1.1- microbio-microbiote Flashcards
nommer les deux grandes étapes historiques lié à la recherche sur le microbiote
1-HUMAN GENOME PROJECT;
- projet international de 13 ans (1990 à 2033) afin de faire un séquençage du génome humain (soit 3 milliards de nucléotides)
2-HUMAN MICROBIOME PROJECT;
- analyse de la composition génétique de la population microbienne qui vit sur et dans les adultes en santé (microbiome)
quel est le ratio bactéries: cellules humaines ?
10:1
Quel est le point de départ du microbiote
▪ Début : Le fétus vit dans un milieu stérile ventre de la mère
▪ À la naissance, le bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère : c’est le début de la colonisation de sa peau et de son système digestif par une «flore normale»
▪ Dans les années qui suivent la naissance, l’enfant entre également en contact avec d’autres personnes et des bactéries de son environnement.
qu’est ce que le micro biote et où se situent-ils? Q’est ce qu’un microbiome?
- ensemble des micro organismes qui résident sur un site donné; la peau, les narines, le tractus génito-urinaire, le tractus digestif
- microbiome est l’ensemble des microorganismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné (donc juste un microbiote + des gènes)
qu’est ce que le microbiome central? + ou - varié que microbiome secondaire ?
- espèces bactériennes présentes chez plus que 95% des personnes humaines à un site donné
- représente la majorité des bactéries présentes à un site donné
- Moins varié que le microbiome secondaire
qu’est ce que le microbiome secondaire?
- espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
- Grande variété d’espèces
- chaque espèce est en plus petite quantité comparativement au microbiome central
quel type de microbiome est le plus différencié/varié?
le secondaire!!
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau de la peau, donc présent dans le microbiome central?
- staphylococcus epidermis
- coryne bacterium
- propionibacterium
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau de la bouche?
- streptococcus
- neisseria
- corynnebacterium
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau du côlon?
- escherichia coli
- enterococcus
- bacteroides
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau du vagin?
- lactobacillus
le microbiote de la peau est influencé par quoi?
- par la présence ou non de glandes sébacées et de l’humidité
- varie selon le sexe
- microbiote cutané varie selon le site
ou il y a le plus de microorganismes?
au niveau du colon
*10^11
mettre en ordre de grandeur la quantité de microorganisme selon le site;
salive
estomac
intestin grêle
côlon
- estomac (10^3)
- intestin grêle (10^4)
- salive (10^9)
- côlon (10^11)
Le microbiote du tractus digestif représente quoi? La diversité et la quantité de bactéries varient selon quoi? Combien de batéries et d’espèces
- Système ouvert de la bouche à l’anus
- La diversité et la quantité de bactéries varient selon le segment du tube digestif.
- 10^14 bactéries : 100,000,000,000,000
- (+) que 500 espèces (Dont la majorité sont non cultivables et Identifiées principalement par séquençage moléculaire)
Comment le microbiote sain variet-il?
Microbiote varie grandement:
* D’une personne à l’autre
* D’une région géographique à l’autre
* En fonction de l’âge
différence entre un accouchement vaginal et par une césarienne
vaginal;
contact avec flore vaginal (lactobacillus, prevotella spp.) et dermale également (staphylococcus, corynebacterium, propionibacterium)
césarienne;
contact avec flore dermale seulement (staphylococcus, corynebacterium, propionibacterium)
=plus à risque de développer certaines pathogènes
décrire microbiote à l’enfance
Enfant entre en contact avec autres personnes et bactéries de son environnement
- Rapide développement de la diversité de la flore et du microbiote
- plus instable = change selon diète et maladies
décrie le microbiote à l’âge adulte
- Un microbiote très différencié et disctinct
- Change plus lentement qu’à l’enfance/ se stabilise
décrire microbiote à âge avancé
- Microbiote très différent des jeunes adultes!
- La flore se diversifie et devient de plus en plus unique au long de la vie
nommer les fonctions du microbiote intestinal
1) fonctions métaboliques
2) stimule l’immunité innée
3) prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
le microbiote métabolise certains nutriments afin de…
afin de les rendre plus facilement disponible pour les cellules hôtes!
- ex des grosses molécules d’hydrate de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes
donner le rôle des acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate
limitent la croissance de certaines bactéries indésirables
comment le microbiote est capable de protéger contre certaines infections entériques?
- en tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
- stimulant la production de mucine, d’immunoglobulines IgA et des peptides anti microbiens (AMPs)
- en stimulant la production IL-22 (augmente la résistance des cellules épithéliales) et IL- 1bêta (augmenter le recrutement de cellules inflammatoires)
- IL = interleukine
quels sont les facteurs externes influençant le microbiote?
- hygiène personnel (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale)
- diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non
- h20 (chlore ou eau des puits)
- prise d’antibiotique
que veut dire dysbiose?
altération de la flore normale
les dysbioses peuvent être associées à quoi?
- maladies du SI (atopie, asthme, sclérose en plaque)
- maladie intestinale (maladie inflammatoire de l’intestin, entérocolite nécrosante du nouveau né)
- maladie métabolique (diabète, obésité)
la symbiose du microbiote amène…
- une tolérance immune
- homéostasie intestinale
- métabolisme sain
la dysbiose peut entraîner quel type de maladies sans trop de précision?
- Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
- Colite ulcéreuse
- maladies cœliaque (entéropathie au gluten)
- vaginite à candida
- obésité (bactéries intestinales efficace à transformer des gros hydrates de carbones en petites molécules facilement absorbables)
À quoi est dûe la Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD) ?
- prise d’antibiotique → altération de la flore normale du côlon → prolifération du C. difficile (pcq manque de compétition alimentaire) → C. difficile produit des toxines responsables de la diarrhée (DACD)
qu’est ce que la colite ulcéreuse? + maladie céliaque
Colite ulcéreuse
- prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit la sulfatase qui dégrade couche de mucine
- augmentation de Prevotellacea (produit des chemokines inductrices d’inflammation)
Maladie céliaque
- Entéropathie au gluten (entéro= intestin pathie=maladie)
qu’est-ce que la vaginite à candida?
- Normalement, la femme a de la levure dans son vagin (ARKKK), mais avec des bonne bactéries présentent ce qui permet une compétition normale. Si on enlève les bonne bactéries avec l’antibiotiques, il n’y a plus de compétition, donc les levures vont proliférer (DÉGEU)
est-ce que la manipulation du microbiome humain pourrait s’avérer positif?
OUI
- pour des fins thérapeutiques la manipulation du microbiome humain est un traitement prometteur pour certaines maladies comme la Clostridioides difficile (C.difficile) avec une efficacité entre 40-96% après une seule transplantation
qu’est-ce qu’un probiotique? Majorité sont quels types? et efficacité dépend de quoi?
- mélange de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin
- la majorité des probiotiques contiennent des bactéries gram+ comme les bifidobacterium et les lactbacillus et des levures comme les saccharomyces
- l’efficacité dépend:
- des microorganismes choisis,
- de la dose,
- de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité)
les probiotiques sont aussi efficaces que les médicaments?
non!
contrairement aux médicaments, moins bon contrôle sur la composition exacte et la concentration résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac
* très difficile d’évaluer leur paramètre pharmacologique
qu’est-ce que la pouchite?
inflammation du réservoir
*cette inflammation arrive suite à une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale (enlève le colon au complet; patient ont beaucoup de diarrhée car colon n’est plus la pour absorber l’eau!)
qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante? Affecte qui? Se manisfest par ? Cocktail de quoi pour le développer? Dysbiose ou symbiose et mortalité?
- maladie qui touche intestin
- enfant né prématurément (en bas de 37 semaines de grossesse)
- se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin
- prédispositon génétique , intestin immunoréactif et réponse inflammatoire immature
- dysbiose du tractus digestif?
- mortalité entre 20-30%
les probiotiques ont un rôle favorable pour?
traitement de la pouchite et prévention d’une entérocolite nécrosante chez les prématurés, mais ce ne sont pas les ATB en vente libre au supermarché
INESS ne recommande pas administration de probiotique pour…
- prévention ou traitement de la Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
- contre-indiqués chez les patients immunosupprimés
différence entre microbiote et microbiome
- microbiome; ensemble de microorganismes (bactéries, fungi,virus et eukaryotes) vivant sur ou dans un hôte, incluant le matériel génétique
- microbiote; microorganisme eux-mêmes
qu’est-ce qu’une transplantation fécale et ses méthodes?
transfert de microorganismes de la flore fécale d’un donneur sain à une personne malade
4 méthodes possibles; côlonoscopies, tube naso-gastrique, lavement intestinal ou ingestion de capsules
qu’est ce qu’un prébiotique?
produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes (qui prend naissance à l’intérieur) désirables
