Virologisk Molekylär Diagnostik Flashcards

1
Q

Vad används i Traditionell virusdiagnostik?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad ingår i Polymerase Chain Reaction (PCR)

A

•Template DNA / (RNA)

  • Termostabilt DNA- polymeras
  • Primrar
  • dATP, dTTP, dCTP, dGTP
  • Buffert (MgCl2, KCl)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Herpes simplexvirus (HSV) 1&2 samt Varicella-zostervirus (VZV) kan orsaka?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Cytomegalovirus (CMV)

  • Orsakar?
  • kvantifiering?
  • Någon specifik grupp som kan drabbas hårt?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Epstein-Barrvirus (EBV)

  • Orsakar?
  • vad kan de orsaka hos immunsuppremerade
  • Kvantifiering?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hepatit C-virus (HCV)

  • Orsakar?
  • Före en behandling?
  • Hur kontrolleras behandlingseffekt?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hepatit B-virus (HBV)

  • Orsakar?
  • Kvantifiering?
  • Inför behandling?
  • Sekvensering görs för?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

HIV

  • När används kvantifiering
  • När används PCR
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nämn några luftvägsvirus, varför är de bra med diagnostik i dessa fall?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Gastroenterit

  • Virus?
  • Bakterier?
  • Protozoer?
  • Paneler?
  • vård?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Ge exempel på snabbtester och patientnära analyser inom den virologiska diagnostiken

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

HPV (humant papillomvirus)

  • Subtyper?
  • Screening
  • Cancer koppling?
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Tradi,onell PCR – svagheter?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Fördelar med realtids-PCR?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Taqman-probe (hydrolysprobe)?

  • När är fluorescensen låg?
  • probe binder till?
  • Bryts ned av? -> genererar
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

berätta om kvantifiering vid PCR

Vad relaterar CT-värdet till?

A
17
Q

Typing

  • När blir fluorescensen dålig?
  • När blir amplifieringen dålig?
  • När används typing?
A
18
Q

hur fungerar Digital PCR?

  • när är de rekomenderat att använda?
A
19
Q

när används sekvensering?

A
20
Q

Vad för genetiska skillnader kan ses vid virologisk molekylär diagnostik med PCR

A

• Muta,oner, mutanter

  • Genotyper, subtyper
  • Varianter
  • Kvasispecies

• Rekombina,on

21
Q

berätta om Kedjestoppssekvensering (Sangersekvensering)

A
22
Q

Sangersekvensering?

A

ddNTP

23
Q

Arbetsflöde i virusserologisk diagnostik?

A
24
Q

vad för begränsningar i virusserologisk diagnostik?

  • svagt/inget band alls i diagram?
  • Brus i diagram?
A
25
Q

Resistensmutationer vad gäller läkemedel:

  • HIV
  • HBV
  • HCV
  • CMV
A
26
Q

Selektion påverkas av ? i virusserologisk diagnostik ?

A
27
Q

Fylogeni används för att?

  • rotat träd
  • orotat träd
A
28
Q

MPS/NGS?

Hur ser förloppet ut?

Hur kan position i reads bedömas?

A