VL 18

Question 1

Art-Definition bei Bakterien und Archaeen

Answer 1

In einer Art, wenn

70-100% (Genetische DNA-DNA Ähnlichkeit)
Gesamt-Genom-Übereinstimmung
X 97-100% (16S RNA Ähnlichkeit)

Question 2

Bakterien-Einordnung

Answer 2

altes System:
fakultativ anaerobe Gram-negative Stäbchen

neues System: (nach 16S rRNA)

Domäne.        Bacteria
Phylum           Proteobacteria
Klasse            Gamma-Proteobacteria
Ordnung        Enterobacteriales
Familie           Enterobacteriaceae
Gattung          Escherichia
Art                  E. coli
Stamm            K12

Question 3

Wie ordnet man eine neue Art taxonomisch ein ?

Answer 3

1. 16S rRNA Analyse und chemische Systematik
2. DNA-DNA-Hybridisierung
3. Finger-Printmethode

Question 4

Phylogenetischer Organismenstammbaum

Answer 4

siehe Folie 13

Question 5

Rate der Neubeschreibung von bakteriellen Arten

Answer 5

aufgrund der neuen Methode, ist diese Rate enorm gestiegen. Es gibt aber auch viele Umgruppierungen

Es gibt aber ein Ungleichgewicht zwischen Sequenzierung und Kultivierung, von 118 Phyla gibt es 85 ohne bekanntes Isolat.

Question 6

Wichtige Hauptgruppen der Bactria

Answer 6

• Aquificae (Aquifex)
• Chloroflexi (Grüne Nichtschwefelbakterien)
• Bacteroidetes
• Planctomycetes
• Firmicutes (Gram-positive mit niedrigem GC-Gehalt)
• Proteobacteria
• Nitrospirae

Question 7

Aquificae

Answer 7

ein Phylum (Hauptgruppe)

• Tief verzweigte hyperthermophile Bakterien
• Wachstumsoptimum 85°C (Vermehrung bis 95°C)

• Obligat chemolithoautotroph (Elektronendonoren: H2, S, Thiosulfat
fakultativ mikroaerob: Sauerstoff oder Nitrat als Elektronenakzeptoren)

• Gattungen: Aquifex, Hydrogenobacter, u.a.
• Aquifex aeolicus: Genomgröße 1,55 Mbp
• CO2-Fixierung durch reduktiven Citratzyklus

Question 8

Planctomycetes

Answer 8

Aquatisch, fakultativ aerob, chemoorganotroph,
Atmung und/oder Gärung

Kein Peptidoglykan sondern Zellwand aus Protein —> Resistenz gegen Penicillin

Morphologische Besonderheiten: Proteinstiele, Knospenbildung, „Zellkern“

Question 9

Anammox-Bakterien

Answer 9

sind Planctomycetes

• Anaerobe Ammonium-Oxidation (chemolithoautotroph): NH4+ + NO2- —> N2 + 2 H2O

haben ein einzigartiges Zellorganell, Anammoxosom
Riboplasma und Paryphoplasma, diese bilden eine spezifische Membran.

Question 10

Anammoxosomen

Answer 10

haben keinen Kontakt zu anderen Membranen

besteht aus Ladderanlipiden

Question 11

Phylum Tenericutes, Ordnung Mycoplasmatales

Answer 11

Spezies Mycoplasma
• Ohne Zellwand
• Oft parasitär
• Oft humanpathogen
• Kleine Genome: 0,58 – 1,4 MbForschung zu „Minimalgenomen“