2.2 RNA no codificantes

Question 1

Función de los RNAs

Answer 1

tienen info genética
síntesis de proteínas
maduración del ARN
regulan expresión de genes
ARN catalítico (ribozimas → splicing)

Question 2

Diferencias entre ADN y ARN

Answer 2

Timinas cambian a uracilos en RNA
El azúcar del RNA es ribosa
Hélice simple (RNA)
RNA -> azúcar + base = nucleósido
Nucleósido + fosfato = nucleótido

Question 3

Estructura secundaria del ARN

Answer 3

hairpins: 5 - 10 NT
stem loops: miles de NT

Question 4

Estructura terciaria del ARN

Answer 4

pseudoknot: 2 stem 2 loops

stem - tallo / loops - bucles

Question 5

Función de los RNA nucleares pequeños (snRNA)

Answer 5

Maduración de RNA primario (hnRNA)
-> proceso de splicing pre-RNA

Question 6

Función de los ARN nucleolares (snoRNA)

Answer 6

precursores de los RNAr

Question 7

Función de los ARN de Cajal (scaARN)

Answer 7

Modifican RNAs nucleares
snRNA y snoRNA

Question 8

Función de los ARN de interferencia (RNAi)

y cuántos nt tiene

Answer 8

21 - 25 nt de RNA de doble cadena que causan el silenciamiento genético

Question 9

Tipos de ARN de interferencia (iRNA)

Answer 9

→ siRNA
→ miRNA
→ piRNA

Question 10

Función de RNA largos no codificantes (lncRNA)

y cuántos nt tiene

Answer 10

De más de 2000 nt, sirven de armazón, regulan diversos procesos como de la act genética y la heterocromatización del chr X

Question 11

ARN’s que se encargan de la maduración del pre-RNA (splicing)

Answer 11

snRNA -> para splicing
- RNAs nucleares pequeños
- small nuclear

Question 12

Características (3) de los snoRNA

Answer 12

Regulación epigenética
splicing
procesamiento de RNAr

Question 13

XIST

Answer 13

para silenciamiento de chr. X

Question 14

H19

Answer 14

para imprinting -> silencia o activación de genes

Question 15

es un ARN no codificante que desempeña un papel clave en la inactivación del cromosoma X

Answer 15

XIST o transcrito específico X-inactivo

Question 16

La proximidad entre el branch site y el splice acceptor site es de ___

Answer 16

20nt -> fundamental para el proceso de empalme del ARN, si estuvieran demasiado separados, el empalme sería menos eficiente o incluso no ocurriría

Question 17

Tipos de snRNA

Answer 17

U1, U2, U4, U5 y U6 -> involucrado en el proceso de splicing pre-RNA

Question 18

Caract. de los snRNA

Answer 18

• Formado por 107-210 nt
• Asociados con 6 a 10 proteínas que forman el small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs)
• Presentes en el núcleo

Question 19

A dónde se une el U1 y U2 del snRNA

Answer 19

U1 → se une al 5’ del pre-RNA del intrón
U2 → se une al sitio de ramificación del intrón 1
(Ambos forman parte del spliceosoma)
-> Una vez pegados hacen loop, se van los intrones y por cargas se unen exones

Question 20

Caract. de los miRNA

Answer 20

• Se conocen como RNA pequeños
• 21 a 22nt
• Regulan la traducción por medio de complementariedad de los bases transcritos

Question 21

Dos formas que podemos ver a los miRNA

Answer 21

Bicatenaria -> forma inactiva en doble cadena
Monocatenaria -> activa en cadena sencilla

Question 22

Función de un miRNA con un RNAm, en la traducción

Answer 22

miRNA se une al UTR’3 del ARNm (hibrida) bloqueando la deadenilación → bloquenado la traducción

Question 23

¿Quién sintetiza el miRNA?

y en dónde

Answer 23

RNA pol II en el núcleo

Question 24

¿Qué enzimas cortan al RNA en el núcleo para quitar cola de poliA y CAP del miRNA?

Answer 24

RNASEN o DROSHA (1er corte) en núcleo

Question 25

¿Cómo empieza la síntesis de miRNA?

Answer 25

En el núcleo la RNA polimerasa II transcribe el gen del miRNA como una molécula precursora conocida como pri-miRNA (estructura de horquilla) con cola poliA

Question 26

¿Qué ocurre después de la síntesis del pri-miRNA? | y hacia dónde se dirige

Answer 26

Drosha o RNASEN corta el pri-miRNA en el núcleo (quita CAP y poliA) para generar pre-miRNA. -> Este pre-miRNA tiene unos 70nt y una estructura de horquilla bien definida. - Y mediante una exportina-5 transporta **el pre-miRNA al citoplasma.**

Question 27

Una vez llega el pre-miRNA al citoplasma ¿Qué ocurre?

Answer 27

Dicer corta el pre-miRNA en ambos extremos, eliminando el lazo de la horquilla y generando una molécula de miRNA de doble hebra **(miRNA-duplex)** -> Dicer produce un RNA de 21-23nt

Question 28

¿Qué ocurre después de que el complejo Dicer actuó?

Answer 28

Argonauta (AGO) en el complejo RISC selecciona la hebra guía o funcional del miRNA (para que permanezca) y degrada la hebra pasajera. -> Elimina doble cadena y lo deja sencillo (monocatenario) para tener el miRNA maduro

Question 29

¿Qué ocurre dentro del complejo RISC?

Answer 29

El miRNA pasa de ser una molécula bicatenaria (doble hebra) a una monocatenaria (una sola hebra). -> recordar que este complejo está formado por múltiples proteínas entre ellas Argonauta

Question 30

Función del miRNA maduro en el complejo RISC

Answer 30

El miRNA dentro del RISC guía la unión del complejo a secuencias complementarias en el RNAm -> volviéndolo bicatenario inactivándolo -> va a regular la expresión génica mediante la degradación o inhibición de la traducción del RNAm objetivo. | miRNA principalmente bloquea NO degrada

Question 31

¿Qué pasó en 1990 con los microRNAs?

Answer 31

Introducción de copias extras de un gen productor de pigmento -> en vez de intensificarlo, lo silenció, y las plantas crecieron sin color xD

Question 32

¿Qué pasó en 1998 con los microRNAs?

Answer 32

Tenían como objetivo el silenciamiento de una prot. muscular específica. Se introdujeron RNA de cadena sencilla secuencia complementaria, RNA de doble cadena -> Los dsRNA detenían la producción de la prot

Question 33

¿Qué es el fenómeno de interferencia RNA?

Answer 33

Destrucción de RNAm que contenían la misma secuencia del dsRNA

Question 34

Caract. de los siRNA

Answer 34

RNAs pequeños de interferencia BIcatenarios de 21 a 25bp - Ambos extremos 3´presentan extremos protuberantes, NO forma loop

Question 35

Origen de los miRNA y siRNA

Answer 35

- miRNA codificado por genes endógenos en el genoma - siRNA son exógenos o introducidos en la célula por agentes externos como virus, transposones, o moléculas sintéticas diseñadas en el lab, tmbn puedne ser endógenos,

Question 36

¿Cómo es el procesamiento de los siRNA?

Answer 36

El siRNA se origina a partir de ARN bicatenario largo (dsRNA), que es directamente procesado por Dicer en el citoplasma sin la necesidad de una etapa de procesamiento nuclear (no involucra a Drosha como en los miRNA) Dicer endonucleasa corta -> siRNA forma complejo -> AGO elimina cadena pasajera -> RISC y siRNA se unen a cadena blanco eliminándola

Question 37

Complementariedad con el mRNA objetivo (miRNA)

Answer 37

Los miRNA típicamente tienen una complementariedad parcial con su mRNA diana. Como resultado bloquean la traducción del mRNA en lugar de inducir su degradación

Question 38

Complementariedad con el mRNA objetivo (siRNA)

Answer 38

- Los siRNA generalmente tienen una complementariedad casi perfecta con su mRNA objetivo (100%). - Como resultado, el siRNA induce la degradación directa del mRNA mediante el complejo RISC

Question 39

Inducen principalmente la degradación del mRNA de manera específica y rápida, gracias a su complementariedad perfecta con el mRNA objetivo

Answer 39

siRNA -> usados para silenciar genes específicos de forma intencional