2.2 RNA no codificantes Flashcards
Función de los RNAs
tienen info genética
síntesis de proteínas
maduración del ARN
regulan expresión de genes
ARN catalítico (ribozimas → splicing)
Diferencias entre ADN y ARN
Timinas cambian a uracilos en RNA
El azúcar del RNA es ribosa
Hélice simple (RNA)
RNA -> azúcar + base = nucleósido
Nucleósido + fosfato = nucleótido
Estructura secundaria del ARN
hairpins: 5 - 10 NT
stem loops: miles de NT
Estructura terciaria del ARN
pseudoknot: 2 stem 2 loops
stem - tallo / loops - bucles
Función de los RNA nucleares pequeños (snRNA)
Maduración de RNA primario (hnRNA)
-> proceso de splicing pre-RNA
Función de los ARN nucleolares (snoRNA)
precursores de los RNAr
Función de los ARN de Cajal (scaARN)
Modifican RNAs nucleares
snRNA y snoRNA
Función de los ARN de interferencia (RNAi)
y cuántos nt tiene
21 - 25 nt de RNA de doble cadena que causan el silenciamiento genético
Tipos de ARN de interferencia (iRNA)
→ siRNA
→ miRNA
→ piRNA
Función de RNA largos no codificantes (lncRNA)
y cuántos nt tiene
De más de 2000 nt, sirven de armazón, regulan diversos procesos como de la act genética y la heterocromatización del chr X
ARN’s que se encargan de la maduración del pre-RNA (splicing)
snRNA -> para splicing
- RNAs nucleares pequeños
- small nuclear
Características (3) de los snoRNA
Regulación epigenética
splicing
procesamiento de RNAr
XIST
para silenciamiento de chr. X
H19
para imprinting -> silencia o activación de genes
es un ARN no codificante que desempeña un papel clave en la inactivación del cromosoma X
XIST o transcrito específico X-inactivo
La proximidad entre el branch site y el splice acceptor site es de ___
20nt -> fundamental para el proceso de empalme del ARN, si estuvieran demasiado separados, el empalme sería menos eficiente o incluso no ocurriría
Tipos de snRNA
U1, U2, U4, U5 y U6 -> involucrado en el proceso de splicing pre-RNA
Caract. de los snRNA
- Formado por 107-210 nt
- Asociados con 6 a 10 proteínas que forman el small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs)
- Presentes en el núcleo
A dónde se une el U1 y U2 del snRNA
U1 → se une al 5’ del pre-RNA del intrón
U2 → se une al sitio de ramificación del intrón 1
(Ambos forman parte del spliceosoma)
-> Una vez pegados hacen loop, se van los intrones y por cargas se unen exones
Caract. de los miRNA
- Se conocen como RNA pequeños
- 21 a 22nt
- Regulan la traducción por medio de complementariedad de los bases transcritos
Dos formas que podemos ver a los miRNA
Bicatenaria -> forma inactiva en doble cadena
Monocatenaria -> activa en cadena sencilla
Función de un miRNA con un RNAm, en la traducción
miRNA se une al UTR’3 del ARNm (hibrida) bloqueando la deadenilación → bloquenado la traducción
¿Quién sintetiza el miRNA?
y en dónde
RNA pol II en el núcleo
¿Qué enzimas cortan al RNA en el núcleo para quitar cola de poliA y CAP del miRNA?
RNASEN o DROSHA (1er corte) en núcleo
¿Cómo empieza la síntesis de miRNA?
En el núcleo la RNA polimerasa II transcribe el gen del miRNA como una molécula precursora conocida como pri-miRNA (estructura de horquilla) con cola poliA
¿Qué ocurre después de la síntesis del pri-miRNA?
y hacia dónde se dirige
Drosha o RNASEN corta el pri-miRNA en el núcleo (quita CAP y poliA) para generar pre-miRNA.
-> Este pre-miRNA tiene unos 70nt y una estructura de horquilla bien definida.
- Y mediante una exportina-5 transporta el pre-miRNA al citoplasma.
Una vez llega el pre-miRNA al citoplasma ¿Qué ocurre?
Dicer corta el pre-miRNA en ambos extremos, eliminando el lazo de la horquilla y generando una molécula de miRNA de doble hebra (miRNA-duplex)
-> Dicer produce un RNA de 21-23nt
¿Qué ocurre después de que el complejo Dicer actuó?
Argonauta (AGO) en el complejo RISC selecciona la hebra guía o funcional del miRNA (para que permanezca) y degrada la hebra pasajera.
-> Elimina doble cadena y lo deja sencillo (monocatenario) para tener el miRNA maduro
¿Qué ocurre dentro del complejo RISC?
El miRNA pasa de ser una molécula bicatenaria (doble hebra) a una monocatenaria (una sola hebra).
-> recordar que este complejo está formado por múltiples proteínas entre ellas Argonauta
Función del miRNA maduro en el complejo RISC
El miRNA dentro del RISC guía la unión del complejo a secuencias complementarias en el RNAm -> volviéndolo bicatenario inactivándolo
-> va a regular la expresión génica mediante la degradación o inhibición de la traducción del RNAm objetivo.
miRNA principalmente bloquea NO degrada
¿Qué pasó en 1990 con los microRNAs?
Introducción de copias extras de un gen productor de pigmento
-> en vez de intensificarlo, lo silenció, y las plantas crecieron sin color xD
¿Qué pasó en 1998 con los microRNAs?
Tenían como objetivo el silenciamiento de una prot. muscular específica. Se introdujeron RNA de cadena sencilla secuencia complementaria, RNA de doble cadena
-> Los dsRNA detenían la producción de la prot
¿Qué es el fenómeno de interferencia RNA?
Destrucción de RNAm que contenían la misma secuencia del dsRNA
Caract. de los siRNA
RNAs pequeños de interferencia
BIcatenarios de 21 a 25bp
- Ambos extremos 3´presentan extremos protuberantes, NO forma loop
Origen de los miRNA y siRNA
- miRNA codificado por genes endógenos en el genoma
- siRNA son exógenos o introducidos en la célula por agentes externos como virus, transposones, o moléculas sintéticas diseñadas en el lab, tmbn puedne ser endógenos,
¿Cómo es el procesamiento de los siRNA?
El siRNA se origina a partir de ARN bicatenario largo (dsRNA), que es directamente procesado por Dicer en el citoplasma sin la necesidad de una etapa de procesamiento nuclear (no involucra a Drosha como en los miRNA)
Dicer endonucleasa corta -> siRNA forma complejo -> AGO elimina cadena pasajera -> RISC y siRNA se unen a cadena blanco eliminándola
Complementariedad con el mRNA objetivo (miRNA)
Los miRNA típicamente tienen una complementariedad parcial con su mRNA diana. Como resultado bloquean la traducción del mRNA en lugar de inducir su degradación
Complementariedad con el mRNA objetivo (siRNA)
- Los siRNA generalmente tienen una complementariedad casi perfecta con su mRNA objetivo (100%).
- Como resultado, el siRNA induce la degradación directa del mRNA mediante el complejo RISC
Inducen principalmente la degradación del mRNA de manera específica y rápida, gracias a su complementariedad perfecta con el mRNA objetivo
siRNA -> usados para silenciar genes específicos de forma intencional
