Transcription de l'ADN (3.1.0) Flashcards
Réplication
ADN => plusieurs copies de l’ADN
Transcription
ADN => ARN
Traduction
ARN => synthèse de protéine
lors que la transcription, que génère l’ARN polymérase
polymère de ribonucléotides => ARN
ARN polymérase synthétise le brin matrice dans quel sens
5’à 3’
vrai ou faux, l’ADN a un groupe hydroxyle de plus que l’ARN
faux, ARN > ADN
vrai ou faux, l’ARN peut avoir une structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire
faux, secondaire et tertiaire
c’est quoi les pseudoknot sur l’ARN
les liaisons qui se font entre des brins simples dans les boucles d’ARN
vrai ou faux, le passage de l’ARN polymérase entraîne une division des brins de l’hélice d’ADN
faux, brins déjà séparés avant le passage de l’ARN polymérase (hélicase) et après son passage, l’hélice se reconstruit
c’est quoi un hétéroduplex
hélice hybride de ARN/ADN qui sont formées de façon transitoire après le passage de l’ARN polymérase
que relie les nucléotides de l’ARN transcrit, quelle structure forme ces liens
liens phosphodiesters créés par le centre actif de l’ARN polymérase
vrai ou faux, lARN polymérase a besoin d’ammorce pour faire la transcription de l’ARN
faux
site d’initiation de la transcription
promoteur
site de terminaison de la transcription
terminateur
qu’est-ce qui est nécessaire pour que la polymérase commence ou termine la transcription
signaux de l’ADN et facteurs protéiques
vrai ou faux, le facteur sigma s’associe à la polymérase pour former le complexe de terminaison de la transcription chez les eucaryotes
faux, sigma forme un complexe d’initiation avec la polymérase chez les procaryotes
à quel moment le signal sigma quitte la polymérase et à quel moment il s’y ré-associe?
quitte 10 nucléotides après le début de la transcription
associe quand la polymérase se détache de l’ADN; au signal de stop
c’est quoi une séquence consensus ou séquence canonique
séquence analysée pour calculer l’ordre des nucléotides et acides aminés trouvés à chq position dans un alignement de séquences: permet de calculer les pourcentages de motifs qui se répètent dans une séquence
rôle du signal sigma
sélectionne le promoteur du gène à transcrire; permet donc l’initiation
quel énoncé est juste:
a) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase après sa liaison au promoteur
b) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant sa liaison au promoteur
b) le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant sa liaison au promoteur
qu’est-ce qui dicte à la polymérase quel brin utiliser comme matrice et le sens où faire la transcription
des séquences courtes; boîtes -10 et -35
pourquoi les boîtes -10 et -35 sont négatifs
derrière le site d’initiation à +1
vrai ou faux, sur l’ADN, il existe un point 0 entre les séquences négatives (-10/-35) et le site d’initiation +1
faux, pas de 0
séquence consensus des promoteurs
séquence idéale des bases (analysée statistiquement)
Pour assurer un fort promoteur (efficacité d’initiation à la transcription, affinité du facteur sigma) on veut que sa séquence soit similaire à quoi
à la séquence consensus idéale
quelle séquence d’ADN sert de repère pour assembler le complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes
TATAAT
où se situe TATAAT sur le brin d’ADN
-10 => 10 nucléotides avant le site d’initiation (promoteur)
qu’est-ce qui est responsable de reconnaître la séquence promotrice sur l’ADN
facteurs sigma (plusieurs qui sont spécifiques à des séquences particulières)
le complexe d’initiation (facteur sigma et ARN polymérase) se fixe à quelle partie de l’ADN
promoteur (initiation)
qu’est-ce qui entraîne l’ouverture de la double hélice de l’ADN et la bulle de transcription
contacte ARN polymérase (avec sigma) et promoteur
comment appelle-t-on l’étape après le relâchement du facteur sigma de l’ARN polymérase
élongation après la synthèse de 10 nucléotides et le départ du facteur sigma
comment l’ARN polymérase sait où s’arrêter
ARN prend une forme particulière grâce à ses appariements intrammoléculaires/locaux => création du signal de terminaison
le signal de terminaison est régulièrement riche en quel type de séquence
G-C suivi de U (G-C ont une liaison forte de 3 h-bonds)
comment appelle-t-on la conformation spéciale de l’ARN qui permet la terminaison de la transcription en forçant l’ARN polymérase de se détacher
tige boucle d’ARN ou Hairpin Loop
ARN polymérase II produit quel type d’ARN
ARNm => code pour protéines
ARNnc => non-codant
ARN polymérase I produit quel type d’ARN
ARNr => compose ribosomes
ARN polymérase III produit quel type d’ARN
ARNt => adaptateur pour la synthèse protéique
ARN polymérase III produit des petits ARN non-codants utiles pour des processus cellulaire, lesquels?
snRNA & snoRNA
à quoi sert la boîte TATA à -25 chez les eucaryotes
repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription (-25)
complexe d’initiation de la transcription est formé par quoi chez les eucaryotes?
facteurs généraux + ARN polymérase II
quelles séquences autres que TATA sont impliquées dans la régulation des gènes?
-80, -100 et les enhancers
premier facteur à se faire lier à la TATA box
TFIID, sur sa sous-unité TBP qui permet de reconnaître TATA
à quoi servent les sous-unités TAF de TFIID
reconnaître les autres séquences ADN proches du site d’initiation pour réguler le binding de TBP
quel facteur permet à l’ARN polymérase de se positionner correctement sur la site d’initiation
TFIIB
quel facteur permet de stabiliser les interactions entre l’ARN polymérase et TFIID (via sous-unité TBP) et TFIIB tout en attirant les prochains facteurs TFIIE et TFIIH
TFIIF
vrai ou faux, TFIIE vient avant TFIIF
faux, TFIIF attire TFIIE
qui attire et régule TFIIH
TFIIF et TFIIE attire TFIIH (mais TFIIE le régule)
quel facteur permet à l’ARN polymérase de se détacher du promoteur en la phosphorylant
TFIIH
que sont les General Transcription Factors
TFII => les facteurs généraux de transcription
vrai ou faux, les facteurs de transcription (TFII) permet à l’ARN polymérase de se lier à la boîte TATA après qu’elle l’ait reconnue elle-même
faux, ARN polymérase ne reconnaît pas la boîte TATA seule, besoin des facteurs de transcription pour la reconnaissance ET la fixation
ordre d’apparition des facteurs généraux de transcription
1) TFIID (sous-unité TBP)
2) TFIIB => recrute ARN polymérase II
3) TFIIF
4) TFIIE
5) TFIIH => départ de la polymérase du site d’initiation
que se passe-t-il après la liaison de TFIIH pour occasionner le début de la transcription par la polymérase?
- séparation des 2 brins d’ADN (fonction hélicase)
- phosphorylation de la queue C-term de la polymérase (fonction kinase)
- phosphorylation mène à libérer les facteurs de transcription => signal de départ
quel facteur de transcription reste accrocher à l’ARN polymérase II pendant l’élongation de la chaîne d’ARN
TFIID (premier à s’être set)
vrai ou faux, la transcription et la maturation des brins d’ARN sont faits en 2 étapes distinctes
faux, simultanément
quelle séquence trouve-t-on en guise de terminaison dans la transcription de l’ARN des eucaryotes
séquence dans le pré-ARNm transcrit, signal de polyadénylation (AAUAAA)
poly-A polymerase ajoute la queue A après le clivage de la pre-ARNm
vrai ou faux, l’ARNm se dégrade super vite et super facilement
vrai (qq minutes ou qq heures)
fragile à cause du groupe hydroxyle à 2’
demi-vie des ARNm
4.8 min
c’est quoi une demi-vie
temps pour arriver à 50% d’abondance
le taux de transcription d’un gène est régulé à quel moment dans la transcription
initiation de la transcription (séquence du promoteur et facteurs qui s’y attachent)
vrai ou faux, la vitesse d’élongation change tout dépendant de la spécificité du promoteur avec les facteurs de transcriptions
faux, toujours la même vitesse
qu’est-ce qui facilite l’assemblage des facteurs de transcription + polymérase sur le promoteur
protéines activatrices de transcription
qu’est-ce qui empêche l’assemblage des facteurs de transcription + polymérase sur le promoteur
protéines répresseurs
comment les facteurs d’activation font l’activation de la transcription
- se lie à l’ADN et change la conformation de ces complexes
- recrute des facteurs généraux
- attire complexes de remodelage de la chromatine (moins condensée = active transcription)
site de liaison des protéines activatrices
enhancers
site de liaison des protéines répresseurs
silenceurs
domaines que comprennent les facteurs spécifiques de transcription
domaine de liaison à l’ADN (DBD)
domaine d’activation/répression (TAD)
possibilité de contenir un domaine de réponse à un signal (SSD) [ex; liaison à une hormone stéroïdienne]
pourquoi les facteurs d’activation créés une boucle d’ADN
rapproche l’activateur à l’ARN polymérase: interaction malgré la distance
vrai ou faux, les enzymes qui transforment le glycogène en glucose sont constamment présentes dans la cellule
faux, synthétisée en présence de glucocorticoïdes => produits en cas d’effort physique
vrai ou faux l’efficacité d’initiation est propre à un gène
vrai, varie d’un gène à l’autre
qu’est-ce qui détermine l’efficacité d’initiation d’un gène
facteurs de transcriptions qui se lient à l’ADN et complexes protéiques qui s’y lient
qu’est-ce qui détermine l’efficacité d’initiation d’un gène
facteurs spécifiques de transcriptions qui se lient à l’ADN et complexes protéiques qui s’y lient
vrai ou faux, le complexe d’initiation est le même pour tous les gènes
vrai, ARN polymérase + facteurs généraux de transcription. c’est la combi des facteurs spécifiques de transcription au reste du complexe protéique qui est spécifique à chaque gène
activateur de la transcription recrute (acétylase/déacétylase) d’histone
acétylase => moins condensée => plus accessible => transcription
répresseur de la transcription recrute (acétylase/déacétylase) d’histone
déacétylase => plus condensée => pas de transcription
