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Genho&Protheo > 2.2 RNA no codificantes > Flashcards

2.2 RNA no codificantes Flashcards

1
Q

Función de los RNAs

A

tienen info genética
síntesis de proteínas
maduración del ARN
regulan expresión de genes
ARN catalítico (ribozimas → splicing)

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2
Q

Diferencias entre ADN y ARN

A

Timinas cambian a uracilos en RNA
El azúcar del RNA es ribosa
Hélice simple (RNA)
RNA -> azúcar + base = nucleósido
Nucleósido + fosfato = nucleótido

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3
Q

Estructura secundaria del ARN

A

hairpins: 5 - 10 NT
stem loops: miles de NT

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4
Q

Estructura terciaria del ARN

A

pseudoknot: 2 stem 2 loops

stem - tallo / loops - bucles

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5
Q

Función de los RNA nucleares pequeños (snRNA)

A

Maduración de RNA primario (hnRNA)
-> proceso de splicing pre-RNA

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6
Q

Función de los ARN nucleolares (snoRNA)

A

precursores de los RNAr

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7
Q

Función de los ARN de Cajal (scaARN)

A

Modifican RNAs nucleares
snRNA y snoRNA

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8
Q

Función de los ARN de interferencia (RNAi)

y cuántos nt tiene

A

21 - 25 nt de RNA de doble cadena que causan el silenciamiento genético

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9
Q

Tipos de ARN de interferencia (iRNA)

A

→ siRNA
→ miRNA
→ piRNA

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10
Q

Función de RNA largos no codificantes (lncRNA)

y cuántos nt tiene

A

De más de 2000 nt, sirven de armazón, regulan diversos procesos como de la act genética y la heterocromatización del chr X

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11
Q

ARN’s que se encargan de la maduración del pre-RNA (splicing)

A

snRNA -> para splicing
- RNAs nucleares pequeños
- small nuclear

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12
Q

Características (3) de los snoRNA

A

Regulación epigenética
splicing
procesamiento de RNAr

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13
Q

XIST

A

para silenciamiento de chr. X

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14
Q

H19

A

para imprinting -> silencia o activación de genes

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15
Q

es un ARN no codificante que desempeña un papel clave en la inactivación del cromosoma X

A

XIST o transcrito específico X-inactivo

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16
Q

La proximidad entre el branch site y el splice acceptor site es de ___

A

20nt -> fundamental para el proceso de empalme del ARN, si estuvieran demasiado separados, el empalme sería menos eficiente o incluso no ocurriría

17
Q

Tipos de snRNA

A

U1, U2, U4, U5 y U6 -> involucrado en el proceso de splicing pre-RNA

18
Q

Caract. de los snRNA

A
  • Formado por 107-210 nt
  • Asociados con 6 a 10 proteínas que forman el small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs)
  • Presentes en el núcleo
19
Q

A dónde se une el U1 y U2 del snRNA

A

U1 → se une al 5’ del pre-RNA del intrón
U2 → se une al sitio de ramificación del intrón 1
(Ambos forman parte del spliceosoma)
-> Una vez pegados hacen loop, se van los intrones y por cargas se unen exones

20
Q

Caract. de los miRNA

A
  • Se conocen como RNA pequeños
  • 21 a 22nt
  • Regulan la traducción por medio de complementariedad de los bases transcritos
21
Q

Dos formas que podemos ver a los miRNA

A

Bicatenaria -> forma inactiva en doble cadena
Monocatenaria -> activa en cadena sencilla

22
Q

Función de un miRNA con un RNAm, en la traducción

A

miRNA se une al UTR’3 del ARNm (hibrida) bloqueando la deadenilación → bloquenado la traducción

23
Q

¿Quién sintetiza el miRNA?

y en dónde

A

RNA pol II en el núcleo

24
Q

¿Qué enzimas cortan al RNA en el núcleo para quitar cola de poliA y CAP del miRNA?

A

RNASEN o DROSHA (1er corte) en núcleo

25
Q

¿Cómo empieza la síntesis de miRNA?

A

En el núcleo la RNA polimerasa II transcribe el gen del miRNA como una molécula precursora conocida como pri-miRNA (estructura de horquilla) con cola poliA

26
Q

¿Qué ocurre después de la síntesis del pri-miRNA?

y hacia dónde se dirige

A

Drosha o RNASEN corta el pri-miRNA en el núcleo (quita CAP y poliA) para generar pre-miRNA.
-> Este pre-miRNA tiene unos 70nt y una estructura de horquilla bien definida.
- Y mediante una exportina-5 transporta el pre-miRNA al citoplasma.

27
Q

Una vez llega el pre-miRNA al citoplasma ¿Qué ocurre?

A

Dicer corta el pre-miRNA en ambos extremos, eliminando el lazo de la horquilla y generando una molécula de miRNA de doble hebra (miRNA-duplex)
-> Dicer produce un RNA de 21-23nt

28
Q

¿Qué ocurre después de que el complejo Dicer actuó?

A

Argonauta (AGO) en el complejo RISC selecciona la hebra guía o funcional del miRNA (para que permanezca) y degrada la hebra pasajera.
-> Elimina doble cadena y lo deja sencillo (monocatenario) para tener el miRNA maduro

29
Q

¿Qué ocurre dentro del complejo RISC?

A

El miRNA pasa de ser una molécula bicatenaria (doble hebra) a una monocatenaria (una sola hebra).
-> recordar que este complejo está formado por múltiples proteínas entre ellas Argonauta

30
Q

Función del miRNA maduro en el complejo RISC

A

El miRNA dentro del RISC guía la unión del complejo a secuencias complementarias en el RNAm -> volviéndolo bicatenario inacitvandolo
-> va a regular la expresión génica mediante la degradación o inhibición de la traducción del RNAm objetivo.

miRNA principalmente bloquea NO degrada

31
Q

¿Qué pasó en 1990 con los microRNAs?

A

Introducción de copias extras de un gen productor de pigmento
-> en vez de intensificarlo, lo silenció, y las plantas crecieron sin color xD

32
Q

¿Qué pasó en 1998 con los microRNAs?

A

Tenían como objetivo el silenciamiento de una prot. muscular específica. Se introdujeron RNA de cadena sencilla secuencia complementaria, RNA de doble cadena
-> Los dsRNA detenían la producción de la prot

33
Q

¿Qué es el fenómeno de interferencia RNA?

A

Destrucción de RNAm que contenían la misma secuencia del dsRNA

34
Q

Caract. de los siRNA

A

RNAs pequeños de interferencia
BIcatenarios de 21 a 25bp
- Ambos extremos 3´presentan extremos protuberantes, NO forma loop

35
Q

Origen de los miRNA y siRNA

A
  • miRNA codificado por genes endógenos en el genoma
  • siRNA son exógenos o introducidos en la célula por agentes externos como virus, transposones, o moléculas sintéticas diseñadas en el lab, tmbn puedne ser endógenos,
36
Q

¿Cómo es el procesamiento de los siRNA?

A

El siRNA se origina a partir de ARN bicatenario largo (dsRNA), que es directamente procesado por Dicer en el citoplasma sin la necesidad de una etapa de procesamiento nuclear (no involucra a Drosha como en los miRNA)
Dicer endonucleasa corta -> siRNA forma complejo -> AGO elimina cadena pasajera -> RISC y siRNA se unen a cadena blanco eliminándola

37
Q

Complementariedad con el mRNA objetivo (miRNA)

A

Los miRNA típicamente tienen una complementariedad parcial con su mRNA diana. Como resultado bloquean la traducción del mRNA en lugar de inducir su degradación

38
Q

Complementariedad con el mRNA objetivo (siRNA)

A
  • Los siRNA generalmente tienen una complementariedad casi perfecta con su mRNA objetivo (100%).
  • Como resultado, el siRNA induce la degradación directa del mRNA mediante el complejo RISC
39
Q

Inducen principalmente la degradación del mRNA de manera específica y rápida, gracias a su complementariedad perfecta con el mRNA objetivo

A

siRNA -> usados para silenciar genes específicos de forma intencional

Genho&Protheo (16 decks)

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