4- Estructura funcional de las proteínas Flashcards
Traducción definición
Proceso por el cual una secuencia nucleotídica (RNAm) es utilizada para ordenar y unir de manera correcta una cadena poipeptídica
Componentes del RNAt
- Extremo 3’ ACC: Tiene la secuencia ACC, que es el sitio donde se une el aminoácido.
- Anticodón: Es complementario al mRNA
- Lazo T: Reconoce al RNA ribosomal,
- Lazo D: Contiene dos bases deshidroxiuridina que permiten el reconocimiento por la enzima aminoacil-tRNA sintetasa, que carga al tRNA con el aminoácido adecuado.
- El último nucleótido del triplete del anticodón no es tan específico
Evitan la unión prematura de las subunidades.
40S y 60S están inicialmente separadas y asociadas a factores de iniciación, como eIF3 y eIF6
Complejo de preiniciación lo forman
- La subunidad 40S se asocia con el factor eIF3
- Incluye la unión de eIF2-GTP y el tRNA de iniciación (Met-tRNAᵢᴹᵉᵗ)
- eIF1A se ensambla con la subunidad 40S
Este proceso es crucial para el inicio de la traducción.
eIF2 requiere GTP para unirse al tRNAᵢᴹᵉᵗ
Este factor actúa para separar las subunidades del ribosoma y evitar que se unan prematuramente hasta que todos los factores de iniciación estén en su lugar.
elF6
¿Cómo empieza el complejo de iniciación?
- El complejo de iniciación eIF4E se une al cap 5’ del mRNA, identificando y preparando el mRNA para la traducción.
- eIF4G interactúa con eIF4E para formar el complejo de iniciación
Función de eIF4A
Actúa como una helicasa, desenrollando las estructuras secundarias del mRNA con ATP, permitiendo que el ribosoma escanee el mRNA hasta encontrar tRNA- Met, desplazándose por la región 5´UTR hasta encontrar AUG
-> permite que el ARNm se mantenga lineal
Una vez que el codón de inicio es identificado, el reconocimiento del tRNAᵢᴹᵉᵗ permite _______
la unión de la subunidad 60S, formando el ribosoma 80S completo y listo para iniciar la traducción.
Frecuencia de nucleótidos situados en torno al sitio de iniciación de la traducción en proteínas humanas
Secuencia Kozak
La secuencia de Kozak _____
(5’-ACCAUGG-3’) alrededor del codón de inicio afecta la eficiencia de la traducción. (A y G regiones conervadas)
-> reconocida por la subunidad pequeña del ribosoma (40S), junto con eIF -> ayudando a que el ribosoma identifique el codón de inicio AUG, posteriormente llega 60s empezando la traducción
secuencia que afecta la eficiencia de la traducción
Una vez que el ribosoma está completamente ensamblado en el sitio de inicio, ________
el complejo ribosomal no se disocia hasta que termine la traducción.
Zonas del ribosoma
Sitio A: Sitio de aceptación del aminoacil RNAt (corresponde a la lectura del codón)
Sitio P: Sitio donde se elonga la cadena peptídica, se localiza el peptidil-RNAt
Sitio E: Por donde el tRNA sale del ribosoma después de haber transferido su aminoácido.
Pasos de elongación
1- El tRNA de iniciación (Met-tRNAᵢᴹᵉᵗ) se encuentra en el sitio P con el primer A.A (metionina).
2- El aminoacil-tRNA correspondiente al siguiente codón entra en el sitio A con ayuda de factores de elongación.
3- La hidrólisis de GTP provoca un cambio conformacional en el ribosoma que asegura la entrada correcta del tRNA.
4- El rRNA cataliza la formación del enlace peptídico entre la metionina y el nuevo aminoácido en el sitio A
5- La hidrólisis de GTP y ATP permite el cambio conformacional del ribosoma, moviendo el tRNA que estaba en el sitio P hacia el sitio E y el tRNA que estaba en el sitio A hacia el sitio P.
6- Este movimiento deja el sitio A libre para el siguiente aminoacil-tRNA, permitiendo que el proceso continúe.
Código genético
Compuesto por 3 bases nitrogenadas (tripletes o codones) específicos para cada A.A
Las proteínas son consideradas ________
las moléculas que realizan las acciones codificadas por medio de genes
de prot primitivas -> a complejas
Estructura de las proteínas
- Los aminoácidos son las unidades de construcción de las proteínas.
- Cada aminoácido tiene un átomo de carbono central (carbono alfa) al que se unen cuatro grupos químicos.
- Los átomos de los A.A se unen mediante enlaces covalentes
- Al unirse los A.A se pierde una molécula de H2O
Grupos químicos unidos al carbono central:
- Grupo amino (NH₂): Contribuye a la basicidad del aminoácido.
- Grupo carboxilo (COOH): Confiere acidez al aminoácido.
- Átomo de hidrógeno (H).
- Cadena lateral o grupo R: Es la parte variable de cada aminoácido y determina sus propiedades químicas y su carácter único, ya que varía entre los diferentes aminoácidos.
Cadena lateral o grupo R de los A.A varían según
tamaño, forma, hidrofobicidad, carga y reactividad
Estructura primaria de las proteínas
- Arreglo lineal simple
- Polimerización de aminoácidos
- Péptidos: Cadenas cortas de A.A unidos por enlaces peptídico (20-30)
- Polipéptidos: Cadenas más largas de A.A, (>100 - 4000)
- Tamaño se reporte en Da
Estructura secundaria de las proteínas
- Ocurre en los espacios que se generan después del plegamiento de la proteína
- Adquiere una estructura espiral en ausencia de enlaces no covalentes
- Cuando se estabilizan los puentes de H+ en algunos residuos, se adquiere las estructuras (elementos de soporte interno)
Hélices alfa y hojas beta
Hélices alfa (α) caract
- El átomo carbonil- O2 de cada péptido está unido por puentes de H+ al átomo amino-H+
- Todos los puentes de H+ están orientados en la misma dirección, contribuyendo a la estructura helicoidal.
- Grupos R en los extremos, afectando su hidrosolubilidad o hidrofobicidad.
- 3.6 residuos de A.A por cada giro completo de la hélice
Hojas beta (β) o láminas beta
- Hebras paralelas de dos cadenas de A.A formadas por puentes de hidrógeno entre el grupo N-H y el grupo C=O
- Consiste en hebras cortas (5-8 residuos)
- La dirección de las hebras puede ser paralela o antiparalela (determinada por el enlace peptídico)
Las estructuras secundarias pueden formar ____
giros entre 3 o 4 residuos, localizados en la base de la prot
-> formados por puentes de H+ entre los residuos
-> permiten presentar estructuras más compactadas
