1- Transcription COPY Flashcards
Que fait la réplication
ADN –> ADN.
Que fait la transcription
Transforme l’ADN en ARN
Que fait la Traduction
ARN –> Protéine.
Comment fonctionne l’ARN polymérase?
- Synthétise l’ARN de 5’ à 3’.
- Synthétise une copie complémentaire du brin matrice (qui lui est lu de 3’ à 5’).
- L’ARN a la séquence du brin d’ADN codant, mais avec des ribonucléotides au lieu de désoxyribonucléotides et des U au lieu de T.
Quelle est la structure de l’ARN
À cause des interactions entre les bases, elle a une structure secondaire (*avec pseudoknot) et tertiaire”
Différence entre le pentose de l’ARN et ADN.
ARN a un OH au C2
Différence entre uracile et thymine.
Uracile: CH
Thymine: CH3
Que sont les pseudoknot
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles dans la structure secondaire de l’ARN
Décrit l’action de l’ARN polymérase
- Déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase.
- Reformation de la double hélice en arrière de l’ARN polymérase.
- Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (hétéroduplex).
Caractéristiques des ARN polymérases
- Synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN.
- Transcrit de 5’ à 3’ (mais le brin matrice d’ADN est lu du 3’ –> 5’)
- PAS BESOIN D’AMORCE
- Transcription n’a pas à être aussi précise que la réplication puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit.
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides à son site actif.
Comment l’ARN polymérase sait où commencer ou terminer la transcription?
IL FAUT DES SÉQUENCES SUR L’ADN QUI SIGNALENT INITIATION ET TERMINAISON.
Séquences :
- Promoteur = initiation de la transcription.
- Terminateur = terminaison de la transcription.
De quoi a besoin la polymérase pour initier et terminer la transcription
Facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN.
Que fait le facteur sigma et qu’est-ce qu’un facteur?
- Chez les procaryotes, Sigma s’associe à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription avant de se lier au promoteur.
- Sigma est un facteur (protéine) nécessaire à l’initiation de la transcription qui permet la sélection du promoteur du gène à transcrire.
- Il y a plusieurs facteur sigma chez les procaryotes
- Un facteur est une protéine nécessaire pour un processus quelconque
Où est recrutée et relachée l’ARN polymérase?
Recrutée: Promoteur, avec le facteur sigma.
Relâchée: Signal de stop, il y a arrêt de la transcription.
Quand est relaché le facteur sigma
10 nucléotides après l’initiation de la transcription.
Qu’est-ce que la séquence consensus ou canonique?
SÉQUENCE CONSENSUS OU SÉQUENCE CANONIQUE
- Ordre calculé des nucléotides (acide nucléique) ou aa (protéines) le plus fréquent trouvés à chaque position dans un alignement de séquences donné.
- Représente les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres.
- Des pourcentages des motifs (séquence qui a une structure spécifique) de séquences similaires sont ainsi calculés pour chaque position.
Que reconnaissent les facteurs sigma?
- Une paire de courts motifs (séquences) conservés: appelés boites -10 et -35 à cause de leur distance du site d’initiation de la transcription
- La position de cette séquence consensus (canonique) dicte le brin à utiliser ainsi que le sens de la transcription.
Chez les procaryotes, sigma est un facteur qui permet la sélection du promoteur du gène à transcrire. Sigma va s’associer à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription avant de se lier au promoteur.
Qu’est-ce que la séquence consensus des promoteurs?
- Séquence idéale obtenue par analyse statistique des fréquences des bases à chaque position.
Qu’est-ce qu’un promoteur fort
- Plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus (idéale) —-»» plus grande sera l’affinité du facteur sigma ——-»> et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la transcription.
Si l’efficacité d’initiation de la transcription est plus grande, le promoteur est aussi plus fort.
Quelle séquence représente le point de repère de l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription pour les procaryotes?
- La séquence TATAAT (-10)
- Soit, située environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.