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Transcription de l'ADN (3.1.0) Flashcards

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1
Q

Réplication

A

ADN => plusieurs copies de l’ADN

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Q

Transcription

A

ADN => ARN

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Q

Traduction

A

ARN => synthèse de protéine

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4
Q

lors que la transcription, que génère l’ARN polymérase

A

polymère de ribonucléotides => ARN

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5
Q

ARN polymérase synthétise le brin matrice dans quel sens

A

5’à 3’

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6
Q

vrai ou faux, l’ADN a un groupe hydroxyle de plus que l’ARN

A

faux, ARN > ADN

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7
Q

vrai ou faux, l’ARN peut avoir une structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire

A

faux, secondaire et tertiaire

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8
Q

c’est quoi les pseudoknot sur l’ARN

A

les liaisons qui se font entre des brins simples dans les boucles d’ARN

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9
Q

vrai ou faux, le passage de l’ARN polymérase entraîne une division des brins de l’hélice d’ADN

A

faux, brins déjà séparés avant le passage de l’ARN polymérase (hélicase) et après son passage, l’hélice se reconstruit

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10
Q

c’est quoi un hétéroduplex

A

hélice hybride de ARN/ADN qui sont formées de façon transitoire après le passage de l’ARN polymérase

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11
Q

que relie les nucléotides de l’ARN transcrit, quelle structure forme ces liens

A

liens phosphodiesters créés par le centre actif de l’ARN polymérase

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12
Q

vrai ou faux, lARN polymérase a besoin d’ammorce pour faire la transcription de l’ARN

A

faux

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13
Q

site d’initiation de la transcription

A

promoteur

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14
Q

site de terminaison de la transcription

A

terminateur

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15
Q

qu’est-ce qui est nécessaire pour que la polymérase commence ou termine la transcription

A

signaux de l’ADN et facteurs protéiques

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16
Q

vrai ou faux, le facteur sigma s’associe à la polymérase pour former le complexe de terminaison de la transcription chez les eucaryotes

A

faux, sigma forme un complexe d’initiation avec la polymérase chez les procaryotes

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17
Q

à quel moment le signal sigma quitte la polymérase et à quel moment il s’y ré-associe?

A

quitte 10 nucléotides après le début de la transcription

associe quand la polymérase se détache de l’ADN; au signal de stop

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18
Q

c’est quoi une séquence consensus ou séquence canonique

A

séquence analysée pour calculer l’ordre des nucléotides et acides aminés trouvés à chq position dans un alignement de séquences: permet de calculer les pourcentages de motifs qui se répètent dans une séquence

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19
Q

rôle du signal sigma

A

sélectionne le promoteur du gène à transcrire; permet donc l’initiation

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20
Q

quel énoncé est juste:

a) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase après sa liaison au promoteur
b) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant sa liaison au promoteur

A

b) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant sa liaison au promoteur

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21
Q

qu’est-ce qui dicte à la polymérase quel brin utiliser comme matrice et le sens où faire la transcription

A

des séquences courtes; boîtes -10 et -35

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22
Q

pourquoi les boîtes -10 et -35 sont négatifs

A

derrière le site d’initiation à +1

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23
Q

vrai ou faux, sur l’ADN, il existe un point 0 entre les séquences négatives (-10/-35) et le site d’initiation +1

A

faux, pas de 0

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24
Q

séquence consensus des promoteurs

A

séquence idéale des bases (analysée statistiquement)

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25
Q

Pour assurer un fort promoteur (efficacité d’initiation à la transcription, affinité du facteur sigma) on veut que sa séquence soit similaire à quoi

A

à la séquence consensus idéale

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26
Q

quelle séquence d’ADN sert de repère pour assembler le complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes

A

TATAAT

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27
Q

où se situe TATAAT sur le brin d’ADN

A

-10 => 10 nucléotides avant le site d’initiation (promoteur)

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28
Q

qu’est-ce qui est responsable de reconnaître la séquence promotrice sur l’ADN

A

facteurs sigma (plusieurs qui sont spécifiques à des séquences particulières)

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29
Q

le complexe d’initiation (facteur sigma et ARN polymérase) se fixe à quelle partie de l’ADN

A

promoteur (initiation)

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30
Q

qu’est-ce qui entraîne l’ouverture de la double hélice de l’ADN et la bulle de transcription

A

contacte ARN polymérase (avec sigma) et promoteur

31
Q

comment appelle-t-on l’étape après le relâchement du facteur sigma de l’ARN polymérase

A

élongation après la synthèse de 10 nucléotides et le départ du facteur sigma

32
Q

comment l’ARN polymérase sait où s’arrêter

A

ARN prend une forme particulière grâce à ses appariements intrammoléculaires/locaux => création du signal de terminaison

33
Q

le signal de terminaison est régulièrement riche en quel type de séquence

A

G-C suivi de U (G-C ont une liaison forte de 3 h-bonds)

34
Q

comment appelle-t-on la conformation spéciale de l’ARN qui permet la terminaison de la transcription en forçant l’ARN polymérase de se détacher

A

tige boucle d’ARN ou Hairpin Loop

35
Q

ARN polymérase II produit quel type d’ARN

A

ARNm => code pour protéines

ARNnc => non-codant

36
Q

ARN polymérase I produit quel type d’ARN

A

ARNr => compose ribosomes

37
Q

ARN polymérase III produit quel type d’ARN

A

ARNt => adaptateur pour la synthèse protéique

38
Q

ARN polymérase III produit des petits ARN non-codants utiles pour des processus cellulaire, lesquels?

A

snRNA & snoRNA

39
Q

à quoi sert la boîte TATA à -25 chez les eucaryotes

A

repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription (-25)

40
Q

complexe d’initiation de la transcription est formé par quoi chez les eucaryotes?

A

facteurs généraux + ARN polymérase II

41
Q

quelles séquences autres que TATA sont impliquées dans la régulation des gènes?

A

-80, -100 et les enhancers

42
Q

premier facteur à se faire lier à la TATA box

A

TFIID, sur sa sous-unité TBP qui permet de reconnaître TATA

43
Q

à quoi servent les sous-unités TAF de TFIID

A

reconnaître les autres séquences ADN proches du site d’initiation pour réguler le binding de TBP

44
Q

quel facteur permet à l’ARN polymérase de se positionner correctement sur la site d’initiation

A

TFIIB

45
Q

quel facteur permet de stabiliser les interactions entre l’ARN polymérase et TFIID (via sous-unité TBP) et TFIIB tout en attirant les prochains facteurs TFIIE et TFIIH

A

TFIIF

46
Q

vrai ou faux, TFIIE vient avant TFIIF

A

faux, TFIIF attire TFIIE

47
Q

qui attire et régule TFIIH

A

TFIIF et TFIIE attire TFIIH (mais TFIIE le régule)

48
Q

quel facteur permet à l’ARN polymérase de se détacher du promoteur en la phosphorylant

A

TFIIH

49
Q

que sont les General Transcription Factors

A

TFII => les facteurs généraux de transcription

50
Q

vrai ou faux, les facteurs de transcription (TFII) permet à l’ARN polymérase de se lier à la boîte TATA après qu’elle l’ait reconnue elle-même

A

faux, ARN polymérase ne reconnaît pas la boîte TATA seule, besoin des facteurs de transcription pour la reconnaissance ET la fixation

51
Q

ordre d’apparition des facteurs généraux de transcription

A

1) TFIID (sous-unité TBP)
2) TFIIB => recrute ARN polymérase II
3) TFIIF
4) TFIIE
5) TFIIH => départ de la polymérase du site d’initiation

52
Q

que se passe-t-il après la liaison de TFIIH pour occasionner le début de la transcription par la polymérase?

A
  • séparation des 2 brins d’ADN (fonction hélicase)
  • phosphorylation de la queue C-term de la polymérase (fonction kinase)
  • phosphorylation mène à libérer les facteurs de transcription => signal de départ
53
Q

quel facteur de transcription reste accrocher à l’ARN polymérase II pendant l’élongation de la chaîne d’ARN

A

TFIID (premier à s’être set)

54
Q

vrai ou faux, la transcription et la maturation des brins d’ARN sont faits en 2 étapes distinctes

A

faux, simultanément

55
Q

quelle séquence trouve-t-on en guise de terminaison dans la transcription de l’ARN des eucaryotes

A

séquence dans le pré-ARNm transcrit, signal de polyadénylation (AAUAAA)

poly-A polymerase ajoute la queue A après le clivage de la pre-ARNm

56
Q

vrai ou faux, l’ARNm se dégrade super vite et super facilement

A

vrai (qq minutes ou qq heures)

fragile à cause du groupe hydroxyle à 2’

57
Q

demi-vie des ARNm

A

4.8 min

58
Q

c’est quoi une demi-vie

A

temps pour arriver à 50% d’abondance

59
Q

le taux de transcription d’un gène est régulé à quel moment dans la transcription

A

initiation de la transcription (séquence du promoteur et facteurs qui s’y attachent)

60
Q

vrai ou faux, la vitesse d’élongation change tout dépendant de la spécificité du promoteur avec les facteurs de transcriptions

A

faux, toujours la même vitesse

61
Q

qu’est-ce qui facilite l’assemblage des facteurs de transcription + polymérase sur le promoteur

A

protéines activatrices de transcription

62
Q

qu’est-ce qui empêche l’assemblage des facteurs de transcription + polymérase sur le promoteur

A

protéines répresseurs

63
Q

comment les facteurs d’activation font l’activation de la transcription

A
  • se lie à l’ADN et change la conformation de ces complexes
  • recrute des facteurs généraux
  • attire complexes de remodelage de la chromatine (moins condensée = active transcription)
64
Q

site de liaison des protéines activatrices

A

enhancers

65
Q

site de liaison des protéines répresseurs

A

silenceurs

66
Q

domaines que comprennent les facteurs spécifiques de transcription

A

domaine de liaison à l’ADN (DBD)
domaine d’activation/répression (TAD)
possibilité de contenir un domaine de réponse à un signal (SSD) [ex; liaison à une hormone stéroïdienne]

67
Q

pourquoi les facteurs d’activation créés une boucle d’ADN

A

rapproche l’activateur à l’ARN polymérase: interaction malgré la distance

68
Q

vrai ou faux, les enzymes qui transforment le glycogène en glucose sont constamment présentes dans la cellule

A

faux, synthétisée en présence de glucocorticoïdes => produits en cas d’effort physique

69
Q

vrai ou faux l’efficacité d’initiation est propre à un gène

A

vrai, varie d’un gène à l’autre

70
Q

qu’est-ce qui détermine l’efficacité d’initiation d’un gène

A

facteurs de transcriptions qui se lient à l’ADN et complexes protéiques qui s’y lient

71
Q

qu’est-ce qui détermine l’efficacité d’initiation d’un gène

A

facteurs spécifiques de transcriptions qui se lient à l’ADN et complexes protéiques qui s’y lient

72
Q

vrai ou faux, le complexe d’initiation est le même pour tous les gènes

A

vrai, ARN polymérase + facteurs généraux de transcription. c’est la combi des facteurs spécifiques de transcription au reste du complexe protéique qui est spécifique à chaque gène

73
Q

activateur de la transcription recrute (acétylase/déacétylase) d’histone

A

acétylase => moins condensée => plus accessible => transcription

74
Q

répresseur de la transcription recrute (acétylase/déacétylase) d’histone

A

déacétylase => plus condensée => pas de transcription

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