenue la spécificité de l’infection?
- récepteurs cellulaires spécifiques
- restrictions intracellulaires
Infections aigues
A quel moment se fait la transmission?
Entre période d’incubation et signes ou symptômes
Infections aigues
Qu’est-ce que la variation antigénique?
Mécanisme effectif pour le maintien de quelques virus causant les infections aigues
Infections aigues
Qu’est-ce que la plasticité antigénique?
- virions peuvent tolérer de nombreuses substitutions amines dans leurs protéines structurelles
- apparition mutants résistants aux Ac
Infections aigues
Citez des virus à haute plasticité antigénique?
- rhinovirus
- influenza (enveloppés)
Infections aigues
A quoi est du la variation antigénique chez un pote immunocompétant?
- glissement antigénique (drift)avec apparition virions avec une surface protéique légèrement altérée
- changement antigénique (shift) avec changement majeur de la surface protéique par acquisition de gènes encodant une nouvelle surface protéique
Infections persistantes
Quelles sont les 3 types d’interactions persistantes entre l’hôte et le virus?
- infections chroniques
- infections latentes
- infections lentes
Infections persistantes
Quels sont les points clés des infections persistantes?
- non éradiquées par la réponse immunitaire
- modulation immunitaire du virus
- d’autres résultent d’anormalités au niveau du système immunitaire
- large nombres de cellules infectées
Que sont les infections des tissus avec une surveillance immunitaire réduite?
- tissus avec surface exposée à l’environnement (peau, glandes…)
- seuil plus élevé de l’action immunitaire
- mais aussi autres compartiments du corps qui ne peut montrer des réponses inflammatoires
Quels sont les mécanismes proposés pour la persistance et échappement à la surveillance immunitaire par les cellules infectées par HIV?
- expression restreinte
- bourgeonnement de particules virales dans les vacuoles cytoplasmiques
- inhibition prolifération L
- variations génétiques
- multiplication dans des sites privilégiées immunitaires
- mobilité des cellules latentes infectées avec inhibition défenses immunitaire et non spécifiques
Quels sont les mécanismes proposés pour la persistance et l’échappement à la surveillance immunitaire par le cytomégalovirus?
- expression altérée et distribution TC de CMH classe 1
- production altérée L ou co-stimulation
- inhibition lyse dédiée par système du complément due ) une augmentation production facteurs inhibiteurs
- masquage surface cellulaire avec surproduction récepteurs Fc capable de se lier à l’IgG
- excrétion modulateurs cellulaire du SI par CMV
