Transcription - Dr. Rokeach (par: Elizabeth Romero) Flashcards
c’est quoi le flux de l’information génétique?
la transcription génère quoi? qui est synthétisé par quoi?
génère un polymère de ribonucléotides
qui est synthétisé par une ARN polymérase
l’ARN polymérase synthétise dans quelle direction?
5’—>3’
l’ARN est synthétisé sur quel brin, et ce dernier est lu dans quelle direction?
sur le brin matrice qui est lu de 3’ à 5’
l’ARN transcrit à partir du brin matrice est complémentaire ou identique à celui-ci?
complémentaire (l’ARNt est identique au brin codant)
L’ARN transcrit est la même séquence que quel brin? mais quelle est la différence avec celui-ci?
séquence du brin d’ADN codant mais avec des ribonucléotides au lieu de désoxyribonucléotides, et de U au lieu de T
c’est quoi la différence entre la structure de l’ARN vs la structure de l’ADN?
qu’est-ce qui fait que l’ARN a une structure secondaire et tertiaire?
l’interaction entre ses bases
quel est l’élément particulier de structure secondaire de l’ARN?
correction: la structure tertiaire****
pseudoknot (quand 2 boucles se rencontrent
à part le pseudoknot, qu’est-ce qui permet de tenir ensemble la structure secondaire et tertiaire de l’ARN?
appariement de bases par des ponts H
la transcription se fait grâce à quelle protéine?
ARN polymérase
Comment se fait le déroulement de l’ADN lors de la transcription?
déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN et au fur et à mesure que
l’ARN polymérase se déplace reformation de la double hélice en arrière
c’est quoi un hétéroduplex?
courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (~9 nuc.)
c’est quoi les 4 caractéristiques des ARN polymérases?
- L’ARN polymérase synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
- Transcrit de 5’ à 3’ (brin matrice de l’ADN doit être lu de 3’ à 5’)
- Ne nécessite pas d’amorce
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
Pourquoi l’ARN polymérase n’a pas besoin d’amorce?
peut être dû au fait que la transcription n’a pas à être aussi précise que la réplication d’ADN puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit
Les cellules eucaryotes utilisent combien d’ARN polymérases
3
V ou F, les ARN polymérases des eucaryotes produisent 1 seul type d’ARN
FAUX, ils produisent plusieurs types d’ARN
quels sont les 4 types d’ARN des cellules eucaryotes?
- ARNm
- ARNr
- ARNt
- petits ARN
à quoi servent les ARNm**?
codent pour des protéines: ARNnc ARN non-codants (miRNA, lncRNA)
quelle ARN polymérase synthétise les ARNm**?
ARN polymérase II
à quoi servent les ARNr**?
composent les ribosomes
quelle ARN polymérase compose les ARNr**?
ARN polymérase I
à quoi servent les ARNt**?
servent d’adaptateurs lors de la synthèse protéique
quelle ARN polymérase synthétise les ARNt**?
ARN polymérase III
les petits ARN servent à quoi?
sont utilisés dans différents processus cellulaires (snRNA, snoRNA)
quelle est l’ARN polymérase qui synthétise les petits ARN?
ARN polymérase III
La polymérase nécessite quoi pour initier et terminer la transcription
des facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN
où commence et où termine la transcription?
commence au promoteur et se termine au terminateur
c’est quoi le promoteur?
signal d’initiation de la transcription
c’est quoi le terminateur
Signal de terminaison de la transcription
et site de terminaison
quel est le facteur qui va sélectionner le promoteur du gène à transcrire chez les procaryotes pour initier la transcription?
facteur σ (sigma)
le facteur σ s’associe à quoi chez les procaryotes? pour former quoi?
à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
décrivez de manière brève les 3 étapes de la transcription procaryote
- INITIATION: Les facteurs sigma (σ) chez les procaryotes s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription et L’ARN polymérase est recrutée au niveau du promoteur
-
ÉLONGATION: Le facteur sigma (σ) est relâché
quelques 10 nucléotides après initiation de la transcription et donc l’ARN polymérase fait la synthèse - TERMINAISON: L’ARN polymérase est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de stop (arrêt de la transcription)
sur cette image, que représentent les chiffres? en comptant à partir de quoi?
les positions des nucléotides en comptant à partir du premier nucléotide transcrit
le premier nucléotide transcrit est désigné par quelle numérotation?
+1
L’asymétrie du promoteur (par exemple le fait que la séquence conservée à -35 est située en amont de la séquence à -10) sert à quoi?
oriente la polymérase et détermine la direction de la transcription
c’est quoi une séquence consensus?
c’est la séquence idéale: c’est ce qu’on retrouve pour la plupart dans chaque position de promoteur
comment appelle-t-on les courts motifs espacés colorés en vert sur la photo?
boîtes -10 et -35
décrivez les 7 étapes de la transcription procaryote + en détail
1) Le facteur sigma s’associe à l’ARN
polymérase avant la transcription. Ce complexe
ira se fixer sur le promoteur.
2) Le contact de l’ARN polymérase avec le
promoteur entraîne l’ouverture locale de la double
hélice d’ADN -> bulle de transcription.
3) Initiation de la synthèse d’ARN à 50
ribonucléotides/seconde.
4-5) Relâchement du facteur sigma après la
synthèse d’une chaîne de ± 10 ribonucléotides
ET Élongation
6) Rencontre du signal de terminaison : il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux(intramoléculaires).
Lorsque l’ARN se met sous cette forme, cela indique à l’ARN polymérase qu’elle doit être relâchée
7) L’ARN polymérase se détache, libérant l’ARN.
où se trouve le signal de terminaison de la
transcription encodée par l’ADN d’un procaryote?
À l’extrémité 3’ de l’ARN néo-synthétisée
La séquence d’ARN transcrite du signal de terminaison permet la formation de quoi?
d’une tige-boucle (hairpin, épingle à cheveux)
c’est quoi la nature du signal de terminaison chez les procaryotes?
La séquence en tige-boucle riche en G-C suivi d’une série de U cause la terminaison de la transcription chez les procaryotes
lequel est + complexe: le promoteur eucaryote ou procaryote?
le promoteur eucaryote est beaucoup + complexe
qu’est-ce qui sert sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes?
La boîte TATA située environ 25 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription
c’est d’abord quoi qui s’associent à l’ADN du promoteur chez les eucaryotes et cela permet quoi?
les facteurs de transcription généraux s’associent à l’ADN du promoteur (et non le complexe d’initiation au complet dès le départ, contrairement aux procaryotes), ce qui permet à l’ARN
polymérase II de se lier
quelle est la toute première étape de la transcription chez les eucaryotes?
Reconnaissance de la boite TATA (-25 ) par TFIID
(complexe composé de TBP, TATA Binding Protein)
que se passe-t-il lors de la transcription eucaryote après reconnaissance de la boite TATA (-25 ) par TFIID?
Recrutement de TFIIB par TFIID lié à l’ADN
que se passe-t-il lors de la transcription eucaryote après recrutement de TFIIB par TFIID lié à l’ADN?
Recrutement de l’ARN polymérase II + de facteurs généraux de transcription (TFIIF, TFIIE, TFIIH) et ils forment le complexe d’initiation de la transcription
Ils sont recrutés sur l’ADN et favorisent ouverture de l’ADN pour permettre la transcription
que se passe-t-il lors de la transcription eucaryote après la formation du complexe d’initiation de la transcription? cela favorise quoi?
Phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase par la kinase TFIIH, ce qui favorise le désengagement de la polymérase des protéines du complexe d’initiation, cela donne le signal de départ
que se passe-t-il lors de la transcription eucaryote après phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase
par la kinase TFIIH? cela annonce quoi?
L’action de TFIIH entraîne une séparation des deux
brins de l’ADN (c’est une ouverture locale) et une
phosphorylation d’une partie de l’ARN
polymérase.
Cela annonce à l’ARN polymérase que
tout est en place pour commencer la transcription
Cette phosphorylation de l’ARN polymérase II (lors de la transcription chez les eucaryotes) entraîne la libération de quoi? qu’est-ce qui n’est pas libéré?
des autres facteurs de transcription (TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH) pour qu’elle puisse commencer l’élongation de la chaîne d’ARN
TFIID avec TBP n’est pas libéré
suite à la phosphorylation de l’ARN polymérase II qui libère les autres facteurs de transcription (lors de la transcription des eucaryotes), que se passe-t-il?
Début de la synthèse de l’ARN (une fois tous ces
facteurs libérés)
V ou F: Les ARN des eucaryotes sont transcrits et modifiés simultanément dans le noyau
VRAI
La terminaison chez les eucaryotes est couplée à quoi?
à la polyadénylation (à voir plus tard maturation des ARN)
Le terminateur chez les eucaryotes est une séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signal de quoi?
de polyadénylation: AAUAAA
Chez les eucaryotes, que se passe-t-il au pré-ARNm et cela donne lieu à quoi?
le pré-ARNm est clivé et polyadénylé : et donc la polymérase se détache
