Transcription (régulation de l'expression génique) - Dr. Rokeach (par: Elizabeth Romero) Flashcards
Est-ce que tous les gènes sont transcrits (exprimés) avec la même efficacité (procaryotes et eucaryotes)?
non
Le taux de transcription détermine quoi?
le niveau de ARNm et donc aussi de combien de protéine sera synthétisée
L’efficacité de la transcription est déterminée par quoi?
la séquence du promoteur et les facteurs de
transcription qui s’y attachent
CONCEPT À RETENIR: Le taux de transcription (niveau d’expression) d’un gène est régulé au niveau de l’initiation ou de la terminaison?
initiation
L’efficacité de transcription détermine quoi et a donc un impact sur quoi?
détermine la quantité d’ARN produit et
a donc un impact sur la quantité de protéine traduite
L’initiation de la transcription est contrôlée par quoi?
des facteurs protéiques
qu’est-ce qui permet l’expression d’un gène au « bon moment », selon les besoins de la cellule?
Il existe des régions de contrôle spécifiques de la transcription sur l’ADN en amont du promoteur
La régulation la transcription se fait par quoi? qui font quoi?
par liaison de facteurs protéiques qui inhibent ou
stimulent la transcription, favorisant ou pas l’assemblage de l’ARN polymérase et des protéines
de transcription au niveau du promoteur
les régions de contrôle spécifiques de la transcription sur l’ADN en amont du promoteur sont reconnues par des protéines spécifiques qui s’y lient. Cela entraîne quoi? résultant en quoi?
entraîne un changement de conformation de ces complexes et de l’ADN résultant en activation ou inhibition de la transcription
les protéines spécifiques qui reconnaissent et se lient aux régions de contrôle spécifiques de la transcription sur l’ADN en amont du promoteur peuvent recruter quoi?
des facteurs généraux de la transcription et l’ARN polymérase et aussi attirer des complexes du remodelage de la chromatine
Certaines protéines (protéines activatrices) stimulent la transcription et se lient à quelle séquence?
enhancer
la séquence enhancer peut se trouver où?
à des milliers de paires de bases du site d’initiation de la transcription
Les facteurs de transcription comprennent quels 2 domaines?
- domaine de liaison à l’ADN (DBD: DNA Binding Domain)
- domaine d’activation (TAD; protéine d’activation)
ou un domaine de répression (protéine de répression)
À part le domaine de liaison à l’ADN et le domaine d’activation/de répression, les facteurs de transcription peuvent contenir quel 3e domaine? exemple?
domaine de réponse à un signal (SSD)
Ex: domaine de liaison à une
hormone stéroïdienne
Certaines protéines se liant aux séquences de régulation sont des activateurs de la transcription, ils font quoi? les répresseurs font quoi?
- activateurs: facilitent l’assemblage des facteurs généraux de transcription et de la polymérase sur le promoteur
- répresseurs: font l’inverse
C’est quoi la définition d’un facteur de transcription?
Protéine qui lie l’ADN et influence la transcription positivement ou négativement
que représente cette image?
Mobilisation du récepteur glucocorticoïde (GR) du cytoplasme (a) au noyau (b) par l’addition de la dexaméthasone
Décrivez en détail les étapes de la régulation de la transcription par les hormones glucocorticoïdes
- Les hormones glucocorticoïdes, produites en situation de stress, entrent dans la cellule et se lient à son récepteur (qui subit un changement de conformation nécessaire à sa fixation à l’ADN)
- La conformation du récepteur une fois lié à l‘hormone permet la reconnaissance de sa séquence cible sur l’ADN (en amont du gène de l’enzyme hydrolysant le glycogène) ce qui lui permet de se lier au complexe d’initiation
- Cela enclenche la transcription
- la protéine qui en résulte mène à la réponse à l’organisme
- Si la cellule ne reçoit plus de glucocorticoïdes, la réponse cesse et les complexes d’initiation se défont
- Le glycogène cesse alors d’être hydrolysé en glucose
Dans l’exemple illustré, que se passe-til?
le récepteur des glucocorticoïdes activent fortement l’expression de plusieurs gènes en se combinant
avec plusieurs autres facteurs de transcription qui diffèrent selon le gène
Quelle est la 1ère étape de l’activation de la transcription grâce aux facteurs protéiques?
soit:
- ouverture de la chromatine (par HAT)
- remodellage de la chromatine pour accessibilité du promoteur (par complexe de remodellage de la chromatine)
Quelle est la 2e étape de l’activation de la transcription par les facteurs protéiques?
Recrutement des facteurs généraux de la
transcription + ARN polymérase
Quelles sont les 3 types de répression de la transcription par les facteurs protéiques?
1) Compétition entre un activateur et un répresseur
de la transcription pour une même séquence
régulatrice
2) Masquage d’un domaine d’activation
(du facteur de transcription activateur par le
facteur de transcription répressif)
3) Interaction directe ou indirecte possible
entre le facteur répresseur de transcription et
les facteurs généraux de transcription
Ces facteurs qui contrôlent l’initiation de la transcription agissent le plus souvent en quoi? qui s’associent à quoi et où?
en complexes protéiques qui s’associent aux
régions régulatrices du gène à proximité ou à distance du site d’initiation
qu’est-ce qui détermine l’efficacité (vitesse) d’initiation de la transcription (qui varie d’un gène à l’autre)?
Les facteurs de transcription qui se lient à l’ADN et complexes protéiques qui se lient à ces facteurs
