הרצאה 8 Flashcards

1
Q

RSS מהם איזורי?

A

V בקצה 3 של

J ובקצה 5 של

ישנם האזורים האלו.

הם אלו שמכוונים את תהליכי הרקומבינציה, בעלי מבנה שמור.

בתמונה- מבנה kvo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

RSS איך מתרחש תהליך הרקומבינציה באיזורי ה?

שרשרת קלה

A

היצמדות-> יצירת לולאה-> חיתוך דו גדילי-> חיבור הקצוות

J ושל V של ה RRS ה

מתקרבים אחד לשני, האיזורים האומפלימנטריים (הפטמבר והנונמר) נצמדים אחד לשני. בינהם יש הספייסרים של ה23, 12 נוקלאוטידים שאינם מתאימים אחד לשני באורך ולכן מייצרים לולאה.

לולאה גדולה גדולה של 23 נוקלאוטידים ולולאה קטנה של 12 נוקלאוטידים.

גודל הלופים קריטי לתהליך הרקומבינציה כי המערכת האנזימנטית מותאמת לגודל זה.

J ושל ה V בשלב הבא ישנו חיתוך דו גדילי בצד של

הדנא בינהם נחתך ומסולק, הקצוות נסגרים ומקבלים דנא מעגלי שיוצר החוצה.

J עם ה V לאחר מכן יש חיבור של ה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

הוא מסוכן לתא V ו J למה חיתוך דו גדילי ב?

מה הפתרון לדבר זה?

A

זה מסוכן לתא כי זה עלול להכניס אותו לאפופטוזיס

הפתרון:

  1. חיבור פוספט בין הנוקלאוטידים החשופים בקצה.

hairpin נקרא

  1. חיתוך חד גדילי במקום אקראי סמוך לקצה ופרישה של הדנא
  2. חיבור הקצוות הדביקים- הקצוות מחפשים את ההתאמה המיטבית. יהיה חיתוך של הנוקלאוטידים המיותרים ומילוי החוסרים להשלמת החיבור בין

J ל V.

כתוצרה מכך התווספו עוד נוקלאוטידים אקראיים בנק החיבור.

P נקראים נוקלאוטידים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מהו המבנה של הלוקוס של השרשרת הכבדה?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מהי החלוקה בדומיין של השרשרת הכבדה?

frameworks+ CDR

A

V,D,J

CDR3 נפגשים ב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

כמה רקומבינציות יש בתהליך של יצירת השרשרת הכבדה?

מה קורה אם אחת מהן גורמת

frameshift ל ?

A

2 רקומבינציות

אם אחת גורמת לפריימשיפט השניה יכולה לפצות על כך ולהחזיר למסגרת הנכונה.

שני שליש של כל רקומבינציה גורמת ליצירת מסגרת קריאה לא נכונה ויצירת פריימשיפט.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

בשרשרת הכבדה RSS איך נראה ה?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

איך מתרחש תהליך הרקומבינציה בשרשרת הכבדה?

A

היצמדות-> יצירת לולאה-> חיתוך דו גדילי-> היצמדות

(כמו בשרשרת הקלה)

פירוט לאחר השלב של החיתוך הדו גדילי:

(V ל D ובין D ל J קורה בין)

  1. Hairpin שלב ראשון
  2. חיתוך חד גדילי
  3. מאריך את הקצוות באופן אקראי TDT האנזים
  4. יש חיבור של קצוות דביקים לפי התאמה מיטבית

בסופו של דבר יש שני סוגי נוקלאוטידים שהתווספו

P א. נוקלאוטידים שהתווספו כתוצאה מהמבנה הפלינדרומי,נוקלאוטידים

N ב. נוקליאוטידים שהתווספו בגלל האנזים*, נוקליאוטידים

*TDT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

TDT מהו האנזים?

A

terminal deoxynucleotidyl transferase

בשרשרת הכבדה N מוסיף נוקלאוטידים

קורה בשלב טרם חיבור הקצוות הדביקים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה ההבדל בין קבוצות הנוקלאוטידים שנוספות בשרשרת הקלה לעומת אלו שנוספות לשרשרת הכבדה בתהליך הרקומבינציה?

A

P נוקלאוטידים

נוספים לשרשרת הקלה והכבדה, בהתאם לדנא הקיים

N נוקלאוטידים

נוספים באופן אקראי לשרשרת הכבדה בלבד

TDT עי האנזים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

בשרשרת הקלה Frameshift מה קורה במקרים?

מה הדבר הכי מגביל באפשרויות התיקון?

A

הדבר המשמעותי הוא הזמן- אם התא לא יתקן את עצמו מהר הוא יאבד את היכולת לשרוד במח העצם.

  1. ניתן לעשות רקומבינציה על האלל השני (מהכרומוזום הזוגי האחר)
  2. ניתן לעשות רקומבינציה על השרשרת השניה (למשל אם ניסינו על למדא ניתן לנסות בקאפא)
  3. ניתן לעשות ניסיות נוסף על אותו הלוקוס (התהליך מתואר בתמונה)

upstream v יעבור רקומבינציה עם doenstream J

(נשארים בדכ עוד סגמנטים, התהליך יקרה עד שהלוקוס נגמר,

הוא המגביל J לרוב)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

בשרשרת הכבדה Frameshift מה קורה במקרים?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

האם תהליך הרקומבינציה בתאי בי תלוי בנוכחות אנטיגן?

A

לא

הוא תהליך אקראי לחלוטין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מהו הסדר של יצירת השרשראות בתא בי?

A
  1. שרשרת כבדה
  2. שרשרת קלה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

אילו סגמנטים מתחברים לאילו לפי הסדר בשרשראות הקלות והכבדות?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

VDJ recombinase מהם?

A

קומפלקס אנזימים (לפחות 10 אנזימים שונים) שמבצעים את הרקומבינציה. כל אנזים מבצע פעולה אחרת, למשל:חיתוך דו-גדילי, חיתוך חד-גדילי ועוד. חלק מהאנזימים האלו ייחודיים ופועלים אך ורק בתהליך הרקומבינציה, לכן הם יתבטאו רק בלימפוציטים (תאי בי ותאי טי).
RAG1, RAG2 האנזימים הקריטיים הם,

בלעדיהם לא תהיה רקומבינציה

17
Q

RAG1, RAG2 מהם האנזימים?

מה קורה כאשר יש חסר של אחד מהם?

A

VDJ recombinase אנזימים ממשפחת

מבצעים את הרקומבינציה

בחסר של אחד מהם אין רקומבינציה- קרי אין תאי בי או תאי טי.

18
Q

למה יש בלעדיות אללית?

(איך לא נוצר מצב שלתא אחד יש 2 שרשראות כבדות. אם שני אללים עוברים רקומבינציה, בעיקרון יכולות להיות 2 שרשראות כבדות. יכולות להיות פוטנציאלית 4 שרשראות קלות.)

A
  1. היעילות של תהליך הרקומבינציה מאוד נמוכה והוא מתרחש בקצב מאוד איטי. לכן, אם שני אללים עוברים רקומבינציה, הסיכוי ששני האללים יגיעו לנקודת הסוף בדיוק באותו הזמן הוא כמעט 0.
  2. פי תופעת הבלעדיות האללית, תוצרים של רקומבינציה פרודוקטיבית (כלומר חלבון), מורגשים ע”י התא. ברגע שנוצר חלבון אחד תקין, החלבון הזה עושה עיכוב (משוב שלילי) על הלוקוס כדי לעצור את הרקומבינציה.

נעצר מיד לחלוטין והתא VDJ recombinase בפועל הביטוי של

נשאר עם האלל שהצליח, קורה גם בשרשרת הקלה וגם בשרשרת הכבדה.

19
Q

באיזה אופן מסודרים האזורים/ דומיינים הקבועים של השרשראות הקבועות על הלוקוס?

A

כל האזורים הקבועים נמצאים ברצף אחד אחרי השני.

בגלל שהאיזור המקודד לו IGM למשל- הנוגדן הראשון שנוצר הוא

V-D-J הוא הקרוב ביותר ל 𝜇 כלומר ל-

20
Q

מה ההבדל בהרכב של הנוגדנים המופרשים לנוגדנים הממברנלים?

איך נוצר כל אחד מהם?

מתי משתמשים בנוגדנים ממברנלים ומתי במופרשים?

A

הנוגדנים המופרשים הם הידופילים,

הנוגדנים הממברנלים יהיו הידרופובים.

בשביל ליצור נוגדן מופרש צריך לעשות ספלייסינג שכולל את החלק

מסומן בכתום בתמונה- SC שנקרא.

בתאי פלסמה splicing עובר SC

בשביל ליצור נוגדן ממברנלי צריך לעשות ספלייסינג שכולל את החלק

מסומן בצהוב בתמונה- MC שנקרא

כשהנוגדן צריך להיות ממברנלי B בתאי splicing עובר MC

תא בי נאיבי עם נוגדן ממברנלי-> מוצא אנטיגן-> הופך לתא פלסמה שמפריש נוגדנים

21
Q

באיזה תאים יכולים להיות מבוטאים הנוגדנים

ביחד IgM ו IgD

A

בוגר B בתא

22
Q

IgA או IgG איך נוצר?

A

class switch recombination (isotype switching)

IgD ו IgM תא נאיבי מבטא רק

ולאחר מפגש עם אנטיגן הוא צריך להחליף ולבטא איזוטיפ אחר.

𝜇 האיזוטיפ החדש שהתא צריך לבטא יחליף את ה

ולכן הוא עובר תהליך נוסף של רקומבינציה גנטית- אך בלוקוס אחר.

התהליך דומה לרקומבינציה המקורית

הלוקוסים מתחברים-> נוצרת לולאה אשר מסולקת-> יש חיתוך דנא וחיבור מחדש של המקטעים המבוקשים.

התהליך תלוי מפגש עם אנטיגן, תלוי סיוע מתאי טי. החיבור נעשה בתוך אינטרונים ולכן אין משמעות לפריימשיפט.

23
Q

B סיכום החיים של תא

A
24
Q

מהי הבעייתיות בתהליך הרקומבינציה?

A

יש סיכון לעבור טרנסלורציה ולכן תאי בי מועדין מאוד לעבור התמרה סרטנית. הטרנסלוקציות האלו הן מתרחשות בשכיחות די גבוהה. אבל כדי שתא כזה יהפוך להיות סרטני לא מספיק שתהיה טרנסלוקציה וצריכים להתרחש עוד אירועים נוספים.

25
Q

allotype מהו המונח?

A

מונח המתאר שינויים נקודתיים של ח”א בודדות בתוך שרשרת כבדה או קלה, אך ורק באזורים הקבועים, לגביהם יש שונות (פולימורפיזם) באוכלוסייה. (תזכורת: איזוטיפים הם חלבונים עם אותו תפקיד שמקודדים מאזורים שונים בגנום. ישנם 9 איזוטיפים של שרשרת כבדה ו-2 של שרשרת קלה).

דוגמה לאתר אלוטיפי: מקום מסוים באזור הוריאבילי של שרשרת קפא, לגביה יש שונות באוכלוסייה. זה לא משפיע על מבנה השרשרת. מבחינה גנטית: יש שני אללים של שרשרת כבדה, לכן יכולים להיות 2 אלוטיפים שונים ברמה העקרונית אצל כל אדם.

26
Q

סיכום הרצאה 8:

  1. איפה מתרחש תהליך הרקומבינציה ואיך?

V D J של הסגמנטים

  1. באיזה איזור יש חיבור של הסגמנטים האלו? מה אופי החיבורים ולמה זה מביא? מה הבעייתיות באופי החיבורים האלו? איך מתמודדים עם הבעייתיות?
  2. מי מבצע את הרקומבינציה?
  3. איך מתבצע שינוי איזוטיפ לאחר מפגש עם אנטיגן? על אילו שרשראות בנוגדן השינוי מפתיע?
  4. מה הסיכון ברקומבינציה?
  5. איזה חלק בדנא “נזרק” כחלק מתהליך הרקומבינציה?
A