BCM 1502 Biosynthèse et catabolisme des nucléotides Flashcards
Combien de cycle comporte une pyrimidine?
Combien de cycle comporte un purine?
- pyrimidine: 1
- Purine: 2
Quelles sont les pyrimidines?
- Cytosine
- Uracil
- Thymine
Quelles sont les purines?
- Adénine
- Guanine
Quelle est la différence structurelle entre l’uracile et la thymine?
La thymine est l’uracile méthylé.
Quelle est la différence entre un nucléoside et un nucléotide?
Les nucléoside sont une base azoté avec un ribose ou un désoxydibose tant-dis que les nucléotides ont un, deux ou trois phosphate en plus.
Quel partie d’un nucléotide est la plus énergétique?
la liaison pyrophosphate
Quelles sont les molécules nécéssaire à la synthèse d’une purine? (6)
- 2 glutamine (Azote)
- 1 aspartate (Azote)
- 1 glycine (Azote et Carbone)
- 2 formyl THF (Carbone)
- 1 bicarbonate (Carbone)
- X molécules énergétiques (ribose-P + ATP)
Quel base azotée dans la synthèse des purine précède l’adénine et la guanine
La base hypoxanthine
Quelle nucléotide est formé à partir de la base hypoxanthine?
L’inosine monophosphate
Sur quelle molécule est synthétisé les purines?
Un ribose-5-phosphate (R5P)
Quelle est la première étape de la synthèse d’une purine?
La transformation du Ribose-5-phosphate (R5P) en 5-Phosphoribosyl-⍺-pyrophosphate (PRPP) par la Ribose phosphate pyrophosphokinase
Quelle est la deuxième étape de la biosynthèse des purines?
substitution de l’oxygène en C1 par une fonction amine en position beta par amidophosphorybosyl transférase pour faire du beta-5-phosphoribosylamine (PRA)
Quelle est la particularité du PRPP?
Il s’agit d’une molécule très énergétique et réactive. Elle joue le rôle de l’activation de la biosynthèse des purines.
D’où vient le R5P pour la la synthèse des purines?
La voie des pentoses
Quelle est le produit du catabolisme des purines?
L’acide urique
Comment le ratio d’AMP et de GMP dans l’organisme est contrôlé?
La voie de la synthèse de l’AMP requiert du GTP et la voie de synthèse de du GMP requiert de l’ATP.
Alors une forte concentration en GTP stimule la synthèse d’AMP et vice-versa.
Quel médicament vient interrompre une étape dans la biosynthèse de l’AMP et de la GMP?
Quelle étape est interrompue?
À quoi sert ce médicament?
- L’acide mycophénolique (MPA)
- L’IMP déshydrogénase (première étape de la synthèse du GMP)
- Médicament anti-rejet
Quel est le principe des médicaments anti-rejets?
Empêcher la biosynthèse de nucléotides.
Pourquoi un bloquage dans la biosynthèse de nuclétoides ne tue pas un sujet humain?
Car le corps est capable de recycler les bases azotés de l’alimentation et préexistantes.
Quelle cellules sont affectées sévèrement par le bloquage de la biosynthèse de nucléotides?
Pourquoi?
Les lymphocytes T et B
Car les lymphocytes doivent absolument biosynthétiser de nouveaux nucléotides pour leur division cellulaire et ne peuvent pas recycler.
Comment le corps attaque-t-il une greffe d’organe?
Par une réaction immunitaire avec les lymphocytes T et B.
Comment est phosphorylé le GMP et le GDP?
L’ATP vient transférer une phosphate au GMP via nucléoside monophosphate kinase ou au GDP via nucléoside diphosphate kinase
Qu’est-ce du XMP?
Xanthosine monophosphate
Un intermédiaire de la biosynthèse du GMP.
Quelles purines peuvent être catabolisées?
- AMP
- IMP
- XMP
- GMP
Quelle est la première étape du catabolisme des purines?
Déphosphorylation du nucléotides par une nucléotidase
Quel nucléoside doit subir une réaction supplémentaire avant la deuxième étape du catabolisme des purines?
L’adénosine: Elle doit subir une désamination par l’adénosine désaminase pour devenir de l’inosine.
Quelle est la deuxième étape du catabolisme des purines?
l’hydrolyse du ribose du nucléoside par purine nucléoside phosphorylase (PNP) pour n’avoir que la base azotée.
Que doit subir la guanine avant la troisième étape du catabolisme des purines?
Une désamination par la guanine désaminase pour devenir de la xhanthine.
Quelle est la troisième étape du catabolisme des purines?
L’oxydation de la xhanthine en acide urique par la xanthine oxydase.
Quelle est la particularité de l’acide urique?
C’est une molécule qui ne peut pas être transformée d’avantage par le corps. (Ne peut pas être recyclé) Elle doit donc être éliminée.
Qu’est-ce que la goutte?
Une maladie où l’acide urique s’accumule dans les articulations d’un sujet.
Quelle médication est donnée à un sujet souffrant de la goutte? Quel est sont effet?
De l’allopurinol qui inhibe la xanthine oxydase.
Où est excrété l’acide urique?
70% par les reins
D’où vient la majorité des acides nucléiques recyclés?
L’ARN
Quelles bases de purines peuvent être récupérées?
- adénine
- hypoxanthine
- guanine
Quelles sont le deux enzymes de la récupération des purines?
- l’adénine phosphoribosyl tranférase (APRT)
- L’hypoxanthine-guanine phosphoribosyl transférase (HGPRT)
Quelle est le bilan réactionnel de la voie de récupération des purines?
base azoté + PRPP –> NMP + PPi
Qu’est-ce que le syndrome de Lesch-Nyhan? (4 faits)
- Un déficit sévère d’HGPRT. Cela empêche le recyclage d’hypoxanthine et de guanine.
- Cela crée des problèmes dévelopementaux causant entre autre un retard mental.
- Ce déficit force le corps à synthétiser plus d’acide aminés.
- Cela crée une accumulation en acide urique qui cause la goutte.
- Cette erreur génétique se trouve sur le gène X
Quel genre de mutation avons-nous observé chez certaines moisissures du pain?
des moisissures incapables de synthétiser des pyrimidines. Elles devaient donc s’alimenter de cytosine et d’uracile pour survivre ou d’acide orotique.
Quelles molécules sont nécéssaire à la biosynthèse de pyrimidine? (5)
- 1 glutamine (1 azote)
- 1 aspartate (1 azote ; 3 carbones)
- 1 bicarbonate (1 carbone)
- de la quinone (cofacteur)
- de l’énergie sous forme d’ATP
Quel enzyme de la biosynthèse utilise la quinone?
Que forme-t-elle?
À quoi sert ce cofacteur?
- La dihydro-orotate déshydrogénase
- Elle forme l’orotate (acide orotique)
- Il sert d’accepteur de proton (se fait réduire)
Quelle molécule précède l’UMP lors de la biosynthèse des pyrimidines?
L’orotidine-5-monophosphate (OMP)
Quel est le chemin de synthèse de la synthèse de dCTP et dTTP?
dCTP: UMP–>UDP–>UTP–>CTP–>CDP–>dCDP–>dCTP
dTTP: UMP–>UDP–>dUDP–>dUTP–>dUMP–>dTMP–>dTDP–>dTTP
Quelles sont les 4 règles de la biosynthèse des pyrimidines?
- Seulement les NDP peuvent être “désoxydé” en dNDP
- Seulement le dUMP peut être méthylé en dTMP
- Seulement le UTP peut être converti en CTP
- Seulement le NTP peut être converti en NMP
Quelle enzyme est responsable de synthétiser le CTP?
Quelles molécules sont utilisées?
La CTP synthase qui transforme l’UTP en CTP avec une glutamine, une ATP et une molécule d’eau en CTP
Qu’est-ce que l’arthrite rhumatoïde?
Il s’agit d’une maladie auto-immunitaire où les articulation sont ciblées.
Quel médicament est donné pour traiter l’arthrite rhumatoïde?
Où agit ce médicament?
Quel est l’effet secondaire?
- L’Arava
- Il vient inhiber la dihydro-orotate déshydrogénase qui produit de l’acide orotique dans la biosynthèse des pyrimidines
- immunosupression
Quelle est la première étape du catabolisme des pyrimidines?
La déphosphorylation des riboses par des nucléotidases pour former des nucélosides.
Quel nucléoside doit une réaction supplémentaire avant de passer à la deuxième étape du catabolisme des pyrimidines?
La cytidine doit subir une désamination pour devenir un uridine.
Quelle est la deuxième étape du catabolisme des pyrimidines?
Hydrolyse du ribose du nucléoside pour former une uracil ou une thymine dépendamment de la méthylation du substrat par une phosphorylase.
Quelle est la troisième étape du catabolisme des pyrimidines?
La désamination et décarboxyation de β-uréidoproionate par β-uréidoproionase pour former une β-alanine.
Quel est la produit finale du catabolisme des pyrimidines et où va-t-il?
Malonyl-CoA qui sert à la synthèse d’acides gras
Quelle enzyme est responsable de former les désoxyriboses?
Quel est le substrat?
- Ribonucléotide réductase (RNR)
- NDP
Quels sont deux molécules capables d’inhiber la RNR?
- hydroxyurée
- 8-Hydroxyquinoline
Quel cofacteur est nécessité à la synthèse de dTMP?
Quelle est l’enzyme catalyse cette réaction?
- THF
- Méthylation par Thymidylate synthase
Quelles sont les étapes de régénération du THF?
- hydrogénation du DHF en THF par dihydrofolate réducatase
- THF est hydroxyméthylé en N5, N10-Méthylène-THF par la sérine hydroxyméthyltransférase
Pourquoi le dUTP doit être transformé en dUMP pour être transformé en dTMP pour être rephosphoryler ensuite?
Car le dUTP pourrait être incorporé dans l’ADN ce qui causerait des mutations. Le corps le transforme donc premièrement sous une forme plus stable.
Quels sont les médicaments utilisés pour traiter le cancer affectant la biosynthèse de dTMP? (3)
Où agissent-ils? (2)
- 5-fluorodésoxyuridylate (FdUMP) (thymidylate synthase)
- Aminoptérine (analogue du DHF) (Dihydrofolate réducatase)
- Améthoptérine/Méthotrexate (analogue du DHF) (Dihydrofolate réducatase)
Quel médicament antibactérien a comme cible le cycle de THF?
Triméthoprime qui vient inhbier la dihyrofolate réductase
Discute de l’efficacité de l’inhibition du cycle du THF comme traitement.
Le THF se trouve dans la biosynthèse des pyrimidines et des purines. L’inhibition de son cycle inhibe donc la synthèse de quasi tous les acides nucléiques.
Quel est le principe des médicaments anti-cancer?
Quel est l’effet secondaire?
- Les cellules cancéreuse possèdent une indice mitotique très élevé. Si on inhibe la synthèse d’acides nucléiques on peut réduire cet indice mitotique.
- La synthèse des acides nucléiques étant très affecté cela peut affecter certains tissus tel que les cellules immunitaires, les cheveux et la peau.
