MALDI TOF Flashcards
Artbestämning inom bakteriologi görs med?
- Biokemi/odlingsbaserade
- Genetiska; PCR, sekvensering (Sanger/NGS)
- Fettsyra-profil, SDS-page (protein-profil), MALDI TOF MS
MALDI-TOF MS =
Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization -Time Of Flight Mass Spectrometry
Användningsområde rutindiagnostik för MALDI-TOF MS i mikrobiologi?
Artbestämning av framodlade mikroorganismer (genus/art)
– Bakterier
– Jästsvamp
– Mögelsvamp
Med olika typ av matrix kan du detektera olika saker. Vad kan du detektera med följande matrix:
MALDI-TOF MS
- Vad detekteras?
- Vilka proteiner detekteras?
- Vad bestämer signalintensiteten?
Berätta om ribosomen i bakterier
MALDI-TOF MS för artidentifiering är bra för att?
Två IVD-system på marknaden, vadb heter dem
Vad säger de olika färgerna dig?
Svårigheter med MALDI TOF ms
- Närbesläktade arter (databas otillräcklig? Eller omöjligt?)
- Nya arter
- Bakterier med kapsel, Mögel, vissa Gram-pos => mer svårpreppade
- Skillnader pga odlingsmedium /ursprung Framodlade bakterier krävs idag för optimal analys
Ge exempel på användningsområden inom mikrobiologi för MALDI TOF
- Artbestämning direkt från urin/blododling
- Typning under artnivå, epidemiologisk typning ex. Clostidrium difficile
- Antibiotikaresistens-bestämning
Beskriv stegen i MALDI TOF
vad är överstruket