trafic membranaire intracellulaire Flashcards
2 voies principales de trafic membranaire intracellulaire
- endosomale (dégradation)
- biosynthèse (sécrétion)
quelle structure permet le transport des vésicules à longue distance
microtubules/cytosquelette
rôle des vésicules
cargo, intermédiaire de transport, entre les différents compartiments.
steps de bourgeonnement du compartiment donneur, fusion de la vésicule sur le compartiment cible receveur
formation de vésicules à la membrane plasmique
endocytose => internalisation
fusion de vésicule à la membrane plasmique
exocytose => externalisation
vrai ou faux, au contraire de la bicouche lipidique de la membrane plasmique, l’endomembrane d’une vésicule est symétrique
faux, asymétrique
quel feuillet de l’endomembrane d’une vésicule devient le feuillet externe de la membrane plasmique
a) feuillet côté de la lumière (intérieur) de la vésicule
b) feuillet externe de la vésicule
a) feuillet côté de la lumière (intérieur) de la vésicule
mécanisme d’internalisation de larges particules spécifiques à la membrane plasmique
phagocytose
mécanisme d’internalisation de liquide non-spécifique à la membrane plasmique
macropinocytose
mécanisme d’internalisation de liquide non-spécifique à la membrane plasmique à travers de petites vésicules
micropinocytose
endocytose comprend nécessairement la formation de quelle structure
vésicule
vrai ou faux, la micropinocytose est un type d’endocytose indépendant de la clathrine et de la cavéoline
vrai
mécanisme d’internalisation de particules moyennes et spécifiques à la membrane plasmique
dépendant à la clathrine
dépendant à la cavéoline
quels énoncés sont vrais
a) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un lysosome
b) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un endosome précoce
c) la molécule entrée par macropinocytose ou micropinocytose sera ensuite dégradée par un lysosome
d) la molécule entrée par mécanisme dépendant de la cavéoline ou clathrine sera ensuite dégradée par un endosome précoce
d) la molécule entrée par mécanisme dépendant de la cavéoline ou clathrine sera ensuite dégradée par un endosome précoce
a) la molécule entrée par phagocytose sera ensuite dégradée par un lysosome
macro/micropinocytose = endosome précoce
les pseudopodes utilisés pour phagocytose dépendent de quoi pour leur permettre une mobilité
actine
qu’arrive-t-il si la phosphatidylsérine (PS) est exposée à la surface de la membrane plasmique (feuillet externe)?
corps apoptotique comme le macrophage vont reconnaître comme un signal d’apoptose et leur récepteur PS va lier la PS pour ammorcer la phagogytose
(PS sur feuillet interne = normal = pas de signal d’apoptose = survie)
différence entre phagocytose et pinocytose
pinocytose = pas de particules solides => gouttelettes fluide & Nu
point commun du mode d’action phagocytose et pinocytose
dépendants de l’actine
étapes de formation d’une vésicule de clathrine
- liaison ligand / récepteur de chargement = signal pour recrutement clathrine et déformation de la membrane plasmique
- adaptine lie récepteur et clathrine (se trouve entre les deux)
- polymérisation des clathrines qui forment un manteau à la surface membranaire, formation d’une vésicule qui garde un cou attaché à la membrane plasmique
- dynamine s’accroche et scinde le cou des vésicules (free the vésicules!!) par hydrolyse de GTP
- bourgeonnement complet = détachement = vésicule perd son manteau de clathrines
- vésicule nue ready à se fusionner avec un compartiment cible
forme précurseur de la clathrine dans le cytosol (clathrine qui n’est pas encore polymérisée)
triskèle
forme de la clathrine à la membrane qui permet de former la vésicule
polymérisation en forme polyédrale
protéine qui permet la scission de la vésicule de clathrine
dynamine
protéine qui facilite la formation de la vésicule mantelée de clathrine (sa polymérisation)
actine
comment agit la dynamine sur la vésicule mantelée de clathrines
forme des oligomères en hélices autour du cou
quelle vésicule est plus petite: dépendante de la cavéoline ou de la clathrine
cavéoline
endosome
vésicule avec membrane unique qui vient de la membrane plasmique après l’endocytose
différence entre un endosome précoce et un endosome tardif
tardif = + acide = + mature
qu’est-ce qui transporte le cholestérol
LDL => lipiprotéines de basse densité (voir slide 30 pour réviser le process complet )
vrai ou faux, les endosomes ont un pH plus bas (plu acide) que les lysosomes
faux, contraire => ce qui permet l’activation des enzymes hydrolases
d’où proviennent les exosomes
système endosomale
les corps multivésiculaires proviennent de quoi
endosome tardif => permettent aux exosomes d’être libérés quand corps multivésiculaires (MVB) se fusionnent à la membrane plasmique
c’est quoi un corps multivésiculaire (MVB)
endosome tardif dans lequel il y a des exosomes en bourgeonnement => des petites vésicules dans une plus grande vésicule
c’est quoi l’autophagie
protéine ou organites capturés dans autophagosome et dégrader après la fusion avec un lysosome
double membrane lipidique impliquée dans l’autophagie
autophagosome
quel élément est faux concernant les peroxysomes
a) présent dans toutes les cellules eucaryotes
b) ressemblent au lysosome, font parti du système endolysosomal
c) sphérique
d) 1 membrane
e) rôle dans métabolisme et détoxification
b) ressemblent au lysosome, font parti du système endolysosomal
FAUX, RESSEMBLENT PAS PAS DAND LE SYSTÈME ENDOLYSOSOMAL)
implication des peroxysomes dans le métabolisme
oxide les acides gras
implication des peroxysomes dans la détoxification
produit/dégrade le H2O2
métabolise les ROS aka esoèces réactives d’oxygène
quel énoncé est faux concernant les peroxysomes
a) possèdent plus de 50 enzymes
b) synthèse les acides biliaires
c) synthèse de lipides
d) catalase la plus rare pour les espèces réactives d’oxygène
e) la plupart des peroxysomes se forment de “novo” par bourgeonnement
d) catalase la plus rare pour les espèces réactives d’oxygène
faux, la plus abondante!
e) la plupart des peroxysomes se forment de “novo” par bourgeonnement
FAUX, par fission et croissance comme mitochondries
quel choix de “destiné” s’offre aux protéine endocytées
- recyclées à la membrane plasmique
- dégradées par lysosomes
toutes ces options suivent le tri fait dans l’endosome précoce/ endosome de triage
quelles structures permettent à la vésicule de bind avec la membrane cible
v-Snare = petites cordes sur vésicule t-Snare = petites cordes sur membrane du compartiment cible
v-Snare + t-Snare = fusion vésicule/membrane
=> les 2 se lient et s’unissent pour permettre la coalescence des membranes et la fusion entre vésicule et l’autre membrane cible
qu’est-ce qui permet aux SNAREs de se désassembler pour recycler les composantes
hydrolye d’ATP par une ATPase
vrai ou faux, un SNARE est spécifique à un compartiment, il en existe donc plusieurs pour différents compartiments
vrai, ils étiquettent et trient des compartiments en particulier
type de GTP attaché aux vésicules pour permettre à la vésicule de s’attacher et de s’appareiller à la membrane cible
Rab-GTP (vient de la superfamille des Ras)
quel intermédiaire permet à la vésicule de s’attacher à la membrane via l’activité de Rab-GTP
Effecteur de Rab, une protéine d’attachement
phospholipide mineur présent sur le feuillet interne de la membrane plasmique qui est très important pour la spécificité de la membrane
PI: phosphadidylinositol
PI phosphorylés donnent quoi
phosphoinositides
quel élément est faux concernant la phosphorylation des PI
a) résultat = phosphoinositides
b) c’est l’anneau qui est phosphorylé
c) phosphorylation/déphosphorylation par des kinases et phosphatases
d) phosphorylation possible sur les positions 2,3 et 4 d l’anneau
d) phosphorylation possible sur les positions 2,3 et 4 d l’anneau
FAUX, 3,4,5 POSSIBLE
je retire un groupement phosphate aux phosphoinositides
phosphatase
j’ajoute un groupement phosphate aux phosphoinositides
kinase
comment les cellules peuvent distinguer les différents compartiments?
via les phosphoinositides différents sur chaque membrane
structures impliquées dans la voie endosomal => internalisation par dégradation
endosome précoce, endosome tardif, lysosome
structures impliquées dans la voie de sécrétion
réticulum endoplasmique
appareil de Golgi
vésicule de transport
la voie de sécrétion implique le passage de quoi vers quoi
protéines synthétisées par le RER vers la membrane/ exportation par sécrétion/lysosomes
quelle structure a une lumière en continuité avec l’enveloppe nucléaire
réticulum endoplasmique; réseau de citernes/sacs membranaires autour du noyau
qui est responsable de fabriquer les membranes de la cellule
réticulum endoplasmique
quels énoncés sont faux à propos du REL (lisse)
a) possède des ribosomes
b) réseau tubulaire
c) synthétise des lipides et du calcium
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
a) possède des ribosomes
FAUX, RER
c) synthétise des lipides et du calcium
FAUX, SYNTHÉTISE DES LIPIDES MAIS C’EST UNE RÉSERVE DE CALCIUM DANS LES MUSCLES, ÇA NE LE PRODUIT PAS
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
FAUX
quels énoncés sont faux à propos du RER (rugueux)
a) possède des ribosomes
b) réseau tubulaire
c) réservoir de calcium pour les muscles
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
e) synthétise des protéines
f) contrôle de la qualité
g) s’occupe de faire la glycosylation des protéines
b) réseau tubulaire
FAUX, LISSE = TUBES MAIS RUGUEUX = CITERNES
c) réservoir de calcium pour les muscles
FAUX, RÔLE DU REL
d) contrôle le repliement des protéines par ponts hydrogène
FAUX, PAR PONTS DISULFURE (STRONG BOND)
vrai ou faux, le RER et le REL sont deux structures indépendantes qui se sont pas reliées
faux, en continuité l’une avec l’autre
composition des ribosomes
ARNr + protéines avec 2 sous-unités (50S et 30S)
rôle ribosome
traduction de protéines (gènes => prot)
étapes générales synthèse protéique par ribosomes
- ribosome lie chaque codon de 3 nucléotides de 5’@3’
2. acides aminés formés sont transférés à la chaîne polypeptide par ARNt (transfert) jusqu’au codon stop
vrai ou faux, un ribosome traduit TOUJOURS un ARNm tout seul
faux, polysomes possibles => plusieurs ribosomes sur le même ARNm simultanément (muuuushpit)
qu’ont de particulier les protéines transmembranaires ou destinées à être sécrétées hors de la cellule
séquence signal peptide au N-term => permet d’orienter le ribosome vers le RE
comme une étiquette
les protéines nucléaires sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
a) libres dans le cytosol
les protéines mitochondriales sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
a) libres dans le cytosol
les protéines cytosoliques sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
a) libres dans le cytosol
les protéines transmembranaires sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
les protéines qui fonctionnent dans le système endomembranaire sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
les protéines destinées à être sécrétées hors de la cellule sont:
a) libres dans le cytosol
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
b) liées à la membrane du RE par chaînes polypeptidiques naissantes
vrai ou faux, la translocation d’une protéine se fait en une étape séparée et ultérieure à la fin de la traduction de la protéine en question
faux, simultané, translocation co-traductionnelle (les 2 process se font en même temps)
complexe protéique qui allonge une protéine en formation dans la citerne du RER
translocon
où est modifiée la protéine au cours de sa formation
dans la lumière du RER
après l’allongement de la protéine en formation dans la lumière du RER par un translocon, la séquence signal sur la protéine destinées à être sécrétée ou à être transmembranaire est clivée par quoi
peptidase
comment une protéine transmembranaire s’insère-t-elle dans la bicouche lipidique
par le translocon, un canal de translocation
importance du glycocalyx sur les protéines transmembranaires et lipides sur le feuillet externe de la membrane
protection chimiques (intestin) et reconnaissance cellulaire (immunité)
les protéines transmembranaires sont glycolysées à partir d’où
lumière RE à partir de glucose, mannose et N-acétylglucosamine
2 classes de glycoprotéines dans le RE et l’Appareil de Golgi
N-glycosylation
O-glycosylation
quel élément est faux concernant la N-glycosylation
a) oses = glucose
b) liés aux N de la sérine (Thr)
c) dans le RE
d) ajout de glycane (14 sucres) dans la lumière du RER
b) liés aux N de la sérine (Thr)
FAUX, LIÉS AUX N DE L’ASPARAGINE (ASN)
quel élément est faux concernant la O-glycosylation
a) oses = glucose
b) liés aux O de la sérine (Thr)
c) dans l’appareil de Golgi
a) oses = glucose
FAUX, OSES - GALACTOSE
quelle structure permet de contrôler la qualité du repliement protéique dans la lumière du RE
chaperon calnexine sur la membrane du RE (vers l’intérieur, la lumière) => les retient, les kidnappe, ne peuvent pas se diriger vers l’appareil de Golgi
que se passe-t-il quand il y a trop de protéines mal repliées dans le RE
produit plus de chaperonnes calnexine, on veut la même qualité
à quoi sert l’endoribonucléase IRE1
- contrôle épissage de XBP1 (facteur de transcription qui augmente la capacité d’une cellule à faire de la synthèse)
- dégrade des ARNm pour qu’ils produisent moins de protéines (- traduction)
RÉPONSE AUX PROTÉINES MAL REPLIÉES
c’est quoi la destinée d’une protéine mal repliée
capturées par les chaperonnes calnexines => rétro-transloquées par le translocon => ubiquitinées par une ligase => dégradées par protéasome
le RER est important pour quel type de structure des protéines?
secondaire
on dit que le RE contrôle sa taille via quel processus?
UPR; Unfolded Protein Response
l’entrée de l’appareil de Golgi est vis-à-vis (RER/ membrane plasmique) alors que sa sortie est vis-à-vis (RER/ membrane plasmique)
entrée = RER sortie = membrane plasmique
3 citernes de l’appareil de Golgi
Cis
Médianes
Trans
qu’est-ce qui permet la rétention au RE via le transport antérograde et où se fait-il
COPII, dans le compartiment intermédiaire RE-Golgien [ERGIC]
qu’est-ce qui permet le transport de récupération
COPI dans le réseau cis-Golgien
rôles appareil de Golgi
- finition/maturation des protéines en finissant leur glycosylation (les active et stabilise)
- étiquetage des protéines pour savoir où elles vont se diriger (destination finale)
- triage / concentration / emballage protéines dans vésicules/ granules de sécrétion
qu’est-ce qui permet le transport des vésicules ou granules de sécrétion de l’appareil de Golgi vers la destination des protéines
microtubules sur lesquels avancent la kinésine ou la dynéine
la partie triage se fait dans quelle région de l’appareil de Golgi
à la sortie, réseau trans-Golgien (TGN), de là on décide si la protéine va au lysosome, à la membrane plamique ou dans un vésicule de sécrétion
la glycolysation des protéines dans le réticulum endoplasmique fait intervenir majoritairement du mannose ou des oligossacharides complexes?
enrichi au mannose dans le RE et oligosaccharides complexes dans l’appareil de Golgi
quels éléments correspondent à une sécrétion constitutive
a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
b) fait par toutes les cellules
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes
b) fait par toutes les cellules
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase
quels éléments correspondent à une sécrétion régulée
a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
b) fait par toutes les cellules
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
d) les protéines solubles sont sécrétés en permanence
e) permet l’homéostasie de la membrane
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
g) un exemple = pompe Na+/K+ ATPase
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes
a) fait par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire
c) les protéines solubles sont sécrétés à des moments précis mais pas tout le temps
f) un exemple = sécrétion de l’insuline par le pancréas en réponse au glucose
h) dans les cellules spécialisées commes les adipocytes
bouton synaptique = sécrétion régulée ou constitutive
régulée
trasnport endosomale dans les cellules polarisés possible par quelle méthode
transcytose; ENDOCYTOSE MEMBRANE APICALE SUIVI DE TRANSPORT + FUSION AVE MEMBRANE BASOLATÉRALE
