BCM 1502 Cycle de l'acide citrique Flashcards
Quels sont les produits global du TCA? (4)
-2 CO2
-3 NADH
-1 FADH2
-1 GTP
Où a lieu le TCA?
Dans la matrice du mitochondrie
Quels sont les deux types de transports principaux dans la matrice des mitochondries?
- Diffusion passive (suit le gradiant de concentration)
- Par transport facilité (transporteurs actifs)
Quel molécule vient s’ajouter au groupement acétyle-CoA?
Oxaloacétate
Quel enzyme transforme le pyruvate en acétyl-CoA?
La pyruvate déshydrogénase (PDC)
Produit un CO2 et un NADH+H+.
De combien d’enzymes est composé la PDC? Lesquels sont-ils?
- E1 (Pyruvate déshydrogénase)
- E2 (Dihydrolipoyl transacétylase)
- E3 (Dihydrolipoyl déshydrogénase)
Quels sont les avantages d’avoir un multienzyme? (PDC)
- Diminution de la distance que doivent parcourir les substrats et produits de la réaction.
- Minimise les réactions intermédiaires
- Régulation des réactions coordonnées
Quel est le bras de la PDC?
Le bras lipoyllysyl
Il s’assure du transfert des intermédiaires entre les différents enzymes.
Comment l’arsenic affecte le TCA?
L’arsenic se lie de manière covalente au bras liposyllysyl ce qui l’inactive lui et l’enzyme entièrement.
Quels-sont les 5 coenzymes du PDC?
- Thiamine pyrophosphate (TPP)
- Lipoamide (le bras)
- Coenzyme A (CoA)
- FAD
- NAD+
Quelle est la première réaction du PDC?
Pyruvate perds CO2 et le carboxyl est remplacé par la TPP.
Quelle est la deuxième réaction du PDC?
TPP se fait substitué par le lipoamide qui va aussi oxyder le groupement hydroxy par pyruvate déshydrogénase.
Quelle est la troisième réaction du PDC?
Le lipoamide est substitué par CoA grâce à dihydrolipoyl transacétylase.
Quelle est la quatrième réaction du PDC?
La lipoamide se fait restauré par la dihyrolipoyl déshydrogénase et produit un NADH + H+.
Quels sont les deux régulateurs du PDC?
- Inhibition par produits: NADH et Acétyl CoA
- modification covalente de la E1 (pyruvate déshydrogénase): phosphorylation
Quels sont les enzymes responsables du contrôle de la PDC par phosphorylation?
- Pyruvate déhydrogénase kinase (utilise ATP pour phosphoryler E1)
- Pyruvate déshydrogénase phosphatase (hydrolyse le lien O-P)
Quels sont les activateurs de la pyruvate déhydrogénase kinase?
Acétyl-CoA et NADH
Qu’est-ce que la citrate synthase?
C’est l’enzyme qui va coupler l’oxaloacétate et l’acétyl-CoA pour faire du citrate. (Perd CoA par oxydation)
Qu’est-ce que l’Aconitase?
Elle transforme le citrate en l’isocitrate avec Cis-Aconitate comme intermédiaire.
Elle utilise un centre fer-soufre
Il s’agit d’une réaction de déshydratation et de réhydratation
Qu’est-ce que l’isocitrate déshydrogénase?
Elle oxyde le groupement hydroxy (formation d’NADH + H+) pour ensuite permettre décarboxylation (formation de CO2) de l’isocitrate. l’énolate est ensuite hydrogéné pour former une cétone. (⍺-cétoglutarate)
Qu’est-ce que l’⍺-cétoglutarate déshydrogénase?
Comme la PDC elle décarboxyle l’⍺-cétoglutarate (formation de CO2) pour lui mettre CoA, pour faire une succinyl-CoA.
formation d’NADH + H+
Multienzyme composé de E1, E2 et E3
Qu’est-ce que la Succinyl-CoA synthétase?
Elle clive CoA de la succinyl-CoA, formant GTP et une Succinate.
Qu’est-ce que la Succinate déshydrogénase?
Déhydrogénise le succinate en fumarate et forme un molécule de FADH2.
Protéine membranaire
FAD est lié par covalence à l’enzyme
Qu’est-ce que la fumarase?
Elle hydrate la double liaison du fumarate pour faire du S/L-Malate.
Qu’est-ce que la malate déshydrogénase?
Elle oxyde le groupement hydroxy et forme une molécule de NADH + H+.
Cela régénère l’oxaloacétate initial du cycle TCA.
Combien d’ATP fait la TCA?
12 ATP par cycle, donc 24 par glucose.
Combien d’ATP fait l’oxydation du glucose?
38 ATP
Quelles molécules servent d’activateurs dans la TCA?
Principalement le pyruvate, l’ADP et le Ca2+.
Quel est le lien entre la TCA et la biosynthèse?
Dans le cycle de la TCA est formé les précurseurs de beaucoup de macromolécules.
Est-ce que la TCA est catabolique ou anabolique?
Elle est amphibolique.
Quel lien peut on faire entre la TCA et le cancer?
La mutation de certains gènes qui codent des enzymes de la TCA corrèlent avec certains cancers.
Combien de points d’inhibitions possède le TCA?
4 entre les quatre première réactions excluant celle avec l’aconitase et incluant la PDC.
