2.4 Repetidos comunes Flashcards
¿Qué son los repetidos comunes?
Regiones de ADN que tienen secuencias repetidas y están en diferentes regiones (dispersos)
¿En qué regiones pueden estar los repetidos comunes?
(4)
transposones (45%)
regiones intergénicas
pseudogenes
repeticiones cortas, largas y en tandem
¿Qué son los transposones?
Elementos móviles del genoma: secuencias que se pueden replicar e insertar en diferentes localizaciones (genes saltarines)
Tipos de transposones
Clase I: Retro-transposones
Clase II: DNA transposones
Clase I de transposones
Retro-transposones -> elementos genéticos móviles que pueden moverse de un lugar a otro dentro del genoma a través de un mecanismo de copia y pega mediado por RNA
1- Una enzima, transcriptasa reversa convierte este ARN en ADN complementario (cDNA).
2- El cDNA se inserta en una nueva ubicación dentro del genoma.
Clasificación de los retro-transposones
- LTR -> repeticiones terminales largas, son secuencias de (100pb a 5Kb), localizada en los extremos de los cromosomas
- no LTR -> Repeticiones terminales no largas, se subdividen en dos (LINE y SINE)
Tipos de no LTR
- LINEs → elementos intercalados largos (20% genoma)
- SINEs → elementos intercalados cortos (13% genoma)
Clase II de transposones
DNA transposones
-> saltan directamente a otro DNA
Caract. de los LINEs (5)
long interspersed nuclear elements
- Localizados en regiones eucromáticas en bandas G
- Son autónomos -> ellos mismos mismos producen la transcriptasa reversa y endonucleasa
- 3 familias (LINE 1-3) -> LINE 1 más común (17%) longitud de 6Kb
- Su transcripción es bidireccional en 5´UTR
- Tiene cola de poliA xq viene de RNA
LINE 1 caract.
ORF 1: transcribe a p40 (prot. chaperona de ac. nucleicos)
ORF 2: produce endonucleasa y transcriptasa reversa (autónoma)
-> ORF son marcos de lectura, producen algo
Open reading frames
Características de los SINEs
short interspersed nuclear elements
- Retro-transposones 100-400pb
- no autónomos (no codifican ninguna prot)
- LINEs y SINEs comparten secuencias
- La maquinaria de LINEs es responsable de la retro-transcripción de SINEs por lo que carecen de TR y endonucleasa
¿Cuál es la forma más común de SINEs?
y qué son?
Elementos ALU -> secuencias de ADN repetidas que se encuentran en el genoma humano
Características de los elementos ALU (3)
- Secuencia más abundante con una longitud de 280pb
- Compuesto por 2 repetidos en tandem 120pb c/u seguido de una secuencia de An/Tn
- Están en bandas R (Q negativas) en brazo largo (q)
