1. Structure des acides aminés Flashcards

1
Q

Unités de base formant les protéines

A

Acides aminés

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Q

A quelle formule chimique générale correspond la structure des a.a

A

Carbone alpha, fonction acide (COOH) + fonction amine (NH2) + chaîne latérale (groupe R) + H

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3
Q

V ou f, le pH n’affecte pas le degré d’ionisation des acides aminés

A

Faux, les protons peuvent être relâchés et accommodés au sein de la protéine en fonction du pH.

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4
Q

Groupement fonctionnel autour du carbone alpha qui varie

A

Chaîne latérale (groupe R)

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5
Q

Les a.a sont ______ : elles ont un caractère basique par leur groupement amine et acide par leur groupement carboxyle

A

Amphoterique

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6
Q

Étant donne que le carbone alpha est asymétrique, on dit de lui qu’il est un centre

A

Chiral

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7
Q

Dans les proteines, on retrouve seulement les a.a de quelle forme chirale?

A

Forme L (sens des aiguilles d’une montre selon CORN)

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8
Q

Nombre de différents acides aminés

A

20

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9
Q

Les propriétés des acides aminés sont déterminées par quel groupement fonctionnel

A

Chaîne latérale R

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10
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale hydrophobe (non polaire)

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11
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale polaire (non chargée)

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12
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale hydrophobe (non polaire)

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13
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale polaire (non chargée)

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14
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale polaire basique (+)

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15
Q

Identifies les a.a et leur type de chaîne latérale

A

Chaîne latérale polaire acide (-)

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16
Q

Point commun entre l’acide aspartique et l’acide glutamique concernant un de leur groupement qui leur donne leur nom

A

Contiennent un groupement carboxylique

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17
Q

Trouve le type d’acide aminé : non polaire, interaction faible ou nulle avec l’eau

A

Hydrophobes

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18
Q

2 caractéristiques particulières concernant la structure des acides aminés hydrophobes (nous permet de les reconnaitre)

A

Cycles aromatiques et chaînes d’hydrocarbures

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19
Q

Les chaînes latérales hydrophobes formant la structure de la protéine sont vers l’intérieur. Pourquoi?

A

Minimiser l’interaction avec le solvant

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20
Q

Trouve le type d’a.a : interaction des groupements fonctionnels avec l’eau

A

A.a polaires non chargées et chargés

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21
Q

Type d’a.a pouvant également se retrouver à l’intérieur dans la structure d’une protéine, mais si des ponts H sont possibles

A

Acides amines polaires (chargés et non chargés)

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22
Q

Acide aminé ayant H comme chaîne latérale, pas particulièrement hydrophobe ni polaire

A

Glycine

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23
Q

Type d’a.a : leur groupement sont, dans la plupart des cas, non ionisables et ne participent pas aux réactions chimiques

A

Acides aminés hydrophobes

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24
Q

Nom du groupement de l’histidine qui peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH

A

Groupement imidazole

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25
Q

Autour d’un pH physiologique (7,2), on retrouve une mixture d’histidine ionisée et non ionisée sur l’azote de la chaîne latérale, dans quels types pouvons-nous classer cet a.a ?

A

Polaire chargée et polaire non chargée

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26
Q

Petit, seul a.a non chiral

A

Glycine

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27
Q

V ou f, glycine = hydrophobe

A

Faux, non hydrophobe

28
Q

V ou f, glycine = non-charge

A

Vrai

29
Q

Dans quel type d’a.a pouvons nous mettre la glycine

A

A.a polaire ou hydrophobe

30
Q

A.a qui possède la plus petite chaîne latérale, le carbone alpha ne possède pas 4 groupements différents autour de lui

A

Glycine

31
Q

Type d’a.a : chaîne latérale = chargée a pH physiologique, les a.a forment des contacts avec le solvant

A

A.a polaires chargés

32
Q

Nomme les 2 a.a polaires chargés (-) ACIDES

A

Aspartate et glutamate

33
Q

Nomme les 2 a.a polaires chargés (+) BASIQUES

A

Lysine et arginine

34
Q

Point d’inflexion de la courbe de titrage du groupe ionisable

A

PKa

35
Q

Lorsqu’on réalise un titrage, on débute avec une solution acide ou basique

A

Acide (pH faible - beaucoup de H + - se rapproche de 0)

36
Q

Quelle est l’équation d’Hendersson-Hasselbalch

A

Le pH = pKa + log ([base conjuguée] / [acide] )

37
Q

Terme : pH où l’a.a est électriquement neutre (autant de charges positives que négatives)

A

Point isoélectrique (zwitterion)

38
Q

Formule pour trouver le point isoélectrique si 2 fonctions ionisables

A

Le pI = (pKa1 + pKa2) / 2

39
Q

Formule pour trouver le point isoélectrique si diacide

A

Le pI = (pKa 1 + pKa 2) / 2

40
Q

Formule pour trouver le point isoélectrique si dibasique

A

Le pI = (pKa 2 + pKa 3) / 2

41
Q

Chaque a.a contient au moins combien de groupements ionisables

A

Au moins 2 groupements

42
Q

Quel groupement fonctionnel a une plus faible affinité pour son propre proton? Relâche un proton plus facilement en solution (titrage)

A

Groupement carboxyle

43
Q

Qu’est ce qui varie entre les a.a?

A

La structure de la chaîne latérale (R)

44
Q

V ou f, le nombre de pKa correspond au nombre de groupements ionisables

A

V

45
Q

Quel est le premier groupe ionisable pour tous les a.a

A

Carboxyle !!! (Son pKa est autour de 2 pour tous les 20 a.a)

46
Q

Comment nomme-t-on un cycle avec 2 groupements azotes (histidine)

A

Imidazole

47
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : cysteine

A

8,4

48
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Tyrosine

A

10,5

49
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Acide aspartique

A

3,9

50
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Acide glutamique

A

4,1

51
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Lysine

A

10,5

52
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Arginine

A

12

53
Q

Trouve le pKa de la chaîne latérale de : Histidine

A

6

54
Q

Quel est l’ordre d’ionisation pour les deux acides ?

A

1) carboxyle 2) chaîne latérale 3) amine

55
Q

Quel est l’ordre d’ionisation pour les deux basiques polaires ? (Lysine et arginine)

A

1) carboxyle 2) amine 3) chaîne latérale R

56
Q

Par quel lien les a.a sont-ils liés entre eux dans une proteine

A

Lien covalent

57
Q

Comment former un dipeptide ?

A

Condensation de 2 a.a (carboxyle devient un carbonyle et vient se lier au N de l’amine)

58
Q

Courte chaîne d’a.a (<50)

A

Polypeptides

59
Q

Polypeptides longs ayant une structure tridimensionnelle définie

A

Protéines

60
Q

Comment appelle-t-on les a.a ayant perdus leur fonction acide et amine du a la formation du lien peptidique

A

Résidu

61
Q

La première extrémité d’un peptide est N ou C terminale ?

A

N terminale (débute par un NH3+), c’est la fin du peptide qui est C terminale (termine par COO-)

62
Q

Pour chaque position dans une chaîne d’a.a, il y a combien de possibilités

A

20

63
Q

Trouve le nombre de possibilités selon la longueur de l’acide aminé si c’est un dipeptide ?

A

20 possibles x 20 possibles = 400 possibilités

64
Q

Associe la description à la bonne structure de protéine : arrangement linéaire des a.a

A

Structure primaire

65
Q

Associe la description à la bonne structure de protéine : formations locales de structures 3D à plusieurs a.a

A

Structure secondaire

66
Q

Associe la description à la bonne structure de protéine : assemblage de plusieurs polypeptides entre eux pour former une protéine fonctionnelle (sous unités)

A

Structure quaternaire

67
Q
A